文档库 最新最全的文档下载
当前位置:文档库 › 暨南大学生物化学练习题-有往年考题的答案

暨南大学生物化学练习题-有往年考题的答案

暨南大学生物化学练习题-有往年考题的答案
暨南大学生物化学练习题-有往年考题的答案

1. 拉式构象图内容

答:拉氏构象图:Ramachandran根据蛋白质

中非键合原子间的最小接触距离,确定了哪些

成对二面角(Φ、Ψ)所规定的两个相邻肽单

位的构象是允许的,哪些是不允许的,并且以

Φ为横坐标,以Ψ为纵坐标,在坐标图上标

出,该坐标图称拉氏构象图(The

Ramachandran Diagram)。

图上的一个位点对应于一对二面角(Φ、

Ψ),代表一个Cα的两个相邻肽单位的构象。

该图简化了蛋白质构象的研究,有利于正

确判断蛋白质结构模型的正误。同时也发现了

肽链的折叠具有想当大的局限性,二面角(Φ、

Ψ)取值范围有限,只有取值所对应的构象才

是立体化学所允许的。

⑴实线封闭区域

一般允许区,非键合原子间的距离大于一

般允许距离,区域内任何二面角确定的构象都

是允许的,两者无斥力,构想能量最低,所以

构象是稳定的。

⑵虚线封闭区域

是最大允许区,非键合原子间的距离介于

最小允许距离和一般允许距离之间,立体化学

允许,但构象不够稳定。

⑶虚线外区域

是不允许区,该区域内任何二面角确定的

肽链构象,都是不允许的,此构象中非键合原

子间距离小于最小允许距离,斥力大,构象极

不稳定。

Gly的Φ、Ψ角允许范围很大。

总之,由于原子基因之间不利的空间相互

作用,肽链构象的范围是很有限的,对非Gly

氨基酸残基一般允许区占全平面的7.7%,最

大允许区占全平面22.5%。

2. 蛋白质翻译后修饰的作用。

蛋白质的结构更为复杂, 功能更为完善, 调节更为精细, 作用

更为专一。表现如下:

(1)磷酸化、糖基化和硫酸化还有许多其它的修饰对蛋白的功

能是极为重要的,因为它们能决定蛋白的活性、稳定性、定位

和循环,进一步影响细胞的生长分化、细胞周期、细胞凋亡和

癌症发生等生物学过程;

(3)与某些疾病相关:如多种硫酸酯酶缺乏症,属于一种罕见

的溶酶体储存紊乱疾病,造成硫酸酯酶的翻译后修饰出现异常,

致使酶活性减少或缺乏,造成各种硫酸酯酶的硫酸酯底物堆积

在细胞的溶酶体和其他细胞器中,损害细胞的正常功能,出现

一系列复杂的临床表型。

3. 二硫键在肽链折叠、蛋白质结构和功能方面的作用

答:二硫键等基团间的相互作用为蛋白质产生维持高级结构和功能提供基础。半胱氨酸残基中的巯基是所有蛋白质氨基酸残基中最活泼基团,在体内多种反应中扮演着至关重要角色。巯基与二硫键之间可借助氧化还原反应相互转化。

当条件合适时,二硫键可按照原来的配对进行组合,这样形成的蛋白质可与天然蛋白质一样,既有正确的空间构象,又具有原来蛋白质的生物活性。这一过程被成为蛋白质氧化重折叠。就天然构象的恢复而言,二硫键不仅能稳定天然构象,且还能引导进一步氧化与折叠的发生。

(1)二硫键能够帮助肽链折叠

二硫键的形成对于稳定蛋白质的空间结构和保持其活性功能具有极其重要的影响,是蛋白质折叠过程中的重要步骤,它的错误配对是影响蛋白质多肽链正确折叠的重要原因,而且其形成的动力学和热力学性质影响着蛋白质折叠的速率和途径。相对而言,二硫键更倾向于在氨基酸序列的前半段出现,这在蛋白质翻译过程中对于保证蛋白质新生肽链顺利延伸合成和减少发生错误折叠是有积极意义的。

(2)二硫键能够维持蛋白质结构

二硫键作为共价化合键,存在于多数蛋白质中。二硫键的形成能够使蛋白质肽链的空间结构更为紧密,从而发挥维持和稳定蛋白质三维结构的功能。二硫键可以具有不同的空间构型,因此形成二硫键的2个半胱氨酸残基所在肽段的相对构象,也可因为二硫键构型不同而发生改变。大多数真核细胞膜表面蛋白和分泌蛋白经常通过二硫键来稳定其构象。

(3)二硫键的形成和变化能够影响蛋白质的功能

半胱氨酸残基中的巯基是所有蛋白质氨基酸残基中最活泼的基团,在体内参抗氧化、亚硝基化和巯基-二硫键交换等多种重要生理反应,从而发挥并调节蛋白质的功能,如:可以调节细胞内环境分子间的接触,从而影响蛋白质的分泌情况;二硫键能够作为许多蛋白功能的切换器,一些分泌的可溶性蛋白和细胞表面受体蛋白通过一个或多个二硫键的切割来实现其功能的控制;另外,蛋白巯基还可以作为细胞内环境分子间相互作用的媒介,其媒介作用通过直接地形成分子间二硫键或间接地改变折叠途径和后续的聚集反应来实现。例举如下:

A、巯基的抗氧化作用——在谷胱甘肽(GSH)中,半胱氨酸残基形成的疏基能够维持细胞的正常代谢与保

护细胞膜的完整性,并能结合亲电子基、重金属离子与氧自由基等有害物质,具有抗脂质过氧化作用,可直接使氧自由基还原或促进超氧化物歧化酶合成。另外,由于巯基具有抗氧化作用,现已证实GSH水平下降是诱导细胞发生凋亡的重要因素。

B、巯基的亚硝基化反应:蛋白质巯基亚硝基化修饰——主要是指巯基与气体信号分子一氧化氮(NO)反应。

蛋白质巯基被NO或其衍生物修饰可发挥NO的生物活性,且使NO更稳定。蛋白质的巯基亚硝基化修饰影响其在细胞内的活性和功能,如核转录因子(NF-κB) 的一个亚基巯基亚硝基化能够影响其与DNA结合;蛋白质巯基亚硝基化修饰能够活化钙离子通道,天门冬氨酸受体(NMDAR)蛋白质巯基亚硝基化影响相关信号通路;蛋白质巯基亚硝基化调控Caspase酶活性,用Fas处理细胞,Caspase-3发生去亚硝基化后活化,诱导细胞凋亡。

C、巯基-二硫键交换反应对细胞信号分子影响——人热休克转录因子1(heat shock transcription factor

1,HSF1)中半胱氨酸残基的氧化还原反应能够影响其被热激活状态并DNA结合。

4. 为什么会出现转角?转角为什么一般都出现在蛋白质表面?

答:β-转角是种简单的非重复性结构。在β-转角中第一个残基的C=O与第四个残基的N-H氢键键合形成一个紧密的环,使β-转角成为比较稳定的结构,多处在蛋白质分子的表面,在这里改变多肽链方向的阻力比较小。

β-转角的特定构象在一定程度上取决与他的组成氨基酸,某些氨基酸如脯氨酸和甘氨酸经常存在其中:甘氨酸(Gly):R=H,即侧链没有空间位组,因此临近氨基酸残基形成的二面角自由度较大、不稳定。一般不出现在规则二级结构中,但常出现在β-转角中,能很好地调整其他残基的空间阻碍,因此是立体化学上最合适的氨基酸,并常出现在两股肽段贴近的位置;

脯氨酸(Pro):N原子位于刚性封闭的吡咯环,并使Φ角固定为-60°;该N原子连接的H原子已用于肽键的形成,且吡咯环又阻止其C=O接近附近肽平面的NH,故难以形成α-螺旋或β-折叠所需要的氢键。因此在一定程度上迫使β-转角形成,促使多台自身回折且这些回折有助于反平行β折叠片的形成。

β-转角及其附近氨基酸残基有较大的亲水性,常出现亲水性较强的D(Asp)、N(Asn)、Q(Gln)、S(Ser)等氨基酸残基,故大多位于蛋白质分子表面,参与蛋白质与水分子、其他蛋白或分子之间的相互作用。常是蛋白质磷酸化或N-糖基化位点,其序列具有保守性,与参与蛋白质生物学功能密切相关。

5. 肽链设计

Design a sequence of polypeptide containing up to 25 amino acids which is likely to form a hairpin α-helical structure two antiparallel(反向平行)α-helices,with a β-turn in the center of the sequence. Show you proposed sequence using the one-letter code of amino acids, and explain the special features of your design .(设计一个多肽序列:包含25个氨基酸的发卡α-螺旋结构、两个反平行的α-螺旋和位于序列中间的β-转角结构。用氨基酸代码的形式写出你的序列,解释你设计的具体思路。)

【肽链的设计合成】

基本合成步骤:

1 、去保护: Fmoc 保护的柱子和单体必须用一种碱性溶剂( piperidine )去除氨基的保护基团。(如图 1 )

2 、激活和交联:下一个氨基酸的羧基被一种激活剂所激活溶解,激活的单体与游离的氨基在交联剂的作用下交联,形成肽键。

3 、循环:这两步反应反复循环直到整条肽链合成完毕。

4 、洗脱和脱保护:根据肽链所含的残基不同,用不同的脱树脂溶剂从柱上洗脱下来,其保护基团被一种脱保护剂( TFA )洗脱和脱保护。

简介

多肽是复杂的大分子 , 因此每条序列在物理和化学特性上都是独特的,有些多肽合成很困难 , 另有些多肽虽然合成相对容易 , 但纯化困难;最常见的问题是许多肽不溶于水溶液 , 因此在纯化中 , 这些疏水肽必须溶于非水溶剂中或特殊的缓冲液 , 而这些溶剂或缓冲液很可能不适合应用于生物实验系统 , 因此研究人员不能使用该多肽达到自己的目的 , 因此下面是对于研究人员设计多肽的一些建议。

如何降低肽链合成的难度?

1. 减少序列长度

由于肽的长度增加会导致粗产物纯度降低 , 小于 15 个残基的肽比较容易得到较高纯度的初产物,当肽链长度增加到 20 个残基以上时 , 正确产物的量就是一个主要考虑的问题。在许多实验中 , 降低残基数低于 20 往往能得到更好的实验结果。

2. 减少疏水性残基数

疏水性残基占明显优势的肽,尤其在距 C 端 7-12 个残基的区域,常常引起合成困难。这通常被认为是由于合成中形成 b 折叠片,这样会产生不完全配对。用 1 个或几个极性残基置换或加入 Gly 或 Pro 以打开肽结构可能会有帮助。

3. 减少“困难”残基

有多个 Cys 、 Met 、 Arg 、 Try 残基通常难于合成。 Ser 通常可作为 Cys 的非氧化替换。

如何增强肽链的可溶性?

?改变 N 端或 C 端

对于酸性肽 ( 即 pH 值为 7 时带负电荷 ), 我们推荐乙酰化 (N 端乙酰化 , C 端保持自由羧基 ), 以增加负电荷。而对于碱性肽 ( 即 pH 值为 7 时带正电荷 ), 我们推荐氨基化 (N 端自由氨基 , C 端氨基化 ), 以增加正电荷。

?缩短或加长序列

某些序列含有大量疏水氨基酸 , 如 Trp 、 Phe 、 Val 、 Ile 、 Leu 、 Met 、 Tyr 和 Ala 等 , 当这些疏水残基大于 50% 通常难于溶解。为了增加肽的极性 , 加长序列可能会有帮助。另外一种选择是通过减少疏水残基的方法降低肽链的长度以增加极性。肽链极性越高 , 就越有可能溶于水。

?加入可溶性残基

对于某些肽链而言 , 加上一些极性氨基酸能改善可溶性。我们推荐给酸性肽的 N 端或 C 端加上

Glu-Glu 。给碱性肽的 N 端或 C 端加上 Lys-Lys 。如果不能加入带电荷基团 , 可以将 Ser-Gly-Ser 加到 N 端或 C 端。但是 , 肽链的两端不能改变时 , 该方法则不可行。

?通过置换一个或多个残基改变序列

肽链的可溶性可通过改变序列内某些残基来改善。通常单个残基的替换就能显著改善其疏水性 , 而这种改变通常是较为保守的 , 如用 Gly 代替 Ala 。

?通过选用不同“ 框架” 来改变序列

如果能用某个序列来制备许多长度一定的相互串连或重叠的多肽 , 则可以用改变各个多肽起始点的方法来实现改变序列的目的。其原理是 : 在同一多肽的亲水和疏水残基间创造新的更好的平衡 , 或将同一多肽内的“ 困难” 残基 ( 比如 2 个 Cys) 放进两个不同的多肽而不是集于同一分子内。

特殊氨基酸残基对肽链特性影响的一些要点

对于由遗传密码编码的二十种氨基酸及蛋白质中常见的其他氨基酸 , 按其特性可以用几种方法进行分类。下面列出了最常见的氨基酸的三字母代码和单字母代码,以及不同的分类方法。

氨基酸的代码

蛋白质中常见的其他氨基酸

肽链设计中常见的其它氨基酸

α- 氨基丁酸 (Cys 的置换物 )

β- 氨基丙氨酸 (Ala 的直链异构物 )

正亮氨酸 ( 亮氨酸的线性侧链异构物 )

氨基酸按其亲水性、疏水性分类

亲水性氨基酸 : D, E, H, K, Q, R, S, T, 羟脯氨酸 , 焦谷氨酸

疏水性氨基酸 : A, F, I, L, M, P, V, W, Y, α- 氨基丁酸 , β- 氨基丙氨酸 , 正亮氨酸

C 和 G 属于未定类

其它的分类方法

在温和条件下氧化的氨基酸 -->C, M

脱氨或脱羧基的氨基酸 -->N, Q

蛋白制备中易降解的氨基酸 -->M, W

带正电荷的氨基酸 -->K, R, H

带负电荷的氨基酸 -->D, E

当下列疏水氨基酸 , 即 Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Phe, Trp 存在于 C 端时 , 通常引起合成及纯化的困难 , 这主要是因为它们难溶于水。如果您看见这些氨基酸 , 即 Cys 、 His 、 Pro 普遍存在于序列中或在 C 端时 , 则在常规的固相合成中需要特殊的固相支持物。在用普通的固相支持物时 , 在二肽阶段 , 由于环化引起的损失非常高。在许多例子中 , 甚至导致所有链从固相支持物上损失 , 但是若 C 端为氨基化 Pro 时 , 或者用特殊的 PEG- 聚苯乙烯固相支持物时 , 能使产量大为提高 , 则不会发生这种现象。

6. 上课时学习的四种蛋白质折叠的理论模型。

▲框架模型(FRAMEWORK MODEL)

P. S. Kim 和R. L. Baldwin 于1982 年提出了蛋白质折叠的框架模型,该模型认为在蛋白质折叠的过程中大约有15个氨基酸残基的多肽链首先折叠为瞬态的a螺旋或b片层结构的二级结构单元,然后这种瞬态的结构通过扩散彼此接近形成aa、ab 或bb的复合结构而获得稳定。这种复合结构又称为折叠单元。折叠单元作为一个核心吸引和稳定其它摆动着的二级结构单元,形成折叠框架,其它的侧链将适应这个框架。

框架模型假设蛋白质的局部构象依赖于局部的氨基酸序列。在多肽链折叠过程的起始阶段, 先迅速形成不稳定的二级结构单元;称为“FLICKERING CLUSTER”, 随后这些二级结构靠近接触, 从而形成稳定的二级结构框架;最后,二级结构框架相互拼接,肽链逐渐紧缩,形成了蛋白质的三级结构。这个模型认为即使是一个小分子的蛋白也可以一部分一部分的进行折叠, 其间形成的亚结构域是折叠中间体的重要结构。

▲疏水塌缩模型(HYDROPHOBIC COLLAPSE MODEL)

在疏水塌缩模型中,疏水作用力被认为是在蛋白质折叠过程中起决定性作用的力的因素。在形成任何二级结构和三级结构之前首先发生很快的非特异性的疏水塌缩。

▲扩散-碰撞-粘合机制(DIFFUSION-COLLISION-ADHESION MODEL)

该模型认为蛋白质的折叠起始于伸展肽链上的几个位点,在这些位点上生成不稳定的二级结构单元或者疏水簇,主要依靠局部序列的进程或中程(3-4个残基)相互作用来维系。它们以非特异性布朗运动的方式扩散、碰撞、相互黏附,导致大的结构生成并因此而增加了稳定性。进一步的碰撞形成具有疏水核心和二级结构的类熔球态中间体的球状结构。球形中间体调整为致密的、无活性的类似天然结构的高度有序熔球态结构。最后无活性的高度有序熔球态转变为完整的有活力的天然态。

▲成核-凝聚-生长模型(NUCLEAR-CONDENSATION-GROWTH MODEL)

根据这种模型,肽链中的某一区域可以形成“折叠晶核”,以它们为核心,整个肽链继续折叠进而获得天然构象。所谓“晶核”实际上是由一些特殊的氨基酸残基形成的类似于天然态相互作用的网络结构,这些残基间不是以非特异的疏水作用维系的,而是由特异的相互作用使这些残基形成了紧密堆积。晶核的形成是折叠起始阶段限速步骤。

▲拼版模型(JIG-SAW PUZZLE MODEL)

此模型的中心思想就是多肽链可以沿多条不同的途径进行折叠, 在沿每条途径折叠的过程中都是天然结构越来越多, 最终都能形成天然构象, 而且沿每条途径的折叠速度都较快, 与单一途径折叠方式相比, 多肽链速度较快, 另一方面, 外界生理生化环境的微小变化或突变等因素可能会给单一折叠途径造成较大的影响,而对具有多条途径的折叠方式而言, 这些变化可能给某条折叠途径带来影响, 但不会影响另外的折叠途径, 因而不会从总体上干扰多肽链的折叠, 除非这些因素造成的变化太大以致于从根本上影响多肽链的折叠。

【NMR用于研究蛋白质的一个主要优点在于它能极为详细的研究蛋白质分子的动力学,即动态的结构或结构的运动与蛋白质分子功能的关系。目前的NMR技术已经能够在秒到皮秒的时间域上观察蛋白质结构的运动过程,其中包括主链和侧链的运动,以及在各种不同的温度和压力下蛋白质的折叠和去折叠过程。蛋白质大分子的结构分析也不仅仅只是解出某个具体的结构,而是更加关注结构的涨落和运动。例如,运输小分子的酶和蛋白质通常存在着两种构象,结合配体的和未结合配体的。一种构象内的结构涨落是构象转变所必需的前奏,因此需要把光谱学,波谱学和X 射线结构分析结合起来研究结构涨落的平衡,构象改变和改变过程中形成的多种中间态,又如,为了了解蛋白质是如何折叠的,就必须知道折叠时几个基本过程的时间尺度和机制,包括二级结构(螺旋和折叠)的形成,卷曲,长程相互作用以及未折叠肽段的全面崩溃。多种技术用于研究次过程,如快速核磁共振,快速光谱技术(荧光,远紫外和近紫外圆二色)。

在生物体内,生物信息的流动可以分为两个部分:第一部分是存储于DNA序列中的遗传信息通过转录和翻译传入蛋白质的一级序列中,这是一维信息之间的传递,三联子密码介导了这一传递过程;第二部分是肽链经过疏水塌缩、空间盘曲、侧链聚集等折叠过程形成蛋白质的天然构象,同时获得生物活性,从而将生命信息表达出来;而蛋白质作为生命信息的表达载体,它折叠所形成的特定空间结构是其具有生物学功能的基础,也就是说,这个一维信息向三维信息的转化过程是表现生命活力所必需的(蛋白质的氨基酸序列究竟是如何确定其空间构象的呢?)。

蛋白质折叠的研究热点有两个方面:

一是蛋白质模型的研究。这方面集中在简单的格点模型,主要内容有3个方面:1、水分子影响;2、侧链的影响;3、拓扑结构研究。

二是蛋白质折叠机理的研究,主要内容有:1、热力学性质分析;2、动力学过程的研究;3、折叠初期研究。】7. 分子伴侣的定义?一个蛋白质称为分子伴侣的要求。

答:【折叠酶(蛋白质二硫键异构酶/脯氨酰顺反异构酶)】

定义:

分子伴侣是一类在序列上没有相关性但具有相同功能的蛋白质,它们能够结合并稳定另外一种蛋白质的不稳定构象,通过有效控制其结合和释放,来促进新生多肽正确折叠、多聚体的装配或降解及细胞器蛋白的跨膜运输等。

要求:

(1)在细胞内能够参与帮助并催化介导其它多肽链或寡聚体蛋白质分子进行折叠和装配;

(2)组装完之后,与折叠蛋白分离,不参与构成这些蛋白质的结构和功能组份;

(3)

(4)

8. L型氨基酸和D型氨基酸转化。

答:【D型-氨基酸氧化酶可催化D-氨基酸生成相应的α-酮酸,在哺乳动物体内主要分布于肾脏,因此推测D

型-氨基酸手性转化通路为:首先,D型-氨基酸在D型-氨基酸氧化酶作用下生成相应的α-酮酸,随后α-酮酸在特定的转氨酶作用下生成L型-氨基酸。(由于生命体内只合成L型-氨基酸,所以α-酮酸在转氨酶作用下只能生成L-型氨基酸。】N-乙酰-氨基酰化酶

9.α螺旋的结构特征

蛋白质中常见的二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基(第n个)的羰基与多肽链C端方向的第4个残基(第4+n个)的酰胺氮形成氢键。在古典的右手α-螺旋结构中,螺距为0.54nm,每一圈含有3.6个氨基酸残基,每个残基沿着螺旋的长轴上升

0.15nm。

①肽链骨架围绕一个轴以螺旋的方式伸展;

②螺旋形成是自发的,肽链骨架上由n位氨基酸残基上的-C=O与n+4位残基上的-NH之间形成的氢键起着稳

定的作用;被氢键封闭的环含有13个原子,因此α螺旋也称为3.6/13螺旋;

③每隔3.6个残基,螺旋上升一圈;每一个氨基酸残基环绕螺旋轴100°,螺距为0.54nm,即每个氨基酸残

基沿轴上升0.15nm;螺旋的半径是0.23nm;Φ角和Ψ角分别为-57°和-48°;

④α螺旋有左手和右手之分,但蛋白质中的α螺旋主要是右手螺旋;

⑤氨基酸残基的R基团位于螺旋的外侧,并不参与螺旋的形成,但其大小、形状和带电状态却能影响螺旋的

形成和稳定。

* 影响α-螺旋稳定的因素:

酸性或碱性氨基酸集中的区域,由于同电荷相斥,不利于α-螺旋形成;较大的R(如苯丙氨酸、色氨酸、异亮氨酸)集中的区域,也妨碍α-螺旋形成;脯氨酸因其α-碳原子位于五元环上,不易扭转,加之它是亚氨基酸,不易形成氢键,故不易形成上述α-螺旋;甘氨酸的R基为H,空间占位很小,也会影响该处螺旋的稳定。

10.蛋白质分子构象的立体化学原则

Linus Pauling和Robert Corey于20世纪40年代末至50年代初,应用X-射线衍射法(X-ray diffraction)技术对α-角蛋白等研究结果,提出了蛋白质分子构象的立体化学原则,要点如下:

(1)肽链空间构象的基本结构单位为肽平面或肽单位。

所谓的肽平面是指肽链中从一个Cα原子到另一个Cα原子之间的结构,共包含6个原子(Cα、C、O、

N、H、Cα),它们在空间共处于同一个平面。如下图所示:

(3)肽键C-N键长为0.132nm,比一般的C-N单键(0.147nm)短,比C=N双键(0.128nm)要长,具有部分双键

的性质(partial double-bond character),不能旋转。而Cα-COOH、C-NH2,为真正单键(pure single bond),可以旋转。

(4)相邻肽平面构成二面角:

一个Cα原子相连的两个肽平面,由于N1-Cα和Cα-C2(羧基碳)两个键为单键,肽平面可以分别围绕这两个键旋转,从而构成不同的构象。一个肽平面围绕N1-Cα(氮原子与α-碳原子)旋转的角度,用Φ表示。另一个肽平面围绕Cα-C2(α-碳原子与羧基碳)旋转的角度,用Ψ表示。这两个旋转角度叫二面角(dihedral angle)。通常二面角(Φ,Ψ)确定后,一个多肽链的二级结构就确定了。

11.β-片层结构特征

Astbury等人曾对β-角蛋白进行X线衍射分析,发现具有0.7nm的重复单位。如将毛发α-角蛋白在湿热条件下拉伸,可拉长到原长二倍,这种α-螺旋的X线衍射图可改变为与β-角蛋白类似的衍射图。说明β-角蛋白中的结构和α-螺旋拉长伸展后结构相同。两段以上的这种折叠成锯齿状的肽链,通过氢键相连而平行成片层状的结构称为β-片层(β-pleated sheet)结构或称β-折叠。

①是肽链相当伸展的结构,肽链平面之间折叠成锯齿状,相邻肽键平面间呈110°角。氨基酸残基的R侧链

伸出在锯齿的上方或下方。

②依靠两条肽链或一条肽链内的两段肽链间的C=O与H梄形成氢键,使构象稳定。

③两段肽链可以是平行的,也可以是反平行的。即前者两条链从“N端”到“C端”是同方向的,后者是反

方向的。Β-片层结构的形式十分多样,正、反平行能相互交替。

④平行的β-片层结构中,两个残基的间距为0.65nm;反平行的β-片层结构,则间距为0.7nm。

12.稳定蛋白质三维结构的作用力

(1)氢键

多数蛋白质采取的折叠策略是使主链肽基之间形成最大数目的分子内氢键(如α-螺旋、β-折叠),同时保持大部分能成氢键的侧链处于蛋白质分子表面,与水相互作用。

(2)范德华力

包括三种弱的作用力:定向效应、导效应、分散效应

(3)疏水作用

(4)盐键(离子键)

(5)二硫键

二硫键形成之前,蛋白质分子已形成三级结构,二硫键不指导多肽链的折叠,三级结构形成后,二硫键可稳定此构象。主要存在于体外蛋白中,在细胞内,由于有高浓度的还原性物质,所以没有二硫键。(6)酯键

(7)配位键

13.GFP

GFP吸收的光谱,最大峰值为395nm(紫外),并有一个峰值为470nm的副峰(蓝光);发射光谱最大峰值为

509nm(绿光),并带有峰值为540nm的侧峰(Shouder).

GFP荧光极其稳定,在激发光照射下,GFP抗光漂白(Photobleaching)能力比荧光素(fluorescein)强,特别在450~490nm蓝光波长下更稳定.

GFP需要在氧化状态下产生荧光,强还原剂能使GFP转变为非荧光形式,但一旦重新暴露在空气或氧气中,GFP 荧光便立即得到恢复.而一些弱还原剂并不影响GFP荧光.中度氧化剂对GFP荧光影响也不大,如生物材料的固定,脱水剂戊二酸或甲醛等. GFP融合蛋白的荧光灵敏度远比荧光素标记的荧光抗体高,抗光漂白能力强,因此更适用于定量测定与分析.

GFP是由两个相当规则的内含一个α-螺旋和外面包围l1个β-折叠的β-桶状结构组成的二聚体,β-桶状结构直径约3nm,高约4nm。β折叠彼此紧密结合,象桶板一样形成桶状结构的外围,并且形成了一个规则的氢

键带。桶状结构和位于其末端的短α螺旋以及环状结构一起组成一个单独的致密结构域,没有可供扩散的配体进入缝隙。这种坚实的结构保证了其稳定和抗热、抗变性的特点。

GFP的生色基团附着于α-螺旋上,几乎完美的包被于桶状结构中心。位于圆桶中央的α-螺旋含有一个由六肽组成的发光中心,而发光团是由其中的三肽Ser65-Tyr66-Gly67经过环化形成了对羟基苯咪唑啉酮。GFP的生色基团是蛋白质自身催化环化的结果,环化是一个有氧过程,在严格厌氧条件下GFP不能形成荧光,因为GFP 的生色团形成需要O2使Tyr66脱氢氧化。生色基团通过Tyr66的脱质子(酚盐)和质子化状态(羟酚基)的转换决定荧光发射,此模型为Yang等的晶体学证据所支持。

生物化学题库及答案大全

《生物化学》题库 习题一参考答案 一、填空题 1蛋白质中的苯丙氨酸、酪氨酸和__色氨酸__3种氨基酸具有紫外吸收特性,因而使蛋白质在 280nm处有最大吸收值。 2蛋白质的二级结构最基本的有两种类型,它们是_α-螺旋结构__和___β-折叠结构__。前者的螺距为 0.54nm,每圈螺旋含_3.6__个氨基酸残基,每个氨基酸残基沿轴上升高度为__0.15nm____。天然 蛋白质中的该结构大都属于右手螺旋。 3氨基酸与茚三酮发生氧化脱羧脱氨反应生成__蓝紫色____色化合物,而脯氨酸与茚三酮反应 生成黄色化合物。 4当氨基酸溶液的pH=pI时,氨基酸以两性离子离子形式存在,当pH>pI时,氨基酸以负 离子形式存在。 5维持DNA双螺旋结构的因素有:碱基堆积力;氢键;离子键 6酶的活性中心包括结合部位和催化部位两个功能部位,其中前者直接与底物结合,决定酶的 专一性,后者是发生化学变化的部位,决定催化反应的性质。 72个H+或e经过细胞内的NADH和FADH2呼吸链时,各产生3个和2个ATP。 81分子葡萄糖转化为2分子乳酸净生成______2________分子ATP。 糖酵解过程中有3个不可逆的酶促反应,这些酶是己糖激酶;果糖磷酸激酶;丙酮酸激酶9。 10大肠杆菌RNA聚合酶全酶由σββα'2组成;核心酶的组成是'2ββα。参

与识别起始信号的是σ因子。 11按溶解性将维生素分为水溶性和脂溶性性维生素,其中前者主要包括V B1、V B2、V B6、 V B12、V C,后者主要包括V A、V D、V E、V K(每种类型至少写出三种维生素。) 12蛋白质的生物合成是以mRNA作为模板,tRNA作为运输氨基酸的工具,蛋白质合 成的场所是 核糖体。 13细胞内参与合成嘧啶碱基的氨基酸有:天冬氨酸和谷氨酰胺。 14、原核生物蛋白质合成的延伸阶段,氨基酸是以氨酰tRNA合成酶?GTP?EF-Tu三元复合体的形式进 位的。 15、脂肪酸的β-氧化包括氧化;水化;再氧化和硫解4步化学反应。 二、选择题 1、(E)反密码子GUA,所识别的密码子是: A.CAU B.UG C C.CGU D.UAC E.都不对 2、(C)下列哪一项不是蛋白质的性质之一? A.处于等电状态时溶解度最小 B.加入少量中性盐溶解度增加 C.变性蛋白质的溶解度增加 D.有紫外吸收特性 3.(B)竞争性抑制剂作用特点是:

2009复旦大学生物化学试题

2009年复旦大学生命科学学院研究生招生试题 一、是非题(对○,错╳;每题1分,共30分) 1.一级氨基酸就是必须氨基酸。(错) 2.热激蛋白(Heat shock protein)只存在于真核生物中。(错) 3.某些微生物能用D型氨基酸合成肽类抗生素。(对)4.SDS能与氨基酸结合但不能与核苷酸结合。(对)5.Sanger的最大贡献是发明了独特的蛋白质N末端标记法。(错,还有测序)6.有机溶剂的电介常数比水小使得静电作用增强而导致蛋白质变性。(对) 7. RNaseP中的RNA组分比蛋白质在分子量和空间上都要大得多。(对) 8.有些生物的结构基因的起始密码子是GTG。(对) 少数细菌(属于原核生物)以GUG(缬氨酸)或UUG为起始密码。 最近研究发现线粒体和叶绿体使用的遗传密码稍有差异,比如线粒体和叶绿体以AUG、AUU、AUA 为起始密码子。 9. Pauling提出了肽键理论。(错,H.E.fischer)10.有证据表明大肠杆菌拥有第21个一级氨基酸的tRNA。(对) 11. 4-羟基脯氨酸是在胶原蛋白被合成后脯氨酸上发生的修饰。(对) 12.米氏方程最早是根据实验数据推导的经验公式。(对) 13.酶反应动力学的特征常数Km是指室温下的测定值。(错) 14.人体皮肤上的黑色素是通过氨基酸合成而来。(对,生物蝶呤和酪氨酸) 15.疏水氨基酸残基也会分布在球蛋白的表面。(对) 16. 红血球上存在大量糖蛋白,是为了防止相互碰撞发生融合。(对,负电性) 17. Edman降解是一种内切蛋白质的化学反应。(错,N端外切)18.P450是肝脏中负责解毒的一群酶,其活性的抑制会导致药物反应。(对) 19.α-amanitin只能抑制真核生物蛋白质的合成。(对)20.SDS是蛋白酶K的激活剂。(错) 21.离子通道蛋白通常以数个α螺旋成束状镶嵌在细胞膜中。(对)22.DTT让T aq DNA聚合酶保持活性是通过将所有二硫键打开来达到的。(错) 23. 脂肪酸生物合成的限速步骤是脂肪酸合成酶复合物催化的反应。(错,生物素羧化酶) 24. 胰岛素是抑制脂肪酶活化(抗脂解)的激素。(对) 25. 核苷酸补救途径的特征是所有核苷酸都可以用现成的碱基合成核苷酸。(错,C) 26. 人脑中的γ-氨基丁酸是由谷氨酸代谢产生的。(对) 27. 激素必须与靶细胞的受体结合才能发挥其生物化学作用。(对) 28. 人类有可能继续发现更多的维生素和具有新作用的现有维生素。(对)

生物化学试题及参考答案

121.胆固醇在体内的主要代谢去路是(C) A.转变成胆固醇酯 B.转变为维生素D3 C.合成胆汁酸 D.合成类固醇激素 E.转变为二氢胆固醇 125.肝细胞内脂肪合成后的主要去向是(C) A. C. E. A.胆A.激酶 136.高密度脂蛋白的主要功能是(D) A.转运外源性脂肪 B.转运内源性脂肪 C.转运胆固醇 D.逆转胆固醇 E.转运游离脂肪酸 138.家族性高胆固醇血症纯合子的原发性代谢障碍是(C)

A.缺乏载脂蛋白B B.由VLDL生成LDL增加 C.细胞膜LDL受体功能缺陷 D.肝脏HMG-CoA还原酶活性增加 E.脂酰胆固醇脂酰转移酶(ACAT)活性降低 139.下列哪种磷脂含有胆碱(B) A.脑磷脂 B.卵磷脂 C.心磷脂 D.磷脂酸 E.脑苷脂 )A. D. A. E. A. 谢 A. 216.直接参与胆固醇合成的物质是(ACE) A.乙酰CoA B.丙二酰CoA C.ATP D.NADH E.NADPH 217.胆固醇在体内可以转变为(BDE) A.维生素D2 B.睾酮 C.胆红素 D.醛固酮 E.鹅胆酸220.合成甘油磷脂共同需要的原料(ABE)

A.甘油 B.脂肪酸 C.胆碱 D.乙醇胺 E.磷酸盐 222.脂蛋白的结构是(ABCDE) A.脂蛋白呈球状颗粒 B.脂蛋白具有亲水表面和疏水核心 C.载脂蛋白位于表面 D.CM、VLDL主要以甘油三酯为核心 E.LDL、HDL主要的胆固醇酯为核心 过淋巴系统进入血液循环。 230、写出胆固醇合成的基本原料及关键酶?胆固醇在体内可的转变成哪些物质?

答:胆固醇合成的基本原料是乙酰CoA、NADPH和ATP等,限速酶是HMG-CoA还原酶,胆固醇在体内可以转变为胆汁酸、类固醇激素和维生素D3。231、简述血脂的来源和去路? 答:来源:食物脂类的消化吸收;体内自身合成的 2、 (β-[及 胰岛素抑制HSL活性及肉碱脂酰转移酶工的活性,增加乙酰CoA羧化酶的活性,故能促进脂肪合成,抑制脂肪分解及脂肪酸的氧化。 29、乙酰CoA可进入以下代谢途径: 答:①进入三羧酸循环氧化分解为和O,产生大量

生物化学试题带答案

一、选择题 1、蛋白质一级结构的主要化学键就是( E ) A、氢键 B、疏水键 C、盐键 D、二硫键 E、肽键 2、蛋白质变性后可出现下列哪种变化( D ) A、一级结构发生改变 B、构型发生改变 C、分子量变小 D、构象发生改变 E、溶解度变大 3、下列没有高能键的化合物就是( B ) A、磷酸肌酸 B、谷氨酰胺 C、ADP D、1,3一二磷酸甘油酸 E、磷酸烯醇式丙酮酸 4、嘌呤核苷酸从头合成中,首先合成的就是( A ) A、IMP B、AMP C、GMP D、XMP E、ATP 6、体内氨基酸脱氨基最主要的方式就是( B ) A、氧化脱氨基作用 B、联合脱氨基作用 C、转氨基作用 D、非氧化脱氨基作用 E、脱水脱氨基作用 7、关于三羧酸循环,下列的叙述哪条不正确( D ) A、产生NADH与FADH2 B、有GTP生成 C、氧化乙酰COA D、提供草酰乙酸净合成 E、在无氧条件下不能运转 8、胆固醇生物合成的限速酶就是( C ) A、HMG COA合成酶 B、HMG COA裂解酶 C、HMG COA还原酶 D、乙酰乙酰COA脱氢酶 E、硫激酶 9、下列何种酶就是酵解过程中的限速酶( D ) A、醛缩酶 B、烯醇化酶 C、乳酸脱氢酶 D、磷酸果糖激酶 E、3一磷酸甘油脱氢酶

10、DNA二级结构模型就是( B ) A、α一螺旋 B、走向相反的右手双螺旋 C、三股螺旋 D、走向相反的左手双螺旋 E、走向相同的右手双螺旋 11、下列维生素中参与转氨基作用的就是( D ) A、硫胺素 B、尼克酸 C、核黄素 D、磷酸吡哆醛 E、泛酸 12、人体嘌呤分解代谢的终产物就是( B ) A、尿素 B、尿酸 C、氨 D、β—丙氨酸 E、β—氨基异丁酸 13、蛋白质生物合成的起始信号就是( D ) A、UAG B、UAA C、UGA D、AUG E、AGU 14、非蛋白氮中含量最多的物质就是( D ) A、氨基酸 B、尿酸 C、肌酸 D、尿素 E、胆红素 15、脱氧核糖核苷酸生成的方式就是( B ) A、在一磷酸核苷水平上还原 B、在二磷酸核苷水平上还原 C、在三磷酸核苷水平上还原 D、在核苷水平上还原 16、妨碍胆道钙吸收的物质就是( E ) A、乳酸 B、氨基酸 C、抗坏血酸 D、柠檬酸 E、草酸盐 17、下列哪种途径在线粒体中进行( E ) A、糖的无氧酵介 B、糖元的分解 C、糖元的合成 D、糖的磷酸戊糖途径 E、三羧酸循环 18、关于DNA复制,下列哪项就是错误的( D ) A、真核细胞DNA有多个复制起始点 B、为半保留复制 C、亲代DNA双链都可作为模板 D、子代DNA的合成都就是连续进行的

生物化学题库及答案.

生物化学试题库 蛋白质化学 一、填空题 1.构成蛋白质的氨基酸有种,一般可根据氨基酸侧链(R)的大小分为侧链氨基酸和侧链氨基酸两大类。其中前一类氨基酸侧链基团的共同特怔是具有性;而后一类氨基酸侧链(或基团)共有的特征是具有性。碱性氨基酸(pH6~7时荷正电)有两种,它们分别是氨基酸和氨基酸;酸性氨基酸也有两种,分别是氨基酸和氨基酸。 2.紫外吸收法(280nm)定量测定蛋白质时其主要依据是因为大多数可溶性蛋白质分子中含有氨基酸、氨基酸或氨基酸。 3.丝氨酸侧链特征基团是;半胱氨酸的侧链基团是 。这三种氨基酸三字母代表符号分别是 4.氨基酸与水合印三酮反应的基团是,除脯氨酸以外反应产物的颜色是;因为脯氨酸是α—亚氨基酸,它与水合印三酮的反应则显示色。 5.蛋白质结构中主键称为键,次级键有、、 、、;次级键中属于共价键的是键。 6.镰刀状贫血症是最早认识的一种分子病,患者的血红蛋白分子β亚基的第六位 氨酸被氨酸所替代,前一种氨基酸为性侧链氨基酸,后者为性侧链氨基酸,这种微小的差异导致红血蛋白分子在氧分压较低时易于聚集,氧合能力下降,而易引起溶血性贫血。 7.Edman反应的主要试剂是;在寡肽或多肽序列测定中,Edman反应的主要特点是。 8.蛋白质二级结构的基本类型有、、 和。其中维持前三种二级结构稳定键的次级键为 键。此外多肽链中决定这些结构的形成与存在的根本性因与、、 有关。而当我肽链中出现脯氨酸残基的时候,多肽链的α-螺旋往往会。 9.蛋白质水溶液是一种比较稳定的亲水胶体,其稳定性主要因素有两个,分别是 和。 10.蛋白质处于等电点时,所具有的主要特征是、。 11.在适当浓度的β-巯基乙醇和8M脲溶液中,RNase(牛)丧失原有活性。这主要是因为RNA酶的被破坏造成的。其中β-巯基乙醇可使RNA酶分子中的键破坏。而8M脲可使键破坏。当用透析方法去除β-巯基乙醇和脲的情况下,RNA酶又恢复原有催化功能,这种现象称为。 12.细胞色素C,血红蛋白的等电点分别为10和7.1,在pH8.5的溶液中它们分别荷的电性是、。 13.在生理pH条件下,蛋白质分子中氨酸和氨酸残基的侧链几乎完全带负电,而氨酸、氨酸或氨酸残基侧链完全荷正电(假设该蛋白质含有这些氨基酸组分)。 14.包含两个相邻肽键的主肽链原子可表示为,单个肽平面及包含的原子可表示为。 15.当氨基酸溶液的pH=pI时,氨基酸(主要)以离子形式存在;当pH>pI时,氨基酸

大学生物化学习题-答案

生物化学习题 蛋白质 —、填空题 1. 氨基酸的等电点(pl)是指—水溶液中,氨基酸分子净电荷为0时的溶液PH值。 2. 氨基酸在等电点时,主要以_兼性一离子形式存在,在pH>pI的溶液中,大部分以负/阴离子形式存在,在pH

生物化学试题库(试题库+答案)

生物化学试题库及其答案——糖类化学 一、填空题 1.纤维素是由________________组成,它们之间通过________________糖苷键相连。 2.常用定量测定还原糖的试剂为________________试剂和 ________________试剂。 3.人血液中含量最丰富的糖是________________,肝脏中含量最丰富的糖是 ________________,肌肉中含量最丰富的糖是________________。 4.乳糖是由一分子________________和一分子________________组成,它们之间通过________________糖苷键相连。 5.鉴别糖的普通方法为________________试验。 6.蛋白聚糖是由________________和________________共价结合形成的复合物。 7.糖苷是指糖的________________和醇、酚等化合物失水而形成的缩醛(或缩酮)等形式的化合物。 8.判断一个糖的D-型和L-型是以________________碳原子上羟基的位置作依据。 9.多糖的构象大致可分为________________、________________、 ________________和________________四种类型,决定其构象的主要因素是 ________________。 二、是非题 1.[ ]果糖是左旋的,因此它属于L-构型。 2.[ ]从热力学上讲,葡萄糖的船式构象比椅式构象更稳 定。 3.[ ]糖原、淀粉和纤维素分子中都有一个还原端,所以它们都有还原性。 4.[ ]同一种单糖的α-型和β-型是对映体。 5.[ ]糖的变旋现象是指糖溶液放置后,旋光方向从右旋变成左旋或从左旋变成右旋。 6.[ ]D-葡萄糖的对映体为L-葡萄糖,后者存在于自然界。 7.[ ]D-葡萄糖,D-甘露糖和D-果糖生成同一种糖脎。 8.[ ]糖链的合成无模板,糖基的顺序由基因编码的转移酶决定。 9.[ ]醛式葡萄糖变成环状后无还原性。 10.[ ]肽聚糖分子中不仅有L-型氨基酸,而且还有D-型氨基酸。 三、选择题

生物化学题库及答案1

生物膜 五、问答题 1.正常生物膜中,脂质分子以什么的结构和状态存在? 答:.脂质分子以脂双层结构存在,其状态为液晶态。 2.流动镶嵌模型的要点是什么? 答:.蛋白质和脂质分子都有流动性,膜具有二侧不对称性,蛋白质附在膜表面或嵌入膜内部 3.外周蛋白和嵌入蛋白在提取性质上有那些不同?现代生物膜的结构要点是什么? 4.什么是生物膜的相变?生物膜可以几种状态存在? 5.什么是液晶相?它有何特点? 6.影响生物膜相变的因素有那些?他们是如何对生物膜的相变影响的? 7.物质的跨膜运输有那些主要类型?各种类型的要点是什么? 1.脂质分子以脂双层结构存在,其状态为液晶态。 2.蛋白质和脂质分子都有流动性,膜具有二侧不对称性,蛋白质附在膜表面或嵌入膜内部 3.由于外周蛋白与膜以极性键结合,所以可以有普通的方法予以提取;由于嵌入蛋白与膜通过非极性键结合,所以只能用特殊的方法予以提取。 现代生物膜结构要点:脂双层是生物膜的骨架;蛋白质以外周蛋白和嵌入蛋白两种方式与膜结合;膜脂和膜蛋白在结构和功能上都具有二侧不对称性;膜具有一定的流动性;膜组分之间有相互作用。 4.生物膜从一种状态变为另一种状态的变化过程为生物膜的相变,一般指液晶相与晶胶相之间的变化。生物膜可以三种状态存在,即:晶胶相、液晶相和液相。 5.生物膜既有液态的流动性,又有晶体的有序性的状态称为液晶相。其特点为:头部有序,尾部无序,短程有序,长程无序,有序的流动,流动的有序。 6.影响生物膜相变的因素及其作用为:A、脂肪酸链的长度,其长度越长,膜的相变温度越高;B、脂肪酸链的不饱和度,其不饱和度越高,膜的相变温度越低;C、固醇类,他们可使液晶相存在温度范围变宽;D、蛋白质,其影响与固醇类相似。 7.有两种运输类型,即主动运输和被动运输,被动运输又分为简单扩散和帮助扩散两种。简单扩散运输方 向为从高浓度向低浓度,不需载体和能量;帮助扩散运输方向同上,需要载体,但不需能量;主动运输运 输方向为从低浓度向高浓度,需要载体和能量。 生物氧化与氧化磷酸化 一、选择题 1.生物氧化的底物是: A、无机离子 B、蛋白质 C、核酸 D、小分子有机物 2.除了哪一种化合物外,下列化合物都含有高能键? A、磷酸烯醇式丙酮酸 B、磷酸肌酸 C、ADP D、G-6-P E、1,3-二磷酸甘油酸 3.下列哪一种氧化还原体系的氧化还原电位最大? A、延胡羧酸→丙酮酸 B、CoQ(氧化型) →CoQ(还原型) C、Cyta Fe2+→Cyta Fe3+ D、Cytb Fe3+→Cytb Fe2+ E、NAD+→NADH 4.呼吸链的电子传递体中,有一组分不是蛋白质而是脂质,这就是:

生物化学与分子生物学试题库完整

“生物化学与分子生物学” 题库 第二军医大学基础医学部 生物化学与分子生物学教研室编制 2004年7月

第一篇生物大分子的结构与功能 第一章蛋白质的结构与功能 一、单项选择题(A型题) 1.蛋白质的一级结构是指下面的哪一种情况?( ) A、氨基酸种类的数量 B、分子中的各种化学键 C、氨基酸残基的排列顺序 D、多肽链的形态和大小 E、氨基酸的连接方式 2.关于蛋白质分子三级结构的描述,其中错误的是:( ) A、天然蛋白质分子均有这种结构 B、具有三级结构的多肽链都有生物学活性 C、三级结构的稳定性主要是次级键维系 D、亲水基团多聚集在三级结构的表面 E、骨架链原子的空间排布 3、学习“蛋白质结构与功能”的理论后,我们认识到错误概念是()。 A、蛋白质变性是肽键断裂所致 B、蛋白质的一级结构决定其空间结构 C、肽键的键长较单键短,但较双键长 D、四级结构蛋白质必定由二条或二条以上多肽链组成 E、蛋白质活性不仅取决于其一级结构,还依赖于高级结构的正确 4、通过“蛋白质、核酸的结构与功能”的学习,认为错误的概念是()。 A、氢键是维系多肽链β-折叠的主要化学键 B、DNA分子的二级结构是双螺旋,维系其稳定的重要因素是碱基堆积力 C、蛋白质变性后可以恢复,但DNA变性后则不能恢复 D、谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸三者组成GSH E、蛋白质亚基具有三级结构,而tRNA三级结构呈倒L形 5、“蛋白质分子结构与功能”一章学习,告之我们以下概念不对的是()。 A、氢键不仅是维系β-折叠的作用力,也是稳定β-转角结构的化学键 B、活性蛋白质均具有四级结构 C、α-螺旋的每一圈包含3.6个氨基酸残基 D、亚基独立存在时,不呈现生物学活性的 E、肽键是不可以自由旋转的 6、关于蛋白质分子中α-螺旋的下列描述,哪一项是错误的?() A、蛋白质的一种二级结构 B、呈右手螺旋

生物化学题库(含答案).

蛋白质 一、填空R (1)氨基酸的结构通式为H2N-C-COOH 。 (2)组成蛋白质分子的碱性氨基酸有赖氨酸、组氨酸、精氨酸,酸性氨基酸有天冬氨酸、谷氨酸。 (3)氨基酸的等电点pI是指氨基酸所带净电荷为零时溶液的pH值。 (4)蛋白质的常见结构有α-螺旋β-折叠β-转角和无规卷曲。 (5)SDS-PAGE纯化分离蛋白质是根据各种蛋白质分子量大小不同。 (6)氨基酸在等电点时主要以两性离子形式存在,在pH>pI时的溶液中,大部分以__阴_离子形式存在,在pH

生物化学试题及答案(1)

生物化学试题(1) 第一章蛋白质的结构与功能 [测试题] 一、名词解释:1.氨基酸 2.肽 3.肽键 4.肽键平面 5.蛋白质一级结构 6.α-螺旋 7.模序 8.次级键 9.结构域 10.亚基 11.协同效应 12.蛋白质等电点 13.蛋白质的变性 14.蛋白质的沉淀 15.电泳 16.透析 17.层析 18.沉降系数 19.双缩脲反应 20.谷胱甘肽 二、填空题 21.在各种蛋白质分子中,含量比较相近的元素是____,测得某蛋白质样品含氮量为15.2克,该样品白质含量应为____克。 22.组成蛋白质的基本单位是____,它们的结构均为____,它们之间靠____键彼此连接而形成的物质称为____。 23.由于氨基酸既含有碱性的氨基和酸性的羧基,可以在酸性溶液中带____电荷,在碱性溶液中带____电荷,因此,氨基酸是____电解质。当所带的正、负电荷相等时,氨基酸成为____离子,此时溶液的pH值称为该氨基酸的____。 24.决定蛋白质的空间构象和生物学功能的是蛋白质的____级结构,该结构是指多肽链中____的排列顺序。25.蛋白质的二级结构是蛋白质分子中某一段肽链的____构象,多肽链的折叠盘绕是以____为基础的,常见的二级结构形式包括____,____,____和____。 26.维持蛋白质二级结构的化学键是____,它们是在肽键平面上的____和____之间形成。 27.稳定蛋白质三级结构的次级键包括____,____,____和____等。 28.构成蛋白质的氨基酸有____种,除____外都有旋光性。其中碱性氨基酸有____,____,____。酸性氨基酸有____,____。 29.电泳法分离蛋白质主要根据在某一pH值条件下,蛋白质所带的净电荷____而达到分离的目的,还和蛋白质的____及____有一定关系。 30.蛋白质在pI时以____离子的形式存在,在pH>pI的溶液中,大部分以____离子形式存在,在pH

厦门大学生物化学多年真题

厦门大学 2004年攻读硕士学位研究生入学考试试题 科目名称:生物化学 一、填空题 1、纤维素分子是由()组成,它们之间通过()键相连。 2、真核生物的RNA聚合酶III转录的是()。 3、糖原合成中,葡萄糖单体的活性形式是(),蛋白质的生物合成中,氨基酸的活性形式是形成()。 4、糖肽键的主要连接键有()和()两种。 5、卵磷脂是由()、()、()和()组成。 6、snRNA主要参与()的加工成熟,真核生物tRNA的加工,成熟过程包括()、()、和()等。 7、用碱水解核酸,产物主要是()和混合物。 8、DEAE-纤维素是一种()交换剂,CM-纤维素是一种()交换剂。 9、蛋白质分子中的生色氨基酸是指()、()和()三种。 10、糖酵解和糖异生作用是相反的两个过程,各自的调空酶协调作用,防止了()是形成。 11、酶活力是指(),一般用()来表示。 12、DNA测序的解决得益于哪两种技术的应用:()和()。 13、羽田杀菌素是()的结构类似物,可以强烈地一直腺苷酸琥珀酸合成酶的活性,从而抑制了腺苷酸的合成。 14、常用3.613-螺旋(n=3)来表示蛋白质二级结构中的α-螺旋,其中的3.6指(),13表示()。 15、蛋白质的生物合成中,每增加一个氨基酸残基要消耗()个高能键。 二、选择题 1、环状结构的己醛其立体异构体的数目有几个? A、4 B、16 C、32 D、64 2、真核生物mRNA的帽子结构中,m7G与多核苷酸链通过三个磷酸基联接,联接方式是A2’-5 B3’-5’C3’-3’ D5’-5’ 3、下列哪种糖不能形成糖砂? A、葡萄糖 B、乳糖 C、蔗糖 D、麦芽糖 4、下列物质中,不是高能化合物的是: A、琥珀酰CoA B、1,3-二磷酸甘油酸 C、SAM D1,6-二磷酸果酸 5、下列化合物中哪个不属于脂类化合物? A、甘油三丁酸酯 B、胆固醇硬脂酸酯 C、羊毛蜡 D、石蜡 6、每分子血红蛋白所含铁离子数为几个? A、1 B、2 C、4 D、8 7、煤气中毒主要是因为煤气中的一氧化碳的什么作用? A、抑制琉基酶,使失活琉基酶 B、抑制胆碱酯酶,只乙酰胆碱堆积,引起神经中毒 C、抑制其它酶的作用,导致代谢紊乱

生物化学试题及答案(4)

生物化学试题及答案(4) 第四章糖代谢 【测试题】 一、名词解释 1.糖酵解(glycolysis)11.糖原累积症 2.糖的有氧氧化12.糖酵解途径 3.磷酸戊糖途径13.血糖(blood sugar) 4.糖异生(glyconoegenesis)14.高血糖(hyperglycemin) 5.糖原的合成与分解15.低血糖(hypoglycemin) 6.三羧酸循环(krebs循环)16.肾糖阈 7.巴斯德效应(Pastuer效应) 17.糖尿病 8.丙酮酸羧化支路18.低血糖休克 9.乳酸循环(coris循环)19.活性葡萄糖 10.三碳途径20.底物循环 二、填空题 21.葡萄糖在体内主要分解代谢途径有、和。 22.糖酵解反应的进行亚细胞定位是在,最终产物为。 23.糖酵解途径中仅有的脱氢反应是在酶催化下完成的,受氢体是。两个 底物水平磷酸化反应分别由酶和酶催化。 24.肝糖原酵解的关键酶分别是、和丙酮酸激酶。 25.6—磷酸果糖激酶—1最强的变构激活剂是,是由6—磷酸果糖激酶—2催化生成,该酶是一双功能酶同时具有和两种活性。 26.1分子葡萄糖经糖酵解生成分子ATP,净生成分子A TP,其主要生理意义在于。 27.由于成熟红细胞没有,完全依赖供给能量。 28.丙酮酸脱氢酶复合体含有维生素、、、和。 29.三羧酸循环是由与缩合成柠檬酸开始,每循环一次有次脱氢、 - 次脱羧和次底物水平磷酸化,共生成分子A TP。 30.在三羧酸循环中催化氧化脱羧的酶分别是和。 31.糖有氧氧化反应的进行亚细胞定位是和。1分子葡萄糖氧化成CO2和H2O净生成或分子ATP。 32.6—磷酸果糖激酶—1有两个A TP结合位点,一是ATP作为底物结合,另一是与ATP亲和能力较低,需较高浓度A TP才能与之结合。 33.人体主要通过途径,为核酸的生物合成提供。 34.糖原合成与分解的关键酶分别是和。在糖原分解代谢时肝主要受的调控,而肌肉主要受的调控。 35.因肝脏含有酶,故能使糖原分解成葡萄糖,而肌肉中缺乏此酶,故肌糖原分解增强时,生成增多。 36.糖异生主要器官是,其次是。 37.糖异生的主要原料为、和。 38.糖异生过程中的关键酶分别是、、和。 39.调节血糖最主要的激素分别是和。 40.在饥饿状态下,维持血糖浓度恒定的主要代谢途径是。 三、选择题

生物化学试题及答案 .

生物化学试题及答案 绪论 一.名词解释 1.生物化学 2.生物大分子 蛋白质 一、名词解释 1、等电点 2、等离子点 3、肽平面 4、蛋白质一级结构 5、蛋白质二级结构 6、超二级结构 7、结构域 8、蛋白质三级结构 9、蛋白质四级结构 10、亚基 11、寡聚蛋白 12、蛋白质变性 13、蛋白质沉淀 14、蛋白质盐析 15、蛋白质盐溶 16、简单蛋白质 17、结合蛋白质 18、必需氨基酸 19、同源蛋白质 二、填空题 1、某蛋白质样品中的氮含量为0.40g,那么此样品中约含蛋白 g。 2、蛋白质水解会导致产物发生消旋。 3、蛋白质的基本化学单位是,其构象的基本单位是。 4、芳香族氨基酸包括、和。 5、常见的蛋白质氨基酸按极性可分为、、和。 6、氨基酸处在pH大于其pI的溶液时,分子带净电,在电场中向极游动。 7、蛋白质的最大吸收峰波长为。 8、构成蛋白质的氨基酸除外,均含有手性α-碳原子。 9、天然蛋白质氨基酸的构型绝大多数为。 10、在近紫外区只有、、和具有吸收光的能力。 11、常用于测定蛋白质N末端的反应有、和。 12、α-氨基酸与茚三酮反应生成色化合物。 13、脯氨酸与羟脯氨酸与茚三酮反应生成色化合物。 14、坂口反应可用于检测,指示现象为出现。 15、肽键中羰基氧和酰胺氢呈式排列。 16、还原型谷胱甘肽的缩写是。 17、蛋白质的一级结构主要靠和维系;空间结构则主要依靠维系。 18、维持蛋白质的空间结构的次级键包括、、和等。 19、常见的蛋白质二级结构包括、、、和等。 20、β-折叠可分和。 21、常见的超二级结构形式有、、和等。 22、蛋白质具有其特异性的功能主要取决于自身的排列顺序。 23、蛋白质按分子轴比可分为和。 24、已知谷氨酸的pK1(α-COOH)为2.19,pK2(γ-COOH)为4.25,其pK3(α-NH3+)为9.67,其pI为。 25、溶液pH等于等电点时,蛋白质的溶解度最。 三、简答题

生物化学试题及答案

《基础生物化学》试题一 一、判断题(正确的画“√”,错的画“×”,填入答题框。每题1分,共20分) 1、DNA是遗传物质,而RNA则不是。 2、天然氨基酸都有一个不对称α-碳原子。 3、蛋白质降解的泛肽途径是一个耗能的过程,而蛋白酶对蛋白质的水解不需要ATP。 4、酶的最适温度是酶的一个特征性常数。 5、糖异生途径是由相同的一批酶催化的糖酵解途径的逆转。 6、哺乳动物无氧下不能存活,因为葡萄糖酵解不能合成ATP。 7、DNA聚合酶和RNA聚合酶的催化反应都需要引物。 8、变性后的蛋白质其分子量也发生改变。 9、tRNA的二级结构是倒L型。 10、端粒酶是一种反转录酶。 11、原核细胞新生肽链N端第一个残基为fMet,真核细胞新生肽链N端为Met。 12、DNA复制与转录的共同点在于都是以双链DNA为模板,以半保留方式进行,最后形成链状产物。 13、对于可逆反应而言,酶既可以改变正反应速度,也可以改变逆反应速度。 14、对于任一双链DNA分子来说,分子中的G和C的含量愈高,其熔点(Tm)值愈大。 15、DNA损伤重组修复可将损伤部位彻底修复。 16、蛋白质在小于等电点的pH溶液中,向阳极移动,而在大于等电点的pH溶液中将向阴极移动。 17、酮体是在肝内合成,肝外利用。 18、镰刀型红细胞贫血病是一种先天性遗传病,其病因是由于血红蛋白的代谢发生障碍。 19、基因表达的最终产物都是蛋白质。 20、脂肪酸的从头合成需要NADPH+H+作为还原反应的供氢体。 二、单项选择题(请将正确答案填在答题框内。每题1分,共30分) 1、NAD+在酶促反应中转移() A、氨基 B、氧原子 C、羧基 D、氢原子 2、参与转录的酶是()。 A、依赖DNA的RNA聚合酶 B、依赖DNA的DNA聚合酶 C、依赖RNA的DNA聚合酶 D、依赖RNA的RNA聚合酶 3、米氏常数Km是一个可以用来度量()。 A、酶和底物亲和力大小的常数 B、酶促反应速度大小的常数 C、酶被底物饱和程度的常数 D、酶的稳定性的常数 4、某双链DNA纯样品含15%的A,该样品中G的含量为()。 A、35% B、15% C、30% D、20% 5、具有生物催化剂特征的核酶(ribozyme)其化学本质是()。 A、蛋白质 B、RNA C、DNA D、酶 6、下列与能量代谢有关的途径不在线粒体内进行的是()。 A、三羧酸循环 B、氧化磷酸化 C、脂肪酸β氧化 D、糖酵解作用 7、大肠杆菌有三种DNA聚合酶,其中主要参予DNA损伤修复的是()。 A、DNA聚合酶Ⅰ B、DNA聚合酶Ⅱ C、DNA聚合酶Ⅲ D、都不可以 8、分离鉴定氨基酸的纸层析是()。 A、离子交换层析 B、亲和层析 C、分配层析 D、薄层层析 9、糖酵解中,下列()催化的反应不是限速反应。 A、丙酮酸激酶 B、磷酸果糖激酶 C、己糖激酶 D、磷酸丙糖异构酶 10、DNA复制需要:(1)DNA聚合酶Ⅲ;(2)解链蛋白;(3)DNA聚合酶Ⅰ;(4)DNA指导的RNA聚合酶;(5)DNA连接酶参加。其作用的顺序是()。

大学生物化学习题集,答案

生物化学习题 蛋白质化学 1.单项选择题 (1)在生理pH条件下,下列哪个氨基酸带正电荷? A.丙氨酸 B.酪氨酸 C.色氨酸 D.赖氨酸 E.异亮氨酸 (2)下列氨基酸中哪一种是非必需氨基酸? A.亮氨酸 B.酪氨酸 C.赖氨酸 D.蛋氨酸 E.苏氨酸 (3)下列关于蛋白质α螺旋的叙述,哪一项是错误的? A.分子内氢键使它稳定 B.减少R团基间的相互作用可使它稳定 C.疏水键使它稳定 D.脯氨酸残基的存在可中断α螺旋 E.它是一些蛋白质的二级结构 (4)蛋白质含氮量平均约为 A.20% B.5% C.8% D.16% E.23% (5)组成蛋白质的20种氨酸酸中除哪一种外,其α碳原子均为不对称碳原子? A.丙氨酸 B.异亮氨酸 C.脯氨酸 D.甘氨酸 E.组氨酸 (6)维系蛋白质一级结构的化学键是 A.盐键 B.疏水键 C.氢键 D.二硫键 E.肽键 (7)维系蛋白质分子中α螺旋的化学键是 A.肽键 B.离子键 C.二硫键 D.氢键 E.疏水键 (8)维系蛋白质三级结构稳定的最重要的键或作用力是 A.二硫键 B.盐键 C.氢键 D.范德瓦力 E.疏水键 (9)含两个羧基的氨基酸是: A.色氨酸 B.酪氨酸 C.谷氨酸 D.赖氨酸 E.苏氨酸 (10)蛋白质变性是由于 A.蛋白质一级结构的改变 B.蛋白质亚基的解聚 C.蛋白质空间构象的破坏 D.辅基的脱落 E.蛋白质水解 (11)变性蛋白质的特点是 A.不易被胃蛋白酶水解 B.粘度下降 C.溶解度增加 D.颜色反应减弱 E.丧失原有的生物活性 (12)处于等电点的蛋白质 A.分子表面净电荷为零 B.分子最不稳定,易变性 C.分子不易沉淀 D.易聚合成多聚体 E.易被蛋白酶水解 (13)有一血清蛋白(pI=4.9)和血红蛋白(pI=6.8)的混合物,在哪种pH条件下电泳,分离效果 最好? A.pH8.6 B.pH6.5 D.pH4.9 (14)有一混合蛋白质溶液,各种蛋白质的pI分别为4.6,5.0,5.3,6.7,7.3,电泳时欲使 其中四种泳向正极,缓冲液的pH应是多少? A.4.0 B.5.0 C.6.0 D.7.0

生物化学测试题及答案

生物化学第一章蛋白质化学测试题 一、单项选择题 1.测得某一蛋白质样品的氮含量为0.40g,此样品约含蛋白质多少?B(每克样品*6.25) A.2.00g B.2.50g C.6.40g D.3.00g E.6.25g 2.下列含有两个羧基的氨基酸是:E A.精氨酸B.赖氨酸C.甘氨酸 D.色氨酸 E.谷氨酸 3.维持蛋白质二级结构的主要化学键是:D A.盐键 B.疏水键 C.肽键D.氢键 E.二硫键(三级结构) 4.关于蛋白质分子三级结构的描述,其中错误的是:B A.天然蛋白质分子均有的这种结构 B.具有三级结构的多肽链都具有生物学活性 C.三级结构的稳定性主要是次级键维系 D.亲水基团聚集在三级结构的表面 E.决定盘曲折叠的因素是氨基酸残基 5.具有四级结构的蛋白质特征是:E A.分子中必定含有辅基 B.在两条或两条以上具有三级结构多肽链的基础上,肽链进一步折叠,盘曲形成 C.每条多肽链都具有独立的生物学活性 D.依赖肽键维系四级结构的稳定性 E.由两条或两条以上具在三级结构的多肽链组成 6.蛋白质所形成的胶体颗粒,在下列哪种条件下不稳定:C A.溶液pH值大于pI B.溶液pH值小于pI C.溶液pH值等于pI D.溶液pH值等于7.4 E.在水溶液中 7.蛋白质变性是由于:D A.氨基酸排列顺序的改变B.氨基酸组成的改变C.肽键的断裂D.蛋白质空间构象的破坏E.蛋白质的水解 8.变性蛋白质的主要特点是:D A.粘度下降B.溶解度增加C.不易被蛋白酶水解 D.生物学活性丧失 E.容易被盐析出现沉淀

9.若用重金属沉淀pI为8的蛋白质时,该溶液的pH值应为:B A.8 B.>8 C.<8 D.≤8 E.≥8 10.蛋白质分子组成中不含有下列哪种氨基酸?E A.半胱氨酸 B.蛋氨酸 C.胱氨酸 D.丝氨酸 E.瓜氨酸二、多项选择题 1.含硫氨基酸包括:AD A.蛋氨酸 B.苏氨酸 C.组氨酸D.半胖氨酸2.下列哪些是碱性氨基酸:ACD A.组氨酸B.蛋氨酸C.精氨酸D.赖氨酸 3.芳香族氨基酸是:ABD A.苯丙氨酸 B.酪氨酸 C.色氨酸 D.脯氨酸 4.关于α-螺旋正确的是:ABD A.螺旋中每3.6个氨基酸残基为一周 B.为右手螺旋结构 C.两螺旋之间借二硫键维持其稳定(氢键) D.氨基酸侧链R基团分布在螺旋外侧 5.蛋白质的二级结构包括:ABCD A.α-螺旋 B.β-片层C.β-转角 D.无规卷曲 6.下列关于β-片层结构的论述哪些是正确的:ABC A.是一种伸展的肽链结构 B.肽键平面折叠成锯齿状 C.也可由两条以上多肽链顺向或逆向平行排列而成 D.两链间形成离子键以使结构稳定(氢键) 7.维持蛋白质三级结构的主要键是:BCD A.肽键B.疏水键C.离子键D.范德华引力 8.下列哪种蛋白质在pH5的溶液中带正电荷?BCD(>5) A.pI为4.5的蛋白质B.pI为7.4的蛋白质 C.pI为7的蛋白质D.pI为6.5的蛋白质 9.使蛋白质沉淀但不变性的方法有:AC A.中性盐沉淀蛋白 B.鞣酸沉淀蛋白 C.低温乙醇沉淀蛋白D.重金属盐沉淀蛋白 10.变性蛋白质的特性有:ABC

生物化学习题及答案

第一章糖习题 一选择题 1.糖是生物体维持生命活动提供能量的(B)(南京师范大学2001年) A.次要来源B.主要来源 C.唯一来源D.重要来源 2. 纤维素与半纤维素的最终水解产物是(B)(南京师范大学2000年) A。杂合多糖 B.葡萄糖C.直链淀粉 D.支链淀粉 3. 下列那个糖是酮糖(A)(中科院1997年) A。D-果糖 B.D—半乳糖 C。乳糖 D.蔗糖 4。下列哪个糖不是还原糖(D)(清华大学2002年) A. D—果糖 B. D-半乳糖 C.乳糖 D.蔗糖 5。分子式为C5H10O5的开链醛糖有多少个可能的异构体(C)(中科院1996) A。2 B.4 C。8 D.6 6. 下列那种糖不能生成糖殺(C) A。葡萄糖B. 果糖C.蔗糖 D。乳糖 7. 直链淀粉遇碘呈(D) A. 红色B. 黄色C. 紫色D。蓝色 8. 纤维素的组成单糖和糖苷键的连接方式为(C) A。葡萄糖,α-1,4—糖苷键B。葡萄糖,β-1,3—糖苷键 C. 葡萄糖,β-1,4糖苷键D. 半乳糖,β—1,4半乳糖 9。有五个碳原子的糖(C) A.D-果糖B. 赤藓糖 C. 2—脱氧核糖D. D—木糖 10.决定葡萄糖是D型还是L型立体异构体的碳原子是(D) A.C2 B.C3 C。C4 D. C5 二填空题 1. 人血液中含量最丰富的糖是___葡萄糖___,肝脏中含量最丰富的糖是___肝糖原___,肌肉中含量最丰富的糖是___肌糖原__。 2. 蔗糖是由一分子___D-葡萄糖__和一分子__D—果糖__组成的,他们之间通过_α-β—1,2-糖苷键___糖苷键相连。 3。生物体内常见的双糖有__麦芽糖__,__蔗糖__,和__乳糖__。 4. 判断一个糖的D-型和L—型是以__5号___碳原子上羟基的位置作依据。 5。乳糖是由一分子___ D-葡萄糖___和一分子___ D-半乳糖___组成,它们之间通过___β—1,4糖苷键___糖苷键连接起来。 6.直链淀粉遇碘呈____蓝___色,支链淀粉遇碘呈____紫红___色,糖原遇碘呈____红__色。 三名词解释 1.构象分子中各个原子核基团在三维空间的排列和分布。 2.构型在立体异构中取代原子或基团在空间的取向。 3.糖苷键半糖半缩醛结构上的羟基可以与其他含羟基的化合物(如醇、酚类)失水缩合 而成缩醛式衍生物,成为糖苷,之间的化学键即为糖苷键。

相关文档
相关文档 最新文档