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DOI 10.1093nargkg005 The PEDANT genome database

DOI 10.1093nargkg005 The PEDANT genome database
DOI 10.1093nargkg005 The PEDANT genome database

The PEDANT genome database

Dmitrij Frishman 1,*,Martin Mokrejs 1,Denis Kosykh 1,Gabi Kastenmu

¨ller 1,Grigory Kolesov 1,Igor Zubrzycki 1,Christian Gruber 2,Birgitta Geier 2,Andreas Kaps 2,Kaj Albermann 2,Andreas Volz 2,Christian Wagner 2,Matthias Fellenberg 2,Klaus Heumann 2and Hans-Werner Mewes 1,3

1

Institute for Bioinformatics,GSF -National Research Center for Environment and Health,Ingolsta

¨dter Landstra?e 1,85764Neueherberg,Germany,2

Biomax Informatics AG,Lochhamer Stra?e 11,82152Martinsried,Germany and 3

Department of Genome-oriented Bioinformatics,Wissenschaftszentrum Weihenstephan,Technische Universita

¨t Mu ¨nchen,85350Freising,Germany

Received August 13,2002;Revised and Accepted September 12,2002

ABSTRACT

The PEDANT genome database (http://pedant.gsf.de)provides exhaustive automatic analysis of genomic sequences by a large variety of established bioinfor-matics tools through a comprehensive Web-based user interface.One hundred and seventy seven completely sequenced and un?nished genomes have been processed so far,including large eukar-yotic genomes (mouse,human)published recently.In this contribution,we describe the current status of the PEDANT database and novel analytical features added to the PEDANT server in 2002.Those include:(i)integration with the BioRS TM data retrieval system which allows fast text queries,(ii)pre-computed sequence clusters in each complete genome,(iii)a comprehensive set of tools for genome comparison,including genome comparison tables and protein function prediction based on genomic context,and (iv)computation and visualization of protein–protein interaction (PPI)networks based on experi-mental data.The availability of functional and structural predictions for 650000genomic proteins in well organized form makes PEDANT a useful resource for both functional and structural genomics.

OVERVIEW AND STATUS OF THE PEDANT DATABASE IN 2003

When the ?rst version of the PEDANT genome database was launched in 1996(1)it provided a computational analysis of the ?ve ?rst completely sequenced genomes available at that time using a limited set of algorithms and with results stored as static HTML pages.In the past seven years,the PEDANT genome analysis software has matured (2):it is now based on

an ef?cient relational database schema compatible with both MySQL TM and Oracle TM database management systems,employs a broad range of modern bioinformatics methods to analyze sequence data,and offers an extensive user interface.In parallel,the database content was explosively growing following the fast pace of genome sequencing projects.However,the main concept of the database has not changed since the ?rst day of its existence.Since in-depth manual annotation of all genomic sequences pouring into the databases is virtually impossible our goal has been to provide exhaustive functional and structural characterization of publicly available genomes by automatic means in a timely fashion.Being fully aware of the pitfalls of automatic sequence analysis (3)we use reasonably stringent recognition parameters to avoid excessive false positive rates,and at the same time not only provide search and prediction results in digested form,but also store the raw output of bioinformatics methods,enabling the annotator or the biologist using the database to make his own judgement on the signi?cance of the results presented.

At the time of writing the total of 177genomes are available on-line.The database consists of three major sections:

1.Genomes which undergo careful in-depth analysis by the MIPS biologists using the subsystem for manual annotation available in the PEDANT software suite.This section currently includes Neurospora crassa ,Thermoplasma acidophilum ,and Arabidopsis thaliana .

https://www.wendangku.net/doc/dd17558302.html,pletely sequenced and published genomes.The main source of sequence data for this section,including DNA contigs and ORF nomenclature,is the genomes division of GenBank (4),although in some cases we obtain data directly from sequencing centres.Whenever possible we use data manually curated by NCBI staff (ftp://https://www.wendangku.net/doc/dd17558302.html,/genomes/Bacteria).If a curated version is not avail-able,original data as submitted by the authors (ftp://https://www.wendangku.net/doc/dd17558302.html,/genbank/genomes/Bacteria)is processed.This section contains 5eukaryotic,84eubacterial,and 16archaebacterial datasets.

*To whom correspondence should be addressed.Tel:t498931874201;Fax:t498931873585;Email:d.frishman@gsf.de

#2003Oxford University Press

Nucleic Acids Research,2003,V ol.31,No.1207–211

DOI:10.1093/nar/gkg005

3.Un?nished genomic sequences.Gene prediction is con-

ducted by ORPHEUS(5)in a completely automatic fashion,usually allowing for large overlaps between ORFs.This leads to many over-predicted ORFs,but ensures that fewer real ORFs are missed.In many cases, the PEDANT database is the only source of annotation for such datasets.In recent time,this section of the database was growing slower then before because we chose to commit our processing capacity to the quickly growing number of completely sequenced genomes recently pub-lished,including all publicly available eukaryotic genomes.

This section contains15eukaryotic,51eubacterial,and3 archaebacterial datasets.

Among the most significant recent additions to the database is mouse genome data obtained from https://www.wendangku.net/doc/dd17558302.html,. The mouse database contains20chromosome contigs with 37793genes predicted using the Fgeneshttsoftware (https://www.wendangku.net/doc/dd17558302.html,).

For each of the roughly650000protein sequences processed so far the following pre-computed analyses are available: (A)Protein function

BLAST(6)similarity searches against the complete

non-redundant protein sequence database.

Motif searches against the Pfam(7),BLOCKS(8),and

PROSITE(9)databases.InterPro(10)calculations are

in preparation.

Predictions of cellular roles and functions based on high-

stringency BLAST searches against protein sequences

with manually assigned functional categories according

to the FunCat Functional Catalogue developed by MIPS

and Biomax Informatics AG.The FunCat catalogue

covers a broad range of biological concepts,including

cellular processes,systemic physiology,development

and anatomy for prokaryotes and unicellular eukaryotes,

plants and animals.In addition,genomes annotated with

other vocabularies(such as Gene Ontology)can be

mapped to FunCat annotations and thus integrated into

the similarity search,as already done for the genomes of

Drosophila melanogaster and Caenorhabditis elegans.

At present,we use proteins with manually assigned

functional categories of the following species:plant

A.thaliana,fungi Saccharomyces cerevisiae,eubacter-

ium Listeria monocytogenes EGD and archaebacterium

T.acidophilum.More species-speci?c catalogues are in

preparation and will be available shortly(e.g.bacteria

Bacillus subtilis,Helicobacter pylori,N.crassa).

Similarity-based predictions of enzyme nomenclature

(EC numbers).

Similarity-based extraction of keywords and super-

family assignments from the PIR-International sequence

database(11).

Assignment of sequence to known clusters of ortholo-

gous groups[COGS,(12)].

(B)Protein structure

Sensitive similarity-based identi?cation of known3D

structures and structural domains.For this purpose,we

are using the IMPALA software(13)which allows

comparison of each gene product with a collection of

position speci?c scoring matrices,or pro?le library,

representing sequences with known three dimensional

structure from the PDB database(14)and sequences of

structural domains from the SCOP database(15).CATH

(16)domain predictions are being currently added to the

database.

Prediction of transmembrane regions using the

TMHMM software(17).

Identi?cation of local low similarity regions and entire

non-globular domains based on the SEG algorithm(18).

Prediction of coiled coil motifs(19).

Prediction of protein structural classes(all-a,all-b,a/b). In some cases,further analyses may be available.For example, for cDNA collections we conduct BLASTN searches against relevant taxonomic subdivisions of the EMBL database(20). Several additional methods to predict protein features,such as localization or presence of signal peptides are implemented, but not systematically used due to high error rates. Perhaps the most characteristic feature of the PEDANT user interface,available since its conception,is the automatic assignment of gene products to various functional and structural categories.There are two types of such categories: Individual categories,such as sequences with homologues. Selecting this category immediately leads to the list of sequences possessing a BLAST hit,sorted by signi?cance. Further categories of this type are:sequences without homology,non-identical closest homologues,sequences with predicted transmembrane segments,coiled coils,low complexity and non-globular regions.

Group categories,such as sequence and structure motifs. Selecting such category?rst leads to the list of all groups of a given type actually identi?ed in a particular genome.In a second step,the user selects an item of interest,e.g., a Pfam domain,and gets the list of sequences that are predicted to possess this domain.Categories of this type are:Pfam,BLOCKS,and PROSITE motifs,functional categories,EC numbers,PIR keywords and superfamilies, SCOP and CATH domains,COGs,as well as sequence clusters(see below).In addition,BLAST similarity hits are classi?ed based on their taxonomic origin;additional categories in the taxonomy section—superkingdom, kingdom,phylum,class,and species—allow the user to obtain the lists of respective taxonomic divisions and then select sequences that have at least one BLAST hit in a given division.

In addition,the following searches can be performed interactively against protein sequences as well as DNA sequences or ORFs and contigs of a particular genome:

BLAST search with a user query sequence

Sequence pattern search using the PROSITE regular expression language

As soon as an ORF of interest has been selected from a given category or based on an interactive search,an integrated, hyperlinked protein report is provided showing analysis results according to dynamically set thresholds.All evidence available is summarized in the report,including a number of calculated parameters,such as molecular weight,pI value,position of the ORF on the contig,homology-derived data,as well as

208Nucleic Acids Research,2003,V ol.31,No.1

predicted structural features.A navigation toolbar in the upper part of the report page allows access to the protein and DNA sequence of a given ORF and the raw results of individual computational methods.Those are also equipped with Web links and can be used as reference for further manual annotation.An advanced DNA viewer represents contigs in graphical form and allows one to navigate,zoom,produce six-frame translation,and show DNA features such as restriction sites and genetic elements(genes,ORFs,exons,tRNAs,etc.). The protein viewer visualizes information about similarity to entries in the protein databases used and predicted protein features, e.g.sequence motifs and secondary structure elements.This is especially useful for judging on the domain structure of the homology hits.

The public PEDANT database server has been upgraded in terms of CPU speed,RAM memory and disk space.In order to improve the performance of the public MySQL database server,a separate server is utilized to conduct computations and prepare the data.When newly created datasets pass extensive quality tests and a substantial number of new databases have been accumulated,a new release of the PEDANT database is made.At the time of writing the version of the database is1.0.2.

SEARCHING AND DATA MINING IN THE PEDANT GENOME DATABASE USING THE BioRS TM INTEGRATION AND RETRIEVAL SYSTEM

In order to enable users to take full advantage of the exhaustive genome annotation available in the PEDANT database,fast and ef?cient data mining and search capabilities must be provided.However,given the enormous amount of pre-computed bioinformatics analyses stored in MySQL tables this requirement is not easy to meet.Although MySQL is arguably the fastest relational database currently available a simple text search for the word‘kinase’in only one500mB table containing BLAST results for the A.thaliana genome takes more than a minute to complete,and composite queries in such large datasets are all but impossible.

To enhance the data-mining capabilities of the PEDANT Genome Database its latest release has been integrated with the BioRS Integration and Retrieval System developed by Biomax Informatics AG(www.biomax.de).The BioRS system is able to integrate and search?at-?le databases as well as relational databases(at present,MySQL,Oracle and DB2).Additional index data structures are generated,allowing queries to be processed on the index for enhanced query performance.The original data source is accessed only when the user requests the entire entry or when indexing is performed.Because the open Common Object Request Broker Architecture(CORBA) is used as platform-independent middleware,indexing and querying processes can be distributed over as many CPUs as are available,facilitating timely updates of the indices.

The PEDANT GUI now provides an HTML-based search form which allows one to specify complex search terms(using wildcards)and apply them selectively to different parts of the annotation, e.g.to search only in Pfam motifs,functional categories or known3D structures.Several instances of such pairs of attributes and search values are provided and can be combined by Boolean operators.Additional criteria for searching include sequence length,number of transmembrane regions,pI range and percentage of low complexity sequence. After clicking the‘Search’button,a CGI program is initiated to translate the values of the HTML search form into the BioRS Query Language.The query is executed by the BioRS core using search daemons and the results are returned to the PEDANT client which then generates an HTML-based table including hyperlinks to the corresponding protein reports. Due to the use of pre-calculated indices search results are returned essentially instantly,allowing interactive exploration of the information contained in the PEDANT database.For example,a search for A.thaliana proteins having the word ‘transcription’in functional categories,the word‘?oral’in BLAST search results,the word‘mads’anywhere in the annotation,and pI in the range from4to8?nds12hits in the 11gB annotation of the genome in just a few seconds. SEQUENCE CLUSTERING AND PARALOGOUS GENE FAMILIES

One of the important aspects of genome annotation involves evaluation of gene duplication and the analysis of paralogous gene families.Within each completely sequenced genome we conduct an all against all comparison of proteins by PSI-BLAST,with low complexity sequence regions masked. Sequences possessing suf?cient degree of similarity in a reciprocal fashion(BLAST similarity score greater than 45bits)are joined into single-linkage groups.In cases where reciprocal BLAST comparisons produce only one local alignment between two sequences in each direction,this hit is made symmetrical by taking into account only the longer alignment.Additionally,results of sensitive recognition of Pfam domains through HMMER searches(21)are taken into account.If two or more proteins in a genome display similarity to the same Pfam domain with a signi?cant E-value(typically 0.001),it may be safely assumed that the corresponding protein sequence spans are similar to each other,even if BLAST fails to recognize such relationships.Correspondingly, by selecting the‘sequence clusters’category on the PEDANT launch panel the user is presented with a list of sequence clusters found in the given genome,with the number of sequences in each cluster and the cluster name indicated.The latter is automatically derived from the description lines of the cluster sequences,with informative description lines given priority over those containing the words‘unknown’,‘putative’, and the like.For each cluster the list of sequences can be displayed.In addition,a graphical representation of the cluster is available in form of a circular diagram,visualizing the structure of the BLAST and Pfam hits as well as the structural information available for the cluster proteins(22). COMPARATIVE GENOMICS

Starting from the year2002an exhaustive all-on-all BLAST comparison of all protein sequences in completely sequenced genomes is conducted for each major release of the PEDANT database;the current version encompasses165000proteins in 70genomes.After selecting the‘intergenome comparison’Nucleic Acids Research,2003,V ol.31,No.1209

category on the launch panel the user may choose up to10 genomes to be compared and obtain a table of similarity relationships between a query genome and the selected target genomes.Similarity hits are coloured according to their BLAST score and equipped with links to respective genome datasets.In addition,on each report page of proteins involved in the cross-genome comparison a link‘compare genomes starting from this gene’appears,leading to the appropriate page of the genome comparison table.Such table is a very convenient tool for quickly assessing the distribution of a given gene across selected representatives of main taxonomic groups or most important model organisms.Since chromosomal coordinates of genes are also provided it is also possible to estimate the conservation of genomic context around a given gene of interest.

For more in-depth exploration of gene context we have developed a novel computational method called SNAP [Similarity-Neighbourhood APproach;(23)].A Similarity-Neighbourhood Graph(SN-Graph)is built that involves chains of alternating S-and N-relationships.The former represent BLAST similarity hits between putative orthologues in different genomes while the latter involve neighbouring genes on the same genome.An SN-Graph can thus be thought of as a walk across many genomes which begins with a particular gene in genome A and proceeds to its orthologue in genome B. The walk then continues to encompass a given number of neighbours of this orthologue on each side.Subsequently, orthologues of these neighbours are found in other genomes, their neighbours identi?ed,and so on.Closed paths on an SN-graph,that we call SN-cycles,are strongly non-random and have the tendency to join functionally related genes involved in the same biochemical process.A specialized Web server, Snapper,has been developed which allows one to submit a protein sequence for a SNAP analysis[http://pedant.gsf.de/ snapper;(24)].This server takes full advantage of the PEDANT functional annotation and provides links to PEDANT entries.Conversely,a Snapper session can be launched from any PEDANT database report page by pressing the‘submit this sequence for SNAP analysis’button.

Y et another way to establish functional links between gene products in a similarity-free fashion is through phylogenetic pro?ling which involves?nding genes with correlated occurrence in different genomes(25).We have incorporated a feature-rich implementation of this method(Wong et al.,in preparation)into the PEDANT server.In this case,too,the user can invoke a pro?ling analysis for a gene of interest directly from the PEDANT report page.

PROTEIN–PROTEIN INTERACTIONS

Another novel feature of the PEDANT database introduced in 2002is the incorporation of the data on protein–protein interactions(PPI).The information is directly imported from the MIPS PPI catalogue[(26);http://mips.gsf.de/proj/yeast/ CYGD/interaction]which currently describes the total of 13842interactions for4033proteins from the S.cerevisiae genome.In particular,the catalogue includes the following two components:(i)the original PPI catalogue which was being built by a group of MIPS biologists since1997based on careful analysis of yeast literature(27).This‘classical’part of the catalogue contains information on1889proteins involved in4924interactions,classi?ed into physical and genetic interactions,and(ii)recently published data from large-scale two-hybrid experiments[e.g.,(28)].After clicking on the category‘protein–protein interactions’on the PEDANT launch panel the user is presented with a list of individual experiments (for convenience the‘classic’catalogue is treated as one experiment although data come from hundreds of different publications).For each experiment,a table of interactions between pairs of ORFs is shown,interlinked to the corresponding protein reports.In addition,individual disjoint PPI networks can be delineated and visualized using a graphical Java applet.Direct incorporation of PPI data into PEDANT facilitates its ef?cient exploration in the context of functional annotation(29).At present,this feature is only available for the S.cerevisiae genome;data on other organisms will be added in the future.

STRUCTURAL GENOMICS

The rich set of structural and functional characteristics derived for each protein as well as the high degree of automation and advanced analytical features make the PEDANT database a useful tool for structural genomics.In particular,PEDANT can be used to facilitate the target selection https://www.wendangku.net/doc/dd17558302.html,ing the sequence clustering results described above it is easy to judge the domain structure of the protein families.Further,circular diagrams visualize available structural information on each cluster member(domains with known three-dimensional structure,transmembrane regions).Based on these pre-computed results we have created an ef?cient target selection tool called STRUDEL[STRucture DEtermination Logic;

(22)].A Web-based interface for this tool allowing PEDANT users to select structural targets of interest according to speci?ed criteria is currently being developed. REFERENCES

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Nucleic Acids Research,2003,V ol.31,No.1211

第三章荷载及荷载效应组合

第三章荷载及荷载效应组合 一、结构上的荷载分类 1.按随时间的变异分类: 永久荷载—在设计基准期内其量值不随时间变化,或其变化与平均值相比可以忽略不计的作用。 可变荷载—在设计基准期内其量值随时间变化,且其变化与平均值相比不可忽略的作用。 偶然荷载—在设计基准期内出现或不一定出现,而一旦出现其量值很大且持续时间很短的作用。 2.按随空间位置的变异分类 固定荷载—在结构空间位置上具有固定分布的作用。 可动荷载—在结构空间位置上的一定范围内可以任意分布的作用。 3.按结构的反应分类 静态荷载—使结构产生的加速度可忽略不计的作用。 动态荷载—使结构产生的加速度不可忽略的作用。 ?《荷载规范》 ? 3.1.1结构上的荷载可分为下列三类: ? 1 永久荷载,例如结构自重、土压力、预应力等。 ? 2 可变荷载,例如楼面活荷载、屋面活荷载和积灰荷载、吊车荷载、风荷载、雪荷载等。 ? 3 偶然荷载,例如爆炸力、撞击力等。 ?二、荷载代表值 ?建筑结构设计时,对不同荷载应采用不同的设计值。 对永久荷载应采用标准值作为代表值; 对可变荷载应根据设计要求采用标准值、组合值、频遇值或准永久值作为代表值; 对偶然荷载应按建筑结构使用的特点确定其代表值。 ?《荷载规范》 ? 3.1.2建筑结构设计时,对不同荷载应采用不同的代表值。 ? ?对永久荷载应采用标准值作为代表值。 ?对可变荷载应根据设计要求采用标准值、组合值、频遇值或准永久值作为代表值。 ? ?对偶然荷载应按建筑结构使用的特点确定其代表值。 ? 2.1.4荷载代表值representative values of a load ?设计中用以验算极限状态所采用的荷载量值,例如标准值、组合值、频遇值和准永久值。 ? ? 2.1.6标准值characteristic value/nominal value ? ?荷载的基本代表值,为设计基准期内最大荷载统计分布的特征值(例如均值、众值、中值或某个分位值)。 ? 2.1.7组合值combination value ?对可变荷载,使组合后的荷载效应在设计基准期内的超越概率,能与该荷载单独出现时的相应概率趋于一致的荷载值;或使组合后的结构具有统一规定的可靠指标的荷载值。

浅谈多功能酶标仪选择的要素

近年来,随着多功能酶标仪在国内各高校实验室逐渐推广开来,多功能酶标仪品牌和型号也逐渐多了起来,乱花渐欲迷人眼。除了三大传统优势品牌PE、MD和TECAN,还出现了众多后来者插足此市场,如收购了芬兰雷勃的Thermo、从发光起家的Berthold、针对药筛领域的BMG以及新兴的BioTek等品牌。各品牌都有各自的一个甚至多个系列产品线,特性各不相同,选购时各种技术参数、技术指标令人眼花缭乱。 本文尝试从用户实际使用的角度,探讨应该如何看待花样繁多的参数特性,希望能帮助大家找到真正合适自己的多功能酶标仪。 一、滤片Vs光栅 多功能酶标仪的分类方法众多,但最简单的莫过于用他们的滤光方式来作分界线。一般来说,可以分为滤光片型和光栅型两大类。当然也有一些型号,例如Synergy4和EnVision等,一台机器里面同时装上了滤光片和光栅。但是滤片和光栅并不能同时完成同一个检测,还是想用光栅的时候用光栅,该用滤片的时候用滤片;还有一些实验非用其中一个不可,另一模块实现不了的。所以这类仪器本质上还只是把滤片和光栅放在了一起,并没有使两者糅合而产生新的技术突破。 总体来说,滤片技术由于发展已久,配合二向色镜(其实也就是另一模式的滤光反光滤镜)等光路系统,可以实现大部分实验的需要。目前常规多功能酶标仪中最高的检测灵敏度就是用滤光片型做出来的,例如TECAN Infinite F500的荧光检测的灵敏度可以达到0.04 fmol/孔(荧光素,384孔/80ul)。 但是滤光片型仪器由于受限于滤片的波长和数量限制,不可能满足日益增加的实验类型的检测需要,而且有时需要对物质的吸收、激发和发射光谱进行研究,所以后来就诞生了光栅型的仪器。 最先推出光栅的是MD公司,其光栅习惯上称为单光栅。由于光纯度的不足,在光栅的后面又加入了一组带阻滤片,再把杂光过滤一遍,达到了5×10-4的杂光率,基本与纯粹的滤光片系统一致。后来TECAN 又发展出了双光栅技术,通过两次光栅滤光,杂光率降到了10-6。后来,Thermo、BioTek和PE的部分新款仪器等都使用了类似双光栅技术。由于激发和发射各用了一组双光栅,此类机器又被称为四光栅型多功能酶标仪。 光栅型酶标仪的推陈出新,使得用户在波长选择上不再受限,而且在杂光率、带宽控制等性能上还超越了滤光片系统。例如,TECAN公司在2008年底推出使用了第三代四光栅系统的M1000酶标仪,杂光率降到了2×10-7的新低,还实现了带宽2.5~20nm连续可调。这些都是目前滤光片型酶标仪所不能或者较难实现的。 二、杂光率&波长准确性 光栅型滤光系统俨然已经成为了目前通用性多功能酶标仪的主流,多家厂家共同努力,已经把光栅技术推到了历史新高。在光栅的众多技术参数之中,最关键的无疑就是光栅的杂光率和波长选择的准确性了。 杂光率指得就是光源通过光栅后,得到的光线中,“不需要”的波长的光占所标称波长的光的比例,表征了滤光的纯度。由于光线干涉、衍射等的复杂性,无论使用滤光片还是光栅,杂光都是不可避免的。各种滤光技术的本质就是要想办法把杂光尽可能地去掉。一般来说,滤光片型的杂光率在10-4~10-5之间,光栅型的可以做到10-6~10-7。由于此类杂光是非特异的,而且会直接进入最后的检测器,所以有多少的杂光就会引入多少的随机误差。在荧光等检测过程中,由于检测器存在放大效应,杂光率的干扰也会被指数级放大。因此,杂光率就是一个滤光系统的首要性能指标。 光栅的另一个重要指标就是波长选择的准确性。因为很多检测是依赖于物质在某个波长的特征图谱。就像

midas荷载组合与桥博的对应关系

m i d a s荷载组合与桥博 的对应关系 WTD standardization office【WTD 5AB- WTDK 08- WTD 2C】

相信在用桥博做了桥梁计算之后,再用midas计算,刚开始会遇到一个很普遍的问题。那就是:m i d a s里面的荷载组合跟桥博是如何对应的? 说实话,对于初学者来说,midas的前处理(建模阶段)相对来说还算比较容易的,但是后处理(结果分析)阶段跟桥博相比就显的有些无从下手了。毕竟两个计算软件是不同的国家开发的。 桥博作为我们国内最优秀的桥梁专业类的计算软件,比较符合我们中国人的习惯,而且做起直线桥、一般的杆系桥很快捷。而midas这个韩国人开发的软件,里面多多少少总有些地方我们不是很习惯。这两个软件都是很好的软件,对我们的桥梁设计提供了很大的帮助,当然同时也存在很大的不同,各有千秋。 下面我就荷载组合这个问题来说明一下他们的区别与联系。 一、桥博荷载组合 a.桥博里面常用的荷载组合有: 1、承载能力极限状态组合Ⅰ:基本组合 2、正常使用极限状态组合Ⅰ:长期效应组合 3、正常使用极限状态组合Ⅱ:短期效应组合 4、正常使用极限状态组合Ⅲ:标准值组合 相应荷载组合的基本定义可以查看规范JTG D60-2004第4.1.6 b.桥博里面荷载组合的应用: 1、钢筋混凝土构件设计: 承载能力极限状态强度验算:查看承载能力极限状态荷载组合I强度验算结果;

?正常使用极限状态裂缝宽度验算:查看正常使用极限状态荷载组合II裂缝验算结果; ?构件的各种应力可供参考,建议用户对钢筋混凝土构件的压应力应有所控制; 2、预应力混凝土构件设计: ?承载能力极限状态强度验算:查看承载能力极限状态荷载组合I强度验算结果; ?正常使用极限状态应力验算: ?法向压应力:查看正常使用极限状态荷载组合III应力验算结果;(最大压应力验算结果) ?法向拉应力(抗裂性): 全预应力构件:查看正常使用极限状态荷载组合II应力验算结果; (最大拉应力验算结果) 部分预应力A类构件: ?长期效应组合:查看正常使用极限状态荷载组合I应力验算结果;(最大拉应力验算结果) ?短期效应组合:查看正常使用极限状态荷载组合II应力验算结果;(最大拉应力验算结果) ?主压应力:查看正常使用极限状态荷载组合III应力验算结果;(最大主压应力验算结果) ?主拉应力:查看正常使用极限状态荷载组合II应力验算结果;(最大主拉应力验算结果)

荷载分类和组合

荷载分类和组合试题下载 1、计算檩条承受的雪荷载 条件:某仓库屋盖为粘土瓦、木望板、木椽条、圆木檩条、木屋架结构体系,其剖面如图1.4.1所示,屋面坡度α=26.56°(26°34′),木檩条沿屋面方向间距1.5m,计算跨度3m,该地区基本雪压为0.35kN/m2。 要求:确定作用在檩条上由屋面积雪荷载产生沿檩条跨度的均布线荷载标准值。 2、最大轮压产生的吊车梁最大弯矩准永久值(未乘动力系数) 条件:跨度6m的简支吊车梁,其自重及轨道,联结件重的标准值为5.8kN/m,计算跨度l0=5.8m,承受二台A5级起重量10t的电动吊钩桥式吊车(上海起重运输机械厂生产),吊车跨度L k=16.5m,中级工作制。 吊车主要技术参数见表1.3.4。 要求:由吊车最大轮压产生的吊车梁正截面最大弯矩准永久值。 3、钢吊车梁的最大轮压设计值和横向水平荷载设计值 条件:厂房中列柱,柱距12m,柱列两侧跨内按生产要求分别设有重级工作制软钩吊车两台,吊车起重量Q=50/10t,横行小车重g=15t,吊车桥架跨度L k=28.5m,每台吊车轮距及桥宽如图1.3.12所示,最大轮压Pmax=470kN(标准值)。

已确定吊车梁采用Q345钢,截面尺寸(无扣孔)如图1.3.13所示。 要求:确定轮压设计值和横向水平荷载设计值 4、计算屋面板承受的雪荷载 条件:某单跨带天窗工业厂房,屋盖为1.5m×6m预应力混凝土大型屋面板、预应力混凝土屋架承重体系,当地的基本雪压为0.4kN/m2,其剖面图见图1.4.2。 要求:确定设计屋面板时应考虑的雪荷载标准值。 5、设计会议室楼面梁时楼面活荷载的折减 条件:某会议室的简支钢筋混凝土楼面梁,其计算跨度l0为9m,其上铺有6m×1.2m(长×宽)的预制钢筋混凝土空心板(图1.2.3)。 要求:求楼面梁承受的楼面均布活荷载标准值在梁上产生的均布线荷载。

多功能酶标仪技术规格要求

多功能酶标仪技术规格要求 一、采购内容 二、技术要求 1、系统性能 多模式检测模块:可见光/紫外光吸收、荧光强度(顶读&底读)、超高灵敏化学发光、时间分辨荧光和超灵敏Alpha检测。 2、激发光源: 2.1光吸收、荧光强度、TRF模块光源采用高能闪烁氙灯,波长范围230-1000 nm。*2.2 Alpha光源采用680 nm 高能固态激光光源,激光输出功率>200 mw。 *3、检测器:多模式检测模块:同时配置两个PMT:一个红敏PMT和一个独立超高灵敏度PMT。 4、可见/紫外吸收光:双光栅系统可进行光吸收检测,波长范围230-1000 nm,双光栅分光步进(increments)0.5nm。 *5、荧光强度(顶读和底读):高精度四光栅系统,要求前置cut-off滤光片,波长范围250-850nm;分光步进(increments)0.5nm。 *6、超敏感化学发光:独立于荧光检测之外的单独光路,独立超敏感PMT检测器。 7、时间分辨荧光:激发配置320 nm/340 nm滤光片/二向色镜优化组合,保证激发光强度。发射光路为双光栅,满足包括615nm和665 nm在内的单/多波长检测。*8、超灵敏Alpha检测:优化独立Alpha专用光路,采用高能固态激光+独立超灵敏PMT优化高速组合,以达到最佳的检测效率和灵敏度。要能提供Alpha检测试剂盒及特殊应用的定制化服务。 9、温控模块:保证样品检测温度稳定到室温+3至65摄氏度。

10、具有三种振荡模式:线形、圆形、8字形,可设定震荡速度、振幅及振荡时间。具有仪器外(outside)振荡功能,在程序运行的过程中,微孔板可以伸出仪器外部振荡,便于实现程序运行中观察振荡效果,而不必中止程序。 11、具有板孔扫描功能:可选孔内圆形或方形区域中的多点扫描检测,适用于贴壁细胞或不均匀样本检测,以减少因样品分布不均匀造成的检测偏差。软件可自动优化调节检测器Z轴高度,以保证检测的灵敏度,减少孔间信号串扰。 12、配备专业仪器自动化控制及数据分析处理软件,软件友好,易学易用。具备线性拟合、动力学、剂量效应等多种常用的数据计算及分析功能,结果可以Excel、文本、网页、图片等多种格式输出。 三、技术服务要求 3.1设备安装调试 在用户指定的地点完成安装调试,并配合用户进行测试验收。 3.2 技术培训及服务 3.2.1完成设备现场安装调试和验收后,在用户所在地免费提供专业培训,就 设备的操作使用和保养维护等内容进行重点培训。 *3.2.2 要能提供原厂AlphaScreen/AlphaLISA检测试剂以及时间分辨荧光检 测试剂,并具有专业技术开发实验室及服务能力,并由应用技术工程师提供蛋 白-蛋白等分子间相互作用实验的现场操作培训以及后期新实验开发培训。 3.3质保期 整机保修1年,保修期自验收签字之日起计算。 3.4维修响应时间 接到维修通知后,2小时内作出响应,24小时内到场排除故障。

MIDAS的PSC设计验算说明

北京迈达斯技术有限公司 2007年5月

MIDAS/Civil PSC设计验算功能说明 一.程序给出的验算结果 (2) 二. 程序验算结果说明及与规范中相应条文的对应关系 (2) 1、施工阶段正截面法向应力验算:(对应规范7.2.7,7.2.8) (2) 2、受拉区钢筋拉应力验算:(对应规范6.1.3~6.1.4,7.1.3~7.1.5) (3) 3、使用阶段正截面抗裂验算:(对应规范6.3.1(第1条)和规范6.3.2) (3) 4、使用阶段斜截面抗裂验算:(对应规范6.3.1(第2条)和规范6.3.3) (4) 5、使用阶段正截面压应力验算:(对应规范6.1.5,6.1.6,7.1.3~7.1.5) (4) 6、使用阶段斜截面主压应力验算:(对应规范7.1.3~7.1.6) (4) 7、使用阶段裂缝宽度验算:(对应规范6.4.2~6.4.4) (4) 8、普通钢筋估算:(对应规范5.2.2~5.2.5) (5) 9、预应力钢筋量估算: (5) 10、使用阶段正截面抗弯验算:(应规范5.2.2~5.2.5) (5) 11、使用阶段斜截面抗剪验算:(对应规范5.2.6~5.2.11) (6) 12、使用阶段抗扭验算:(对应规范5.5.1~5.5.6) (6) 三、PSC设计验算时错误信息说明 (7) 四、PSC设计其它相关说明 (7)

MIDAS/Civil PSC设计验算功能说明 一.程序给出的验算结果 程序一共给出了12项验算结果,如下所列。根据“PSC设计参数”中“截面设计内力” 和“构件类型”选定的内容的不同,给出的具体验算结果是不同的,详见表1。 1)施工阶段正截面法向应力验算 2)受拉区钢筋的拉应力验算 3)使用阶段正截面抗裂验算* 4)使用阶段斜截面抗裂验算* 5)使用阶段正截面压应力验算* 6)使用阶段斜截面主压应力验算* 7)使用阶段裂缝宽度验算 8)普通钢筋量估算* 9)预应力钢筋量估算* 10)使用阶段正截面抗弯验算 11)使用阶段斜截面抗剪验算 12)使用阶段抗扭验算 不同的“PSC设计参数”对应的验算结果 项目二维二维+扭矩三维 全预应力不提供第7)、8)、12)项验算不提供第7)、8)项验算不提供第7) 、8)项验算部分预应力 不提供第7)、12)项验算不提供第7)项验算不提供第7)项验算A类 部分预应力 不提供第3)、12)项验算不提供第3)项验算不提供第3)项验算B类 二. 程序验算结果说明及与规范中相应条文的对应关系 1、施工阶段正截面法向应力验算:(对应规范7.2.7,7.2.8) -进行施工阶段正截面法向应力验算时,由预加力和荷载产生的法向应力可分别按照规范第6.1.5条和第7.1.3条进行计算。此时,预应力钢筋应扣除相应阶段的预应力损 失,荷载采用施工荷载,截面性质按本规范第6.1.4条的规定采用。对计算结果的叠 加要满足规范第7.2.8条的规定。 -最大、最小分别代表施工阶段在相应截面产生的正截面混凝土法向压应力和正截面混凝土法向拉应力。 -设计结果表格中最大/最小分别表示的是混凝土最大压应力/混凝土最大拉应力,同

多功能酶标仪SpectraMaxi3的操作规程

多功能酶标仪SpectraMax i3的标准操作规程Standard Operation of SpectraMax i3 部门Department 签名/日期Signature/Date 起草人:Prepared by 樊小川,Xiaochuan Fan QC 审核人:Reviewed by 黄思佳,Sijia Huang QC 审核人:Reviewed by 褚夫兰,Fulan Chu QA 批准人:Approved by 张伯彦,Boyan Zhang 质量负责人 1 目的 建立多功能酶标仪SpectraMax i3的标准操作程序,规范SpectraMax i3 多功能酶标仪检测时的操作。 2 适用范围

本规程适用于所有对多功能酶标仪SpectraMax i3的操作 3 术语或定义 多功能酶标仪:指功能较强、精度较高的单体台式酶标仪,可检测吸光度(Abs)、荧光强度(FL)、时间分辨荧光(TRF)、化学发光(Lum)等。 4 责任 4.1 仪器负责人负责多功能酶标仪的日常及定期维护,出现故障时负责联系厂家维修,保 证运行正常。 4.2 实验操作人员需严格按照本规程执行,保证仪器正常使用,每次用完后填写仪器使用 记录,且使用后及时清理台面,保持仪器洁净。 5 EHS要求 N/A 6 程序 6.1 仪器安装 仪器与电脑连接完毕并连接电源以后,按仪器背面的按钮可以直接启动仪器,经过几分钟后的仪器自检后就可以开始用于检测。在连有电源的情况下,保持24小时开机,不要罩防尘罩以保持透气,隔1-2月关机重启一次。 6.2 SoftMax Pro软件操作基本步骤 6.2.1 打开软件 点击“SoftMax Pro 6.3”图标,打开SoftMax Pro 软件,出现"Plate Setup Helper"对话框。若无则点击图标。 6.2.2 连接仪器 点击‘Choose a diffecient instrument’,打开‘Instrument Connection’对话框,在“Availible Instruments”菜单中选择仪器连接线与电脑所接的串口号(COM)。 选择所购买的酶标仪型号SpectraMax i3或添加模块卡盒型号。最后点击“OK”键连接。 6.2.3 仪器检测参数设定 点击图标后出现“Settings”对话框,对话框最上方出现Read Mode(读板模式)和Read Type(读板类型)两个选项,读板模式有ABS(光吸收)、FL(荧光强度)、LUM(化学发光)和TRF(时间分辨荧光),读板类型有终点检测(Endpoint)、动力学(Kinetic)、单孔扫描(Well Scan)和光谱扫描(Spectrum)四种。使用者根据实验

(整理)midas荷载组合与桥博的对应关系.

相信在用桥博做了桥梁计算之后,再用midas计算,刚开始会遇到一个很普遍的问题。那就是:midas里面的荷载组合跟桥博是如何对应的? 说实话,对于初学者来说,midas的前处理(建模阶段)相对来说还算比较容易的,但是后处理(结果分析)阶段跟桥博相比就显的有些无从下手了。毕竟两个计算软件是不同的国家开发的。 桥博作为我们国内最优秀的桥梁专业类的计算软件,比较符合我们中国人的习惯,而且做起直线桥、一般的杆系桥很快捷。而midas这个韩国人开发的软件,里面多多少少总有些地方我们不是很习惯。这两个软件都是很好的软件,对我们的桥梁设计提供了很大的帮助,当然同时也存在很大的不同,各有千秋。 下面我就荷载组合这个问题来说明一下他们的区别与联系。 一、桥博荷载组合 a.桥博里面常用的荷载组合有: 1、承载能力极限状态组合Ⅰ:基本组合 2、正常使用极限状态组合Ⅰ:长期效应组合 3、正常使用极限状态组合Ⅱ:短期效应组合 4、正常使用极限状态组合Ⅲ:标准值组合 相应荷载组合的基本定义可以查看规范JTG D60-2004第 4.1.6条~第 4.1.7条的相关规定。 b.桥博里面荷载组合的应用: 1、钢筋混凝土构件设计: ?承载能力极限状态强度验算:查看承载能力极限状态荷载组合I强度验算结果; ?正常使用极限状态裂缝宽度验算:查看正常使用极限状态荷载组合II裂缝验算结果; ?构件的各种应力可供参考,建议用户对钢筋混凝土构件的压应力应有所控制; 2、预应力混凝土构件设计: ?承载能力极限状态强度验算:查看承载能力极限状态荷载组合I强度验算结果; ?正常使用极限状态应力验算: 法向压应力:查看正常使用极限状态荷载组合III应力验算结果; (最大压应力验算结果) 法向拉应力(抗裂性): 全预应力构件:查看正常使用极限状态荷载组合II应力验算结果;(最大拉应力验算结果) 部分预应力A类构件: ?长期效应组合:查看正常使用极限状态荷载组合I应力验算 结果;(最大拉应力验算结果) ?短期效应组合:查看正常使用极限状态荷载组合II应力验 算结果;(最大拉应力验算结果) 主压应力:查看正常使用极限状态荷载组合III应力验算结果;(最大主压应力验算结果) 主拉应力:查看正常使用极限状态荷载组合II应力验算结果;(最

2019荷载分类、代表值定义与各规范荷载组合

荷载分类及取值荷载分类类型代表值 永久荷载例如结构自重、土压力,预应力等。标准值 偶然荷载例如爆炸力、撞击力等(自重是指材料自身重量产生的 荷载(重力)) 标准值、组合值、 频 遇值或准永久值 可变荷载例如楼面活荷载、屋面活荷载和积灰荷载、吊车荷载、 风荷载、雪荷载等 按建筑结构使用的 特 点确定 荷载代表值定义 荷载组合荷载代表值定义 标准值荷载的基本代表值,为设计基准期内最大荷载分布的特征值 对可变荷载,使组合后的荷载效应在设计金准期内的超越概率,能与该荷载组合值单独出现是的相应概率趋于一致的荷载值,或使组合后的结构具有统一规定的可靠指标的荷载值。组合值=标准值×组合系数 频遇值对可变荷载,在设计基准期内,其超越的总时间为规定的较小比率或超越概 率为规定频率的荷载值 准永久值对可变荷载,在设计基准期内,其超越的总时间约为设计基准期一半的荷载 值 注:设计基准期,为确定设计可变荷载代表值而选定的时间参数。建筑结构设计所考虑的荷载统计参数,都是按设计基准期为50年确定的,如设计时所采用其他设计基准期,则必须另行确定在该基准期内最大荷载的概率分布及相应的统计参数。 设计使用年限,设计使用年限是设计规定的一个时期,在这一规定的时期内,只需要进行正常的维护而不需进行大修就能按预期目的使用,完成预定的功能,即房屋建筑在正常设计、正常施工、正常使用和维护下所应达到的使用年限。 基本组合永久荷载+可变荷载的组合承载能力 荷极限状态 偶然组合 永久荷载+可变荷载+一个偶然荷载,以及偶然事件发生后 受 损结构整体稳定性验算时,永久荷载+可变荷载的组合 载 标准组合采用标准值或组合值为荷载代表值的组合组 合正常使用 极限状态 频遇组合对可变荷载采用频遇值或准永久值为荷载代表值的组合 准永久组合对可变荷载采用准永久值为代表值的组合 使用状态、设计组合、适用计算及分项系数 验算状态荷载效应 组合 适用计算 抗力取值 分项系数 规范 正常使用极限状态标准组合 按地基承载力确定基底面积及埋深; 按单桩承载力确定桩数; 地基承载力特征 值或单桩承载力 特征值 地基 基础 3.0.5 .

多功能酶标仪基本操作规程

多功能酶标仪基本操作规程 一、可见与紫外光原始吸光值的直接测定方法 1、首先打开连接酶标仪的电插板上的全部开关。打开酶标仪主机背面电源线上端的开关。 2、再打开电脑开关。(注意,一定要先开仪器,后开电脑,以免仪器连接出现问题。) 3、在电脑主屏幕上选择[Magellan6]。 4、仪器自检后,酶标板托架自动伸出(注意仪器前部不要放置物品,以免档住托架的伸出)。将酶 标板按数字正确的方向(A1位于左上角)放在托架上。 5、点击仪器下部最右侧的[move plate in] 图标,酶标板将自动进入仪器中。(注意:千万不要用手 将酶标板推入仪器,造成仪器损坏)。 6、在屏幕上选Start measurement。点击绿色箭头。 7、在Select a File窗口左上角选Obtain Raw Date 然后点击绿色箭头。 8、在plate 栏中的plate definition 下拉条中,对板的类型进行选择。酶标的吸光度测定,一般情况 下选xxxxx xx Flat Transparent (x孔,平底,透明板)。(注意测定紫外吸收时要使用可以透过紫外光的透明板)如果板要加盖子,就要再选中Plate with cover。 9、在Measurements 栏内双击Absorbance ,出现Absorbance的对话框。 10、在Absorbance的对话框中: ⑴在Wavelength栏中Measurement项输入测定波长值;Reference项,在需要扣除背景波长时选中并 输入背景波长值。一般情况不选. ⑵在Multiple read per well栏中对于吸光值的测定可不选 ⑶在Read 栏中: Number of flashes 项一般选10;Settle time(使平静时间)项对于96或384孔 板一般选0;对于其他孔数的板可考虑输入适当的值;孔数越少的板,Settle time 设置时间要较长,以防止在测定过程中板移动距离大,对液面平稳的影响。 ⑷在Label栏中Name后输入你为此块板自定义的英文名;也可不设置。 11、在Part of plate 栏中,用鼠标左键拉框,选择要测定的样品孔(使待测定的样品孔变为黄色), (注意:待测孔只可横向或纵向连续选择,不可以被间断)。如果选择错误需要更改,不要做任何删除,只要再直接重新选择即可。点击本栏中的Detail 对所选的样品孔进行确认后,点击OK,(如果选孔有错误,选择Cancel 返回上页再重复以上操作。) 12、点击OK后,箭头变绿,点击绿色箭头,在Measurement 的workspace处输入(日、月、年- 自定义文件名wsp)再点击Start,仪器开始自动测定。 13、测定结束后,点击File 选择print,直接打印测定参数与结果,或在最上方Edit选择Copy to Excel, 然后打开下方出现的Excel表(显示为板式数据)并打印结果。 14、关机,退出当前界面,点击左下角Exit Megellan 回到主屏幕。关电脑,关仪器电源和插板电 源。 二、荧光值的直接测定方法 1、首先打开连接酶标仪的电插板上的全部开关。打开酶标仪主机背面电源线上端的开关。 2、再打开电脑开关。(注意,一定要先开仪器,后开电脑,以免仪器连接出现问题。) 3、在电脑主屏幕上选择[Magellan6]。 4、仪器自检后,酶标板托架自动伸出(注意仪器前部不要放置物品,以免档住托架的伸出)。将酶 标板按数字正确的方向(A1位于左上角)放在托架上。 5、点击仪器下部最右侧的[move plate in] 图标,酶标板将自动进入仪器中。(注意:千万不要用手 将酶标板推入仪器,造成仪器损坏)。 6、在屏幕上选Start measurement。点击绿色箭头。 7、在Select a File窗口左上角选Obtain Raw Date 然后点击绿色箭头。 8、在plate 栏中的plate definition 下拉条中,对板的类型进行选择。荧光酶标的测定,一般情况下 选xxxxx xx Flat black (x孔,平底,黑板。6孔板测定时没有黑板可选,可选择6孔,平底,透明板)。

Proliant Gen8服务器硬件、系统安装

HP Proliant Gen8硬件及软件安装 第一部分硬件 (1) 1.1 HP Proliant BL460c Gen8 (1) 1.2 HP ProLiant SL230s Gen8 (4) 1.3 HP ProLiant SL250s Gen8 (4) 1.4 HP ProLiant SL270s Gen8 (5) 第二部分软件 (5) 2.1 DL360 Gen8 开机自检和Intelligent Provisioning界面设置 (5) 2.2 G8服务器—P420i ORCA界面 (17) 2.3 DL360 Gen8引导安装Windows 2008 (24) 2.4 G8服务器—intelligent provisioning智能引导安装Win2008 (52) 2.5 G8服务器—SPP安装 (59) 2.6 DL360 G8安装ESXI 5.0 (68) 第一部分硬件 1.1 HP Proliant BL460c Gen8 概述 安装BL 460c Gen8 需要完成下面步骤 ●安装和配置刀片机箱笼子(C7000、C3000) ●安装刀片服务器选件 ●在机箱中相应的位置安装互联模块 ●连接互联模块到用户的网络 ●在机箱笼子中安装刀片 ●刀片服务器的完全配置 C7000 的机箱

的将BL460C Gen8 连入用户的网络。 C3000 机箱

在安装时要注意,机箱后面的互连模块和对应刀片中的mezzanime卡的对应关系,这样更好的将BL460C Gen8 连入用户的网络。 安装BL460C Gen8 1.移除C3000或C7000 前面的刀片位置空白盒子

Midas:荷载工况与荷载组合-2015-04-21

Midas:荷载工况与荷载组合 荷载工况的荷载安全系数(荷载分项系数)(荷载组合系数):当分析桥梁结构时,根据"公路钢筋混凝土及预应力混凝土桥涵设计规范"(JTJ023-85),当汽车荷载效应占总荷载效应5%及以上时,荷载安全系数应提高5%;当汽车荷载效应占总荷载效应33%及以上时,荷载安全系数应提高3%;当汽车荷载效应占总荷载效应50%及以上时,荷载安全系数不再提高。目前按规范自动生成的荷载组合没有考虑提高的荷载安全系数,用户应根据需要将其进行相应调整。 施工阶段荷载工况:该项只有定义了施工阶段时才处于激活状态。 ST:只用定义为非施工阶段荷载类型的工况生成荷载组合。 CS:只用定义为施工阶段荷载类型的工况生成荷载组合。 ST+CS:同时考虑施工阶段中的荷载效应和使用阶段的荷载效应自动生成荷载组合。在此应注意的是在施工阶段中激活和钝化的荷载,在荷载工况定义中一定要定义为“施工阶段荷载”类型。 2.在施工阶段分析后,程序会自动生成一个Postcs阶段以及下列荷载工况:(Postcs阶段的模型和边界为在施工阶段分析控制对话框中定义的“最终施工阶段”的模型,荷载为该最终施工阶段上的荷载和在“基本”阶段上定义的没有定义为“施工阶段荷载”类型的所有其他荷载)。 恒荷载(CS):除预应力、收缩和徐变之外,在各施工阶段激活和钝化的所有荷载均保存在该工况下。 施工荷载(CS):当要查看恒荷载(CS)中的某个荷载的效应时,可在施工阶段分析控制对话框中的“从施工阶段分析结果:恒荷载(CS)工况中分离出荷载工况(施工荷载(CS))”中将该工况分离出来,分离出的工况效应将保存在施工荷载(CS)工况中。 合计(CS): 具有实际意义的效应的合计结果。在查看各种效应(反力、位移、内力、应力)时,在荷载工况/组合列表框中,在“合计(CS)”上面的工况均为有意义的工况效应,在“合计(CS)”下面的工况均为无意义的工况效应。

酶标仪原理及结构-科邦实验室

酶标仪的原理及结构 酶标仪即酶联免疫检测仪,是酶联免疫吸附试验的专用仪器。可简单地分为半自动和全自动2大类,但其工作原理基本上都是一致的,其核心都是一个比色计,即用比色法来分析抗原或抗体的含量。 酶标法是什么 酶联免疫吸附试验方法简称酶标法,是标记技术中的一种,是从荧光抗体技术,同位素免疫技术发展而来的一种敏感,特异,快速并且能自动化的现代技术。 酶标法的基本原理是将抗原或抗体与酶用胶联剂结合为酶标抗原或抗体,此酶标抗原或抗体可与固相载体上或组织内相应抗原或抗体发生特异反应,并牢固地结合形成仍保持活性的免疫复合物。当加入相应底物时,底物被酶催化而呈现出相应反应颜色。颜色深浅与相应抗原或抗体含量成正比。 由于此技术是建立在抗原-抗体反应和酶的高效催化作用的基础上,因此,具有高度的灵敏性和特异性,是一种极富生命力的免疫学试验技术。 酶标仪的原理 酶标仪就是应用酶标法原理的仪器,酶标仪类似于一台变相光电比色计或分光光度计,其基本工作原理与主要结构和光电比色计基本相同。

光源灯发出的光波经过滤光片或单色器变成一束单色光,进入塑料微孔极中的待测标本.该单色光一部分被标本吸收,另一部分则透过标本照射到光电检测器上,光电检测器将这一待测标本不同而强弱不同的光信号转换成相应的电信号,电信号经前置放大,对数放大,模数转换等信号处理后送入微处理器进行数据处理和计算,Z后由显示器和打印机显示结果。 微处理机还通过控制电路控制机械驱动机构X方向和Y方向的运动来移动微孔板,从而实现自动进样检测过程。而另一些酶标仪则是采用手工移动微孔板进行检测,因此省去了X,Y方向的机械驱动机构和控制电路,从而使仪器更小巧,结构也更简单。 微孔板是一种经事先包理专用于放置待测样本的透明塑料板,板上有多排大小均匀一致的小孔,孔内都包埋着相应的抗原或抗体,微孔板上每个小孔可盛放零点几毫升的溶液。其常见规格有40孔板,55孔板,96孔板等多种,不同的仪器选用不同规格的孔板,对其可进行一孔一孔地检测或一排一排地检测。 酶标仪测定是在特定波长下,检测被测物的吸光值。随着检测方式的发展,拥有多种检测模式的单体台式酶标仪叫做多功能酶标仪,可检测吸光度(Abs)、荧光强度(FI)、时间分辨荧光(TRF)、荧光偏振(FP)、和化学发光(Lum)。 酶标仪从原理上可以分为光栅型酶标仪和滤光片型酶标仪。光栅型酶标仪可以截取光源波长范围内的任意波长,而滤光片型酶标仪则根据选配的滤光片,只能截取特定波长进行检测。 酶标仪的结构 酶标仪所用的单色光既可通过相干滤光片来获得,也可用分光光度计相同的单色器来得到。在使用滤光片作滤波装置时与普通比色计一样,滤光片即可放在微孔板的前面,也可放在微孔板的后面,其效果是相同的。光源灯发出的光经聚光镜,光栏后到达反射镜,经反射镜作90°反射后垂直通过比色溶液,然后再经滤光片送到光电管。 酶标仪可分为单通道和多通道2种类型,单通道又有自动和手动2种之分。自动型的仪器有X,Y方向的机械驱动机构,可将微孔板L的小孔一个个依次送入光束下面测试,手动型则靠手工移动微孔板来进行测量。

DL160Gen8安装CentOS6.3

DL160 Gen8 安装CentOS 6.3 一.须知: 1.由于DL160Gen8使用内置HP Dynamic Smart Array B120i 阵列卡,因此在安装 CentOS时需要手动加载阵列卡驱动,以使操作系统识别到硬盘。 2.DL160Gen8出厂默认关闭Dynamic Smart Array B120i 阵列卡,需要进入RBSU(即 BIOS)开启阵列卡。 3.VID=Virtual Install Disk. 为服务器内置存储空间,大小约256M.集成于主板中.内含基 本阵列卡驱动. 二.安装流程概览 三.安装详细过程. 1.开机加电后,根据屏幕提示相关功能选项按键,按F9进入RBSU。本手册截图使用 了ILO远程界面.

2.进入RBSU后,依次选择以下选项以开启B120i阵列卡。System Options -> SATA Controller Options -> Embeded SATA Configuration -> Enable Dynamic HP Smart Array B120i Raid Support. 3.进入RBSU后,依次选择以下选项以开启VID(Virtual Install Disk). Advanced Options ->Advanced System ROM Options -> Virtual Install Disk -> Enable.

注意:VID为服务器内置存储空间,内含基本阵列卡驱动(Windows&Linux)。安装操作系统完成后,建议将该选项重新选为Disable. 4.将以上两步做完后,按下Esc,会提示确认退出,按下F10即保存退出。服务器自 动重启。 5.自动重启后,在服务器自检界面已经可以看到HP Dynamic Smart Array B120i 阵列卡 正在初始化,初始化完成后会显示阵列卡固件版本和缓存大小,如下图所示。

荷载分类、代标准表格值定义及各规范荷载组合.doc

荷载分类及取值 荷载分类类型代表值 永久荷载例如结构自重、土压力,预应力等。标准值 例如爆炸力、撞击力等(自重是指材料自身重量产生的标准值、组合值、频 偶然荷载 荷载(重力))遇值或准永久值 例如楼面活荷载、屋面活荷载和积灰荷载、吊车荷载、按建筑结构使用的特 可变荷载 风荷载、雪荷载等点确定 荷载代表值定义 荷载代表值定义 标准值荷载的基本代表值,为设计基准期内最大荷载分布的特征值 对可变荷载,使组合后的荷载效应在设计金准期内的超越概率,能与该荷载组合值单独出现是的相应概率趋于一致的荷载值,或使组合后的结构具有统一规定 的可靠指标的荷载值。组合值=标准值×组合系数 对可变荷载,在设计基准期内,其超越的总时间为规定的较小比率或超越概频遇值 率为规定频率的荷载值 对可变荷载,在设计基准期内,其超越的总时间约为设计基准期一半的荷载准永久值 值 注:设计基准期,为确定设计可变荷载代表值而选定的时间参数。建筑结构设计所考虑的荷载统计参数,都是按设计基准期为 50 年确定的,如设计时所采用其他设计基准期,则必须另行确定在该基准期内最大荷载的概率分布及相应的统计参数。 设计使用年限,设计使用年限是设计规定的一个时期,在这一规定的时期内,只需要进 行正常的维护而不需进行大修就能按预期目的使用,完成预定的功能,即房屋建筑在正常设 计、正常施工、正常使用和维护下所应达到的使用年限。 荷载组合 荷基本组合永久荷载+可变荷载的组合 承载能力 载永久荷载 +可变荷载 +一个偶然荷载,以及偶然事件发生后受极限状态偶然组合 组损结构整体稳定性验算时,永久荷载+可变荷载的组合 1

合标准组合采用标准值或组合值为荷载代表值的组合 正常使用 频遇组合对可变荷载采用频遇值或准永久值为荷载代表值的组合极限状态 准永久组合对可变荷载采用准永久值为代表值的组合 使用状态、设计组合、适用计算及分项系数 荷载效应抗力取值验算状态适用计算规范 组合分项系数 地基承载力特征 按地基承载力确定基底面积及埋深; 值或单桩承载力 标准组合按单桩承载力确定桩数; 正常使用特征值 极限状态验算基础裂缝宽度 地基变形(含沉降、差异沉降、倾斜) 准永久组合分项系数 (不计风荷载和地震作用);地基 挡墙、地基或滑坡稳定;基础 分项系数 基础抗浮稳定 3.0.5 确定基础或桩基承台高度; 承载能力 基本组合确定支挡结构截面; 极限状态 计算基础或支挡结构内力,确定配筋相应分项系数 和验算材料强度; 挡土墙压力及滑坡推力 正常使用基桩或复合基桩桩基标准组合按单桩承载力确定桩数或布桩; 极限状态承载力特征值 3.1.7 2

多功能酶标仪SpectraMax-i3的操作规程

多功能酶标仪SpectraMax-i3的操作规程编号 M-SOP-2-0083 No. 标准操作规程版本号 Standard Operating Procedure 01 Version 多功能酶标仪SpectraMax i3的标准操作规程 多功能酶标仪SpectraMax i3的标准操作规程 Standard Operation of SpectraMax i3 部门签名/日期 Department Signature/Date 起草人: XX, Xiaochuan X Prepared by QC 审核人: XX, Sijia XX Reviewed by QC 审核人: XX, Fulan X Reviewed by QA 批准人: XX, Boyan XX Approved by 质量负责人 颁发部门执行日期质量保证部-QA Issued by Effective Date 替换文件复审日期 Version 00 Replaced For Review Date 分发部门 QA,QC Distributed to 1 of 7 编号 M-SOP-2-0083 No. 标准操作规程版本号 Standard Operating Procedure 01 Version 多功能酶标仪SpectraMax i3的标准操作规程 1 目的 建立多功能酶标仪SpectraMax i3的标准操作程序,规范SpectraMax i3 多功能酶标仪 检测时的操作。 2 适用范围

本规程适用于所有对多功能酶标仪SpectraMax i3的操作 3 术语或定义 多功能酶标仪:指功能较强、精度较高的单体台式酶标仪,可检测吸光度(Abs)、荧 光强度(FL)、时间分辨荧光(TRF)、化学发光(Lum)等。 4 责任 4.1 仪器负责人负责多功能酶标仪的日常及定期维护,出现故障时负责联系厂家维修,保 证运行正常。 4.2 实验操作人员需严格按照本规程执行,保证仪器正常使用,每次用完后填写仪器使用 记录,且使用后及时清理台面,保持仪器洁净。 5 EHS要求 N/A 6 程序 6.1 仪器安装 仪器与电脑连接完毕并连接电源以后,按仪器背面的按钮可以直接启动仪器,经过几分钟后的仪器自检后就可以开始用于检测。在连有电源的情况下,保持24小时开机,不要罩防尘罩以保持透气,隔1-2月关机重启一次。 6.2 SoftMax Pro软件操作基本步骤 6.2.1 打开软件 点击“SoftMax Pro 6.3”图标,打开SoftMax Pro 软件,出现 "Plate Setup Helper"对话框。若无则点击图标。

Midas civil荷载组合详解

主要根据公路桥涵设计通用规范(JTG D60-2004)编制。在结果>荷载组合对话框中选择“自动生成”功能。 a. 在荷载>移动荷载分析数据中定义移动荷载时,下面组合中的符号L 用ML 代替。b. 反应谱荷载工况的简称为ESP c. 在荷载>移动荷载分析数据中,将人群荷载按移动荷载定义,并在移动荷载工况中将其与其它汽车荷载子荷载工况进行组合时(在移动荷载工况中选择“组合”),在定义人群荷载子荷载工况时,系数应取0.8(根据通用规范 4.1.6 条第 1 项)。为了考虑人群荷载单独作用的情况(系数1.0 的情况),需要另外单独定义一个人群荷载移动工况。 d. 下面组合中考虑了可变荷载作用的不同时组合(JTG D60-2004 中表4.1.5) e. 不考虑汽车荷载的恒荷载+其他可变荷载的组合及组合值系数需用户另外添加(规范无规定)。 f. 永久荷载中既有对结构承载能力不利,又有对结构的承载能力有利的永久荷载时,需要用户另外添加组合或修改“永久荷载对结构的承载能力有利组合”中的系数。g. 在荷载组合自动生成对话框中选择“考虑弯桥制动力”时,当汽车制动力与离心力同时出现在荷载组合中时,制动力荷载的组合系数自动乘以0.7 的系数。 h. 程序会自动生成各状态组合的包络组合。i. 钢结构的组合依然沿用旧规范。j. 当有移动荷载作用时,在设计中实际采用的组合会更多(对每个荷载组合都会对弯矩最大时、剪力最大时、轴力最大时的情况进行验算)。k. 在荷载>静

力荷载工况中定义荷载名称,但没有具体定义荷载值时,荷载组合的自动生成功能将不包含该荷载工况名称。l. 预应力混凝土设计荷载组合在荷载组合的“混凝土”中定义。a) 永久荷载对结构的承载能力不利(120 个) 恒荷载组合(1 个): 1.2*D+1.2*PS+1.2*EV+1.4*EH+1.0*(SH+CR)+1.0*B+0. 5*STL 永久荷载+1 个可变作用(8 个): 1.2*D+1.2*PS+1.2*EV+1.4*EH+1.0*(SH+CR)+1.0*B+0. 5*STL +1.4*(L+IL+CF) 1.2*D+1.2*PS+1.2*EV+1.4*EH+1.0*(SH+CR)+1.0*B+0. 5*STL +1.4*LS 1.2*D+1.2*PS+1.2*EV+1.4*EH+1.0*(SH+CR)+1.0*B+0. 5*STL +1.4*CRL 1.2*D+1.2*PS+1.2*EV+1.4*EH+1.0*(SH+CR)+1.0*B+0. 5*STL +1.1*W 1.2*D+1.2*PS+1.2*EV+1.4*EH+1.0*(SH+CR)+1.0*B+0. 5*STL +1.4*SF 1.2*D+1.2*PS+1.2*EV+1.4*EH+1.0*(SH+CR)+1.0*B+0. 5*STL +1.4*IP 1.2*D+1.2*PS+1.2*EV+1.4*EH+1.0*(SH+CR)+1.0*B+0. 5*STL +1.4*(T+TPG) 1.2*D+1.2*PS+1.2*EV+1.4*EH+1.0*(SH+CR)+1.0*B+0.

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