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基于GO蛋白质网络功能模块调研报告

中南大学本科生毕业论文（设计）

题目基于GO的蛋白质网络功能模块评价系统的设计与实现

学生姓名田书屹

指导教师李敏

学院信息科学与工程学院专业班级

摘要

在后基因组时代，基于蛋白质网络的功能模块挖掘成为研究蛋白质相互作用机理和蛋白质功能的重要手段。但由于先验知识（即已知功能模块）的缺乏，如何有效评估挖掘的功能模块一直是一个重要课题。随着基因本体GO(Gene Ontology)的发展，每一个基因产物都会有一个或者多个GO注释信息。GO注释信息提供了蛋白质的分子功能、组成成分和生物进程，为有效评价功能模块提供了依据。本课题旨在开发出使用方便的基于GO的蛋白质网络功能模块评价系统，提供良好的用户接口，批处理完成用户提交的任务，通过计算每个功能模块的分子功能、组成成分和生物进程的P-value等，为用户提供直观的统计分析结果

本文第一张为绪论，第二章讲述蛋白质网络和相关图论知识的基本概念和基本研究方法，第三章讲述GO数据库及基于GO的功能模块评价方法，第四章为本调研报告的结束语部分，其中包含了总结和研究计划两部分。

关键词蛋白质网络 GO数据库

摘要

第一章绪论

1.1研究背景

1.2研究意义

第二章蛋白质网络的基本概念和基本研究方法

2.1 概论

2.2

第一章绪论

1.1 研究背景

虽然第一次提出蛋白质组概念是在1994年，但相关研究可以追溯到上世纪90年代中期甚至更早，尤其是80年代初，在基因组计划提出之前，就有人提出过类似的蛋白质组计划，当时称为Human Protein Index计划，旨在分析细胞内的所有蛋白质。但由于种种原因，这一计划被搁浅。90年代初期，各种技术已比较成熟，在这样的背景下，经过各国科学家的讨论，才提出蛋白质组这一概念。

国际上蛋白质组研究进展十分迅速，不论基础理论还是技术方法，都在不断进步和完善。相当多种细胞的蛋白质组数据库已经建立，相应的国际互联网站也层出不穷。1996年，澳大利亚建立了世界上第一个蛋白质组研究中心：Australia Proteome Analysis Facility ( APAF )。丹麦、加拿大、日本也先后成立了蛋白质组研究中心。在美国，各大药厂和公司在巨大财力的支持下，也纷纷加入蛋白质组的研究阵容。去年在瑞士成立的GeneProt公司，是由以蛋白质组数据库“SWISSPROT” 著称的蛋白质组研究人员成立的，以应用蛋白质组技术开发新药物靶标为目的，建立了配备有上百台质谱仪的高通量技术平台。而当年提出Human Protein Index 的美国科学家Normsn G. Anderson也成立了类似的蛋白质组学公司，继续其多年未实现的梦想。2001年4月，在美国成立了国际人类蛋白质组研究组织（Human Proteome Organization, HUPO）,随后欧洲、亚太地区都成立了区域性蛋白质组研究组织，试图通过合作的方式，融合各方面的力量，完成人类蛋白质组计划（Human Proteome Project）。

1.2研究意义

随着人类基因组计划的实施和推进，生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代，生命科学的主要研究对象是功能基因组学，包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。尽管现在已有多个物种的基因组被测序，但在这些基因组中通常有一半以上基因的功能是未知的。目前功能基因组中所采用的策略，如基因芯片、基因表达序列分析(Serial analysis of gene expression, SAGE)等，都是从细胞中mRNA的角度来考虑的，其前提是细胞中mRNA的水平反映了蛋白质表达的水平。但事实并不完全如此，从DNA mRNA 蛋白质，存在三个层次的调控，即转录水平调控(Transcriptional control )，翻译水平调控(Translational control)，翻译后水平调控(Post-translational control )。从mRNA角度考虑，实际上仅包括了转录水平调控，并不能全面代表蛋白质表达水平。实验也证明，组织中mRNA 丰度与蛋白质丰度的相关性并不好，尤其对于低丰度蛋白质来说，相关性更差。更重要的是，蛋白质复杂的翻译后修饰、蛋白质的亚细胞定位或迁移、蛋白质－蛋白质相互作用等则几乎无法从mRNA水平来判断。毋庸置疑，蛋白质是生理功能的执行者，是生命现象的直接体现者，对蛋白质结构和功能的研究将直接阐明生命在生理或病理条件下的变化机制。蛋白质本身的存在形式和活动规律，如翻译后修饰、蛋白质间相互作用以及蛋白质构

象等问题，仍依赖于直接对蛋白质的研究来解决。虽然蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多，但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。传统的对单个蛋白质进行研究的方式已无法满足后基因组时代的要求。这是因为：(1) 生命现象的发生往往是多因素影响的，必然涉及到多个蛋白质。(2) 多个蛋白质的参与是交织成网络的，或平行发生，或呈级联因果。(3) 在执行生理功能时蛋白质的表现是多样的、动态的，并不象基因组那样基本固定不变。因此要对生命的复杂活动有全面和深入的认识，必然要在整体、动态、网络的水平上对蛋白质进行研究。因此在上世纪90年代中期，国际上产生了一门新兴学科－蛋白质组学（Proteomics），它是以细胞内全部蛋白质的存在及其活动方式为研究对象。可以说蛋白质组研究的开展不仅是生命科学研究进入后基因组时代的里程碑，也是后基因组时代生命科学研究的核心内容之一。

第二章蛋白质网络的基本概念和基本研究方法

2.1概论

在破译了基因序列的后基因组时代，功能基因组学的一个目标是研究已破译基因的生物功能并控制它们. 生命体不能通过孤立的分子实现细胞功能，而是必须通过分子之间的相互作用才能实现. 因而，分析生命分子间的相互作用自然可能得到基因的生物功能更准确、详尽的信息，而近年来多种实验方法产生的大规模蛋白质相互作用数据为揭示这些基因的功能提供了可能. 在这些数据中，特别以酵母的蛋白质相互作用网络数据最为完备[1～4]. 本文拟以酵母的蛋白质相互作用网络为研究对象，采用新的模块化聚类方法，对酵母的基因功能进行研究.

从大规模数据产生到现在，对蛋白质网络的研究已经越来越得到大家的重视，统计“投票”法[5]、全局预测法[6]、谱方法[7]、概率方法[8]、马尔可夫随机场方法[9]、信息传递算法[10]等都已经被用来寻找功能模块和预测蛋白质功能，此外还有聚类方法[11～16]. 目前，聚类方法已成为寻找功能模块和预测蛋白质功能一类主要的方法，其中采用最多的是层次聚类. Rives 等[12]较早地对蛋白质相互作用网络进行了研究，用聚类方法来寻找网络功能模块，其基本假设就是近邻相互作用的蛋白质具有相似的功能. Brun 等[13]和Samanta 等[15]都利用具有相互作用蛋白质对的共同邻居定义它们之间的相似度，进而采用聚类方法预测未知蛋白质的功能. Brun 等采用的是Czekanowski-Dice 距离法，而Samanta 等则采用概率模型进行分析，他们都得到了不错的结果. 我们研究组针对蛋白质网络的矩阵可视化的需要提出了基于链接矩阵的聚类算法[16]，能够很好地反映网络的拓扑性质和生物特性，并可用于蛋白质功能的预测.现有的层次聚类算法都是用蛋白质相互作用网络的数据信息定义蛋白质间的距离或相似度，并在此基础上进行聚类分析. 本文打破了这种设计模式，直接从功能团的定义出发，汲取Brun 等和Samanta等方法的优点，考虑功能团之间一阶和二阶相互作用，定义功能模块间的相似度进行聚类分析，进而预测模块内未知蛋白质的功能. 与以往的聚类方法相比较，具有更好的预测效果. 该方法还可以应用于蛋白质代谢网、因特网、人际关系网等具有类似结构的网络，对研究一般性网络具有普遍意义.

2.2蛋白质网络的基本概念

蛋白质是生物完成各种生命活动，实现各种生命功能所必须的大分子物质，是构成一切细胞和组织结构必不可少的成分和重要的物质基础[1]。但是蛋白质的功能并不是通过单个蛋白质表现出来的，而是这通过蛋白质之间在特定条件下的相互作用（例如，磷酸化、糖基化等）才能表现出一定的功能的[2]。

蛋白质与蛋白质之间存在复杂的相互作用关系[3]，用一个无向图表示，其中每个节点表示一个蛋白质，每条边表示一对蛋白质之间的相互作用，从而构成了蛋白质相互作用网络[4]。蛋白质相互作用网络中这些紧密关联的一组蛋白质被称为一个模块、一个聚簇或一个团。

研究一个基因及其表达产物-蛋白质的功能时，绝对不可以孤立的、静止地研究其本身，一定要同时研究和它有相互作用的一些蛋白质/核酸，从而找出其对应的生物功能模块，这就是蛋白质相互作用谱(protein interaction profile) 产生的由来。这和蛋白质表达谱一样，将会给实验研究提供大量的功能信息。这是一个很好的功能预测的方法。我们也可以从拓扑结构[5]上对蛋白质网络进行分析，探寻蛋白质复合物或网络功能模块以及注释未知蛋白质功能[6]，从而得到结构上的稠密子图。将计算得出的结果与实验结果相比较，结果证明，在结构上具有紧密结构的子图在很大程度上都具有特定的生物意义，蛋白质网络的这种性质为研究和分析蛋白质功能提供了新的理论依据，给蛋白质生物功能的研究和预测开辟了新的方向。

2.3复杂网络分析的介绍

生物系统包括很多元素（基因、蛋白质、蛋白质复合物、转录因子等）的相互作用和相互调控，将其简化为节点集和边集。

无向网络、有向网络、加权网络、邻接矩阵、邻居、路、环、派系（全连通）、连通分支（无向、有向）

网络的度量：

1、节点的度（出度、入度）、度分布p(k)（联合度分布）、网络的同配或异配性

2、聚类系数：网络凝聚性的度量，也是一个节点与其邻居与派系的相似程度。聚类系数分布C(k)：度为k的所有节点的聚类系数的平均值

3、平均路径长度：为了避免不连通的点，采用了调和平均，而不是代数平均最短路径长度分布

4、其他：中心性

程度中心性：关联大量的边的点有大的程度中心性

靠近中心性：与所有其他节点有最短路径的节点有大的靠近中心性

中介中心性：最短路径经过这个点（边）的条数多的有大的中介中心性

2.3.1理论上的网络模型

ER随机网络：给定n个孤立点，每次以概率p连接两个节点，共连次。

随机网络是均匀网络，度分布服从Poisson分布，聚类系数分布平行于x 轴，平均路径长度约为log(n)，有小世界效应

WS小世界模型：给定一个规则网络，以一个固定的概率随机化重连边无标度网络：度分布服从幂律分布，有少数度高的节点，大部分节点的度比较低。平均路径长度约为log(log(n))，也具有小世界特性等级网络：聚类系数分布服从幂律分布。度低的节点有较高的凝聚性

几何随机网络：在有界的格子上随机的放节点。例如：在一个环上，当两个节点间的距离小于一个阈值时连接（最近邻耦合网络）

2.3.2子图表征

模体是一个网络通过与这个网络对应的零模型（随机图）比较得到的，可看做网络的原子组分，提供了网络的结构和功能区域

相同节点的所有可能的模体，有向图要比无向图多

局部连通模式可以用来对网络分类和比较，因此引入了度分布的一般化——子图分布的概念。这样，当它们的子图分布相似时，认为两个网络相似

最新研究集中在全局网络性质（平均路径长度、聚类系数、同配性、度分布等）。

大多数实际网络有明显的模块结构。从网络的拓扑结构确定模块有很多方法，最广泛应用的是基于模块最优化的划分技术，使得网络划分成模块时，模块内部边的数目与外部边的数目的比值最大

值得讨论的是：有多少随机图可以呈现大的模块性；模块最优化在识别模块小于一个尺度时是无效

2.4蛋白质相互作用网络（PIN）

定义PIN：节点：蛋白质；无向边：蛋白质间的实体连接的相互作用对于PIN的形成，两个主要的技术是：酵母双杂交（Y2H）和串联亲和纯化策略

因为大多数实验工作和分析是集中在酵母上的，因此我们主要集中在酵母PIN

2.4.1蛋白质相互作用数据库

蛋白质相互作用数据库包括DIP、BIND、MIPS、MINT、REACTOME，但他们之间的重叠部分很小，因此可信度不高。

这些数据库里的相互作用都是基于小规模实验得到的，集中在研究者感兴趣的蛋白质上，而高通量实验是基于全局蛋白质组的，因此小规模实验得到的数据可靠性不高

2.4.2酵母双杂交系统（Y2H）

检测诱饵蛋白（与Gal4转录因子的DNA结合域融合）和靶蛋白（与Gal4的转录活性域融合）的相互作用，他们的相互作用重构了分离的Gal4的结合并且恢复Gal4的功能，然后激活报告基因，通过检测报告基因的表达产物，判断是否发生了相互作用

但人为的使两个蛋白质在一块，会引起较高的假阳性，因为可能两个蛋白质有不同的定位，或不是同时表达的

因为杂交蛋白在细胞核中的集中，PTM可能不足，导致假阴性发生

2.4.3蛋白质复合物的串联亲和纯化（TAP）

与Y2H比较，TAP方法可以阐明天然蛋白质复合物。尽管全面的TAP纯化策略还没有应用到动物和植物的PIN上，但TAP标记对于从这些生物体中提纯复合物的改进和质谱仪的高灵敏度和精确性的发展为这类分析提供可能。

从TAP获得的网络与前面的定义有所不同。这里的边是指诱饵蛋白和其他蛋白连接，当它们是联合纯化的。这样的方式使得在相同的复合物中的蛋白质有边相连，而他们之间并不一定有直接的关联作用

2.4.4用于蛋白质组研究的蛋白质和肽芯片

蛋白质和肽芯片实验将靶蛋白或肽应用在芯片上，测量同每个诱饵蛋白或肽的亲和力，得到PIN

主要缺点：这种体外的方法缺乏生理环境

2.4.5概率模型和数据整合

对每个相互作用，依赖一个金标准（即真阳性相互作用和真阴性相互作用的参考集）的定义研究它的固有可靠性，可以用来优化计算方法对相互作用可靠预测的效率

为了提高涉及范围和精确度，整合信息的异质资源是必要的。

相互作用的可靠性可以用一个置信度表示，这个置信度可以联合多个资源得到（用朴素贝叶斯方法）：

2.5 PIN的复杂网络分析

研究表明PIN度分布服从幂律，即是无标度网络。一个讨论热点是关于真实世界数据的度分布是幂律的解释。其中一个观点是：真实世界的数据都是有噪音、不精确、不完整，是从大网络中抽样得到的

为了评定幂律结果的正确性，研究表明从无标度网络中抽样，得到的网络不是无标度网络。

因此得到的存在于PIN中的无标度特性不能很可靠的预测整个PIN，更可能的是，基于完整PIN是无标度网络，当前结果可能得到其他的度分布当随机移除节点时，无标度网络比ER-随机网络鲁棒性好。

Jeong用酵母PIN证实了节点度和重要性的正相关性；其他人也证明了中介中心性和重要性有较小的正相关性

Han提出了中心点的两个类型：

party中心：他们的基因在很多生理条件下，与所有的邻居共表达

date中心：他们的基因在某个生理条件下，与一个或很少的邻居共表达但因为大多数节点的度很低，并且依赖于生理状态，因此有人怀疑这种中心分类的存在性

2.5.1节点度相关

Maslov和Sneppen考虑了酵母的包含3278个蛋白和4549条边的PIN，与随机化重连的网络比较各个节点的度，发现了关联的异配性，比较清楚的生物学意义是：不同模块间的干扰尽可能的小。而且中心点与其他中心点分享他们的邻居，这样增加了整体的鲁棒性

2.5.2等级结构

主要思想是：有相似功能的蛋白质应该被聚到一类。

通过分析四个不同的PIN（两个基于Y2H数据库的和两个基于MIPS和DIP 的），发现聚类系数分布随度的增加递减，因此都有等级结构这样就可以基于蛋白质在网络中的位置预测它的功能

2.5.3子图分析

Wuchty研究了酵母PIN的特异性子图，发现这些特异性子图比随机情况下包含更多的保守蛋白。用InParanoid来识别高度保守蛋白，并且考虑了酵母蛋白与五种真核生物的同源的保守性

这可以作为考虑小的子图的功能生物学作用的根据

前面提到，小的子图可以用来衡量两个网络的相似程度

2.5.4模块结构和多种蛋白质复合物

PIN已经被证明有模块结构，直接的解释是，它有很多蛋白质复合物检测蛋白质复合物的方法是聚类，包括MCL（Markov聚类）、RNSC（限制邻近搜索聚类）、SPC（超顺磁聚类）和MCODE（分子复合物检测）对原有网络进行随机化移除或加边，然后用这几种算法测试，发现MCL 比其他的鲁棒性好，RNSC对边的删除更敏感，其他两种在这些方面相对弱些

模式识别的算法也可以得到模块结构，定义节点度的相似度量，开始于一个初始的随机子网络，根据相似性与他们的邻居交换信息，这种方法与MCL很相似

用网络的模块结构，根据下面两种度量定义了节点的作用

1、z，相对模块内节点度，衡量一个节点连接到模块中其他节点的好坏

2、P，参与系数，衡量节点连接到其他模块的好坏

也证明了网络的异配性

2.6蛋白质信号网络（PSN）

大多数信号网络的研究集中在减少复杂性的一个特定蛋白质翻译后修饰（PTM）

一些基于常微分方程的数学模型可以提供很多关于动力学及信号转导路径功能的洞察，但需要很多生物数据

定义PSN：节点是蛋白质的PTM状态水平；有向边是因果关系，暗示一个蛋白质的PTM状态使得另一个蛋白质的PTM状态改变。因此节点是一个定量变量，即PTM状态的浓度。磷酸化是研究的最多的PTM

2.6.1扰动策略

近来，两个主要的研究是怎样通过实验获得体内PSN和扰动分析

基本思路是：系统中的某些元素发生扰动，测量其他元素的反应。这样可以得到因果关系，但下一步要区分直接或间接作用

Santo研究了人类3个裂原活性蛋白激酶小网络的相互作用并给了一个干

扰然后推断网络的结构，后来又用到信号网络上

Sachs研究了11个蛋白质的信号网络。系统中的元素重复被干扰，并且重复测量它们的反应。与已知的路径比较，可靠性比较高

2.6.2磷酸化蛋白质组学

磷酸肽序列的质谱识别分离磷酸肽能够得到大量磷酸化位点

因为每个磷酸化蛋白质平均至少有三个磷酸化位点，这样可以定义另一个网络，将磷酸化位点看做节点，这样可以发现体内的PSN（动态的）

2.6.3用于磷酸化测量的蛋白质芯片

Ptacek发现蛋白质激酶对蛋白质不同集合磷酸化的高度相关性，暗示芯片是识别特定蛋白质激酶底物的有效工具

缺点：因为生理环境信息的缺乏，蛋白质芯片仅仅是可能激酶连接的预测。

启动信号的缺失不可避免的导致假阴性；人为地将激酶和底物靠近会导致假阳性

肽芯片可以用来确定动物和植物细胞提取物中蛋白质组范围激酶的活性缺点：除了上面的缺点，激酶与底物的对接域可能被磷酸化位点分离

2.6.4PSN的计算探索

Lingding提出NetworKIN的方法，发现PSN，这类网络信息确定了至少60%的激酶特异性，并且预测精确性提高

除了直接的蛋白质间的相互作用，STRING还提供了间接的蛋白质或基因间的相互作用

就激酶和他们的底物来说，PIN和PSN有大部分的重叠，因此，期望用PIN 的信息构建PSN

2.7总结

综述了从蛋白质组获得网络模型的实验方法和计算方法，以及复杂网络分析

强调了网络拓扑和生物系统鲁棒性的关系；网络度量和表型特征的关系；

并且功能相似的蛋白质相连接，对于预测未知蛋白很重要；每个网络点边的特异性

很多蛋白质网络的分析结果依赖于与零模型的比较：如果与随机情况是不同，这种性质可能蕴含着某些生物学意义。因此零模型的选择至关重要 PIN和PSN在不同的环境中是动态变化的，用NerworKIN或蛋白质和肽芯片将会提高细胞调控的动力学模型的构建

化学遗传学、启动子活性的时空分析、RNA干扰技术、其他的PTM分析等等可以提供这些网络的其他方面的研究

单个细胞水平的信号调控网络期望得到更精确的网络模型

包含所有发生在代谢、蛋白质组、转录的调控事件的网络将可以用复杂网络分析进行研究

第三章GO数据库及基于GO的功能模块评价方法

3.1概述

GO(gene ontology)是基因本体联合会(Gene Onotology Consortium)所建立的数据库，旨在建立一个适用于各种物种的，对基因和蛋白质功能进行限定和描述的，并能随着研究不断深入而更新的语义词汇标准。GO 是多种生物本体语言中的一种，提供了三层结构的系统定义方式，用于描述基因产物的功能．

3.2基因本体论(gene ontology)的建立

现今的生物学家们浪费了太多的时间和精力在搜寻生物信息上。这种情况归结为生物学上定义混乱的原因，不同的生物学数据库可能会使用不同的术语，好比是一些方言一样。不光是精确的计算机难以搜寻到这些随时间和人为多重因素而随机改变的定义，即使是完全由人手动处理也无法完成。举个例子来说，如果需要找到一个用于制抗生素的药物靶点，你可能想找到所有的和细菌蛋白质合成相关的基因产物，特别是那些和人体中蛋白质合成组分显著不同的。但如果一个数据库描述这些基因产物为“翻译类”，而另一个数据库描述其为“蛋白质合成类”，那么这无疑对于计算机来说是难以区分这两个在字面上相差甚远却在功能上相一致的定义。

Gene Ontology 就是为了解决上述问题，使各种数据库中基因产物功能描述相一致而发起的一个项目。这个项目最初是由1988 年对三个模式生物数据库的整合开始：the FlyBase (果蝇数据库Drosophila)，the Saccharomyces Genome Database (酵母基因组数据库SGD) 和the Mouse Genome Informatics (小鼠基因组数据库MGI)。从那开始，GO 不断发展扩大，现在已是包含数十个动物、植物、微生物的数据库。

GO 开发了具有三级结构的语义词汇标准(Ontologies)，根据基因产物的相关生物学途径、细胞学组件以及分子功能而分别给予定义，与具体物种无关。GO 的工作大致可分为三个部分：第一，给予并维持语义(terms)；第二，将位于数据库当中的基因、基因产物与GO本体论语言当中的语义(terms)进行关联，形成网络；第三，开发相关工具，使本体论标准语言的产生和维持更为便捷。

GO 的定义法则已经在多个合作的数据库中使用，这使在这些数据库中的查询具有极高的一致性。这种定义语言具有多重结构，因此在各种程度上都能进行查询。举例来说，GO可以被用来在小鼠基因组中查询和信号转导相关的基因产物，也可以进一步找到各种生物的受体酪氨酸激酶。这种结构允许在各种水平添加对此基因产物特性的认识。

3.3本体论(The ontologies)简介

GO 提供了一系列的语义（terms）用来描述基因、基因产物的特性。这些语义分为三种不同的种类：细胞学组件，用于描述亚细胞结构、位置和大分子复合物，如核仁、端粒和识别起始的复合物等；分子功能，用于描述基因、基因产物个体的功能，如与碳水化合物结合或ATP 水解酶活性等；生物学途径，指分子功能的有序组合，达成更广的生物功能，如有丝分裂或嘌呤代谢等。

基因产物可能分别具有分子生物学上的功能、生物学途径和在细胞中的组件作用。当然，它们也可能在某一个方面有多种性质。如细胞色素C，在分子功能上体现为电子传递活性，在生物学途径中与氧化磷酸化和细胞凋亡有关，在细胞中存在于线粒体质中和线粒体内膜上。

注：基因产物和其生物功能常常被我们混淆。例如，“乙醇脱氢酶”既可以指放在Eppendorf 试管里的基因产物，也表明了它的功能。但是这之间其实是存在差别的：一个基因产物可以拥有多种分子功能，多种基因产物也可以行使同一种分子功能。比如还是“乙醇脱氢酶”，其实多种基因产物都具有这种功能，而并不是所有的这些酶都是由乙醇脱氢酶基因编码的。一个基因产物可以同时具有“乙醇脱氢酶”和“乙醛歧化酶”两种功能，甚至更多。所以，在GO 中，很重要的一点在于，当使用“乙醇脱氢酶活性”这种术语时，所指的是功能，并不是基因产物。

下面，将进一步的分别说明GO 的具体定义情况。

细胞组件

即细胞中的位置，指基因产物位于何种细胞器或基因产物组中(如糙面内质网，核或核糖体，蛋白酶体等)。

分子功能

分子功能描述在分子生物学上的活性，如催化活性或结合活性。GO 分子功能用来定义功能而不是整体分子，而且不特异性地指出这些功能具体的时空信息。分子功能大部分指的是单个基因产物的功能，还有一小部分是此基因产物形成的复合物的功能。定义功能的义项包括催化活性、转运活性、结合活性等，更为狭窄的定义包括腺苷酸环化酶活性或钟形受体结合活性等。

生物学途径

生物学途径是由分子功能有序地组成的，具有多个步骤的一个过程。举例来说，较为宽泛的是细胞生长和维持、信号传导。一些更为具体的例子包括嘧啶代谢或α－配糖基的运输等。一个生物学途径并不是完全和一条生物学通路相等。因此，GO 并不涉及到通路中复杂的机制和所依赖的因素。

3.4 本体论语义之间的关系及其组织结构

3.4.1 语义之间关系的基本理解

基因本体论组织类似于图，语义作为图的结点，语义之间的关系为图中的边。因此，一旦产生新的语义，其与其它语义之间的关系也会同时被定义。语义之间的关系有四种：is a、part of 和regulates。

关系表示的几点约定

1. “语义”用图论的术语“结点”表示

2. 我们习惯于用父子结点来表示语义之间的关系，其中父结点离根结点较近，表示相对宽泛的语义，而子结点离叶子结点较近，相对父结点其语义所代表的内容更为具体。

3. 图中的实线表示结点之间的关系

4. 虚线表示推理而并未证明的关系

上述可以用下图表示：

A is a B；

B is part of C

从而可以得出：A is part of C，其形式化表示为：is a·part of → part

ofGO 图具有树的性质，但与其不同的是，GO 图中结点不但可能具有多个孩子结点，而且可能具有多个父亲结点，且与不同的父结点具有不同的关系，如下图所示：线粒体(mitochondrion)便有两个父亲结点，因为线粒体既是一种细胞器(organelle)，又是细胞质(cytoplasm)的一部分。同样，细胞器(organelle)也有两个孩子结点，因为线粒体是一种细胞器(organelle)，细胞器膜(organelle membrane)是细胞器的一部分。

3.4.2 关系之间的推导

is a· is a → is a

is a 具有传递性，即如果A is a B，B is a C，那么A is a C。形式化表示为is a· is a →is a。如下图：线粒体(mitochondrion)是一种胞内细胞器(intracellular organelle)，而胞内细胞器是一种细胞器官(organelle)，从而可以推出：线粒体是一种细胞器官。

part of·part of → part of

part of 具有传递性，如果A is part of B，B is part of C，那么A is part of C。形式化表示为part of·part of → part of。同样如下图所示：线粒体(mitochondrion)是细胞质(cytoplasm)的一部分，细胞质又是细胞(cell)的一部分，从而可得出：线粒体是细胞的一部分。

part of·is a → part of 与is a·part of → part of

如果关系is a 与part of 组合，则其关系均为part of。分别如下图所示：

3.4.3 调节控制关系(the regulates relation)及其推导

基因本体论语义中，如果某一过程直接影响另一过程或参数值(quality)的表现形式，我们称前者调节控制(regulates)后者。被调节的对象可以是一个过程，如生物通路、酶促反应等，也可以是一个参数值，如细胞大小，pH 值等。与part of 类似，调节控制关系也是充分非必要的，即：B 能且仅能调节控制A，而A 并非只受B 的调节控制。如下图所示：

例如：一旦cell cycle checkpoint(细胞周期检查点)出现时，它总是调节控制cell cycle(细胞周期)，然而细胞周期并不单独受细胞周期检查点调节控制，还受其它过程的调节控制。

regulates·is a → regulates 、is a· regulates → regulates 以及regulates· part of →regulates 均为正确的推导关系，其示意图分别如下：

截至目前，尚不能确定part of·regulates → ???、regulates·regulates → ??? 为何种关系。

3.4.4 本体论的组织结构

GO 委员会除了要定义语义(term)以外，还要定义该语义与其它语义之间的关系，使语义总体构成有一定结构的语义词汇表。

本体论的图形化表示

本体论的结构可以用图表示，其中语义表示为结点，其间的关系表示为结点之间的边。当然GO 语义之间的关系是单向的，例如：线粒体(mitochondrion)是一个细胞器(organelle)，可以表示为a mitochondrion is an organelle，但反过来不成立，细胞器不是一个线粒体！在这种意义上说，本体论的结构更像是有向非循环树，其中离根结点越近的结点越概括，离叶子结点越近的结点越具体，但与有向非循环树不同的是，本体论结构图中的结点可以有两个及其以上的父结点。例如：生物过程当中的语义已糖合成(hexose biosynthetic process)就有两个父结点，已糖代谢(hexose metabolic process) 和单糖合成(monosaccharide biosynthetic -process)。其并不难理解，因为已糖(hexose)是一种单糖(monosaccharide)，生物合成过程(biosyntheitc process)也是一种生物代谢过程(metabolic process) 。本体论中部分语义结构的图形化表示：

3.5 GO的注释(Annotation)

那么，GO 中的术语如何和相对应的基因产物相联系的呢？这是由参与合作的数据库来完成的，它们使用GO 的定义方法，对它们所包含的基因产物进行注解，并且提供支持这种注解的参考和证据。每个基因或基因产物都会有一个列表，列出与之相关的GO 术语。每个数据库都会给出所有这些基因产物和GO 术语的联系数据库，可以在GO 的站点查询到。GO 对基因和基因产物的注释阐明了基因产物和用于定义他们的GO 术语之间的关系。基因产物指一个基因编码的RNA 或蛋白产物。因为一个基因可能编码多个具有很不相同性质的产物，所以GO 推荐的注释是针对基因产物的而不是基因的。一个基因是和所有适用于它的术语联系在一起的。

一个基因产物可以被一种本体论定义的多种分支或多种水平注释。注释需要反映在正常情况下此基因产物的功能，生物途径，定位等，而并不包括其在突变或病理状态下的情况。GO 联合会的各个数据库成员采用手动或自动的方式生成注释，这两种方式共有的原理是：

1. 所有的注释都需要有来源，可以是文字、另一个数据库或是计算机分析结果；

2. 注释必须提供支持这种基因产物和GO 术语之间联系的证据。

网络攻击机制和技术发展综述

网络攻击机制和技术发展综述一、概述在这个世界上，人类不断研究和发展新的信息安全机制和工程实践，为战胜计算机网络安全威胁付出了艰巨的努力。似乎如果计算机攻击手法不再翻新，关于信息安全的战争将很快结束。虽然，大多数地下组织研究的攻击手法都是惊人的相似，无非就是：蠕虫、后门、rootkits、DoS和sniffer等。但这些手段都体现了它们惊人的威力。到今年，情况愈演愈烈。这几类攻击手段的新变种，与去年前年出现的相比，更加智能化，攻击目标直指互联网基础协议和操作系统层次。从web程序的控制程序到内核级rootkits，黑客的攻击手法不断升级翻新，向用户的信息安全防范能力不断发起挑战。 (注：rootkits, 是一种攻击脚本、经修改的系统程序，或者成套攻击脚本和工具，用于在一个目标系统中非法获取系统的最高控制权限。) 在长期与信息安全专家的较量中，黑客对开发隐蔽的计算机网络攻击技术更加得心应手。同时，这些工具应用起来也越来越简单。以前很多命令行的攻击工具被人写成了GUI(图形界面)的内核级rootkit，将这些高度诡异的攻击武器武装到了那些热中于”玩脚本的菜鸟”手中，这些杀伤力很强的黑客工具，使”脚本菜鸟”们变得象令人敬畏的黑客。当然，工具本身是不会危及系统安全的-坏事都是人干的。信息安全专业人员也使用和入侵者同样使用的扫描和监听工具，对系统安全做例行公事般地审计。在恶意用户使用前，那些能非法控制web程序的新的渗透测试工具，也被安全人员用来测试系统的漏洞。但是，还有很多的工具有它完全黑暗的一面，比如，蠕虫程序不断发展和传播，它只用来干坏事；反入侵检测工具和很多rootkits专门用来破坏系统的安全性。本文将探讨一些黑客工具的独创性，以及它们令普通人惊讶的功能。这对帮助用户考虑采用新技术和传统措施来防范这些威胁有很重要的意义:在攻击者攻击来临之前，先检测和修补系统和软件漏洞。二、Web应用程序：首选目标日益增长的网络业务应用为脆弱的web应用提供了漏洞滋生的土壤。如银行、政府机构和在线商务企业都使用了web技术提供服务。这些机构往往自己开发整套的web应用程序(ASP、JSP和CGI等)，而这些开发者由于没有获得过专业训练，导致这些自产软件漏洞百出。Web程序的开发者没有意识到，任何传递给浏览器的信息都可能被用户利用和操纵。不管用不用SSL(安全套接层)，恶意用户可以查看、修改或者插入敏感信息（包括价格、会话跟踪信息甚至是脚本执行代码）。攻击者可以通过状态操纵攻击或者SQL代码嵌入等技术危及电子商务网站的安全。所谓状态操纵攻击(state manipulation), 是指攻击者通过在URL中修改传递给浏览器的敏感信息，隐藏表格元素和cookies，达到非法访问的目的。如果一个安全意识松懈的web开发者，他把数据存储在会话ID中，而没有考虑到价格和余额等关键数据的完整性保护，则攻击者完全可以修改这些数据。再加上如果web程序相信由浏览器传递过来的数据，那么攻击者完全可以窃取用户帐号、修改价格或者修改帐户余额。所谓SQL代码嵌入(SQL injection)，是指攻击者在普通用户输入中插入数据库查询指令。这些问题相当多情况下是因为输入检验不严格和在错误的代码层中编码引起的，如对逗号”,”和分号”;”等。在这种情况下，攻击者可以对数据库进行查询、修改和删除等操作，在特定情况下，还可以执行系统指令。一般情况下，web网页上的用户名表单往往是这类攻击的入口。如果攻击者使用Proxy server执行这类操作，管理员将很难查到入侵者的来源。而要防止这类攻击，必须在自研软件开发程序上下手整治，形成良好的编程规范和代码检测机制，仅仅靠勤打补丁和安装防火墙是不够的。关于SQL Injection更多的详细信息，请参考：https://www.wendangku.net/doc/a615573496.html,/article/db/2412.htm

手机市场调研报告精彩范文

手机市场调研报告精彩范文现代人已经离不开手机，那么手机市场的调查报告要怎么写呢?一起来看看手机市场调研报告精彩范文吧! 一、调查目的：了解手机在大学生中的状况近年来，随着手机在校园里的普及，越来越多的手机厂商把目光投向了校园这一潜在的巨大市场。为了了解手机在大学生中的普遍情况、使用效果以及消费情况，掌握手机在大学的销售情况和市场前景，我们决定以大学生为调查对象，对校园里的手机市场作一次调研。二、调查对象：大学生三、设计调查项目和调查表四、调查时间：20xx年10月01日——20xx年10月25日五、调查方式：网络问卷为了使调查具有普遍性，我们放弃了传统的书面问卷形式，而采用制作电子版问卷在网络上进行调查的方式。这样做的好处是显而易见的： 1. 提高效率，减少调查工作量。我们制作的电子版调查问卷使用https://www.wendangku.net/doc/a615573496.html,平台开发，并挂在朋友的个人主机空间上，无需印刷，无需人工分派问卷 2. 调查范围更广，调查对象更具随机性。由于是在网上答卷，没有空间和时间的限制，回答我们答卷的大学生朋友人数在20天左右的时间内轻松突破1000人，最后达到了1237人，并且这些参加我们调查的朋友全国各地。这个数字是由调查页面自动跟踪生成的。

3. 数据统计便捷。我专门设计了一个调查数据统计页面，对调查数据进行自动的跟踪统计，主要有人数统计，占同类选项百分比统计等六、调查方法： 1. 由调查小组成员共同协商确定问卷内容，以书面文件形式确定，交由本人进行制作成电子版调查问卷。 2. 电子问卷制作完成并通过无错测试后，我将其上传到我朋友租用的虚拟主机空间。 3. 动员调查小组所有成员进行广泛宣传，宣传方式主要有二：一是让自己的朋友上网回答调查，二是在论坛上发布信息，让论坛上的网友帮忙回答 4. 调查完成后，由全体小组成员对调查统计数据进行分析 5. 撰写调研报告七、调查数据统计分析：本次调查共有1237人参加并且完成了问卷，全国16个省市67所高校，并且参加调查的朋友具有很高的随机性，保证了本次大学生手机调研具有一定普遍意义。我们主要针对大学生手机拥有和需求状况、学生手机的使用要求分析、学生手机族的消费动力分析、学生手机族的消费动机分析、学生手机族的目标确立分析5个方面进行数据统计和分析并最后给出我们小组的营销建议。 1. 大学生手机拥有和需求状况：

网络工程施工报告

题目：工程施工报告姓名XXX 学院信息工程学院专业计算机网络班级0X计算机网络X班指导教师XX 提交时间20XX年X月X日

目录一、系统规模 (3) 二、设计原则 (3) 1、实用性与先进性 (3) 2、开放性与标准化 (3) 3、可靠性与安全性 (3) 4、经济性与可扩充性 (4) 三、设备选型报告 (4) 四、施工配置报告 (5) 1、有办公室网络布线 (5) 2、由器、核心交换机 (5) 五、系统配置报告： (8) IIS (8) DNS: (10) DHCP: (11)

一、系统规模在两个分公司建立网络管理中心，各部门设立分中心，建立功能齐备的网络管理系统，保证网络的高效可靠运行，同时提供丰富的网络应用资源和便利的资源访问手段，将网络中心与南昌总部相连，并通过南昌总部进入Internet。二、设计原则企业计算机网络的建设，应当遵循以下原则为设计指导思想 1、实用性与先进性实用性应该成为企业网建设的首要原则，只有实用才能使公司以及员工直接受益，在实用的基础上，应当尽可能的采用先进的成熟的技术，同时选购具有先进技术水平的计算机系统、网络设备和应用软件，保证它们在相当的一段时间内的先进性和可用性。 2、开放性与标准化企业建设的一个显著的特点就是要有良好的开放性，这种开放性领先标准化来实现，使这些符合标准的计算机系统很容易地进行网络互连，为此，应该制定全网统一的网络体系结构，并遵循统一的通信协议标准。网络体系结构和通信协议应选择广泛使用的国际化工业标准，使企业网成为一个完全开放式的网络环境，便于整个企业员工的工作。 3、可靠性与安全性可靠性是企业网稳定运行的关键，网络系统所用设备和材料应当符合国际和国内认证的有关标准，并要经过严格检验，网络的每一建设过程都要把好质量关，保证网络系统有一个良好的运行环境。安全性是指网络能够有效地控制系统资源，并有完善的数据保护措施，安全性是的基础是网络的可靠性。

市场调研报告范文精选3篇

市场调研报告范文精选3篇调查报告是反映对某个问题、某个事件或某方面情况调查研究所获得的成果的文章，通过事实说明其观点，对调查对象作出评价，阐明其意义，或从总结点上的经验入手，讲明某个道理。调查报告要怎么写呢?我精选了一些关于调查报告的优秀范文，让我们一起来看看吧。市场调研报告一、调查方案 (一)调查目的：通过了解大学生手机使用情况，为手机销售商和手机制造商提供参考，同时为大学生对手机消费市场的开发提供一定的参考。 (二)调查对象：在校生 (三)调查程序： 1、设计调查问卷，明确调查方向和内容; 2、进行网络聊天调查。随机和各大学的学生相互聊天并让他们填写调查表; 3、根据回收网络问卷进行分析，具体内容如下： (1)根据样本的购买场所、价格及牌子、月消费分布状况的均值、方差等分布的数字特征，推断大学生总体手机月消费分布的相应参数;

(2)根据各个同学对手机功能的不同要求，对手机市场进行分析; 二、问卷设计大学生手机使用情况调查问卷三、数据分析根据以上整理的数据，我进行数据分析，得出结论：学生手机市场是个很广阔的具有巨大发展潜力的市场。 (一)根据学生手机市场份额分析 (二)学生消费群的普遍特点作为学生我对这个群体做了一些了解，对于我们共同的特点进行分析，得出手机市场应该针对不同学生群体开发产品或进行针对性的营销手段，才能够抢占市场。下面我们就来对学生群体的特点来进行分析： 1、学生消费群的普遍特点： 1)没有经济收入; 2)追逐时尚、崇尚个性化的独特风格和注重个性张扬; 4)学生基本以集体生活为主，相互间信息交流很快易受同学、朋友的影响。 5)品牌意识强烈，喜爱产品; (三)学生消费者购买手机的准则和特点

网络工程项目总结报告

网络工程项目总结报告项目名＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿提交时间．目录第一章项目基本情况项目概述项目描述本次项目的主要针对X行现有MGX一级骨干网的替换更新以及北京、上海之间核心骨干网的建设，将一级骨干网从基于ATM交换的传输网络升级成纯IP路由的数据网络，以更好的满足X行业务发展的需要，并满足以后网络的升级和扩展的需求。项目过程的基本回顾项目时间主要项目内容—第一阶段综合布线：综合布线方案的设计，综合布线产品的选购。第二阶段网络工程：网络方案的设计，与路由交换产品的选购及配置。第三阶段服务器搭建：web服务器的配置。主要项目过程第一阶段：绘制各楼宇平面图，根据项目情况设计布线方案，然后根据需求，选购布线产品。第二阶段：把各种设备接入网络，配置各交换机划分vlan实现内部网络的互通。配置防火墙使内部网络能访问互联网。第三阶段：配置内网web服务器、ftp服务器、dns服务器，配置ISA服务器,及外部dns服务器 web服务器,Exchange邮件服务器。项目与完成情况第二章．本人承担的主要任务第一阶段：男生宿舍布线图的绘制。第二阶段：核心交换机的配置。

第三阶段：ISA、web服务器的配置。完成项目任务的技术方案与步骤第一阶段：由于网络对传输速度及可靠性的要求，使用六类双绞线连接交机与pc，中心机房(主教学楼一楼)与男生宿舍、女生宿舍采有光纤连接。楼宇内部交换机采用六类双绞线连接。第二阶段：考虑到网络内计算机数量多，及数据的安全性，由于男生、女生宿舍部通信频繁，故把男、女生宿舍各自划分一个vlan考虑到财务部数据要求高安全性，所以把财务单独划分到一个vlan，学生机房不能与老师网络互通，也不能连互联网，所以单独划到一个vlan，其余部门划分到一个vlan。在防火墙上本配置Nat使内部网络接入互联网，配置vpn使本校区与青岛校互通。其中核心交机的vrrp的部分配置如下：核心交换机 1 1track 200 int vlan 2 line-protocol exit int vlan 2 ip add 1 ip 1 priority 120 vrrp 1 preempt vrrp 1 track 200 decrement 30 vrrp 1 authentication md5 key-string 123456 vrrp 2 ip 2 priority 100 vrrp 2 preempt 核心交换机2 vrrp 2 authentication md5 key-string 123456 track 200 int vlan 2 line-protocol exit int vlan 2 ip add 1 ip 1 priority 100 vrrp 1 preempt vrrp 1 authentication md5 key-string 123456 vrrp 2 ip 2 priority 120 vrrp 2 track 300 decrement 30 vrrp 2 preempt vrrp 2 authentication md5 key-string 123456 第三阶段：在局域网内部建立用搭建dns服务器，给内部提供域名解析，用server-u 搭建ftp服务器供学生存放作业和老师课件，用?iis 发布php，jsp 网搭建邮件服务器。md站供学校师生进行信息流。利用．项目中的问题及解决方法在做windows 2003 发布jsp php网站时，jsp网站总是访问不到默认主页必须加上才能访问到，因为在是在同一服务器发布jsp与php网站,所以把resin整合到iis上发布jsp网站，上网查了许多资料后得知，在iis的网站属性的应用程序配置中有个映射，只有在此添加的扩展名在客户访问时能主动查找并返回客户端，添加jsp的映射后能正常访问jsp网站默认主页。

互联网行业调查报告范本

Screen and evaluate the results within a certain period, analyze the deficiencies, learn from them and form Countermeasures. 姓名：___________________ 单位：___________________ 时间：___________________ 互联网行业调查报告

编号：FS-DY-62073 互联网行业调查报告随着3.15的临近，人们对于消费者权益保障问题关注度再次升温。尤其随着互联网行业的发展，互联网市场存在的问题频频出现，包括电子商务、互联网金融以及电信服务等方面，问题明显。这些问题不但侵犯了消费者的权益、影响消费体验，也影响了行业的稳定发展。其中尤其是b2c网购、o2o和p2p网贷三大热门领域，一度也成为了侵犯消费者权益问题的重灾区。速途研究院分析师团队通过市场调查相关数据，分析了国内互联网市场所面临的消费者权益问题，并为消费市场敲响警钟。四大问题高发领域及主要问题国内互联网行业内问题出现最为频繁，接受投诉最为广泛的主要包括：o2o、b2c、p2p以及电信服务。o2o在国内起步时间不长，主要问题体现在餐饮服务行业，包括食品安全

以及送餐时间过长等问题;b2c网上购物以淘宝/天猫等几大平台为代表，接受消费者投诉屡创新高，问题集中体现在商品质量和服务两大方面;p2p网贷仅XX年出现的问题平台就有275家之多，问题主要体现在提现困难和老板跑路;电信服务今年的投诉情况较去年增长了将近4倍，其中手游市场的飞速发展带来的手有投诉案件激增起到了主导作用，此外乱扣费现象依然频发。 XX-XX年网络投诉行业分布网络服务占比超过1/3 XX-XX年度各行业投诉量统计显示，国内被投诉最多的行业为网络服务行业，占到了34.52%，超过全部投诉量的1/3;其次是it通讯行业，投诉占比22.86%;第三位是家电行业，占比9.15%;汽车行业投诉占比6.23%排在第四位;房产家居以3.89%的占比位列第五。此外，服装美容、旅游教育、金融保险、食品烟酒、医疗健康等行业的投诉分别占到3.72%、3.15%、2.10%、2.04%、1.82%。可见网络服务行业较传统行业存在的问题更多，随着互联网的继续发展，作为一个虚拟的交互空间，有必要提供足够的安全手段来保障线上消费者的合法权益。

网络隔离技术发展历程和未来方向

网络隔离技术发展历程和未来方向面对新型网络攻击手段的出现和高安全度网络对安全的特殊需求，全新安全防护防范理念的网络安全技术——“网络隔离技术”应运而生。网络隔离技术的目标是确保把有害的攻击隔离，在可信网络之外和保证可信网络内部信息不外泄的前提下，完成网间数据的安全交换。网络隔离技术是在原有安全技术的基础上发展起来的，它弥补了原有安全技术的不足，突出了自己的优势。隔离技术的发展历程网络隔离，英文名为Network Isolation，主要是指把两个或两个以上可路由的网络（如：TCP/IP）通过不可路由的协议（如：IPX/SPX、NetBEUI等）进行数据交换而达到隔离目的。由于其原理主要是采用了不同的协议，所以通常也叫协议隔离（Protocol Isolation）。1997年，信息安全专家Mark Joseph Edwards在他编写的《Understanding Network Security》一书中，他就对协议隔离进行了归类。在书中他明确地指出了协议隔离和防火墙不属于同类产品。隔离概念是在为了保护高安全度网络环境的情况下产生的；隔离产品的大量出现，也是经历了五代隔离技术不断的实践和理论相结合后得来的。第一代隔离技术——完全的隔离。此方法使得网络处于信息孤岛状态，做到了完全的物理隔离，需要至少两套网络和系统，更重要的是信息交流的不便和成本的提高，这样给维护和使用带来了极大的不便。第二代隔离技术——硬件卡隔离。在客户端增加一块硬件卡，客户端硬盘或其他存储设备首先连接到该卡，然后再转接到主板上，通过该卡能控制客户端硬盘或其他存储设备。而在选择不同的硬盘时，同时选择了该卡上不同的网络接口，连接到不同的网络。但是，这种隔离产品有的仍然需要网络布线为双网线结构，产品存在着较大的安全隐患。第三代隔离技术—数据转播隔离。利用转播系统分时复制文件的途径来实现隔离，切换时间非常之久，甚至需要手工完成，不仅明显地减缓了访问速度，更不支持常见的网络应用，失去了网络存在的意义。第四代隔离技术—空气开关隔离。它是通过使用单刀双掷开关，使得内外部网络分时访问临时缓存器来完成数据交换的，但在安全和性能上存在有许多问题。第五代隔离技术—安全通道隔离。此技术通过专用通信硬件和专有安全协议等安全机制，来实现内外部网络的隔离和数据交换，不仅解决了以前隔离技术存在的问题，并有效地把内外部网络隔离开来，而且高效地实现了内外网数据的安全交换，透明支持多种网络应用，成为当前隔离技术的发展方向。隔离技术需具备的安全要点要具有高度的自身安全性隔离产品要保证自身具有高度的安全性，至少在理论和实践上要比防火墙高一个安全级别。从技术实现上，除了和防火墙一样对操作系统进行加固优化或采用安全操作系统外，关键在于要把外网接口和内网接口从一套操作系统中分离出来。也就是说至少要由两套主机系统组成，一套控制外网接口，另一套控制内网接口，然后在两套主机系统之间通过不可路由的协议进行数据交换，如此，既便黑客攻破了外网系统，仍然无法控制内网系统，就达到了更高的安全级别。要确保网络之间是隔离的保证网间隔离的关键是网络包不可路由到对方网络，无论中间采用了什么转换方法，只要最终使得一方的网络包能够进入到对方的网络中，都无法称之为隔离，即达不到隔离的效果。显然，只是对网间的包进行转发，并且允许建立端到端连接的防火墙，是没有任何隔离效果的。此外，那些只是把网络包转换为文本，交换到对方网络后，再把文本转换为网络包的产品也是没有做到隔离的。要保证网间交换的只是应用数据既然要达到网络隔离，就必须做到彻底防范基于网络协

20xx网络工程师工作总结

20xx网络工程师工作总结一、前言从我入职之后开始，在公司领导及各部门各同事各单位的帮助下，严格要求自己，遵守公司各项规章制度及管理程序，与同事之间相处融洽;工作上，尽职尽责。严格履行系统集成工程师的岗位职责，认真学习，努力工作，较好地完成了本职工作和领导交给的各项任务，为了今后更好的工作，总结经验、吸取教训;本人就本年度的工作做出总结。二、主要职责 1、负责系统集成设计及售前、售后服务及维修工作; 2、负责协助销售部门、商务部门做好技术支持工作及培训工作; 3、负责提高部门的技术专业水平以及员工的系统集成服务能力; 4、负责系统集成项目的总体设计; 5、负责系统集成安装、调试的全面工作; 6、负责施工程方案及施工计划的编制与实施; 7、负责组织、协调及监督综合布线工程的实施; 8、负责工程用设备及物资的进货检验; 9、负责对客户进行各阶段的培训工作，严格执行服务手册的要求; 10、负责公司产品销售的技术服务咨询与技术支持，跟踪疑难问题的解决。三、工作心得

曾遇到的问题与处理方法技术方面：问题描述：在民政大厅调试H3C交换机，配置好后但其光路无法接通。处理方法：检查光模块，切换别用线缆测试，还是无法连通，进接口查看，发现一端是强制10M，一端是强制1000M，修改接口速率后网络连通，问题最终处理。问题描述：旅游发展公司网络突然断线，办公区设备无法正常连接网络; 处理方法：在客户端检测，网络到接入交换机到网关都是通的，网关到外网无法连通，经排查是广电接入模块坏了，更换设备解决问题。主要参与项目湿地公园项目是我来公司后第一次负责的大型项目，由于前期项目现场负责人变动，所有的工作并不像想象中的那么一帆风顺，通过和项目设计部同事沟通，对照设备采购单清单，根据设备情况设计网络架构图，根据监控，广播，WiFi 等业务情况，划分网络区域来合理的利用核心交换机的性能。但是在项目中关于广播系统，和大华监控系统不熟悉，厂家技术有不是太配合来现场帮忙指导，只有在公司同事帮助下和自己搜索资料，最终配置完成。另外作为系统集成工程师，在项目建设的过程中将会面对着各方面的单位及人员的复杂关系。自己在项目中的一言一行都代表着公司的利益，我们一定要搞清楚自己在项目中所处的角色和定位，在这个前提下，我们还要具备较好的技术能力和较好的应变沟通能力来处理和协调在项目实施过程中遇到的和项目中各单位角色的各种问题。需加强培训

网络工程实施报告

XX 省绿卡 INTRANET 网络工程实施报告目录第一章、工程管理 (4) 1、工程管理的工作目标 (4) 2、工程管理内容 (5) A、详细工程计划 (5) B、基于工程计划协调工程进展 (5)

C、工程管理 (6) D、人力资源和设备资源的统一管理 (6) E、统一协调 (6) 3、工程管理计划 (PMP) (6) 4、工程协调会 (7) 5、文档管理 (7) 第二章、工程实施 (8) 实施步骤： 1：工程准备阶段 (8) 2：硬件安装联调阶段 (8) 3：工程初验 (9) 4：试运行及终验 (9) 具体实施： 1．项目进度表： (10) 2．准备工作要求 (10) 3．网络拓扑结构 (11) 4、网络设备命名规则 (13) 5．线路情况说明 (13) 6．地址分配 (13) 7．路由规划 (15) 8．云南绿卡网络的具体技术特性，可靠性、冗余备份 (17) 第三章、技术支持与服务 (19) 1、技术支持力量 (19) 2、售后服务 (19) 3、保修服务 (20) 4、技术支持服务时间及人员 (20) 第四章、网络设备安装 (21) 1、XX 绿卡过程工程中心点安装实施 (21) 2、电路情况调查表 (22) 3、机房情况调查表 (22) 4、大理、玉溪中心 LAN 的调整 (23) 5、地州、县局的安装 (23)

第五章、工程实施验收 (25) 1、数据网络的连通性测试 (25) 2、 IP电话的连通性及效果测试 (25) 3、备份线路、备份路由的测试 (26) 4、网络路由汇聚的测试 (26) 5、网管系统的功能测试 (26) 第六章、工程文档 (27) 1、安装报告 (27) 2、验收报告 (32) 3、 IP 地址分配表 (35) 4、 IP 电话号码表 (37) 5、设备技术参数 (37) 6、设备配置参数 (37) 第一章、工程管理 1、工程管理的工作目标 XX 科技有限公司充分认识到一个数据、语音网络工程实施成功的标志是：按时、有序、保质地完成一个统一的数据、语音通信系统，而有效的工程督导是整个工程实施取得成功的关键。XX 公司自一九九一年进入中国市场以来，先后在金融、油田、电信、邮政、政府等多个领域展开合作，是目前在中国具备实施基于 CISCO 设备的全国数据、语音通信网工程实际经验的专业性网络集成公司。基于多年的工程经验， XX 公司具备一套行之有效的工程管理程序，可以保证用户数据网络项目的顺利完成。 XX 公司将向用户提供有效的工程实施质量控制程序，确保XX 绿卡网络工程的质量和进度。该程序包括设计细化认证、人力资源管理（项目领导小组确认）、产品和材料管理、工程和技术档案管理等。所有相关的技术资料和操作手册将及时提供给用户有关机构的管理人员，以便用户及时掌握和了解这些技术。

市场调查报告范文6篇

市场调查报告范文6篇市场调查报告范文市场调查报告范文（一）：关于手机的市场调研报告目前我国手机产业在市场快速发展的依托下，继续持续了高速增长的发展势头。而手机商也在极力的至于手机的创新，追求更加的与众不同，以至于在市场的竞争中占据优势。这时候智能手机就顺应时代的潮流而问世了。谷歌安卓系统的HTc、苹果IoS系统Iphone顿时风靡全球。在中国市场有力的挑战了诺基亚的市场份额第一的宝座。时代在进步，社会在发展。不想落后那么就务必得创新，务必跟得上时代的脚步。国产手机虽然取得了群体性的突破，但系统、品质、营销、宣传等都跟不上国外品牌，占领市场份额的优势很弱。国产魅族就顺应时代呈此刻消费者面前，让所有的国产手机商有了借鉴的榜样。不可否认的魅族手机的宣传很到位、很成功。但宣传的成功并不代表真正的成功。在真正的开售日开始，魅族手机的各种各样的问题就显示出来了。于此基础上，在各种渠道从魅族手机的营销、优势、产品、库存多个方面上进行了资料搜集，并保证执行操作的简易性与客观性，最后对问卷进行了详尽的分析，并借以了超多数据与图表，以此更加全面地阐明问卷的具体状况，得

出更加精准与富有代表性的结论。调查实施调查背景根据工业和信息化部统计，XX年我国手机产量亿部，占全球手机产量的%;截止到XX年5月底，我国手机用户已经到达亿户，并继续持续快速增长态势。但是从国内手机市场的品牌占有状况看，国产品牌的手机只占%，中国的手机市场依然是海外品牌一统天下的局面。XX年中国手机市场规模将接近1600亿，智能手机、音乐手机、3G手机将成为未来5年市场发展的亮点。中国手机市场进入规模化增长阶段，产品及市场层面的竞争相当激烈，产品同质化、价格战及渠道下沉是最直接表现，厂商竞争重点也由争夺市场份额向追求利润转移，手机市场竞争全面升级。与此同时，手机核准制取消以及中国3G 手机市场即将启动加速手机市场竞争全面升级，一方面体此刻优势品牌份额集中及众多中小品牌份额分化，另一方面体此刻厂商、运营商、渠道商及零售商之间的博弈由竞争向竞合发展。调查方法本次调查我们小组采用了问卷调查的方式，我们使用了标准化的问卷程序。问卷以一般性问题开始，而后随着问卷

网络攻击溯源技术概述

引言随着互联网覆盖面的不断扩大，网络安全的重要性不断增加。面对层出不穷的新型网络入侵技术和频率越来越高的网络入侵行为，对高级IDS （intrusion detection system）的需求日益迫切。从20 世纪70 年代开始了网络攻击防护措施的最初研究，本文首先分析了网络溯源面临的问题，然后述了溯源的分类和应用场景，最后介绍了多种溯源技术的优点。计算机网络是计算机技术和通信技术发展到一定程度相结合的产物，Internet的出现更是将网络技术和人类社会生活予以紧密的结合。随着网络技术的飞速发展，越来越多的传统运作方式正在被低耗、开放、高效的分布式网络应用所替代，网络已经成为人们日常生活中不可缺少的一部分。但是，随之而来基于网络的计算机攻击也愈演愈烈，尤其是DDoS攻击，攻击者利用网络的快速和广泛的互联性，使传统意义上的安全措施基本丧失作用，严重威胁着社会和国家的安全；而且网络攻击者大都使用伪造的IP地址，使被攻击者很难确定攻击源的位置，从而不能实施有针对性地防护策略。这些都使得逆向追踪攻击源的追踪技术成为网络主动防御体系中的重要一环，它对于最小化攻击的当前效果、威慑潜在的网络攻击都有着至关重要的作用。近年来互联网飞速发展，截至2011年6 月底，中国网民数量达到2.53 亿，网民规模跃居世界第一位，普及率达19.1%，全球普及率已经达到21.1%。互联网已经拥有足够庞大的用户基础，网上有游戏、聊天、论坛、邮件、商场、新闻等不同的应用和服务，现实生活中存在的现象、业务、社会关系以及服务在网络上都有不同程度的体现，互联网已经成为名副其实的虚拟社会。现实生活中除了存在道德约束以外，还有法律威慑———违法犯罪活动会被追查，犯罪活动实施者为此可能付出很大的代价甚至人身自由。而与现实生活不同的是在网络虚拟社会中似乎只有类似道德约束的用户自律，却没有法律威慑。网络上大量存在DDoS 攻击、木马、蠕虫、僵尸网络、非授权访问、发送垃圾邮件等恶意行为，但是由于网络匿名传统以及溯源能力的缺失，上述恶意行为即使涉及现实生活的违法犯罪，也很难有效取证和追查，网络犯罪实施者因此有恃无恐，更加猖獗。近年来，随着社会生活越来越依赖互联网，互联网安全问题已经在抑制网络健康

网络攻击技术及攻击实例介绍全解

网络攻击技术及攻击实例介绍摘要：随着计算机网络的广泛使用，网络攻击技术也迅猛发展。研究网络攻击带来的各种威胁，有针对性的对这些威胁进行有效防范，是加固安全防御体系的重要途径。研究计算机网络攻击技术，模拟黑客行为，以敌手推演为模型、以攻防对抗为实践方式来验证网络整体安全防护效能，是加强网络安全防护的一种重要手段。本文介绍了WEB脚本入侵攻击、缓沖区滋出攻击、木马后门攻击、网络设备攻击、内网渗透攻击、拒绝服务攻击、网电空间对抗六种典型网络攻击技术及伊朗核设施遭震网技术的网络攻击案例。一、网络攻击技术分类计算机网络攻击是网络攻击者利用网络通信协议自身存在的缺陷、用户使用的操作系统内在缺陷或用户使用的程序语言本身所具有的安全隐患，通过使网络命令或者专门的软件非法进人本地或远程用户主机系统，获得、修改、删除用户系统的信息以及在用户系统上插入有害信息，降低、破坏网络使用效能等一系列活动的总称。从技术角度看，计算机网络的安全隐患，一方面是由于它面向所有用户，所有资源通过网络共享，另一方面是因为其技术是开放和标准化的。层出不穷的网络攻击事件可视为这些不安全因素最直接的证据。其后果就是导致信息的机密性、完整性、可用性、真实性、可控性等安全属性遭到破坏，进而威胁到系统和网络的安全性。从法律定义上，网络攻击是入侵行为完全完成且入侵者已在目标网络内。但是更激进的观点是(尤其是对网络安全管理员来说)，可能使一个网络受到破坏的所有行为都应称为网络攻击，即从一个入侵者开始对目标机上展开工作的那个时刻起，攻击就开始了。通常网络攻击过程具有明显的阶段性，可以粗略的划分为三个阶段: 准备阶段、实施阶段、善后阶段。

网络工程师个人工作总结报告

网络工程师个人工作总结报告时光飞逝，不知不觉间我入司已经2个多月了，从陌生到熟悉，从一开始对系统的不了解、不熟悉，到现在基本能够掌握公积金的整个系统，这与各位领导和工作同仁的关心和协助是分不开的，借此机会向各位表示最衷心的感谢!感谢公司各位领导对我工作的协助和肯定。现将工作总结如下：一、增强学习，提升自身品质意识，树立严谨的品质理念积极参加公司里组织的各方面的培训课程的学习，严格要求自己，认真做好每日的工作，对现场的设备实行定期的维护，遇到问题积极与甲方沟通与协调，做的今日事今日毕。积极参加公司的培训活动，服从分配，处处以身作则，持续提升自己。二、严格遵守执行公司的各项规章制度，自觉履行自己的工作职责尽职尽责，从不叫苦叫累。严格遵守并执行公司里的各项规章制度和纪律要求，做到按时上班，不迟到不旷工，积极参加公司里组织的各项活动，服从领导工作安排;按时完成领导交给的各项工作任务，不搞情绪化，自觉履行工作职责，认真完成本职工作任务。【篇二】网络工程师个人工作总结报告本人就聘于****公司计算机工程师。并在任职前已经获得计算机工程师技能资格，进入公司了来，我严格履行本职职责，努力工作，持续学习，不但完成了自己的工作和领导交给的个项任务，而且乐于协助公司解决各种问题，得到领导信任和同事的赞扬，年度任职考核全部优秀，以下是我的工作总结。工作方面：

本人熟悉本专业领域的国内外现状和发展趋势，具有丰富的计算机理论知识和计算机在企业管理方面的体会，具有较强的处理本专业实际问题的水平，能将本专业与相关专业相互配合，协调处理相关技能难题，能指导工程师工作和学习。任职期间，较好的完成了公司下达的责任目标; 一、在*年至*年间，实行了**计算机网络综合管理系统的建设与实施工程，使**企业办公自动化以及生产调度自动化走向当代化的前沿。二、主持完成了总公司**系统，实现**无纸化办公。三、受**的委托，为部分技能人员和管理人员累计授课达***余课时，在授课流程中，自己能将理论结合实际，深入浅出，圆满完成了教程任务，提升了本公司技能人员素质和职工素质，为计算机的普及做了一定的贡献; 四、**至**年，先后为公司以及下属部门独立编制了**等具有本企业特色的软件; 五、*年作为主要负责人之一完成了总公司的**管理信息系统，取得一定的社会和经济效益，使**服务上了一个新的台阶。思想政治表现：能认真学习马列主义、毛泽东思想和邓小平理论，拥护党的领导，坚持四项基本原则，热爱祖国，遵纪守法，具有良好的思想素质和职业道德，能用“三个代表”的要求来指导自己的行动。积极要求进步，团结友善，明礼诚信，曾于****年**计算机使用大赛中荣获一等奖，并于****年度被***评为“***”。工作业绩：一、在“**系统”中，本人实行了部分模块的软件编写工作，该系统经省、市科委鉴定，被**奖。

网络攻击溯源技术概述

网络攻击溯源技术概述随着互联网覆盖面的不断扩大，网络安全的重要性不断增加。面对层出不穷的新型网络入侵技术和频率越来越高的网络入侵行为，对高级IDS（intrusion detection system）的需求日益迫切。从20 世纪70 年代开始了网络攻击防护措施的最初研究，本文首先分析了网络溯源面临的问题，然后述了溯源的分类和应用场景，最后介绍了多种溯源技术的优点。引言计算机网络是计算机技术和通信技术发展到一定程度相结合的产物，Intemet的出现更是将网络技术和人类社会生活予以紧密的结合。随着网络技术的飞速发展，越来越多的传统运作方式正在被低耗、开放、高效的分布式网络应用所替代，网络已经成为人们日常生活中不可缺少的一部分。但是，随之而来基于网络的计算机攻击也愈演愈烈，尤其是DDoS攻击，攻击者利用网络的快速和广泛的互联性，使传统意义上的安全措施基本丧失作用，严重威胁着社会和国家的安全；而且网络攻击者大都使用伪造的IP地址，使被攻击者很难确定攻击源的位置，从而不能实施有针对性地防护策略。这些都使得逆向追踪攻击源的追踪技术成为网络主动防御体系中的重要一环，它对于最小化攻击的当前效果、威慑潜在的网络攻击都有着至关重要的作用。

近年来互联网飞速发展，截至2011年6 月底，中国网民数量达到2.53 亿，网民规模跃居世界第一位，普及率达19.1%，全球普及率已经达到21.1%。互联网已经拥有足够庞大的用户基础，网上有游戏、聊天、论坛、邮件、商场、新闻等不同的应用和服务，现实生活中存在的现象、业务、社会关系以及服务在网络上都有不同程度的体现，互联网已经成为名副其实的虚拟社会。现实生活中除了存在道德约束以外，还有法律威慑———违法犯罪活动会被追查，犯罪活动实施者为此可能付出很大的代价甚至人身自由。而与现实生活不同的是在网络虚拟社会中似乎只有类似道德约束的用户自律，却没有法律威慑。网络上大量存在DDoS 攻击、木马、蠕虫、僵尸网络、非授权访问、发送垃圾邮件等恶意行为，但是由于网络匿名传统以及溯源能力的缺失，上述恶意行为即使涉及现实生活的违法犯罪，也很难有效取证和追查，网络犯罪实施者因此有恃无恐，更加猖獗。近年来，随着社会生活越来越依赖互联网，互联网安全问题已经在抑制网络健康有序发展，互联网亟需建设溯源能力。

网络工程项目总结报告

网络工程项目总结报告项目名 ____________ 提交时间 ____________

目录第一章项目基本情况 1.1 项目概述 1.1.1 项目描述本次项目的主要针对X 行现有MGX 一级骨干网的替换更新以及北京、上海之间核心骨干网的建设，将一级骨干网从基于ATM 交换的传输网络升级成纯IP 路由的数据网络，以更好的满足X 行业务发展的需要，并满足以后网络的升级和扩展的需求。 1.2 项目过程的基本回顾 1.2.1 项目时间 1.2.2 主要项目内容第一阶段综合布线：综合布线方案的设计，综合布线产品的选购。第二阶段网络工程：网络方案的设计，与路由交换产品的选购及配置。第三阶段服务器搭建：web 服务器的配置。 1.2.3 主要项目过程第一阶段：绘制各楼宇平面图，根据项目情况设计布线方案，然后根据需求，选购布线产品。第二阶段：把各种设备接入网络，配置各交换机划分vlan 实现内部网络的互通。配置防火墙使内部网络能访问互联网。第三阶段：配置内网web服务器、ftp服务器、dns服务器，配置ISA服务器,及外部dns 服务器web 服务器,Exchange 邮件服务器。第二章项目与完成情况 2.1 本人承担的主要任务第一阶段：男生宿舍布线图的绘制。第二阶段：核心交换机的配置。第三阶段：ISA 、web 服务器的配置。 2.2 完成项目任务的技术方案与步骤第一阶段：由于网络对传输速度及可靠性的要求，使用六类双绞线连接交机与 pc,中心机房（主教学楼一楼）与男生宿舍、女生宿舍采有光纤连接。楼宇内部交换机采用六类双绞线连接。第二阶段：考虑到网络内计算机数量多，及数据的安全性，由于男生、女生宿舍部通信频繁，故把男、女生宿舍各自划分一个vlan 考虑到财务部数据要求高安全性，所以把财务单独划分到一个vlan，学生机房不能与老师网络互通，也不能连互联网，所以单独划到一个vlan，其余部门划分到一个vla n。在防火墙上本配置Nat 使内部网络接入互联网，配置vpn 使本校区与青岛校互通。其中核心交机的vrrp 的部分配置如下：核心交换机1 1track 200 int vlan 2 line-protocol exit

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