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晶体结构软件—Mercury
作者:许妙琼
来源:《科技创新与应用》2013年第35期
摘要:利用Mercury软件可以更好的观察研究晶体结构,有利于晶体结构研究。文章重
点介绍利用Mercury软件研究晶体结构。
关键词:Mercury;晶体;结构
在晶体结构研究过程中,研究者往往要展示晶体的微观内部结构单元,虽然有结构模型,但是数量有限,展示的效果不尽如人意。随着化学软件技术的发展,已经有很多软件可以很好地为晶体结构研究服务。
Mercury是英国剑桥晶体数据中心Cambridge Crystallographic Data Centre制作的剑桥结构数据库系统Cambridge Structural Database System下的一个软件,用来观察研究晶体的三维结构,时有免费的版本和商业版更新。Mercury运行在Windows(或Unix平台)上。下面简单
介绍一下利用Mercury软件来研究晶体结构。
1 Mercury软件的主窗口
Mercury软件的主窗口比较简单,屏幕中间的黑色区域为显示区,所读入的晶体结构数据输出在这里;标题栏显示程序的名称以及当前打开的晶体编号;菜单栏包含一系列菜单命令;工具栏位于菜单栏的下方,列出常用的工具,例如:显示风格、颜色、选择模式和操作方式等等;位于屏幕右侧的空白区域为结构列表区,列出载入文件或数据库所含的结构列表;处于显示区下方的有接触列表区和选项区,前者与分子间或分子内接触作用相关,而后者包含一些常用选项。此外,在显示区下方还有一个是否进行晶胞堆积的复选框;屏幕最下方为任务栏,包含与当前状态有关的帮助信息。
2 Mercury软件的简单操作
2.1 文件调入
mercury软件使用.cif结构文件,要求该结构文件所在的路径不能含中文。
2.2 晶体结构位置调整
显示窗口中按住鼠标左键或右键拖动可以随意旋转结构和调整结构大小的缩放率,也可以通过快捷菜单中的快捷命令来调整,以得到较好的结构视图。
2.3 显示样式选择