细菌属名
1 产水菌门(Aquificae)
1.1 产水菌纲(Aquificae)
2 热袍菌门(Thermotogae)
2.1 热袍菌纲(Thermotogae)
3 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)
3.1 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria)
4 恐球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)
4.1 恐球菌纲(Deinococci)
5 产金菌门(Chrysiogenetes)
5.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)
6 绿弯菌门(Chloroflexi)
6.1 绿弯菌纲(Chloroflexi)
6.2 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)
7 热微菌门(Thermomicrobia)
7.1 热微菌纲(Thermomicrobia)
8 硝化螺旋菌门(Nitrospira)
8.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira)
9 脱铁杆菌门(Deferribacteres)
9.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)
10 蓝藻门(Cyanobacteria)
10.1 蓝藻纲(Cyanobacteria)
11 绿菌门(Chlorobi)
11.1 绿菌纲(Chlorobia)
12 变形菌门(Proteobacteria)
12.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)
12.2 β-变形菌纲(Betaproteobacteria)
12.3 γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)
12.4 δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)
12.5 ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria)
13 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）
13.1 梭菌纲(Clostridia)
13.2 柔膜菌纲(Mollicutes)
13.3 芽孢杆菌纲(Bacilli)
14 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）
14.1 放线菌纲(Actinobacteria)
15 浮霉菌门(Planctomycetes)
15.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia)
16 衣原体门(Chlamydiae)
16.1 衣原体纲(Chlamydiae)
17 螺旋体门(Spirochaetes)
17.1 螺旋体纲(Spirochaetes)
18 纤维杆菌门(Fibrobacteres)
18.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres)
19 酸杆菌门(Acidobacteria)
19.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)
20 拟杆菌门(Bacteroidetes)
20.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)
20.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)
20.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)
21 梭杆菌门(Fusobacteria)
21.1 梭杆菌纲(Fusobacteria)
22 疣微菌门(Verrucomicrobia)
22.1 疣微菌纲(Verrucomicrobiae)
23 网团菌门(Dictyoglomi)
23.1 网团菌纲(Dictyoglomi)
24 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes) 24.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes) 产水菌门(Aquificae)
产水菌纲(Aquificae)
产水菌目(Aquificales)
产水菌科(Aquificaceae)
产水菌属(Aquifex) (Calderobacterium) (Hydrogenobaculum)
氢杆菌属(Hydrogenobacter) (Hydrogenothermus) (Persephonella) (Sulfurihydrogenibium) (Thermocrinis)
科未定
(Balnearium)
除硫杆菌属(Desulfurobacterium)
热弧菌属(Thermovibrio)
热袍菌门(Thermotogae)
热袍菌纲(Thermotogae)
热袍菌目(Thermotogales)
热袍菌科(Thermotogaceae)
热袍菌属(Thermotoga) (Fervidobacterium)
(Geotoga)
(Marinitoga)
(Petrotoga)
热袍菌属(Thermosipho)
热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)
热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria)
热脱硫杆菌目(Thermodesulfobacteriales)
热脱硫杆菌科(Thermodesulfobacteriaceae)
热脱硫杆菌属(Thermodesulfobacterium)
(Thermodesulfatator)
恐球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)
恐球菌纲(Deinococci)
恐球菌目(Deinococcales)
恐球菌科(Deinococcaceae)
恐球菌属(Deinococcus) （注：依据希腊语δεινο? / deinos，与“恐龙”的dino-同源）
栖热菌目(Thermales)
栖热菌科(Thermaceae)
栖热菌属(Thermus)
海栖热菌属(Marinithermus)
亚栖热菌属(Meiothermus)
海洋栖热菌属(Oceanithermus)
火山栖热菌属(Vulcanithermus)
产金菌门(Chrysiogenetes)
产金菌纲(Chrysiogenetes)
产金菌目(Chrysiogenales)
产金菌科(Chrysiogenaceae)
产金菌属(Chrysiogenes)
绿弯菌门(Chloroflexi)
绿弯菌纲(Chloroflexi)
绿弯菌目(Chloroflexales)
绿弯菌科(Chloroflexaceae)
绿弯菌属(Chloroflexus)
绿线菌属(Chloronema)
太阳发菌属(Heliothrix)
玫瑰弯菌属(Roseiflexus)
颤绿菌科(Oscillochloridaceae)
颤绿菌属(Oscilochloris)
爬管菌目(Herpetosiphonales)
爬管菌科(Herpetosiphonaceae)
爬管菌属(Herpetosiphon)
厌氧绳菌纲(Anaerolineae)
厌氧绳菌目(Anaerolineales)
厌氧绳菌科(Anaerolineaceae)
厌氧绳菌属(Anaerolinea)
暖绳菌属(Caldilinea)
热微菌门(Thermomicrobia)
热微菌纲(Thermomicrobia)
热微菌目(Thermomicrobiales)
热微菌科(Thermomicrobiaceae)
热微菌属(Thermomicrobium)
硝化螺旋菌门(Nitrospira)
硝化螺旋菌纲(Nitrospira)
硝化螺旋菌目(Nitrospirales)
硝化螺旋菌科(Nitrospiraceae)
硝化螺旋菌属(Nitrospira)
钩端螺菌属(Leptospirillum)
磁杆菌属(Magnetobacterium)
热脱硫弧菌属(Thermodesulfovibrio) 脱铁杆菌门(Deferribacteres)
脱铁杆菌纲(Deferribacteres)
脱铁杆菌目(Deferribacterales)
脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)
脱铁杆菌属(Deferribacter) (Denitrovibrio)
(Flexistipes)
地弧菌属(Geovibrio)
科未定
(Synergistes)
暖发菌属(Caldithrix)
蓝藻门(Cyanobacteria)
蓝藻纲(Cyanobacteria)
注：本文采用的Bergey's手册中蓝藻内的分类，不论目科属，均为形态分类，其中目在手册中为“Subsection”而非“Order”，目、科均未列名称，此处目名称为习习用法，科不列名称；属除Halospirulina和Trichodesmium之外均标为“形态属”(Form Genus)而非“属”(Genus)。表中在形态分类后面加注"@"。预料不久的将来整个蓝藻分类系统将会大调，与其它细菌统一为系统发育分类系统。
此外，因汉语“藻”字可指多种水生光合产氧生物，包括多支互不相关的原生生物甚至高等水生植物，此处仍用按照“藻”翻译蓝藻门(Cyanobacteria)细菌。但也可依据个人理念将名称定为“某菌”或“某蓝菌”，但应注意避免与其余细菌重名。
色球藻目(Chroococcales)@
第一科@
管孢藻属(Chamaesiphon)@
色球藻属(Chroococcus)@
藻青菌(Cyanobacterium)@
(Cyanobium)@
蓝藻(Cyanothece)@
蓝纤维藻属(Dactylococcopsis)@
(Gloeobacter)@
黏球藻属(Gloeocapsa)@
黏杆藻属(Gloeothece)@
微囊藻属(Microcystis)@
原绿球藻属(Prochlorococcus)@
原绿藻属(Prochloron)@
聚球藻属(Synechococcus)@
集胞藻属(Synechocystis)@
宽球藻目(Pleurocapsales)@
第一科@
(Cyanocystis)@
(Dermocarpella)@
(Stanieria)@
异球藻属(Xenococcus)@
第二科@
拟色球藻属(Chroococcidiopsis)@
黏囊藻属(Myxosarcina)@
宽球藻属(Pleurocapsa)@
颤藻目(Oscillatoriales)@
第一科@
节螺藻属(Arthrospira)@ （包含商业化螺旋藻）
(Borzia)@
(Crinalium)@
(Geitlerinema)@
盐螺旋藻属(Halospirulina)
(Leptolyngbya)@
(Limnothrix)@
鞘丝藻属(Lyngbya)@
微鞘藻属(Microcoleus)@
颤藻属(Oscillatoria)@ (Planktothrix)@
原绿发藻属(Prochlorothrix)@ (Pseudanabaena)@
螺旋藻属(Spirulina)@ (Starria)@
束藻属(Symploca)@
束毛藻属(Trichodesmium) (Tychonema)@
念珠藻目(Nostocales)@
第一科@
鱼腥藻属(Anabaena)@
项圈藻属(Anabaenopsis)@
束丝藻属(Aphanizomenon)@ (Cyanospira)@
拟柱胞藻(Cylindrospermopsis)@ 筒孢藻属(Cylindrospermum)@ 节球藻属(Nodularia)@
念珠藻属(Nostoc)@
伪枝藻属(Scytonema)@
第二科@
眉藻属(Calothrix)@
胶须藻属(Rivularia)@
单歧藻属(Tolypothrix)@
真枝藻目(Stigonematales)@
第一科@ (Chlorogloeopsis)@
费氏藻属(Fischerella)@ (Geitleria)@
(Iyengariella)@
拟念珠藻属(Nostochopsis)@
真枝藻属(Stigonema)@
绿菌门(Chlorobi)
绿菌纲(Chlorobia)
绿菌目(Chlorobiales)
绿菌科(Chlorobiaceae)
绿菌属(Chlorobium)
臂绿菌属(Ancalochloris)
绿棒菌属(Chlorobaculum)
绿爬菌属(Chloroherpeton)
暗网菌属(Pelodictyon)
突柄绿菌属(Prosthecochloris)
变形菌门(Proteobacteria)
α-变形菌纲(Alphaproteobacteria) 红螺菌目(Rhodospirillales)
红螺菌科(Rhodospirillaceae)
红螺菌属(Rhodospirillum)
固氮螺菌属(Azospirillum) (Inquilinus)
磁螺菌属(Magnetospirillum)
褐螺菌属(Phaeospirillum)
红篓菌属(Rhodocista)
红螺旋菌属(Rhodospira)
红弧菌属(Rhodovibrio) (Roseospira)
(Skermanella) (Thalassospira)
(Tistrella)
醋杆菌科(Acetobacteraceae)
醋杆菌属(Acetobacter)
嗜酸菌属(Acidiphilium) (Acidisphaera)
酸胞菌属(Acidocella) (Acidomonas)
(Asaia)
(Craurococcus)
葡糖醋杆菌属(Gluconacetobacter) 葡糖杆菌属(Gluconobacter) (Kozakia)
(Muricoccus) (Paracraurococcus) (Rhodopila)
(Roseococcus)
(Rubritepida)
(Stella)
(Teichococcus)
(Zavarzinia)
立克次体目(Rickettsiales)
立克次体科(Rickettsiaceae)
立克次体属(Rickettsia)
东方体属(Orientia)
无形体科(Anaplasmataceae)
无形体属(Anaplasma)
埃及小体属(Aegyptianella)
考德里氏体属(Cowdria)
埃里希体属(Ehrlichia)
新立克次体属(Neorickettsia)
沃巴赫体属(Wolbachia)
(Xenohaliotis)
全孢菌科(Holosporaceae)
全孢菌属(Holospora)
科未定
(Caedibacter)
(Lyticum)寄生于草履虫的一属尚未确定分类的一种(Odyssella)
(Pseudocaedibacter) 一属分类学关系不明确的细菌(Symbiotes)
被菌属(Tectibacter)
红细菌目(Rhodobacterales)
红细菌科(Rhodobacteraceae)
红细菌属(Rhodobacter)
(Ahrensia)
(Albidovulum)
(Amaricoccus)
(Antarctobacter)
(Gemmobacter)
(Hirschia)
生丝单胞菌属(Hyphomonas)
(Jannaschia)
(Ketogulonicigenium)
(Leisingera)
(Maricaulis)
(Methylarcula)
(Oceanicaulis)
(Octadecabacter)
(Pannonibacter)
副球菌属(Paracoccus)
(Pseudorhodobacter)
(Rhodobaca)
(Rhodothalassium)
小红卵菌属(Rhodovulum)
(Roseibium)
(Roseinatronobacter)
(Roseivivax)
玫瑰杆菌属(Roseobacter)
(Roseovarius)
(Rubrimonas)
(Ruegeria)
(Satittula)
(Silicibacter)
(Staleya)
(Stappia)
(Sulfitobacter)
鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales) 鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae) 鞘脂单胞菌属(Sphingomonas) (Blastomonas)
赤杆菌属(Erythrobacter) (Erythromicrobium) (Erythromonas) (Novosphingobium)
紫杆菌属(Porphyrobacter) (Rhizomonas) (Sandaracinobacter) (Sphingobium)
(Sphingopyxis)
发酵单胞菌属(Zymomonas)
柄杆菌目(Caulobacterales)
柄杆菌科(Caulobacteraceae)
柄杆菌属(Caulobacter)
不粘柄菌属(Asticcacaulis) (Brevundimonas) (Phenylobacterium)
根瘤菌目(Rhizobiales)
根瘤菌科(Rhizobiaceae)
根瘤菌属(Rhizobium)
土壤杆菌属(Agrobacterium)
根瘤菌属(Allorhizobium) (Carbophilus)
(Chelatobacter)
剑菌属(Ensifer)
中华根瘤菌属(Sinorhizobium)
橙单胞菌科(Aurantimonadaceae)
橙单胞菌属(Aurantimonas) (Fulvimarina)
巴通体科(Bartonellaceae)
巴通体属(Bartonella)
布鲁氏菌科(Brucellaceae)
布鲁氏菌属(Brucella)
支动菌属(Mycoplana)
苍白杆菌属(Ochrobactrum)
叶杆菌科(Phyllobacteriaceae)
叶杆菌属(Phyllobacterium) (Aminobacter) (Aquamicrobium) (Defluvibacter)
(Liberibacter)
中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium) (Nitratireductor) (Pseudaminobacter)
甲基孢囊菌科(Methylocystaceae)
甲基孢囊菌属(Methylocystis) (Albibacter)
(Methylopila)
甲基弯曲菌(Methylosinus) (Terasakiella)
拜叶林克氏菌科(Beijerinckiaceae) 拜叶林克氏菌属(Beijerinckia) (Chelatococcus) (Methyulocapsa) (Methylocella)
慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae) 慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)
阿菲波菌属(Afipia) (Agromonas)
芽生杆菌属(Blastobacter) (Bosea)
硝化杆菌属(Nitrobacter) (Oligotropha)
(Rhodoblastus)
红假单胞菌属(Rhodopseudomonas) 生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)
生丝微菌属(Hyphomicrobium)
臂微细菌属(Ancalomicrobium) (Ancylobacter) (Angulomicrobium) (Aquabacter)
固氮根瘤菌(Azorhizobium)
绿菌属(Blastochloris)
(Devosia) (Dichotomicrobium) (Filomicrobium)
(Gemmiger)
(Labrys)
(Methylorhabdus)
土微菌属(Pedomicrobium)
突柄微菌属(Prosthecomicrobium) 红微菌属(Rhodomicrobium)
红游动菌属(Rhodoplanes)
塞里伯氏菌属(Seliberia) (Starkeya)
黄色杆菌属(Xanthobacter)
甲基杆菌科(Methylobacteriaceae) 甲基杆菌属(Methylobacterium) (Microvirga)
原滴虫属(Protomonas) (Roseomonas)
红菌科(Rhodobiaceae)
红菌属(Rhodobium) (Roseospirillum)
短小盒菌目(Parvularculales)
短小盒菌科(Parvularculaceae)
短小盒菌属(Parvularcula)
β-变形菌纲(Betaproteobacteria) 伯克氏菌目(Burkholderiales)
伯克氏菌科(Burkholderiaceae)
伯克氏菌属(Burkholderia)
贪铜菌属(Cupriavidus) (Lautropia)
(Limnobacter)
(Pandoraea)
(Paucimonas) (Polynucleobacter)
青枯菌属(Ralstonia) (Thermothrix)
沃特氏菌属(Wautersia)
草酸杆菌科(Oxalobacteraceae) 草酸杆菌属(Oxalobacter)
杜擀氏属(Duganella)
草螺菌属(Herbaspirillum)
紫色杆菌属(Janthinobacterium) (Massilia) (Oxalicibacterium)
(Telluria)
产碱菌科(Alcaligenaceae)
产碱菌属(Alcaligenes)
无色杆菌属(Achromobacter)
博德氏菌属(Bordetella) (Brackiella)
德克斯氏菌属(Derxia) (Kerstersia)
(Oligella)
(Pelistega)
(Pigmentiphaga)
(Sutterella)
(Taylorella)
丛毛单胞菌科(Comamonadaceae) 丛毛单胞菌属(Comamonas)
食酸菌属(Acidovorax) (Alcyclophilus) (Brachymonas) (Caldimonas)
代尔夫特菌属(Delftia) (Diaphorobacter)
噬氢菌属(Hydrogenophaga) (Hylemonella)
闪板硫菌属(Lampropedia)
大单胞菌属(Macromonas) (Ottowia)
(Polaromonas)
(Ramlibacter)
红育菌属(Rhodoferax)
贪噬菌属(Variovorax) (Xenophilus)
科未定
(Aquabacterium)
(Ideonella)
纤发菌属(Leptothrix) (Roseateles)
红长命菌属(Rubrivivax) (Schlegelella)
球衣菌（细胞）属(Sphaerotilus) (Tepidimonas)
(Thiomonas)
嗜木质菌属(Xylophilus)
嗜氢菌目(Hydrogenophilales)
嗜氢菌科(Hydrogenophilaceae)
嗜氢菌属(Hydrogenophilus)
硫杆状菌属(Thiobacillus)
嗜甲基菌目(Methylophilales)
嗜甲基菌科(Methylophilaceae)
嗜甲基菌属(Methylophilus) (Methylobacillus) (Methylovorus)
奈瑟菌目(Neisseriales)
奈瑟菌科(Neisseriaceae)
奈瑟菌属(Neisseria)
小链菌属(Alysiella)
水螺菌属(Aquaspirillum)
色杆菌属(Chromobacterium)
艾肯氏菌属(Eikenella) (Formivibrio)
(Iodobacter)
金氏菌属(Kingella)
(Laribacter)
(Microvirgula)
(Morococcus)
(Prolinoborus)
西蒙斯氏菌属(Simonsiella)
透明颤菌(Vitreoscilla) (Vogesella)
亚硝化单胞菌目(Nitrosomonadales) 亚硝化单胞菌科(Nitrosomonadaceae) 亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)
亚硝（酸）化叶菌属(Nitrosolobus)
亚硝化螺旋菌属(Nitrosospira)
螺菌科(Spirillaceae)
螺菌属(Spirillum)
嘉利翁氏菌科(Gallionellaceae)
加利翁氏菌属(Gallionella)
红环菌目(Rhodocyclales)
红环菌科(Rhodocyclaceae)
红环菌属(Rhodocyclus)
固氮弓菌属(Azoarcus) (Azonexus)
(Azospira)
(Azovibrio)
(Dechloromonas) (Dechlorosoma)
铁杆菌(Ferribacterium) (Propionibacter)
(Propionivibrio)
(Quadricoccus) (Sterolibacterium)
陶厄氏菌属(Thauera)
动胶菌属(Zoogloea)
普罗卡杆菌目(Procabacteriales)
普罗卡杆菌科(Procabacteriaceae)
普罗卡杆菌属(Procabacter)
γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)
着色菌目(Chromatiales)
着色菌科(Chromatiaceae)
着色菌属(Chromatium) (Allochromatium)
可变细菌属(Amoebobacter)
盐着色菌属(Halochromatium) (Isochromatium)
(Lamprobacter)
闪光囊硫菌属(Lamprocystis) (Marichromatium)
亚硝化球菌属(Nitrosococcus) (Pfennigia)
棍着色菌属(Rhabdochromatium) (Rheinheimera)
热着色菌属(Thermochromatium)
硫碱球菌属(Thioalkalicoccus)
硫橄榄菌属(Thiobaca)
硫匣菌属(Thiocapsa)
硫球菌属(Thiococcus)
硫囊菌属(Thiocystis)
硫网菌属(Thiodictyon)
硫黄球菌属(Thioflavicoccus)
硫盐匣菌属(Thiohalocapsa) (Thiolamprovum)
板硫菌属(Thiopedia)
硫红球菌属(Thiorhodococcus)
硫红弧菌属(Thiorhodovibrio)
硫螺菌属(Thiospirillum)
外硫红螺旋菌科(Ectothiorhodospiraceae) 外硫红螺旋菌属(Ectothiorhodospira)
碱湖生菌属(Alcalilimnicola)
碱螺菌属(Alkalispirillum) (Arhodomonas)
盐红螺旋菌属(Halorhodospira)
硝化球菌属(Nitrococcus)
硫碱螺旋菌属(Thioalkalispira)
硫碱弧菌属(Thialkalivibrio)
硫红螺旋菌属(Thiorhodospira)
盐硫杆状菌科(Halothiobacillaceae) 盐硫杆状菌属(Halothiobacillus)
酸硫杆状菌目(Acidithiobacillales)
酸硫杆状菌科(Acidithiobacillaceae) 酸硫杆状菌属(Acidithiobacillus)
热硫杆状菌科(Thermithiobacillaceae) 热硫杆状菌属(Thermithiobacillus)
黄色单胞菌目(Xanthomonadales)
黄色单胞菌科(Xanthomonadaceae) 黄色单胞菌属(Xanthomonas) (Frateuria)
(Fulvimonas)
(Luteimonas)
溶杆菌属(Lysobacter)
涅瓦菌属(Nevskia) (Pseudoxanthomonas) (Rhodanobacter)
(Schineria)
寡养单胞菌(Stenotrophomonas) (Thermomonas)
(Xylella)
心杆菌目(Cardiobacteriales)
心杆菌科(Cardiobacteriaceae)
心杆菌属(Cardiobacterium) (Dichelobacter)
(Suttonella)
硫发菌目(Thiotrichales)
硫发菌科(Thiotrichaceae)
硫发菌属(Thiothrix)
无色菌属(Achromatium)
贝日阿托菌属(Beggiatoa)
亮发菌属(Leucothrix)
硫细杆菌属(Thiobacterium)
硫株菌(Thiomargarita)
辫硫菌属(Thioploca)
硫螺菌属(Thiospira) (Francisellaceae)
费朗西斯氏菌属(Francisella) (Piscirickettsiaceae) (Piscirickettsia)
解环菌属(Cycloclasticus) (Hydrogenovibrio) (Methylophaga)
(Thioalkalimicrobium) (Thiomicrospira)
军团菌目(Legionellales)
军团菌科(Legionellaceae)
军团菌属(Legionella)
柯克斯体科(Coxiellaceae)
柯克斯体属(Coxiella) (Aquicella)
立克次氏小体属(Rickettsiella) 甲基球菌目(Methylococcales) 甲基球菌科(Methylococcaceae) 甲基球菌属(Methylococcus)
甲基杆菌属(Methylobacter) (Methylocaldum) (Methylomicrobium)
甲基单胞菌属(Methylomonas) (Methylosarcina) (Methylosphaera)
海洋螺菌目(Oceanospirillales) 海洋螺菌科(Oceanospirillaceae) 海洋螺菌属(Oceanospirillum) (Balneatrix)
海单胞菌属(Marinomonas) (Marinospirillum) (Neptunomonas) (Oceanobacter)
(Oleispira) (Pseudospirillum) (Thalassolituus) (Alcanivoraceae)
食烷菌(Alcanivorax) (Fundibacter) (Hahellaceae)
(Hahella)
(Zooshikella)
盐单胞菌科(Halomonadaceae) 盐单胞菌属(Halomonas) (Carnimonas)
色盐杆菌属(Chromohalobacter) (Cobetia)
(Deleya)
(Zymobacter) (Oleiphilaceae)
(Oleiphilus)
(Saccharospirillaceae)
(Saccharospirillum)
假单胞菌目(Pseudomonadales)
假单胞菌科(Pseudomonadaceae)
假单胞菌属(Pseudomonas)
氮单胞菌属(Azomonas)
固氮菌属(Azotobacter)
纤维弧菌属(Cellvibrio)
(Chryseomonas)
(Flavimonas)
(Mesophilobacter)
根杆菌属(Rhizobacter)
(Rugamonas)
(Serpens)
莫拉菌科(Moraxellaceae)
莫拉菌属(Moraxella) （包含布兰汉氏菌(Branhamella)）不动杆菌属(Acinetobacter)
嗜冷杆菌属(Psychrobacter)
科未定
(Enhydrobacter)
交替单胞菌目(Alteromonadales)
交替单胞菌科(Alteromonadaceae)
交替单胞菌属(Alteromonas)
(Aestuariibacter)
(Alishewanella)
(Colwellia)
(Ferrimonas)
(Glaciecola)
(Idiomarina)
海杆菌属(Marinobacter)
(Marinobacterium)
(Microbulbifer)
(Moritella)
单胞菌属(Pseudoalteromonas)
(Psychromonas)
希瓦氏菌属(Shewanella)
(Thalassomonas)
微生物检验实验室诺卡菌属标准操作规程
微生物检验实验室诺卡菌属标准操作规程 1概述 诺卡菌属是一群需氧的、能形成气中菌丝、有孢子的革兰阳性菌。包括9个种，其中星形诺卡菌、巴西诺卡菌、皮诺卡菌、豚鼠耳炎诺卡菌、南非诺卡菌、新星诺卡菌等6个种与人类疾病有关。 2. 标本类型 痰液、脑脊液、穿刺液、脓液、血液等标本。 3 鉴定 3.1 态与染色：革兰阳性，菌体为丝状，称为菌丝或菌丝体。培养早期，菌体裂解为较多的球菌或杆菌状，分枝状菌丝较小；培养后期，可见丰富菌丝体形成。在脓液、痰和脑脊液等临床标本中，为纤细的分枝状菌丝。抗酸染色弱阳性。 3.2 培养特性：注意寻找标本中的颗粒接种培养，在不含抗生素的沙氏培养基（SDA）或营养琼脂培养基上，22℃或35℃均可缓慢生长，需5~7天可见菌落。菌落表面有皱褶，呈颗粒状、黄色或深橙色，表面无白色菌丝。在血琼脂平板上菌落较小、凸起，呈白色，时间延长可出现橙色。 3.3 生化反应：分解葡萄糖，不分解甘露醇、肌醇、酪蛋白、酪氨酸和黄嘌呤，不水解淀粉，不液化明胶。 鉴别要点：3.4
3.4.1 本菌特征：革兰阳性，菌体为丝状，抗酸染色弱阳性；生长缓慢，菌落较小；分解葡萄糖，不分解酪蛋白、酪氨酸和黄嘌呤。 3.4.2 与分枝杆菌的鉴别：星形诺卡菌革兰染色性强，抗酸染色性弱，盐酸乙醇易脱色，菌体呈丝状；分枝杆菌抗酸性强，不易脱色，革兰染色弱。 3.4.3 与红球菌属的鉴别：星形诺卡菌对青霉素耐药，红球菌则敏感。 3.4.4 与棒状杆菌的鉴别：星形诺卡菌菌体呈丝状，而棒状杆菌属菌体一端或两端膨大呈棒状。 3.4.5 与分枝杆菌属和放线菌属的鉴别三者镜下形态相似，但星性诺卡菌抗酸染色弱阳性，分枝杆菌属强阳性，放线菌属为阴性。 3.5 操作步骤 3.5.1 观察菌落特征，挑取可疑菌落，涂片染色镜检。 3.5.2 触酶试验参见触酶试验标准操作规程 3.5.3 鉴定从SDA平板上挑取纯菌落，用仪器法或传统生化法进行细菌鉴定。 4. 药敏 参见药物敏感性试验标准操作规程及CLSI M100-S20最新版本文件。 质量控制5.
诺卡菌病,诺卡菌病的症状,诺卡菌病治疗【专业知识】
诺卡菌病,诺卡菌病的症状,诺卡菌病治疗【专业知识】 疾病简介 奴卡菌病是由诺卡菌(又称奴卡菌)引起的急、慢性、化脓性(偶为肉芽肿性)疾病。奴卡菌属于放线菌。奴卡菌通过感染皮肤和内脏，引起局部和全身症状。 疾病病因 一、发病原因诺卡菌属共百余种，广布于土壤，大多为需氧菌。多数为腐物寄生性的非病原，不属于人体正常菌群，故不呈内源性感染。对人致病的主要有3种：星形诺卡菌(N. asteroides )、豚鼠诺卡菌(N.caviae)和巴西诺卡菌(N.brasiliensis )。以星形诺卡菌和巴西诺卡菌多见。后者致病力强，可引起暴发流行。在我国最常见的为星形诺苄菌。本菌属的共同特征是菌丝纤细，直径0.3～0.2μm，多弯曲如树根状，一般生长到10多小时开始形成隔膜，并断裂成长度不等的杆状、杈状细丝。革兰染色阳性，胞壁IX型，糖类A型，并含LCN-A类脂和诺卡菌酸，DNA中GC含量为60～70mol%。星形诺卡菌菌落表面无白色菌丝;巴西诺卡菌菌落表面有白色菌丝生长。 二、发病机制 病原菌多经外伤进入皮肤或经呼吸道、消化道进入人体，然后局限于某一器官或组织，或经血液循环播散至脑、肾或其他器官。病原菌进入人体后，人体免疫系统中的中性粒细胞通过溶菌酶和其他阳离子蛋白的作用抑制诺卡菌。巨噬细胞和T淋巴细胞也能制和杀灭本菌。因此当宿主免疫防御机制削弱时容易引发本病。此外诺卡菌对吞噬细胞呼吸爆发产物有抵抗力，说明吞噬细胞呼吸爆发与诺卡菌病的发病有密切的联系。 症状体征 一、症状奴卡菌侵犯皮肤和内脏，发生局部和全身感染，引起多种临床表现。 1.皮肤感染皮肤受创后引起病原菌侵入而发病，亦可由肺部病变发展而来。臂部可出现链状排列的皮下结节群，呈孢子丝菌病样奴卡菌病。也可表现为脓肿及慢性瘘管或疣状损害类似皮肤结核，
放线菌与诺卡菌
放线菌与诺卡菌、螺旋体、支原体、立克次体、衣原体复习题 一、选择题： A型题： 1．下述微生物中哪种不是原核细胞型 A．钩端螺旋体 B.沙眼衣原体 C.衣氏放线菌 D.肺炎支原体 E.白色念珠菌 2．下述哪不是依色列放线菌的特性 A．在组织病灶中可出现硫磺样颗粒 B.可导致口腔内感染 C. 属于真核细胞型 微生物 D.抗生素治疗有效 E.机体对放线菌的免疫主要靠细胞免疫 3．衣氏放线菌感染的最常见部位是 A.肠道 B.中枢神经系统 C.面颈部软组织 D.胸膜 E.泌尿道 4．放线菌在机体组织中形成的菌落是 A.硫磺样颗粒 B.细菌L型 C.荷包蛋样菌落 D.黑色菌落 E.绒毛样菌落 5．放线菌与龋齿和牙周炎有关，能产生粘性很强的物质，种物质是 A. 6-去氧太洛糖 B.荚膜 C.普通菌毛 D.顶端结构 E.鞭毛 6．放线菌生长时，对气体的要求是 A.专性需氧 B.专性厌氧 C.需加30％C02 D.微需氧或厌氧 E.兼性厌氧 7．诺卡菌属引起的感染多为 A.内源性感染 B.蚊虫叮咬感染 C.动物的咬伤 D.外源性感染 E.接触感染 8．诺卡菌广泛存在于 A .口腔 B.土壤 C.皮肤 D.肠道 E.水 9．分离放线菌应使用 A.沙保培养基 B.罗氏培养基 C.碱性蛋白胨水培养基 D.BCYE培养基 E.S-S琼脂 10．下述对放线菌正确的描述为 A.多数可致人类疾病 B.多以分裂方式繁殖、有菌丝 C.形成菌丝及孢子的真核生物 D.必须在活的细胞中才能生长繁殖 E.感染细胞内可形成包涵体 11．放线菌感染的病变部位可见 A.异染颗粒 B.质粒 C.硫磺样颗粒 D.内含颗粒 E.营养颗粒 12．可引起内源性感染，好发部位为颈部和颜面部的病原体是 A.衣原体 B.真菌 C.放线菌 D.支原体 E.立克次体 13．关于放线菌错误的是
诺卡菌属生物危害评估报告
诺卡菌属生物危害评估报告 一、细菌的传播与致病 诺卡菌属细胞壁含分枝菌酸，是广泛分布于土壤中的需氧性放线菌。多数为腐物寄生性的非病原，不属于人体正常菌群，故不呈内源性感染。分为星形诺卡菌、短链诺卡菌、鼻疽诺卡菌、肉色诺卡菌、巴西诺卡菌、越橘诺卡菌、豚鼠耳炎诺卡菌、南非诺卡菌、苦味诺卡菌等9种。对人致病的主要有3种：星形诺卡菌（N. asteroides )、豚鼠诺卡菌（N.caviae)和巴西诺卡菌N.brasiliensis )。引起人类疾病主要为星形诺卡菌和巴西诺卡菌。在我国最常见的为星形诺苄菌。奴卡菌病多为外源性感染，可因吸入肺部或侵入创口引起化脓感染。如星形诺卡菌主要通过呼吸道进入人体引起人的原发性、化脓性肺部感染，可出现肺结核的症状如咳嗽,发热,寒战,胸痛,衰弱,纳差和体重减轻,但这些症状都是非特异性的,并且与肺结核或化脓性肺炎相似。胸腔积液也可发生。约1/3病例可发生转移性脑脓肿,通常可有严重头痛和局灶性神经系统异常。肺部病灶可转移到皮下组织，形成脓肿、溃疡和多发性瘘管，也可扩散到其他器官，如引起脑脓肿、腹膜炎等。表现为化脓性肉芽肿样改变，在感染的组织内及脓汁内也有类似“硫磺样颗粒”，呈淡黄色、红色或黑色，称色素颗粒。巴西诺卡菌可因侵入皮下组织，引起慢性化脓性肉芽肿，表现为肿胀、脓肿及多发性瘘管，好发于腿部，称为足分枝菌病。 奴卡菌感染常可发生在一些进行性疾病或免疫障碍性疾病患者的晚期尤其是柯兴综合症、糖尿病或长期应用皮质激素、免疫抑制及广谱抗生素患者。但约一半病人并无预先存在的疾病。本病已被认为是晚期艾滋病患者的一种机会性感染.其他诺卡菌有时也可引起局部或偶也可是全身性的感染。 二、细菌的生物学特性 奴卡菌为革兰氏阳性杆菌，有细长的菌丝，菌丝末端不膨大。色素小颗粒压碎染色镜检，可见颗粒呈菊花状。抗酸染色为弱阳性，在盐酸酒精种较长时间可完全脱色，这可与结核杆菌相区别。本菌属为专性需氧菌。在普通培养基或沙氏琼脂培养基中可缓慢生长，需5~7天可见菌落大小不等，表面有皱褶，颗粒状；不同种类可产生不同色素，如橙红、粉红、黄、黄绿、紫以及其他颜色。在培养的早期菌体裂解为较多的球菌或杆菌状，分枝状菌丝较少。菌丝直径为1μm或更小。若培养时间较长，则菌丝易断裂，可见有丰富菌丝体形成。星形诺卡菌菌落表面无白色菌丝；巴西诺卡菌菌落表面有白色菌丝生长。在液体培养基中常在表面生长形成菌膜，下部液体澄清。 三、细菌的实验室检查及其它检查 1、涂片镜检根据脓、痰涂片和压片检查，可见有革兰阳性和部分抗酸性分枝菌丝若见散在的抗酸性杆菌，应与结核分枝杆菌相区别。 2、分离培养：标本接种分离可用沙保培养基或脑心浸液琼脂平板置37℃培养。因星形诺卡菌在45℃时生长，故温度可有初步鉴别意义。培养24—48h后有小菌落缓慢出现，淡黄色粗颗粒样，边缘陷入培养基中，表面干燥，白色或淡黄色。时间延长则菌落皱折、堆叠如皮革样，表面有天鹅绒样气中菌丝体。需注意，诺卡菌入侵肺部后由于巨噬细胞等免疫因素的
奴卡菌属所致的皮肤软组织感染宜选药物
奴卡菌属所致的皮肤软组织感染宜选药物 一、什么是奴卡菌？ 奴卡菌病系由奴卡氏菌属引起的局限性或播散性、恶急性或慢性化脓性疾病；是一种慢性化脓性(偶或为肉芽肿性)疾病。原发感染在肺，可以无任何症状或仅有肺部症状，有时也可经血源播散而成为系统性感染，多见于20岁-60岁男性。 病原和流行病学本病可由星形奴卡氏菌、巴西奴卡菌或豚鼠奴卡菌引起，病菌为需氧菌，存在于土壤。带菌的灰尘、土壤或食物通过呼吸道、皮肤或消化道进入人体，然后局限于某一器官或组织，或经血循环散播至脑、肾或其他器官。男女老幼普遍易感，不受地区影响。本病的发生和传播途径与机体的抵抗力有密切关系。从皮肤侵入者，常有局限性，可表现为足菌肿型或皮肤脓肿型，很少呈血源性扩散。如通过呼吸道入侵，则首先引起肺部感染，只有在机体抵抗力降低的情况下(特别继发于白血病、淋巴瘤或长期应用免疫抑制剂后)，往往引起血源性播散。因此不少学者认为奴卡菌特别是星形奴卡氏菌也是一种条件致病菌。 二、宜选药物 磺胺哒嗪对本病具有特效，但每日剂量需达6～10g，以期使血浓度≥20mg／100mL，并需应用3～6月以上，有时可并用磺胺增效剂。急性期尚可加用链霉素，每日～2g，脑部感染者可加用环丝氨酸，每6h 250mg。鉴于二者均可透入中枢神经系统，不必加用鞘内治疗。对脑脓疡、脓胸等尚可辅以外科切开排脓，同时应用上述诸抗菌药物。 三、病因分析 本病主要是由星形奴卡菌所引起，但巴西奴卡菌、巴拉圭奴卡菌、
白乐杰奴卡菌、马杜拉奴卡菌等也可致病。它们均属于裂殖菌纲、放线菌目、放线菌科。在组织内和培养中的形态均表现为很长的菌丝。 四、检查手段 本病根据临床表现，真菌检查，尤其是找到颗粒，即可确诊。但其肺部感染需与各期肺结核鉴别。如波及胸膜、胸壁时又需与放线菌病区别。当奴卡菌病的症状不典型时，也应与其它肺真菌病、细菌性脑脓肿、肺癌、肉瘤或晚期梅毒等相鉴别。星形奴卡菌感染者，常可发生于一些其它进行性消耗病及免疫功能障碍的晚期，其中尤易并发于肺泡蛋白沉积症、Cushings综合征、糖尿病或长期应用皮质类固醇、免疫抑制剂及广谱抗生素的患者中。
奴卡菌属所致的皮肤软组织感染宜选药物
奴卡菌属所致的皮肤软组织感染宜选药物 奴卡菌病 【别名】 Nocardiosis 【概述】 奴卡菌病是由奴卡菌属中的某些菌种引起的疾病，好发于肺部和中枢神经系统，亦可血源播散于全身各器官，局部感染则可表现为奴卡菌足菌肿。 奴卡菌为专性需氧菌,该菌存在于土壤中,人类通过外源性感染,引起局限性或播散性,亚急性或慢性化脓性疾病,近年来由于肾上腺皮质激素和免疫抑制剂的广泛应用,奴卡菌的发病率呈上升趋势。 【治疗概述】 1、达巴万星第 1 周 1000 mg，第 2 周 500 mg 静脉注射 1 周 1 次，双倍剂量 >30 min 2 周 2、奥利万星1200 mg 静脉注射 1 次>3 h 1 次 3、泰地唑利200 mg 静脉注射/口服 1 天 1 次>60 min 6 天 4、特拉万星10 mg/kg 静脉注射 1 天 1 次>60 min 7-14 天 5、头孢洛林600 mg 静脉注射 1 天 2 次>60 min 5-14 天 6、利奈唑胺600 mg 静脉注射/口服 1 天 2 次>30-120 min 10-14 天（治疗抗万古霉素肠球菌为 14-28 天） 7、达托霉素500 mg 静脉注射 1 天 1 次>30 min 7-14 天
8、万古霉素15-20 mg/kg 静脉注射 1 天 1-2 次>60 min 7-14 天 长效药 1、达巴万星 达巴万星是一类半合成脂糖肽类抗生素，通过抑制细菌胞壁合成达到杀菌目的，最低抑菌浓度为 0.03-0.12 μg/mL，对 MRSA 有杀菌作用，半衰期长达 8.5 天，给药周期一般为 1 周 1 次。 2、奥利万星 奥利万星是一类万古霉素的脂糖肽类抗生素衍生物，对万古霉素耐受的革兰氏阳性菌可产生浓度依赖性抗菌活性，药理作用为抑制细菌胞壁合成和破坏细菌细胞膜的稳定性，最低抑菌浓度与达巴万星相近，且对 MRSA 有杀菌作用。 奥利万星以药物原形态通过尿液或粪便排出体外，对于高龄、肾功能不全以及轻度至中度肝功能不全患者可不考虑剂量调整。药物半衰期约 393 h，给药周期一般为 1 周 1 次。 短效药 1、泰地唑利 泰地唑利是第二代恶唑烷酮类药物，药理机制与利奈唑胺相近，通过抑制蛋白质合成而达到杀菌作用，对于利奈唑胺耐药菌株、MRSA、万古霉素耐药肠球菌有明