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网状Meta分析中网状关系图的绘制

网状Meta分析中网状关系图的绘制
网状Meta分析中网状关系图的绘制

张超,徐畅2曾宪涛-y

1.湖北医药学院附属太和医院循证医学中心(湖北十堰442000);2.武汉大学中南医院泌尿外科(武汉430071);

3.湖北医药学院附属太和医院口腔科(湖北十堰442000)

摘要网状关系图能够清晰地展示网状Meta分析时各干预措施间存在的直接比较关系。目前有较多绘制网状关系图的方法,但不同方法绘制的网状关系图所提供的信息量有所区别,且软件不同,其操作的友好程度亦不一样。本文简要介绍了如何应用R软件network程序包和gemtc程序包、Stata软件、ADDIS软件绘制网状关系图,并对其异同点进行了比较。

关键词网状Meta分析;网状关系图;network程序包;gemtc程序包;ADDIS软件;Stata软件;R软件

DrawingofNetworkPlotsofNetworkMeta.Analysis

ZHANGCha01,XUChan92,ZENGXian—ta01?3+

j.CenterforEvidence—BasedMedicineandClinicalResearch,TaiheHospital,HubeiUniversityofMedicine,Sh纱an442000,China;

2.DepartmentofUrology,ZhongnanHospital,WuhanUniversity,Wuhan430071,China;

3.DepartmentofStomatology,TaiheHospital,HubeiUniversityoJMedicine,Shiyan442000,China

AbstractNetworkplotscanclearlypresenttherelationshipsamongthedirectcomparisonsofvariousinterven—tionsinanetworkmeta—analysis.Currently,therearesomemethodsofdrawingnetworkplots.However,theinformationprovidedbya

networkplotandtheinterface—friendlydegreetoauserdifferinthekindsofsoftware.ThisarticlebrieflyintroduceshowtodrawnetworkplotsusingthenetworkpackageandgemtcpackagethatbaseonRSoftware,Statasoft—ware,andADDISsoftware,anditalsocomparesthesimilaritiesanddifferencesamongthem.

KeywordsNetworkmeta—analysis;Networkplot;Networkpackage;Gemtcpackage;ADDISsoftware;Statasoft—ware;Rsoftware

网状Meta分析…已经成为临床证据生产的新方法。在做网状Meta分析时,各种干预措施间往往同时存在直接比较与间接比较[2】,这使得其间的关系显得较为复杂。此时,仅通过数据本身来直观反映其间关系较为困难,网状关系图的出现很好的解决了这一问题。通过网状关系图,可以清晰地呈现哪些干预措施间存在直接比较,以及哪些干预措施间可以通过何种干预措施进行间接比较。目前,网状关系图的绘制方法较多,且各有特点。本文仍采用NICEDSUTSD中有效性的数据131(详见《R软件R2WinBUGS程序包在网状Meta分析中的应用》一文表1【4】),简要介绍如何使用几种常用的编程及非编程软件绘制网状关系图。

lR软件network程序包绘制网状关系图

基金项目:湖北省教育科学“十二五”规划2012年度重点课题(2012A050),湖北医药学院2011年度优秀中青年科技创新团队项目(2011CZX01),湖北医药学院附属太和医院2013年循证医学“苗圃基金”项目(EBM2013004)。

作者简介:张超,男(1988年~),住院医师,以循证医学、系统评价/Meta分析为主要研究方向。Email:zhangcha00803@126.COrn

II愀

I1.1R软件的安装及加载network程序包

因是基于R软件,故需先行安装R软件(详见《R软件R2WinBUGS程序包在网状Meta分析中的应用》一文【41)。目前R软件的最新版本为R3.0.1,为保持系列文章的一致性,本文仍采用R2.15。

安装完毕后,双击桌面的R软件图标,即可启动R的交互式窗口(R—GUI)。命令提示符‘‘>’’后,输人命令instaH.packages(‘'network'’),选择镜像安装(CRAN),安装完成后可由library(‘'network'’)命令完成加载。加载完成后即可使用。

1.2网状图绘制

本文例题纳入的64个研究中有12个为3臂研究[3,41,然而在http://www.mtm.uoi.gr/网站上所提供的‘'mtm.networkplot.fun'’文件为两臂研究网状关系图的绘制;需要将所有3臂研究转换为2臂方可进行网状关系图的绘制,因此笔者自行编写了适用于含3臂研究的代码,使用network程序包绘制网状图。其步骤如下:

1.2.1建立网状模型在网状图绘制之前,我们需要建立一个网状模型以存储各干预措施的同一结局

。2们3跏砌旭彻州伽”,:篙瓣:等雁羁回

万方数据

万方数据

万方数据

万方数据

万方数据

Meta分析的完整步骤

Meta分析的完整步骤 根据个人的体会,结合战友的经验总结而成,meta的精髓就是对文献的二次加工和定量合成,所以这个总结也算是对战友经验的meta分析吧。 —、选题和立题 (一)形成需要解决的临床问题: 系统评价可以解决下列临床问题: 1?病因学和危险因素研究; 2.治疗手段的有效性研究; 3.诊断方法评价; 4.预后估计; 5.病人费用和效益分析等。 进行系统评价的最初阶段就应对要解决的问题进行精确描述,包括人群类型(疾病确切分 型、分期)、治疗手段或暴露因素的种类、预期结果等,合理选择进行评价的指标。 (二)指标的选择直接影响文献检索的准确性和敏感性,关系到制定检索策略。 (三)制定纳入排除标准。 二、文献检索 (一)检索策略的制定 这是关键,要求查全和查准。推荐Mesh联合free word 检索。 (二)文献检索,获取摘要和全文 国内的有维普全文VIP, CNKI,万方数据库,外文的有medline ,SD ,OVID等。 (三)文献管理 强烈推荐使用endnote ,procite ,noteexpress 等文献管理软件进行检索和管理文献。 查找文献全文的途径: 在这里,讲一下找文献的过程,以请后来的战友们参考(不包括网上有电子全文的): 1.查找免费全文: (1 )在pubmed center 中看有无免费全文。有的时候虽然没有显示free full text ,但是 点击进去看全文链接也有提供免费全文的。我就碰到几次。

(2 )在google 中搜一下。 少数情况下,NCBI没有提供全文的,google 有可能会找到,使用“学术搜索”。本人虽然没能在google 中找到一篇所需的文献,但发现了一篇非常重要的综述,里面包含了所有我需要的文献(当然不是数据),但起码提供了一个信息,所需要的文献也就这么多了,因为老外的综述也只包含了这么多的内容。这样,至U底找多少文献,找什么文献,心里就更有底了。 (3)免费医学全文杂志网站。Www.freemedicaljournals. 。提供很过超过收费期的免费 全文。 2.图书馆查馆藏目录: 包括到本校的,当然方便,使用pubmed 的linkout看文献收录的数据库,就知道本校的 是否有全文。其它国内高校象复旦、北大、清华等医学院的全文数据库都很全,基本上都 有权限。上海的就有华东地区联目、查国内各医学院校的图书馆联目。这里给出几个: (1)中国高等院校医药图书馆协会的地址: server14.library.imicams.ac.c n/xiehui/che ngyua n. htm ,进入左侧的“现干刊联目”, 可以看到有“现刊联目查询”和“过刊联目查询”,当然,查询结果不可全信,里面有许多错误。本人最难找的两篇文章全部给出了错误的信息(后来电话联系证实的)。 (2)再给出两个比较好的图书馆索要文献的email地址(有偿服务),但可以先提供文献, 后汇钱,当然做为我们,一定要讲信誉吆。一是解放军医学图书馆信息部: xxbmlplas ina. ,:; (3)二是复旦大学医科图书馆(原上医):https://www.wendangku.net/doc/1510597160.html, ,联系人,周月琴,王蔚之, 郑荣,,2,需下载文献传递申请表(202.120.76.225/ill.doc )。其他的图书馆要么要求 先交开户费,比如协和(500元),要么嫌麻烦,虽然网上讲过可提供有偿服务,在这里我就不一一列出了。 3.请DXY战友帮忙,在馆藏文献互助站中发帖,注意格式正确,最好提供linkout的多个 数据库的全文链接,此时为帮助的人着想,就是帮助自己。自己也同时帮助别人查文献,一来互相帮助,我为人人,人人为我。二则通过帮助别人可以积分,同时学会如何发帖和下载全文,我就感觉通过帮助别人收获很大,自己积分越高,获助的速度和机会也就相应增加。现在不少免费的网络空间(我常用爱存www.isload..c n ),比发邮件简便

Meta分析的步骤(完整版)

Meta分析的完整步骤 Meta分析的完整步骤,根据个人的体会,结合战友的经验总结而成,meta的精髓就是对文献的二次加工和定量合成,所以这个总结也算是对战友经验的meta分析吧。 一、选题和立题 (一)形成需要解决的临床问题: 系统评价可以解决下列临床问题: 1.病因学和危险因素研究; 2.治疗手段的有效性研究; 3.诊断方法评价; 4.预后估计; 5.病人费用和效益分析等。 进行系统评价的最初阶段就应对要解决的问题进行精确描述,包括人群类型(疾病确切分型、分期) 、治疗手段或暴露因素的种类、预期结果等,合理选择进行评价的指标。 (二)指标的选择直接影响文献检索的准确性和敏感性,关系到制定检索策略。 (三)制定纳入排除标准。 二、文献检索 (一)检索策略的制定 这是关键,要求查全和查准。推荐Mesh联合free word检索。 (二)文献检索,获取摘要和全文 国内的有维普全文VIP,CNKI,万方数据库,外文的有medline ,SD,OVID等。 (三)文献管理 强烈推荐使用endnote,procite,noteexpress等文献管理软件进行检索和管理文献。 查找文献全文的途径: 在这里,讲一下找文献的过程,以请后来的战友们参考(不包括网上有电子全文的): 1.查找免费全文: (1)在pubmed center中看有无免费全文。有的时候虽然没有显示free full text,但是点击进去看全文链接也有提供免费全文的。我就碰到几次。 (2)在google中搜一下。 少数情况下,NCBI没有提供全文的,google有可能会找到,使用“学术搜索”。本人虽然没能在google中找到一篇所需的文献,但发现了一篇非常重要的综述,里面包含了所有我需要的文献(当然不是数据),但起码提供了一个信息,所需要的文献也就这么多了,因为老外的综述也只包含了这么多的内容。这样,到底找多少文献,找什么文献,心里就更有底了。(3)免费医学全文杂志网站。。提供很过超过收费期的免费全文。 2.图书馆查馆藏目录: 包括到本校的,当然方便,使用pubmed的linkout看文献收录的数据库,就知道本校的是否有全文。其它国内高校象复旦、北大、清华等医学院的全文数据库都很全,基本上都有权限。上海的就有华东地区联目、查国内各医学院校的图书馆联目。这里给出几个: (1)中国高等院校医药图书馆协会的地址:,进入左侧的“现刊联目”,可以看到有“现刊联目查询”和“过刊联目查询”,当然,查询结果不可全信,里面有许多错误。本人最难找的两篇文章全部给出了错误的信息(后来电话联系证实的)。 (2)再给出两个比较好的图书馆索要文献的email地址(有偿服务),但可以先提供文献,后汇钱,当然做为我们,一定要讲信誉吆。一是解放军医学图书馆信息部:,电话:;

Meta分析的完整步骤

Meta 分析的完整步骤,根据个人的体会,结合战友的经验总结而成, 量合成,所以这个总结也算是对战友经验的 meta 分析吧。 一、选题和立题 (一)形成需要解决的临床问题: 系统评价可以解决下列临床问题 : 1. 病因学和危险因素研究 ; 2. 治疗手段的有效性研究 ; 3. 诊断方法评价 ; 4. 预后估计 ; 5. 病人费用和效益分析等。 进行系统评价的最初阶段就应对要解决的问题进行精确描述 , 包括人群类型 (疾病确切分型、 分期 ) 或暴露因素的种类、预期结果等 , 合理选择进行评价的指标 。 (二)指标的选择直接影响文献检索的准确性和敏感性,关系到制定检索策略。 (三)制定纳入排除标准。 、文献检索 一)检索策略的制定 meta 的精髓就是对文献的二次加工和定 、治疗手段

这是关键,要求查全和查准。推荐Mesh 联合free word 检索。 (二)文献检索,获取摘要和全文 国内的有维普全文VIP , CNKI,万方数据库,外文的有medline ,SD , OVID等。 / ■ X 卜TB (三)文献管理 强烈推荐使用endnote ,procite ,noteexpress 等文献管理软件进行检索和管理文献。查找文献全文的途径:在这里,讲一下找文献的过程,以请后来的战友们参考(不包括网上有电子全文的): 1. 查找免费全文: (1)在pubmed center 中看有无免费全文。有的时候虽然没有显示free full text ,但是点击进去看全文链接也有提供免费全文的。我就碰到几次。 (2)在google 中搜一下。 少数情况下,NCBI没有提供全文的,google有可能会找到,使用“学术搜索”。本人虽然没能在google中找到一篇所需的文献,但发现了一篇非常重要的综述,里面包含了所有我需要的文献(当然不是数据),但起码 提供了一个信息,所需要的文献也就这么多了,因为老外的综述也只包含了这么多的内容。这样,到底找多少文献,找什么文献,心里就更有底了

频率学视角下的网状meta分析及其结果解读

频率学视角下的网状meta分析及其结果解读自meta分析问世以来,每年发表的文献不断增多,显示出一幅欣欣向荣的景。不用做实验,收集文献,一台电脑,一个数据库即可,省力又省钱,说是临床神技不为过。然而,随着写的人越来越多,普通的meta分析越来越难找到主题,投稿越发的困难。目前,较火的meta分析要算是网状meta了。相对于普通meta,网状meta的优势显而易见。目前,网状meta又可以分为基于贝叶斯理论和频率学理论两大派。贝叶斯的网络meta分析可用winbugs实现,可惜,单独的winbugs并无作图功能,无法给出森林图等图形化结果,目前普遍的方法是结合R软件或stata软件,读取winbugs计算结果进行作图。其次,单独使用R软件也能实现贝叶斯的网状meta分析,缺陷在于只能实现一致性模型,假如结果存在不一致的情况,仍然要借用winbugs计算。Winbugs的缺陷除了不能作图,还存在编程困难的问题,对于医学专业学生来说,编程是一项极为复杂的事,虽然能找到基本代码进行修改,但是如何修改,如何软件的互相调用,也是一大难题,稍有不慎,代码出错极难解决。网状meta的另一个方法是基于频率学派的,此方法只要stata就能完全操作,包括结果的可视化,均可实现。本文就stata频率学网状meta 2984891249分析结果进行一一解读。 1.1绘制网状结构图结果 网状结构图如图1 所示。由图可见药物D(结点D)的圆圈面积最大,D-C、A-D、A-B 之间的边较宽,表明在纳入NMA 的研究中,

药物D、D-C、A-D、A-B之间比较的研究出现频率最多。(注:此处值展示了普通的网络图,其实,我们可以根据命令,设置不同研究是否盲法、随机、隐藏等质量评价的内容,是图片更加丰富多彩,此处不再展示) 1.2贡献图 网状meta分析中的不同的直接比较对网状meta分析的结果的影响不同,因此有时候需要评估不同直接比较对网状meta 分析结果的影响,并找出影响网状meta分析合并结果最多的直接比较。例如,当评估网状meta分析真实性的时候,就需要评估风险偏倚对网状meta分析结果的影响。高风险偏倚且对网状meta分析高贡献的直接比较结果可能会影响网状meta

Meta分析的步骤.doc

Meta 分析的完整步骤 Meta 分析的完整步骤,根据个人的体会,结合战友的经验总结而成,meta 的精髓就是对文献的二次加工和定量合成,所以这个总结也算是对战友经验的meta 分析吧。 一、选题和立题 (一)形成需要解决的临床问题: 系统评价可以解决下列临床问题: 1.病因学和危险因素研究; 2.治疗手段的有效性研究; 3.诊断方法评价 ; 4.预后估计 ; 5.病人费用和效益分析等。 进行系统评价的最初阶段就应对要解决的问题进行精确描述,包括人群类型 (疾病确切分型、分期 ) 、治疗手段或暴露因素的种类、预期结果等,合理选择进行评价的指标。 (二)指标的选择直接影响文献检索的准确性和敏感性,关系到制定检索策略。 (三)制定纳入排除标准。 二、文献检索 (一)检索策略的制定 这是关键,要求查全和查准。推荐Mesh 联合 free word 检索。 (二)文献检索,获取摘要和全文 国内的有维普全文VIP,CNKI,万方数据库,外文的有medline ,SD, OVID 等。 (三)文献管理 强烈推荐使用endnote , procite , noteexpress 等文献管理软件进行检索和管理文献。 查找文献全文的途径: 在这里,讲一下找文献的过程,以请后来的战友们参考(不包括网上有电子全文的):1.查找免费全文: (1)在 pubmed center 中看有无免费全文。有的时候虽然没有显示 free full text ,但是点击进去看全文链接也有提供免费全文的。我就碰到几次。 (2)在 google 中搜一下。 少数情况下, NCBI 没有提供全文的, google 有可能会找到,使用“学术搜索”。本人虽然没能在google 中找到一篇所需的文献,但发现了一篇非常重要的综述,里面包含了所有我需要的文献(当然不是数据),但起码提供了一个信息,所需要的文献也就这么多了,因为老 外的综述也只包含了这么多的内容。这样,到底找多少文献,找什么文献,心里就更有底了。(3)免费医学全文杂志网站。。提供很过超过收费期的免费全文。 2.图书馆查馆藏目录: 包括到本校的,当然方便,使用pubmed 的linkout 看文献收录的数据库,就知道本校的是否有 全文。其它国内高校象复旦、北大、清华等医学院的全文数据库都很全,基本上都有权限。上 海的就有华东地区联目、查国内各医学院校的图书馆联目。这里给出几个: (1)中国高等院校医药图书馆协会的地址:,进入左侧的“现刊联目” ,可以看到有“现刊联 目查询”和“过刊联目查询” ,当然,查询结果不可全信,里面有许多错误。本人最难找 的两篇文章全部给出了错误的信息(后来电话联系证实的)。 (2)再给出两个比较好的图书馆索要文献的email 地址(有偿服务),但可以先提供文献,后汇钱,当然做为我们,一定要讲信誉吆。一是解放军医学图书馆信息部:,电话:;

Meta分析的完整步骤,DOC

Meta分析的完整步骤,根据个人的体会,结合战友的经验总结而成,meta的精髓就是对文献的二次加工和定量合成,所以这个总结也算是对战友经验的meta分析吧。 一、选题和立题 (三)制定纳入排除标准。 二、文献检索 (一)检索策略的制定 这是关键,要求查全和查准。推荐Mesh联合freeword检索。

(二)文献检索,获取摘要和全文 国内的有维普全文VIP,CNKI,万方数据库,外文的有medline,SD,OVID等。 (三)文献管理 强烈推荐使用endnote,procite,noteexpress等文献管理软件进行 了一篇非常重要的综述,里面包含了所有我需要的文献(当然不是数据),但起码提供了一个信息,所需要的文献也就这么多了,因为老外的综述也只包含了这么多的内容。这样,到底找多少文献,找什么文献,心里就更有底了。

2.图书馆查馆藏目录: 包括到本校的,当然方便,使用pubmed的linkout看文献收录的数据库,就知道本校的是否有全文。其它国内高校象复旦、北大、清华 根据地址来确定是否是同一作者。 5.查找杂志的网址,给主编发信求取全文。这里我就不讲查找的方法了,DXY中有许多帖子。我的一篇全文就是这样得到的。

6.向国外大学里的朋友求助。国外大学的图书馆一般会通过馆际互借来查找非馆藏文献,且获得率非常高。我的三篇文献是通过这一途径得到的。 如果还是找不到,那就……我也没辙了,还有朋友如有其他的方法, 法”; ⑤各组病人的年龄、性别、职业等是否相似; ⑥除进行研究的治疗手段不同外,其它的治疗是否一致; ⑦治疗作用大小; ⑧治疗效果的评价是否准确;

最新整理meta分析中异质性检验浅析教学内容

Meta分析中的异质性检验 一、M eta分析原理 假定各个不同研究都是来自同一个总体,要求不同研究间的统计量应该接近总体参数真实值,所以各个不同文献研究结果是比较接近,就要符合同质性,这时候将所有文献的效应值合并可以采用固定效应模型的有些算法,如倒方差法, man tel hae nszel 法, peto 法等。 二、异质性的概念 2.1广义:描述参与者、干预措施和一系列研究间测量结果的差异和多样性,或那些研究间的内在真实性的变异。 2.2狭义:专指统计学异质性,用来描述一系列研究中效应量的变异程度,也表明除可预见的偶然机会之外的研究间存在的差异性。 三、异质性的分类 3.1临床异质性:包含试验对象的差异,如纳入及排除标准的不同;试验条件的差异,如干预剂量、剂型、方法不同;定义指标的差异,如试验定义的暴露、结局、测量工具不同,等等。 3.2方法学异质性:包含研究设计的差异,如前瞻性、回顾性、随机化对照试验;偏倚风险,如盲法;结局完整性,如随访时间长短不同。 3.3统计学异质性:是指不同试验间被估计的效应指标的变异,它是研究间临床和方法学上多样性的直接结果。 统计学计算一致性以数据为基础,其原理是各研究间可信区间的重合程度 越,则各研究间存在统计学同质性的可能性越大,相反,可信区间的重合程度越 小,各研究间存在统计学异质性的可能性越大。 临床异质性、方法学异质性和统计学异质性三种是相互独立又相互关联的, 临床或方法学上的异质,不一定在统计学上就有异质性的表现,反之亦然。但寻找临床和方法学上的异质性可以提示统计学异质性的来源。 四、异质性检验方法 4.1概念:又叫统计量的齐性检验(一致性检验),目的是检查各个独立研究的结果是否具有可合并性。 4.2常见方法: 4.2.1 Q检验 (1)计算公式及解释 注:Wi :第i个研究的权重,Yi :第i个研究的效应量,M :所有研究的平均效应量。 Q为效应量的标准化平方和,因此服从自由度为(k-1 )的x 2分布。Q值越大,则p 值越小(无效假设为纳入研究的效应量均相同),则异质性越大。 (2)Q检验的缺陷:

基于使用的网状Meta分析软件的比较研究与选择

基于使用的网状Meta分析软件的比较研究与选择 曾宪涛1,2,3?张?超1,3?邝心颖2?孙?鑫2?李幼平2* 1. 武汉大学中南医院循证与转化医学中心(武汉 430071); 2. 四川大学华西医院中国循证医学中心(成都 610041); 3. 湖北医药学院附属太和医院循证医学与临床研究中心(湖北十堰 442000) 摘要?目的 比较各种网状Meta 分析(NMA )软件的特征及功能,为使用者选择软件提供参考。方法 计算机检索PubMed 、CNKI 、Stata 公司官方网站、R 软件官方网站和Google ,收集具有NMA 功能的软件及程序包,检索时限截至2014年7月。下载软件和程序包及其使用指南,用示例进行计算。对软件的基本特征、功能和计算结果进行比较分析。结果 共纳入11款软件,包括编程软件和非编程软件,主要基于贝叶斯学派和频率学派研发。大多数软件已具操作简单、易掌握、计算准确及图形绘制优良等优点,但无一款同时具备较佳计算能力与绘图功能的软件,必需多款软件联合来实现。结论 建议使用者首先依据自身编程基础与习惯等选取,可考虑选用两种或三种软件相互配合来实现NMA 。建议研发一款功能完备、操作简单的免费软件。 关键词 网状Meta 分析;BUGS 软件;R 软件;Stata 软件;SAS 软件;ADDIS 软件;GeMTC 软件;JAGS 软件 Software for Network Meta-Analysis: A Usage-based Comparative Study ZENG Xian-tao 1,2,3, ZHANG Chao 1,3, Joey S.W. KWONG 2, SUN Xin 2, LI You-ping 2 1. Center for Evidence-based and Translational Medicine, Zhongnan Hospital, Wuhan University, Wuhan 430071, China; 2. Chinese Evidence-Based Medicine Centre, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu 610041, China; 3. Center for Evidence-based Medicine and Clinical Research, Taihe Hospital, Hubei University of Medicine, Shiyan 442000, China Abstract Objective To compare the characteristics and functions of the network meta-analysis software and for providing references for users. Methods PubMed, CNKI, official website of Stata and R, and Google were searched to col-lect the software and packages that can perform network meta-analysis up to July 2014. After downloading the software, packages, and their user guides, we used the software and packages to calculate a typical example. The characteristics, func-tions, and computed results were compared and analyzed. Results Finally, 11 types of software were included, including programming and non-programming software. They were developed mainly based on Bayesian or Frequentist. Most types of software have the characteristics of easy to operate, easy to master, exactitude calculation, or good graphing; however, there is no software that has the exactitude calculation and good graphing at the same time, which needs two or more kinds of soft-ware combined to achieve. Conclusion We suggest the user to choose the software at least according to personal program-ming basis and custom; and the user can consider to choose two or more kinds of software combined to finish the objective network meta-analysis. We also suggest to develop a kind of software which is characterized of fully function, easy operation, and free. Key words Network meta-analysis; BUGS software; R software; Stata; SAS; ADDIS; GeMTC software; JAGS software DOI: 10.7507/1672-2531.20140204基金项目:湖北省教育科学“十二五”规划2012年度重点课题(编号:2012A050);湖北医药学院附属太和医院2013年循证医学“苗圃基金”项目(编号:EBM2013004)作者简介:曾宪涛,男(1984年~),硕士,副主任医师、讲师,以循证医学、口腔临床医学、临床流行病学、系统评价/Meta 分析为主要研究方向。Email: zengxiantao1128@https://www.wendangku.net/doc/1510597160.html, * 通讯作者,Email: yzmylab@https://www.wendangku.net/doc/1510597160.html, 自2002年正式提出网状Meta 分析(network meta-analysis ,NMA )以来,其方法学与制作软件均迅速发展?[1-3]。与传统Meta 分析相比, NMA 因纳入干预措施多、数据量大、内在结构复杂,对软件的依赖更为突出。目前已有多款能实现NMA 计算 的软件,但尚无能独立且全面实现NMA 计算及相关图形绘制的软件,必须多款软件相互配合方可完成?[4,5]。目前,最新版Cochrane 手册?[6]虽在16.6和 16.8章节介绍NMA ,并建议使用WinBUGS 软件?[7],但该软件欠缺绘图功能。如何有效选择软件并配合使用,是当前制作NMA 的一个难点。本研究比较分析当前能实现NMA 的软件,为读者更好地选择相关软件提供参考。 1 对象与方法 1.1 NMA 软件选择标准

Meta分析发SCI经验体会

初次接触到Meta分析是在大五实习的时候(2000年10月),当时在消化科实习,正好内科教研室需要人手帮忙,就认识了内科教研室副主任(我人生最重要的几位长者之一),从他那里听说了Meta分析。 然后,从内分泌科一位教授那里拿到了RevMan软件,当时国内做Meta分析的人好像很少,只好自学,一边摸索软件、一边检索国外的相关文献、同时请教前辈们。慢慢的发现了一点诀窍,于是小试牛刀,选择了普萘洛尔预防肝硬化上消化道出血这个题目。检索文献后发现可以分为初次、再次出血的预防。于是分别在国内的核心期刊发表2篇文章(2002年)。当时自己根本没有认识什么SCI,要发表英文文章之类的。后来,陆续在国内发了几篇文章(为了毕业留校,当时发表1篇文章可以加分的)。 SCI实在是被动接触的,也可以说是自己送上门的。2002年发表普萘洛尔的2篇文章后,收到当时国内SCI“牛刊”(World J Gastroenterol)的约稿,大概意思是让把普萘洛尔的2篇文章汇总为1篇发表。于是用了3个月的时间自己翻译、润色、投稿,经过几次修改,在2003年发表(World J Gastroenterol的IF最高年,第二年便被打入冷宫。自己拿了一笔不小的奖金,哈哈。)。 后来选择专业方向,自己转到了眼科方向发展(2001年9月-

2003年6月)。最开始的1年,主要是熟悉临床、做实验,没有顾及眼科Meta分析。最后按照规定在非眼科科室轮转、等待毕业的时候,因为时间比较宽余,所以开始写眼科Meta分析。前前后后在2003年、2004年发表了5篇中文文章(主要都是白内障方面的)。在查阅文献的过程中,发现了一篇文章很有意思,记得是发表了Ophthalmology的,不是对照试验的Meta分析,而是回顾性文献的Meta分析(率的Meta分析),感觉方法不错(公式写的非常明白)。正好当时青光眼非穿透性小梁手术很热(但都是没有对照的回顾性文献),于是就照搬他的方法写出了自己的第一篇眼科SCI(2004年)。 后来的两年,忙着组建家庭、体验临床,将Meta分析基本搁置(关键是没有了毕业分配压力,中级职称评审以往的文章已足够,所以就懒了下来)。2006年开始,因为逐渐感觉到国内SCI 的狂热,自己也认识到职称评审的压力,而缺少科研经费以及科研时间,只好再次开始Meta分析之旅。在2007年发表了自己第一篇真正意义的SCI文章(Am J Ophthalmol)。也是在2007年,花了三个月的时间,总结回顾了自己的以往文章,发现实在是太杂,缺乏系统性,所以认真总结筛选后,决定专注于“青光眼”。于是,把以前发表的青光眼非穿透性小梁手术拿出来,重新检索,发现有很多新的临床试验出来。正好赶上四川救灾,整整四十天时间的坚持(最初的十天还是有很多医疗救护需要做

meta分析的写作思路

收集整理丁香园郎中1987的关于meta分析的写作!! 一、新手meta分析上路(一):选题 现在读研的很多学生甚至临床上的医生,迫于某些压力或者是个人兴趣(找虐型),开始学习meta分析,理想的发篇SCI文章,不济的也当学个技术,技多不压身。为什么会找meta做为切入点呢,江湖传言此乃发文神器,某大仙一年发十篇meta的也不是少见。感觉它不用做实验,窝在家一股脑的看文献,整理整理数据,也不耗钱,真是一本万利的生意,尤其适合苦逼的临床医生。也不用养老鼠闻味道,不用陪细胞过夜,不用天天WB,PCR,转染,过表达,etal。长期接触这些生物试剂能活下来的都是命大。。。。。 所以聪明的中国人开始走上了meta这道“不规路”,早上发,中午发,天天发,发。。。。 好了,扯了那么多没用的,入正题,想发一篇文章,首先是要选好一个题目。我可以负责任的告诉大家,你今天选题的高度决定了你日后发文的高度。所以磨刀不误砍柴工,好好选题,良好的开端是成功的一半(好一碗鸡汤)。 那么问题来了,怎么选题呢?结合我个人的经验,我认为良好的优质的题目有以下几个特点: 1.是临床现有的争议点,大家对此还不是很统一,指南也模棱两可。 2.对现有的操作的一种challenge,如果你的meta能改变某种临床行为,那你屌了。 3.之前已经有篇meta了,但后来因为加入新的articles,挑战了之前的结果,能引起一定的讨论。 当然,这些题目都很难找,因为不仅国人“沉迷”meta,老外也不甘落后的。现阶段大部分multi-centersRCTs都是国外研究机构发表的,他们一般在进行临床研究的同时,已经将其meta分析的文章也顺带做了,RCTs发表同时将meta分析也扔出去。所以好题目都被他们抢了,我们只能捡些他们不要的(这是一个忧伤的故事)。 不管如何,我们还是要掌握一些选题的技巧和原则,指不定那一天就让我们碰上了一个好题目也不一定(人如果没有梦想那跟咸鱼有什么区别,星爷如是说)。我有几个渠道和方式来选择题目(主要指干预方面的meta): 1.看本专业Top临床期刊最新的articles和review,如我是神经科的,我就去多逛逛Neurology,Stroke, Movementdisorder等专科杂志最新的RCTs和综述,尤其是综述里面治疗的那一部分。同时也可以逛逛4大临床期刊(是那4大?不知道,那去搬砖吧)里面关于本专业的一些articles和review。 2.看指南的治疗部分,如XX治疗方式XX病最近有研究表示有效或无效,但缺乏足够的証据,有争议(看到有争议,眼睛都亮了),那就是我们的切入点。但因为指南具有滞后性,所以指南里面提到的可能都已经被人下手了。 3.去逛逛临床试验注册网站,有些大型RCTs发表前都会在这些网站上注册,你就可以了解最新正在进行的临床研究,知道它们大概什么时间弄完,守株待兔,

Meta分析意义

中晚期鼻咽癌同期放化疗疗效的Meta分析 第十三章循证医学和Meta分析 第一节循证医学概述 一、循证医学的定义 著名的临床流行病学家David L. Sackett在2000年版《怎样实践和讲授循证医学》中,定义循证医学为“慎重、准确和明智地应用当前所能获得的最佳的研究依据,同时结合临床医生的个人专业技能和多年的临床经验,考虑患者的权利、价值和期望,将三者完美地结合以制定出患者的治疗措施。 二、循证医学的基础 1、素质良好的临床医生实践循证医学的主体是临床医生,素质良好的临床医生不仅要具备良好的专业水平和崇高的职业道德,而且还需要随时更新和丰富自己的知识。 2、最佳的研究证据最佳的研究证据是指对当前临床研究的文献,应用临床流行病学的原则和方法以及有关质量评价的标准,进行认真分析和严格评价获得的新近最真实可靠且有实际临床应用价值的研究成果或证据。 3、临床流行病学的基本方法和知识要想收集最佳证据,必然要分析其研究设计是否科学;要评价文献的质量,必须要掌握严格的评价标准,分析所报道的研究结果的真实性、可靠性、偏倚的影响及其可被接受的程度;要评价文献的重要临床意义,必须分析研究终点指标的合理性、准确程度以及临床价值等,而这些因素正是临床流行病学研究的核心内容。 4、患者的参与及合作医生任何诊治决策的实施,都必须通过患者的接受和合作,才会取得相应的效果。 5、必要的医疗环境和条件创造和应用临床最佳的研究成果,都离不开相应的硬件设施。 三、循证医学的特点 1、证据的来源EBM是个人经验和外部最佳证据的结合,强调证据尤其是证据的可靠性。 2、对研究方法的要求EBM要求提供证据的临床研究一定要符合临床科研方法学的原则,用科学的研究方法尽可能将多种偏倚控制在最小范围内,保证研究结果的可靠性和可信性。 3、对样本量的要求EBM要求大样本。 4、结果评价的指标EBM以结局终点指标(outcome end-point)为主要观察指标。弥补了传统医学以适度疗效指标(surrogate end-point),为主进行评价的缺陷。 四、循证医学实践的目的 1、弄清疾病发病的危险因素,为疾病的防治提供依据; 2、提供可靠的诊断依据; 3、帮助医生为患者选择当前最科学、合理的治疗措施; 4、分析和应用促进患者康复的有利因素,改善患者预后和提高生存质量; 5、提供可用于卫生管理的最佳研究证据,促进管理决策科学化。 五、循证医学实践的意义 1、促进临床决策科学化,避免资源浪费; 2、发掘疑难问题,促进临床和临床流行病学研究; 3、促进临床医生业务素质的提高,紧跟科学发展水平; 4、有利于国际间医学资源的共享,促进医学科学的发展; 5、有助于患者参与医疗过程,监督医疗,保障自身的权益。 第二节循证医学实践的步骤 一、循证医学实践的步骤

Meta分析的基本方法和步骤

Meta分析基本步骤 (一)提出问题,拟定研究计划。 选择临床热点问题:注意时效性 (二)检索相关文献。 (三)根据纳入、排除标准筛选文献 (四)提取纳入文献的数据信息 a)一般要求2人进行 b)事先设计表格 (五)纳入研究的质量评价 a)达不到分值标准可以排除 (六)资料的统计学处理 (七)敏感性分析 (八)结果分析和讨论 一、选题与立题 a)形成需要解决的临床问题 i.疾病的病因学探讨: ii.治疗方法效果评价:某方法是否优于另一种方法; iii.诊断方法评价:某因子在某肿瘤方面的预测作用; iv.生存预后分析 进行系统评价的最初阶段就应对要解决的问题进行精确描述,包括人群特征 (疾病分型、分期)、治疗手段或暴露因素的种类、预期结果等,合理选择进 行评价的指标。 b)结合自己的研究方向、平时阅读文献、科研讨论、参加学术会议等获得好的选题; 及时去Pubmed检索他人是否已发表 i.注意有无类似分析发表 ii.已发表结果评价,是否有再次分析的意义:(1)结果有无重大变化;(2)已发表结果有无缺陷 iii.对已发表2周内的文献进行评价(Letter) 二、文献检索 (一)检索策略的制定 要求查全和查准。推荐自由词(text word search)或医学主题词(medical subject headings(Me SH))检索 (二)文献检索,获取全文 国内的有维普全文VIP、CNKI、万方数据库

外文的有Pubmed、OVID、Embase(Scopus可能包含,可以替代)等 获取全文途径: Pubmed Goole学术搜索 给通讯作者发email 向国外朋友求助 零点花园(https://www.wendangku.net/doc/1510597160.html,/bbs/)、丁香园等文献求助版块 (三)文献管理 推荐使用endnot、noteexpress和医学文献王等文献管理软件进行检索和管理文 献 三、纳入和排除标准 1、制定标准考虑四个方面 a)研究对象:疾病类型、年龄、性别、病情严重程度等作出明确规定; b)研究设计类型:明确规定哪些类型的设计可以纳入: c)暴露或干预措施:暴露或处理的程度、一致性;干预措施的剂量、强度、病例 依从性等; d)研究结局:量化的、可比的研究结局、随访年限。 另外:类似文献的标准可作参考 2、筛选文献严格按照标准筛选文献。两名研究人员完成。 四、文献质量评价和数据收集 (一)研究的质量评价 RCT研究:包括改良版Jadad量表(1-3分视为低质量,4-7分视为高质量)和Cochrane Handbook 5.0 RCT 质量评价等。 改良版Jadad量表: 1.随机序列的产生: a)恰当:计算机产生的随机数字或类似方法(2分) b)不清楚:随机实验但未描述随机分配的方法(1分) c)不恰当:采用交替分配的方法如单双号(0分) 2.随机化隐藏: a)恰当:中心或药房控制分配方案,或用序列编号一致的容器,现场计算机 控制,密封不透光的信封或其他使临床医生和受试者无法得知分配序列的 方法(2分) b)不清楚:只表明使用随机数字表或其他随机分配方案(1分) c)不恰当:交替分配、病例号、星期日数、开放式随机号码表、系列编码信 封以及任何不能防止分组的可预测性的措施(0分) d)不使用(0分) 3.盲法:

BMJ的一篇meta分析范文分享.doc

BMJ 的一篇 meta 分析范文分享 随着科学研究的发展,医生和科研工作者越来越需要全 面实时了解医学信息,但往往受到时间和资源的限制,所以 产生了对原始文献的结果进行综合分析的需求,这就催生了 一门专业学科——Meta 分析。 Meta 分析能对同一课题的多 项研究结果的一致性进行评价;提出一些新的研究问题,为 进一步研究指明方向;当受制于某些条件时,如时间或研究 对象的限制, meta 分析不失为一种好的选择;对小样本的临 床实验研究, meta 分析可以统计效能和效应值估计的精确 度。因此,设计合理、严密的 meta 分析文章能对证据进行更 客观的评价(与传统的描述性的综述相比),对效应指标进 行更准确、客观的评估,并能解释不同研究结果之间的异质 性。盟主今天就带大家看看一篇可谓范文的 meta 分析。这是一篇2014 年发表在 BMJ 上的 meta 分析: 1、作者首先提出 临床问题:在健康无症状感染人群中进行 Hp 根除治疗,是否可 预防胃癌发生。无疑,这是一个医学界非常关注的、有 意义的问题。 2、制定文献的纳入、排除标准,作者设定了 详细的文献纳入、排除标准: 3、检索文献:规定检索范围(Medline(1946 to December 2013), Embase(1947 to December 2013), and the Cochranecentral register of controlled trials ),并对会议论文集进行手工检索,

选择可能符合条件的研究,联系这些只发表了会议摘要的研 究者,要求他们提供完整的数据集或论文。检索策略作者以 单独的附件形式列出,共56 条: 4、筛选文献:作者列 出根据纳入、排除标准进行文献评价的流程图如下:5、提取数据:设定信息提取表,列出所要提取的信息,并进行敏 感性分析。 6、对纳入的研究进行偏倚风险评价:这篇meta 分析纳入的都是 RCT 研究,偏倚风险评价由两名研究者根据Cochrane 手册独立完成,分歧通过讨论解决。涉及随机化、随机方案 隐藏、盲法实施、失访率等。 7、数据合并、统计学分析:作者应用随机效应模型以得到 更保守和稳健的估计,并进行多个亚组分析。

Meta分析与药物评价

Meta分析与药物评价 审评二部唐健元 中文摘要:本文通过对meta分析的简要介绍,浅析其在当前药物评价中的作用。 Meta分析是对具有相同研究目的且相互独立的多个研究结果予以合并作出定量分析。通过合并多个同类研究,达到增大样本量,提高检验效能的目的,经正确方法建立起来的meta分析结果一般来说更接近真实情况。最初的Meta分析技术主要用于临床医学和公共卫生决策等方面,随着分析方法的成熟和人们认识的进步,欧美药政管理当局已逐渐开始要求将meta分析技术用于新药申请中,尤其在生物统计指导原则(ICH E9)中明确指出,“meta 分析技术被认作是用来概括药物申请的整体有效性结果和在整体安全性评价中分析罕见事件的一个有用工具”。 1. meta分析的目的和意义 meta分析是一个观察性的回顾性研究,它与传统文献综述的主要区别在于传统文献综述是以定性分析描述为主,而meta分析则可以对合并研究结果进行定量,有助于药物受益人群的外推和发现一些小概率不良事件,并可纠正因小样本RCT所带来的研究偏倚,同时可找出相同研究却有不同结论的原因所在。如单个研究结果显示“没有统计学意义”并不意味着干预措施无效,很可能由于样本量偏小导致检验功效较低,当效应较弱时易犯Ⅱ类错误。其次,对于多个同类研究结果在程度和方向上出现不一致时,采用meta分析可以得出同类研究的平均效应水平,并可解决研究结果中出现有争议或相互矛盾的现象,使得效应范围更加精确。第三、meta分析可以揭示单个研究中存在的不确定性,考察研究间异质性来源,估计可能存在的各种偏倚,而当meta分析纳入多个同质性很好的研究时,其结论就具有一般性意义。 2. meta分析的基本方法[1、2] 一般的meta分析基本步骤有:一、提出问题,主要包括有研究对象、研究设计、处理因素、研究效应等四个要素。二、文献检索,文献检索包括有机检和手检,并应充分考虑检索结果的敏感性和特异性,保证高质量的查全率非常重要。三、选择符合要求的纳入文献,为尽量降低选择偏倚,使meta分析结果有较好的重复性,一般应从研究对象、研究设计类型、暴露或干预措施、研究结局、研究开展的时间或文献发表的年份和语种、样本大小及随访年限、多重发表的处理和提供信息的完整性等方面进行考虑。四、纳入研究的质量评价,主要应从选择偏倚、实施偏倚、失访偏倚和测量偏倚等方面进行考虑。五、数据信息提取,数据提取工作最好采取盲法的双人独立实施操作,避免产生选择偏倚。六、资料的统计学处

meta分析中异质性检验浅析

Meta 分析中的异质性检验 一、Meta 分析原理 假定各个不同研究都是来自同一个总体,要求不同研究间的统计量应该接近总体参数真实值,所以各个不同文献研究结果是比较接近,就要符合同质性,这时候将所有文献的效应值合并可以采用固定效应模型的有些算法,如倒方差法,mantel haenszel法,peto法等。 二、异质性的概念 2.1广义:描述参与者、干预措施和一系列研究间测量结果的差异和多样性,或那些研究间的内在真实性的变异。 2.2狭义:专指统计学异质性,用来描述一系列研究中效应量的变异程度,也表明除可预见的偶然机会之外的研究间存在的差异性。 三、异质性的分类 3.1临床异质性:包含试验对象的差异,如纳入及排除标准的不同;试验条件的差异,如干预剂量、剂型、方法不同;定义指标的差异,如试验定义的暴露、结局、测量工具不同,等等。 3.2方法学异质性:包含研究设计的差异,如前瞻性、回顾性、随机化对照试验;偏倚风险,如盲法;结局完整性,如随访时间长短不同。 3.3统计学异质性:是指不同试验间被估计的效应指标的变异,它是研究间临床和方法学上多样性的直接结果。 统计学计算一致性以数据为基础,其原理是各研究间可信区间的重合程度越,则各研究间存在统计学同质性的可能性越大,相反,可信区间的重合程度越小,各研究间存在统计学异质性的可能性越大。 临床异质性、方法学异质性和统计学异质性三种是相互独立又相互关联的,临床或方法学上的异质,不一定在统计学上就有异质性的表现,反之亦然。但寻找临床和方法学上的异质性可以提示统计学异质性的来源。 四、异质性检验方法 4.1概念:又叫统计量的齐性检验(一致性检验),目的是检查各个独立研究的 结果是否具有可合并性。 4.2常见方法: 4.2.1 Q检验 (1)计算公式及解释 k Q=W i(Y i?M)2 i=1 注:Wi :第i个研究的权重,Yi :第i个研究的效应量,M :所有研究的平均效应量。 Q为效应量的标准化平方和,因此服从自由度为(k-1)的χ2分布。Q值越大,则p值越小(无效假设为纳入研究的效应量均相同),则异质性越大。(2)Q检验的缺陷:

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