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ALPHACAM中文使用手册

第一章简介

关于使用本手册

本手册系提供程序的使用及操作的详细说明。通常您可在程工主画面的辅助说明中寻找相关的使用说明。而本手册则是更详细，依照章节的画面说明。此手册应在使用软件之后，有所疑问，再来查询之用。

本手的习惯用法

应按何键，系统以完整符号表示，如：[Enter] , [Esc] , [Tab ], [Ctrl ] , [Shift ], [Spacebar ] , [F4 ] , [A ] , [B ] , [S]等。而二键同时按时，则以：[Ctrl ] + [S]表示。而键须依序而按，则以：[Atl ] , [F ], [O]表示。在程序操作时，而鼠标最常用到。在手册中，按鼠标系以“按”及符号Θ表示。按鼠标右键则为R-Θ。按鼠标2次，则以“按二次”说明，而以符号2Θ表示按鼠标左键二次。而按左键一次选取，则以Θ符号表示。

指令及选项的使用时，则以粗黑大字表示。主菜单及次选项是以阶层表示。例如：几何图形|弧|二点+半径。黑三角表示主菜单下，它会再开一个次选项视图。若是同一主菜单下，有多个指令要使用，全阶层表示则代繁锁，则次选项则以|拷贝|来表示。

指令选用可以用滑或键。若用键躩，先按Atl，再依序按下标线的字母。例如：Atl,F,O,表示档案|开始旧文件…指令。

另一个指令选取法，是所谓的“热键”。其法表示在选项屏幕中，以“Ctrl+键”表示，例如：档案|储存档案Ctrl+S。使用时，即先按Ctrl键。手册以Ctrl+Spacebar 表示。

大部份指令有一更快速，直接的选用法：“图像”按钮。若此指令有图像钮可供选用，则会在指令到列的最后以其图像显示出来，例如：

几何图形|APS快速几何图形|线到弧熔接

若该指令还有“热键”，则会在它的指令列及图像之后，再把热键列出，例如：档案|开启档案Ctrl+O.

开/关的指令，表示“开”或“关”则是在指令的前面打上一个勾勾表示。例如：显示|显示选项| ˇ显示断点。

若指令之后，会带出一对话框，供再选取指令，则是在指令之后，以小点点表示，如下：

几何图形|编辑/列出几何图形…

对话框指令的选用同前表示尖法，只是以一大粗线符号表示而已，例如：

加工|刀具方向边|更改出/进L/R。

当用到许多指令或一对话框中的多个选项，为辟免冗长指令串或重复显示﹔会将之缩短，例如：

边|更改出/进L/R。

若依版本或内容不同而功能有限制的选项，会以大括号表示，例如：﹚Z﹛

手册中，指令交叉参考时会以不括号表示，例如：

?请参考档案|规划允许倒回的次数，第21页﹙

显示了菜单及指令和对话框选项。

!!注!! 注解以此惊叹号和大写黑体字表示

APS (AlphaCAM Programming System)在某些地方仍用到(例如APS 快速几何图形)。是为了与DOS版的APS在档案及扩展名等保持兼容之故。

AlphaCAM 介绍

AlphaCAM NC机器计算机辅助设/制造系统系为英国，Coventry所在的Licom Systems公司所发展及拥有各版本皆适用于Microsoft Windows,3.x,Microsoft Windows 95@,and Microsoft Windows NT系统。

AlphaCAM-CAD为没有加工菜单指令的3D铣床模块。在此可作2D及3D的构图，但不能产生NC码。

软件保护

AlphaCAM 软件系Licom Systems公司所拥有并享智慧财产权法律的保护。软件系用一外接的密码锁接在计算机的并按或串接阜上面来保护。若此密码锁未装上，晨进入上，但仍无法进入系统，请先检查系统主目录，(如ALPHA197)下的KEYTYPE.INI档案。此文件告诉系统到裹找密码锁。在档案管理员中，找到此档案，点选二次，即会将之载入到记事本中供编辑。

系统操作时，会不定时检查此密码锁的存在与否。因此使用时，请勿将之移走。但在某些时候，例如密码锁后面接了一台打印机时，有可能造成系统找不到锁。倘此发生时，系统会将屏幕上所有数据存到LICOMCFG目录下的!!!.3档案，再离开。

当密码锁问题解决后，重新启动系统，选档案|开启旧档Ctrl+O，在开启旧档的对话框中，按DOS档案，!!!.1,!!!.2及!!!.3即最先显示出来。

AlphCAM和“标准”窗口用法的不同

参照数字的输入角度，第错误！尚未定义书签。页

AlphaCAM的用法全部和Windows的规则相符，并额外增加一些让使用者更便利的操作。例如，在对话框中，按Tab可跳到下一栏，而按Enter如同按OK，同Windows一样。但在提示列中输入X，Y坐标值时，（例如输入线端点坐标X，Y）可按Tab或Enter跳到下一栏。而当二值皆输入后，按Enter表示确定“完成”，如同按OK一样。

若要输入XY或﹚Z﹛坐标值时，在该栏内按X，Y或﹚Z﹛，则前一坐标值的X，

Y或﹚Z﹛会被叫出来。若在Y栏中，按X，则将X值输入Y坐标栏中。

在任何数值输入栏中，可以任何数字式表示输入。

选取多个图素时，Esc或按右键表示‘选取结束’。而构图时，按Esc或按右键则表示‘构图结束’。

按Spachbar会呼叫前一个指令，包括在编极︱倒回Ctrl+Z之前的最后一个。

在档案︱储存档案或另存盘案…对话框中按Creta Dir即可产生档案的目录。

在对话框上的屏幕前头按Esc或按右键，表示‘回到前一对话框或指令列’。

如同标准窗口，按F1表示“辅助说明”。但在AlphaCAM中，但在AlphaCAM中，除此意义外，在提示列出现‘F1＝？’时，按F1表示‘未知’所需之值。系统会另外问其它信息来解此未知坐标图。

步聚：输入数目及角度值

(参照宏指令的数学功能及AlphaEDIT手册中有关后处理器的章节)

键盘上的数字输入可用数学或三角函数，例如2.56+5.67-1.23，或(1.25-4.7)/2，SIN(60.5)+6.75。

在对话框中，Tab 键跳到下一栏，而Enter键则如同按OK，而其它字段即依输入之值。

构图时，在提示输入X，Y坐标时，可按Tab或Enter跳到下一字段。若值未知，可按F1或按输入字段旁边的？钮。当二字段皆输入值后，按Enter表示‘完成’，如同按在OK一样。

有效的数学式包括

+﹔-﹔*﹔/﹔SQR()﹔ABS()﹔MOD(，)﹔LOG()﹔LOG10()﹔INT()﹔SIN()﹔COS()﹔TAN()﹔ASIN()﹔ATAN()﹔ATAN2()﹔COSH()﹔AINH()﹔TANH()。

所有角度值，是以度来表示的。而且P1=3.14159(键入文字P1)。

P**X表示P的X次方(若P为正数，X可不必为整数)。

英制时，可输入分数，例如13/64。整数加上分数则为1.875C可以1+7/8 OR 1 7/8表示。+号可以用一空格来取代。

角度则可用10进制或度分秒表示，例如，12.34或12D 20M 14S。

公用指令图像及其它相等之功能

公用指令图素有相等的功能键

F3=正交模式

F5=网络抓点

F6=端点

F7=中点

F8=圆弧中心

F9=交点(线或弧)

F10=正切于

F11=垂直于

F12=平行于

而且，

F1=未知

F4=封闭与结束新的几何图形

窗口屏幕摆置

建议使用最少为1024*768的屏幕分辨率。若解析只有800*600(SVGA)图像可能太大了，不方便摆放，且占去太多空间。因此不建议使用(VGA(640*480)。请议PC 的内容，调整计算机的分辨率。

步聚:使用AlphaCAM

选用系统的指令或项，可使用指标移到主菜单上，点选，再点选所要的指令或选项。或者，可用“滑移或释放”的方法，将指标置于所要的主菜单上，按住鼠标左键，拉出下拉屏幕，不放掉鼠标左键，并移到所要的指令上，再放掉鼠标的左键。

上二例中皆然，若选项左边有一小黑三角符号，即表示项有次菜单，提供更多选项，若用“滑移即释放”法，只须继断移动指针至次菜单的选项再放开即可。某些指令或选项是可‘开/关’型的。选表‘开’，再选‘关’。若目前该指令或选项为已被选取则此指令之前会有一打勾符号表示。

以键盘输入数值时，其提示列可为在顶部或底部，或为‘浮动式’可置于任何地方。利用档案|系统规划…来设定。若设定为“浮动式”则需要时，提示列才出现，不用时，即自动消失。

屏幕最底下为‘状态区’，表示目前选用指令的状态。在此栏中，亦有目前光标所在位置的X，Y，{Z}坐标。而此栏最右边，则是显示正交和网格模或网格抓点的启动与否。

图像棒

若想保有最大的工作空间，可将所有图像棒关掉。在档案|系统规划…中，设定适当选项，即可决定图像棒显示与否。或则在每一主菜单的下拉选项中，开/关图像棒选项。若图像为显示，则该图像棒项前有一打勾符号表示已开。

图像棒的位置，要任意摆放﹔离开系骆，再进入时，会自动记起离开之状态。要移动图像棒，请用鼠标在键选图像棒？(非按钮)，并拖到所位置。若要旋转，则是先按住Shift键，再按鼠标左键，再放到Shift.可将图像棒留在屏幕上，任何地方，或“停泊”到任何屏幕角落。

按在图像按钮，即直接呼叫该指令。若只把光标停在图像钮上而不按，则会有该钮的功能/名称显示在旁。

不用图像钮，只用下拉屏幕亦可操作系统全套功能。但图像钮较快，因此建议多使用。

磁盘档案的密码保护

安装后，系统要完全使用所有系统资源。但若需要，要加入密码保护，以避免不相干人员动到系统，即需输入密码，系统主要磁盘系指主目录(如Alph197)或LICOMDAT及LICOMDIR所在的磁盘。

而在其它磁盘上的档案即不受此保护﹔如在软盘机上的软盘片等。

设定及移除密码的方法，只有由客户公司职权内人员的书面申请才行。

保护的功能有：

由磁盘删去档案。

重新命名任何档案。

覆盖去任何一个档案。

删去一个目录。

重新命名一目录。

备份目录。

载回报份之目录。

设定参数，例如RS232 I/O

档名及储存

APS檔名命名法不受DOS及Windows 3.X的8位限制。NC程序，刀具，后处理器…等，皆可用长文件名，如同窗口的规定。

系统储存图及NC在内定的LICOMDIR目录下。可以自由产生任何的目录(在档案|储存档案Ctrl+S 或另存新檔…|APS|另存新文件中按产生目录钮)

和Windows规定一样，亦可储存长文件名档案到根目录下。

第二章档案

此章说明档案下拉划幕下的指令。主要为有关加载及储存档案，输入及输出数据。以及规划程序运作，文字字型，打印等的指令。

开启新档…Ctrl+O

此指令读进AlphaCAM构图画面产生的所有图素，路径，层…等。若内存内尚有档案未存，系统会提示存盘。若记忆内没有东西，系统自动将档案大小调整到符合整个屏幕。

若内存中已有档案，该档案之文件名会显示在屏幕最上方以及档案对话框中档案列的第一个。若内存中没有档案，则最近使用过的档案会排在第一个，其它的则依字母顺序排列。

在此对话框中，可让你更改目录及磁盘等。并显示目前磁盘的可用空间大小。同时有OK及Cancel按钮及搜寻，重新命名及删除档案等按钮。

若要加载最后一次使用的档案，只须按OK或Enter。若要另一档案，则只须在该档名上连点二次或点档名一次，再按OK钮。若档案太多时，系统会有一拖拉

钮，供下拉，显示档案。或者，你可以用下列二方法来找档案。

1、按住鼠标左键，扫过第一个档案(反白)。然后输入所需文件名中的字母。则

系统将相符这些字母的档案反白且带到窗口上部来。

2、若不知档案存在何处，可按“搜寻”按钮。对话框出现后，打入文件名的任

若按目前目录钮，所有含输入字母的档案皆会出现在|开启档案的对话框中，供选取之。

若按所有目录钮，另一窗口会显示出所有含输入字母的偿名及其所在的目录骨，即目录：檔名。

选取档案，只须在其上连点二次，或点选一次，再按OK钮。目前目录即换写此文件之目录，而档案也已加载内存中。

在|搜寻框中第三个按钮为“显示所有档案”，此钮只有搜寻完毕后才有作用。按此钮，将目前目录的所有档案显示出来。

若要载入DOS档案，按DOS档案钮。此为开启旧文件的窗口，但多了一个APS 的按钮，让你回到|APS开启档案对话框。若选开启旧文件指令时…Ctrl+O，出现的是此对话框，表示上次使用此路径，只须按APS返回即可。

只有在选了档案之后，“重新命名”钮才有作用。欲重命名时，选档案(反白)，再按“重新命名”钮。在新对话框中，旧文件名反白显示，只须输入新名，即将之盖去﹔若只要更改它，鼠标轻点在文件名任一地方，档名即不再反白，再用箭头移动，输入所要的，再按OK或Enter键即完成。

若新文件名与目录中档名相同时，重新命名无效。按Spacebar键可重新呼叫“重新命名”功能。

只有在选了一或多个档案后，“删除”钮才有作用，要删除时，选档案，按“删除”钮。

若要删去一连相连的档案，可以将光标放在第一个档名上，按住鼠标左键，再拖以最后的档名，释放，所有的选取档案即反白表示。或者，可以先点选第一个档案，再按住Shift键，选最后一个档案，如此，其中间所有档案即一并被选到而反白。

若要删去不连在一起的许多个档案，可先选第一个，再按Ctrl键，一一点选要删去的档案。或是，用Shift+鼠标左键，选连在一起的档案，再以按Ctrl键，点选其它要删去的个别档案。

选取完后，即按“删除”钮。系统会要求确认是否删去N个档案。

另存新檔…和储存档案相近，但可让你输入新的档案。

在储存档案及另存新档…时，若会写到同一个文件名时，系统会要求确认。若按NO钮时，︱另存新档对框会让你更改文件名或目录。

第一次储存时，应用另存新档…给它个名字。若选用储存档案时，系统会︱另存新档对话框供你输入档名。

插入图档…Ctrl+Ins

将一档案加入到内存中。新图会以白色显示，而O，O点在光标上，可以输入此档O，O所在的坐标，或按住鼠标左键定位。

此框中可让你更改目录或磁盘，并显示出目前磁盘中可用的空间。用时，亦有OK，Cancel以及搜寻，DOS档案，重新命名以及删除按钮。

步骤：

更改目录

存取文件时，更改目录抽在。在档案︱开启旧档…Ctrl+O或档案︱另存新档…的对话框中，点在目前目录旁的小箭头，所有的目录即显现，若目录太多时，左边即有一堆拉钮，可下拉出所有目录。点所要的目录上，即变为目前的目录。若看不到所要目录，用推拉钮来找目录，或者按目录名第一字母的键。若许多目录字母开头时，再按按第一字母键，即会显示同字母开头的下一个目录。选取反白的目录或按工OK钮即可。

输入NC…*

将手写的或其它CAM系统产生的NC程序读进系统成为路径或图形。除了车床系统外，系统可自动解释任何标准DIN码及其合理的变异。（即GO1/2/3G90/91 G41/42G84-84），以及Micon或Heidenhain MDI码。而且不须指定后处理器。若NC有循环指令或子程序则可能会不对，因其变化太多了。

车床中，系统会要求先选后处理器，因为系统必须之到NC用的是直径或半径值﹔以及G02代表或反转等。此后处理只要和NC相似即可，不用是同原来的一样。反读时，系统问是否要一行接一行读。若设为是，则每一行NC会显示在屏幕底﹔而且会有一小方框在左下角，显示目前的‘S’速度，‘F’进给，X，Y和Z。而且，只要碰到有T码，系统会将刀库显示出来，供选取该把刀用。

输入CAD…Ctrl+T档案种类

对话框中有DXF，IGES，CADL，ANVIL或VDA-FS格式供选用，可将任何CAD 系统相同格式读入。标准版则只有DXF和IGES格式可用。在CAD中相连的图素，在读进时自动连接，除非将“连接图素”选项由内定而关掉。

3D铣床系统多了输入3D XYZ点的选项﹔可将任何三次元量测试（反工程）的断面数据曲面一（参照输入CAD…︱档案种类︱3D XYZ点）。

CAD文件中若有不同层，系统会将之分配到使用者层中。必要时，系统会在使用者层中给予层名。使用者层系在CAD︱使用者层…Ctrl+U中。每一层会依系统的内定方式给予一种颜色。例如几何图形为绿色。而不同曲面即给不同颜色。若指令某层为某一颜色，则层中所有图素即以该颜色显示。

但上述原则不适用于多折线，曲线或STL文件（STL为以多折线形式的三角形）。它们仍在CAD的各层来存，但为表示它们非2D图素，3D多折线经红色表示，而2D的曲线为橘色，而3D曲线为黄色，不管它们是在何颜色的层中。

若一层中有多个曲面，这些曲面皆以层指定的颜色显示。但可用编辑︱更改…从旧图层，到几何图形，将之转为APS内定曲面层。此时每个曲面即以不同颜色显示。

上述有些例外如下：

1、C AD文件中，系不含路径的。所以若图层中有层名叫“刀具路径”，此层会

被放到APS的辅助图素层。此时，可用编辑︱更改…指令将之更改为可以加工的几何图形。

2、若CAD文件中，有文字。此文字可被忽略或输入为几何图形或辅助图形。依

系统的字型，并放到APS的系统图层中。此时可用编辑︱更改…指令，将之移到你要的层。系统将文字加载时，即转化为可加工的点线弧。

3、因此档案必要时，可以忽略，不要读入。

输入CAD…Ctrl+I档案种类︱3D XYZ点（3D铣床系统）

（参XYZ点格式）

所有商业版系统皆可读入三次元量的点坐标档案，并产生为3D多折线或2D平面上的线。曲面可用几何图形︱3D曲面…断面曲面指令来产生。此为参数式的cubic Bspline方程式，可精确描绘曲面。

点档案可以是任何类型档案﹔若档中开头有注解，请用编辑器在注解和点坐标间，加入START来区隔。点系定义一条条的断面线。断面线可以不是平均间隔，可以是任何顺序。而每一断面线中的点数据，其间距亦可不固定，但须是依序的点。

2D的线段若是在X或Y方向，系统可自动侦测线段的结束/起始点，可用，可不用线段结束符号。但若2D线段不是在X或Y方向，则每断面线皆须有结束符号。

若选输入为3D多折线，那么断面线可为任何方向，不用每条皆互相平行。

若没标示结束符号，系统即要求给予一2DON断面线宽度公差值。此值系在计算断面线时使用。例如量测断面线时，量床公差可能为+/-.03﹔那么，反读时，可给予0.1的公差值。

步骤：

XYZ点档案格式

若每一断面线皆以结束符号区隔，那么只要给足够的字符供系统判断即可。例如，结束符号为

‘＃..Rapid X..Y..’

那么只要输入RAPID为结束符号即可。

XYZ值可以’,’,空隔或二者来分开。若X Y和Z字母有用﹐数字可为任何顺序﹐否则﹐得依序标示﹐例如﹐A=1,Y=2,及Z=3可表示为﹕

1 2 3

1﹐2﹐3

X1 Y2 Z3

X1, Z3, Y2

Z3 Y2 X1

若使用了X YZ字母﹐那么重复的字数值﹐可以省略﹐而所有行中的其它字符及

数字也会被略去﹔例如﹕

START ‘START可用/可略看情形

Seq 0.4m Z -0.2 X -0.1 Y 0.4

POINT # 22

SEQ.NO.4mm Z –0.3 X –0.1 Y 0.7

POINT #23

SEQ.NO. 4mm X –0.2 Y 0.9 ‘Z值同前-Z值

输入CAD…Ctrl+I 连结图案

若保留内定的输入CAD…连强图素为是﹐可输入欲忽略’断点’的尺寸。通常0.01即可﹐此系考虑CAD制图时﹐应连强接图素﹐有时有小断点或重迭。而CAD的储存系依构图的连续﹔AlpaCAM在读入时﹐会自动将连结图素形成一图素（并考虑上述断点公差值）。

若想保留和原来CAD一模一样的状态﹐只须关掉连结图素的功能。如此即不会任何的更改﹐这在输入3D的CAD图档时﹐有时得用到。

输出NC…

依档案|选取后处理器…的设定﹐将路径或图形的NC码存到记忆中。请参照AlpaEDIT手册说明﹐如何设定适合使用的后处理器。必要时﹐系统会问是否输出全部加工道次或只有可见的加工道次。

通常系选用全部加工道次﹐但有时须将某些道次输出为一条程序时﹐系统会提示NC可能不完整﹐届时你得费心检视NC码头尾是否正常。

欲将NC码传送到机器上﹐先选档案|Ctrl+S,存起图形﹐再选档案|输出N C…将NC存在内存中。再用AlpahEDIT中的传输指令﹐可传/收到任何控制或RS232的设备的数据。

输出CAD…

若有隐藏图素时﹐系统会问是输出所有图层或可见的图层。若选所有图层则不论有否图素隐藏﹐即一并输出。但没有任何图素的图层﹐则予以忽略。若选限可见的图层﹐则隐藏的图素﹐即不被输出。

若选的为DXF档案﹐则APS内定图素﹕几何图形﹐辅助图形﹐刀具路径﹐尺寸﹐曲线﹐曲面及使用者图层﹐会以其层名输出（只要不是空的）。

因DXF层名不能有空格﹐所以有空格的即以小断线取代而输出。而IGES档案则不用层名﹐改用号码。因此APS内定图层即以数字1﹐2﹐3…来取代。而使用者层则为接续其后的数字。

选取后处理器…

加工产生刀具路径﹐再转NC码时﹐即依此指令所选的后处理器来产生﹐后处理器系在AlpaEDIT中定义﹐请参考该手册﹐以了解如何做适合的后处理。内定的后处理在清单中以绿色显示。可加以更改为你适用的机型。

任何时间选取后处理器后﹐即可得到不同的NC格式。此功能可在任何时候选取

执行。

每次重选此指令﹐后处理器所有的变量值皆会重置。因此再列出/输出NC时﹐即会再要求输入变量的值。此法可供简易地修正输入错误值时的修正法。

列出NC码…Ctrl+L

NC码系以目前选定的后处理器来转出NC﹐此后处理器即显示在窗口之顶。若无刀具路径时﹐即将几何图形输出﹐但没有换刀﹐进给﹐转速或Z值等。若有刀具路径﹐则系统会再列出加工道次及所有刀具和加工时间等。且系统刀路有所隐藏时﹐会有显示全部和只显示可见的供选择。

若有道次隐藏时﹐只选可见道次输出时﹐所有的加工道次仍全部列出来（名称﹐刀具﹐加工时间…等）在程序之头﹐但只有可见的道次有NC码列出来。

转/列出NC时﹐一遇须输入数值的变量时﹐系统即停下﹐并于提示列要求输入数值。

在全部NC列完前﹐显示框下有下一首及列出全部和Cancel按钮。但列出完毕之后﹐则只剩Cancel钮。若程序表过显示框﹐则框右侧有一推拉钮﹐供往上/下推拉检视NC。若点在某行NC上﹐该行即反白﹔并保留反白﹐即使已出显示框外﹐如此可让您在某行做一记号﹐方便检视之用。

清除内存…Ctrl+M

可保供删除几何图形﹐辅助图形﹐刀具路径﹐尺寸﹐曲面﹐曲线及使用者层。而删除全部图层﹐则删去内存中所有东西﹐包括供编辑Ctrl+Z叫回的记录。选删去全部图层时﹐﹐系统会警告没有存盘。若要叫回之前删除全部图层的东西﹐只能呼叫回自动存盘保留的东西了﹐（参考档案|系统规画…l自动存盘间隔（分）﹐第21页）。

系统规画…

对话框供开/关图像棒﹔提示列在屏幕之顶或底部或浮动式。自动存档的时间间隔及可倒回的次数。或设定内定的字型。

自动储存间隔（分）

自动将记忆内容存到磁盘的时间间隔。储存的档案系在目录LICOMFG之下﹐分别为!!!.1﹐!!!.2 and !!!.3 (!!!.3 为最近一次的存档)。

此功能在长时绘图而忘了存盘或计算机中途不幸断电等时有用。或在做了大错误后﹐亦可叫回之前的自动存盘档案。之所以有3个档案﹐是为了方便在刚自动存盘前﹐若有重大错误﹐可以呼叫此储存之前的!!!.2 或!!!.1档案。

叫回自动储存的档案﹐选档案|开启旧档…Ctrl+O﹐并选DOS档案。自动储存的档案即列在LIOMCFG目录的最前端。

字型

此指令有次显示框﹐供选产生或修改字型﹐以供在几何图形|字型…指令中使用。

|定义新的字型

此指令加载一空白的格框﹐供置入字或图形﹐以作为一新的字形。要放入格框的

图形﹐必须完全置入才行。

每一格框中有一白色角落﹐定义此字型的参考零点。而另有一字母﹐表示呼叫此字型的键盘字母。而此字母包括F1-F10键﹐如此可让你用一个键即呼叫出特殊的几何图形。

为字型产生及使用方便性﹐每一字型皆以一10单位为基准。因此﹐系统中输入的高值﹐皆除以10。例如公制中﹐要高25mm,则输入值为25。若英制﹐要高1英寸﹐则输入值为1。

系统会考虑斜度垂直或弧形边而自动调整文字的水平位置﹐使你可将文字左下角置于参考零点﹐某此字型﹐或许放在参考零点的左或右边一点较好。而基准零点系以5个单位为一间隔﹐所以用公用指令|设定纲格/正交…l纲格间距﹐设值为’5’而设定抓点模式﹔来抓点以确定文字于所要的位置。

此指令不包含在标准模块内。

开启字型供编辑

将字型加载供进一步调整﹐修改。完成后﹐须选档案|文字字型|储存目前字型将之储存﹔若无此动作﹐系统会警告。

参数式宏指令…*

将AIPhaEDIT所作的宏指令读入来产生几何图形﹐选取刀具﹐加工﹐产生NC等﹐宏指令可包含显示列要求输入数值﹐此功能可供做相近的族群的工作﹐请参阅AIPhaEDIT手册的详细说明。

打印机/绘图机…CtrI+P

（参照下面打印预视）

系统会将图置放在图纸中心﹐在印完第一个图后﹐可载入另一个图﹐再删去第一个图﹐打印时即不会重迭在第一个图上。

对话框中供你设定打印的细节﹐例如是直或横印﹐是否印出X/Y轴向等﹐另可将输出存到一个档案﹐而非打印机|绘图机。

比例可以是自动（填满纸张）﹐或设定一个值﹐而图的单位即乘以此值﹐图尺寸可为公式英制﹐以利系统将之和图纸作一比较﹐在此公英制不可互换。

在打印机/绘图机旁的我按纽﹐可呼出窗口中打印机﹐绘图机的起动程序﹐以作…进一步的打印质量之设定。

打印预视…

将打印的结果显示在屏幕上﹐此打印结果是依档案|打印机/绘图机…CtrI+P选项中所高定而印。

若在预视中﹐选打印按纽﹐则打印机/绘图机的对话框出现供确认是否印XY轴向﹐及打印为直式或横式等。

离开

离开系统﹔离开前﹐系统会提醒任何未输出NC码的加工路径或未储存的文件安。

第三章编辑

编辑指令介绍

在2D时﹐指令即如其名一般的功能。但若有3D的工作元面体存在﹐则必须考虑﹐是否有选取工作平面。若无工作平面被选﹐则内定为3D﹐例如编辑|搬移﹐拷贝

选取图素时﹐可一一点选或框选之﹐只有完全框到的才选到﹔而再选则可去掉﹐按Esc或R-结束前﹐可再加/减选取之图素。

倒回Ctrl+Z

可倒回大部份的接线员令﹔例外的﹐不能倒回的为﹕

显示指令（例如显示窗口Ctrl+W）

档案|开启旧文件…Ctrl+O（除非内存未清除）

档案|储存档案Ctrl+S

档案|输入NC…

档案|输入CAD…

档案|输出NC…

档案|输出CAD…

档案|清除内存Ctrl+M（若选取l全部图层时）

例回的次数在档案|系统规画…中设定。理论上﹐此数目可为无限大﹔但每个动作皆须有内存来记录﹐因此数目太大﹐将占去太多内存。建义数字为10。

若你作复杂曲面而须大内存来储存时﹐可以在档案|系统规画…中设倒回次数为1﹐并随意画一条线﹐删除之﹐以节省内存。

删除Ctrl+Del

选取完毕后﹐第统会警告有多少路径及图形将被删除﹐并在求确认。而材料框及辅助图形皆视为几何图形。

选取完毕几何图形或刀具路径后﹐按OK或Cancel则再回到删除的模式下。再按Esc划R-即离开此模式。

若选取了几何图形或刀具路径。系统要求确认删去二者或其中之一。若按在除了

Cancel键之外的键。会要求按OK或Cancel确认如上所述。若按耷笪Cancel上﹐则放弃删除指令。再按Esc即再呼叫删除指令。

若在删除模式中﹐前一选项钮可再选前次选择之图素。再来可增/减选取所需图素。

下刀点﹐排序

|下刀点Ctrl+F

设定封闭图素/路径的下刀点﹐而开放的轮敦则只能在二端点之一端为起点。可用加工|刀具方向…对话框中的反向选项﹐来切换起始加工之端点。

|第一的…

指定为第一个切削的几何图形或刀具路径。

|排序…

排序几何图形时﹐没有任何的限制﹐即如指示进行﹐而排序刀具路径时﹐则只限排同一道次（刀具）内的刀具路径。因为将一刀之路径插到另一刀的路径之中间﹐是没有意义的。若选取无效的路径﹐系统将予以忽略。欲更换道次的顺序。请用加工|编辑加工|加工道次…Ctrl+E指令。

若有作刀具路径拷贝为子程序形式。则子程序呼叫之顺序可更改﹔但子程序中的刀具路径则不更改。但原刀具路径则可再更改﹐排序﹔而子程序即依之而更改。搬移﹐拷贝等。

|搬移

将几何图形或刀具路径搬到任何位置。可一一选取或框选图素。再设参考点及新点位置。搬移时﹐选取之图素即以白色框﹐在参考点显示于光标上而显示。点选或输入新点位置即可。

若移动量已知﹐而不知坐标﹔则参考点输入为0﹐0﹔而新点即输入该移动量。|拷贝

拷贝图素到新位置﹐仍保留原来之图素。若拷贝的为刀具路径﹐系统即要求确认拷贝为线性拷贝﹐刀具排序或子程序拷贝﹐刀具排序。

|重复

为拷贝的延伸指令。在指定的方向上复制图素。如同手搬移和拷贝﹐须输入参考点。而要求位移量时﹐可以鼠标带者百外框到新位置或输入复制图素之间的位移量。

若输入值为位移量时﹐X﹐Y﹐[z]值为距参考点之值。输入的坐标非第一个重复的图素之坐标﹔除非参考点设为0﹐0。

再来系统问须拷贝几个（包含原来的）。若输入值为’1’﹔则没有任何复制。因第1个即为原来的。而复制的方向﹐即为选取或输入的位移量之X﹐Y[Z]值。

|旋转

以基准点﹐将任意数之图素转以任意角度。在输入基准点之后﹐系统会将图素以百线表示﹐并在图素与基准点之间连以一直线﹐表示由X轴起之夹角。角度值显示在底下状态列右侧。

|数组

系统要求输入XY向的数量和位移量。产生顺序为X向﹐再来以来回﹐向Y向产生。

|镜像

此指令可将任何图素变成对称图素之一半。而镜像系对一轴线而为。此一轴线即告诉系统镜像之方向。而此轴向可为任何长度之线段。

选定完轴线之后﹐系统及间是否保留原有的图素。否﹐则删去原图素。是﹐即保留原来图素。

若镜像的是刀具路径﹐所有镜像之刀具即的以保持原来之切削方向。

|此例

选完图素后﹐系统要求一参考点。若非重要此例于一特定点﹐可点任何点或输入任何值（例如0﹐0）。

再来是X向的此例值及Y的此例值﹐后者内定同前者。若要相同﹐按Enter即可。在此同前一样﹐可输入任何的数学计算式。

若仍在此例模式﹐则X及Y的此例则仍保有原来之值。如此可对许多图素于不同参考点做相同比例缩放。一离开此模式后﹐此例值即重复为1。

若此缩放的为弧而X和Y值不同﹐则弧将由每象限4个由点隔开的弧形成。每个弧与相邻弧皆为1度误差内正切。

若此例的为一刀具路径﹐则路径更改﹐刀具并不变﹐因此加工即不如原先所希望﹔最好删去路径﹐重做。

裁断﹐连接等

|裁断

(参照修剪﹐第29页)

可将任何几何图形或刀具路径﹐以指定点或以切割的图形﹐辅助线将之打断。此可将连续图形之一部份删去。若显示|显示选项√显示刀具方向为开﹐则每一几何图形即有一刀具符号于起点。若此塞满屏幕﹐可将之关掉﹐另打开显示|显示选项|√显示断点来显示出图素之起点。

|修剪

类似裁断﹐打断并修剪几何图形及刀具路径。先选相交之几何图形可用框选﹔再选要修剪之图形或路径。选取的部份将被删除去。

|分解

将几何图形或多折线分解分离的线和弧。

|连结

将头尾相连（非相交）之图形﹐辅助线或刀具路径（同一把刀﹐同加工条件）相连结成一连续的元素。可用框选选取图素。而图素方向会调整为一方向。请用显示|显示选项|√显示刀具方向来检视结果。

若连结不同种类的图素﹐则将变为优先级高的种类图素﹕刀具路径﹐几何图形再辅助线图形。例如一刀具路径与一几何图形或辅助图形相连结﹐则新的连结图

素即变为和原来这路径﹐条件相同的刀具路径。而相同层之图素﹐相连结后仍在同一图层。不同层之图素﹐相连结后﹐即存到APS的内定图素。

此指令亦可将分开之3D我折线相连结为一条多折线。

|延伸

要求选取边界﹐再选要延伸的几何图形。线或弧的端点﹐与边界较近﹐而有交点者﹐即予延伸。

|倒圆角

输入所需倒角值。若只需在二图素间倒角﹐则选单一（选二图素）钮。再选线段或弧二图素。此二图素不见得须在屏幕上相交﹔系统会自动找相交点。而原有这例角会被新我你倒圆角取代。

若要倒一整个图形的所有角落。选’全部’（如刀具方向所示）钮。所有外部的锐角即倒角﹔而内部角落则保留。内外部角落的判定﹐是以刀具方向而定。若刀具方向在线中心。则所有锐角皆倒角。但所有已存在倒角皆保留﹐不取代。

|倒直角

欲在二图素间素倒一直角﹐点单一（选二图素）钮﹐并输入倒直角第一及第二个之距离。选取二线段（非弧）则在不一定于屏幕上相交的二线段间﹐加入一倒直角﹔旧的会为此新的取代。

欲倒所有角落之直角﹐选全部（如刀具方向所示）。所有外部角落即予倒角﹐而内部角落则略过。内外部是以刀具方向而定。刀具方向在图形中心时﹐则所有角落皆倒落角。但原有的倒角不会被取代。

|偏置

可将线﹐弧或整个图形或曲面偏置一距离。若未选用者层﹐则工作在APS几何图其的层。若单一线或弧偏置。结果即为辅助图形的线或弧。若偏置的为整个几何图形﹐则看辅助图形指令是否开启﹐而为几何图形或辅助图形。

若有启动一使用者图层﹐则偏置的永为几何图形﹐不管辅助图形指令是否启动。若偏置的为曲面﹐则选取之曲面会以指定距离依曲面方向偏置。原贡面仍保留﹐必要时﹐应删除去。偏置值须为正值。而偏置方向即依曲面之方向﹐可由显示|显示选项|√显示刀具方向指令来显示。

更改…Ctrl+H

将图素由某种类更改为另一种类或至另一图层。更改的选项为﹕

从﹕

几何图形辅助图形材料

刀具路径切削进给快速移位

尺寸旧的图层

到﹕

几何图形辅助图形材料

刀具路径切削进给快速移位

尺寸激活的使用者图层

某些更改是不允许的﹐例如几何图形变为刀具路径﹐因它不具有刀资﹐Z值﹐切削速率等。而反向则可﹐因可丢掉加工的信息。可与不可再对话框中﹐会自然显示。

几何图形﹐辅助图形﹐刀具路径﹐切削进给入快速移位﹐即APS层之内容。而旧的图层﹐即值另它图层入一使用者层。曲面和曲线可更改为启动的使用者层﹐以方便显示与否。3D加工时﹐可对任何图层之曲面加﹐因此不受此影响。

聚合

将选取之几何图形或辅助图形﹐予以一聚合号码。刀具路径不能聚何﹐因刀具路径之聚合号码系用于子程序路径之关联。

任何编辑指令作用于所有的聚合﹐即使仅聚合其中之一被选取。因此聚合图素可一并被拷贝﹐搬移﹐旋转﹐删除等。存取并不影响聚合之型类。

聚合号码为透明性﹐即未清除内存时﹐加载另一档﹐而有重复号码时﹐系统自动新排号。

键入的文字﹐每一字皆自动聚合为一单元。所以只需一点取即可选得由数个图素形成之文字。

加工|刀具方向…指令不适用于聚合的单元﹔例如A字母﹐可设方向在A外部﹐而内之三角形为内部。但所有加工指令皆适用于聚合单元。

此法适用于加工一群孔﹐此时只需选一个孔。或加工一群字﹐此时只需选一个其中之图素。但有时亦有不便之处﹐此时用编辑|炸开聚合即可聚合之图素恢复为原来之单独图素。

炸开聚合

将聚合之图素﹐分开为原来之单一图素﹐其功能对刀具路径没有效用。选取时﹐可直接选或以窗框框选之。

第四章显示

此章指令皆与显示于屏幕及如何显示于屏幕有关。显示窗口，平移，重绘及显示先项等指令皆为透明的。即表不论在执行何指令时，皆可来执行此指令，而后回归到原来指令状态下。

显示全部Ctrl+A

将内存中（除了隐藏及使用者外）之图素全部显示出来。若在APS快速几何图形中选用了显示︱显示全部指令，此指令即保启动状态﹔如此，在作图时屏幕

大小即随作图大小自动变化。

显示窗口Ctrl+A

(参照显示3D窗口)

将部分图素放大到全屏幕。以鼠标左键光标点一一点上，拉到对角。框选范围内之图素即予放大到全屏幕。（若用显示︱3D窗口3D则充满该窗口）。

前一窗口Ctrl+B

将现在显示窗口之前的窗口显示出来。

窗口缩小Ctrl+PgUp

将窗口缩小约1/4按Ctrl+PgUp即刻执行缩小。按住此键则持续缩小。若3D窗口已开，则作用窗口缩小﹔若无作用窗口，则3D等角窗口随之缩小。

窗口放大Ctrl+PgDn

将窗口放大约1.4倍，Ctrl+PgDn即刻执行放大。按住键，则连续放大，若3D窗口已开，只放大作用之窗口。若无作用窗口，则只有3D等角窗口放大。

显示极限

显示于显示︱设定极限中选定之图案。而显示︱显示全部Ctrl+A则将内存中所有图素显示出来不管有否极限设定。

不移窗口Ctrl+

在不更改屏幕比例下，将屏幕移动更改﹔例如将屏幕上看不到的部份，移到屏幕上。在所要的位置，按下鼠标左键，将光标移到所需位置，系统以白线，显示此二点这距离与方向按鼠标左键确认后，屏幕即重绘。

Ctrl+，则屏幕即依箭头按钮方向平移。按拉方向键这，则连续平移。若3D窗口有打开，则平移只作用于作用的窗口﹔若无作用的窗口，则3D 等角窗口平移。

重绘屏幕Ctrl+R

将目前屏幕在不更动任何尺寸及窗口下重新适合在更改屏幕图素之后执行，以确定是否下确。系统为减少时间浪费，绝少自动重绘，必要时，即选窗口︱重绘显示选项

在显示︱显示选项下有六个指令。若选用后，将会以勾勾表示。且即刻生效，若想同时选显示︱显示选项︱单节执行及显示快速位移和︱显示刀具，则以按图像钮再按重绘钮快。

︱显示刀具方向

（参照松散/非松散边界）

以一小圆圈加小箭头表示图形之起始点和方向，以及此图形刀具是走在中心或任一边。此图圈图形为固定大小，不因为屏幕尺寸分辨率而变，亦不代表实际使用之刀具尺寸。

图形画完后，内定的刀具方向为中心。可用加工︱刀具方向…来改变它。而此小圆圈符号亦代表此几何图形为松散或非松散边界。

而在曲面上时，此符号为一3D的小箭头，指向曲面欲加工的面上。可用3D︱刀具方向指令来更改之。

显示刀具

若显示︱3D窗口3D关掉（即只显示XY窗口）则在每一线/弧之起点，皆有和刀具直径相同的圆代表刀具。

若显示︱3D窗口打开，则3D显示的刀具即表示刀具切削情形。按PgUp可加速，而PgDn减速﹔而按Spacebar则回复到回来的速度。每次按PgUp和PgDn 皆为以2倍加，减速。所以只要多按几次或连续按住一下子，即为最大/最小速度。

︱显示材料切削

以材料为刀具切削去的模拟。若切削为零预留量，则尖角切削不到之处，即以白色表示，可清楚看到刀具太大，切削不到之处。若显示︱3D窗口3D功能打开，则此仿真仅显示在XY窗口（平面图，右下角）

︱单节执行

按Enter或鼠标左键会执行一线段或弧的切削。若按住Enter，则连续一步步执行。在左下角，有一方框，则显示每一步切削的‘S’速度，‘F’切削进给及每线/

弧的起始XYZ值。

︱绘图快速移位

若无刀具路径，此快速位移表几何图形之顺序（3D铣床不适用）。若有路径，则表示刀具切削之间的快速位移。

︱显示断点

若开启显示︱显示断点︱刀具方向显示的圆圈可能太多太大，无法清楚看出。则此︱显示断点在每一起始点经小叉叉表示。因此在用编辑︱截断，连结等︱截断指令时，或输入一外来的CAD文件，欲检查图形是否完整，连续时，每一段应只有一小叉叉。

3D 窗口

在3D，前视，侧视与上视四个窗口中，几何图形经绿色，而刀具路径以应有深度及不同颜色表示。

调整窗口大小，吸须在交点一下，拖到所要地方，放开即可，窗口即自动重绘。任何时间皆可‘拖放’此交点到任何地方。

显示下拉菜单中所有指令皆适用此四个窗口。除非有特定的作用窗口。用用的窗口有一个较亮的外框。再点一下此窗口，即回复非作用的窗口。若无特定的作用窗口，显示︱显示全部Ctrl+A即会重将四个窗口依同一比例重绘。（将全部图素，绘入窗口所需的比例）。而等角窗口即是永远自动比例重绘。

3D实体切削…*

显示材料及刀具动态切削材料之状态。此模型只切割一次，所以若更改视角，也只有绘图此模型。

在选3D实体切削…之前，在XY窗口上画一包含工件的外框，并用3D︱设定材

料尺寸将之外框设为材料。给予深度后，此即为实体切削之材料尺寸。若未定义此材料，系统会给予一大于所有刀具路径的外框，作为内定的材料尺寸。

第一个对话框让你选用实体是否涂彩或只是线框（较快）或只是结果（最快），三者之结果最终皆是涂彩，并可用标准或进阶之涂彩。进阶速度较慢，但结果较平滑，精确。

切削刀形会加以考虑，例如钻头之斜角，但只有靠近工件之刀形部份显示出来，为的是较快一些。在此窗口右上角有一刀具形状按钮，可停止此实体切削动作，只在右下角XY窗口，作2D切削显示。再按一次此钮，即再返回实体切削仿真。当实体切削模型结束后，按鼠标右键会有一浮动的窗口显示在下列有单中的部份指令，供选用。

此实体模型可以旋转，平移或放大/缩小，即使是在切削进行之中。

设定权限

以此设定图形中的主要部份。除非重置，系统即记住此极限设定值，但显示︱显示全部Ctrl+A不受此限制。显示全部全将内存中所有图形/路径全部显示出来。

设定观测角度

调整3D窗口图形的旋转及倾斜度。可用鼠标或键盘进行。

使用鼠标同，在XY窗口中，按鼠标左键来调整绕Z轴的旋转，或于右上角X/Y 窗口中，调整倾斜度。在此二窗口中，皆有一‘眼睛’出现，且3D窗口中，有一工件外形依旋转即倾斜而变化表示。按鼠标左键即固定角度，而近按右键即将3D窗口重绘。

在右上X/Y窗口中，调整的角度，只是垂直向上的即上视，平视或由下往上的视角。并不会影响在右下角平面设定的视角。

使用键盘，不须选用设定窗口角度的指令。若3D窗口为作用窗口或没设定作用窗口，只有按键盘的箭头--任何时候，即使在执行其它指令。即可以箭头之方向旋转。除了3D窗口，其它的窗口并不会旋转，只是重绘而已。快速涂彩Ctrl+Q

此开/关的指令只适用3D曲面与STL档案.STL档案会即刻以灰色涂彩显示。而3D曲面即先转为嵌片再涂彩。

此涂彩可以旋转，平移或放大/缩小。

3D细腻涂彩

此指令只用于3D曲面，最后显示为标准涂彩，进阶涂彩，线架构，或无隐葳线的线架构。

若前面＝绿色，背面＝红色，为颜色之设定﹔则刀具之方向为绿色，而相反之方向则为红色。

显示完成后，按鼠标右键即显示一浮动窗口，包含许多下拉菜单中的指令。而选项刀具方向反向可将曲面方向反向。可将反向之曲面（红色）点选，转为绿色。设定极限

以此设定图形中的主要部份。除非重置，系统即记住此极限设定值。但显示︱显示全部Ctrl+A不受此限制。显示全部会将内存中所有图形/路径全部显示出来。背景颜色

系统有16种颜色供选用。此设定不受窗口中控制台之颜色设定。

车床显示︱显示选项

︱显示刀具

每一道次之刀具即依比例显示出来。若刀具含有辅助线（如刀具的说明），则选取刀具时，会显示出来，但刀具模拟切削时，则不再显示。若不选显示刀具，则重绘时较快。因此，只在要检查工件细微时，才打开此功能。

︱材料切割

在2D以颜色显示材料切割的情形。每一道次皆一一显示与粗坏之情形。

︱显示双边

在中心线二侧绘出粗坏与工件。若选用材料切割显示工具，即可见粗坏逐步切削成工件之过程。此功能在做内孔加工时，可检视刀背是否撞到工件。

︱显示平衡（同步）点

仅用于双刀塔车床。将同步点显示出来。此点表一刀具在等待状态，待另一刀塔之刀具到达相对应之同步点时才加工。

第五章几何图形

系统可用一般CAD形式构图：以线段，弧，圆等基本图形，加以截断，删除及连结等指令来建图。但参考下介绍之快速几何图形，可得另一种更快速之构图。APS快速几何图形之介绍

使用APS快速几何图形建图时，系统知道要建的为一连续的轮廓，而非单独的线段或弧，因此了解他与弧之间会自动化正切相接，只需告诉系统刀具是如何更改方向，系统即自动计算。

传统CAD书法和APS快速几何图形法有甚大不同，因为CAD构图时，系统不知你书的是什么，可能是一幅图，而非加工件。因而必须精确书出点、线、弧、辅助线，并行线等来求交点，弧中心等，而用APS快速几何图形时，系统知道要书的为一加工件，一包含连续线/弧的外形。因此不用──尽单独图素，再倒角，像剪，连接等。

选一方便的起始点，例如点或已知弧，再依工件图形建构，以系统之“转换点”，线弧与另一线弧相交，刀具转向之点来考虑，除非特别指明，不然系统即假设线

生物软件使用说明书大全

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Aquachem中文教程彩图详解

AquaChem 简要使用说明GAOZANDONG@https://www.wendangku.net/doc/7b703509.html,

AquaChem 简要使用说明（编译） --AquaChem是用于水溶液地球化学数据的分析、作图和模拟的专业软件，加拿大滑铁卢水文地质有限公司（Waterloo Hydrogeologic, Inc.）与Lukas Calmbach博士合作开发，前者拥有版权。 --本说明为中国西北地下水开发培训班学员专用。是在阅读原版用户手册基础上的摘译，并进行重新编排，在省略很多内容的同时对某些操作步骤进行了更为详细地介绍，目的是让计算机操作不很熟练、英语阅读有一定困难的学员对该软件有一个初步了解并能够实际操作。 --如果想深入了解和应用AquaChem软件，请参阅用户手册。该手册以电子文本方式存储在安装目录下的Tutorials文件夹内，文件名为aqcdemo.pdf。如果计算机内没有安装打开该文件的Acrobat阅读器，可从互联网上免费下载安装（从任一网站如新浪、搜狐等的搜索引擎上查找以“acrobat”为关键词的“软件”）。

1、简介 AquaChem是一个专门用于水溶液地球化学数据的图形和数值分析的软件包。它具有完全可以由用户自己定制的地球化学数据和参数数据库系统，并提供水文地球化学领域得到广泛应用的多种数据分析和作图工具。 AquaChem的数据分析功能包括单位转换、电荷平衡、样品混合以及样品相关性分析和地球化学参数计算等，辅之以广泛应用的水化学数据图形工具，可以更清楚地表示水的化学特征和质量。AquaChem的图形工具包括： ●三线图，包括piper（图1-1a）、Durov（图1-1b）和简单的三离子三线图（图1-1c）； a，Piper三线图 b，Durov三线图c，三线图图1-1 AquaChem中的三线图 a，饼图b，Schoeller指印图 c，Stiff折线图 d，放射图图1-2 AquaChem中的饼图、折线图和放射图 ●饼图（图1-2a）、折线图（Schoeller指印图，图1-2b；Stiff折线图，图1-2c）和

Gblocks使用说明书-by florawz1

Gblocks使用说明书（by florawz） 1.首先打开软件，进入主页面 2.输入O ，然后回车，对话框显示输入一个文件或路径此时将比对好的（.fas）文件拖入对话框。对话框即出现该文件的路径（如图）按回车，即导入该序列。对话框上部出现下列信息 3.快速比对：输入G，然后回车。在原比对文件所在文件夹内即可出现Gblocks 已经处理好的文件

.fas-gb文件可用Bioedit和DNAMAN打开。打开.htm文件，可查看可视化的处理结果（如图） 4.主菜单： t. 指定的序列类型（可以是蛋白质,DNA或者密码子）。输入一个t，回车。序列类型改为Condons 再输入一个t，回车。序列类型改为DNA（如此循环修改）

o. 打开一个文件。必须为 NBRF/PIR 或 FASTA 格式，序列长度不限。打开 NBRF/PIR-格式的序列时，在序列备注第一行要注明序列类型如： >P1;byflorawz ------MEYLLQEYLPILVFLGMASALAIVLILAAAVIAVRN--PDPEKVSAYECGFNAF D-DARMKFDVRFYLVSILFIIFDLEVAFLFPWAVSFASLS-DVAFWGLMVFLAVLTVGFA YEWKKGALEWA----------------------* (fas格式则不需要，第一行直接为>byflorawz即可) 注意：在使用Glocks分析前，序列缺口必须先消除。在将比对文件拖进改软件时，要去路径掉末尾的空格。打开多个文件：必须建立一个path文件。输入各个相关文件的路径，在安装好的文件包内可以看到一个"paths"范例，用word打开此文件，即可看到各个文件的所在路径（如图）多条比对序列的处理：如果所有的比对文件的路径都在一个paths文件，且各个比对文件的序列条数，以及物种的顺序都是相同的，那么这些比对文件在最后的结果中可以连接起来。如果各个比对文件的序列条数不同，那么也可以一起处理，但是最后不能连接。 b. 显示 Block 限制性参数 (详情见下页). s. 显示保存菜单(详情见下页). g. 处理计算 q. 退出 5.限定性参数菜单

常见生物软件使用技巧汇集

常见生物软件使用技巧汇集 Q1.怎么查找序列保守区？ A1：很多人查找序列保守区，一般通过序列多重比对后，肉眼判断序列保守区，但此法难免太主观，不具重复性，且选择的保守区无法受统计上的显著性检验。其实，实现这一目的，可以使用DnaSP--> “Analysis” -->“Conserved DNA regi on”...

Q2. 多个FASTA格式保存的单条序列如何批量快速合并为一个文件？ A2 ：一条条添加，费时费劲，且容易出错。解决的办法有两个：一是可以通过DNAMAN的“多重序列比对”后导出功能，即：添加序列所在的目录，或全选相关文件，进行多重比对，导出Clustal aln 文件，然后再转换为FASTA；二是使用我们2012年新开发的序列火枪手套件的“Seq Merger.exe” 即可快速实现合并。 Q3. 如何解决Clustalx 多重比对（*.Aln格式）后转为MEGA 格式时提示出错的问题？ A3：检查所转换MEGA 的*.meg 文件最后几行内容是否有*号，全部删减之即可。因为Clustalx 多重比对后，程序会自动添加一致序列。

Q4. 为什么DNAMAN软件的很多功能菜单都显示无法使用？ A4：DNAMAN软件的精华在于通道（Channel）的应用，遇到功能菜单呈灰度无法使用时，不妨将序列载入通道后再试试... Q5. 如何让多重比对美观显示又不占篇幅？ A5：推荐使用Web Logo （https://www.wendangku.net/doc/7b703509.html,/logo.cgi）或Sequence L ogo之类的在线工具处理。其实这类工具还有一个妙用－可用于设计简并引物，简并序列一目了然，如下图的第7个碱其位点，G/A=R。 Q6. 如何在多重比对序列的上方显示对应的蛋白质二级结构？ A6：使用ESPript（http://espript.ibcp.fr/ESPript/cgi-bin/ESPript.cgi）对多重比对序列着色的同时，上传预测的蛋白质结构文件*.pdb 即可，效果如下图所示，详见《马铃薯Y病毒pipo基因的分子变异及结构特征分析》一文。具体操作方法可以参考《ESpript 美化多重比对序列图解(By Raindy) 》。

PAML 中文说明

PAML: 最大似然法分析系统发育Phylogenetic Analysis by Maximum Likelyhood 版本：4.3（2009年9月） Ziheng Y ang 马向辉翻译

1、概述 PAML (for Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood) 是一个用最大似然法分析蛋白质或DNA序列系统发育的一个程序包。 1.1 PAML 文件：除了这个手册以外，以下资源也需要注意： PAML网站：https://www.wendangku.net/doc/7b703509.html,/software/PAML.html。在这个网站上有PAML的下载以及编译程序; PAML FAQ页面：https://www.wendangku.net/doc/7b703509.html,/software/pamlFAQs.pdf; PAML讨论群：https://www.wendangku.net/doc/7b703509.html,/phpBB2/，在这里你可以提出你的问题，或者提出你发现的漏洞。 1.2 PAML 可以做些什么？ PAML 的最新版本包含一下几个程序模块：baseml, basemlg, codeml, evolver, pamp, yn00, mcmctree, 以及chi2。其中最常用的模块的介绍可以参考杨子恒教授2007年发表的文章。模块运行中用到的计算、统计方法在杨子恒教授的书中有详细的介绍。模块的主要作用包括：计算以及检测系统发育树（baseml 和codeml）; 计算复杂的碱基替代或者氨基酸替代模型中的参数，如不同位点间不同速率的模型或多个基因或者位点的综合分析模型（baseml和codeml）; 用似然比例检测比较几个模型（baseml，codeml以及chi2）; 用全局分子钟或者局部分子钟估算分歧时间（baseml和codeml）; 用最大似然法重建祖先氨基酸、核苷酸序列以及密码子模型（baseml和codeml）; 用蒙特卡洛模拟生成氨基酸、密码子

Phylip中文使用说明

Phylip中文使用说 Introduction PHYLIP程序的运行这些程序要按照一定的顺序来运行。前一个程序的输出作为下一个程序的输入。如何合理的组合这些程序也很关键。在windows中，PHYLIP程序可通过双击程序的图标来启动，或是在命令行中输入程序的名称来启动。我们建议使用命令行方式，因为你也许能看到一些错误提示。它启动的方是：开始->所有程序->附件->命令提示符。大部分PHYLIP程序运行方法相同。程序把infile作为默认输入文件，如果没有找到它将要求用户输入数据文件的名称。输出结果写在 outfile文件中。有些则写在outfile和outtree或plotfile中。因为大部分程序使用默认的输入和输出文件名，所以在下一步的分析前，要重命名你想保存的文件。比如，你用Dnadist得到了距离矩阵（outfile），你还想试试不同的设置，那么再做矩阵计算前，你可以把outfile重命名为dnadist_outfile，或其它名称，这样你就能区别两次的结果了。程序重抽样工具该程序生成一系列的特殊的随机样本，保存在outfile中。这些样本在后继的分

析中作为一个序列对文件，要设置选项M（use multiple datasets）。 Seqboot 生成随机样本，用bootstrap和jack-knife方法。距离方法：顺序使用这些程序。首先，用dandist或protdist程序计算序列比对结果的距离矩阵。接着这个矩阵被fitch、kitsch或 neighbor程序转换为树。Dandist 和protdist程序的输出文件是outfile。在运行fitch、kitsch或neighbor 前，outfile应该重命名为infile或另外的名字。fitch、kitsch和neighbor的输出文件是outfile和outtree。 Dnadist DNA距离矩阵计算器 Protdist 蛋白质距离矩阵计算器 Fitch 没有分子时钟的Fitch-Margoliash树 Kitsch 有分子时钟的Fitch-Margoliash树 Neighbor Neighbor-Joining和UPGMA树基于字符的方法这些程序读入一个序列对，它们的输出文件是outfile和outtree。 Dnapars DNA简约法 Dnapenny DNA简约法using branch-and-bound Dnaml DNA最大似然，无分子时钟