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RT-PCR_步骤(精)

RT-PCR_步骤(精)
RT-PCR_步骤(精)

一、组织抽提:

1.取组织块50-100㎎用液氮在研钵中研磨成粉末

2.移入玻璃匀浆器加入1ml Trizol 抽打匀浆

3.移入1.5ml新离心管用5 ml针头抽打

4.冰上5分钟

5.离心12,000g 4℃ 5分钟取上清液移入1.5ml新离心管

6.加0.2 ml氯仿,震荡,冰上5分钟

7.离心<12,000g 4℃ 10分钟取上层液相移入1.5ml新离心管

8.加0.5 ml异丙醇,震荡,冰上孵育5分钟

9.离心<12,000g 4℃ 5分钟弃去上清液

10.加入1 ml 75%乙醇,震荡

11.离心<7,500g 4℃ 5分钟弃去上清液

12.室温下使之变透明

13.加入DEPC处理水10μl --35μl 溶解RNA(可保存在液氮或低温冰箱)

14.走RNA变性电泳观察18s,28s条带,分光光度计检测260/280吸光度比值,计算RNA浓度

二、RT反应体系(第一步):约20分钟

RNA 抽提物5μl

Radome 引物2μl

RNA sin 0.5μl

1.65℃ 15分钟

2.立即放入冰浴

RT反应体系(第二步):约2小时

RNA sin 0.5μl

10mM dNTP 1μl

5×RT 缓冲液4μl

4μl

25mM MgCl

2

AMV 逆转录酶3μl

1.37℃ 1.5小时

2.94℃ 5-10分钟

3.反应物保存于-20℃或进行PCR

三1、PCR反应体系:约4.5小时

25mM MgCl

2μl

2

10×PCR 缓冲液5μl

10mM dNTP 1μl

上下游引物10pmol/μl 2.5μl×2

CDNA模板 2.5μl

ddH

O 34μl

2

Taq酶0.5μl

轻质石蜡油50μl

100μl

1.94℃ 2分钟,55℃ 1分钟,72℃ 2分钟为第一个步1个循环

2.94℃ 45秒,55℃ 40秒,72℃ 1分钟为第二步30个循环

3.72℃ 10分钟

4.取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳

三2、PCR反应体系:约5小时

3μl

25mM MgCl

2

10×PCR 缓冲液5μl

10mM dNTP 1μl

上下游引物10pmol/μl 2.5μl×2

CDNA模板5μl

O 30μl

ddH

2

Taq酶1μl

轻质石蜡油50μl

100μl

1.94℃ 2分钟,55℃ 1分钟,72℃ 2分钟为第一个步1个循环

2.94℃ 45秒,50℃ 40秒,72℃ 1分钟为第二步40个循环

3.72℃ 10分钟

4.取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳

四、电泳:约1.25小时

1.配0.5×TBE电泳缓冲液300 ml

2.胶浓度1.7%(40ml 0.5×TBE加0.68g胶)

3.微波炉中火2分钟溶解胶

4.冷却至60℃加入溴乙锭2μl(10mg/ml的终浓度0.5μg/ml)

5.放入梳子,浇板,待凝固

6.加8μl PCR反应产物+2μl溴酚兰

7.电泳50-80V(每㎝ 5V)

一、实验器具与材料:

1、移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl

2、吸头:1ml、200μl、20μl

3、匀浆管:5ml

4、吸头台:放置1ml吸头的一个,放置20μl吸头的一个

5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl

6、试剂瓶:2个60ml的棕色试剂瓶(广口,带盖)

1个125ml的白色试剂瓶(放无水乙醇)

7、量筒:50ml、250ml、500ml

8、容量瓶:250ml、500ml、1000ml

9、试管架:5ml、1.5ml、20μl

10、盐水瓶:250ml、500ml各2个备用,一个装无水乙醇,另一个装DEPC水

11、铝制饭盒:4个

12、塑料小饭盒:1个

13、大瓷缸:2个

14、锡泊纸:一卷

15、卷纸:2卷

16、三角烧瓶:带盖,稍大

二、实验器具的处理与准备

1、塑料制品:(包括枪头、EP管、匀浆管等)

先将DEPC水从容量瓶中倒入瓷缸中,将塑料制品逐个浸泡其中,其中小枪头需要吸管打入DEPC水,过夜,然后高压,再烤干备用,实验前将枪头等放入吸头台,再高压一次(EP管)

2、玻璃制品:泡酸过夜,冲洗干净,蒙锡纸烤干备用(DEPC水泡)(洗净后先泡1‰DEPC过夜,再烤干)

3、匀浆器:(包括剪刀、镊子)先洗净后,再高压(不需要泡DEPC)

三、试剂配制:

1、DEPC水:吸出1ml放在1000ml双蒸水中配成1‰DEPC水,放在1000ml容量瓶中静置4小时备用。

2、75%乙醇:用无水乙醇DEPC水配,然后放-20℃保存(其中DEPC水需先高压)

3、异丙醇:放入棕色瓶中

4、氯仿:放入棕色瓶中

5、琼脂糖

四、几种缓冲液的配制:

1、电泳缓冲液:

Tris 54g 硼酸27.5g

0.5M EDTA 20ml?pH8.0

蒸溜水1000ml

5×TBE (贮存液)

再将5×TBE稀释10倍成0.5TBE就可以在电泳时使用(即工作液浓度),如取50ml贮存液450ml水--→500ml工作缓冲液

2、上样缓冲液:

0.25%溴酚蓝

0.25%二甲苯青FF

30%甘油

6×缓冲液,4℃保存

五、琼脂糖凝胶的配制:

1、1.0%:

1.0g琼脂糖100ml电泳缓冲液,微波炉中火30秒至沸腾,熔化的琼脂物冷却至60℃时加入10mg/ml溴化乙锭

2.5μl,充分混匀,将温热的凝胶倒入已置好梳子的胶膜中,在室温下放置30-45min后现进行电泳。

2、1.5%:

同上,将琼脂糖的量改为1.5g

六、需购置的Rt-PCR材料:

(生工. Tel. 2236106.)

Taq酶(含MgCl2 Buffer)200u 70.00

dNTP: 1支

oligo(dT)15: 1 OD 40.00 promega

M-MLV: 1支250.00 promega (Buffer)

RNasin: 1支110

-- -20℃

DEPC 5g 110.00

Trizol 100ml/1瓶Invitrogen Life technologies

-- 4℃

Marker: 10μg 0.2μg/ml 150.00 科威

(1543. 994. 697. 515. 377. 231)

七、引物合成

正义:5′-CACGATGGAGGGGCCGGACTCATC-3′

反义:5′-TAAAGACCTCTATGCCAACACAGT-3′

2、par-4:

正义:5′-GGGACCTCGGAACTCAAC-3′

反义:5′-TGTATCTGCCTGGGACTG-3′

3、退火温度计算

2(A T)4(G C)

正反义平均数,再上下波动度(±4℃,或±5℃)

4、引物各合成5 OD,每OD一瓶分装好

5、引物稀释:

加DEPC水量为(μl)

= ? nmol / OD ×管上所标OD数×100

是为10p mol / μl 浓度的引物溶液

八、PCR产物电泳

先将1-10μl左右PCR产物,加已点在纸上的溴酸兰,反复吸打混匀后进行电泳,一般电流为10mA,电源100V,电泳30分钟,紫外灯下观察,满意的结果扫描打印。

九、几个注意点:

1、逆转录的关键步骤是立即冰水浴?

2、Rt时,先打开PCR预热30分钟。

3、RNA抽提前,打开离心机预冷。

TRIzol法抽提总RNA

细胞1×107

组织100mg

加1mlTRIzol

细胞用1ml加样器吹至液体澄清且无细胞团块

匀浆(要彻底,后转至EP管)

(组织匀浆量>100mg时分装1ml/每EP管)

颠倒混匀10下,室温5分钟

加氯仿1/5体积(0.2ml)(必须按总体积的1/5)

颠倒混匀10下,室温5分钟

4℃,离心12000g,15分钟

转上层水相(约400μl)于另一1.5mlEP管中

加等体积异丙醇(约400μl),混匀室温10分钟

4℃,离心12000g,10分钟

弃上清

加冰预冷的75%乙醇(用DEPC水配)1ml

4℃离心7500g,5分钟

弃上清,空气干燥5-10分钟(不能完全干燥)

溶于DEPC水中至20μl(10μl-20μl)

(可在55-60℃水中,<10分钟助溶)

注:

1、RNA若用于核酸转移应溶解于样本缓冲液中,否则DEPC溶解

2、细胞组织加TRIzol匀浆后,可在-60℃放置至少一个月(甚至可一年以上)

3、RNA在75%乙醇中,2-8℃至少可保存一周,-20℃至少可保存一年

两步法RT-PCR

(第一步:逆转录反应)

试剂浓度体积终浓度

RNA 23μl(11.5μl)

Oligo(dT)15 0.05μg/μl 4μl(2μl) 0.005μg/μl

(稀释10倍后用)

混匀,离心,70℃5min

立即冰水浴,稍离心

试剂浓度体积终浓度

M-MLV Buffer 5× 8μl (4μl) 1×

dNTP 10mM 2μl (1μl) 0.5mM

RNasin 40U/μl 1μl (0.5μl) 20μ

M-MLV 200U/μl 2μl (1μl) 200U

总体积40μl(20μl)

混匀,离心,42℃60min

95℃10min(破坏MLV)

4℃保存

两步法RT-PCR

(第二步:PCR反应)

总体积20μl(50μl)

试剂浓度体积终浓度

Taq Buffer 10× 2μl (5μl_) 1×

MgCl2 25mM 1.2μl (3μl) 1.5mM

dNTP 10mM 0.2μl (0.5μl) <200uM

上游引物10pmol/μl 0.3μl (1μl) 10pmol

下游引物10pmol/μl 0.3μl (1μl) 10pmol

cDNA模板X (?) (1-10μl)

DEPC水20μl-4.3μl-X

Taq酶 2.5U/μl 0.3μl (1μl) 2.5U/μl ↓

混匀

97℃,5分钟

立即冰水浴

混匀

95℃5分预变性

94℃30秒变性

X℃40秒退火

72℃30秒延伸

72℃7分终末延伸

28-36循环,4℃保温

三、电泳:

加1-10μl PCR产物溴芬兰(1-2.5μl)混匀,加样,电泳。

注意:Taq酶、M-MLV、Rnasin等-20℃保存,操作时置于冰上。DNTP勿反复冻融。

取200mg组织,放到1.5ml EP管中,加入1ml Trizol剪碎。

2. 震荡30s。

3. 加0.2ml氯仿,剧烈摇动30s,室温3min。

4. 12000×g,4℃离心,15min。

5. 吸上层无色水相,移入另一EP管中(约0.5ml)。

6. 加等体积异丙醇,-20℃,30min。

7. 12000×g,4℃离心,10min。在管底部可见微量RNA沉淀

8. 弃上清,加75%乙醇1ml,振荡。

9. 7500×g,4℃离心,10min。

10. 弃上清,用滤纸小心吸取残留液体,室温干燥5-10min。

11. 沉淀溶于20μl DEPC水,取1μl加入79μl DEPC水测OD260/OD280

12. 计算浓度与纯度,-70℃保存。

OD260×40×稀释倍数

RNA浓度(μg/μl)=────────────

1000

逆转录合成cDNA

反应体系如下

━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━

MgCl2 2μl

10×RT Buffer 1μl

RNase Free dH2O 3.75μl

dNTP Mixture(各10mM) 1μl

RNase Inhibitor 0.25μl

AMV Reverse Transcriptase 0.5μl

Random 9 mers 0.5μl

Positive Control RNA (1μg)1μl

混匀快速离心一次

反应条件如下

30℃10min

42℃30min

99℃5min

5℃5min

-20℃冰箱冻存

PCR反应

━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━

摸板cDNA 2.5μl

5×PCR Buffer 2.5μl

灭菌蒸馏水7.2μl

聚合酶Ex Taq HS 0.1μl

上游引物0.1μl

下游引物0.1μl

─────────────────────────────

Total 12.5μl

混匀快速离心一次

反应条件

94℃2min 1Cycle

94℃40sec ┓

50-65℃40sec ┃25-35Cycles

72℃1min ┛

72℃5min 1Cycle

PCR产物-20℃冰箱保存

取PCR产物8μl加5×Loading Buffer 2μl 2%琼脂糖凝胶电泳120V 100mA 30min 溴化乙锭染色,凝胶成象仪成象并保存结果

RT-PCR的实验原理与操作步骤复习课程

R T-P C R的实验原理与 操作步骤

提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR 扩增,而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR使测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。 (一) 反转录酶的选择 1. Moloney鼠白血病病毒(MMLV)反转录酶:有强的聚合酶活性,RNA酶H活性相对较弱。最适作用温度为37℃。 2. 禽成髓细胞瘤病毒(AMV)反转录酶:有强的聚合酶活性和RNA酶H活性。最适作用温度为42℃。 3. Thermus thermophilus、Thermus flavus等嗜热微生物的热稳定性反转录酶:在Mn2 存在下,允许高温反转录RNA,以消除RNA模板的二级结构。 4. MMLV反转录酶的RNase H-突变体:商品名为SuperScript 和 SuperScriptⅡ。此种酶较其它酶能多将更大部分的RNA转换成cDNA,这一特性允许从含二级结构的、低温反转录很困难的m模板合成较长cDNA。 (二) 合成cDNA引物的选择 1. 随机六聚体引物:当特定mRNA由于含有使反转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体引物这一不特异的引物来拷贝全长mRNA。用此种方法时,体系中所有RNA分子全部充当了cDNA第一链模板,PCR引物在扩增过程中赋予所需要的特异性。通常用此引物合成的cDNA中96%来源于rRNA。 2. Oligo(dT):是一种对mRNA特异的方法。因绝大多数真核细胞mRNA具有3’端Poly(A )尾,此引物与其配对,仅mRNA被转录。由于Poly(A )RNA仅占总RNA的1-4%,故此种引物合成的cDNA比随机六聚体作为引物和得到的cDNA 在数量和复杂性方面均要小。 3. 特异性引物:最特异的引发方法是用含目标RNA的互补序列的寡核苷酸作为引物,若PCR反应用二种特异性引物,第一条链的合成可由与mRNA 3’端最靠近的配对引物起始。用此类引物仅产生所需要的cDNA,导致更为特异的PCR扩增。生物科研https://www.wendangku.net/doc/1a16416283.html, 二、实验耗材与试剂 1.RNA提取" target="_blank" >RNA取试剂 2.第一链cDNA合成试剂盒

PCR扩增的原理和操作步骤

PCR 扩增反应的操作 第一节PCR 扩增反应的基本原理 一、聚合酶链式反应(PCR )的基本构成 PCR 是聚合酶链式反应的简称,指在引物指导下由酶催化的对特定模板(克隆或基因组DNA )的扩增反应,是模拟体内DNA 复制过程,在体外特异性扩增DNA 片段的一种技术,在分子生物学中有广泛的应用,包括用于DNA 作图、DNA 测序、分子系统遗传学等。 PCR 基本原理: 是以单链DNA 为模板,4 种dNTP 为底物,在模板3'末端有引物存在的情况下,用酶进行互补链的延伸,多次反复的循环能使微量的模板DNA 得到极大程度的扩增。在微量离心管中,加入与待扩增的DNA 片段两端已知序列分别互补的两个引物、适量的缓冲液、微量的DNA 膜板、四种dNTP 溶液、耐热Taq DNA 聚合酶、Mg 2+等。反应时先将上述溶液加热,使模板DNA 在高温下变性,双链解开为单链状态;然后降低溶液温度,使合成引物在低温下与其靶序列配对,形成部分双链,称为退火;再将温度升至合适温度,在Taq DNA 聚合酶的催化下,以dNTP 为原料,引物沿5'→ 3'方向延伸,形成新的DNA 片段,该片段又可作为下一轮反应的模板,如此重复改变温度,由高温变性、低温复性和适温延伸组成一个周期,反复循环,使目的基因得以迅速扩增。因此PCR 循环过程为三部分构成:模板变性、引物退火、热稳定DNA 聚合酶在适当温度下催化DNA 链延伸合成(见图)。 1.模板DNA 的变性 模板DNA加热到90~95 C时,双螺旋结构的氢键断裂,双链解开成为单链,称为DNA的变性,以便它与引物结合,为下轮反应作准备。变性温度与DNA 中G-C 含量有关,G-C 间由三个氢键连接,而A-T 间只有两个氢键相连,所以G-C 含量较高的模板,其解链温度相对要高些。故PCR 中DNA 变性需要的温度和时间与模板DNA 的二级结构的复杂性、G-C 含量高低等均有关。对于高G-C含量的模板DNA在实验中需添加一定量二甲基亚砜(DMSO),并且在PCR循环中起 始阶段热变性温度可以采用97 C ,时间适当延长,即所谓的热启动。 2.模板DNA 与引物的退火 将反应混合物温度降低至37~65C时,寡核苷酸引物与单链模板杂交,形成DNA模板-引物复 合物。退火所需要的温度和时间取决于引物与靶序列的同源性程度及寡核苷酸的碱基组成。一般要求引物的浓度大大高于模板DNA 的浓度 ,并由于引物的长度显著短于模板的长度, 因此在退火时,引物与模板中的互补序列的配对速度比模板之间重新配对成双链的速度要快得多,退火时间一般为1?2min。 3.引物的延伸 DNA 模板-引物复合物在Taq DNA 聚合酶的作用下,以dNTP 为反应原料,靶序列为模板, 按碱基配对与半保留复制原理,合成一条与模板DNA 链互补的新链。重复循环变性-退火-延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。延伸所需要的时间取决于模板DNA的长度。在72 C条件下,Taq DNA聚合酶催化的合成速度大约为40?60个碱基/秒。经过一轮“变性-退火-延伸”循环,模板拷贝数增加了一倍。在以后的循环中,新合成的DNA 都可以起模板作用,因此每一轮循环以后, DNA 拷贝数就增加一倍。每完成一个循环需2?4min, —次PCR 经过30?40次循环,约2?3h。扩增初期,扩增的量呈直线上升,但是当引物、模板、聚合酶达到一定比值时,酶的催化反应趋于饱和,便出现所谓的“平台效应”,即靶DNA 产物的浓度不再增加。 PCR 的三个反应步骤反复进行,使DNA 扩增量呈指数上升。反应最终的DNA 扩增量可用Y =(1 + X)n计算。Y代表DNA片段扩增后的拷贝数,X表示平(Y)均每次的扩增效率,n代表循环次数。平均扩增效率的理论值为100%,但在实际反应中平均效率达不到理论值。反应初期, 靶序列DNA片段的增加呈指数形式,随着PCR产物的逐渐积累,被扩增的DNA片段不再呈指数

RT-PCR实验方法总结大全.

RT-PCR实验方法总结大全 RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求: 1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng 或1ug。 2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA 存在,不是单改变Mg2+浓度、退火温度能解决的。 1RT和PCR时的引物设计是不是一定要先知道目的基因的序列?必须 在RT时,引物设计有3种方法即a:Random 9mers;b:Oligo dT-Adaptor Primer;和c:特异的下游引物。如果用a和b方法,是扩增的所有的cDNA(理论上,还要用此产物做PCR 的模板继续扩增。 如果用c方法,那么要去那里查它的序列呢?https://www.wendangku.net/doc/1a16416283.html,问题: 在做RT-PCR遇到一怪现象,即对同一动物不同组织扩增同一段基因,结果从一种组织中可以扩出我的目的基因,条带非常的好,而另一组织在同样的条件下却得到许多非特异性的条带,尝试其他条件同样无法得到满意的结果,百思不得其解!(注:已肯定该基因在两种组织中都表达,且内参照在两种组织都可扩增出来 从这两种组织中提取的RNA的量是不一样的,我测过吸光度,差异还很大,会不会和这有关呢?请高手指教! 解答: 1.RT-PCR有两种做法:

条件具备的话可用kit进行一步法进行;若条件不太好的话可分两步进行逆转录再PCR。但后来发现两步法的结果更加理想,条带特异性强且无拖尾现象,我推测是体系更加单一比较利于PCR的进行,当然也可能是我买的kit不太好。(promega。 2.RT-PCR应具备的条件 高质量的RNA(保留后可做5‘,3’RACE;引物的(最好产物短点;若涉及粗略定量的话还应考虑RNA的浓度或是cDNA的浓度(如果由内标分子更好,但我发现其实很不容易将RNA的浓度以及内标分子的表达量调整的完全一样;体系的均一性等。 3.RACE 我做过RACE(3’RACE是宝生物的Kit;5‘RACE是Gibico,但现在再进行另一个同源基因的3‘RACE时却怎么也P不出来,这两个基因是由同一对引物扩增出来的,其中一个已经获得了全序列(RACE的方法,而另一个基因的3’UTR 却增么也扩不出来,我推测是不是该基因的3‘UTR太长的缘故,我都快绿了,有无 RT-PCR的常用内标b-actin 和GAPDH的使用有选择性吗?比如不同的细胞,不同的刺激。 有关内参: RT-PCR内参照可以在一个管子里做(那样也是图好看一些,最好分开两管,把除了引物之外的mixture统一配,拍照后,算目的基因和内参的比值,这就是基因表达的相对浓度。 问:我曾经作过同一管的PCR,内有actin 和目的基因引物。虽然可见到两条均一条带但图片质量不理想(而且酶量、Mg2+加倍。请教mxbdna2003 ,你是如何处理同一管的PCR的各成分的浓度? 答: it should determined the amount of RNA. but it not for the quantitity of the PCR. it just was convienent to guess the amount ot the template<(for RT and PCR and bettrer for publication and editor if he don not know the preocedure much. but the amount just

RT-PCR的实验原理与操作步骤

提取组织或细胞中的总RNA以其中的mRN作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCF使测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量 RNA羊品分析成为可能。该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。 (一)反转录酶的选择 1. Moloney 鼠白血病病毒(MMLV)反转录酶:有强的聚合酶活性,RNA酶H活 性相对较弱。最适作用温度为37 C。 2. 禽成髓细胞瘤病毒(AMV)反转录酶:有强的聚合酶活性和 RNA 酶 H 活性。 最适作用温度为42 C。 3. Thermus thermophilus 、 Thermus flavus 等嗜热微生物的热稳定性反转录 酶:在Mn2存在下,允许高温反转录 RNA,以消除RNA模板的二级结构。 4. MMLV 反转录酶的 RNase H- 突变体:商品名为 SuperScript 和 SuperScript U。此种酶较其它酶能多将更大部分的RNA转换成cDNA,这一 特性允许从含二级结构的、低温反转录很困难的 m 模板合成较长 cDNA 。 (二)合成 cDNA 引物的选择 1. 随机六聚体引物:当特定 mRNA 由于含有使反转录酶终止的序列而难于拷贝 其全长序列时,可采用随机六聚体引物这一不特异的引物来拷贝全长 mRNA 。 用此种方法时,体系中所有RNA分子全部充当了 cDNA第一链模板,PCR引物在扩增过程中赋予所需要的特异性。通常用此引物合成的 cDNA 中 96%来源 于 rRNA。 2. Oligo(dT) :是一种对 mRNA 特异的方法。因绝大多数真核细胞 mRNA 具有

PCR扩增实验操作步骤

PCR扩增反应 一、实验原理 PCR:是一种选择性扩增DNA或RNA的方法,其基本原理是依据体内细胞分裂中的DNA半保留复制机理,以及在体外dNTP分子于不同温度下双链和单链可以互相转变的性质,人为地控制体外合成系统的温度,以促使双链DNA变成单链DNA;单链DNA与人工合成的引物退火,以及在dNTP存在下,耐高温的DNA聚合酶使引物沿单链模板延伸成为双链DNA。 PCR反应分3步:①变性:通过加热使DNA 双螺旋的氢键断裂,双链解离形成单链DNA;②退火:当温度突然降低时,由于模板分子结构较引物要复杂得多,而且反应体系中引物DNA量大大多于模板DNA,使引物和其互补的模板在局部形成杂交链,而模板DNA 双链之间互补的机会较少。③延伸:在DNA聚合酶和4 种dNTP底物及Mg2+存在的条件下,5'→3'的聚合酶催化以引物为起始点的DNA链延伸反应,以上3步为一个循环,每一循环的产物可以作为下一个循环的模板,数小时之后,介于两个引物之间的特异性DNA片段得到了大量复制,数量可达2×106~7拷贝。 变性 退火 延伸 图反应历程

二、实验材料 1·模板:细菌DNA 2·TsgDNA聚合酶3·dNTP混合液 4·10倍浓度PCR缓冲液5·2.5mmol/LMgCl2 6·RAPD引物:S14 S15 S18 S66 S74 S88 S97 S103 S110 S115 7·提取细菌DNA的相关试剂 三、操作步骤 1.细菌染色体DNA的提取(见上一组) 3·反应程序: 将RAPD反应试剂加入EP管中 轻混后用100ul石蜡油覆盖于反应混合液之上,防止样品在反复加热-冷却的过程中蒸发,盖好盖子 打开PCR反应仪输入以下反应数据 ●94 摄氏度预变性5min ●94摄氏度变性40s ●40摄氏度退火40s ●72摄氏度延伸1min 将EP管放入仪器开始扩增,循环35次;72摄氏度延伸10min 仪器为Model MyGene 25 Plus 三、注意事项 1、PCR反应体系中DNA样品及各种试剂的用量都极少,必须严格注意吸样量的准确性 及全部放入反应体系中。 2、为避免污染凡是用在PCR反应中的Tip尖、离心管、蒸馏水都要灭菌;吸每种试剂 时都要换新的灭菌Tip尖。 3、加试剂时先加消毒三蒸水,最后加DNA模板和Taq DNA聚合酶。 4、置PCR仪进行PCR反应前,PCR管要盖紧,否则使液体蒸发影响PCR反应。 5.引物条件首先引物与模板的序列要紧密互补,其次引物与引物之间避免形成稳定二聚 体或发夹结构,再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应(即错配)。

实时荧光定量PCR(Real-Time-PCR)实验流程

实时荧光定量PCR(Real-Time PCR)实验流程 一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录) 不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法,因为Real-Time PCR对RNA样品的质量要求较高,所以,正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法,在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。 在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂;取2ug进行RNA的甲醛变性胶电泳检测,如果存在DNA污染时,要用DNase I进行消化(因为在处理过程中RNA极易降解,建议体系中加入适量RNA酶抑制剂)。 二、DNase I 消化样品RNA 中的DNA 用DNase I 消化DNA 组份加量 模板(RNA) 10ug RNase Inhibitor 4ul DNase I buffer 10ul DNase I 10ul DEPC处理H2O 至100ul 混匀,37℃ 90min 三、RNA琼脂糖凝胶电泳 1.1%的琼脂糖凝胶电泳凝胶的配制: 1)称取琼脂糖0.45g放入三角瓶中,向其中加入4.5ml的10×MOPS缓冲液和39.5ml 的DEPC水,放微波炉里溶化。 2)待冷却到60摄氏度左右时,加入1ml甲醛,摇匀(避免产生气泡)。倒入凝胶板上凝固30min。 2.取各个RNA样品4μl,加入6×RNA电泳上样缓冲液2μl混匀,加入变性胶加样孔中。3.120V电压下电泳25min。用凝胶紫外分析仪观察,照相保存。 4.RNA电泳结果如下图所示。可见28S和18S两条明亮条带,无DNA条带污染。 四.RNA反转录为cDNA 反转录程序(以MBI的M-MLV为例) 组份加量(20ul体系) 加量(40ul体系) 模板(RNA) 0.1~2.5ug(根据条带的亮度适当调整) 3ug(根据条带的亮度适当调整) 引物T18(50uM)(或其他引物) 2.0ul 4.0ul DEPC处理H2O 至12.5ul 至25ul

分子标记的实验原理及操作流程

AFLP分子标记实验 扩增片段长度多态性 Amplified fragment length polymorphism(AFLP 是在随机扩增多态性(RAPD和限制性片段长度多态性(RFLP技术上发展起来的DNA多态性检测技术,具有RFLP技术高重复性和RAPD技术简便快捷的特点,不需象RFLP 分析一样必须制备探针,且与RAPD标记一样对基因组多态性的检测不需要知道其基因组的序列特征,同时弥补了 RAPD技术重复性差的缺陷。同其他以PCR为基础的标记技术相比,AFLP技术能同时检测到大量的位点和多态性标记。此技术已经成功地用于遗传多样性研究,种质资源鉴定方面的研究,构建遗传图谱等。 其基本原理是:以PCR(聚合酶链式反应为基础,结合了 RFLP、RAPD的分子标记技术。把DNA进行限制性内切酶酶切,然后选择特定的片段进行PCR扩增(在所有的限制性片段两端加上带有特定序列的’接头”用与接头互补的但3-端有几个随机选择的核苷酸的引物进行特异PCR扩增,只有那些与3-端严格配对的片段才能得到扩增,再在有高分辨力的测序胶上分开这些扩增产物,用放射性法、荧光法或银染染色法均可检测之。 一、实验材料 采用青稞叶片提取总DNA 实验设备 1. 美国贝克曼库尔特CEQ8000毛细管电泳系统, 2. 美国贝克曼库尔特台式冷冻离心机, 3. 美国MJ公司PCR仪,

4. 安玛西亚电泳仪等。 三、实验试剂 1. 试剂:请使用高质量产品,推荐日本东洋坊TOYOBO公司的相关产品 DNA提取试剂盒; EcoRI酶,Msel酶,T4连接酶试剂盒; Taq 酶,dNTP, PCR reactio n buffer; 琼脂糖电泳试剂:琼脂糖,无毒GeneFinder核酸染料替代传统EB染料;超纯水(18.2M ? ? cm 2. 其他实验需要物品 微量移液枪(一套及相应尺寸Tip头,PCR管,冰浴等。 四、实验流程 1、总DNA提取 使用DNA提取试剂盒提取植物基因组DNA,通过紫外分光光度计检测或用标准品跑胶检测。一般来说,100ng的基因组DNA作为反应模板是足够的。 2、EcoR1酶消化(20ul体系/样品 EcoR1 1ul

RT-PCR实验步骤

RT-PCR实验步骤 一、总RNA提取 1. 取200mg组织,放到1.5mlEP管中,加入1mlTrizol剪碎。 2. 震荡30s。 3. 加0.2ml氯仿,剧烈摇动30s,室温3min。 4. 12000×g,4℃离心,15min。 5. 吸上层无色水相,移入另一EP管中(约0.5ml)。 6. 加等体积异丙醇,-20℃,30min。 7. 12000×g,4℃离心,10min。在管底部可见微量RNA沉淀 8. 弃上清,加75%乙醇1ml,振荡。 9. 7500×g,4℃离心,10min。 10. 弃上清,用滤纸小心吸取残留液体,室温干燥5-10min。 11. 沉淀溶于20μlDEPC水,取1μl加入79μlDEPC水测OD260/OD280 12. 计算浓度与纯度,-70℃保存。 二、逆转录合成cDNA第一链 反应体系如下

混匀快速离心一次反应条件如下 -20℃ 冰箱冻存三、PCR反应 混匀快速离心一次反应条件如下

PCR产物-20℃冰箱保存 取PCR产物8μl 加5×Loading Buffer 2μl 2%琼脂糖凝胶电泳120V。 100mA 30min 溴化乙锭染色,凝胶成象仪成象并保存结果。 RT-PCR实验方法总结1,2 RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求: 1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。 2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2+浓度、退火温度能解决的。 1)RT和PCR时的引物设计是不是一定要先知道目的基因的序列?必须 在RT时,引物设计有3种方法即a:Random 9mers;b:Oligo dT-Adaptor Primer;和c:特异的下游引物。如果用a和b方法,是扩增的所有的cDNA(理论上),还要用此产物做PCR 的模板继续扩增。 如果用c方法,那么要去那里查它的序列呢?https://www.wendangku.net/doc/1a16416283.html, 问题: 在做RT-PCR遇到一怪现象,即对同一动物不同组织扩增同一段基因,结果从一种组织中可以扩出我的目的基因,条带非常的好,而另一组织在同样的条件下却得到许多非特异性的条带,尝试其他条件同样无法得到满意的结果,百思不得其解!(注:已肯定该基因在两种组织中都表达,且内参照在两种组织都可扩增出来) 从这两种组织中提取的RNA的量是不一样的,我测过吸光度,差异还很大,会不会和这有关呢?请高手指教! 解答: 1.RT-PCR有两种做法: 条件具备的话可用kit进行一步法进行;若条件不太好的话可分两步进行逆转录再PCR。但后来发现两步法的结果更加理想,条带特异性强且无拖尾现象,我推测是体系更加单一比较利于PCR 的进行,当然也可能是我买的kit不太好。(promega)。 2.RT-PCR应具备的条件 高质量的RNA(保留后可做5‘,3’RACE);引物的(最好产物短点);若涉及粗略定量的话还应

凯氏定氮仪原理及操作步骤

凯氏定氮仪原理: 蛋白质是含氮的有机化合物。食品与硫酸和催化剂一同加热消化,使蛋白质分解,分解的氨与硫酸结合生成硫酸铵。然后碱化蒸馏使氨游离,用硼酸吸收后再以硫酸或盐酸标准溶液滴定,根据酸的消耗量乘以换算系数,即为蛋白质含量。 1.有机物中的胺根在强热和CuSO4,浓H2SO4 作用下,硝化生成(NH4)2SO4 反应式为: 2NH2+H2S04+2H=(NH4)2S04 (其中CuSO4做催化剂) 2.在凯氏定氮器中与碱作用,通过蒸馏释放出NH3 ,收集于H3BO3 溶液中 反应式为: (NH4)2SO4+2NaOH=2NH3+2H2O+Na2SO4 2NH3+4H3BO3=(NH4)2B4O7+5H2O 3.用已知浓度的H2SO4(或HCI)标准溶液滴定,根据HCI消耗的量计算出氮的含量,然后乘以相应的换算因子,既得蛋白质的含量反应式为: (NH4)2B4O7+H2SO4+5H2O=(NH4)2SO4+4H3BO3 (NH4)2B4O7+2HCl+5H2O=2NH4Cl+4H3BO3 凯氏定氮仪操作步骤: (一)消化

1、准备6个凯氏烧瓶,标号。1、 2、3号烧瓶中分别加入适当浓度的蛋白溶液,样品要加到烧瓶底部,切勿沾在瓶口及瓶颈上。再依次加入硫酸钾-硫酸铜接触剂,浓硫酸,30%过氧化氢。4、5、6号烧瓶作为空白对照,用以测定试剂中可能含有的微量含氮物质,对样品测定进行校正。4、5、6号烧瓶中加入蒸馏水代替样液,其余所加试剂与1、2、3号烧瓶相同。 2、将加好试剂的各烧瓶放置消化架上,接好抽气装置。先用微火加热煮沸,此时烧瓶内物质炭化变黑,并产生大量泡沫,务必注意防止气泡冲出管口。待泡沫消失停止产生后,加大火力,保持瓶内液体微沸,至溶液澄清后,再继续加热使消化液微沸15min。在消化过程中要随时转动烧瓶,以使内壁粘着物质均能流入底部,以保证样品完全消化。消化时放出的气体内含SO2,具有强烈刺激性,因此自始自终应打开抽水泵将气体抽入自来水排出。整个消化过程均应在通风橱中进行。消化完全后,关闭火焰,使烧瓶冷却至室温。 (二)蒸馏和吸收 蒸馏和吸收是在微量凯氏定氮仪内进行的。凯氏定氮蒸馏装置种类甚多,大体上都由蒸气发生、氨的蒸馏和氨的吸收三部分组成。 1、仪器的洗涤 仪器安装前,各部件需经一般方法洗涤干净,所用橡皮管、塞须浸在10%NaOH溶液中,煮约10min,水洗、水煮10min,再水洗数次,然后安装并固定在一只铁架台上。 仪器使用前,微量全部管道都须经水蒸气洗涤,以除去管道

定量PCR的实验步骤。

定量PCR的实验步骤 一、标准曲线的标准DNA样品准备 1.将目的片段进行克隆,对克隆得到的阳性菌落进行质粒DNA的提取和纯化(试剂盒),纯化后的质粒DNA纯度用DO260/DO280的比值来鉴定,纯的DNA比值应该在1.8-1.9之间,如果比值大于1.9的时候表示有RNA污染,小于1.6的时候表示有蛋白质的污染(DO260的1OD值相当于50ng/ul的双链DNA 或33ng/ul的单链DNA或40ng/ul的RNA); 2.采用紫外分光光度法(DO260 nm)测定质粒DNA的吸光度DO260值为A,(B=1DO260=50 ng/ul),由于载体质粒序列和插入的目标片段的序列都是已知的,这样通过核苷酸的相对分子量和标准品序列信息估算出单个质粒DNA (阳性质粒)的分子量C (ng/mol),进而计算标准品的拷贝数D(copy/uL): 拷贝数D=A×B C ×6.02×1023(copy/ul) 3.将2步骤中计算出来的已知拷贝数的质粒DNA以10倍为梯度进行稀释,稀释7个系列(各个梯度的浓度一般为101~107),作为标准曲线的DNA模板; 二、未知样品的定量标定 模板质粒DNA每个梯度设置3个平行样。未知样品设置2个平行样,同时设置一个没有质粒DNA的阴性对照。(定量实验,误差是不可避免的,设立平行样,对数据进行统计处理,可以将误差降低到最小,以满足小样本统计的要求;确保数据的有效性,排除假阳性的干扰,必须设置阴性对照,阳性对照有标准样品就做,没有标准样品就可以省略不做); 2.按照下面的程序进行荧光定量PCR反应: 95℃ 3 min 95℃10 s 58℃20 s 40个循环 72℃20 s

RT-PCR实验步骤

RT-PCR实验步骤

RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求: 1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。 2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2+浓度、退火温度能解决的。 1)RT和PCR时的引物设计是不是一定要先知道目的基因的序列?必须 在RT时,引物设计有3种方法即a:Random 9mers;b:Oligo dT-Adaptor Primer;和c:特异的下游引物。如果用a和b方法,是扩增的所有的cDNA(理论上),还要用此产物做PCR 的模板继续扩增。 如果用c方法,那么要去那里查它的序列呢?https://www.wendangku.net/doc/1a16416283.html, 问题: 在做RT-PCR遇到一怪现象,即对同一动物不同组织扩增同一段基因,结果从一种组织中可以扩出我的目的基因,条带非常的好,而另

一组织在同样的条件下却得到许多非特异性的条带,尝试其他条件同样无法得到满意的结果,百思不得其解!(注:已肯定该基因在两种组织中都表达,且内参照在两种组织都可扩增出来) 从这两种组织中提取的RNA的量是不一样的,我测过吸光度,差异还很大,会不会和这有关呢?请高手指教! 解答: 1.RT-PCR有两种做法: 条件具备的话可用kit进行一步法进行;若条件不太好的话可分两步进行逆转录再PCR。但后来发现两步法的结果更加理想,条带特异性强且无拖尾现象,我推测是体系更加单一比较利于PCR的进行,当然也可能是我买的kit不太好。(promega)。 2.RT-PCR应具备的条件 高质量的RNA(保留后可做5‘,3’RACE);引物的(最好产物短点);若涉及粗略定量的话还应考虑RNA的浓度或是cDNA的浓度(如果由内标分子更好,但我发现其实很不容易将RNA的浓度以及内标分子的表达量调整的完全一样);体系的均一性等。 3.RACE 我做过RACE(3’RACE是宝生物的Kit;5‘RACE是Gibico),但现在再进行另一个同源基因的3‘RACE时却怎么也P不出来,这两个基因是由同一对引物扩增出来的,其中一个已经获得了全序列(RACE的方法),而另一个基因的3’UTR却增么也扩不出来,我推测是不是该基因的3‘UTR太长的缘故,我都快绿了,有无

(待分)rtpcr原理和实验步骤

原理与实验步骤 一、知识背景: 、基因表达: 单拷贝基因表达存在逐步放大机制,如一个蚕丝心蛋白基因个丝心蛋白(每个存活,可以合成个丝心蛋白)共合成个丝心蛋白。因此单拷贝基因的表达水平对于其功能水平的调控是非常重要的。 、技术( ):即聚合酶链式反应。 在模板、引物和四种脱氧核苷酸存在的条件下依赖于聚合酶的酶促反应,其特异性由两我工合成的引物序列决定。反应分三步: .变性:通过加热使双螺旋的氢键断裂,形成单链。 .退火:将反应混合液冷却至某一温度,使引物与模板结合。 .延伸:在聚合酶和及+存在下,退火引物沿’’方向延伸。 以上三步为一个循环,如此反复。 、逆转录酶和 逆转录酶()是存在于病毒体内的依赖的聚合酶,至少具有以下三种活性: 、依赖的聚合酶活性:以为模板合成第一条链。 、水解活性:水解杂合体中的。 、依赖的聚合酶活性:以第一条链为模板合成互补的双链. 二、的准备: .引物的设计及其原则: ) 引物的特异性决定反应特异性。因此引物设计是否合理对于整个实验有着至关重要的影响。在引物设计时要充分考虑到可能存在的同源序列,同种蛋白的不同亚型,不同的剪切方式以及可能存在的对引物的特异性的影响。尽量选择覆盖相连两个内含子的引物,或者在目的蛋白表达过程中特异存在而在其他亚型中不存在的内含子。 ) 引物设计原则的把握 引物设计原则包括 : 、引物长度:一般为~,引物太短会影响的特异性,引物太长的最适延伸温度会超过酶的最适温度,也影响反应的特异性。 、碱基分布:四种碱基最好应随机分布,避免嘌呤或嘧啶的聚集存在,特别是连续出现个以上的单一碱基。含量(值):%~%,扩增的复性温度一般是较低值减去~度。 、’端要求:’端必须与模板严格互补,不能进行任何修饰,也不能有形成任何二级结构的可能。末位碱基是时错配的引发效率最低,、居中间,因此引物的’端最好选用、、而尽可能避免连续出现两个以上的。 、引物自身二级结构:引物自身不应存在互补序列,否则会自身折叠成发夹状结构或引物自身复性。 、引物之间的二级结构:两引物之间不应有多于个连续碱基互补,’端不应超过个。、同源序列:引物与非特异扩增序列的同源性应小于连续个的互补碱基存在。 、’端无严格限制:’末端碱基可以游离,但最好是或,使产物的末端结合稳定。还可以进行特异修饰(标记、酶切位点等)等等。 根据实验目的选择适当的引物。常用引物设计软件如,等对于这些条件都可以自行设置。 、耗材:

PCR实验步骤

qRT-PCR实验步骤 应用LightCycler?/LightCycler?480 System Real Time PCR扩增仪的操作方法 一、按下列组分配制PCR反应液(反应液配制请在冰上进行) 注意: 1、通常引物终浓度为0.4μM可以得到较好结果。反应性能较差时,可以在0.1~1.0 μM 范围内调整引物浓度。 2、在20 μl的反应体系中,DNA模板的添加量通常在100 ng以下。因不同种类的DNA 模板中含有的靶基因的拷贝数不同,必要时可进行梯度稀释,确定最佳的DNA模板添加量。另外,2 Step RT-PCR反应的cDNA(RT反应液)作为模板时的添加量不要超过PCR反应液总体积的10%。 二、进行Real Time PCR反应 LightCycler? 480 System: Stage 1:预变性 95℃30s(升温速率4.4℃/s) 1 Cycle Stage 2:PCR反应 分析模式:定量分析 95℃5s(升温速率4.4℃/s) 60℃30s (升温速率2.2℃/秒,Acquisition Mode : Single) 40 Cycles Stage 3:溶解 分析模式:溶解曲线 95℃5 秒钟(升温速率4.4℃/秒) 60℃1 分钟(升温速率2.2℃/秒) 95℃(升温速率0.11℃/秒, Acquisition Mode : Continuous, Acquisitions : 5 per℃) 1 cycle Stage 4:降温

40℃30 秒钟(升温速率2.2℃/秒) 1 cycle 三、实验结果分析 反应结束后确认Real Time PCR的扩增曲线和融解曲线,进行PCR定量时制作标准曲线等。分析方法参见仪器操作手册。

原理及操作步骤

3 实验原理 3.1人工抗原的制备原理(以奥沙普秦为例) 奥沙普秦为小分子物质(分子质量小于500),本身不具有诱导产生抗体的能力,必须设法先将奥沙普秦与载体蛋白质偶联制备出相应的人工完全抗原,这是半抗原免疫分析的关键所在。合成人工抗原的机理为:水溶性的N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)的羟基与奥沙普秦的羧基在脂溶性缩合剂二环己基碳二亚胺(DCC)的作用下,脱水缩合形成活泼酯化奥沙普秦中间化合物,然后载体蛋白在某一PH值下,一般是大于其等电点,是蛋白质中的氨基暴露出来,从而成为提供伯胺的底物,然后亲核进攻活性中间产物活泼酯化奥沙普秦,从而达到小分子化学物偶联到载体蛋白的目的。 3.2 ELISA技术的原理 ELISA 是以免疫学反应为基础,将抗原、抗体的特异性反应与酶对底物的高效催化作用相结合起来的一种敏感性很高的试验技术。免疫酶技术是将酶标记在抗体/抗原分子上,形成酶标抗体/酶标抗原,称为酶结合物。该酶结合物的酶在免疫反应后,作用于底物使之呈色,根据颜色的有无和深浅,定位或定量抗原/抗体。ELISA 法是免疫酶技术的一种,其特点是利用聚苯乙烯微量反应板(或球)吸附抗原/抗体,使之固相化,免疫反应和酶促反应都在其中进行。在每次反应后都要反复洗涤,这既保证了反应的定量关系,也避免了末反应的游离抗体/抗原的分离步骤。在ELISA 法中.酶促反应只进行一次,而抗原、抗体的免疫反应可进行一次或数次,即可用二抗(抗抗体)、三抗再次进行免疫反应。 目前常用的几种ELISA 方法有:测定抗体的间接法,测定抗原的双抗体夹心法和测定抗原的竞争法等。 3.3 ELISA竞争抑制法的原理 包被好的抗原与加入的抗原(标准抗原)形成竞争,如果抗体石特异性抗体,它就会与游离的标准抗原结合,而不与板上的检测

流式细胞仪原理及操作步骤

流式细胞仪原理及操作步骤 流式细胞仪(FCM)是八十年代集单克隆抗体、荧光化学、激光、计算机等高技术发展起 来的一种先进仪器,已广泛应用于免疫学、生物化学、生物学、肿瘤学以及血液学等方面的 研究和临床常规工作。其中检测人白细胞表面标志可对白血病、淋巴瘤作用迅速正确的诊断, 对淋巴细胞群和亚群进行精确分类,还能分离纯化某一群或亚群细胞。活细胞免疫荧光技术 是用于FCM检测的标本准备,染色后也能在荧光显微镜下进行观察,在某些实验条件下,活细胞免疫荧光染色后的特异性和敏感性要优于滴片固定的常规间接免疫荧光的结果。 (一)原理一 活细胞表面保留有较完整的抗原或受体,先用特异性鼠源性单克隆抗体与细胞表面相应抗原结合,再用荧光标记的第二抗体结合,根据所测定的荧光强度和阳性百分率即可知相应抗原的密度和分布。 (二)操作步骤 制备活性高的细胞悬液(培养细胞系、外周血单个核细胞、胸腺细胞、脾细胞等均可用 于本法) 用10% FCS RPMI1640调整细胞浓度为 5X 106?IX 107/ ml 取40卩1细胞悬液加入预先有特异性McAb(5?50卩I) 的小玻璃管或塑料离心管,再加50卩I 1 : 20(用DPBS (或兔抗鼠)荧光标记物,充分振摇 J 4 C 30mi n 用洗涤液洗涤2次,每次加液2ml左右 1000rpmx 5mi n J] 加适量固定液(如为FCM制备标本,一般加入1ml固定液,如制片后在荧光 显微镜下观察,视细胞浓度加入100?500 ^1固定液) FCM检测或制片后荧光显微镜下观察 (标本在试管中可保存5?7天) (三)试剂和器材 1. 各种特异性单克隆抗体。 2. 荧光标记的羊抗鼠或兔抗鼠第二抗体,灭活正常兔血清。 3. 10% FCS RPMI1640, DPBS、洗涤液、固定液(见附录)。 4. 玻璃管、塑料管、离心机、荧光显微镜等。

菌落PCR实验步骤.doc

菌落PCR资料 PCR, 菌落, 资料 菌落PCR 菌落PCR与我们通常的普通DNA的PCR的不同在于,直接以单个菌作为模板。是一种可以快速鉴定菌落是否为含目的质粒的阳性菌落。操作简单,快接,阳性率较高,在转化鉴定中较常见。 操作方法: 1,挑取单个菌落,可以用高压灭菌的牙签。现在含抗性的平板上画线,做保种用,然后置于20ultriton-x100中搅和一下,将相应的菌和板子上的画线区做上对应的记号 2,将装有20ulTritonx-100的EP管100度煮2分钟 3,按照菌中预期包含的质粒加好PCR体系,建议做20ul体系,模板加煮过的菌的上清1ul 4,上机即可。退火温度可以稍低,虽然没有什么根据可言,但是个人经验,推荐比质粒PCR 时稍低 5,电泳,看结果,阳性的菌落对应的板子可以直接挑菌小摇,保种或者送测序都可以 我的做法是: 用枪头挑选单菌落到装有20uL水的pcr管中,然后悬浮菌液。 在做PCR时,吸取1uL做摸板,但电泳检测后,选有阳性克隆相对的菌液10uL与试管的液体培养基中培养。这样做,既初步检测了阳性克隆,又保存了所需要的菌落。 当然,在挑菌时也有用接种环挑的,有用牙签挑的,看个人的爱好了 我们都是直接拿牙签挑单菌落往PCR反应体系中搅拌一下,一般都能鉴定出来。想节省麻烦的话,还可以菌落鉴定同时挑单克隆,用1.5的EP管装1mL左右培养基,牙签挑出菌落后先在培养基上搅拌然后再放到PCR反应体系中。 把PCR体系先加好,用接种针直接往菌落上戳一下然后伸到体系里面晃晃就可以上机P了,我每次都是这样,可能是最方便的方法了。 取200ul水,牙签挑菌,煮沸5‘,冰浴5’,12000rpm,取上清5ul做模版。其他的和普通pcr一样。 我们都是用过夜培养的菌液0.3ul(不要超过0.5ul)做模板,很简单的,其它都不变。先94度5min 裂解菌,最好5min后再加入taq酶。 是的,菌落PCR不难。。但是如果发现结果出现非特异带,在目的带位置有很弱的条带出现,最好再用液体培养后再做一次PCR,我就因为这个阴性结果折腾了1个月。。扩培后再作菌落PCR就得到阳性结果了。。 我是这样做的,取菌液60ul至ep管中,沸水中煮5min,离心,取其中上清1ul作模板,屡试不爽 拿牙签点一下菌落然后再体系里面涮一下就可以了 如果觉得不可靠,就索性接个种,摇个小管,然后取1ul作模板 模板如果太多了,引物就不够用了,显然扩不出来,这种现象在质粒这种模板的PCR里面很多,你提出来的质粒不要忘记稀释

分析仪操作原理及其操作方法讲解

分析仪操作及原理 注意: 1、标定前请确认标气背景气、标定气含量,保证通入仪器的是对应的标气。 2、百分含量仪器通入标气后需稳定10分钟以上方可标定,微量仪器需稳定时间更长一 些,待数值稳定以后再进行标定。 CO2红外气体分析仪(AIA1203) 这台仪器为ABB生产EL2020系列型号为Uras26,测量范围0~5~20ppm.vol.CO2,精度为±1% 一、测量原理(红外式) 根据不同组分气体对不同波长的红外线具有选择性吸收的特性而工作的分析仪表。测量这种吸收光谱可判别出气体的种类;测量吸收强度可确定被测气体的浓度。 各种多原子气体(CO,CO2,CH4等)对红外线某一段电磁波的辐射都能具有一定的吸收能力,而且这种吸收能力对波长具有选择性,只有当红外光谱中某一段光谱的频率与物质分子本身的频率一致时,该物质分子才吸收这一段红外光谱的辐射能。我们把能吸收的这一段红外线光谱称为该气体的特征吸收波段。气体吸收了红外线光谱的辐射能后,一部分可转变成热能,使温度升高。红外线光谱的辐射又特别显著,这就能让我们利用各种元件,如热电堆、热敏电阻等去测量红外线辐射能的大小。 二、标定 1、选择校准菜单:menu calibrate manual calibration. 2、用箭头键选择zero gas。 3、接通零点气。操作零点气钢瓶减压阀组件,使输出压力控制在20kpa,将操作面板上 多通阀(5MV)切向“零点气”,打开测量流量计,调整“测量”转子流量计旋钮,使进气量控制在30L/H左右。 4、确认零点气连接上并且零点气浓度值输入后。按ENTER键确认。 5、当测量示值显示稳定,按ENTER键开始校准零点。 6、接受校准结果按ENTER键;不接受校准结果返回步骤6按BACK键;不接受校准结 果返回测量状态按MEAS键。 7、用箭头键选择SPAN GAS(零点标定完成后会自动跳到zero 和span的选择窗口。 8、按4步骤接通量程气。

PCR实验室操作流程

乙型肝炎病毒(HBV DNA PCR ABI7300)检侧标准操作程序 飞INFORMATIONFORTE检测信息 二、ANALYTICALPRINCTP检测原理 聚台酶链式反应(PCR可对特定核苷酸片段进行指数级的扩增,而实时荧光定量PCF技术,是指在PCF反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。在实时荧光定量PCR反应中,引入了一种荧光化学物质,荧光物质有两种:荧光探针和荧光染料。我们目前是使用TaqMan荧光探针的检测原理:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCRT增时,Taq 酶的5' —3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,荧光信号强度也等比例增加(图一)。这样就可以通过荧光 强度变化监测产物量的变化,从而得到一条荧光扩增曲线图 3 ■- atwnch-ftr

三、操作步骤 (一)试剂配制 1、进入试剂准备区,开启冰箱冷冻层取出 HBV-DNA 佥测试剂盒。查 看外包装盒(包括生产批号、有效期),无误后拆开试剂盒,取出核酸 提取液、反应液及Taq 酶(核对核酸提取液、HBVPC 反应液及Taq 酶 管上批号与试剂外包装盒批号是否一致)(图1),不一致则不可使用, 需更换新的试剂。室温平衡20min ,完全融化后2000rpm 离心备用。 2、核酸提取液的分装 (1)取0.5ml 离心管架置于超净工作台内(开机前用紫外线消毒30 分钟),用右手拿起镊子逐个将离心管放入离心管架(注意应夹住离 心管外壁,不能碰到管内壁),摆放顺序为横列从左往右摆,竖列为 从上往下隔行排,离心管个数为n (n 二样本数+对照品+质控品)。完成 后将镊子放回原位(图 2)。 对 及 有 效 La i

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