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mpich2安装全过程

说明：本系统测试环境为centos4.3，并且以获得mpich2-1.0.6p1.tar.gz软件包。假设你的mpich2-1.0.6p1.tar.gz软件包已经下载到/root/目录下。以root 用户登录。要求会使用vi文本编辑器修改文件。下面以四台pc为例。

准备工作：设置IP，更改主机名为node01,node02,node03,node04.

一、创建SSH信任连接（在root目录下）

1、更改/etc/hosts文件

#vi /etc/hosts 打开hosts文件，更改如下：

127.0.0.1 localhost.localdomain localhost

node01的IP scc-m(可以不做)

node01的IP node01

node02的IP node02

node03的IP node03

2、在node01生成SSH秘钥对

#ssh-keygen -t rsa 一路回车即可

产生.ssh文件,

#ls -a 查看是否有.ssh文件夹

3、进入.ssh目录

#cd .ssh

4、生成authorized_keys文件

#cp id_rsa.pub authorized_keys

5、退出到root目录

#cd ..

6、建立本身的信任连接

#ssh node01 按提示输入yes（三个字母要打全）

7、设置node02（node02的root目录下）

#ssh-keygen -t rsa 生成.ssh文件夹

#scp node01的IP：/root/.ssh/* /root/.ssh 拷贝node01上的.ssh文件夹覆盖本地的

#scp node01的IP：/etc/hosts /etc/hosts 拷贝node01上的hosts文件覆盖本地的

#ssh node01 提示处输入yes回车

设置node03的方法与node02相同

8、确认3台机器的信任连接已建立

对每个节点执行：

#ssh node01

#ssh node02

#ssh node03

在提示处输入yes回车，最后确定无需输入密码并且没有任何提示信息即可登陆（"Last login:时间日期"提示信息除外）

二、安装MPICH2(在节点root目录下)

1、解压缩

#tar -zxvf mpich2-1.0.1.tar.gz

或者#gunzip -c mpich2-1.0.1.tar.gz|tar xf mpich2-1.0.1.tar

2、创建安装目录

#mkdir /usr/MPICH-instsll

3、进入mpich2解压目录

#cd mpich2-1.0.1

4、设置安装目录

#./configure --prefix=/usr/MPICH-install

5、编译

#make

6、安装

#make install

7、退出到root目录

#cd ..

8、通过编辑.bashrc文件修改环境变量

#vi .bashrc

修改后的.bashrc文件如下：

# .bashrc

# User specific aliases and functions

PATH="$PATH:/usr/MPICH-install/bin" 新增加的 #Source .bashrc

9、测试环境变量设置

#which mpd

#which mpicc

#which mpiexec

#which mpirun

10、修改/etc/mpd.conf文件，内容为secretword=myword

#vi /etc/mpd.conf

设置文件读取权限和修改时间

#touch /etc/mpd.conf

#chmod 600 /etc/mpd.conf

11、创建主机名称集合文件/root/mpd.hosts

#vi mpd.hosts

文件内容如下：

node01

node02

node03

三、测试

1、本地测试

#mpd & 启动

#mpdtrace 观看启动机器

#mpdallexit 退出

2、通过mpd.hosts运行集群系统

#mpdboot -n number -f mpd.hosts number为要起动的机器个数 #mpdtrace

#mpdallexit

3、测试运行MPICH的例子程序

#mpdboot -n 4 -f mpd.hosts 启动4台机器

#mpiexec -n number /usr/MPICH-install/examples/cpi number为使用的进程数

#mpdallexit

4、如果测试不能通过，请进行第四步

四、问题解决

1、通过mpdcheck获得一写帮助信息

#mpdcheck -pc

2、查错

#mpdcheck -l

3、通过mpd.hosts文件查错

#mpdcheck -f mpd.hosts 如果无错误

#mpdcheck -f mpd.hosts -ssh

4、如果上述无错误，可略过此步

对任意两台机器进行查错

m1: #mpdcheck -s 输出主机名host和端口port

m2: #mpdcheck -c host port

注意：以上四步都是在没有运行mpd的情况下进行的

5、mpd查错

m1: #mpd -e & 返回使用的端口

m2: #mpd -h m1 -p echoed_port_m1 &

MPI安装与运行报告

MPI 安装于运行报告本机运行环境：机器型号：联想G450 处理器：Pentium（R）Dual-Core CPU T4200 @ 2.00GHz 运行内存（RAM）：2GB 操作系统：Windows 7（32 位）程序开发环境：Visual Studio 2008 MPI 版本： mpich2-1.3.2p1-win-ia32 安装程序详细安装步骤： 1、运行mpich2-1.3.2p1-win-ia32.msi。安装过程中，会要求设置一个passphrase我的机器上默认的passphrase是beHappy,很有意思的密码。设置这个东西很重要，一定要记住；下面会说到为什么。 2、安装完之后,不知道下一步怎么进行了。打开刚才安装的MPICH2 的快捷方式目录，发现了一个README文件。打开之后，发现了MPICH2的使用方法介绍,于是按照其中的指示,我进行了第一个MPI 并行程序的编写。我使用的是VC++2008首先创建一个新的工程，取名为MPITes。添加MPI 库的支持：按照README中的指导，应该首先将MPI的头文件目录包含到项目中去。结果在项目属性中找了半天，也没有找到添加头文件目录的位置，只找到了包含库文件的位置，我安装MPICH2的目录为D:\Program Files\MPICH2将MPICH2的库文件添加到如下面图1所示的位置即可。最后才反应过来，这个工程还是空的，没有任何文件，可能跟这个有关系吧。于是，马上新建了一个Cpp文件main.cpp，将老师PPT中的例子程序拷贝进去。

图1 果然，新建了这个cpp文件之后，项目属性中多出了C/C++这样一项, 于是，就可以在其中设置包含文件的目录了，相应的配置如下面图2所示图2 设置好这些文件之后，编译程序，结果在连接的时候报错，类似于 main.obj : error LNK2019:无法解析的外部符号_MPI_Finalize,该符号在函数_main中被引用”这样的错误出现了六个。再看READM文档，发现了这样? 句话：

MPICH2在Windows环境下Visual_Studio_2010的环境搭建

MPICH2在Windows系统Visual Studio 2010的环境搭建本机运行环境：机器型号：联想G450 处理器：Pentium（R）Dual-Core CPU T4200 @ 2.00GHz 运行内存（RAM）：2GB 操作系统：Windows 7(32位) 程序开发环境：Visual Studio 2008 MPI版本： mpich2-1.3.2p1-win-ia32安装程序 MPI的编译和运行对于简单的程序，可以使用专门的编译命令。对于大的项目，最好使用标准的Makefile。MPICH提供的编译命令有mpicc和mpif77，它们分别是C和Fortran的编译命令: mpicc -o first first.c mpif77 -o first firstf.f 对于编译得到的目标程序，运行的命令为： mpirun –arch xxx –np yyy first 其中xxx为machines.的，yyy为申请的进程数目。 MPICH的安装和配置文中使用的MPICH2安装文件是mpich2-1.4-win-ia32 (https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html,/mpi/mpich)，在Windows下安装MPICH2比较简单，但是要有Microsoft .NET Framework的支持。安装基本上只要单击“Next”即可。在安装过程中会提示输入进程管理器的密码，这个密码被用来访问所有的程序，这里使用的密码为admin。如果是多台机器执行mpi，那么这多台机器上必须配置相同的mpi用户，就是新用户的用户名和密码必须相同。

实验3安装MPICH

实验3 安装MPICH 准备知识（自学）一、Linux命令及脚本文件目的与要求：使学生掌握Linux基本命令的使用；学会编写简单的脚本文件。主要内容及提示： 1．Linux基本命令 1.1帮助所有的Linux命令及C，MPI函数的使用说明都可以通过联机帮助获得。 man 〈命令|C语言函数名|MPI函数名〉〈命令名〉—help 1.2 文件、目录、磁盘操作命令 ls 查看目录中的内容，常用的参数有–al pwd 显示当前工作目录 cd 改变当前工作目录，（.表示当前目录；..表示父目录；~表示当前用户的主目录） mkdir 建立子目录 cp 复制文件或子目录，可用参数 -R cat 显示文件内容 more 分屏输出（回车：上滚一行；空格：上滚一屏；q：退出） less 分屏输出（q键退出、还可以使用光标上下移动键） chmod 改变文件或目录的读(r)写(w)执行(x)属性（三组rwx中，第一组rwx 为该文件主的权限、第二组rwx为同一用户组中其他用户的权限、第三组rwx为其他用户的权限。例如：chmod 765 <文件名>，则文件的读写执行权限为rwxrw-r-x，即7=111B，6=110B，5=101B，这里B表示二进制） ln 建立文件链接，常用参数-s（相当于Windows中的“快捷方式”） rm 删除文件，删除子目录（需要参数-r） mv 移动文件（目标文件若存在，则会被覆盖） gzip gz文件的压缩/解压缩，常用参数-d(解压缩)，-9（最大压缩） tar tar，tgz文件的打包/解包，常用参数-cvf（打包成tar文件），-xvf （解tar文件包），-zcvf（打包并压缩成tgz文件），-zxvf(解tgz文件) df 显示硬盘各分区的使用情况 mount 装载文件系统 umount 卸载文件系统 1.3 m命令集——DOS/Windows格式软盘的使用 mdir或mdir a: 显示软盘当前目录内容 mcopy Linux操作系统中的文件与DOS/Windos格式软盘之间复制文件 mtype 显示软盘中指定文件的内容 mren 更改软盘中指定文件的文件名 mdel 删除软盘中指定文件 mcd 改变软盘的当前目录 mmd 在软盘上建立子目录

Win7 64bit系统mpich2并行平台的搭建

Windows7系统下搭建MPI环境本人想做一个小的机群,做并行计算,搜罗了一些网上的资料,在单机上建了个并行平台,一些小例子都没问题,但是我的计算程序还是没有成功! 我的电脑是Win7 ,64位系统。按照网上所说64位系统应该装64位的mpich2，但是没有找到资源，就装了32位的。程序设计软件是vc++6! 下面讲一下我的安装过程，希望对大家有用！！！第一项：准备工作 1 安装MPI的SDK——MPICH2 mpich2-1.4.1p1-win-ia32安装程序的下载地址： https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html,/research/projects/mpich2/downloads/tarballs/ 1.4.1p1/mpich2-1.4.1p1-win-ia32.msi 注意：网上很多人都说要以管理员身份进行安装，究竟怎样以管理员身份安装呢？这一点浪费了我好长时间，其实也不是很难，只是没有意识到！点击“开始”——输入cmd（就会看见cmd.exe）——右键——以管理员身份运行——（输入要安装的文件）"msiexec /i e:\mpi\mpich2-1.4.1p1-win-ia32.msi"回车即可，然后按照提示下一步直至安装成功。其中e:\mpi\mpich2-1.4.1p1-win-ia32.msi是指源文件所在位置。（注意空格）安装成功后会有如下几个文件生成注意在bin文件中一定要有下面两个应用程序，否则未安装成功。

2 新建用户密码安装成功后要测试一下，测试前要先注册一个用户（这个用户名须为有效的操作系统管理员账户，密码对应为系统登录密码。这个地方也煞费苦心啊，一定要注意！！！）开始——控制面板——用户账户和家庭安全——添加或删除用户账户——创建一个新账户（在下面可以看到）——输入用户名（选择用户类型为“管理员”）——创建用户然后再创建密码就ok啦！如下图所示这个用户名和密码就是我们测试时需要用的。 3 注册开始——所有程序——mpich2——wmpiregister 如下图，这个就是刚才注册的用户和密码。输入后点击Register——OK。就会出现一行字，成功注册。

MPICH 的安装使用和MPI原理分析

MPICH 的安装使用和MPI原理分析MPICH的安装和使用运行mpich2-1.3.2p1-win-ia32.msi，填写passphrase，默认为behappy，选择默认路径安装。运行wmpiregister, 注册当前的管理员用户。使用建立和编译MPI程序：新建一个项目，设置项目属性，将MPICH2\lib 目录添加到C++连接的library path内，将MPICH2\include 目录添加到C++链接的Include Path内，在程序属性的链接器->命令行中添加mpi.lib，编译和生成程序。将结果exe程序拷贝到MPICH2\bin 目录下，运行mpiexec程序，在Application内添加要我们运行的exe程序。选择进程数目，然后Execute，就会显示多个进程的执行情况。 MPICH程序原理 MPI过程就好像一个几步的过程调用，通过初始化，设置进程数，运行进程，进程间发送和接受消息，结束这些步骤来完成。每个步骤都有基本函数相对应。 MPI_Init (*argc,*argv);//初始化MPI环境 MPI_Comm_size (comm,*size) ;//返回同组内进程数 MPI_Comm_rank (comm,*rank) ;//返回该进程在组内的进程号，从0开始 MPI_Send(buf,count,datatype,dest,tag,comm); //向目标进程发送buf内的count个datatype数据 MPI_Recv(buf,count,datatype,source,comm,status);//接收消息 MPI_Finalize ();//结束 MPIπ的计算程序说明 #include "mpi.h" #include #include double f(double x) { return(4.0/(1.0+x*x)); } int main (int argc,char * argv[]) { int done =0,n,myid,numprocs,i; double PI25DT=3.141592653589793238462643; double mypi,pi,h,sum,x;

MPICH在windows下搭建集群系统

一、首先自己的计算机上进行测试 1、命令行方式：注册：mpiexec -register 输入你当前登陆帐户名和密码，不注册的话每次执行程序都要求输入帐户和密码。运行：mpiexec -n 2 helloworld.exe 这里用两个进程执行当前目录下的helloworld.exe，如果在linux下就应该写为mpiexec -n 2 ./helloworld.exe 2、GUI方式：注册：开始菜单=>所有程序=>MPICH2=>wmpiregister.exe 填上当前登陆用户名和密码，点击“register”将信息写入磁盘，再点“ok”关闭程序。若先点击“ok”则是写入内存，重启机器后还要再注册。想更换其他用户运行mpi程序时，点“remove”将原来的信息删除。运行：开始菜单=>所有程序=>MPICH2=>wmpiexec.exe 在Application处选择可执行程序，在Number of processes处选择用几个进程。点“Execute”执行，“B reak”终止程序。下面有个选项“more options”，选中后有更多的参数可选用，包括用配置文件执行程序，单机测试没必要写配置文件了吧。二、加上多台计算机上测试首先、在其他的机器上也安装mpich2，版本不应该相差太远，最好同样版本，如mpich2-1.0.6。其次、每个机器上的帐户要一样，如administrator，更重要的是密码也要一样！希望新手要注意：用户和密码都要求一致。再次、一定要把所有机器的防火墙都关掉,windows防火墙最好也关掉，不然可能相互连接不上，或者执行的时候有奇怪的错误。

Linux环境下MPICH安装指南

Linux环境下MPICH安装指南说明：本系统测试环境为Redhat9.0完全安装，下载mpich2-1.0.1.tar.gz软件包到/root/目录下。以root用户登录。假设：安装三台微机，名字分别为：node01,node02,node03. 一、Linux环境下设置SSH信任连接（在root目录下） 1）在/etc/hosts文件下添加 #vi /etc/hosts 打开hosts文件，在其后添加： node01 IP node01 https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html, node02 IP node02 https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html, node03 IP node03 https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html, 在需要用户下建立SSH信任连接： 2) 在各节点机上生成SSH秘钥. #ssh-keygen -t rsa 一路回车即可产生.ssh文件夹, 包括文件id_rsa, id_rsa.pub 在各节点机.ssh目录下生成authorized_keys文件各节点机拷贝其他节点机上的id_rsa.pub内容（密钥）到本机的authorized_keys 文件中，则节点机间建立了SSH信任连接。 ***注意：其他用户下建立信任连接方法同上面 3）确认节点机器的信任连接已建立在某节点（如node01）上执行： #ssh node02 #ssh node03 在提示处输入yes回车，最后确定无需输入密码并且没有任何提示信息即可登陆

对方机器则表示配置成功。二、安装MPICH2(在root目录下) 1）解压缩下载mpich2-1.0.1.tar到根目录下，然后解压缩 #tar -zxvf mpich2-1.0.1.tar.gz 2）创建MPICH安装目录 #mkdir /usr/MPICH-instsll 进入mpich2-1.0.1目录设置安装目录 #./configure --prefix=/usr/MPICH-install 3）编译、安装 #make #make install 4）增加MPICH执行路径可在.bashrc 或etc/bashrc 或etc/profile中添加安装路径如在etc/profile 中添加路径：usr/MPICH-install/bin 然后可测试路径设置： #which mpd #which mpicc #which mpiexec #which mpirun 5）创建/etc/mpd.conf文件，输入内容为secretword=myword 设置文件读取权限和修改时间： #touch /etc/mpd.conf

Intel MPI 4.1.0及MPICH2 1.2.1 for rhel6.2 X86_64 install

MPICH2 1.2.1 for rhel6.2 X86_64 install 物理机配置：Core i3 CPU（64位、VT技术支持即可），Win7 X86_64位系统（64位系统即可），6G内存（全安装完后，内存利用率为81%），300G硬盘虚拟机配置（1,2,3机类似）：1 CPU，2/1/1G内存，60/20/10G硬盘，双网卡软件：VirtualBox 4.2.12，rhel6.2 X86_64，MPICH2基本包（包含1个文件），详见下面：建立三个虚拟机，配置如下图：

安装rhel6.2 X86_64系统，可用虚拟光驱安装。分区情况：/——60/20/10G，swap ——4/2/2G，文件包为缺省安装，最好选择英文模式，添加中文支持即可。不安装防火墙和Selinux，不打任何补丁。安装步骤略。本文说明如下：为1机root用户执行为2机root用户执行，另不说明或#开头即为2机root用户执行为3机root用户执行因有些步骤忘记了截图，选用了网络上的相应图片，会根据情况相应说明，在这里对选用了相应图片的作者表示感谢！一、r ed hat enterprise linux 6 yum服务器的搭建 1、创建源文件存放的目录。 #mkdir /yum/ 2、挂光盘。 #mount /dev/cdrom media 3、将光盘文件复制到服务器上的源目录。 #cp -a /media/* /yum/ 4、新建一个yum源的响应文件，后缀为.repo。 #vi /etc/yum.repos.d/local.repo 其内容如下： 5、修改yum源地址。 #vi /usr/lib/python2.6/site-packages/yum/yumRepo.py 中的782行： Remote = url + ‘/’ + relative 将其改为： Remote = url + ‘/yum’ + relative 6、关于yum的一些命令。 #yum clean all #yum install -y *** #yum grouplist #yum groupinstall ***

MPI安装、设置以及运行

MPI安装、VS设置以及运行一安装 MPICH2的安装很简单，按照步骤来就行了。 Intel cluster tool 安装参照install-cluster说明，找到license file即可。安装完成后在“任务管理器”进程中能找到“smpd.exe”进程说明安装成功。如下图二VS设置（c语言）首先按照VS步骤新建空项目，编辑源文件。完成源文件c后，需对其属性进行如下设置才能成功生成exe文件。 1、添加include 在工具栏中选择“项目”——“test1属性”，将出现test1属性页，选择“配置属性”——“c/c++”——“常规”，在右侧“附加包含目录”中添加MPI的“include”文件夹，如下图

2、添加lib 同样在属性页中选择“配置属性”——“链接器”——“常规”，在右侧“附加库目录”中添加“lib”文件夹，如下图

3、设置参数同样在属性页中选择“配置属性”——“链接器”——“输入”，在右侧“附加依赖项”中输入“mpi.lib”. 如下图确定，然后退出，完成设置，可以生成exe文件。三运行生成的exe文件运行exe文件有两种方法，一种通过“开始”——“程序”——“MPICH2”——“wmpiexec.exe”运行，另一种是通过“命令提示符”窗口运行。但运行前都需要注册，MPI要求电脑设置管理员用户和密码，在注册时采用相同用户名和密码。设置步骤如下： 1、设置电脑管理员用户名和密码 2、“开始”——“程序”——“MPICH2”——“wmpiregister.exe”出现如下界面，输入用户名及密码，register，完成注册。

64位MPICH2+64位Win7+VS2013并行计算环境的搭建

64位MPICH2+Win7+VS2013并行计算环境的搭建一、软硬件条件 1．硬件：四核心CPU，4G内存，320G硬盘，台式机一台； 2．软件环境：64位Windows7企业版，Visual Studio2013（以下简称VS2013），64位的mpich2-1.4.1p1-win-x86-64.msi。二、软件安装 1．VS2013的安装； 2．MPICH2的安装（64位版）： 1)使用Administrator登陆，安装MPICH2 对Win7系统，由于系统用户权限比较复杂，一定要用Administrator 用户进行登录才可以安装MPICH2。用其它用户登录，即便是属于Administrators管理组的用户，安装后MPICH2所需要的smpd.exe进程都无法启动。所以，若当前登录用户不是Administrator，请先注销后用Administrator用户登录来安装MPICH2。安装过程中若提示有进程要通过防火墙，点允许即可，安装以默认选项及路径安装即可，一共就十几兆，也不大，不需要更改路径。安装结束后，可注销Administrator用户，再以常用用户登录系统。

Win7下使用Administrator用户登录的方法是：计算机->管理->本地用户和组->用户->Administrator->属性，去掉帐户已禁用前面的勾。切换用户，就可使用Administrator登陆了。图表 1 使用Administrator登陆安装完成后，可以通过查看任务管理器里面是否有smpd.exe进程来看安装是否成功。若有，安装成功；否则，安装不成功。 2）创建MPICH2登录用户右击桌面上的计算机，并选管理，在计算机管理窗口左边选“本地用户和组->用户”，然后在右边空白处右击选新建用户；在新建用户窗口中新建mpich2用户并设置密码，取消其中的“用户下次登录必须修改密码”，选中“用户不能更改密码”和“密码永不过期”，如图2所示。所有安装并行环境上的计算机上的用户名和密码都必须一样

MPICH2在Windows下的配置

MPICH2在WINDOWS下的安装配置文章分类:Java编程 MPICH2是与MPI-2相对应的MPICH实现版本，包含了MPI-2相对于MPI-1扩充后的一些功能，比如动态任务管理，并行I/O等。当前最新版本是 MPICH2-1.0.5. 2.3.1 MPICH2 for Microsoft Windows 的安装与配置安装MPICH2 for Microsoft Windows 对系统有如下要求： 1. Windows 2003/XP 的Professional 或Server 版（不支持Windows 95/98） 2. 所有主机必须能够建立TCP/IP 连接 3. MPICH支持的编译器有：MS VC++ 6.x，MS VC++.NET， Compaq Visual Fortran 6.x,Intel Fortran，gcc，以及g77。安装MPICH，必须以管理员的身份登录。本次实验使用的是MPICH2 for Microoft Windows 版本是1.0.5p2 ，下载后直接运行，安装即可。下载地址是：https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html,/mpi/ mpich/downloads/mpich2-1.0.5p2-win32-ia32.msi. 以管理员的身份登录每台主机，在所有主机上建立一个同样的账户（当然也可以每个机器使用不同的用户名和账户，然后建立一个配置文件，使用命令行的方式运行程序），然后，运行下载的安装文件，将MPICH 安装到每台主机上。打开“任务管理器”中的“进程”选项卡，查看是否有一个smpd.exe 的进程。如果有的话说明安装成功。以后每次启动系统，该进程将自动运行。添加 MPICH2 路径到Windows,以便后面可以在任何路径下使用mpiexec: 1. 右击“My Computer” and点击 properties. 2. 选择 Advanced 标签. 3. 选择 Environment Variables 按钮. 4. 在”System Variables”下选中“path”变量并且单击edit. 添加“C:\MPICH2\bin”到列表的末尾, 注意要将它与前一个路径用分号隔开. 安装好MPICH2 之后还必须对每台计算机进行注册和配置才能使用。其中注册必须每台计算机都要进行，配置只要在主控的计算机执行就行了。注册的目的是，将先前在每台计算机上申请的账号与密码注册到MPICH2 中去，这样MPICH2 才能在网络环境中访问每台主机。配置方法：运行 “mpich\mpd\bin\wmpiregister.exe”wmpiregister运行界面如图2.1所示：图2.1 wmpiregister运行界面程序的设置很简单，只要在Account中输入你当前登录Windows所使用的用户名，注意必须是管理员权限.在password中输入该用户名对应的密码即可。MPICH2不能使用没有密码的用户，如果当前用户没有密码，则应该为其创建一个，然后再运行wmpiregister进行配置。输入完成后，单击Register进行注册即可。显示Password encrypted into the Registry，即表示注册成功。点击Register按钮，则上面的信息将写入硬盘，否则保存在内存中，再重新启动之后就不存在了。

Lammps_安装步骤详解-已测试

一lamps非并行安装 1 在终端输入： cd /mnt （源码包lammps.tar.gz放在/mnt下(cp /home/lab/Desktop/lammps.tar.gz /mnt)） gunzip lamps.tar.gz tar xvf lamps.tar mv lammps-5Dec10 lmp (重命名为lmp) cd lmp/src/STUBS make clean make cd /mnt/lmp/src/MAKE vi Makefile.serial 后出现 # g++ = RedHat Linux box, g++4, gfortran, no MPI,no FFT SHELL = /bin/sh # --------------------------------------------------------------------- # compiler/linker settings # specify flags and libraries needed for your compiler CC = g++4 g++4该为g++ CCFLAGS = -g -O DEPFLAGS = -M LINK = g++4 g++4改为g++ LINKFLAGS = -g -O LIB = ARCHIVE = ar ARFLAGS = -rc SIZE = size

# --------------------------------------------------------------------- 然后存档，退出，终端输入 cd /mnt/lmp/src make clean-all make serial 之后linux开始编译，最后会在/mnt/lmp/src下生成lmp_serial的可执行文件。 mv lmp_serial lmp 2 计算一example 终端输入： cd /mnt/lmp/e*/shear cp /mnt/lmp/src/lmp /mnt/lmp/e*/shear ./lmp

MPICH2+Eclipse开发环境的配置小结

MPICH2＋Eclipse开发环境的配置小结 Windows 为了两个系统下保持一致，所以在windows平台下没有用VC，而是用的MinGW作为编译器，MinGW的下载页面在https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html,/down load.shtml，大家可以只下载MinGW-5.0.2.exe和gdb-5.2.1-1.exe，MinGW-5.0.2. exe很小，启动这个程序会到网络上下载你要安装的程序，我们这里只需要在安装的过程中选择g++和make文件下载安装就可以了，但是调试用的gdb不在里面，需要单独下载，也就是gdb-5.2.1-1.exe。MinGW的默认安装路径是C:\Min GW，安装完MinGW后需要执行gdb-5.2.1-1.exe，将gdb安装到MinGW安装的路径中。然后，将MinGW目录下的bin目录里的mingw32-make.exe改名为ma ke.exe，最后要为eclipse写几个环境变量，分别是： PATH = C:\MinGW\bin;%PATH% LIBRARY_PATH = C:\MinGW\lib C_INCLUDE_PATH = C:\MinGW\include CPLUS_INCLUDE_PATH = C:\MinGW\include\c++\3.4.2;C:\MinGW\includ e\c++\3.4.2\mingw32;C:\MinGW\include\c++\3.4.2\backward;C:\MinGW\include 出现文件路径的地方根据MinGW安装的位置和具体版本号来修改即可。ht tp://https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html,/down3/20070606/06110041280.JPG 为了能使用Eclipse，首先得安装JDK，这个没什么可说的，到sun.co m下载一个安装程序，一路next就ok了。Eclipse到https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html,/下，解压开压缩包就能用。但要开发C/C++程序，还需要eclipse的插件CDT，还是到https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html,/上下载，解开压缩包。把features和plugins里的东西拷贝到eclipse下的features和plugins里就可以，重新启动eclipse，如果能在新建项目里看到C和C++项目，就说明插件安装成功了，如果没有的话，就到eclips e的目录下的configuration目录里，把org.eclipse.update这个文件夹删掉，重启e clipse应该就能用。

Lammps_安装步骤详解

一 lamps非并行安装 1 在终端输入： cd /mnt （源码包放在/mnt下 (cp /home/lab/Desktop/ /mnt)）gunzip xvf mv lammps-5Dec10 lmp (重命名为lmp) cd lmp/src/STUBS make clean make cd /mnt/lmp/src/MAKE vi 后出现 # g++ = RedHat Linux box, g++4, gfortran, no MPI,no FFT SHELL = /bin/sh # --------------------------------------------------------------------- # compiler/linker settings # specify flags and libraries needed for your compiler CC = g++4 g++4该为g++ CCFLAGS = -g -O DEPFLAGS = -M LINK = g++4 g++4改为g++ LINKFLAGS = -g -O LIB = ARCHIVE = ar ARFLAGS = -rc SIZE = size # --------------------------------------------------------------------- 然后存档，退出，终端输入 cd /mnt/lmp/src

make clean-all make serial 之后linux开始编译，最后会在/mnt/lmp/src下生成lmp_serial的可执行文件。 mv lmp_serial lmp 2 计算一example 终端输入： cd /mnt/lmp/e*/shear cp /mnt/lmp/src/lmp /mnt/lmp/e*/shear ./lmp< 即开始计算二lammps的并行安装 1 安装fftw 终端输入: cd /mnt gunzip 2.1.5 (源码包在 /mnt下) tar xvf 2.1.5 cd fftw-2.1.5 ./configure –prefix=/opt/fftw --enable -float make make install (fftw-2.1.5即安装在/opt/fftw下) 2 安装mpich

mpich2配置

Compaq Visual Fortran6.5环境下配置MPICH2 1 先下载稳定版本的mpich2-1.0.7rc2-win32-ia32.msi安装程序。下载地址：https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html,/research/projects/mpich2/ 2 安装mpi至默认目录C:\Program Files\MPICH2(此过程要去微软官方下载vcredist_x86.exe 软件) 3 运行开始>程序>MPICH2>wmpiconfigure.exewmpiregister，进行注册，这里填写Windows 系统的用户名和密码，最好这个用户是有管理员权限的用户，写好帐号和密码后，点register。 4 运行开始>程序>MPICH2>wmpiconfigure.exe，这个窗口是设置连入并行系统的控制端，点apply all。 5 打开Compaq Visual Fortran6.5 选择tools>options>directories……，分别在show directories for下拉菜单中选择Library Files 和Include Files，然后分别添加路径 C:\Program Files\MPICH2\lib C:\Program Files\MPICH2\include 这个地方或者干脆把MPICH安装目录下的lib文件夹中的所有文件全部复制到\Microsoft Visual Studio\DF98\LIB中，同时把MPICH安装目录下的Include文件夹中的所有文件全部复制到\Microsoft Visual Studio\DF98\INCLUDE 6 进入Compaq Visual Fortran6.5测试第一个程序先建立一个Project（项目），选择Fortran console Application，Project（项目名称）假定为Testmpi（注意保存的位置），然后点击OK，出现的对话框中选择An empty project，点击Finish，点击OK. 7．设置环境变量：点击菜单Project->Settings...，（或者按alt + F7）进行下面操作： I) 在setting for中，选择Win32 debug； II) 选择Fortran标签，进行下面操作：

MPICH2安装及MPI简介

MPICH2安装及MPI简介 MPICH2的安装 ●下载MPICH2包mpich2.tar.gz ●解压缩# tar xfz mpich2.tar.gz ●#mkdir /tmp/root/mpich2-1.0.8 ●#cd /tmp/root/mpich2-1.0.8 ●#/root/Desktop/mpich2-1.0.8/configure --prefix=/usr/local 2>&1 | tee configure.log //其中root/Desktop/mpich2-1.0.8/为解压后MPICH2路径 ●#make 2>&1 | tee make.log ●#make install PACKAGE=mpich-1.0.8 2>&1 | tee install.log ●#make installcheck PACKAGE=mpich-1.0.8 2>&1 | tee installcheck.log 测试安装是否成功 #which mpiexec #which mpd //默认程序管理命令default process manager #which mpicc #which mpirun 注：如果不是安装在/usr/local目录下，则还需设置环境变量。通过编辑.bashrc文件修改环境变量

#vi .bashrc 修改后的.bashrc文件如下： # .bashrc # User specific aliases and functions PATH="$PATH:/usr/MPICH-install/bin" //新增加的 #Source .bashrc mpd配置文件中设置密码 #cd $HOME #touch .mpd.conf #chmod 600 .mpd.conf //权限设置为只有自己有读写权限在超级用户下： #cd /etc #vi mpd.conf 写入secretword=jsi 并保存 #chmod 600 /etc/mpd.conf 单机测试 #mpd & #mpdtrace //显示本机名为成功 #mpiexec –n 1 /bin/hostname #mpdallexit SSH配置

MPI的安装和配置

MPI MPI ?.MPI的安装 1.下载MPICH2软件包官?：https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html,/downloads/。本次安装直接选择已经下载好的mpich2-1.4.1p1-win-ia32.man（32位）进?安装。 2.先安装NET Framework 3.5 步骤1点“mpich2-1.4.1p1-win-ia32.man（32位）”可能会发现?法进?安装，直接弹出官?下载MPICH2软件包的情况。这是因为电脑上没有配置NET Framework3.5的原因，所以要先在电脑上安装NET Framework3.5或者NET Framework2.0。如果电脑上已经安装有NET Framework 3.5，跳过此步骤。先百度下载NET Framework 3.5，打开后按照提?进程依次点NEXT就可以安装好NET Framework 3.5。 3.按照提?进程进?安装。安装?录默认：C：\Program Files (x86)\MPICH2即可。如下截图： 4.加?mpich2的路径：计算机---属性---?级系统设置---?级---环境变量---path中加?C:\Program Files (x86)\MPICH2\BIN路径。如下截图：

5.双击运?C:\Program Files\MPICH2\bin ?录下的wmpiregister （1）、输?账户的?户名与密码（2）、点击Register注册（3）、点击OK，确认如下截图

6、 1.、以管理员?份启动命令名提?符：找到命令处理程序C:\Windows\System32\cmd.exe 点击右键：选择以管理员?份运?（2）、在C:\Program Files（x86）\MPICH2\bin?录下运?： smpd -install -Pumbaa（账户名） *******（账户密码）如下截图

MPICH2的下载及安装

1、从网址https://www.wendangku.net/doc/e13756948.html,/mpi/mpich/处下载MPICH 最新版本的源程序, 文件名为mpich2-1.x.x.tar.gz, 其中1.x.x 为MPICH 的版本号(目前的最新版本为mpich2-1.1.1p1.tar.gz)。在下面描述的过程中需用MPICH 的实际版本号替换1.x.x 2、展开MPICH 源程序: tar zxvf mpich2-1.1.1p1.tar.gz 3、配置、编译MPICH: cd mpich2-1.1.1p1 ./configure -prefix=/usr/local/mpi --disable-weak-symbols make 上述命令生成的MPICH 库应该使用ch_p4 进行底层通信。选项--disable-weak-symbols 的使用是为避免MPICH 1.2.5 的一个bug, 否则产生的库中将没有MPI_File_xxxx 等函数(只有PMPI_File_xxx 等函数) 4、安装MPICH: make install 这一步必须以root 身份执行, 它将MPICH 的文件安装到目录/usr/local/mpi 中。安装完毕后可以删除MPICH 源文件目录。 5、添加环境变量分别将“/usr/local/mpi/bin” 和“/usr/local/mpi/man” 加入到环境变量PATH 和MANPATH 中。只需在目录/etc/profile.d 中创建两个文件mpich.sh 和mpich.csh, 它们分别对Bourne shell和C shell 起作用, 这两个文件的内容如下: – /etc/profile.d/mpich.sh : #!/bin/bash export MANPATH=${MANPATH}:/usr/local/mpi/man export PATH=${PATH}:/usr/local/mpi/bin – /etc/profile.d/mpich.csh : #!/bin/csh if ( $?MANPATH == 0 ) then setenv MANPATH :/usr/local/mpi/man else setenv MANPATH ${MANPATH}:/usr/local/mpi/man endif setenv PATH ${PATH}:/usr/local/mpi/bin 6、测试MPICH: C 程序 cp /usr/local/mpi/examples/cpi.c . mpicc -o cpi cpi.c . mpirun -np 1 cpi mpirun -np 2 cpi

MPI安装与运行报告2

Ubuntu系统下mpich2的安装。把老师给的“mpich2-1.3.2p1.tar.gz ”解压到我的用户目录下。一、首先进入解压后mpich2文件的根目录，运行配置操作：./configure --prefix=/home//mpich2-install |& tee info.txt ，结果报错如下： "No Fortran 77 compiler found. If you don't need to build any Fortran programs, you can disable Fortran support using --disable-f77 and --disable-fc. If you do want to build Fortran programs, you need to install a Fortran compiler such as gfortran or ifort before you can proceed." 于是按照提示修改命令，改为./configure --prefix=/home/east/mpich2-install --disable-f77 --disable-fc |& tee info.txt，结果又提示没有找到C++编译器：“configure: error: Aborting because C++ compiler does not work. If you do not need a C++ compiler, configure with –disable-cxx” 考虑到以后应该会用到g++，于是根据提示用“sudo apt-get install g++”命令进行了安装。然后再次运行配置命令，终于成功完成。二、运行make命令”make |& tee info.txt”，经过了漫长的等待，看到提示”Make completed”的时候，终于松了一口气。三、安装MPICH2，运行”make install |& tee info.txt”命令。很快，就“Make completed”了。四、将安装后MPICH2的bin目录“mpich2-install”添加到系统路径中，即添加到启动脚本中，运行命令“PATH=/home/east/mpich2-install/bin:$PATH ; export PATH”，或者直接修改系统配置文件/etc/profile，然后重启系统以使配置文件生效。然后运行which mpiexec，系统回显出mpiexec的路径，证明bin目录已经成功添加到系统路径中。