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DNA条形码技术在鉴定蛆症异蚤蝇中的应用_岳巧云

DNA条形码技术在鉴定蛆症异蚤蝇中的应用_岳巧云
DNA条形码技术在鉴定蛆症异蚤蝇中的应用_岳巧云

[作者简介] 岳巧云(1971-),女,博士,主要从事分子生物学和

细胞发育的研究。

*通讯联系人

=微生物检测方法>

DNA 条形码技术在鉴定蛆症异蚤蝇中的应用

岳巧云,冯文军,王章根,管维,刘国雄,邱德义

*

(中山出入境检验检疫局,广东中山 528403)

[摘要] 目的:建立应用DNA 条形码技术鉴定蛆症异蚤蝇的方法。方法:分别提取在口岸检疫中截获的双翅目幼虫和成虫的基因组DNA,利用节肢动物线粒体细胞色素氧化酶I(CO I)的通用引物进行DNA 扩增。PCR 产物直接测序,测序引物同扩增引物,得到清晰可读的665bp CO I 的DNA 片段碱基序列。与G enBank 中相近的序列进行比较,并用C l ustal W 2在线建立N J 系统发育树。结果:成虫和幼虫CO I 的DNA 序列100%相同,与G enB ank 中公布的长度为559bp 的蛆症异蚤蝇的CO I 相应片段相似性高达9819%,与同属其他种类的可比片段的DNA 序列相似性则低于90%。结论:根据结果可以判断所截获的双翅目昆虫为蛆症异蚤蝇。本文的研究再一次证明了DNA 条形码技术可以直接应用于昆虫种类的鉴定。

[关键词] DNA 条形码技术;蛆症异蚤蝇;种类鉴定

[中图分类号] R 34 [文献标识码] A [文章编号] 1004-8685(2010)06-1400-03

Application of DNA barcoding techniques to s pecies identification of M egaselia scalaris

YUE Q iao -yun ,FEN G W en -jun ,WAN G Zhang-gen ,GUAN W ei ,LIU Guo -x iong ,Q I U D e -y i *(Zhongshan En try -Ex it Inspecti on and Q uarantine Bureau ,Zhongshan 528403,Ch i na)

[Abstract] O bjective :T o estab lish a m e t hod of applica tion DNA B arcodi ng techn i ques to the spec i es i dentificati on o f M egaselia scalar is 1M e thods :G enom i c DNA we re ex tracted from bo t h the D i ptera adu lt and larva i ntercepted from the i m ported waste pa -per 1PCR w as perfor m ed w it h the arthropod degene rate m itochondr i a l cy tochro m e ox idase (CO I)pr i m ers 1Sequenc i ng pri m ers we re sa m e w it h the PCR ones 1665bp CO I sequences w ere obta i ned fro m t he PCR product sequenced directl y 1Sequences blasted i n the G enBank ,and a N J-tree o f the l a rva ,adu lt and related species was bu lit w ith C lusta lW 2on line 1Resu lts :Sequences o f the compared CO I frag m ents from the adult and l arva w ere 100%identi ca ,l wh i ch w as 9819%i dentical to t he pub lished 559bp CO I frag m en t of M e gaselia scal aris i n t he G enBank ,i dentifi ca tion w as less than 90%compared w ith othe r spec i es from the sa m e genus 1Con clusi on :Based on these results ,w e cou l d conc l ude t hat the intercepted spec i es is M e gaseli a sca l aris 1In th i s study we confir m ed aga i n that app licati on of DNA Barcod i ng to spec i es i dentificati on of i nsec t i s desirab le and w it h high confi dence 1[K ey words] DNA barcoding ;M egaselia scalar is ;Species identifi cation 相近种类昆虫的幼虫形态特征差异小,有些特征在不同的发育时期不够稳定,根据幼虫的形态学特征进行种类鉴定很难确保其准确性,并且需要鉴定者具有非常丰富的分类学知识和经验,因此昆虫幼虫的鉴定一直是一个技术难题。目前在国际范围内对昆虫的种类鉴定主要还是依据成虫的形态学特征。在口岸检疫工作中,如果截获的是幼虫、卵、蛹等非成虫虫态,通常需要将其培养成成虫后再进行鉴定,整个检疫鉴定过程时间长达数周[1],大大加长了通关周期,影响贸易的往来。

在昆虫学研究领域,分子生物学技术主要应用于系统演化及分类鉴定两方面。昆虫系统演化的研究是从分子水平上找出其种间的DNA 序列的特异性差异,主要目的为探索昆虫种、属

间的相对亲缘关系,同时也为昆虫的分子鉴定奠定了基础[2]

DNA 条形码(Ba rcodi ng)是一种近几年刚刚兴起的新技术,它的原理是利用基因组DNA 上一段标准的或者大家公认的基因片段,作为分子靶标来进行种级水平的物种鉴定。用于条形码技术的DNA 片段要具备以下两个特点:一是与整个基因组DNA 相比要短得多;二是非常容易获得。线粒体C O I

基因在细胞内的拷贝数高,获得技术简单,而且序列非常保守,在物种内不同个体之间只有1%~2%的差异,而近缘种间的差异大,非常适合作为DNA 条形码技术的分子标记。

DNA 条形码技术为物种的鉴定提供了新的手段,弥补了传统形态分类的诸多不足。尤其适用于难以用形态分类特征进行鉴定的幼虫、卵、蛹等非成虫虫态。利用分子标记进行种类鉴定国际上已有不少的尝试,如Ball 等(2005)[3]用DNA 条形码鉴别了70多种水生蜉蝣,游中华等(2007)[4]用线粒体CO I 鉴别了入侵害虫西花蓟马及其他8种常见蓟马。岳巧云等(待发表,2010)[10]直接将DNA 条形码技术应用于未知昆虫幼虫种类的鉴定,达到了预期的效果。肖金花等(2004)[5]则综述了线粒体CO I 片段在物种鉴定方面的独特优点,并指出DNA 条形码技术为生物分类学的新动向。

本文用线粒体CO I 基因片段作为分子标记,对在口岸检疫过程中截获的双翅目成虫和幼虫进行了鉴定,并对成虫进行形态分类而验证分子分类的结果,二者结果完全相符,从而证实了DNA 条形码技术在非成虫虫态昆虫种类鉴定中应用的准确性和实用性。1 材料与方法111 标本的采集

研究所用的标本为在口岸检疫过程中截获的双翅目幼虫

和成虫。采集到的标本经PBS清洗,显微镜下去除虫体表面携带的其他节肢动物(如螨等)的污染后,立即投入100%酒精中固定,置于-20e冰箱中保存备用。

112DNA提取

成虫和幼虫的DNA提取均采用T akara公司生产的U n-i versal G eno m ic DNA ex tracti on试剂盒。按照试剂盒使用手册进行基因组DNA提取。

113PCR扩增和测序

11311DNA扩增PCR扩增所用引物为:LCO14905c-GGT-C AA C AAATCATAAAGATATTGG-3c,H CO21985c-TAAACT-TCAGGGTGA CCAAAAAATCA-3c[6],由宝生物工程(大连)有限公司合成。EX-T aq DNA聚合酶、dNTP等PCR试剂从T aka R a公司购置。

PCR反应体系(50L l):10倍PCR缓冲液5L;l正向引物(20L m ol/L)215L;l反向引物(20L m ol/L)215L;l dNTP (10mm o l/L)115L;l Ex-T aq1L;l模板DNA2L;l无菌水定容到50L l。

EX-T aq DNA聚合酶扩增条件:94e变性5m i n;94e、40s,54e、40s,72e、1m i n,反应40个循环;72e延伸10m in。

11312PCR产物测序PCR产物检测用1%的A garose胶, 97V电压,400mA电流,电泳45m i n。Syb rgreen荧光染料染色,UV I凝胶系统成像。

采用PCR产物直接测序法,PCR产物经纯化后,送宝生物工程(大连)有限公司完成测序,测序引物同于扩增引物。测序序列在删除两端引物区不确定的碱基后,将所得序列在G enBank中进行比对,找到G enB ank中相似性高的前7个序列,用C l ustaW l2分析本文中所测的成虫、幼虫和这7个序列并构建N J系统关系树。

2结果与分析

211PCR产物

PCR产物长度为700bp左右。

M:100bp D NA Ladder;B:阴性对照;A:成虫;L:幼虫

图1成虫和幼虫的CO I检测凝胶图

212幼虫和成虫序列的比较

DNA测序结果经Chromas软件验证图谱为有效序列。除去两端引物附近的不确定碱基,所得有效序列为665bp。成虫与幼虫的核苷酸序列一致性为100%,*表示完全一致(图2)。213与G enBank中的序列比对

B l ast结果表明,PCR产物所测得的序列与G enBank中编号GU075400公布的559bp的蛆症异蚤蝇CO I序列相似性为9819%,共存在6个碱基对差异,其中5个变异发生在第三密码子上,占总变异数的8313%,一个发生在第一密码子上,占总变异数的1617%(图3,*表示完全一致)。而与同属其他种类CO I核苷酸的相似度最高为8915%(表1)。

将559bp 核苷酸序列按无脊椎动物线粒体编码,利用T ranseq 在线翻译成蛋白质,进行氨基酸序列比对(b l ast P ),结果与G enBank 中公布的蛆症异蚤蝇的C O I 氨基酸序列(ACY4070111)相似性为100%(图4),*

表示完全一致。

图4 成虫与G en Bank 中蛆症异蚤蝇CO I 氨基酸序列的比较

214 N J 系统进化树的构建与分析

选取G enBank 中与目的片段核苷酸序列比较所得的相似性最高的前7个序列。详细信息见表1。

表1 蛆症异蚤蝇成虫、幼虫及G e nbank 中7种高相似性种类比较信息表

物种GenBank

登录号与幼虫相较相同碱基数缺失与幼虫相较相似度(%)

蛆症异蚤蝇幼虫本研究559/5590100蛆症异蚤蝇成虫本研究559/5590100蛆症异蚤蝇G U 0754*******/56029819异蚤蝇-1G U 0753*******/56148915异蚤蝇-2G U 0754*******/564108910异蚤蝇-3G U 0754*******/564108818异蚤蝇-4G U 0754*******/564108818异蚤蝇-5G U 0754*******/564108818蚤蝇

EU12653011

498/559

16

8911

分别将幼虫、成虫并这7个序列存成Fasta 格式,用C lus-t

a W l 2软件进行在线数据分析,并构建N J 系统进化树,结果如图5所示。树上所标数字为遗传距离。结果显示本研究所测成虫和幼虫最先聚在一起,然后与G enBank 中的蛆症异蚤蝇聚在一起,M 1ru fipes 的三个不同的种内差异类型聚成一支,蚤蝇科的种类明显单独为另外一支(图5)。因此可以根据所选取的CO I DNA

序列判断所截获的双翅目昆虫为蛆症异蚤蝇。

图5 幼虫、成虫与G enBank 中序列相近种类的NJ 系统发育树

3 讨论

昆虫的鉴定一般以成虫的形态特征为依据,而幼虫的鉴定一直是一个分类难题。采取的措施往往为实验室内饲养,待幼虫发育成成虫后,再行鉴定,费时费力,如果是没有生命的非成虫虫态或者肢体残缺不全的虫体,形态分类就难以应用了。在国境口岸检疫上表现为阻碍通关的速度,影响经济的发展。对于外来入侵种由于不能及时鉴定种类,不能采取相应的防治措施,而对生态环境造成潜在的威胁,甚至造成巨

大的损失。

分子生物学技术在分类学中的应用,给传统的形态分类提供了新的方法,为分类学指明了一个新的可能方向。利用线粒体CO I 基因的DNA 序列来区分物种一直是一个争议比较大的问题,关键在于难以提供一个统一的区分标准,即序列分歧达到什么程度才能明确为两个不同的物种[5]。现有的研究数据表明绝大多数物种的CO I 序列表现出低的种内遗传差异及相对较高的种间差异[3,7~9]。CBOL (Consorti um for the B arcode L ife ,生物条形码协会)的成立并在全球的范围内发起运用DNA 条形码技术进行物种鉴定的科学研究活动,把线粒体CO I 作为分子标记鉴定物种提升到一个历史高度,CO I 完全可以胜任物种鉴别的重任。

DNA 条形码技术的出现为解决幼虫、卵、蛹等非成虫虫态的快速鉴定提供了技术理论支持和一个有力的手段。我们的研究结果表明,同一种昆虫的成虫和幼虫线粒体CO I 片段的DNA 序列一致性非常高,在本文研究的例证中在长度为559个碱基的片段中,成虫与幼虫的序列完全一致,高达100%,种内差异小于2%,而与其他近似种的一致性则小于90%,差异大于10%,可以进行种类的鉴别。从N J 系统进化树可以看出,幼虫和成虫及G enB ank 中的同一种类遗传距离非常的近,与近似种的遗传距离相对远的多,物种鉴定结果分明、准确。同时我们还用成虫的形态分类特征进行验证,与DNA 条形码鉴定的结果完全一致。我们的所有结果验证了利用DNA 条形码技术完全可以直接运用于昆虫幼虫种类的鉴定。

但是到目前为止DNA 条形码技术的广泛应用,还受数据库中数据不全的限制,因此需要广大的科学研究者尽可能全地提供不同物种的CO I 序列和其他可以用于条形码物种鉴定的数据,建立DNA 条形码数据库,为DNA 条形码技术广泛用于鉴定物种提供足够的数据。

[参考文献]

[1]朱振华,叶辉,张智英1基于m t DNA Cyt b 的六种果实蝇的分子鉴定(双翅目:实蝇科)[J]1昆虫学报,2007,48(3):386-3901

[2]叶军,周国梁,易建平,等1地中海实蝇幼虫分子鉴定[J]1昆虫知

识,2007,44(4):562-5661

[3]B all SL ,H eb ert PDN 1B i ological identificati on ofm ayfli es (Ephe m er -op t era)us i ng DNA barcodes [J]1J N Am B enthol Soc ,2005,24(3):508-5241

[4]游中华,路虹,张宪省,等1入侵害虫西花蓟马及其他8种常见蓟马的分子鉴定[J]1昆虫学报,2007,50(7):720-7261

[5]肖金花,肖晖,黄大卫1生物分类学新动向-DNA 条形编码[J]1动物学报,2004,50(5):852-8551[6]Fol m er O ,B lack M,H oeh W,et a l 1DNA Pri m ers f or a m plificati on of

M it ochondrial cytochro m e C ox i dase subunit I f ro m d i verse metaz oan

i nvertebrates[J]1M olM ar B iol B i otechno,l 1994,3:294-2991[7]H ebert PDN ,R atnasi ngh a m S,de W aard J R 1Barcod i ng an i m al life :

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fi sh species [J]1Ph ilosoph ical Transactions of t h e Royal Soci et y B -B i ol ogical Sciences ,2005,2360(1462):1847-18571[9]H aji babaeiM,Janzen D H,Bu rna J M,et al 1DNA barcodes d istingu i sh species of trop i cal lepidoptera[J]1P NAS,2006,103(4):968-9711[10]岳巧云,任国栋,刘国雄,等1Barcod i ng 在未知昆虫幼虫种类鉴定

中的应用[J]1植物检疫,20101

(收稿日期:2010-01-12)

条码技术在物流中的应用

酒泉职业技术学院毕业论文 2010 级物流管理专业 题目:条码技术在物流中的应用于研究 毕业时间: 2013年6月 学生姓名:冯翠莲 指导教师:秦兴军 班级: 10上海环众物流管理班 二〇一二年五月二十日 酒泉职业技术学院 2013 届各专业 毕业论文(设计)成绩评定表

目录 摘要(关键词) (3) 1.条码技术的概述 (3) 2.形码技术特点 (4) 3.条码技术对物流的作用 (5) 4.条码技术在物流中的应用 (5) 5.国内外条码技术的发展状况 (6) 6.码技术存在的问题,应采取相应的措施 (8) 7. 总结 (9) 参考文献 (10)

浅析条码技术在物流行业的应用 【摘要】本文对条码技术在物流领域中的应用进行了研究,详细的介绍了条码技术特有的特点、作用、国内外的发展以及在物流领域应用中的现状。并报告了在物流领域中存在的一些不利于条码技术发展的问题,从多个角度对存在问题的原因进行分析、调查,从而提出对策,发表建议。 【关键词】条码技术物流应用 一、条码技术概述 (一)条码技术的概念 条形码技术是在计算机的应用实践中产生和发展起来的一种自动识别技术,是为实现对信息的自动扫描而设计的。条形码技术可以大量、快速采集信息,非常适合物流管理系统对大量化和高速化信息采集的要求,是实现POS系统、EDl、电子商务、供应链管理的技术基础。条形码技术包括条形码的编码技术、条形符号设计技术、快速识别技术和计算机管理技术。 (二)条码技术的特点 是迄今为止最经济、实用的一种自动识别技术。在信息输入技术中,采用的自动识别技术种类很多,条码作为一种图形识别技术与其它技术相比有如下特点: 1.操作简单易行且条码符号制作容易 2.灵活实用。条码标识既可以作为一种识别手段单独使用,也可以和有关识别设备组成一个系统实现自动化识别,还可以和其他控制设备联接起来实现自动化管理。 3.信息采集速度快。利用条码扫描的录入信息的速度是键盘录入的20倍。大概的速度是4000字符/分钟 4.采集信息量大。利用条码扫描,依次可以采集几十位字符的信息,而且可以通过选择不同码制的条码增加字符密度,使采集的信息量成倍增加。 除以上外还具有可靠性强﹑自由度大﹑设备结构简单、成本低等特点。

条形码与二维码的优缺点分析

条形码与二维码的优缺点分析 什么是条形码? 条形码(barcode)是将宽度不等的多个黑条和空白,按照一定的编码规则排列,用以表达一组信息的图形标识符。常见的条形码是由反射率相差很大的黑条(简称条)和白条(简称空)排成的平行线图案。条形码可以标出物品的生产国、制造厂家、商品名称、生产日期、图书分类号、邮件起止地点、类别、日期等许多信息,因而在商品流通、图书管理、邮政管理、银行系统等许多领域都得到广泛的应用。条形码技术,是随着计算机与信息技术的发展和应用而诞生的,它是集编码、印刷、识别、数据采集和处理于一身的新型技术。它的种类包括有:EAN码,UPC码,UCC/EAN-128码,交叉25码,39码,以及库德巴码。各种不同种类的 UPC-E码 条形码的发展历程 最早被打上条形码的产品是箭牌口香糖。条形码技术最早产生在风声鹤唳的二十世纪二十年代,诞生于威斯汀豪斯(Westinghouse)的实验室里。一位名叫约翰·科芒德(John Kermode)性格古怪的发明家“异想天开”地想对邮政单据实现自动分检,那时候对电子技术应用方面的每一个设想都使人感到非常新奇。他的想法是在信封上做条码标记,条码中的信息是收信人的地址,就象今天的邮政编码。为此科芒德发明了最早的条码标识,设计方案非常的简单(注:这种方法称为模块比较法),即一个“条”表示数字“1”,二个“条”表示数字“2”,以次类推。然后,他又发明了由基本的元件组成的条码识读设备:一个扫描器(能够发射光并接收反射光);一个测定反射信号条和空的方法,即边缘定位线圈;和使用测定结果的方法,即译码器。 此后不久,随着LED(发光二极管)、微处理器和激光二极管的不断发展,迎来了新的标识符号(象征学)和其应用的大爆炸,人们称之为“条码工业”。今天很少能找到没有直接接触过即快又准的条形码技术的公司或个人。由于在这一领域的技术进步与发展非常迅速,并且每天都有越来越多的应用领域被开发,用不了多久条形码就会像灯泡和半导体收音机一样普及,将会使我们每一个人的生活都变得更加轻松和方便。 条形码的的运作原理 识别原理 要将按照一定规则编译出来的条形码转换成有意义的信息,需要经历扫描和译码两个过程。物体的颜色是由其反射光的类型决定的,白色物体能反射各种波长的可见光,黑色物体则吸收各种波长的可见光,所以当条形码扫描器光源发出的光在条形码上反射后,反射光照射到条码扫描器内部的光电转换器上,光电转换器根据强弱不同的反射光信号,转换成相应的电信号。根据原理的差异,扫描器可以分为光笔、红光CCD、激光、影像四种。电

条码技术的应用

浅谈条形码技术的应用 摘要:本文论述了条形码的概念,常见条形码的类型,以及条形码在各个行业领域的应用情况。 关键词:条形码;二维条形码;技术应用。 一.条形码技术概述 条形码是由一组宽度不同、反射率不同的条和空按规定的编码规则组合起来的,用以表示一组数据和符号,条形技术是研究如何把计算机所需要的数据用一种条形码来表示,以及如何将条形码表示的数据转变为计算机可以自动采集的数据。因而,条形码技术主要包括:条形码编码原理及规则标准、条形码译码技术、光电技术、印刷技术、扫描技术、通信技术、计算机技术等。 (二)条形码技术的优点 条形码是迄今为止最经济、实用的一种自动识别技术。条形码技术具有以下几个方面的优点 输入速度快:与键盘输入相比,条形码输入的速度是键盘输入的5倍,并且能实现“即时数据输入”。 可靠性高:键盘输入数据出错率为三百分之一,利用光学字符识别技术出错率为万分之一,而采用条形码技术误码率低于百万分之一。 采集信息量大:利用传统的一维条形码一次可采集几十位字符的信息,二维条形码更可以携带数千个字符的信息,并有一定的自动纠错能力。

灵活实用:条形码标识既可以作为一种识别手段单独使用,也可以和有关识别设备组成一个系统实现自动化识别,还可以和其他控制设备联接起来实现自动化管理。 另外,条形码标签易于制作,对设备和材料没有特殊要求,识别设备操作容易,不需要特殊培训,且设备也相对便宜。 二.产品条码防伪管理系统 产品条码防伪管理系统可帮助企业对关键商品在分销网络中的有序流动实现严格的监督和控制,提高企业的渠道管理水平,降低和规避渠道风险。系统通过应用加密型二维条码技术,对关键商品进行精确和保密的标识。通过外地分支机构的商品核查职能,可有效杜绝产品跨区销售和窜货,防范假冒伪劣的冲击。1、生产管理模块 企业在每个产品上面贴上一个唯一标志的条码,可以有加密一维码,加密二维码等形式,含有产品的品种信息,生产信息,序列号,销售信息等,特别是,二维条码可以记录更详细的商品的销售区域、销售负责人、关键配件序列号等数据和信息,从而为商品添加了一个唯一、完整、保密的身份和属性标识符。 2、销售管理模块 分销企业通过将二维条码技术与进销存软件、企业广域网络的结合,便可对商品分销的全流程实现全面、有效、安全的管理和监控。并进一步得到宝贵的商品仓储、物流、销售、回款等数据,为企业总部的经营决策提供宝贵的统计信息、数据和报表。

商品学论文-条形码在商场中的应用分析

条形码在商场中的应用分析 (摘要:条形码,绝大多数人都认识,它在商场中的运用,极大地方便了人们的购物生活,由于它的功能的强大,也越来越受到各方面的重视,社会在逐步更加充分的开发条形码的作用和功能。本论文通过介绍条形码的内容、功能、作用等,进一步阐述条形码在现代的商业社会,特别是一些大型商场的广泛作用。)正文:所谓的条形码,在一些商场里面随处可见,许多的超市,你会发现里面的商品,每件上面都贴有由一排黑色线条组成的标签,这就是条形码。仔细看一下,就会发现条形码上的线条有宽、有窄;黑线条之间是空白,空白也是有宽、有窄。 正式的说,条形码是一门技术,通过查找资料,我们知道,条形码是在计算机应用和实践中产生并发展起来的一种广泛应用于商业、邮政、图书管理、仓储、工业生产过程控制、交通等领域的自动识别技术,具有输入速度快、准确度高、成本低、可靠性强等优点,在当今的自动识别技术中占有重要的地位。 条形码是由一组规则排列的条、空以及对应的字符组成的标记,“条”指对光线反射率较低的部分,“空”指对光线反射率较高的部分,这些条和空组成的数据表达一定的信息,并能够用特定的设备识读,转换成与计算机兼容的二进制和十进制信息。通常对于每一种物品,它的编码是唯一的,对于普通的一维条形码来说,还要通过数据库建立条形码与商品信息的对应关系,当条形码的数据传到计算机上时,由计算机上的应用程序对数据进行操作和处理。因此,普通的一维条形码在使用过程中仅作为识别信息,它的意义是通过在计算机系统的数据库中提取相应的信息而实现的。 通过查询资料,了解到条形码技术有如下优点:1、输入速度快:与键盘输入相比,条形码输入的速度是键盘输入的5倍,并且能实现"即时数据输入"。2,可靠性高:键盘输入数据出错率为三百分之一,利用光学字符识别技术出错率为万分之一,而采用条形码技术误码率低于百万分之一。 3、采集信息量大:利用传统的一维条形码一次可采集几十位字符的信息,二维条形码更可以携带数千个字符的信息,并有一定的自动纠错能力。 4、灵活实用:条形码标识既可以作为一种识别手段单独使用,也可以和有关识别设备组成一个系统实现自动化识别,

中药材DNA条形码分子鉴定指导原则

中药材DNA条形码分子鉴定指导原则 1. 背景 中药材存在多基原物种及同名异物、同物异名等问题,鉴于传统基原鉴定、性状鉴定、显微鉴定和理化鉴定方法存在局限性,为保证中药材临床应用安全、准确、有效,有必要增加中药材DNA条形码分子鉴定法。 2. 定义及原理 DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术,是传统形态鉴别方法的有效补充。由于DNA序列是由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)四种碱基以不同顺序排列组成,因此一定长度DNA序列能够区分不同物种。 中药材DNA条形码分子鉴定是以ITS2为主体条形码序列鉴定中药材的方法体系,其中植物类中药材选用ITS2为主体序列,psbA-trnH为辅助序列,动物类中药材采用COI为主体序列,ITS2为辅助序列,符合中药材鉴定简单、精确的特点,有明确的判断标准,能够实现对中药材及其基原物种的准确鉴定。本指导原则用于规范中药材DNA条形码分子鉴定法,为其应用提供指导。 3. 适用范围 适用于中药材(包括药材、药材粉末及部分药材饮片)及基原物种的鉴定。4. 方法流程 中药材DNA条形码分子鉴定法主要包括供试品处理、DNA提取、PCR扩增、测序、序列拼接及结果判定,以下内容详细说明各流程中的主要原理及注意事项。1)供试品处理 除特殊标明外,药材使用75%乙醇擦洗表面后晾干,称取10-100 mg备用。具体见各药材项下。 2)DNA提取 DNA的提取包括破碎细胞壁、释放DNA,DNA的分离和纯化,DNA的浓缩、沉淀与洗涤等基本步骤,目前常用试剂盒法,包括植物基因组DNA提取试剂盒和动物组织/细胞基因组DNA提取试剂盒。 由于植物类中药材种类繁多,可根据所研究中药材的具体情况对提取方法加

条码技术发展及前景

国内外条码技术发展现状与趋势 条码技术是20世纪中叶发展并广泛应用的集光、机、电和计算机技术为一体的高新技术,是将数据进行自动采集并输入计算机的重要方法和手段。它解决了计算机应用中数据采集的“瓶颈”,实现了信息的快速、准确获取与传输,是信息管理系统和管理自动化的基础。条码技术有机地联系了各行各业的信息系统,为实物流和信息流的同步提供了技术手段,有效地提高了供应链管理的效率,是电子商务、物流管理现代化等的必要前提。 从上个世纪70年代开始,经过30多年的发展,条码技术作为一种关键的信息标识和信息采集技术,在全球范围内得到了迅猛发展。国际上,随着应用的不断深入,条码技术正处于一个强劲的集成创新发展期,是商业贸易、物流、产品追溯、电子商务等领域的主导信息技术。 十多年来,以条码技术为代表的自动识别技术,在我国国民经济各行业应用的广度和深度不断发展,已经成为信息化建设中的一个重要部分,是建设大市场、搞活大流通,实现国民经济现代化,促进企业参与国际经济大循环,增强竞争力不可缺少的技术工具和手段。 一、国外现状与趋势 国际上,从上个世纪70年代至今,条码技术及应用都取得了长足的发展: 符号表示已由一维条码发展到二维条码,目前又出现了将一维条码和二维条码结合在一起的复合码;条码介质由纸质发展到特殊介质;条码的应用已从商业领域拓展到物流、金融等经济领域,并向纵深发展,面向企业信息化管理的深层次的集成;条码技术产品逐渐向高、精、尖和集成化方向发展。目前,国际上条码技术的发展呈如下特点。 1.条码技术产业迅猛发展 根据美国的专业研究机构VDC (Venture DevelopmentCorp.)的统计,全球条码市场规模一直在持续稳步增长。到2008年,全球条码技术装备的市场规模将从2003年的90亿美元增长到155亿美元,其中美洲地区年平均增长率将超过

我国期刊条形码分析及使用

我国期刊条形码分析及使用

“=L1+J1+H1+F1+D1+B 1”(相当于奇数位之和),在A4单元格中输入 “=A2+A3”,之后,通过人工计算,用10减去A4单元格数字的个位,即得校验码C的值(见图1,由于此时E1,F1,G1,H1,I1,J1,K1,L1,M1还没有输入具体数字,所以A2,A3,A4单元显示是错误的)。 以2012年出版的《出版科学》为例,将 D1D2D3D4D5D6D7分别用1009585代替,Y1Y2 用12代替,结果如图2所示,计算结果为94,用10减去94的个位数4,即得到的校验码为6,因此《出版科学》2012年全年的主代码为:9771009585126。 图1 条码主码中校验码计算示意图图2 以《出版科学》2012年的条码主码的校验码计算为例 1.2 附加码 附加码S1S2表示连续出版物的系列号,即周或月份的序数。附加码S1S2的取值见表2中的第2列。 表2 附加码S1S2的取值 标准中的笔者建议 出版周期S1S2 备注S1S2 备注 周刊01~53 用出版周的序数 表示01,02,……52 周刊,全年刊期 52期 旬刊01~36 用出版旬的序数 表示01,02,……, 36 旬刊,全年刊期 36期 双周刊02,04,06~52或 01~03~05~53 用出版周的序数 表示 01,02,……, 26 双周刊,全年刊 期26期 半月刊01~24 用出版半月的序 数表示01,02,……, 24 半月刊,全年刊 期24期

《期刊出版形式规范》规定:“期刊条码的附加码应与期刊出版的刊期和(或)出版的年份、月份或期号保持一致”。由表2可以看出,由于期刊出版月份不固定,例如,有的双月刊逢单月出版则附加码分别表示为(01,03,05,07,09,11),逢双月出版则分别为02,04,06,08,10,12,这样在阅读附加码时,还必须结合刊期才能断定是第几期,不具有唯一性。季刊的情况更麻烦,要分3种情况,季头,季中,季末则有3 种表示方式:(01,04,07,10),(02,05,08,11),(03,06,09,12)。所以,笔者建议,采用期刊的刊期作为附加码,去掉《期刊出版形式规范》中的期刊条码的附加码应与期刊出版年份、月份保持一致的规定。具体见表2中的第4列。例如对于双月刊来说,今后不管是逢单月出还是逢双月出,附加码都是唯一的,因为采用期次作为附加码,刊期为双月刊的期刊一年出版6期,提供的附加码就是01,02,……,06这6组数字。南红梅等[3]也撰文建议采 取这种作法,这样,期刊条码中的附加码就具有了唯一性,便于各编辑部选择。 由于《出版科学》是双月刊,所以2012年各期的附加码分别是:01,02,

条形码技术的应用

条形码技术的应用 淮北师范大学09信管顾明星20091205008 摘要:本文论述了条形码的概念,常见条形码的类型,以及条形码在各个行业领域的应用情况。 关键词:条形码;二维条形码;技术应用。 条形码或条码(barcode)是将宽度不等的多个黑条和空白,按照一定的编码规则排列,用以表达一组信息的图形标识符。常见的条形码是由反射率相差很大的黑条(简称条)和白条(简称空)排成的平行线图案。条形码可以标出物品的生产国、制造厂家、商品名称、生产日期、图书分类号、邮件起止地点、类别、日期等许多信息,因而在商品流通、图书管理、邮政管理、银行系统等许多领域都得到了广泛的应用。本文着重介绍了常见的几种条形码以及在各个行业的应用,以实例为基础,说明条形码应用的优越性和实用性。 条形码技术概述 条形码是由一组宽度不同、反射率不同的条和空按规定的编码规则组合起来的,用以表示一组数据和符号,条形技术是研究如何把计算机所需要的数据用一种条形码来表示,以及如何将条形码表示的数据转变为计算机可以自动采集的数据。因而,条形码技术主要包括:条形码编码原理及规则标准、条形码译码技术、光电技术、印刷技术、扫描技术、通信技术、计算机技术等。具体来说条形码是一种可印制的机器语言,它采用二进制数的概念,

经?l?和?0?表示编码的特定组合单元。直观看来,常用的条形码是由一组字符组成,如数字0-9,字母A-E或一些专用符号。? 条形码类型及常见条形码介绍 条形码是一种信息记录形式,根据不同的规定的编码规则所提出的条形码编号方案,多达四十余种,目前应用最为广泛的有:交叉二五码、三九码、UPC码、EAN码、128码等。近年来又出现了按矩阵方式或堆栈方式排列信息的二维条形码。若从印制条形码的材料、颜色分类,可分黑白条形码、彩色条形码、发光条形码(荧光条形码、磷光条形码)和磁性条形码等。 条码种类很多,常见的大概有二十多种码制,其中包括: Code39码(标准39码)、Codabar码(库德巴码)、Code25码(标准25码)、ITF25码(交叉25码)、Matrix25码(矩阵25码)、UPC-A码、UPC-E码、EAN-13码(EAN-13国际商品条码)、EAN-8码(EAN-8国际商品条码)、中国邮政码(矩阵25码的一种变体)、Code-B码、MSI码、Code11码、Code93码、ISBN码、ISSN 码、Code128码(Code128码,包括EAN128码)、Code39EMS(EMS 专用的39码)等一维条码和PDF417等二维条码。 条形码技术的优点 条形码是迄今为止最经济、实用的一种自动识别技术。条形码技术具有以下几个方面的优点 输入速度快:与键盘输入相比,条形码输入的速度是键盘输入的5倍,并且能实现“即时数据输入”。

DNA条形码

DNA条形码技术研究进展 摘要: DNA条形码(DNA barcoding)是近几年国际生物学研究的重点,即通过使用短标准核酸片段,对物种进行快速、准确的识别和鉴定。该技术在动物研究中采用线粒体COI基因中650bp片段,在植物中条形码主要在叶绿体基因组上进行选择,此外还有核基因ITS等。虽然DNA条形码研究还处于起步阶段,面临巨大的挑战,但是越来越多的研究表明DNA条形码可以广泛应用于生物的分类和鉴定,是一种简便、高效、准确的物种鉴定技术。本文简略的概述了DNA条形码的主要研究方法,开发应用以及面对的困难和争议,并展望该技术在生命科学领域的发展前景。 关键词:DNA条形码,物种鉴定,分类 引言 科学准确的鉴别区分物种是进一步开展深入研究的和利用的前提和基础。自瑞典植物学分类家Carolus Linnaeus建立双名法命名体系以来,虽然已经鉴定出大约一百七十万种生物,但是地球生物种类繁多,已鉴定分类的物种斤占生物总数约15%,人类仍然没有认识鉴定的物种占大多数,尤其是深海,原始丛林中的物种。 传统生物分类法主要依据形态学特征,比较解剖学等,在形态特征显著的脊椎动物,高等植物,昆虫等生物类群中应用效果较好,对形态差异较小的微小生物则差强人意,此外许多生物的形态容易受环境及生理时期影响,会导致分类产生误差。 自上世纪五十年代DNA双螺旋结构提出以来,人类对遗传物质的认识与日俱增,特别是PCR技术、测序技术和生物信息学技术的飞速发展,推动了利用DNA 蕴藏的信息对系统发育学的快速发展,并应用至生物分类学研究。 条形码技术是现代零售业发展的需求而产生的,在零售业的商品管理与销售中发挥了无法替代的关键作用。生物分类学家从中得到启示,DNA分子一级结构上的线性核苷酸序列可以建立类似的生物条形码,应用于快速鉴别生物。基于此,加拿大Guelph大学教授Hebert等(2003a)首次提出DNA条形码(DNA barcoding)

DNA条形码技术

D N A条形码技术 -标准化文件发布号:(9456-EUATWK-MWUB-WUNN-INNUL-DDQTY-KII

DNA条形码技术 一、DNA条形码 1、定义 DNA条形码(DNA barcode)是指生物体内能够代表该物种的、标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段。 2、特点 理想的DNA barcoding应当符合下列标准:(1)具有足够的变异性以区分不同的物种,同时具有相对的保守性;(2)必须是一段标准的DNA区来尽可能鉴别不同的分类群;(3)目标DNA区应当包含足够的系统进化信息以定位物种在分类系统(科、属等)中的位置;(4)应该是高度保守的引物设计区以便于通用引物的设计;(5)目标DNA区应该足够的短以便于有部分降解的DNA的扩增… 。 DNA barcoding作为生物“种水平species—level”鉴定的工具引人注目。Genbank数据库中CO I序列正在快速增加。Min等分析了CO I序列及其来源基因组核苷酸含量之间的关系,结果表明849个CO I基因的5 端的DNA barcoding 序列令人惊奇地准确地代表了其来源完整线粒体基因mtDNA的重要信息,也就是说对于未测序的基因组,从DNA barcoding能快速预知完整基因组的组成。 3、优点 (1)以DNA序列为检测对象,其在个体发育过程中不会改变。同种生物不同生长时期的DNA序列信息是相同的。同种生物不同生长时期的DNA序列信息是相同的,即经过加工,形态发生变化,而DNA序列信息不会改变,较之传统的方法,扩大了检测样本范围;同时样本部分受损也不会影响识别结果。(2)可进行非专家物种鉴定。该技术是机械重复的,只要设计一套简单的实验方案,经过简单培训的技术员即可操作。 (3)准确性高。特定的物种具有特定的DNA序列信息,而形态学鉴别特征会因趋同和变异导致物种的鉴定误差。

条形码的识别图像处理报告解析

华侨大学厦门工学院图像通信课程设计报告 题目:基于数字图像处理的条形码识别专业、班级: 学生姓名: 学号: 指导教师: 分数:

目录 一、设计任务及要求 (3) 二、设计原理及设计方案 (3) 2.1、条码译码原理 (3) 2.2条码译码方案 (4) 三、设计步骤与结果 (10) 3.1设计步骤 (10) 3.2结果分析 (11) 四、课程设计总结 (15) 五、心得体会 (15) 六、参考文献 (16) 附录一、源程序 (17) 附录二、成绩评定表 (25)

一、设计任务及要求 本课程设计研究的是基于数字图像处理的EAN-13条形码识别算法,通过工具平台MATLAB 实现。其中图像处理部分是条码识别重要的前期工作,利用MATLAB 强大的图象处理工具箱实现图像的读入、加噪仿真、滤波、二值化处理等工作,最终得到高质量的二值化图像。条码识别就是在二值图像的基础上实现,二值图像的质量直接关系到条码能否正确识读。 二、设计原理及设计方案 2.1、条码译码原理: 如图1-1所示是EAN-13条码的一个字符。条、空宽度的定义如下:图中1C 、 2C 、3C 、4C 表示每个字符中四个相邻条、空的宽度,T 表示一个字符的宽度。 图1-1 EAN-13条码宽度的定义 设一个字符中单位模块的宽度为n ,则单位模块的宽度: n=T /7 T=1C +2C +3C +4C 由于条码条、空宽度1C 、2C 、3C 、4C 已知,设条码条、空分别占单位模块的个数为i m ,则: i m =i C /n(其中i 取1、2、3、4) 因此,由mi 可知道条码的编码。例如: (1)若1m =2、2m =2、3m =2、4m =1; 条码的排列为条-空-条-空,则可知条码编码为1100110,是右侧偶性字符1;

中药材dna条形码分子鉴定法指导原则及其在《中国药典》(版)中的应用复习课程

中药材D N A条形码分子鉴定法指导原则及其在《中国药典》(2015年版)中的应用

《中药制剂分析》 课程论文 中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则及其在《中国药典》(2015年版)中的应用 药学(药物分析方向)2012级 指导教师:高晓霞 2015 年 11月

摘要:中药材存在多基原物种及同名异物、同物异名等问题,鉴于传统基原鉴定、性状鉴定、显微鉴定和理化鉴定方法存在局限性,为保证中药材临床应用安全、准确、有效,有必要增加中药材DNA条形码分子鉴定法。如今分子生物学技术在中药材鉴定领域的应用已逐步深入。《中国药典》2010年版收载了乌梢蛇饮片、蕲蛇饮片、川贝母药材的DNA分子鉴定方法,而《中国药典》2015年版收载了“中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则”,DNA条形码分子鉴定法是利用公认的相对较短的DNA序列来进行物种假定的一种分子生物学技术,是传统形态鉴别方法的有效补充。这标志着中药材的分子鉴定由实验室科研层面进入国家标准的应用层面。 关键词:中药材;DNA;鉴定;指导原则 一、中药材DNA条形码分子鉴定指导原则[1] 1.1定义及原理 该鉴定方法主要适用于中药材(包括药材、药材粉末及部分药材饮片)及基原物种的鉴定。DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术,是传统形态鉴别方法的有效补充。由于DNA序列是由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)4种碱基以不同顺序排列组成,因此一定长度DNA序列能够区分不同物种。 中药材DNA条形码分子鉴定指导原则通过对大样本量中药材进行DNA条形码分子鉴定研究,建立以ITS2为核心,psbA-trnH为辅的植物类药材DNA条形码鉴定体系和以COI为主、ITS2为辅的动物类药材DNA条形码鉴定体系。 1.2方法与步骤

条形码技术的应用总结

条形码技术的应用总结. 条形码或条码(barcode)是将宽度不等的多个黑条和空白,按照一定的编码规则排列,用以表达一组信息的图形标识符。常见的条形码是由反射率相差很大的黑条(简称条)和白条(简称空)

排成的平行线图案。条形码可以标出物品的生产国、制造厂家、商品名称、生产日期、图书分类号、邮件起止地点、类别、日期等许多信息,因而在商品流通、图书管理、邮政管理、银行系统等许多领域都得到了广泛的应用。本文着重介绍了常见的几种条形码以及在各个行业的应用,以实例为基础,说明条形码应用的优越性和实用性。条形码技术概述 条形码是由一组宽度不同、反射率不同的条和空按规定的编码规则组

合起来的,用以表示一组数据和符号,条形技术是研究如何把计算机所需要的数据用一种条形码来表示,以及如何将条形码表示的数据转变为计算机可以自动采集的数据。因而,条形码技术主要包括:条形码编码原理及规则标准、条形码译码技术、光电技术、印刷技术、扫描技术、通信技术、计算机技术等。具体来说条形码是一种可印制的机器语言,它采用二进制数的概念,经?l?和?0?表示编码的特定组合单元。直观看来,常用的条形码是由一组字符组成,如数字0-9,字母A-E或一些专用符号。? 条形码类型及常见条形码介绍 条形码是一种信息记录形式,根据不同的规定的编码规则所目前应用最为广泛的有:多达四十余种,提出的条形码编号方案, 交叉二五码、三九码、UPC码、EAN码、128码等。近年来又出现了按矩阵方式或堆栈方式排列信息的二维条形码。若从印制条形码的材料、颜色分类,可分黑白条形码、彩色条形码、发光条形

码(荧光条形码、磷光条形码)和磁性条形码等。 条码种类很多,常见的大概有二十多种码制,其中包括: Code39码(标准39码)、Codabar码(库德巴码)、Code25码(标准25码)、ITF25码(交叉25码)、Matrix25码(矩阵25码)、UPC-A 码、UPC-E码、EAN-13码(EAN-13国际商品条码)、EAN-8码(EAN-8国际商品条码)、中国邮政码(矩阵25码的一种变体)、Code-B码、MSI码、Code11码、Code93码、ISBN码、ISSN码、Code128码(Code128

中国条形码技术市场的发展分析

中国条形码技术市场的发展前沿动态 导读:在当今条形码技术发展非常迅速,并且每天都有越来越多的应用领域被开发,用不了多久条形码就会象灯泡和半导体收音机一样普及,将会使我们每一个人的生活都变得更加轻松和方便。 条形码技术诞生有一个故事由来,最早产生于二十世纪二十年代的Westinghouse实验室里。一位名叫John Kermode性格古怪的发明家“异想天开”地想对邮政单据实现自动分检,那时候对电子技术应用方面的每一个设想都使人感到非常新奇。 他的想法是在信封上做条码标记,条码中的信息是收信人的地址,就象今天的邮政编码。Kermode发明的条码标识,设计方案非常简单,即一个“条”表示数字“1”,二个“条”表示数字“2”,以次类推。然后,他又发明了由基本的元件组成的条码识读设备:一个扫描器(能够发射光并接收反射光);一个测定反射信号条和空的方法,即边缘定位线圈;和使用测定结果的方法,即译码器。 Kermode的扫描器利用当时新发明的光电池来收集反射光。“空”反射回来的是强信号,“条”反射回来的是弱信号。与当今高速度的电子元气件应用不同的是,Kermode利用磁性线圈来测定“条”和“空”。就象一个小孩将电线与电池连接再绕在一颗钉子上来夹纸。Kermode 用一个带铁芯的线圈在接收到“空”的信号的时候吸引一个开关,在接收到“条”的信号的时候,释放开关并接通电路。因此,最早的条码阅读器噪音很大。开关由一系列的继电器控制,“开”和“关”由打印在信封上“条”的数量决定。通过这种方法,条码符号直接对信件进行分检。

直到1949年的专利文献中才第一次有了Norm Woodland和Bernard Silver发明的全方位条形码符号的记载,后来到了1970年Iterface Mechanisms公司开发出“二维码”之后,才有了价格适于销售的二维矩阵条码的打印和识读设备。那时二维矩阵条形码用于报社排版过程的自动化。 此后不久,随着LED(发光二极管)、微处理器和激光二极管的不断发展,迎来了新的标识符号(象征学)和其应用的大爆炸,人们称之为“条码工业”。今天做条形码的企业琳琅满目,如何选择有保障的条形码企业是每一个想买条形码客户所要考虑的首要问题,通过市场调查发现,在中国有10个比较出名的企业,鹭源条码科技网居其中之一,有周到的售前咨询,售后技术支持,以强硬的服务诚信确保客户的利益,有将近10年的经验技术做后盾。 在当今条形码技术发展非常迅速,并且每天都有越来越多的应用领域被开发,用不了多久条形码就会象灯泡和半导体收音机一样普及,将会使我们每一个人的生活都变得更加轻松和方便。

植物DNA条形码研究简介

植物DNA条形码 摘要DNA条形码技术是利用标准的、具有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段在物种内的特异性和种间的多样性而创建的一种新的生物身份识别系统, 从而实现对物种的快速自动鉴定。尽管这一技术在理论上和具体应用上仍存在很多争论, 但DNA条形码概念自2003年由加拿大分类学家Paul Hebert首次提出后就在世界范围内受到了广泛关注。该技术在动物研究中已得到广泛的应用,所采用的标准片段是线粒体COl基因中约650 bp长的一段。然而在植物DNA条形码的研究进展相对缓慢,目前尚处于对所提议的各片段比较和评价阶段,还未获得一致的标准片段。由于植物中线粒体基因组进化速率较慢,因此条形码片段主要在叶绿体基因组上进行选择,被提议的编码基因片段主要有rpoB,rpoC1,matK,rbcL,UPA,非编码区片段有trnH-psbA,atpF-atpH,psbK-psbl,此外还有核基因ITS。 关键词DNA条形码,物种识别,ITS, matK, 形态分类学,植物DNA条形码, rbcL, trnH-psbA,DNA barcoding,DNA barcode,plant DNA barcoding 期刊或会议 生命条形码联盟(CBOL):由研究条形码的学者、专家所组成的国际性组织。2008年2月在昆明召开“中国生命条形码研究战略研讨会”。会议邀请十余名国外顶级专家以及国内植物、动物、微生物的知名学者,就DNA条形码的研究技术、策略和进展以及条形码管理发表演讲。中国科学院、国家自然科学基金委员会及科技部领导和近150名国内外专业人士参加了本次会议。2009年,为了明确中国生命条形码研究的发展战略,部署与生命条形码相关的各项工作,由中国科学院牵头,中科院动物研究所承办的“生命条码联盟(CBOL,the Consortium for the Barcode of Life)中国会议”近日召开。本次大会的主题是:建立国内的生命条形码合作平台,保持独立性并体现特色,在此基础上实现与国际进行接轨合作。大会旨在引进国际上生命条形码发展的先进理念、技术和成功经验,扩大与世界各国在生命条形码相关领域的交流与合作,进一步推进并指导我国生命条形码发展进程。 PLOS:公共科学图书馆(Public Library of Science,简称PLoS)是一个由科学家和医生组成的非营利机构,致力于把世界上科学和医学的文献作为免费资源向公众开放。2003年,PLoS作出一个非营利科学医学发布的决定,为科学家和医生提供高质量高水平的期刊,其中会发布他们最重要的作品。在这个开放资源的模式下,PLoS期刊直接在网上可以看到,免费使用,之后再发布或使用也没有任何限制,只要按创作共享注明出处授权条款的要求注明作者和来源即可。 Molecular Ecology Resources:分子生物学期刊

条形码技术及其应用

条形码技术及其应用 条形码技术属于自动识别范畴。它是随着电子技术的进步,尤其是计算机技术在现代化生产和管理领域中的广泛应用面发展起来的一门实用的数据输入技术。从系统看,条形码技术涉及编码技术、光传感技术、条形码印刷技术以及计算机识别应用技术。 条形码是由一组宽度不同、反射率不同的条和空按规定的编码规则组合起来的,用以表示一组数据和符号,条形技术是研究如何把计算机所需要的数据用一种条形码来表示,以及如何将条形码表示的数据转变为计算机可以自动采集的数据。因而,条形码技术主要包括:条形码编码原理及规则标准、条形码译码技术、光电技术、印刷技术、扫描技术、通信技术、计算机技术等。具体来说条形码是一种可印制的机器语言,它采用二进制数的概念,经l 和0 表示编码的特定组合单元。直观看来,常用的条形码是由一组字符组成,如数字0-9,字母A-E或一些专用符号。 条形码是一种信息记录形式,根据不同的规定的编码规则所提出的条形码编号方案,多达四十余种,目前应用最为广泛的有:交叉二五码、三九码、UPC码、EAN码、128码等。近年来又出现了按矩阵方式或堆栈方式排列信息的二维条形码。若从印制条形码的材料、颜色分类,可分黑白条形码、彩色条形码、发光条形码(荧光条形码、磷光条形码)和磁性条形码等。 不论哪一种条形码,都有的共同点是: 条形码符号图形结构简单; 每个条形码字符由一定的条符组成,占有一定的宽度和印制面积; 每种编码方案均有自己的字符集; 每种编码方案与对应的阅读装置的性能要求密切配合。 条形码系统是由条形码符号设计、制作及扫描识读组成的自动识别系统。条形码识读装置是条形码系统的基本设备,它的功能译读条形码符号,即把条形码条符宽度、间隔等信号转换成不同时间长短的输出信号,并将该信号转化为计算机可识别的二进制编码,然后输入计算机。识读装置由扫描器和译码器组成。扫描器又称光电读入器,它装有照亮被读条形码的光束检测器件,接收条形码的反射光,产生模拟信号,经放大、量化后送译码器处理。扫描器可以是一支光笔或激光枪,由人手持作业;也可以是一种安装在某部位的自动扫描器,典型的有固定光束扫描器、直线扫描器、逐行扫描器和全方位扫描器。译码器存贮有需译读的条形码编码方案的数据库库译码算法。早期的识别设备,扫描器和译码器是分开的,近年推出的设备大多已合成一体,整个设备完整,方便、灵巧。 当计算机配置了网络控制器之类的接口软、硬件时,这个条形码系统就能同时处理多个条形码识读装置输入的条形码信息。

解析商品条形码

解析商品条形码 商品条形码是指由一组规则排列的条、空及其对应字符组成的标识,用以表示一定的商品信息的符号。其中条为深色、空为纳色,用于条形码识读设备的扫描识读。其对应字符由一组阿拉伯数字组成,供人们直接识读或经过键盘向计算机输入数据运用。这一组条空和相应的字符所表示的信息是相同的。 条形码技术是随着计算机与信息技术的开展和应用而降生的,它是集编码、印刷、辨认、数据采集和处置于一身的新型技术。 运用条形码扫描是今后市场流通的大趋向。为了使商品可以在全世界自在、普遍地流通,企业无论是设计制造,申请注册还是运用商品条形码,都必需遵照商品条形码管理的有关规则。 目前世界上常用的码制有ENA条形码、UPC条形码、二五条形码、穿插二五条形码、库德巴条形码、三九条形码和128条形码等,而商品上最常运用的就是EAN商品条形码。 EAN商品条形码亦称通用商品条形码,由国际物品编码协会制定,通用于世界各地,是目前国际上运用最普遍的一种商品条形码。我国目前在国内推行运用的也是这种商品条形码。EAN商品条形码分为EAN-13(规范版)和EAN-8(缩短版)两种。 EAN-13通用商品条形码普通由前缀局部、制造厂商代码、商品代码和校验码组成。商品条形码中的前缀码是用来标识国度或地域的代码,赋码权在国际物品编码协会,如00-09代表美国、加拿大。45-49代表日本。690-692代表中国大陆,471代表我国台湾地域,489代表香港特区。制造厂商代码的赋权在各个国度或地域的物品编码组织,我国由国度物品编码中心赋予制造厂商代码。商品代码是用来标识商品的代码,赋码权由产品消费企业本人行使,消费企业依照规则条件本人决议在本人的何种商品上运用哪些阿拉伯数字为商品条形码。商品条形码最后用1位校验码来校验商品条形码中左起第l-12数字代码的正确性。 商品条形码的编码遵照独一性准绳,以保证商品条形码在全世界范围内不反复,即一个商品项目只能有一个代码,或者说一个代码只能标识一种商品项目。不同规格、不同包装、不同种类、不同价钱、不同颜色的商品只能运用不同的商品代码。 商品条形码的规范尺寸是37.29mmx26.26mm,放大倍率是0.8-2.0。当印刷面积允许时,应选择1.0倍率以上的条形码,以满足识读请求。放大倍数越小的条形码,印刷精度请求越高,当印刷精度不能满足请求时,易形成条形码识读艰难。 由于条形码的识读是经过条形码的条和空的颜色比照度来完成的,普通状况下,只需可以满足比照度(PCS值)的请求的颜色即可运用。通常采用淡色作空的颜色,如白色、橙色、黄色等,采用深色作条的颜色,如黑色、暗绿色、深棕色等。最好的颜色搭配是黑条白空。依据条形码检测的理论经历,红色、金色、浅黄色不宜作条的颜色,透明、金色不能作空的颜色。 EAN-8商品条形码是指用于标识的数字代码为8位的商品条形码,由7位数字表示的商品项目代码和1位数字表示的校验符组成。 商品条形码的降生极大中央便了商品流通,现代社会已离不开商品条形码。据统计,目前我国已有50万种产品运用了国际通用的商品条形码。我国参加世贸组织后,企业在国际舞台上必将博得更多的活动空间。要与国际惯例接轨,顺应国际经贸的需求,企业更不能慢待商品条形码。 信息来源:条码设备网 原文地址:https://www.wendangku.net/doc/2b7065105.html,/detail/75-3605.html

DNA条码

DAN条码的应用及前景 摘要:DNA条形码技术在最近几年发展迅速,本文就DNA条码技术在医学媒介生物鉴定中的应用,用该技术进行物种鉴定具有快速、简便的优点,及其DNA条码技术的背景进行了介绍。 关键词:DNA 条形码技术;背景;物种鉴定;生物多样性保护 DNA条形码技术是运用来自生物体基因组适当部分的一段短的核苷酸序列对物种进行种级水平鉴定,DNA条形码技术的核心是选择合适的DNA片断其变异速率必须足够的慢从而使种内变异最小,同时也要求充分的快来显示种间变异,同时它必须相对容易得到,人或缺失尽量的少,使序列的对比更容.理想中的DNA条码技术应符合下列标准:(1).同一物种不同个体之间作为条码的DNA序列一致,而不同物种之间具有差异;(2).应该是标准化的,即同分类群使用相同的DNA片断作为条码;(3).条码DNA片断应包含足够的系统发育信息,以便很容易将未知的或尚未“编条码”物种划入其分类等级(属,科等)中;(4).应该非常稳健,有高度保守的引物区和高可靠性的DNA扩增和测序;(5) 条码DNA片断应该足够的短,以便允

许降解的DNA 的扩增.因此,理想的DNA条码标记应具有差异的,标准化的,含有系统发育信息,极度稳健并且短的等特性,不但这样的一个理想的DNA标记尚未被发现,或许,根本存在?.用于动物和真菌的分子条形码技术的DNA片段——线粒体eoxl基因(编码细胞色素氧化酶亚基1)在陆地植物中高度保守,因此不适合作为植物的DNA条码.事实上,在植物中所有的线粒体基因进化速度都太慢,以至于不能精确的鉴别物种,因此它没有被选作植物的DNA条形码技术.核基因组在植物系统发育研究中通常使用I TS 序列,但核基因组高拷贝区复杂的一致性进化和旁系同源等性质,影响了该片断在某些类群的植物中的运用.在比较了7个主要候选质体DNA片断(at pF —at pH 间隔区,mat K基因,r b c L基因,r poB基因,r poC1基因,psbK—psbI间隔区,和t r nH—ps b A 间隔区)的性能后,CBOL推荐r b c L.mat K两个片断的联合作为植物条形码.通过对通用性、序列质量、分辨率和成本之间复杂的权衡后,这种提议可能是目前最务实的方案.[1]以2个位点r b c L—mat K为核心的条码为运用DNA序列数据鉴定物种提供了一个通用的框架,从而有助于发现陆地植物中更多的物种.选择了合适的用于分析的DNA 区段以后,必须

植物DNA条形码序列筛选与鉴定研究

植物DNA条形码序列筛选与鉴定研究 DNA条形码是指用短的、标准的DNA序列作为物种标记来鉴定物种的一种新技术,它是传统形态学分类的有效补充。目前,植物类群中DNA条形码的研究和应用尚处于探索阶段,筛选候选片段、进而确定通用条形码是当前植物条形码研究的首要任务。 为了评估候选条形码在植物中的通用性,本文选取了植物主要类群之一裸子植物门作为取样对象进行研究。此外,由于DNA条形码的应用主要集中在属内物种水平,因此本文还专门针对被子植物门中蔷薇科和大戟科两个具体类群进行小范围研究,进而加快植物标准DNA条形码的确定,促进植物完整条形码数据库的建立。 综合实验分析结果,得出的主要结论如下:(1)基于扩增效率、种内种间遗传距离、"DNA barcoding gap"和物种鉴定能力四个筛选标准,本文评估了七个DNA 片段(psbA-trnH, rbcL, matK, rpoB, rpoCl,ITS和ITS2)对裸子植物鉴定的有效性。研究结果表明ITS2是所选片段中最适合鉴定裸子植物的条形码。 为了进一步验证ITS2对裸子植物的鉴定能力,我们扩大了样本范围对其进行评估。对于涵盖12科80属502种的888个样本,ITS2的正确鉴定效率在种水平和属水平分别达到73%和98%。 (2)以蔷薇科植物为研究对象,本文分别对四个DNA片段(rbcL, matK, rpoCl 和ITS2)的扩增成功率、遗传距离差异、"DNA barcoding gap"和物种鉴定能力四个方面进行了评估和比较。研究结果表明ITS2是所评估DNA片段中最有潜力的DNA条形码。 为了进一步检验ITS2对蔷薇科植物鉴定的有效性,本文基于一个更大的样

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