基因及其顺式调控元件在动物表型进化中的作用_孙博渊[1]

生物化学复习参考

远程教育生物化学复习参考 一、多选题A型（每题1分，总计30分） 1、属于酸性氨基酸的是 A. Lys B. Asn C. Gln D. Glu E. Cys 2、下列哪种氨基酸代谢产生SAM A. 色氨酸 B. 苏氨酸 C. 苯丙氨酸 D. 蛋氨酸 E. 脯氨酸 3、维持蛋白质分子中α-螺旋稳定的化学键是 A．肽键 B．疏水键 C．氢键 D．二硫键 E．离子键 4、下列哪个氨基酸不是 ．．L-α-氨基酸 A. Gly B. Ala C. Val D. Leu E. Asp 5、酪氨酸tRNA的反密码子是5′-GUA-3′,它能辨认mRNA上的相应密码子是A． GUA B． AUG C． UAC D． GTA E． TAC 6、DNA变性后理化性质改变正确的是 A．溶液粘度不变 B．是循序渐进的过程 C．形成三股链螺旋 D． 260nm波长处的光吸收增高 E．正旋光性增高 7、DNA的Tm值描述正确的是 A．只与DNA链的长短有直接关系 B．与G-C碱基对含量成正比 C．与A-T碱基对含量成正比 D．与碱基组成无关 E．所有真核生物Tm都一样

8、DNA上的外显子是 A．不被转录的序列 B．被转录但不被翻译的序列 C．被转录也被翻译的序列 D．调节基因序列 E．以上都不对 9、下列关于DNA复制的叙述错误 ．．的是 A．有DNA指导的RNA聚合酶参加 B．有RNA指导的DNA聚合酶参加 C．为半保留复制 D．以四种dNTP为原料 E．有DNA连接酶参加 10、真核生物DNA复制中催化前导链合成的酶是A． polⅠ B． polα C． polβ D． polγ E． polδ 11、原核生物的RNA聚合酶的核心酶组成是A．α2ββ′σ B．α2ββ′ C．α2β′σ D．αββ′ E．α2βσ 12、可使原核生物转录过程终止的是 A. ρ因子 B. 核心酶 C. σ因子 D. 全酶 E. α亚基 13、原核生物辨认转录起始点的是 A．α亚基 B．β亚基 C．β′亚基 D．σ亚基 E．α2ββ′ 14、关于密码子的正确描述是 A．密码子中可以有稀有碱基 B．密码子中任何碱基的突变都会影响翻译C．每个密码子都对应一种氨基酸 D．多种氨基酸都有两个以上的密码 E．不同生物的密码子是不同的 15、蛋白质分子中没有遗传密码的氨基酸是A．丝氨酸

分子生物学期末模拟试题

海南大学海洋学院分子生物学期末模拟试题 11海科曾奇整理（红色字体为非常重要部分,需要其他什么科目模拟题的小伙伴请给我留言）第一题：名词解释 1.C值：一种生物单倍体基因组DNA的总量。 2.半保留复制：每条子代分子的一条链来自亲代DNA，另一条链则 是新合成的，我们把这种复制方式称为DNA的半保留复制。 3.核酶：具有催化活性的RNA，在RNA的剪接加工过程中起到自 我催化的作用。 4.魔斑：当细菌生长过程中，遇到氨基酸全面缺乏时，细菌将会产 生一个应急反应，停止全部基因的表达。产生这一应急反应的信号是鸟苷四磷酸(ppGpp)和鸟苷五磷酸（pppGpp）。PpGpp与pppGpp的作用不只是一个或几个操纵子，而是影响一大批，所以称他们是超级调控子或称为魔斑。 5.弱化子：在操纵区与结构基因之间的一段可以终止转录作用的核 苷酸序列。 6.DNA探针：是带有标记的一段已知序列DNA，用以检测未知序 列、筛选目的基因等方面广泛应用。 7.SD序列：是核糖体与mRNA结合序列，对翻译起到调控作用。 8.操纵子：是指数个功能上相关的结构基因串联在一起，构成信息 区，连同其上游的调控区（包括启动子和操纵基因）以及下游的转录终止信号所构成的基因表达单位，所转录的RNA为多顺反子。

9.顺式作用元件：是指那些与结构基因表达调控相关、能够被基因 调控蛋白特异性识别和结合的特异DNA序列。包括启动子、上游启动子元件、增强子、加尾信号和一些反应元件等。 10.反式作用因子：是指真核细胞内含有的大量可以通过直接或间接 结合顺式作用元件而调节基因转录活性的蛋白质因子。 11.增强子：位于真核基因中远离转录起始点，能明显增强启动子转 录效率的特殊DNA序列。它可位于被增强的转录基因的上游或下游，也可相距靶基因较远。 12.启动子：是RNA聚合酶特异性识别和结合的DNA序列。 13.转化：指质粒DNA或以它为载体构建的重组DNA导入细菌的过 程。 14.错义突变：DNA分子中碱基对的取代，使得mRNA的某一密码 子发生变化，由它所编码的氨基酸就变成另一种的氨基酸，使得多肽链中的氨基酸顺序也相应的发生改变的突变。 15.翻译：将mRNA链上的核苷酸从一个特定的起始位点开始，按每3个核苷酸代表一个氨基酸的原则，依次合成一条多肽链的过程。 16.转座子：存在于染色体DNA上可自主复制和移位的基本单位。 17.断裂基因：真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相 间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因。 18.基因组文库：将某种生物的基因组DNA切割成一定大小的片段， 并与合适的载体重组后导入宿主细胞，进行克隆。这些存在于所

诺禾致源高分文章集锦-动物基因组

川金丝猴全基因组测序解析其植食性机制与进化史 Whole-genome sequencing of the snub-nosed monkey provides insights into folivory and evolutionary history 研究对象：川金丝猴期刊：Nature Genetics 影响因子：29.352 合作单位：中国科学院动物研究所发表时间：2014年11月 摘 要 Colobines are a unique group of Old World monkeys that principally eat leaves and seeds rather than fruits and insects. We report the sequencing at 146× coverage, de novo assembly and analyses of the genome of a male golden snub-nosed monkey (Rhinopithecus roxellana ) and resequencing at 30× coverage of three related species (Rhinopithecus bieti , Rhinopithecus brelichi and Rhinopithecus strykeri ). Comparative analyses showed that Asian colobines have an enhanced ability to derive energy from fatty acids and to degrade xenobiotics. We found evidence for functional evolution in the colobine RNASE1 gene, encoding a key secretory RNase that digests the high concentrations of bacterial RNA derived from symbiotic microflora. Demographic reconstructions indicated that the profile of ancient effective population sizes for R. roxellana more closely resembles that of giant panda rather than its congeners. These findings offer new insights into the dietary adaptations and evolutionary history of colobine primates. 关键词 金丝猴；重测序；植食性；进化 研究背景 金丝猴（Rhinopithecu spp.)隶属于灵长目（Primates）、疣猴亚科（Colobinae）、仰鼻猴属 （Rhinopithecus ） ，目前共有5个种，即川、滇、黔、缅甸和越南金丝猴。通过对金丝猴基因组以及肠道基因组进行全面系统的研究，解析了金丝猴的植食性分子遗传机制，为了解疣猴亚科的系统进化、功能适应性奠定了遗传基础，同时开展了仰鼻猴属的进化历史和遗传多态性分析。

基因表达复习题

基因表达 一级要求单选题 1 基因表达调控的基本控制点是 A 基因结构活化 B 转录起始 C 转录后加工 D 蛋白质翻译及翻译后加工 E mRNA从细胞核转运到细胞浆 B 2 分解代谢物基因激活蛋白(CAP)对乳糖操纵子表达的影响是 A 正性调控 B 负性调控 C 正性调控、负性调控都可能 D 无调控作用 E 可有可无 A 3 阻遏蛋白识别操纵子中的 A 启动基因 B 结构基因 C 操纵基因 D 内含于 E 外显子 C 4 原核生物基因表达调控的乳糖操纵子系统属于 A 复制水平调节 B 转录水平调节 C 逆转录水平调节 D 翻译水平调节 E 翻译后水平调节 B 5 目前认为基因表达调控的主要环节是 A 基因活化 B 转录起始 C 转录后加工 D 翻译起始 E 翻译后加工 B 6 生物体调节基因表达最根本的目的是 A 适应环境 B 调节代谢 C 维持生长 D 维持分裂 E 维持分化 A 7 顺式作用元件是指 A 基因的5’侧翼序列 B 基因的3’侧翼序列 C 基因的5’、3’侧翼序列 D 基因5’、3’侧翼序列以外的序列 E 具有转录调节功能的特异DNA序列 E 8 一个操纵子通常含有 A 一个启动序列和一个编码基因 B 一个启动序列和数个编码基因 C 数个启动序列和一个编码基因 C 数个启动序列和数个编码基因 E 两个启动序列和数个编码基因 B 9 乳糖操纵子激活的直接诱导剂是 A β半乳糖苷酶 B 通透酶 C 葡萄糖 D 乳糖 E 别乳糖 E 10 lac阻遏蛋白结合乳糖操纵子上的 A P序列 B O序列 C CAP结合位点 D I基因 E Z基因 B 11 对乳糖操纵子来说 A CAP是正性调节因素，阻遏蛋白是负性调节因素 B CAP是负性调节因素，阻遏蛋白是正性调节因素 C CAP和阻遏蛋白都是正性调节因素 D CAP和阻遏蛋白都是负性调节因素 E cAMP- CAP是负性调节因素 A 12 lac阻遏蛋白由 A Z基因编码 B Y基因编码 C A基因编码 D I基因编码 E 以上都不是 D 13 真核生物用多种调节蛋白发挥生物学效应的作用方式是 A 提高RNA聚合酶的转录效率 B 降低RNA聚合酶的转录效率 C 提高DNA-蛋白质相互作用的特异性 D 降低DNA-蛋白质相互作用的特异性 E 以上都不是 A 14 有关操纵子学说的论述，下列哪一项是正确的? A 操纵子调控系统是真核生物基因调控的主要方式

生物化学选择题

生化习题 选择题 1.含有2个羧基的氨基酸是：（ A ） A.谷氨酸 B. 苏氨酸 C.丙氨酸 D. 甘氨酸 2.酶促反应速度V达到最大反应速度Vmax的80%时，底物浓度[S]: （ D ） A. 1 Km B. 2 Km C. 3 Km D. 4 Km 3.三碳糖、六碳糖与七碳糖之间相互转变的糖代谢途径是：（ D ） A．糖异生 B．糖酵解 C．三羧酸循环 D．磷酸戊糖途径 4.哪一种情况可用增加[S]的方法减轻抑制程度：（ B ） A．不可逆抑制作用 B．竞争性可逆抑制作用 C．非竞争性可逆抑制作用 D 反竞争性抑制作用 5.鸟氨酸循环中，尿素生成的氨基来源有：（ C ） A．鸟氨酸 B．精氨酸 C．天冬氨酸 D．瓜氨酸 6.糖酵解途径中，第二步产能的是: （ B ） A. 1，3-二磷酸甘油酸到 3-磷酸甘油酸 B. 磷酸烯醇式丙酮酸到丙酮酸 C. 3-磷酸甘油醛到 1，3-二磷酸甘油酸 D. F-6-P到 F-1,6-P 7.氨基酸的联合脱氨过程中，并不包括哪类酶的作用: （ D ） A 转氨酶 B L –谷氨酸脱氢酶 C 腺苷酸代琥珀酸合成酶 D 谷氨酸脱羧酶 8.下列哪一种物质不是糖异生的原料: （ C ） A. 乳酸 B. 丙酮酸 C. 乙酰CoA D. 生糖氨基酸 9.目前被认为能解释氧化磷酸化机制的假说是: （ C ） A、化学偶联假说 B、构象变化偶联假说 C、化学渗透假说 D、诱导契合假说 10、1958年Meselson和Stahl利用15N标记大肠杆菌DNA的实验证明了下列哪一种机制？（D） A．DNA能被复制 B．DNA基因可转录为mRNA C．DNA基因可表达为蛋白质

基因组学重点整理

生物五界：动物、植物、真菌、原生生物和原核生物；生物三界：真细菌、古细菌、真核生物 具有催化活性的RNA分子称为核酶（ribozyme）核酶催化的生化反应有：自我剪接、催化切断其它RNA、合成多肽键、催化核苷酸的合成 新基因的产生：基因与基因组加倍1）整个基因组加倍； 2）单条或部分染色体加倍；3）单个或成群基因加倍。DNA水平转移：原核生物中的DNA水平转移可通过接合转移，噬菌体转染，外源DNA的摄取等不同途径发生，水平转移的基因大多为非必须基因。动物中由于种间隔离不易进行种间杂交，但其主要来源于真核细胞与原核细胞的内共生。动物种间基因转移主要集中在逆转录病毒及其转座成分。 外显子洗牌与蛋白质创新：产生全新功能蛋白质的方式有二种：功能域加倍，功能域或外显子洗牌 基因冗余：一条染色体上出现一个基因的很多复份(复本）当人们分离到某一新基因时，为了鉴定其生物学功能，常常使其失活，然后观察它们对表型的影响。许多场合，由于第二个重复的功能基因可取代失活的基因而使突变型表型保持正常。这意味着，基因组中有冗余基因存在。看家基因很少重复，它们之间必需保持剂量平衡，因此重复的拷贝很快被淘汰。与个体发育调控相关的基因表达为转录因子，具有多功能域的结构。这类基因重复拷贝变异可使其获得不同的表达控制模式，促使细胞的分化与多样性的产生，并导致复杂形态的建成，具有许多冗余基因。 非编码序列扩张方式：滑序复制、转座因子 模式生物海胆、果蝇、斑马鱼、线虫、蟾蜍、小鼠、酵母、水稻、拟南芥等。模式生物基因组中G+C%含量高, 同时CpG 岛的比例也高。进化程度越高, G+C 含量和CpG 岛的比例就比较低 如果基因之间不存在重叠顺序，也无基因内基因（gene-within-gene），那么ORF阅读出现差错的可能只会发生在非编码区。细菌基因组中缺少内含子，非编码序列仅占11%, 对阅读框的排查干扰较少。细菌基因组的ORF阅读相对比较简单，错误的机率较少。高等真核生物DNA的ORF阅读比较复杂：基因间存在大量非编码序列（人类占70%）；绝大多数基因内含有非编码的内含子。高等真核生物多数外显子的长度少于100个密码子 内含子和外显子序列上的差异：内含子的碱基代换很少受自然选择的压力，保留了较多突变。由于碱基突变趋势大多为C-T,故A/T的含量内含子高于外显子。由于终止密码子为TAA\TAG\TGA，如果以内含子作为编码序列，3种读码框有很高比例的终止密码子。 基因注释程序编写的依据：1）信号指令，包括起始密码子，终止密码子，终止信号，剪接受体位和供体位，多聚嘧啶序列，分支点保守序列2）内容指令，密码子偏好，内含子和外显子长短 基因功能的检测：基因失活、基因过表达、RNAi干涉 双链DNA的测序可从一端开始，亦可从两端进行，前者称单向测序，后者称双向测序。 要获得大于50 kb的DNA限制性片段必需采用稀有切点限制酶。 酵母人工染色体（YAC）1）着丝粒在细胞分裂时负责染色体均等分配。2）端粒位于染色体端部的特异DNA序列，保持人工染色体的稳定性3）自主复制起始点（ ARS）在细胞中启动染色体的复制 合格的STS要满足2个条件：它应是一段序列已知的片段，可据此设计PCR反应来检测不同的DNA片段中是否存在这一顺序；STS必需在染色体上有独一无二的位置。如果某一STS在基因组中多个位点出现，那么由此得出的作图数据将是含混不清的。 遗传图绘制主要依据由孟德尔描述的遗传学原理，第一条定律为等位基因随机分离，第二条定律为非等位基因自由组合，显隐性规律/不完全显性、共显性、连锁 衡量遗传图谱的水平覆盖程度饱和程度 基因类型：transcribed, translatable gene (蛋白基因 ) ； transcribed but non-translatable gene ( RNA 基因 )Non- transcribed, non-translatablegene ( promoter, operator ) rRNA基因，tRNA基因, scRNA基因, snRNA 基因, snoRNA基因, microRNA基因 基因组(genome)：生物所具有的携带遗传信息的遗传物质总和。 基因组学（genomic）：用于概括涉及基因作图、测序和整个基因功能分析的遗传学分支。 染色体组（chromosome set）：不同真核生物核基因组均由一定数目的染色体组成，单倍体细胞所含有的全套染色体。 比较基因组学（comparative genomics）：比较基因组学是基因组学与生物信息学的一个重要分支。通过模式生物基因组与人类基因组之间的比较与鉴别，为分离重要的候选基因，预测新的基因功能，研究生物进化提供依据。（目标）

智慧树知到《分子生物学》章节测试答案

智慧树知到《分子生物学》章节测试答案 第一章 1、目前生物遗传信息传递规律中还没有实验证据的是（） . A:A. DNA →RNA B:B. RNA→蛋白质 C:C. RNA→DNA D:D.蛋白质→ DNA 正确答案： D.蛋白质→ DNA 2、从小鼠的一种有夹膜的致病性肺炎球菌中提取出的 DNA，可使另一种无荚膜、不具有致病性的肺炎球菌转变为有夹膜并具有致病性的肺炎球菌，而蛋白质、 RNA 无此作用，由此可以 证明（）。 A:DNA是遗传物质，蛋白质是遗传信息的体现者。 B: 蛋白质是遗传物质，DNA是遗传信息的体现者。 C:DNA和蛋白质均是遗传物质。 D:RNA是遗传物质，DNA和蛋白质是遗传信息的体现者。 正确答案： DNA是遗传物质，蛋白质是遗传信息的体现者。 3、自然界中以DNA为遗传物质的大多数生物DNA的复制方式为（）。 A:环式 B:半保留 C:D- 环式 D:全保留 正确答案：半保留 Stanley B.Prusien，表彰他发现朊4、 1997 年诺贝尔生理医学奖授予美国加州旧金山大学 病毒及其致病机理，请问朊病毒是一种（）？

A:DNA B:葡萄糖 C:蛋白质 D:RNA 正确答案：蛋白质 5、证明 DNA复制为半保留复制的科学家为（）。 A:Meselson&stahl B:F. Miesher C:o. Avery D:Chargaff 正确答案： Meselson&stahl 第二章 1、证明 DNA是遗传物质的两个关键性实验是：肺炎球菌在老鼠体内的毒性和T2 噬菌体感染大肠杆菌。这两个实验中主要的论点证据是（）。 A: 从被感染的生物体内重新分离得到DNA作为疾病的致病剂 B:DNA突变导致毒性丧失 C:生物体吸收的外源 DNA（而并非蛋白质）改变了其遗传潜能 D:DNA是不能在生物体间转移的，因此它一定是一种非常保守的分子 正确答案：生物体吸收的外源DNA（而并非蛋白质）改变了其遗传潜能 2、物种的C值与其进化复杂性之间无严格对应关系。 A:对 B:错

干旱胁迫相关的顺式作用元件及转录因子简介

干旱胁迫相关的顺式作用元件及转录因子简介 就像植物应答干旱胁迫的信号途径可以分为ABA依赖和不依赖两条一样，相关的顺式作用元件和转录因子也可以分为ABA依赖和不依赖两类。通常的分析方法是通过对干旱或ABA诱导表达基因的启动子序列进行比对辅以序列的删除与碱基的替换等手段可以得到保守的顺式序列。然后利用这些序列进行酵母单杂交筛选等得到相应的反式作用元件。当然，还需要通过凝胶阻滞实验、构建顺式元件序列与标记基因融合转化，通过对得到的反式元件基因进行超表达、RNAi 等手段对结果进行验证(Yamaguchi-Shinozaki and Shinozaki, 2005)。 ABREs是主要的ABA依赖的基因表达的顺式调节元件，该元件普遍存在于不同物种中，在植物受ABA诱导的基因的启动子区域通常以较高的丰度存在，并能与相应的DNA绑定蛋白结合(Guiltinan et al., 1990)。研究发现，ABRE是以组合的形式发挥作用的,即ABRC(ABA response complex)。比如一个ABRE 与一个ACGT-box及一个CE3(coupling element 3)(Shen et al., 1996)，或者两个ABRE(Uno et al., 2000)，甚至一个ABRE与一个DRE组合（Narusaka et al.,2003）。 通过酵母单杂交筛选得到了许多与ABRE结合并调控下游基因表达的反式作用元件，称之为AREB(ABA-responsive element binding protein)或ARF(ABRE binding factor)，系亮氨酸拉链转录因子（bZIP），这些基因受ABA及其它非生物逆境的诱导，而且如上文所言，其激活也依赖于ABA-Dependent的磷酸化（Uno et al., 2000;Choi et al.,2000）。 通过对RD29A和RD29B的研究，发现了一个参与干旱、低温及高盐的不依赖于ABA的顺式作用元件，即DRE（Dehydration responsive element），该顺式元件与RD29A在干旱和高盐胁迫下的迅速诱导表达及在低温胁迫下的诱导表达有关(Yamaguchi-Shinozaki and Shinozaki, 1994)。同样，通过酵母单杂交筛选，找到了结合DREB的反式作用元件，DREB1A和DREB2A以及CBF1（DREB1B），其中DEEB1A与其同源基因受低温诱导，而DREB2A及其同源基因受干旱和高

动物基因组DNA的提取

动物基因组DNA的提取 [实验原理] 在EDTA和SDS等去污剂存在下，用蛋白酶K消化细胞，随后用酚抽提，可以得到哺乳动构基因组DNA，用此方法得到的DNA长度为100-150 kb，适用于L嘴菌体构建基因组文库和Southern分析。 通过本实验了解并掌握提取基因组DNA的原理和步骤，以及相对分子质量较大的DNA 的琼脂糖凝胶电泳技术。 [仪器、材料与试剂] (一)仪器 1.台式离心机 2.玻璃匀浆器 3．高压灭菌锅 4．恒温水浴 (二)材料 1．1.5mL微量离心管 2．微量取样器和吸头 3．无菌过滤器(一次性) 4．10 mL注射器 5．鼠肝 6．三羟甲基氨基甲烷(Tris) 7.十二烷基硫酸钠(SDS) 8．乙二胺四乙酸(EDTA)

9．蛋白酶K 10．RNA酶 11．DNA相对分子质量标准物，DNA／EcoRI+HindⅢ相对分子质量标准物 (三)试剂 1、1.5 mol／L NaCl 2、0.5 mol／L Tris·HCI pH8.0 3．0.5 mol／L EDTA pH8.0 4．3 mol／L NaAc pH5.2 以上均高压灭菌。 5．蛋白酶K 10mg／mL配好后用一次性过滤器过滤，-20 保存(教师配制) 6.组织匀浆液100mmol／LNaCI，10mmol／LTris·HCl(pH 8.0)，0.25mmol／LEDTA(pH8.0) 7．酶解液200mmol／LNaCI，20mmol／L Tris·HCI(pH 8．O)，50mmol／LEDTA(PH 8.0)，200~g／mL蛋白酶K，1％SDS 8．无DNA酵的RNA酶：将胰RNA酶溶解于10mmol／L Tris.HCI(pH7.5)、15 mmol ／L NaCl溶液中，浓度l0mg／mL，于100℃水浴处理15min，以降解DNA酶，缓慢冷却到室温，-20℃保存 9．TE缓冲液：10mmol／LTris·HCl(pH8.0)，25 mmol／LEDTA(pH8.0) 10．平衡酚(pH8.0)：氧仿：异戊醇=25：24：1<体积比) 11．氧仿：异戊醇=24：l(体积比) 12．5xTBE 5．4gTris，2．75g硼酸2mL 0.5mol／L EDTA(pH8.0)，加水到100mL；13．6x上样缓冲液o．25％溴酚蓝，40％(W／V)蔗糖水溶液

生化2013年试题讲解

生化2013年招收攻读硕士学位研究生 入学考试试题 科目代码：832 科目名称：生物化学 招生专业：生命科学学院、化学化工学院、材料学院、地学部、医学院、药学院、能源研究院相关专业 一、填空题（每空1分，共30分） 1.在生物体内的重要单糖，大多以（1）构型存在，以（2）糖苷键连接的多糖，往往作为熊源形式贮存；以（3）型糖苷键连接的多糖，往往以结构成分存在。 2.根据蛋白质的（4），（5），（6）以及吸附性质和对其他分子的生物学亲和力，可将目的蛋白从混合的蛋白质提取液中分离出来。 3.分子病是由于（7）导致一个蛋白质中（8），这是一种遗传病。 4.Km是酶的一个特性常数，他的大小只与（9）有关，而与酶的浓度无关。1/Km可以近似地表示（10）。 5.蛋白质的磷酸化是可逆的。蛋白质磷酸化时需要（11）催化反应，蛋白质去磷酸化时需要（12）催化反应。 6.酵解途径唯一的脱氢反应是（12），脱下的氢由（14）递氢体接受。 7.酮体合成酶系存在于（15），氧化剂用的酶存在于（16）。 8.由尿酸合成过程中产生的2种氨基酸（17）和（18）不参与人体内蛋白质合成。 9.生物体内各类物质有各自的代谢途径，不同的代谢途径可通过交叉点上的关键中间物而星湖转化，使各代谢途径得以沟通形成网络，（19）、（20）、（21）是其中三个最关键的中间代谢物。 10.5-磷酸核糖-1-焦磷酸（PRPP）除了参与嘌呤和嘧啶核苷酸生物合成外，还与（22）和（23）等氨基酸代谢有关。 11.一碳单位可以来自多种氨基酸，其载体是（24）。 12.嘌呤合成时环上的N3和N9来自（25）。 13.tRNA的三叶草结构中，氨基酸臂的功能是携带氨基酸，D环的功能是（26），反密码予功熊是（27）。 14.嘧啶合成的起始物氨甲酰磷酸的合成需要（28）作为氨的供体，尿酸循环中的氨甲酰磷酸（29）作为氨的供体。 15.将不同来源的DNA放在试管里，经热变性后，慢慢冷却，让其复性，如果这些异源DNA之间的某些区域有相同的序列，会形成（30）。

1.什么是顺式作用元件和反式作用因子,并举例。

1．什么是顺式作用元件和反式作用因子，并举例。 答：顺式作用元件是指对基因表达有调节活性的DNA序列，它作为一种原位顺序，其活性只影响与其自身处在同一个DNA分子上的基因；同时，这种DNA序列通常不编码蛋白质，多位于基因旁侧或内含子中。简单的说，顺式作用元件是指影响自身基因表达活性的DNA序列（如转录启动子和增强子）。 反式作用因子是指其基因产物将从合成的场所扩散到其发挥作用的其他场所，游离的基因产物扩散至目标场所的过程为反式作用。调控转录的各种蛋白因子总称反式作用因子。其编码基因与其识别或结合的靶核苷酸序列不在同一个DNA分子上。如RNA聚合酶。 2．简述tRNA三级结构特点与其功能之间的关系。 答：tRNA三级结构是在二级结构的基础上经过进一步折叠扭曲形成倒L形。 此结构反映了tRNA的生物学功能，因为tRNA上所运载的氨基酸必须靠近位于核糖体大亚基上的多肽合成位点，而tRNA的反密码子必须与小亚基上的mRNA相配对，所以两个不同的功能基团最大限度分离。这个结构很可能满足了蛋白质合成过程中对tRNA的各种要求而成为tRNA的通式，tRNA的性质由反密码子决定。该结构形成双螺旋，碱基配对增加，有利于碱基堆积力的增强，空间位阻效应减小，利于与氨基酸结合，利于实现转运功能。 3．请列出至少5种真核生物蛋白质的翻译后加工方式。 答：①N端fMet或Met的切除；②二硫键的合成；③特定氨基酸的修饰（磷酸化、糖基化、甲基化、乙基化等）；④切除新生肽链中的非功能片段；⑤信号序列的切除。 4．简述亮氨酸拉链的结构特征。 答：亮氨酸拉链结构域通常被定义为一行4-7个周期重复的亮氨酸残基，其距离大约跨越8个螺旋转弯，通式为 L-x(6)-L-x(6)-L-x(6)-L，有时典型的亮氨酸残基会被异亮氨酸或缬氨酸所代替。结构分析发现亮氨酸拉链由平行的卷曲螺旋型α螺旋构成，它们通过亮氨酸侧链的疏水作用互相缠绕，亮氨酸统一排列在螺旋的一侧，而所有带电荷的氨基酸残基排在另一侧。当2个蛋白质分子平行排列时，亮氨酸之间相互作用形成二聚体，形成“拉链”。在“拉链”式的蛋白质分子中，亮氨酸以外带电荷的氨基酸形式同DNA结合。亮氨酸拉链的二级结构分析可以发现，该结构域呈“α螺旋-环-α螺旋”的结构，利于形成同源二聚体。 5．试写出一个基因可产生不同表达产物的可能机制。 答：①一个基因转录起始位点的选择不同可导致产生不同类型的酶；②同一个基因，相同的初始mRNA，但由于5′端，内含子及3′末端等选择的不同，使成熟的mRNA也不同，结果编码了功能不同的蛋白。 6.简述增强子的特征。 1,、增强子效应十分明显，2、增强子效应与其位置和取向无关，3、大多为重复序列，4、其增强效应有严密的组织和细胞特异性，5、没有基因专一性，可以在不同的基因组合上表现增强效应，6、许多增强子还受外部信号的调控 7.什么是叫C值和C值反常。 答：C值通常指一种生物单倍体基因组DNA的总量，以每种细胞内的皮克（pg）数表示。 C值反常也称C值谬误，指C值往往与种系的进化复杂性不一致的现象，即基因组大小与遗传复杂性之间没有必然关系，某些低等生物C值很大，如一些两栖动物的C值甚至比哺乳动物的还大。 8.请列出5种RNA分子，并说明其主要作用 1转运RNA tRNA 转运氨基酸 2核蛋白体RNA rRNA 核蛋白体组成成 3信使RNA mRNA 蛋白质合成模板 4不均一核RNA hnRNA 成熟mRNA的前体 5小核RNA snRNA 参与hnRNA的剪接 6小胞浆RNA scRNA/7SL-RNA 蛋白质内质网定位合成的信号识别体的组成成分 7反义RNA anRNA/micRNA 对基因的表达起调节作用 8核酶 Ribozyme RNA 有酶活性的RNA 二、问答题 1.什么叫PCR？试比较PCR与DNA复制的不同点。 答案：略 2.请画出大肠杆菌色氨酸操纵子的结构示意图，简述其表达调控中的转录弱化作用。 3.请画出大肠杆菌乳糖操纵子的结构示意图，阐述其正调控和负调控机制。 在乳糖操纵子调控模型中，负控诱导调节模式是主要的。具体来说，在没有诱导物，如乳糖、IPTG、ONPG等存在时，LacI基因转录产物为阻遏物单体，再结合成四聚体，它们能与O区DNA相结合，从而阻遏基因转录，当有诱导物存在时，可使阻遏物变成不能与O区相结合的非活性形式，从而RNA聚合酶可与Lac启动区相结合，起始基因转录。此外，正调控模式也有体现，大肠杆菌 ------来源网络，仅供参考

分子生物学题库

一．单选题 1. 有关DNA链的描述哪条不对 B A. DNA是由很多脱氧单核苷酸形成的多核苷酸 B. DNA5’端是-OH基，3’端是磷酸 C. 单核苷酸之间通过磷酸二酯键相连 D. DNA的一级结构是指dAMP,dGMP,dCMP,dTMP的排列 2 多核糖体中每一核糖体是 C A 呈解离状态 B 合成一种多肽链 C 合成多种多肽链 D 由mRNA3′端向5′移动 3 识别转录起始点的是 D A ρ因子 B 核心酶 C 聚合酶α亚基 D σ因子 4 真核生物中tRNA和5S rRNA的转录由下列哪一种酶催化 D A RNA聚合酶Ⅰ B 逆转录酶 C RNA聚合酶Ⅱ D RNA聚合酶Ⅲ 5 AUC为异亮氨酸的遗传密码，在tRNA中其相应的反密码应为 C A UAG

B TAG C GAU D GAT 6 原核生物中DNA指导的RNA聚合酶由数个亚单位组成，其核心酶的组成是 A A α 2ββ′ B α 2ββ′σ C α 2β′σ D α 2βσ E αββ′ 7 真核生物转录生成的mRNA前体的加工过程不包括 C A 5′末端加帽 B 3′末端加多聚A尾 C 磷酸化修饰 D 剪接去除内含子并连接外显子 8 转录与复制有许多相似之处，但不包括 D A 均以DNA为模板 B 所产生的新链，核苷酸之间的连接键均为磷酸二酯键 C 所用的酶均为依赖DNA的聚合酶 D 可同时合成两条互补链 E 在转录和复制过程中，遵循碱基配对的原则 9 RNA聚合酶Ⅱ催化生成之产物是A A mRNA

B tRNA及5SrRNA C 18S，28S，5.8S及5SrRNA D 18S，28S，及5.8SrRNA 10 操纵子的基因表达调节系统属于B A 复制水平调节 B 转录水平调节 C 翻译水平调节 D 翻译后水平调节 11 乳糖、阿拉伯糖、色氨酸等小分子物质在基因表达调控中作用的共同特点是 D A 与启动子结合 B 与DNA结合影响模板活性 C 与RNA聚合酶结合影响其活性 D 与蛋白质结合影响该蛋白质结合DNA E 与操纵基因结合 12 有关理想质粒载体的特点，正确的是 B A 为线性单链DNA B 含有多种限制酶的单一切点 C 含有同一限制酶的多个切点 D 其复制受宿主控制 13 以下关于顺式作用元件的叙述哪项是错误的 D

动植物基因组denovo常见问题

动植物基因组de novo常见问题 基础知识 1、什么是基因组de novo测序 答：对某一物种进行高通量测序，利用高性能计算平台和生物信息学方法，在不依赖于参考基因组的情况下进行组装，从而绘制该物种的全基因组序列图谱。 2、普通基因组的定义 答：单倍体，纯合二倍体或者杂合度<%，且重复序列含量<50%，GC 含量为35%到65%之间的二倍体。 3、复杂基因组的定义 答：杂合率＞%，重复序列含量＞50%，GC含量处于异常的范围（GC 含量＜35%或者GC含量＞65%＝的二倍体，多倍体。 诺禾致源对二倍体复杂基因组进一步细分为微杂合基因组（%＜杂合率＜%＝、高杂合基因组（杂合率＞%）以及高重复基因组（重复序列比例>50%）。 4、怎么查询基因组的大小 答：查询植物基因组大小的网站：； 查询动物基因组大小的网站：。

5、基因组的项目周期 6、基因组承诺的组装指标 答：简单基因组：contig N50>20K，scaffold N50>500K； 复杂基因组：contig N50>20K，scaffold N50>300K。 样品要求 1、动植物基因组测序对取样有什么要求 答：植物：需要黑暗无菌条件下培养的黄化苗、组培苗，基因组样本量500μg~1mg，越多越好。选择纯合或杂合度尽可能小的样品（杂合度<%）。 动物：应选取肌肉、血液等含脂肪较少的部位取样，尽量选择同一个体取样，以减少个体差异性对后续拼接的影响。基因组样本量

500μg~1mg，越多越好。样本的性别决定模式是XY型，则尽量选择雌性个体（XX型），如果是ZW型，则尽量选择雄性个体（ZZ型）。 2、全基因组测序对DNA样本有什么要求 答：（1）样品需求量（单次）：小片段文库，≥3μg；2Kb~5Kb大片段文库，≥20μg；10Kb~20Kb大片段文库，≥60μg；完成全基因组测序样品DNA量需求约为500μg~1mg； （2）样品浓度：对于小片段文库，≥50ng/μl，对于2Kb~5Kb 大片段文库，≥150ng/μl；对于10Kb~20Kb大片段文库，≥150ng/μl； （3）样品纯度：OD260/280=~；无蛋白质、RNA污染或肉眼可见杂质污染； （4）样品质量：基因组完整。如需建立≥5Kb的插入片段文库，则电泳结果，基因组DNA主带≥23Kb；脉冲场电泳结果，基因组DNA 主带≥40Kb。 文库构建 1、基因组测序的文库构建及测序策略 答：简单基因组：180bp、500bp、2K、5K、10K；PE100测序；测序深度一般为100-150X；

13 生物化学习题与解析--基因表达调控

基因表达调控 一、选择题 （一） A 型选择题 1 ．基因表达调控的最基本环节是 A ．染色质活化 B ．基因转录起始 C ．转录后的加工 D ．翻译 E ．翻译后的加工 2 ．将大肠杆菌的碳源由葡萄糖转变为乳糖时，细菌细胞内不发生 A ．乳糖→ 半乳糖 B ． cAMP 浓度升高 C ．半乳糖与阻遏蛋白结合 D ． RNA 聚合酶与启动序列结合 E ．阻遏蛋白与操纵序列结合 3 ．增强子的特点是 A ．增强子单独存在可以启动转录 B ．增强子的方向对其发挥功能有较大的影响 C ．增强子不能远离转录起始点 D ．增强子增加启动子的转录活性 E ．增强子不能位于启动子内 4 ．下列那个不属于顺式作用元件 A ． UAS B ． TATA 盒 C ． CAAT 盒 D ． Pribnow 盒 E ． GC 盒 5 ．关于铁反应元件（ IRE ）错误的是 A ．位于运铁蛋白受体 (TfR) 的 mRNA 上 B ． IRE 构成重复序列 C ．铁浓度高时 IRE 促进 TfR mRNA 降解 D ．每个 IR E 可形成柄环节构 E ． IRE 结合蛋白与 IRE 结合促进 TfR mRNA 降解 6 ．启动子是指 A ． DNA 分子中能转录的序列 B ．转录启动时 RNA 聚合酶识别与结合的 DNA 序列 C ．与阻遏蛋白结合的 DNA 序列 D ．含有转录终止信号的 DNA 序列 E ．与反式作用因子结合的 RNA 序列 7 ．关于管家基因叙述错误的是 A ．在同种生物所有个体的全生命过程中几乎所有组织细胞都表达 B ．在同种生物所有个体的几乎所有细胞中持续表达 C ．在同种生物几乎所有个体中持续表达 D ．在同种生物所有个体中持续表达、表达量一成不变 E ．在同种生物所有个体的各个生长阶段持续表达 8 ．转录调节因子是 A ．大肠杆菌的操纵子 B ． mRNA 的特殊序列 C ．一类特殊的蛋白质 D ．成群的操纵子组成的凋控网络 E ．产生阻遏蛋白的调节基因 9 ．对大多数基因来说， CpG 序列高度甲基化 A ．抑制基因转录 B ．促进基因转录 C ．与基因转录无关 D ．对基因转录影响不大 E ．既可抑制也可促进基因转录 10 ． HIV 的 Tat 蛋白的功能是 A ．促进 RNA po l Ⅱ 与 DNA 结合 B ．提高转录的频率

生物化学复习题

生物化学复习题 选择题：(A型题) 1．蛋白质的基本组成单位是： A．肽键平面 B．核苷酸 C．肽 D．氨基酸 E．碱基 2．一个生物样品的含氮量为5%，它的蛋白质含量为： A．8.80% B．12.50% C．16.0% D．38.0% E．31.25% 3．维持蛋白质分子中 -折叠的化学键是： A．肽键 B．疏水键 C．氢键 D．二硫键 E．离子键 4．维持蛋白质分子中α-螺旋的化学键是： A．肽键 B．疏水键 C．氢键 D．二硫键 E．离子键 5．关于蛋白质等电点的叙述，下列哪项是正确的？ A．在等电点处，蛋白质分子所带净电荷为零 B．等电点时蛋白质变性沉淀 C．不同蛋白质的等电点不同 D．在等电点处，蛋白质的稳定性增加 A．蛋白质的等电点与它所含的碱性氨基酸的数目无关 6．蛋白质在280nm处有最大的光吸收，主要是由下列哪组结构引起的？ A．组氨酸的咪唑基和酪氨酸的酚基 B．酪氨酸的酚基和色氨酸的吲哚环 C．酪氨酸的酚基和苯丙氨酸的苯环 D．色氨酸的吲哚环和苯丙氨酸的苯环 E．苯丙氨酸的苯环和组氨酸的咪唑基 7．蛋白质的一级结构指的是： A．蛋白质中的α-螺旋结构 B．蛋白质分子的无规卷曲 C．蛋白质分子内氨基酸以肽键相连接 D．蛋白质分子内氨基酸的排列顺序

E．蛋白质分子内的二硫键 8．下列哪种碱基几乎仅存在于RNA中？ A．腺嘌呤 B．鸟嘌呤 C．胞嘧啶 D．尿嘧啶 E．5-甲基尿嘧啶 9．下列哪种碱基几乎仅存在于DNA中？ A．腺嘌呤 B．鸟嘌呤 C．胞嘧啶 D．尿嘧啶 E．胸腺嘧啶 10．组成核酸的基本单位是： A．碱基、磷酸、戊糖 B．核苷 C．单核苷酸 D．氨基酸 E．环单核苷酸 11．核酸溶液在下列哪个波长有最大光吸收？ A．280nm B．260nm C．340nm D．225nm E．400nm 12．核酸中核苷酸之间的连接方式是： A．3’，5’-磷酸二酯键 B．1’，5’-磷酸二酯键 C．2’，5’-磷酸二酯键 D．1’，3’-磷酸二酯键 E．2’，3’-磷酸二酯键 13．维持DNA双螺旋横向稳定性的力是： A．碱基堆积力 B．碱基对之间的氢键 C．螺旋内侧疏水力 D．二硫键 E．磷酸二酯键 14．关于真核生物mRNA的结构特点，下列哪项是正确的？ A．mRNA的3'-端帽子结构通常是7-甲基GpppG B．由大、小两个亚基组成 C．在帽子结构中，存在5',5'-磷酸二酯键 D．其二级结构与DNA一样，整个分子均为双螺旋结构E．其5'-端为-CCA结构 15．酶的活性中心是指：

动物基因组学重测序的应用研究进展

畜牧兽医学报 2016，47（10）：1947-1953 A c t aV e t e r i n a r i a e tZ o o t e c h n i c aS i n i c a d o i ：10.11843/j .i s s n .0366-6964.2016.10.001动物基因组学重测序的应用研究进展 汪文强1，2，赵生国2，马利青3，郭继军4，马月辉1*，赵倩君1* （1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京100193；2.甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州730070； 3.青海省畜牧兽医科学院，西宁810016； 4.青海省畜牧总站，西宁810001 ）摘 要：随着第二代测序技术的研发和应用，基因组学的研究不断出新，为其带来了更新的科研方法和解决方案。基因组测序可以更深地了解一个物种的分子进化、基因组成和基因调控等特点，特别基因组重测序技术的发展和应用，将基因组学的研究推向了多领域、多样化、多功能的新阶段。现已从变异检测、性状定位、遗传图谱构建、群体进化分析等方面取得丰硕成果。文章阐述了动物基因组重测序学领域中全基因组测序技术和简化基因组测序技术的应用现状和发展趋势。关键词：重测序； 群体进化；变异检测；性状定位；遗传图谱中图分类号：S 813.3 文献标志码：A 文章编号：0366-6964（2016）10-1947-07收稿日期：2015-12-30 基金项目：中国农业科学院科技创新工程（A S T I P -I A S 01）；国家自然科学基金项目（31201765）；国家绒毛用羊产业技术体系（C A R S -40-01 ）作者简介：汪文强（1991-），男，甘肃天水人，硕士生，主要从事动物遗传育种与繁殖研究，E -m a i l ：187931128479@163.c o m *通信作者：赵倩君，副研究员，E -m a i l ：z h a o q i a n j u n @c a a s .c n ；马月辉，研究员，E -m a i l ：y u e h u i .m a @263.n e t T h eR e s e a r c hP r o g r e s s a n dA p p l i c a t i o no fR e s e q u e n c i n g B a s e d o nA n i m a lG e n o m i c s W A N G W e n -q i a n g 1，2，Z H A OS h e n g -g u o 2，M AL i -q i n g 3，G U OJ i -j u n 4，M A Y u e -h u i 1*，Z H A O Q i a n -j u n 1*（1.I n s t i t u t e o f A n i m a l S c i e n c e ，C h i n e s e A c a d e m y o f A g r i c u l t u r a l S c i e n c e s ，B e i j i n g 1 00193，C h i n a ；2.C o l l e g e o f A n i m a l S c i e n c e a n dT e c h n o l o g y ，G a n s uA g r i c u l t u r a lU n i v e r s i t y ，L a n z h o u 730070，C h i n a ；3.Q i n g h a i A c a d e m y o f A n i m a l S c i e n c e a n dV e t e r i n a r y M e d i c i n e ，X i n i n g 8 10016，C h i n a ；4.A n i m a lH u s b a n d r y S t a t i o n o f Q i n g h a i ，X i n i n g 8 10001，C h i n a ）A b s t r a c t ：W i t h t h e a p p l i c a t i o na n dd e v e l o p m e n t o f t h en e x t g e n e r a t i o ns e q u e n c i n g t e c h n i q u e ，t h e r e s e a r c h e so f g e n o m i c s a r e c o n s t a n t l y u p d a t i n g ，w h i c h f i n d s o u t n e ws o l u t i o n s a n d t e c h n o l o g i e s t o g e n o m i c s .T h e g e n o m e s e q u e n c i n g i s c o m p e t e n t t o l e a r nt h e p o p u l a t i o ne v o l u t i o n ，g e n ec o m p o s i -t i o na n d g e n e r e g u l a t i o nd e e p l y ，e s p e c i a l l y t h e a p p l i c a t i o na n dd e v e l o p m e n t o f g e n o m e r e s e q u e n c -i n g t e c h n o l o g y ，w h i c hm a k e s t h e g e n o m e r e s e a r c h c o m e i n t o b e i n g a n e we r a i nm u l t i r e g i o n ，d i v e r -s i f i c a t i o na n dm u l t i f u n c t i o n .N o w a d a y s t h e n e x t g e n e r a t i o n s e q u e n c i n g t e c h n i q u e h a sm a d e a l a r g e p r o g r e s s i nm u t a t i o nd e t e c t i o n ， f i n em a p p i n g o f i m p o r t a n t g e n e s ，g e n e t i cm a p c o n s t r u c t i o n ，a n a l y -s i s o f p o p u l a t i o n e v o l u t i o n ，a n d s oo n .T h e r e v i e ws t a t e s a p p l i c a t i o n s t a t u s a n dd e v e l o p m e n t t e n d -e n c y o fw h o l e g e n o m e s e q u e n c i n g t e c h n o l o g y a n d r e d u c e d -r e p r e s e n t a t i o n g e n o m e s e q u e n c i n g t e c h -n o l o g y i na n i m a l g e n o m e r e s e q u e n c i n g .K e y w o r d s ：r e s e q u e n c i n g ；p o p u l a t i o ne v o l u t i o n ；m u t a t i o n d e t e c t i o n ；f i n e m a p p i n g o fi m p o r t a n t g e n e s ；g e n e t i cm a p 随着S a n g e r 测序技术的限制性，第二代测序技术（N e x t g e n e r a t i o ns e q u e n c i n g ，N G S ）的优势逐渐凸显，对重测序技术的发展起到了重要的作用。N G S 的核心思想是边合成边测序，即通过捕捉新合成的末端的标记来确定D N A 的序列，测序技术成本低、高通量、快速、高效等特点能有效地鉴别单核