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四川大学 生物信息学 2012年考试试卷

四川大学 生物信息学 2012年考试试卷

四川大学

2012年攻读硕士学位研究生入学考试试题考试科目:计算机基础

科目代码:940

适用专业:生物信息学

一、名词解释(3’×15)

1.perl

2.SQL

3.Blast

4.正则表达式

5.Bash

6.Swissprot

7.DBMS

8.Apache

9.编译器

10.FASTA序列格式

11.稀疏矩阵

12.数据类型与数据结构

13.指针数组

14.结构体

15.保留字

二、单项选择题(3’×10)

1.

生物信息学期末考试重点

第一讲 生物信息学(Bioinformatics)是20世纪80年代末随着人类基因组计划的启动而兴起的一门新型交叉学科,它体现了生物学、计算机科学、数学、物理学等学科间的渗透与融合。 生物信息学通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析,达到揭示数据所蕴含的生物学意义从而解读生命活动规律的目的。 生物信息学不仅是一门学科,更是一种重要的研究开发平台与工具,是今后进行几乎所有生命科学研究的推手。 生物技术与生物信息学的区别及联系 生物信息学的发展历史 ?人类基因组计划(HGP) ?人类基因组计划由美国科学家于1985年提出,1990年启动。根据该计划,在2015年要把人体约4万个基因的密码全部揭开,同时绘制出人类基因的谱图,也就是说,要揭开组成人体4万个基因的30亿个碱基对的秘密。HGP与曼哈顿原子弹计划和阿波罗计划并称为三大科学计划,被誉为生命科学的登月计划。(百度百科) 随着基因组计划的不断发展,海量的生物学数据必须通过生物信息学的手段进行收集、分析和整理后,才能成为有用的信息和知识。换句话说,人类基因组计划为生物信息学提供了兴盛的契机。上文所说的基因、碱基对、遗传密码子等术语都是生物信息学需要着重研究的地方。 :

】 第二讲回顾细胞结构 细胞是所有生命形式结构和功能的基本单位 细胞组成 细胞膜主要由脂类和蛋白质组成的环绕在细胞表面的双层膜结构 细胞质细胞膜与细胞核之间的区域:包含液体流质,夹杂物存储的营养、分泌物、天然色素和细胞器 细胞器细胞内完成特定功能的结构:线粒体、核糖体、高尔基体、溶酶体等 细胞核最大的细胞器 DNA的结构 碱基(腺嘌呤A、鸟嘌呤G、胞嘧啶C、胸腺嘧啶G) 。 核苷酸 核苷酸是构成DNA分子的重要模块。每个核苷酸分子由一分子称作脱氧核糖的戊 糖(五碳糖)、一分子磷酸和一分子碱基构成。每种核苷酸都有一个碱基对,也就 是A、T、C、G 基因是什么 基因是遗传物质的基本单位 基因就是核苷酸序列。 大部分的基因大约是1000-4000个核苷酸那么长。 基因通过控制蛋白质的合成,从微观和宏观上影响细胞、组织和器官的产生。 基因在染色体上。

四川大学普通生物学2006

四川大学 2006年攻读硕士学位研究生入学考试试题 考试科目:生物学 科目代码:356 适用专业:植物学、动物学、微生物学、遗传学、细胞生物学、生物化学与分子生物学、生态学、生物信息学、生物安全、结构生物学、农药学(试题共四页)一、选择题:选择正确的一个或几个答案写在答题纸上。(总计30分,每题2分,不答全不得分) 1、染色体组型研究关注的是染色体的( )。 A、数目; B、形态; C、大小; D、核苷酸的序列 2、RNA组成成分是( ) A、脱氧核糖,磷酸,碱基; B、核糖,碱基,磷酸; C、氨基酸,葡萄糖,碱基; D、戊糖,碱基,磷酸。 3、在正常人体中,病毒感染细胞后,相邻细胞会产生( )。 A、类毒素; B、抗生素 C、外毒素 D、干扰素 4、植物茎运输有机养分的管道是( ) A、筛管; B、导管; C、伴胞 D、乳汁管 5、高等动植物体内的细胞主要是二倍体的,例外的是单倍体的( )。 A、卵母细胞; B、精母细胞; C、精细胞; D、卵细胞。 6、光周期的形成是因为植物体内存在( ) ,它们能够感知光的性质。 A、叶绿素; B、光敏色素; C、成花素; D、花青素 7、物种数量最多的纲是( )。 A、被子植物纲 B、昆虫纲 C、鸟纲 D、两栖纲 8、白蚁与其消化道中的原生动物的关系是( )。 A、捕食 B、寄生 C、互利共生 D、共栖 9、在mRNA上的起始密码子和终止密码子可能分别是( )。 A、UAG、CAU; B、AUG、UAG; C、AUG、UAA; D、AUG、UGA。 10、生态演替的终极阶段是( ),其中各主要种群的出生率和死亡率达到平衡,能量的输入和输出以及生产量和消耗量也达到平衡。 A、顶级群落; B、优势群落; C、热带雨林; D、全球沙化 11、有三个物种的拉丁学名分别为: ○1Pinus palustris, ○2Quercus palustris,○3Pinus Echinata, 可以判断,亲缘关系较近的两个物种是( )。 A、○1和○2 B、○2和○3 C、○1和○3 D、无法判断 12、拧檬酸循环又称三羧酸循环,其发生部位为( ) A、线粒体; B、叶绿体; C、细胞质; D、内质网 13、成熟促进因子MPF是由两种蛋白质构成的复合体,它的主要功能是控制( )。 A、细胞凋亡; B、细胞周期; C、生殖细胞发育; D、基因突变 14、真核基因的调空机制复杂,可以在多个环节上进行,但不包括( ) A、RNA剪切; B、mRNA寿命; C、DNA复制; D、DNA转录 15、如果DNA模板链的编码从5’端读是TAC, 那么相应的反密码子从5’端读其碱基序列应该是( )

四川大学体育考试试题2

、判断题:审美心境是提高体育观众和审美修养的先决条件。(分) . 正确. 不正确 、判断题:在国际舆论中,经常宣传体育超脱政治的观点,是基于体育和政治本身无关(分) . 正确. 不正确 、判断题:澳大利亚网球公开赛是国际网球四大公开赛之一(分) . 正确. 不正确 、判断题:北京年残奥会吉祥物叫冬冬(分) . 正确. 不正确 、判断题:锻炼中精神意志因素与疲劳没有关系。(分) . 正确. 不正确 、判断题:恶性或良性肿瘤、急性炎症及任何部位的脓肿都可以进行按摩(分) . 正确. 不正确 、判断题:气功的主要功效是保精、练气、养神。(分) . 正确. 不正确 、判断题:球类馆球场边线至墙壁的距离最少不小于(分) . 正确. 不正确 、判断题:有氧耐力是耐力素质的主要方面,发展有氧耐力是提高心肺功能水平。(分) . 正确. 不正确 、判断题:某同学患有疾病,但不影响上游泳课,可以不向教师说明自己的病情,而进行低强度、长时间的游泳练习(分) . 正确. 不正确 、单选题:根据目的、对象和社会施予的影响不同,目前通常认为体育可由哪三个主要部分组成?(分) . 学校体育,竞技体育和社会体育. 娱乐体育,学校体育和竞技体育 . 社会体育,娱乐体育和学校体育. 娱乐体育,社会体育和竞技体育 、单选题:“”字形包扎法适用于()的包扎(分) . 踝关节. 小腿 . 上臂. 手指 、单选题:北京奥运会男子米赛事冠军得主是(分) . 鲍威尔. 博尔特 . 刘翔. 盖伊 、单选题:经常做俯卧撑和仰卧起坐主要是发展(分) . 绝对力量. 速度力量 . 爆发力. 力量耐力 、单选题:经原始教育提炼和改进后的身体运动,由于增添了强身手段,使之有可能通过提高各种身体效能和活动技巧的训练,为学习和掌握生存的本领提供了方法。但其根本目的仍在于(分) . 强身健体. 维持生存 . 消遣娱乐. 技巧训练 、单选题:人体从事体育锻炼时,是全身各器官系统在什么系统指挥下实现的协调整体活动?(分) . 神经系统. 消化系统

最新生物信息学考试复习

——古A.名词解释 1. 生物信息学:广义是指从事对基因组研究相关的生物信息的获取,加工,储存,分配,分析和解释。狭义是指综合应用信息科学,数学理论,方法和技术,管理、分析和利用生物分子数据的科学。 2. 基因芯片:将大量已知或未知序列的DNA片段点在固相载体上,通过物理吸附达到固定化(cDNA芯片),也可以在固相表面直接化学合成,得到寡聚核苷酸芯片。再将待研究的样品与芯片杂交,经过计算机扫描和数据处理,进行定性定量的分析。可以反映大量基因在不同组织或同一组织不同发育时期或不同生理条件下的表达调控情况。 3. NCBI:National Center for Biotechnology Information.是隶属于美国国立医学图书馆(NLM)的综合性数据库,提供生物信息学方面的研究和服务。 4. EMBL:European Molecular Biology Laboratory.EBI为其一部分,是综合性数据库,提供生物信息学方面的研究和服务。 5. 简并引物:PCR引物的某一碱基位置有多种可能的多种引物的混合体。 6. 序列比对:为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列。

7. BLAST:Basic Local Alignment Search Tool.是通过比对(alignment)在数据库中寻找和查询序列(query)相似度很高的序列的工具。 8. ORF:Open Reading Frame.由起始密码子开始,到终止密码子结束可以翻译成蛋白质的核酸序列,一个未知的基因,理论上具有6个ORF。 9. 启动子:是RNA聚合酶识别、结合并开始转录所必须的一段DNA序列。原核生物启动子由上游调控元件和核心启动子组成,核心启动子包括-35区(Sextama box)TTGACA,-10区(Pribnow Box)TATAAT,以及+1区。真核生物启动子包括远上游序列和启动子基本元件构成,启动子基本元件包括启动子上游元件(GC岛,CAAT盒),核心启动子(TATA Box,+1区帽子位点)组成。 10. motif:模体,基序,是序列中局部的保守区域,或者是一组序列中共有的一小段序列模式。 11. 分子进化树:通过比较生物大分子序列的差异的数值重建的进化树。 12. 相似性:序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相似DNA碱基或氨基酸残基序列所占的比例。 13. 同源性:两个基因或蛋白质序列具有共同祖先的结论。

川大《市政管理(1)》16秋在线作业1

奥鹏17春川大《市政管理(1)》16秋在线作业1 一、单选题(共20 道,共40 分。) 1. 城市管理要转变“全能政府”理念,推进()的制度建设。 A. 公私合作 B. 有限政府 C. 多中心治理 D. 企业化政府 标准解: 2. 我国“十一五”规划纲要明确提出,要把()作为推进城镇化的主体形态。 A. 城市群 B. 大都市化 C. 城市带 D. 都市圈 标准解: 3. 新增建设用地土地有偿使用费,实行中央与地方()分成体制. A. 2:8 B. 1:9 C. 4:6 D. 3:7 标准解: 4. ()是指排他性控制和独占某种经济资源、产品、技术或市场。 A. 自然垄断 B. 垄断 C. 强制性垄断 D. 经营性垄断 标准解: 5. ()是一种在消费商具有竞争性,但无法有效地做到排他的产品。 A. 纯公共产品 B. 俱乐部产品 C. 公共服务 D. 公共资源 标准解: 6. ()是指政府按照等价交换原则购买商品和劳务支出。 A. 经济性支出 B. 社会性支出 C. 购买性支出 D. 转移性支出

标准解: 7. 英国城市议会的行政委员主要有法定委员会和()两类。 A. 临时委员会 B. 固定委员会 C. 兼职委员会 D. 常设委员会 标准解: 8. ()是城市发展和社会进步的基本保障。 A. 教育事业 B. 科学技术研究 C. 文化建设 D. 卫生事业建设 标准解: 9. 美国的大城市普遍采用(),市长和立法机构的议员均为全职并有薪金。 A. 市委员会制 B. 市长制 C. 议会经理制 D. 弱市长制 标准解: 10. 市委员会制是由()掌握所有的立法和行政权力。 A. 全体委员 B. 委员长 C. 少数委员 D. 市长 标准解: 11. 城市社区建设的近期目标是: A. 建立政府推动与社区自治相结合的治理模式 B. 构建自治型社区治理模式 C. 政府主导型社区治理模式 D. 居民委员会主导型治理模式 标准解: 12. ()是指以表达和维护一定阶层的群众的具体利益为宗旨,担负着部分社会管理职能的群众性政治团体。 A. 居民委员会 B. 非营利性组织 C. 市民参政 D. 人民团体 标准解: 13. ()以治理理论为依托,主张城市管理是多元治理主体共同治理的过程。 A. 市政学 B. 市政管理学 C. 城市管理学 D. 城市市政学 标准解:

四川大学期末考试试题(A卷).doc

四川大学期末考试试题(A卷) (2013——2014 学年第一学期) 课程号:303066030课序号:课程名称:计算机基础及C程序设计语言 任课教师:刘亚梅刘洋任瑞玲曾晓东余勤罗伟王茂宁王忠邓丽华成绩: 适用专业年级:2012级学生人数:印题份数:学号:姓名: 考试须知 四川大学学生参加由学校组织或由学校承办的各级各类考试,必须严格执行《四川大学考试工作管理办法》和《四川大学考场规则》。有考试违纪作弊行为的,一律按照《四川大学学生考试违纪作弊处罚条例》进行处理。 四川大学各级各类考试的监考人员,必须严格执行《四川大学考试工作管理办法》、《四川大学考场规则》和《四川大学监考人员职责》。有违反学校有关规定的,严格按照《四川大学教学事故认定及处理办法》进行处理。 一、单项选择题(每题1.5分,共45分)(注:本题及以下各题均以VC++6.0为软件编程平台) 1.一个C程序总是从_______开始执行的。 A)main函数B)程序的第一行 C)程序的第一个函数D)不固定位置 2.以下对C语言的描述正确的是。 A)函数允许嵌套定义B)编译时不检查语法 C)用户所定义的标识符必须以字母开头D)转义字符以“\”开头 3.下列C语言中运算对象必须是整型的运算符是。 A) %= B) && C) = D) *= 4.若有以下程序段:int c1, c2=3, c3=2; c1=(float)c2/c3;则执行后,c1、c2的值分别是。 A)0,3.0 B) 1,3.0 C) 0,3 D) 1,3 5.下列变量定义中合法的是。 A)short_a=0xda; B)double b=1+5e2.5; C)int a=‘A’; D)float 2_and=1-e-3; 6.若变量已正确定义并赋值,符合C语言语法的表达式是。 A)++(a+1) B)a=7+b/c=a++ C)a=a+7=c+b D)a=’\0’ 7.设int a=1,b=2,c=3,m=4,n=5,p=3;,则执行表达式(a=m10);,则a和b的值分别是。 A)10和1 B)10和0 C)11和0 D)11和1 11.以下4个选项中,不能 ..看作一条语句的是。 A)if (b= =0) m=1;n=2; B)a=0,b=0,c=0; C)if (b==0){m=1;n=2;} D)if (a>0); 注:1试题字迹务必清晰,书写工整。本题8 页,本页为第 1 页

生物信息学期末考试重点

1、生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处理、存储、传播,分析和解 释等各方面的学科,也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展,生命科学和计 算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学,计算机科学和信息技 术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。 2、数据库(Database)是按照数据结构来组织、存储和管理数据的仓库,它产生于 距今六十多年前,随着信息技术和市场的发展,特别是二十世纪九十年代以后, 数据管理不再仅仅是存储和管理数据,而转变成用户所需要的各种数据管理的方 式。数据库有很多种类型,从最简单的存储有各种数据的表格到能够进行海量数 据存储的大型数据库系统都在各个方面得到了广泛的应用。 3、表达序列标签从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短 的cDNA 部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp。EST 来源于一定环境下一个组织总 mRNA 所构建的cDNA 文库,因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。 4、开放阅读框是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列,可编码相应的蛋白。 ORF识别包括检测六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的 DNA序列而其内部不包含启动子或终止子,符合这些条件的序列有可能对应一个 真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编 码基因的部分或全部的先决条件。 5、蛋白质的一级结构在每种蛋白质中氨基酸按照一定的数目和组成进行排列,并进 一步折叠成特定的空间结构前者我们称为蛋白质的一级结构,也叫初级结构或基 本结构。蛋白质一级结构是理解蛋白质结构、作用机制以及与其同源蛋白质生理 功能的必要基础。 6、基因识别是生物信息学的一个重要分支,使用生物学实验或计算机等手段识别 DNA序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因, 也包括其他具有一定生物学功能的因子,如RNA基因和调控因子。基因识别是基 因组研究的基础。

生物信息学试题复习参考(张弓)

2014-2015学年生物信息学期末考试题 写在前面:这是我考试时候写的答案的大致内容,具体文字我已经不记得了,给大家一个参考,希望对大家复习有帮助。因为我也是扣了很多分,所以答案也有很多错的,大家不要尽信。祝大家考试顺利。 一、实验设计和基础分析 以下qPT-PCR实验方案有哪些错误?请标出错误,并说明原因和写出正确方案。 目的:比较肺癌细胞迁移前后的X基因转录水平表达量 方法:(1)用Trizol法提取细胞总RNA,并用跑胶、OD260/280等方法确认无降解。 (2)用poly-dT引物进行反转录 (3)设计基因特异性PCR引物,用qPCR仪测定X基因和GAPDH基因的Ct值。GAPDH作为内参。 (4)以2^-ΔΔCt方法计算X基因相对于GAPDH的相对含量 (5)比较迁移前后的相对表达量,做三个重复,用t-test进行统计检验,P<0.05为差异显著 1.错误:不能用GAPDH基因作为定量标准;原因:癌症迁移前后GAPDH基因的表达量已经改变了,做定量标准不准确;方案:采用外参(如:其他物种的基因) 2.错误:不能用t-test进行统计检验;原因:t-test进行统计检验的前提是数据呈正态分布,基因表达量不一定呈正太分布;方案:将数据取log10,对数化。 上述两个是我考试时候写的答案,后来经提醒:还发现了一个错误:不能用poly-dT引物进行反转录;原因:。。。。。。;方案:用Oligodt进行逆转录。 二、双序列比对的生物学意义解释 两种细菌的同源蛋白质endonuclease III,长度都为200氨基酸左右,其功能相同,蛋白质序列使用BLAST 可以比对上,同源性高达57%,但其编码DNA序列用BLAST却无法比对上,为了尽可能提高亲缘关系较远的序列的比对效率,比对已经使用BLAST网站上Somewhat similar sequence选项,默认参数(见下图):

四川大学本科课程考试试卷分析

四川大学本科课程考试试卷分析 (参考格式) 课程名称(中英文): 课程号(代码): 课程类别:学时:学分: 参试学生年级:专业:参试总人数(N): 卷面总分(T):客观题总分:主观题总分: 考试时间:年月日 任课教师:试卷分析签名: 一.基本分析 1.成绩分布: *若卷面总分不等于100分,应折合换算为标准总分100分,再按标准分数段进行统计。 2.参考标准:在教学状况正常、考试命题适宜、试卷评阅严谨的前提下,考生成绩应基本符合正态分布。

二.扩展分析 1.定量统计: * “答对人数”指得分在该题满分的90%(含)以上的人数(即:得分≥0.9?Ti 的人 数)。 ** 各题“难度系数” Pi = Ti Ai ,难度系数是反映试题难易程度的指标。 *** 各题“区分度” N Li Gi Di 27.0-= , 其中,Gi 为高分组中该题的答对人数,高分组为卷面总成绩排前27%的人数;Li 为低分组中该题的答对人数,低分组为卷面总成绩排后27% 的人数。 区分度是反映试题能在多大程度上把不同水平的学生区别开来的指标。 2.分析参考标准: 一般情况下,试卷平均难度系数 P >0.7 为试题难度低; P ≤4.0≤0.7 为难度较 为适中(选拔性测试 P =0.5左右为宜,通常期末考试为目标参照性考试,P 可适当 偏高); P <0.4 为难度高。难度适中能更客观地反映出学生的学习效果情况。 一般情况下,试卷平均区分度 D ≥0.3 为区分度高度显著; D ≥0.15 为区分度 基本显著; D<0.15 为区分度较差。

试题的难度系数与区分度相结合可提供命题质量的更为可靠的信息。 三.分析总结 1.从卷面整体解答情况所反映出的教与学中存在的主要问题(含命题质量):2.对今后进一步改进教学的思考: 备注:1. 各学院应按《四川大学考试工作管理办法》充分重视试卷分析工作,通过试卷分析更客观地利用考试的教学信息反馈功能,不断提高命题质量,促进 考试工作的科学化、制度化建设,推动进一步改进教学工作,提高教学质量。 试卷分析由教研室(系)组织、安排相关教师认真完成,并督促、检查将分 析结果及时报教研室(系)。 2. 参试人数少于150人的试卷可只进行第一、三项分析,参试人数150人以 上(含)的试卷第一、二、三项分析均须进行。 3. 2004年7月以前的试卷以第一、三项分析为主,有条件的课程可再开展第 二项分析。

中国科学院大学生物信息学期末考试资料,陈润生老师

生物信息学期末考试复习 1.生物学中的7个数学故事 (1) 孟德尔遗传定律(分离和自由组合定律)运用了组、合原理中的加法原理和乘法原理。 (2) Hardy-Weinberg遗传平衡定律通过构造数学关系式来证明。 (3)基因在染色体上的线性排列采用概率分布优化距离的计算距离,使其更接近真实情况。 (4)关联分析通过假设检验看两个特征的关联有无统计显著性。 (5) 序列比对设计合适的算法可以有效降低计算复杂度。 (6)基因组学和其他的组学组学时代产生的大量数据需要依赖数据库技术来寻找生物分子之间的关联。 (7)微阵列芯片大规模芯片数据需要数据挖掘:聚类、关联、预测建模、异常检测。 2. DNA、protein、RNA序列比对及其算法 序列比对:为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列。常用的方法有:点阵法,动态规划算法,k-tup 算法等。 (1)dotplot算法:通过点阵作图的方法表示,能很直观地氨基酸序列或核苷酸序列上的插入、删除、重复和反相重复。 算法步骤:将两条序列的碱基(或残基)分别沿x轴和y轴排列,依次比较两条序列的每个碱基(或残基),如果两个碱基(或残基)相同则在矩阵中填充点,这样就形成一个点矩阵。在点矩阵中,将对角线上的点连接起来,这些直线所对应的矩形区域就是这两条序列的相似性片段。 算法特点:该算法相似性片段实际上是相同的片段;而且不能提供相似性片段在统计学意义上的相似性。 (2)动态规划算法:分为全局动态规划算法和局部动态规划算法。保证了指定打分模型的情况下,两条序列能获得尽可能的最高分 算法步骤:①初始化序列矩阵;②将序列输入矩阵,计算分数并绘制箭头;③用箭头回溯找到最优得分路径;④连接最优路径,产生序列比对。 动态规划算法优缺点: 优点:对于一个给定的计分函数集合,能找到最优的比对 缺点:时间复杂度为O(n 2),运行慢,计算所需的内存与序列长度的平方成正比,因此不适用于非常长序列的比对。 序列比对的定义,存在哪几种算法,打分矩阵是什么意思 序列比对:为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列; 算法种类:动态规划算法、Smith-Waterman Alterations算法、FASTA - Hi Level Algorithm 算法、BLAST – Heuristic算法; 打分矩阵:通过点矩阵对序列比对进行积分,根据不同物质情况可分为DNA序列打分矩阵:等价矩阵、转换-颠换矩阵、blast矩阵;蛋白质打分矩阵:等价矩阵、遗传密码矩阵、疏水性矩阵、PAM矩阵、BLOSUM矩阵。 1.动态规划算法,给个表格可以把数字填出:

生物信息学考试试卷

一、名词解释(每小题4分,共20分) 1、生物信息学 广义:生命科学中的信息科学。生物体系和过程中信息的存贮、传递和表达;细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程的中各种生物信息。 狭义:生物分子信息的获取、存贮、分析和利用。 2、人类基因组计划 人类基因组计划准备用15年时间,投入30亿美元,完成人类全部24条染色体的3×109脱氧核苷酸对(bp)的序列测定,主要任务包括作图(遗传图谱、物理图谱的建立及转录图谱的绘制)、测序和基因识别。其中还包括模式生物(如大肠杆菌、酵母、线虫、小鼠等)基因组的作图和测序,以及信息系统的建立。作图和测序是基本的任务,在此基础上解读和破译生物体生老病死以及和疾病相关的遗传信息。 3、蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构是指多肽链中氨基酸的序列 4、基因 基因--有遗传效应的DNA片断,是控制生物性状的基本遗传单位。 5、中心法则 是指遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA,即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。 6 、DNA序列比较 序列比较的根本任务是:(1)发现序列之间的相似性;(2)辨别序列之间的差异 目的: 相似序列 相似的结构,相似的功能 判别序列之间的同源性 推测序列之间的进化关系 7、一级数据库 数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据,只经过简单的归类整理和注释 8、基因识别 基因识别,是生物信息学的一个重要分支,使用生物学实验或计算机等手段识别DNA 序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因,也包括其他具有一定生物学功能的因子,如RNA基因和调控因子。 9、系统发生学 系统发生学(phylogenetics)——研究物种之间的进化关系。 10、基因芯片 基因芯片(gene chip),又称DNA微阵列(microarray),是由大量cDNA或寡核苷酸探针密集排列所形成的探针阵列,其工作的基本原理是通过杂交检测信息。

四川大学期末考试试题(闭卷

四川大学期末考试试题(闭卷、开卷、半开卷) (2007-2008学年第1学期) 课程号:30403030 课程名称:计算机图形学(A卷)任课教师:陈蓉,代术成 适用专业年级:计算机科学技术学号:姓名: 一、单项选择题(本大题共10小题,每小题3分,共30分)提示:在每小题列出的四个备选项中只有一个是符合题目要求的,请将其代码填写在题后的括号内。错选、多选或未选均无分 1)灰度等级为256级,分辨率为1024*1024的显示模式,至少需要的帧缓存容量为___B____bit。 A、7M B、8M C、10M D、16M 2) ___C___是在高于显示分辨率的较高分辨率下用点取样方法计算,然后对几个像素的属性进行平均得到较低分辨率下的像素属性。实际上是把显示器看成是比实际更细的网格来增加取样率。 A、提高显示分辨率 B、图像分割 C、过取样(supersampling) D、区域取样(areasampling) 3)用一个n位的整数表示一个位串,用它控制线型时,可以n个像素为周期进行重复显示。若Patten=11100101,而i表示画线程序中的第i个像素,则画线程序中的SETPIXEL(X,Y,COLOR)可改写为___C__ A、if(pattern[i%4])setixel(x,y,color); B、if(pattern[i%6])setixel(x,y,color); C、if(pattern[i%8])setixel(x,y,color); D、if(pattern[i%12])setixel(x,y,color);

4、点P 的齐次坐标为(8,6,2),其对应的空间坐标为__D ____。 A 、(8,6,2) B 、(8,6) C 、(4,3,1) D 、(4,3) 5)在多边形的逐边裁剪法中,对于某条多边形的边(方向为从端点S 到端点P)与某条裁剪线(窗口的某一边)的比较结果共有以下四种情况,分别需输出一些顶点.请问哪种情况下输出的顶点是错误的____A ____。 A :S 和P 均在可见的一侧,则输出S 和P . B :S 和P 均在不可见的一侧,则不输出顶点. C :S 在可见一侧,P 在不可见一侧,则输出线段SP 与裁剪线的交点. D :S 在不可见的一侧,P 在可见的一侧,则输出线段SP 与裁剪线的交点和P . 6)扫描线多边形填充算法中,对于扫描线同各边的交点的处理具有特殊性。穿过某两条边的共享顶点的扫描线与这两条边的交点数只能计为___B __交点: A 、0 个 B 、1个 C 、2个 D 、3个 7、如果观察方向(视线方向)为Z 轴负向,观察向量可设为V=(0,0,-1),则对场景中的图形表平面可判定其可见性。令某平面的法向量为N=(A,B,C)。当___A __时,该平面可判定为后向面(Back-Face )即是观察时不可见的面。 A、C<=0 B、C>=0 C 、A>=0 D 、B<=0 8、多边形面的平面方程为:Ax+By+Cz+D=0。投影后,若扫描线上起始点的深度值为, 则该面的扫描线上所有后继点的深度值计算公式为__B __ A )z(x+1,y)=z(x,y)+A/C B )z(x+1,y)=z(x,y)-A/C C )z(x+1,y)=z(x,y)+C/A D )z(x+1,y)=z(x,y)-C/A 9)当观察光照下的光滑物体表面时,在某个方向上看到高光或强光,这个现象称为__B __ A、漫反射 B、镜面反射 C 、环境光 D 、折射 C D By Ax y x z ---= ),(

生物信息学 本科生版 期末考试试题(机考)

暨南大学考试试卷 注意: 1. 本考试只有相对正确的答案,无论你如何作答,只要写出足够强的论证的理由和过程来 支撑你的观点,并且不违反课程内讲授的基本原理,即算正确。 2. 考试形式为机考,请自备电脑。回答可直接写在本文件里,要写出过程和明确的结论。 最终答卷以PDF形式现场提交以避免乱码和篡改,文件名请统一命名为“学号-姓名.pdf”,例如2013042213-张三.pdf。不按此格式命名文件名者将一律没有成绩! 3. 考试完毕,请用U盘将写好的报告PDF文档拷到监考老师的电脑上,或于考试结束后 15分钟内发邮件至zhanggong@https://www.wendangku.net/doc/815816076.html,,注明主题“期末考试”。 4. 本试卷分为4小题,各题分数分别为20、30、30、20 分,满分100分。 人卵细胞受精到胚胎发育极早期,经历如下阶段: -卵细胞(oocyte) -前核(pronuclei) -受精卵(zygote) -2-细胞期 -4-细胞期 -8-细胞期 -桑椹胚(morula) 为研究在发育过程中的转录调控,研究者对以上时期的细胞进行了单细胞测序。测序仪使用Illumina HiSeq-2000,采用双端100nt测序方式。测序数据的第一端用FANSe2算法云分析平台进行一键式定量分析,得到28个基因表达定量文件(*_SVmerge.txt)。请通过推理和分析,回答以下问题: 1.真核生物中,同一个基因往往可以通过可变剪切的方式,生成若干个不同的 剪切变体。请问云平台分析的这批数据,是如何处理同一基因的不同剪切变体的?这种测序方式有没有可能定量不同的剪切变体?为什么?

暨南大学《生物信息学(本科生版)》试卷考生姓名、学号: 2.Oocyte, zygote, pronuclei, morula阶段都做了生物学重复,请问其重复性好不 好?如果不好,有哪些因素会造成重复性不好?会不会影响结论? 3.发育生物学课本上就已经说道,2-细胞期、4-细胞期、8-细胞期的每一个细胞 都不一样。受精卵已有植物极和动物极之分,在第一次卵裂的2-细胞期中,植物极和动物极被分开;然后继续进行两次纵向卵裂,形成上部4个动物极细胞和下部8个植物极细胞。将来动物极细胞发育成外胚层,植物极细胞发育成内胚层。也就是说,一个胚胎的若干个细胞之间就有不同,其转录组应该有不同。那么,同期的细胞之间差异大,还是不同期之间差异大?这些差异是由发育阶段所致,还是由于单细胞测序的随机性误差所致? 4.哪些基因是“管家基因”(housekeeping gene),哪些基因是只在未受精卵细胞中 有表达的?这两部分基因的mRNA长度分布有没有统计学意义上的差别? (RefSeq-RNA数据库里面所有的mRNA序列都在Human_hg19_refMrna20150317.fa文件中)

专业解析-生物信息学

生物信息学 生物信息学属于自设学科,是在生命科学的研究中,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。 一、专业介绍 1、研究方向 目前,复旦大学该专业研究方向主要有: 01 分子进化 02 比较基因组学 03 疾病遗传信息分析 04 生物信息系统 2、培养目标 培养具有现代生物科学技术、计算机科学与技术、生命信息学的基本理论、基本知识和较强的基本技能,能在各级生物信息学的研究机构、高等学校、企事业单位以及在研究和成果产业化过程中涉及到生物信息学的相关部门,从事科学研究、教学和管理工作的高级专门人才。

3、专业特色 生物信息学(Bioinformatics)是一门计算机、数学、信息技术与生物医学交叉结合的新兴学科,它在人类疾病基因发现、基因与蛋白质的表达与功能研究、合理化药物设计等方面都有着关键的作用。 4、研究生入学考试科目: 初试科目: ①101思想政治理论 ②201英语一 ③727生物化学或729进化生物学 ④874生物统计学或875生物信息学 复试科目: ①专业基础知识与技能 ②英语口语(含听力) (注:以复旦大学为例,各院校考试科目有所不同) 5、相同一级学科(生物学)下的其他专业 植物学、动物学、生理学、水生生物学、微生物学、神经生物学、遗传学、发育生物学、细胞生物学、生物化学与分子生物学、生物物理学、生态学等。 二、招收此自设专业的院校及开设年份

由于该专业具有多学科交叉的特点,所以各院校设置其所属的一级学科就有所不同。如吉林大学(2005)设置生物信息学专业为计算机科学与技术一级学科下的二级学科,第三军医大学(2004)设该专业隶属基础医学一级学科,而中国科学技术大学(2002)、上海生命科学研究院、复旦大学(2003)、四川大学(2003)、南开大学(2002)、军事医学科学院(2005)、中国科学院研究生院(2002)、中国农业大学(2002)、北京师范大学(2004)、浙江大学(2002)、西北农林科技大学(2005)、中山大学(2003)、湖南农业大学等把该专业所属一级学科设置为生物学。 三、就业前景 目前,交叉、新兴学科人才储备和需求量之比大约是1∶10,就业形势看好。随着生命科学与技术的迅速发展,生物信息学毕业生就业前景将更为乐观。 四、就业方向 该专业毕业主要到生物信息及其相关领域的科研机构和大专院校从事教学与科学研究,到生物技术、医药、信息类高新技术企事业单位从事技术开发和管理工作。

计算机图形学_四川大学期末考试试题

一、单项选择题(本大题共10小题,每小题3分,共30分)提示:在每小题列出的四个备选项中只有一个是符合题目要求的,请将其代码填写在题后的括号内。错选、多选或未选均无分 1)灰度等级为256级,分辨率为1024*1024的显示模式,至少需要的帧缓存容量为___B____bit。 A、7M B、8M C、10M D、16M 2) ___C___是在高于显示分辨率的较高分辨率下用点取样方法计算,然后对几个像素的属性进行平均得到较低分辨率下的像素属性。实际上是把显示器看成是比实际更细的网格来增加取样率。 A、提高显示分辨率 B、图像分割 C、过取样(supersampling) D、区域取样(areasampling) 3)用一个n位的整数表示一个位串,用它控制线型时,可以n个像素为周期进行重复显示。若Patten=11100101,而i表示画线程序中的第i个像素,则画线程序中的SETPIXEL(X,Y,COLOR)可改写为___C__ A、if(pattern[i%4])setixel(x,y,color); B、if(pattern[i%6])setixel(x,y,color); C、if(pattern[i%8])setixel(x,y,color); D、if(pattern[i%12])setixel(x,y,color); 4、点P的齐次坐标为(8,6,2),其对应的空间坐标为__D____。 A、(8,6,2) B、(8,6) C、(4,3,1) D、(4,3) 5)在多边形的逐边裁剪法中,对于某条多边形的边(方向为从端点S到端点P)与某条裁剪线(窗口的某一边)的比较结果共有以下四种情况,分别需输出一些顶点.请问哪种情况下输出的顶点是错误的____A____。 A:S和P均在可见的一侧,则输出S和P. B:S和P均在不可见的一侧,则不输出顶点. C:S在可见一侧,P在不可见一侧,则输出线段SP与裁剪线的交点. D:S在不可见的一侧,P在可见的一侧,则输出线段SP与裁剪线的交点和P. 6)扫描线多边形填充算法中,对于扫描线同各边的交点的处理具有特殊性。穿过某两条边的共享顶点的扫描线

川大《市政管理(1)》18春在线作业2

(单选题) 1: 下列不属于城市财政收入特征的是: A: 公共性 B: 规范性 C: 自主性 D: 稳定性 正确答案: (单选题) 2: ()是指排他性控制和独占某种经济资源、产品、技术或市场。 A: 自然垄断 B: 垄断 C: 强制性垄断 D: 经营性垄断 正确答案: (单选题) 3: ()以治理理论为依托,主张城市管理是多元治理主体共同治理的过程。 A: 市政学 B: 市政管理学 C: 城市管理学 D: 城市市政学 正确答案: (单选题) 4: 我国“十一五”规划纲要明确提出,要把()作为推进城镇化的主体形态。 A: 城市群 B: 大都市化 C: 城市带 D: 都市圈 正确答案: (单选题) 5: 根据城市的发展规律,城市化率超过()以后,城市化进程会呈加速发展趋势。 A: 30% B: 40% C: 50% D: 60% 正确答案: (单选题) 6: 美国的大城市普遍采用(),市长和立法机构的议员均为全职并有薪金。 A: 市委员会制 B: 市长制 C: 议会经理制 D: 弱市长制 正确答案: (单选题) 7: ()是指以表达和维护一定阶层的群众的具体利益为宗旨,担负着部分社会管理职能的群众性政治团体。 A: 居民委员会 B: 非营利性组织 C: 市民参政 D: 人民团体 正确答案: (单选题) 8: 市委员会制是由()掌握所有的立法和行政权力。 A: 全体委员 B: 委员长 C: 少数委员 D: 市长 正确答案: (单选题) 9: 城市社区建设的近期目标是: A: 建立政府推动与社区自治相结合的治理模式 B: 构建自治型社区治理模式 C: 政府主导型社区治理模式

生物信息学期末期末复习

■一、选择题: 1.以下哪一个是mRNA条目序列号: A. J01536 ■. NM_15392 C. NP_52280 D. AAB134506 2.确定某个基因在哪些组织中表达的最直接获取相关信息方式是: ■. Unigene B. Entrez C. LocusLink D. PCR 3.一个基因可能对应两个Unigene簇吗? ■可能 B. 不可能 4.下面哪种数据库源于mRNA信息: ■dbEST B. PDB C. OMIM D. HTGS 5.下面哪个数据库面向人类疾病构建: A. EST B. PDB ■. OMIM D. HTGS 6.Refseq和GenBank有什么区别: A. Refseq包括了全世界各个实验室和测序项目提交的DNA序列 B. GenBank提供的是非冗余序列 ■. Refseq源于GenBank,提供非冗余序列信息 D. GenBank源于Refseq 7.如果你需要查询文献信息,下列哪个数据库是你最佳选择: A. OMIM B. Entrez ■PubMed D. PROSITE 8.比较从Entrez和ExPASy中提取有关蛋白质序列信息的方法,下列哪种说法正确: A. 因为GenBank的数据比EMBL更多,Entrez给出的搜索结果将更多 B. 搜索结果很可能一样,因为GenBank和EMBL的序列数据实际一样 ■搜索结果应该相当,但是ExPASy中的SwissProt记录的输出格式不同 9.天冬酰胺、色氨酸和酪氨酸的单字母代码分别对应于: ■N/W/Y B. Q/W/Y C. F/W/Y D. Q/N/W 10.直系同源定义为: ■不同物种中具有共同祖先的同源序列 B. 具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源序列 C. 同一物种中由基因复制产生的同源序列 D. 同一物种中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列 11.下列那个氨基酸最不容易突变: A. 丙氨酸 B. 谷氨酰胺 C. 甲硫氨酸■半胱氨酸 12.PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变: A. 1% B. 20% ■. 80% D. 250% 13.下列哪个句子最好的描述了两个序列全局比对和局部比对的不同: A. 全局比对通常用于比对DNA序列,而局部比对通常用于比对蛋白质序列 B. 全局比对允许间隙,而局部比对不允许 C. 全局比对寻找全局最大化,而局部比对寻找局部最大化 ■全局比对比对整体序列,而局部比对寻找最佳匹配子序列 14.假设你有两条远源相关蛋白质序列。为了比较它们,最好使用下列哪个BLOSUM和PAM矩阵: ■BLOSUM45和PAM250 B. BLOSUM45和PAM 1 C. BLOSUM80和PAM250 D. BLOSUM10和PAM1 15.与PAM打分矩阵比较,BLOSUM打分矩阵的最大区别是: A. 最好用于比对相关性高的蛋白 B. 它是基于近相关蛋白的全局多序列比对 ■它是基于远相关蛋白的局部多序列比对 D. 它结合了全局比对和局部比对

四川大学期末考试试题——古代汉语

四川大学期末考试试题——古代汉语之一(2009-04-20 08:48:31) 标签:校园分类:典型真题解答 课程号:10423040 课序号: 0 课程名称:古代汉语-2 任课教师: 适用专业年级:学生人数:印题份数:学号: 姓名: 第1页: 一、默寫。《離騷》“長太息以掩涕兮”至“余不忍爲此態也”。(10分) 二、填空。(30×0.5=15) 1、按順序寫出《莊子·內篇》篇名:第一,第二,第三, 第四,第五,第六,第七。 2、段玉裁通過對《說文》的研究,發現了上古“”的原理,即同一個諧聲偏旁的諸多形聲字,上古屬於同一個韻部。 3、中古韻書的代表是隋代的《》,它共分個韻部。此書已亡佚,只留下部分殘卷,但是它的體例及其對中古音系的描述基本保留在宋代等的《》中。此書把中古韻母分為部。近古韻書則以元的《》個音部爲代表。

4、中古的平、上、去、入四聲,演變為近、現代的陰平、陽平、上聲和去聲四聲,發生了三項顯著的變化,即:,和。 5、補全“三十六字母”表: 第2页: 三、寫出下列反切的漢語拼音(10分): 古電切()古胡切()居銀切()

同都切() 胡口切()創舉切()如林切()府眉切() 匹凡切()博怪切() 四、解釋下列句中加點的詞(有通假、特殊用法者須注明)。(15×1=15分) 1、今至大爲不義,攻國,則弗知非,從而譽之,謂之義。非: 2、萬物作焉而不辭,生而不有,爲而不恃,功成而弗居。作: 3、此大小之辯也。辯: 4、我決起而飛,搶榆枋,時則不至,而控於地而已矣。搶: 5、木直中繩,輮以爲輪,其曲中規。中: 6、神莫大於化道,福莫長於無禍。莫: 7、聞而審之,則爲福矣;聞而不審,不若不聞。而: 8、夫離法者罪,而諸先生以文學取。離: 9、富國以農,距敵恃卒,而貴文學之士。距: 10、窈窕淑女,君子好逑。逑: 11、髧彼兩髦,實爲我特。特: 12、言既遂矣,至于暴矣。遂: 13、八月剝棗,十月獲稻。剝: 14、遵彼微行,爰求柔桑。爰:

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