南农 分子生物学 RNA的合成
第十三章 RNA的生物合成
以DNA为模板合成RNA的过程叫作转录(transcription)。
-----在DNA双链中，起转录模板作用的链叫作模板链(template strand)或负链。而另l条非转录模板链通常称为编码链(coding strand)或正链，因为其序列和转录产物相同(仅T替代U)。
RNA DNA特异的启动子(promoter)。DNA中转录合成RNA的第一个碱基对，这个位点的
RNA聚合酶合成RNA5′→3′，，所以从转录起点沿RNA聚合酶运动的方向称为下游(downstream)，核苷酸残基编号依次为+2，+3……，而反方向为上游(up— stream)，核苷酸残基编号为-1，-2……。
------从启动子到终止序列(terminatorsequence)之间的DNA序列叫作转录单位(transcription unit)。
第一节原核基因的转录起始
-------操纵子(operon)，即1个启动子控制连在一起的多个结构基因的转录。-
一、RNA
细菌细胞中只有聚合酶，它兼有合成mRNA、tRNA和rRNA的功能。
E.coli5个亚基组成
σ亚基是细菌基因的转录起始因子，它识别并结合于启动子，一旦转录开始就离开RNA聚合酶，代之RNA聚合酶的核心酶(coreenzyme)。E.coli的RNA聚合酶全酶中最常见的σ因子是
亚基二聚体的结合位点处于启动子靠近上游的调节序列，它和转录频率(即启动子的强弱)直接相关。
β′亚基主要结合于DNA的转录模板链，而β亚基则结合底物NTP，并催化形成磷酸二酯键。
RNA聚合酶催化的RNA合成主要分为3个阶段：起始、延伸和终止。
***RNA聚合酶的功能包括：①寻找转录起点，即E.coli墓因组中的大约2 000个启动子。②解开一小段DNA双螺旋，以便产生单链DNA转录模板。⑧选择正确的底物NTP，并催化合成磷酸二酯键。④识别转录终止信号。⑤和转录激活蛋白或阻遏蛋白相互作用，以调节转录速度，这是基因表达调控的主要步骤。
和DNA聚合酶的活性相比，RNA聚合酶没有核酸外切酶活性，也就不具备校正和修复功能。所以，RNA能够从头合成，不需要引物，转录的忠实性自然比复制低得多，其误差率为10-4一10-5，比DNA复制的误差要高105倍。
-----启动子是一段DNA序列，它是RNA聚合酶结合并起始转录的位点。E.coli操纵子的启动子序列，以-35和-10为中心存在共有序列
a启动子有强弱之分，即不同的启动子转录合成RNA的频率有高有低。启动子的强弱很大程度上取决于启动子的序列和RNA聚合酶之间的亲和力。
a强启动子除了必须具备-10和-35区共有序列以外，RNA聚合酶的α亚基和-40～-60区的启动子调节序列相互作用也十分重要。
********转录的起始
(一)转录始于DNA模板的一定区域。首先，RNA聚合酶和DNA形成封闭式复合物 (closecomplex)，σ70因子紧紧结合于启动子序列，DNA双链仍保持碱基配对。
(二)RNA聚合酶一旦结合于启动子，就催化双链DNA解旋，并打开约17bp的区域 (约合B型DNA l.6圈)，形成开放式复合物(open complex)。这样，在DNA转录区产生了局部单链的转录
“泡”(bubble)，暴露出复制模板链，使NTP(底物)能够与其相应的碱基(模板)配对。
(三)接着，RNA聚合酶沿转录模板链运动(DNA 3′→5′)，转录泡随之移动，同时以 NTP为底物按5′→3′方向合成RNA链，使之互补于模板DNA链。转录不需要引物，RNA可以从头合成,新合成的RNA链的5′端核苷酸是高度特异的，为pppG或pppA。。
(四)当大约10个核苷酸已经聚合以后，RNA聚合酶释放σ因子，代之以延伸因子结合于核心酶并继续转录。
(五)操纵子的转录调节主要通过阻遏蛋白和激活蛋白。阻遏蛋白结合于操纵基因 (operator)，抑制了RNA聚合酶的转录起始。而激活蛋白和RNA聚合酶接触并促进转录起始。
(六)细菌经常利用不同的可互换的σ亚基，以识别特殊的启动子，并调节基因的开关。
在迄今所研究的所有真核细胞核中都含有三种RNA聚合酶。其中，RNA聚合酶I主要合成rRNA，RNA聚合酶Ⅱ主要合成mRNA，而RNA聚合酶Ⅲ的转录产物主要是tRNA和5SrRNA.
RNA聚合酶I RNA聚合酶Ⅲ的启动子位于转录
聚合酶Ⅱ转录有关的蛋白因子数目众多，可大致分为以下三种类型：
(一)通用(或基本)转录因子(general or basal factors) (二)上游因子(upstream factors) (三)可诱导因子(inducible factors)
------可诱导因子(如热休克转录因子HSTF)结合的DNA序列叫作效应元件或应答元件(response elements).
-------如果1个基因的转录调节区的元件仅仅被基本因子和上游因子所识别和结合，它就应当在任
何类型的细胞中转录。这种基因可能是组成性表达基因(即管家基因，housekeeping genes)，
------ 增强子(enhancer)序列可以远距离(±50Kb)增强转录起始，其位点在转录起点上游或下游均
可，且与本身序列的方向无关。增强子通常和组织特异表达或时间调节表达的基因转录有关。
--------
DNA，某些转录因子还可能识别并结合于其他因子或RNA
复合物。
(负调节)的例子不
多。
第三节调节真核基因转录的顺式作用元件
一、基因调控区
基因调控区主要由两种序列组成：一是启动子，即转录因子和RNA聚合酶结合区，它们组装成转录复
合物；二是调节序列(regulatory sequences)，即基因调节蛋白结合区，它们调节转录复合物的组装及
转录速度。
RNA聚合酶Ⅱ的启动子由以下两个区域组成：①核心启动子(core promoter)包括TATA盒和起始子(initiator，Inr)，结合基本转录因子，形成起始复合物。②启动子近侧序列元件(PSE) ,GC盒、CAAT
盒和OCT(1L聚体)等短序列元件，结合上游因子和可诱导因子，决定启动子的转录效率和特异性。
-----TATA盒，位于转录起始位点上游大约25～35bp,由6个非常保守的碱基TATA(A／T)A组成，TATA盒对转录起点定位起关键作用。
------Inr位于转录起点附近。绝大多数Inr在一1和十1两个位点的核苷酸序列为CA。Inr对于
转录始于固定位点也起关键作用。
TBP是TATA盒和Inr的通用转录因子，而TFII-I结合于Inr。
-------- 真核基因转录起点核心启动子上游100～200bp范围内有1个转录调控区，叫作启动子近侧
元件 (promoter proximal sequence elements，PSE)，这些元件常常表现出细胞类型特异性。
转录起点上游 100bp的启动子区域中，对转录有影响的三个短序列元件中心分别位于-30、-75、-
90。这三个元件分别是TATA盒(-30)，CAAT盒(-75)和GC盒(-90)。。
------CAAT盒一般位于-80附近。CAAT盒的1个特点是它的功能和方向无关。CAAT盒加强转录效
率。
GC盒也是比较常见的PSE元件，经常以多拷贝出现，其共有序列为GGGCGG，它的功能也和序列方向
无关。
常见的PSE元件还有核苷酸八聚体(Octamer，OCT)。这个8bp长的序列元件以不同的拷贝数、不同的
位置和不同的方向出现于许多真核基因启动子中。
TATA盒和Inr主要决定转录起点的位置，它们只能引起相当低水平的转录。而PSE元件则影响转录
起始的频率。
真核基因几个PSE元件之间的序列并不重要，改变10～30bp距离通常不会影响其功能，但不能超过
一定限度。
RNA聚合酶I的启动子包括两个组成部分：一是核心启动子(-45～+20)，它决定转录起始。二是上
游调控元件(upstreamcontrol element， UCE)，位于-180～-107，它决定转录效率。
RNA聚合酶Ⅲ的启动子分为两大类，第一类是内部启动子(internal promoter)，负责转录5SrRNA
和tRNA的基因，它们位于转录起点的下游。第二类启动子位于转录起点的上游，其转录产物是参与RNA
前体剪接的snRNA (U6)等，它的转录方式在真核基因中较为常见。
TBP(TATA盒结合蛋白)是所有三种真核RNA聚合酶通用的转录起始因子。
第四节 RNA聚合酶Ⅱ转录起始复合物
一、通用转录因子和转录起始复合物的组装
RNA聚合酶Ⅱ的转录起始因子属于通用转录因子(或基本转录因子)，其中，TFIID由1个TATA盒结合蛋白(TBP)和 8个以上TBP结合因子(TAF2)组成。
TBP和其他DNA结合蛋白的主要区别在于，它和DNA，并且使DNA分子发生明显弯曲(约900)。
首先，TFIID结合于启动子中的TATA盒,随后，TFIIB、RNA聚合酶Ⅱ-TFIIF、TFIIE、TFIIH和TFIIJ按顺序先后加入并最终形成转录起始复合物，转录才可能开始。
RNA聚合酶Ⅱ转录起始需要水解ATP以产生能量，这一点和RNA聚合酶 I和Ⅲ的转录起始不同。
二、转录因子的功能性结构域
真核转录激活蛋白的结构模型是，1个或多个激活结构域通过有一定柔性的结构域，连结于特异的DNA结合结构域。由于连接两个功能结构域之间的肽段具有一定的柔性，所以改变这些肽段长度，或者改变真核基因调控区的序列元件之间的距离，不一定影响转录因子的作用。
三、DNA结合结构域
真核转录因子的DNA结合结构域具有多种结构motif(或结构域亚单位)，有五种类型最常见的转录因子的DNA结合结构域，它们是同源盒结构域蛋白，即HD蛋白(homeodomain proteins)，锌指蛋白(zinc-finger proteins)、翼状螺旋蛋白(Winged-helix proteins)、亮氨酸拉链蛋白(1eucine-zipper proteins)和螺旋—环—螺旋蛋白(helix-loop-helix proteins，即HLH)。
第七节转录终止
一、原核基因的转录终止
E.coli有两种基本的转录终止机制。1种机制不需要其他蛋白因子参与，而另1种则依赖于1种蛋白因子——转录终止因子Rho。
二、真核基因的转录终止
真核基因转录终止的机理尚知之甚少。RNA聚合酶Ⅲ转录终止于合成了一系列U之后，但并不需要上游出现茎环结构。在绝大多数哺乳动物转录单位中， RNA聚合酶Ⅱ转录终止于poly A加成位点(addition site)下游0.5～2Kb范围内的多个可能位点。
生化及分子生物学复习资料
生化及分子生物学复习资料（15天15题） 一、变性蛋白质的性质改变 ①结晶及生物活性丧失是蛋白质变性的主要特征。 ②硫水侧链基团外露。 ③理化性质改变，溶解度降低、沉淀，粘度增加，分子伸展。 ④生理化学性质改变。分子结构伸展松散，易被蛋白酶水解。 蛋白质一、二、三、四级结构；β-折叠、α-螺旋 二、B型双螺旋DNA的结构特点 1. 两条反向平行的多核苷酸链围绕一个“中心轴”形成右手双螺旋结构，螺旋表面有一条大沟和小沟； 2.磷酸和脱氧核糖在外侧，通过3’，5 ’－磷酸二酯键相连形成DNA的骨架，与中心轴平行。碱基位于内侧，与中心轴垂直； 3. 两条链间存在碱基互补：A与T或G与C配对形成氢键，称为碱基互补原则（A与T为两个氢键，G与C为三个氢键）； 4. 螺旋的稳定因素为碱基堆集力和氢键； 5. 螺旋的直径为2nm，螺距为，相邻碱基对的距离为，相邻两个核苷酸的夹角为36度。 DNA变性（复性）、增色（减色）效应 三、酶催化作用特点 一般特点(同普通的催化剂)：1、只催化热力学上允许的化学反应（G<0）；2、降低活化能，但不改变化学反应的平衡点；3、加快化学反应速度，但催化剂本身反应前后不发生改变。 特殊之处：1.催化具有高效性；2.高度的专一性(只能催化一种底物或一定结构的底物）； 3.易失活； 4.催化活性受到调节和控制； 5.催化活性与辅助因子有关 (全酶=酶蛋白＋辅助因子） 维生素；酶促反应速度；抑制剂；酶原 四、生物氧化的特点 1.反应条件温和。
2.生物氧化并非代谢物与氧直接结合，而是以脱氢为主的逐步反应。 3.生物氧化是逐步进行的，能量释放也是逐步的，一部分生成ATP。 4.终产物CO2为有机物氧化成有机酸进而脱羧生成。 呼吸链；氧化磷酸化；底物水平磷酸化；解偶联剂 五、磷酸戊糖途径的生理意义 1. 是体内生成NADPH的主要代谢途径 2. 该途径的中间产物为许多化合物的生物合成提供原料。 3. 与光合作用联系起来，实现某些单糖间的互变。 糖酵解；三羧酸循环；糖异生（掌握反应历程） 六、软脂酸β-氧化和从头合成的比较 β-氧化；α－氧化作用；ω－氧化作用 七、如何判断蛋白质的营养价值
第十一章+RNA的生物合成
-第十一章RNA的生物合成——转录测试题-- 一、名词解释 1 转录 2 逆转录 3 逆转录酶 4 逆转录病毒 5 RNA聚合酶的核心酶 6 RNA聚合酶全酶 7 σ因子 8 内含子 9 外显子 10 不对称转录 11 ρ因子 12 启动子 13 ρ因子依赖的转录终止 14 ρ因子不依赖的转录终止 15 hnRNA 二、单项选择题 1．模板DNA的碱基序列是3′—TGCAGT—5′，其转录出RNA碱基序列是：A．5′—AGGUCA—3′ B．5′—ACGUCA—3′ C．5′—UCGUCU—3′ D．5′—ACGTCA—3′ E．5′—ACGUGT—3′ 2. 以RNA为模板合成DNA的过程是 A DNA的全保留复制机制 B DNA的半保留复制机制 C DNA的半不连续复制 D DNA的全不连续复制 E 反转录作用 3．识别RNA转录终止的因子是： A．α因子 B．β因子 C．σ因子 D．ρ因子 E．γ因子 4．下列关于DNA指导的RNA合成的叙述中哪一项是错误的？ A．只有在DNA存在时，RNA聚合酶才能催化生成磷酸二酯键 B．转录过程中RNA聚合酶需要引物 C．RNA链的合成方向是5′→3′ D．大多数情况下只有一股DNA作为RNA的模板
E．合成的RNA链没有环状的 5．DNA指导的RNA聚合酶由数个亚基组成，其核心酶的组成是： A．ααββ′ B．ααββ′σ C．ααβ′ D．ααβ E．αββ′ 6．识别转录起始点的是： A．ρ因子 B．核心酶 C．RNA聚合酶的σ因子 D．RNA聚合酶的α亚基 E．RNA聚合酶的β亚基 7．下列关于σ因子的描述哪一项是正确的？ A．RNA聚合酶的亚基，负责识别DNA模板上转录RNA的特殊起始点 B．DNA聚合酶的亚基，能沿5′→3′及3′→5′方向双向合成RNA C．可识别DNA模板上的终止信号 D．是一种小分子的有机化合物 E．参与逆转录过程 8．DNA复制和转录过程具有许多异同点。下列关于DNA复制和转录的描述中哪项是错误的？A．在体内以一条DNA链为模板转录，而以两条DNA链为模板复制 B．在这两个过程中合成方向都为5′→3′ C．复制的产物通常情况下大于转录的产物 D．两过程均需RNA引物 E．DNA聚合酶和RNA聚合酶都需要Mg2+上一页 9．对RNA聚合酶的叙述不正确的是： A．由核心酶与α因子构成 B．核心酶由α2ββ′组成 C．全酶与核心酶的差别在于β亚单位的存在 D．全酶包括σ因子 E．σ因子仅与转录起动有关 10. 关于反转录酶的叙述错误的是 A 作用物为四种dNTP B 催化RNA水解反应 C. 合成方向3’→5’ D 催化以RNA为模板进行DNA合成 E 可形成DNA-RNA杂交体中间产物 11. 真核细胞中经RNA聚合酶Ⅲ催化转录的产物是 A hnRNA B tRNA
生物化学基本概念
生物化学基本概念
————————————————————————————————作者：————————————————————————————————日期: ?
生物化学基本概念（２80) 一、绪论 １生物化学 2 分子生物学(狭义、广义) 3 结构生物学 4 基因组学 5蛋白质组学 6 糖生物学 7生物工程 8 基因工程 ９酶工程 10 蛋白质工程 11 细胞工程 １2 发酵工程 １3生化工程 １4 模式生物 二、核酸化学 1 核酸 2 拟核区 3质粒 4 沉降系数 5N-Ｃ糖苷键 ６第二信使 7 转化现象 8 类病毒 ９沅病毒（蛋白质侵染因子) 10 核酸的一级结构 11 DNA的一级结构 12 RＮA的一级结构 １3 寡核苷酸 １4 多核苷酸 １5 DNA的二级结构 1６ＤＮＡ的三级结构 17 正超螺旋
1８负超螺旋 19 RＮＡ的二级结构 2０RNＡ的三级结构 2１发夹结构 ２2 多顺反子 23 单顺反子 ２４减色效应 25 增色效应 2６核酸的变性 27 核酸的复性 28ＤNA的熔点（Tｍ、熔解温度) 29 退火 30 分子杂交 ３1 Soｕthｅrn 印迹法 32Ｎouthern 印迹法 三、蛋白质化学 1激素 2抗体 3 补体 4 干扰素 5 糖蛋白 ６蛋白质氨基酸 7非蛋白质氨基酸 8等电点（PＩ） 9肽 １０生物活性肽 11 双缩脲反应 1２构型 13 构象 1４蛋白质的一级结构 15蛋白质的二级结构 １6蛋白质的三级结构 17蛋白质的四级结构 18二面角
19β-折叠 ２0 β-转角 21 无规则卷曲 22超二级结构 ２3 结构域 24分子病 25 可变残基 26 不变残基 ２７电泳 ２8 透析 29 相对迁移率 3０盐析 31 盐溶 32 蛋白质的变性作用 33 变性蛋白 ３4 蛋白质的复性 35 简单蛋白 36 结合蛋白 3７糖蛋白 38脂蛋白 39色蛋白 ４0 核蛋白 41 磷蛋白 42 金属蛋白 4３可逆沉淀 44 不可逆沉淀 四、酶学 1 酶 2 单纯酶 3 结合酶 4 酶蛋白 5 辅因子 6全酶 7 辅酶
生物化学、化学生物学、分子生物学,三者联系与区别
一、生物化学、化学生物学、分子生物学，三者联系与区别 欧洲化学生物学的一个专门刊名为ChemBioChem刊物，这部刊物在我所阅读的文献中被反复提及，我查到该文献的两位主编分别是Jean-Marie Lehn教授和Alan R. Fersht教授，他们在诠释刊物的宗旨[1]时指出：ChemBioChem意指化学生物学和生物化学，其使命是涵盖从复杂的碳水化合物、多肽蛋白质到DNA/RNA，从组合化学、组合生物学到信号传导，从催化抗体到蛋白质折叠，从生物信息学和结构生物学到药物设计，这一范围宽广而欣欣向荣的学科领域。既然化学生物学涵盖面这么广泛，它到底和其它学科之间怎么区分呢？ 想到拿这个题目出来介绍是因为这是我在第一节课课堂讨论中的内容，我们小组所参考的文献主要是关于对化学生物学这门学科的认识，化学生物学的分析手段以及一些新的研究进展，比如药物开发和寻找药物靶点。当时课堂上对于题目中三者展开过热烈讨论，作为新兴学科的化学生物学，研究的是小分子作为工具解决生物学问题的学科，它如何从生物化学和分子生物学中分别出来，这也是我自己最开始产生过矛盾的问题，这里我结合所查阅的文献谈一下自己的理解。 1.1 生物化学(Biological Chemistry) 生物化学是研究生命物质的化学组成、结构、化学现象及生命过程中各种化学变化的生物学分支学科[1]。根据一些生物化学的书我归纳了一下，其研究的基本内容包括对生物体的化学组成的鉴定，对
新陈代谢与代谢调节控制，生物大分子的结构与功能测定，以及研究酶催化，生物膜和生物力学，激素与维生素，生命的起源与进化。 生物化学对其他各门生物学科的深刻影响首先反映在与其关系比较密切的细胞学、微生物学、遗传学、生理学等领域。通过对生物高分子结构与功能进行的深入研究，揭示了生物体物质代谢、能量转换、遗传信息传递、光合作用、神经传导、肌肉收缩、激素作用、免疫和细胞间通讯等许多奥秘，使人们对生命本质的认识跃进到一个崭新的阶段。(摘自https://www.wendangku.net/doc/4a2662129.html,/view/253496.htm) 1.2 化学生物学（Chemical Biology） 化学生物学是使用小分子作为工具解决生物学的问题或通过干扰/调节正常过程了解蛋白质的功能[1]。曾看到过一篇关于介绍化学生物学的奠基人Schreiber的文章，他曾经指出：“化学生物学是对分子生物学的有力补充，分子生物学采用定点突变的方法来改变生物分子如蛋白质和核酸的功能；而化学生物学是采用化学的手段，如运用小分子或人工设计合成的分子作为配体来直接改变生物分子的功能[2]。” 化学生物学是近年来出现的新兴研究领域，它融合了化学、生物学、物理学、信息科学等多个相关学科的理论、技术和研究方法，是一个有活力、有应用前景的新学科。它主要研究的内容包括[3]：1化学遗传学—采用小分子活性化合物作为探针,探索和调控细胞过程 (1)基因表达的小分子调控
生物化学 第11章 核酸的生物合成
第十一章 核酸的生物合成 一、填空题 1．中心法则是 于 年提出的，其内容可概括为 2．所有冈崎片段的延伸都是按 方向进行的。 3．前导链的合成是 的，其合成方向与复制叉移动方向 。 4．引物酶与转录中的RNA 聚合酶之间的差别在于它对 不敏感；后随链的合成是 的。 5．DNA 聚合酶I 的催化功能有 、 、 。 6．DNA 拓扑异构酶有 种类型，分别为 和 ,它们的功能是 。 7．细菌的环状DNA 通常在一个 开始复制，而真核生物染色体中的线形DNA 可以在 起始复制。 8．大肠杆菌DNA 聚合酶III 的 活性使之具有 功能，极大地提高了DNA 复制的保真度。 9．到目前为止，在大肠杆菌中已发现有 种DNA 聚合酶，其中 负责DNA 复制， 负责DNA 损伤修复。 10．大肠杆菌中DNA 指导的RNA 聚合酶全酶的亚基组成为 ，去掉 _因子的部分称为核心酶，这个因子使全酶能识别DNA 上的 位点。 11．在DNA 复制中， 可防止单链模板重新缔合和核酸酶的攻击。 12．DNA 合成时，先由引物酶合成 ，再由 在其3′端合成DNA 链，然后由 切除引物并填补空隙，最后由 连接成完整的链。 13．大肠杆菌DNA 连接酶要求 的参与，哺乳动物的DNA 连接酶要求 参与。 14．原核细胞中各种RNA 是 种RNA 聚合酶催化生成的，而真核细胞核基因的转录分别由 种RNA 聚合酶催化，其中rRNA 基因由 转录，hnRNA 基因由 转录，各类小分子量RNA 则是 的产物。 15．转录单位一般应包括 序列， 序列和 序列。 16．真核细胞中编码蛋白质的基因多为 ，编码的序列还保留在成熟mRNA 中的是 ，编码的序列在前体分子转录后加工中被切除的是 ；在成熟的mRNA 中 序列被拼接起来。 17．限制性核酸内切酶主要来源于 ，都识别双链DNA 中 ，并同时断裂 。 二、选择题(只有一个最佳答案)： 1．如果一个完全具有放射性的双链DNA 分子在无放射性标记溶液中经过两轮复制，产生的四个DNA 分子的放射性情况是：（ ） A 、其中一半没有放射性 B 、都有放射性 C 、半数分子的两条链都有放射性 D 、一个分子的两条链都有放射性 E 、四个分子都不含放射性 2．关于DNA 指导下的RNA 合成的下列论述除了（ ）项外都是正确的。 A 、只有存在DNA 时，RNA 聚合酶才催化磷酸二酯键的生成 DNA DNA RNA 蛋白质 复制 转录 反转录 翻译
生化和分子生物学
华中科技大学生物学硕士研究生入学考试《生化与分子生物学》 考试大纲 第一部分考试说明 一、考试性质 全国硕士研究生入学考试是为高等学校招收硕士研究生而设置的。其中，生物学（专业部分）由我校自行出题。它的评价标准是高等学校优秀本科毕业生能达到的及格或及格以上水平，以保证被录取者具有基本的生物学知识而有利于我校在录取时择优选拔。 二、评价目标 生物学（专业部分）考试在重点考查生物化学和分子生物学的基础知识、基本理论的基础上，注重考查理论联系实际的能力，说明、提出、分析和解决这些学科中出现的现象和问题。 ?正确地理解和掌握有关的基本概念、理论、假说、规律和论断 ?运用掌握的基础理论知识和原理，可以就某一问题设计出实验方案 ?准确、恰当地使用专业术语，文字通顺、层次清楚、有论有据、合乎逻辑地表述 三、考试形式和试卷结构 o答卷方式：闭卷，笔试，所列题目全部为必答题 o答题时间：180分钟 o题型比例：名词解释约15％；填空题约25％；简答和计算约30％；分析论述约30％ 第二部分考查要点 一、分子生物学 （一）DNA 1、DNA的结构 DNA的构成，DNA的一级结构、二级结构、高级结构 2、DNA的复制 DNA的半保留复制，复制起点、方向和速度，复制的几种主要方式 3、原核生物和真核生物DNA复制特点 原核生物DNA复制特点，真核生物DNA复制特点，DNA的复制调控 4、DNA的修复 四种修复方式
5、DNA的转座 转座子的分类和结构特征，转座机制，转座作用的遗传学效应，真核生物的转座子 （二）生物信息的传递（上）——从DNA到RNA 1、RNA的转录 转录的基本过程，转录机器的主要成分 2、启动子与转录起始 启动子的基本结构，启动子的识别，酶与启动子的结合，－10区和－35区的最佳间距，增强子及其功能，真核生物启动子对转录的影响 3、原核生物与真核生物mRNA的特征比较 原核生物mRNA的特征，真核生物mRNA的特征 4、终止和抗终止 不依赖于ρ因子的终止，依赖于ρ因子的终止，抗终止 5、内含子的剪接、编辑及化学修饰 RNA中的内含子，RNA的剪接，RNA的编辑和化学修饰 （三）生物信息的传递（下）——从DNA到蛋白质 1．遗传密码 三联子密码及其破译，遗传密码的性质 2．tRNA tRNA的结构、功能及种类，氨酰－tRNA合成酶 3．核糖体 核糖体的结构，rRNA，核糖体的功能 4．蛋白质合成的生物学机制 氨基酸的活化，肽链的起始、延伸和终止，蛋白质前体的加工，蛋白质合成抑制剂，RNA分子在生物进化中的地位 5．蛋白质运转机制 翻译－运转同步机制，翻译后的运转机制，核定位蛋白的运转机制，蛋白质的降解 （四）分子生物学研究法 1、重组DNA技术发展史上的重大事件 略 2、DNA操作技术 核酸的分离、提纯和定量测定的方法，核酸的凝胶电泳，分子杂交，细菌转化，核苷酸序列分析，基因扩增，DNA与蛋白质相互作用研究 2、基因克隆的主要载体系统 质粒DNA及其分离纯化，重要的大肠杆菌质粒载体，λ噬菌体载体，柯斯质粒载体，pBluescript噬菌体载体
第11章 RNA的生物合成
第十一章RNA的生物合成 一、单项选择题 1、转录的模板链是（） A、编码链 B、前导链 C、DNA的两条链 D、基因组DNA中的一条链 2、转录需要的原料为（） A、NMP B、NTP C、dNMP D、dNDP E、dNTP 3、转录需要的酶有（） A、引物酶 B、依赖DNA的DNA聚合酶（DDDP） C、依赖DNA的RNA聚合酶（DDRP） D、依赖RNA的DNA聚合酶（RDDP） E、依赖RNA的RNA聚合酶（RDRP） 4、以下关于转录的概念，不正确的是（） A、以DNA为模板合成RNA的过程 B、RNA的生物合成过程叫做转录 C、将染色体DNA分子中储存的遗传信息转为RNA碱基排列顺序的过程 D、转录在遗传信息传递中起中介作用 E、遗传信息的表达包括转录形成RNA及由mRNA指导的蛋白质生物合成 5、原核生物转录时识别起始位点的是（） A、α亚基 B、β亚基
A、δ因子C、β′亚基D、δ亚基E、ρ因子6、原核生物体内催化RNA延长的是（） B、α、β亚基 C、α、β、β′亚基 D、α 2、β、β′亚基E、RNA-pol全酶 E、基因DNA中的一条链 7、在DNA分子中，转录起始的5′上游端（） A、原核生物-35区存在TATA盒是RNA-pol识别的位点 B、原核生物-10区存在TATA盒是RNA-pol结合的位点 C、原核生物-35区存在TTGACA序列是RNA-pol结合的位点 D、原核生物-10区存在TTGACA序列是RNA-pol识别的位点 E、真核生物不存在TATA盒 8、DNA模板链为5′—ATAGCT—3′，其转录产物为（） A、5′—TATCGA—3′ C、5′—UATCGA—3′ E、5′—AUAGCU—3′ 9、RNA为5′—UGACGA—3′，它的模板链是（） A、5′—ACUGCU—3′ C、5′—ACTGCU—3′ E、5′—UCGTCA—3′ 10、RNA链为5′—AUCGAUC—3′，它的编码链是（）
第十一章RNA的生物合成练习题
第十一章RNA的生物合成（转录） 一、选择题 A型题 1．下列关于RNA的生物合成，哪一项是正确的？ A．需RNA引物B．DNA双链一股单链是模板C．RNA-pol以DNA为辅酶 D．生成的RNA都是翻译模板E．在胞浆中进行 2．DNA上某段碱基顺序为5′ACTAGTCAG 3′，转录后的mRNA相应的碱基顺序为：A．5′TGATCAGTC 3′ B．5′UGAUCAGUC 3′ C．5′CUGACUAGU 3′ D．5′CTGACTAGT 3′ E．5′CAGAUGACU 3′ 3．转录过程中需要的酶是： A．DNA指导的DNA-pol B．核酸酶C．RNA指导的RNA-polⅡD．DNA指导的RNA-pol E．RNA指导的DNA-pol 4．关于RNA-pol的叙述不正确的是： A．由核心酶与σ因子构成B．核心酶由α2ββ′（ω）组成C．全酶与核心酶的差别在于β亚基的存在D．全酶包括σ因子 E．σ因子仅与转录起始有关 5．原核生物参与转录起始的酶是： A．RNA-pol全酶B．引物酶C．RNA-polⅡD．解链酶E．RNA-pol核心酶 6．原核生物RNA-pol的核心酶组成是： A．αββ′（ω）B．α2ββ′（ω）C．α ββ′σ（ω）D．αβσ（ω）E．ββ′σ（ω）7．能特异性抑制原核生物RNA-pol的是： A．利福平B．鹅膏蕈碱C．假尿嘧啶D．亚硝酸盐E．氯霉素8．在转录延长中，RNA-pol与DNA模板的结合是： A．全酶与模板结合B．核心酶与模板特定位点结合 C．结合状态相对牢固稳定D．结合状态松弛而有利于RNA-pol向前移动E．和转录起始时的结合状态没有区别 9．ρ因子的功能是： A．在启动区域结合阻遏物B．增加RNA合成速率 C．释放结合在启动子上的RNA-pol D．参加转录的终止过程 E．允许特定转录的启动过程 10．RNA作为转录产物，其5′-端常见的起始核苷酸是： A．A或G B．C或U C．pppG或pppA D．pppC或pppU E．无一定规律 11．电子显微镜下观察到转录过程的羽毛状图形说明： A．模板一直打开成单链B．可见复制叉 C．转录产物RNA与模板DNA形成很长的杂化双链 D．多聚核糖体生成必须在转录完结后才出现 E．转录未终止即开始翻译
生物化学笔记(整理版)1
《生物化学》绪论 生物化学可以认为是生命的化学，是研究微生物、植物、动物及人体等的化学组成和生命过程中的化学变化的一门科学。 生命是发展的，生命起源，生物进化，人类起源等，说明生命是在发展，因而人类对生命化学的认识也在发展之中。 20世纪中叶直到80年代，生物化学领域中主要的事件： （一）生物化学研究方法的改进 a. 分配色谱法的创立——快捷、经济的分析技术由Martin.Synge创立。 b. Tisellius用电泳方法分离血清中化学构造相似的蛋白质成分。吸附层析法分离蛋白质及其他物质。 c. Svedberg第一台超离心机，测定了高度复杂的蛋白质。 d. 荧光分析法，同位素示踪，电子显微镜的应用，生物化学的分离、纯化、鉴定的方法向微量、快速、精确、简便、自动化的方向发展。 （二）物理学家、化学家、遗传学家参加到生命化学领域中来 1． Kendrew——物理学家，测定了肌红蛋白的结构。 2． Perutz——对血红蛋白结构进行了X-射线衍射分析。 3． Pauling——化学家，氢键在蛋白质结构中以及大分子间相互作用的重要性，认为某些protein具有类似的螺旋结构，镰刀形红细胞贫血症。 （1．2．3．都是诺贝尔获奖者） 4．Sanger―― 生物化学家 1955年确定了牛胰岛素的结构，获1958年Nobel prize化学奖。1980年设计出一种测定DNA内核苷酸排列顺序的方法，获1980年诺贝尔化学奖。 5．Berg―― 研究DNA重组技术，育成含有哺乳动物激素基因的菌株。 6．Mc clintock―― 遗传学家发现可移动的遗传成分，获1958年诺贝尔生理奖。 7．Krebs―― 生物化学家 1937年发现三羧酸循环，对细胞代谢及分生物的研究作出重要贡献，获1953年诺贝尔生理学或医学奖。 8．Lipmann―― 发现了辅酶A。 9． Ochoa——发现了细菌内的多核苷酸磷酸化酶 10．Korberg——生物化学家，发现DNA分子在细菌内及试管内的复制方式。（9．10．获1959年的诺贝尔生理医学奖） 11．Avery―― 加拿大细菌学家与美国生物学家Macleod,Carty1944年美国纽约洛克菲勒研究所著名实验。肺炎球菌会产生荚膜，其成分为多糖，若将具荚膜的肺炎球菌（光滑型）制成无细胞的物质，与活的无荚膜的肺炎球菌（粗糙型）细胞混合 －>粗糙型细胞也具有与之混合的光滑型的荚膜－>表明，引起这种遗传的物质是DNA 12．Wilkins―― 完成DNA的X-射线衍射研究，对Watson和Crick确定DNA分子的双螺旋结构是至关重要的。三人共获1962年诺贝尔生理医学奖。 13．Nirenberg―― 生物化学家在破译遗传密码方面作出重要贡献。
生物化学与分子生物学
中科院研究生院硕士研究生入学考试 《生物化学与分子生物学》考试大纲 一、考试内容 1.蛋白质化学 考试内容 ●蛋白质的化学组成，20种氨基酸的简写符号 ●氨基酸的理化性质及化学反应 ●蛋白质分子的结构（一级、二级、高级结构的概念及形式） ●蛋白质一级结构测定的一般步骤 ●蛋白质的理化性质及分离纯化和纯度鉴定的方法 ●蛋白质的变性作用 ●蛋白质结构与功能的关系 考试要求 ●了解氨基酸、肽的分类 ●掌握氨基酸与蛋白质的物理性质和化学性质 ●掌握蛋白质一级结构的测定方法 ●理解氨基酸的通式与结构 ●理解蛋白质二级和三级结构的类型及特点，四级结构的概念及亚基 ●掌握肽键的特点 ●掌握蛋白质的变性作用 ●掌握蛋白质结构与功能的关系 2.核酸化学 考试内容 ●核酸的基本化学组成及分类 ●核苷酸的结构 ●DNA和RNA一级结构的概念和二级结构要特点；DNA的三级结构 ●RNA的分类及各类RNA的生物学功能 ●核酸的主要理化特性 ●核酸的研究方法 考试要求 ●全面了解核酸的组成、结构、结构单位以及掌握核酸的性质 ●全面了解核苷酸组成、结构、结构单位以及掌握核苷酸的性质 ●掌握DNA的二级结构模型和核酸杂交技术
3. 糖类结构与功能 考试内容 ●糖的主要分类及其各自的代表 ●糖聚合物及其代表和它们的生物学功能 ●糖链和糖蛋白的生物活性 考试要求 ●掌握糖的概念及其分类 ●掌握糖类的元素组成、化学本质及生物学功用 ●理解旋光异构 ●掌握单糖、二糖、寡糖和多糖的结构和性质 ●掌握糖的鉴定原理 4. 脂质与生物膜 考试内容 ●生物体内脂质的分类，其代表脂及各自特点 ●甘油脂、磷脂以及脂肪酸特性。油脂和甘油磷脂的结构与性质 ●生物膜的化学组成和结构，“流体镶嵌模型”的要点 考试要求 ●了解脂质的类别、功能 ●熟悉重要脂肪酸、重要磷脂的结构 ●掌握甘油脂、磷脂的通式以及脂肪酸的特性 ●掌握油脂和甘油磷脂的结构与性质 5. 酶学 考试内容 ●酶的作用特点 ●酶的作用机理 ●影响酶促反应的因素（米氏方程的推导） ●酶的提纯与活力鉴定的基本方法 ●熟悉酶的国际分类和命名 ●了解抗体酶、核酶和固定化酶的基本概念和应用 考试要求 ●了解酶的概念 ●掌握酶活性调节的因素、酶的作用机制 ●了解酶的分离提纯基本方法 ●熟悉酶的国际分类（第一、二级分类）
分子生物学基本含义
分子生物学 分子生物学的基本含义(p8) 分子生物学是研究核酸、蛋白质等所有生物大分子的形态、结构特征及其重要性、规律性和相互关系的科学，是人类从分子水平上真正揭开生物世界的奥秘，由被动地适应自然界转向主动地改造和重组自然界的基础学科。 分子生物学与其它学科的关系 分子生物学是由生物化学、生物物理学、遗传学、微生物学、细胞学、以至信息科学等多学科相互渗透、综合融会而产生并发展起来的，凝聚了不同学科专长的科学家的共同努力。它虽产生于上述各个学科，但已形成它独特的理论体系和研究手段，成为一个独立的学科。 生物化学与分子生物学关系最为密切: 生物化学是从化学角度研究生命现象的科学，它着重研究生物体内各种生物分子的结构、转变与新陈代谢。传统生物化学的中心内容是代谢，包括糖、脂类、氨基酸、核苷酸、以及能量代谢等与生理功能的联系。 分子生物学则着重阐明生命的本质----主要研究生物大分子核酸与蛋白质的结构与功能、生命信息的传递和调控。 细胞生物学与分子生物学关系也十分密切: 传统的细胞生物学主要研究细胞和亚细胞器的形态、结构与功能。探讨组成细胞的分子结构比单纯观察大体结构能更加深入认识细胞的结构与功能，因此现代细胞生物学的发展越来越多地应用分子生物学的理论和方法。 分子生物学则是从研究各个生物大分子的结构入手，但各个分子不能孤立发挥作用，生命绝非组成成分的随意加和或混合，分子生物学还需要进一步研究各生物分子间的高层次组织和相互作用，尤其是细胞整体反应的分子机理，这在某种程度上是向细胞生物学的靠拢。 第一章序论 1859年发表了《物种起源》，用事实证明“物竞天择，适者生存”的进化论思想。 指出：物种的变异是由于大自然的环境和生物群体的生存竞争造成的，彻底否定了“创世说”。达尔文第一个认识到生物世界的不连续性。 意义：达尔文关于生物进化的学说及其唯物主义的物种起源理论，是生物科学史上最伟大的创举之一，具有不可磨灭的贡献。
第11章 RNA的生物合成
第十一章 RNA的生物合成 一、单项选择题 1、转录的模板链是（） A、编码链 B、前导链 C、DNA的两条链 D、基因组DNA中的一条链 E、基因DNA中的一条链 2、转录需要的原料为（） A、NMP B、NTP C、dNMP D、dNDP E、dNTP 3、转录需要的酶有（） A、引物酶 B、依赖DNA的DNA聚合酶（DDDP） C、依赖DNA的RNA聚合酶（DDRP） D、依赖RNA的DNA聚合酶（RDDP） E、依赖RNA的RNA聚合酶（RDRP） 4、以下关于转录的概念，不正确的是（） A、以DNA为模板合成RNA的过程 B、RNA的生物合成过程叫做转录 C、将染色体DNA分子中储存的遗传信息转为RNA碱基排列顺序的过程 D、转录在遗传信息传递中起中介作用 E、遗传信息的表达包括转录形成RNA及由mRNA指导的蛋白质生物合成 5、原核生物转录时识别起始位点的是（） A、α亚基 B、β亚基 C、β′亚基 D、δ亚基 E、ρ因子 6、原核生物体内催化RNA延长的是（） A、δ因子 B、α、β亚基 C、α、β、β′亚基 D、α2、β、β′亚基 E、RNA-pol全酶 7、在DNA分子中，转录起始的5′上游端（） A、原核生物-35区存在TATA盒是RNA-pol识别的位点 B、原核生物-10区存在TATA盒是RNA-pol结合的位点 C、原核生物-35区存在TTGACA序列是RNA-pol结合的位点 D、原核生物-10区存在TTGACA序列是RNA-pol识别的位点 E、真核生物不存在TATA盒 8、DNA模板链为5′—ATAGCT—3′，其转录产物为（） A、5′—TATCGA—3′ B、3′—TATCGA—5′ C、5′—UATCGA—3′ D、3′—UAUCGA—5′ E、5′—AUAGCU—3′ 9、RNA为5′—UGACGA—3′，它的模板链是（） A、5′—ACUGCU—3′ B、5′—UCGUCA—3′ C、5′—ACTGCU—3′ D、5′—TCGTCA—3′ E、5′—UCGTCA—3′ 10、RNA链为5′—AUCGAUC—3′，它的编码链是（） A、5′—ATCGATC—3′ B、5′—AUCGAUC—3′
生物化学习题与解析 RNA的生物合成过程
R N A的生物合成过程 一、选择题 （一） A 型题 1 ．下列关于转录的叙述正确的是 A ．转录过程需 RNA 引物 B ．转录生成的 RNA 都是翻译模板 C ．真核生物转录是在胞浆中进行的 D ． DNA 双链一股单链是转录模板 E ． DNA 双链同时作为转录模板 2 ． DNA 上某段编码链碱基顺序为 5 ' -ACTAGTCAG- 3 ' ，转录后 mRNA 上相应的碱基顺序为 A ． 5 ' -TGATCAGTC-3 ' B ． 5 ' -UGAUCAGUC-3 ' C ． 5 ' -CUGACUAGU-3 ' D ． 5 ' -CTGACTAGT-3 ' E ． 5 ' -CAGCUGACU-3 ' 3 ．不对称转录是 A ．双向复制后的转录 B ．以 DNA 为模板双向进行转录 C ．同一单链 DNA ，转录时可以交替作为编码链和模板链 D ．同一单链 DNA ，转录时只转录外显子部分 E ．没有规律的转录 4 ．真核生物的转录特点是 A ．发生在细胞质内，因为转录产物主要供蛋白质合成用 B ．转录产物有 poly （ A ）尾， DNA 模板上有相应的 poly （ dT ）序列 C ．转录的终止过程需ρ（ Rho ）因子参与 D ．转录起始需要形成 PIC （转录起始前复合物） E ．需要α因子辨认起点 5 ．下列关于转录编码链的叙述正确的是 A ．能转录生成 mRNA 的 DNA 单链 B ．能转录生成 tRNA 的 DNA 单链 C ．同一 DNA 单链不同片段可作模板链或编码链 D ．是基因调节的成份 E ．是 RNA 链 6 ． Pribnow box 序列是 A ． AAUAAA B ． TAAGG C C ． TTGACA D ． TATAAT E ． AATAAA 7 ．真核生物的 TATA 盒是 A ．参与转录起始 B ．翻译的起始点 C ． RNA 聚合酶核心酶结合位点 D ．σ因子结合位点 E ．复制的起始点 8 ．原核生物 DNA 指导的 RNA 聚合酶由数个亚基组成，其核心酶的组成是 A ．α 2 ββ ' ( ω ) B ．α 2 β ( σ ) C ．α 2 ββ ' σ ( ω ) D ．α 2 β ' ( ω ) E ．αββ ' 9 ．原核生物识别转录起始点的是 A ．ρ因子 B ．核心酶 C ． RNA 聚合酶的α亚基 D ．σ亚基 E ． RNA 聚合酶的β 亚基 10 ．ρ因子的功能是 A ．参与转录的启动过程 B ．参与转录的全过程 C ．加速 RNA 的合成 D ．参与转录的终止过程 E ．可改变 RNA 聚合酶的活性 11 ．在转录延长阶段， RNA 聚合酶与 DNA 模板的结合是
第11章-RNA的生物合成
第11章RNA的生物合成 学习要求 1．掌握RNA生物合成的特点；原核生物转录的基本过程、各阶段特点及相关的酶；真核生物RNA聚合酶的分类、作用特点及产物；转录后修饰相关的重要概念；核酶。2．熟悉mRNA的首尾修饰、剪接、剪切和编辑；tRNA、rRNA转录后加工。 3．了解-35区、-10区、上游、下游及保守序列等概念；转录因子和真核生物转录起始复合物形成过程；转录空泡的形成和其中发生的反应；拼板理论；内含子的其他剪接方式和功能。 基本知识点 RNA的生物合成包括转录与RNA复制。转录是以DNA为模板合成RNA的过程，是生物体内RNA合成的主要方式；RNA复制是以RNA为模板合成RNA的过程，是除逆转录病毒之外的RNA病毒合成RNA的方式。 转录以DNA双链中的一股单链作为模板，以不对称转录的方式，以4种NTP为原料，在RNA聚合酶的催化下合成与模板互补的RNA。原核生物RNA聚合酶仅1种，由4种亚 基组成，有全酶(α 2ββ'σ)和核心酶(α 2 ββ')两种形式。 转录过程分起始、延长和终止三个阶段。原核生物转录起始是RNA聚合酶全酶参与，由σ亚基辨认转录起始点并与模板DNA结合；延长过程由RNA聚合酶核心酶参与，同时伴随蛋白质的翻译；转录终止过程有依赖ρ因子和非依赖ρ因子的转录终止两种方式。 真核生物RNA聚合酶有三种，分别为RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ，每种聚合酶细胞定位、转录产物各不相同。RNA聚合酶结构复杂，由多亚基组成。其中RNA聚合酶Ⅱ最大亚基羧基末端有CTD（羧基末端结构域），去磷酸化的CTD在转录起始中发挥作用。真核生物转录起始过程较原核生物复杂，RNA聚合酶不直接结合模板，需转录因子参与；延长过程无转录与翻译同步的现象；转录终止和转录后修饰密切相关。 转录生成的初级RNA转录物需经过加工才能转变成有功能的成熟的RNA。三种主要RNA转录后加工方式不同。真核mRNA前体的加工包括首尾修饰、剪接和剪切、编辑等。首尾修饰即5' 端加m7GpppN的帽子、3' 端加poly（A）尾；一个前体mRNA分子可经过剪接和剪切两种模式而加工成多个mRNA分子。有些mRNA要经过编辑才能作为翻译的模板。真核rRNA和tRNA的前体由一些特异的核酸酶切除间隔序列，某些碱基经过化学修饰后，成为成熟的rRNA和tRNA。有些真核的rRNA、 tRNA和mRNA前体可自身剪接内含子，无需蛋白质参与，由自身的RNA催化。
21生物化学习题与解析--常用分子生物学技术的原理及其应用
常用分子生物学技术的原理及其应用 一、选择题 （一）A 型题 1 ．分子杂交实验不能用于 A ．单链DNA 与RNA 分子之间的杂交 B ．双链DNA 与RNA 分子之间的杂交 C ．单链RNA 分子之间的杂交 D ．单链DNA 分子之间的杂交 E ．抗原与抗体分子之间的杂交 2 ．关于探针叙述错误的是 A ．带有特殊标记 B ．具有特定序列 C ．必须是双链的核酸片段 D ．可以是基因组DNA 片段 E ．可以是抗体 3 ．下列哪种物质不能用作探针 A ．DNA 片段 B ．cDNA C ．蛋白质 D ．氨基酸 E ．RNA 片段 4 ．印迹技术可以分为 A ．DNA 印迹 B ．RNA 印迹 C ．蛋白质印迹 D ．斑点印迹 E ．以上都对 5 ．PCR 实验延伸温度一般是 A ．90 ℃ B ．72 ℃ C ．80 ℃ D ．95 ℃ E ．60 ℃ 6 ．Western blot 中的探针是 A ．RNA B ．单链DNA C ．cDNA D ．抗体 E ．双链DNA 7 ．Northern blotting 与Southern blotting 不同的是 A ．基本原理不同 B ．无需进行限制性切酶消化 C ．探针必须是RNA
D ．探针必须是DNA E ．靠毛细作用进行转移 8 ．可以不经电泳分离而直接点样在NC 膜上进行杂交分析的是 A ．斑点印迹 B ．原位杂交 C ．RNA 印迹 D ．DNA 芯片技术 E ．DNA 印迹 9 ．下列哪种物质在PCR 反应中不能作为模板 A ．RNA B ．单链DNA C ．cDNA D ．蛋白质 E ．双链DNA 10 ．RT-PCR 中不涉及的是 A ．探针 B ．cDNA C ．逆转录酶 D ．RNA E ．dNTP 11 ．关于PCR 的基本成分叙述错误的是 A ．特异性引物 B ．耐热性DNA 聚合酶 C ．dNTP D ．含有Zn 2+ 的缓冲液 E ．模板 12 ．DNA 链末端合成终止法不需要 A ．ddNTP B ．dNTP C ．引物标记 D ．DNA 聚合酶 E ．模板 13 ．cDNA 文库构建不需要 A ．提取mRNA B ．限制性切酶裂解mRNA C ．逆转录合成cDNA D ．将cDNA 克隆入质粒或噬菌体 E ．重组载体转化宿主细胞 14 ．标签蛋白沉淀是 A ．研究蛋白质相互作用的技术 B ．基于亲和色谱原理 C ．常用标签是GST D ．也可以是6 组氨酸标签 E ．以上都对 15 ．研究蛋白质与DNA 在染色质环境下相互作用的技术是 A ．标签蛋白沉淀 B ．酵母双杂交 C ．凝胶迁移变动实验 D ．染色质免疫沉淀法 E ．噬菌体显示筛选系统
第十一章 RNA的生物合成
第十一章 RNA的生物合成 Chapter 11 RNA Biosynthesis, 生物界，RNA合成有两种方式： 一是D N A指导的R N A合成，也叫转录，此为生物体内的主要合成方式，也是本章介绍的主要内容。 另一种是R N A指导的R N A合成(R N A-d e p e n d e n t R N A s y n t h e s i s)，也叫R N A复制(R N A r e p l i c a t i o n),由R N A依赖的R N A聚合酶(R N A-d e p e n d e n t R N A p o l y m e r a s e)催化，常见于病毒，是逆转录病毒以外的R N A病毒在宿主细胞以病毒的单链R N A 为模板合成R N A的方式。 重点内容 掌握不对称转录、模板链和编码链的概念。 （二）掌握原核生物RNA聚合酶的全酶及核心酶的组成；熟悉模板与酶的辨认结合，启动子的概念。了解-35区、-10区、上游、下游序列等概念，以及两区的作用特点。 （三）熟悉原核生物的转录起始，转录的方向，原核生物的转录终止分两种方式。了解原核生物RNA合成的过程。 （四）熟悉真核生物的RNA聚合酶的分类，作用特点以及各自相应的产物；了解真核生物转录过程。 （五）掌握断裂基因、内含子、外显子的概念； （六）熟悉真核生物mRNA,tRNA的修饰过程。 复制与转录的相同点： ①都是酶促的核苷酸聚合过程 ②以DNA为模板 ③遵循碱基配对原则 ④都需依赖DNA的聚合酶 ⑤聚合过程都是生成磷酸二酯键
⑥新链合成方向为5’→3’ 原核生物转录的模板和酶 Section 1 Templates and Enzymes in Prokaryotic Transcription 原核生物转录的模板 DNA分子上转录出RNA的区段，称为结构基因(structural gene)。 转录的这种选择性称为不对称转录(asymmetric transcription)，它有两方面含义： 在DNA分子双链上，一股链用作模板指引转录，另一股链不转录； 模板链并非总是在同一单链上。 全称：依赖DNA的RNA聚合酶（DDRP）。 RNA合成的化学机制与DNA聚合酶催化DNA合成相似，沿5‘→3’聚合RNA。
生物化学下册课后习题答案
第19章代谢总论 ⒈怎样理解新陈代谢？ 答：新陈代谢是生物体新陈代谢的功能可概括为五个方而：①从周围环境中获得营养物质。②将外界引入的营养物质转变为自身需要的结构元件。③将结构元件装配成自身的大分子。④形成或分解生物体特殊功能所需的生物分子。⑤提供机体生命活动所需的一切能量。 ⒉能量代谢在新陈代谢中占何等地位？ 答：生物体的一切生命活动都需要能量。生物体的生长、发育，包括核酸、蛋白质的生物合成，机体运动，包括肌肉的收缩以及生物膜的传递、运输功能等等，都需要消耗能量。如果没有能量来源生命活动也就无法进行．生命也就停止。 ⒊在能量储存和传递中，哪些物质起着重要作用？ 答：在能量储存和传递中，ATP（腺苷三磷酸）、GTP（鸟苷三磷酸）、UTP（尿苷三磷酸）以及CTP（胞苷三磷酸）等起着重要作用。 ⒋新陈代谢有哪些调节机制？代谢调节有何生物意义？ 答：新陈代谢的调节可慨括地划分为三个不同水平：分子水平、细胞水平和整体水平。分子水平的调节包括反应物和产物的调节（主要是浓度的调节和酶的调节）。酶的调节是最基本的代谢调节，包括酶的数量调节以及酶活性的调节等。酶的数量不只受到合成速率的调节，也受到降解速率的调节。合成速率和降解速率都备有一系列的调节机制。在酶的活性调节机制中，比较普遍的调节机制是可逆的变构调节和共价修饰两种形式。 细胞的特殊结构与酶结合在一起，使酶的作用具有严格的定位条理性，从而使代谢途径得到分隔控制。 多细胞生物还受到在整体水平上的调节。这主要包括激素的调节和神经的调节。高等真核生物由于分化出执行不同功能的各种器官，而使新陈代谢受到合理的分工安排。人类还受到高级神经活动的调节。 除上述各方面的调节作用外，还有来自基因表达的调节作用。 代谢调节的生物学意义在于代谢调节使生物机体能够适应其内、外复杂的变化环境，从而得以生存。 ⒌从“新陈代谢总论”中建立哪些基本概念？ 答：从“新陈代谢总论”中建立的基本概念主要有：代谢、分解代谢、合成代谢、递能作用、基团转移反应、氧化和还原反应、消除异构及重排反应、碳－碳键的形成与断裂反应等。 ⒍概述代谢中的有机反应机制。 答：生物代谢中的反应大体可归纳为四类，即基团转移反应；氧化－还原反应；消除、异构化和重排反应；碳－碳键的形成或断裂反应。这些反应的具体反应机制包括以下几种：酰基转移，磷酰基转移，葡糖基基转移；氧化－还原反应；消除反应，分子内氢原子的迁移（异构化反应），分子重排反应；羟醛综合反应，克莱森酯综合反应，β-酮酸的氧化脱羧反应。
生物化学与分子生物学常考名词解释总结!!!
蛋白质的二级结构是指多肽链的主链骨架中若干肽单位，各自沿一定的轴盘旋或折叠，并以氢键为次级键而形成有规则的构象，如α螺旋β折叠β转角等。 肽单位：肽键是构成在分子的基本化学键，肽键与相邻的原子所组成的基团，成为肽 单位或肽平面。 结构域是位于超二级结构和三级结构间的一个层次。结构域是在蛋白质的三级结构内 的独立折叠单元，其通常都是几个超二级结构单元的组合。在较大的蛋白质分子中， 由于多肽链上相邻的超二级结构紧密联系，进一步折叠形成一个或多个相对独立的致 密的三维实体，即结构域。 超二级结构又称模块或膜序是指在多肽内顺序上相邻的二级结构常常在空间折叠中靠近，彼此相互作用，形成有规则的二级结构聚集体。 三级结构具有二级结构、超二级结构或结构域的一条多肽链，由于其序列上相隔较远的氨基酸残基侧链的相互作用，而进行范围更广泛的盘曲与折叠，形成包括主、测链 在内的空间排列，这种在一条多肽链中所有原子和基团在三维空间的整体排布称为三 级结构。 一级结构蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序，以及二硫键的位置。 四级结构多亚基蛋白质分子中各个具有三级结构的多肽链，以适当的方式聚合所形成的蛋白质的三维结构。 增色效应增色效应或高色效应。由于DNA变性引起的光吸收增加称增色效应,也就是 变性后 DNA 溶液的紫外吸收作用增强的效应。 固定化酶不溶于水的酶。是用物理的或化学的方法使酶与水不溶性大分子载体结合或把酶包埋在水不溶性凝胶或半透膜的微囊体中制成的。 脂肪酸的β氧化饱和脂肪酸在一系列酶的作用下，羧基端的β位C原子发生氧化，C 链在α位C原子与β位C原子间发生断裂，每次生成一个乙酰CoA和较原来少两个C单位的脂肪酸，这个不断重复进行的脂肪酸氧化过程称为脂肪酸的β氧化。 脂肪酸的β-氧化基本过程：丁酰CoA经最后一次β氧化：生成2分子乙酰CoA 。故 每次β氧化1分子脂酰CoA生成1分子FADH２，1分子NADH+H+，1分子乙酰CoA，通过呼吸链氧化前者生成2分子ATP，后者生成3分子ATP。 尿素循环肝脏是动物生成尿素的主要器官，由于精氨酸酶的作用使精氨酸水解为鸟氨酸及尿素。精氨酸在释放了尿素后产生的鸟氨酸，和氨甲酰磷酸反应产生瓜氨酸，瓜 氨酸又和天冬氨酸反应生成精氨基琥珀酸，精氨基琥珀酸为酶裂解，产物为精氨酸及 延胡索酸。由于精氨酸水解在尿素生成后又重新反复生成，故称尿素循环。 操纵子指启动基因、终止基因和一系列紧密连锁的结构基因的总称。原核生物大多数 基因表达调控是通过操纵子机制实现的。操纵子通常由 2个以上的编码序列与启动序列、操纵序列以及其他调节序列在基因组中成簇串联组成。启动序列是RNA聚合酶结合并起动转录的特异DNA序列。多种原核基因启动序列特定区域内，通常在转录起始