提取NDVI步骤和问题
ENVI 提取NDVI的两种方法
原始遥感数据TM: 20070329_subset.img
在ENVI中进行计算NDVI
以下是操作步骤：（昨晚我又尝试了一下，属性表拉伸，已分类，好像是可以了）1.加载20070329_subset.img
2.进入Transform—NDVI，开界面
ok之后，
设置都是选择默认，Red :3 Near IR:4 计算的结果，另命名为20150604.img文件
3.在arcgis中打开：
右侧可以看出范围来3.40282e+038 低: -3.40282e+038，
低: 3.40282e+038，是3.40282*10的38次方
我尝试了一下拉伸和已分类命令，好像是可以了，范围变成了
，
第二种方法
使用波段计算
1.进入打开Basic Tools—Band Math
输出（b4-b3）/(b4+b3)
2.确定B3,B4波段，分布把B3,B4选为波段3和4
把输出结果命名为20150604_2.img文件
3.arcgis中打开：
同样需要在属性表中，拉伸和已分类命令
质粒提取的原理、操作步骤、各溶液的作用
细菌质粒是一类双链、闭环的DNA，大小范围从1kb至200kb以上不等。各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份，通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态，但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上，随着染色体的复制而复制，并通过细胞分裂传递到后代。 质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子，重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA分子。目前已有许多方法可用于质粒DNA的提取，本实验采用碱裂解法提取质粒DNA。 碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法，其基本原理为：当菌体在NaOH和 SDS 溶液中裂解时，蛋白质与DNA发生变性，当加入中和液后，质粒DNA分子能够迅速复性，呈溶解状态，离心时留在上清中；蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状，离心时可沉淀下来。 纯化质粒DNA的方法通常是利用了质粒DNA相对较小及共价闭环两个性质。例如，氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心、离子交换层析、凝胶过滤层析、聚乙二醇分级沉淀等方法，但这些方法相对昂贵或费时。对于小量制备的质粒DNA，经过苯酚、氯仿抽提，RNA酶消化和乙醇沉淀等简单步骤去除残余蛋白质和RNA，所得纯化的质粒DNA已可满足细菌转化、DNA片段的分离和酶切、常规亚克隆及探针标记等要求，故在分子生物学实验室中常用。 一、试剂准备 1. 溶液Ⅰ: 50mM葡萄糖，25mM Tris-HCl(pH ，10mM EDTA(pH ）。1M Tris-HCl[t1] (pH ），EDTA （pH ）10ml，葡萄糖，加ddH2O至500ml。在10 lbf/in2高压灭菌15min ，贮存于4℃。 任何生物化学反应，首先要控制好溶液的pH，因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液。 50 mM葡萄糖最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。因此，如果溶液I 中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言，几乎没有任何影响。所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。EDTA呢大家知道EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂，配在分子生物学试剂中的主要作用是：抑制DNase的活性，和抑制微生物生长。在溶液I中加入高达 10 mM 的EDTA，无非就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。如果不加EDTA，其实也没什么大不了的，只要不磨洋工，只要是在不太长的时间里完成质粒抽提，就不用怕DNA会迅速被降解，因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。如果哪天你手上正好缺了溶液I，可不可以抽提质粒呢实话告诉你，只要用等体积的水，或LB培养基来悬浮菌体就可以了。 NaOH也使DNA变性，但只是个副产物，在溶液3加入后其中的醋酸和NaOH中和，质粒DNA 恢复活性 2. 溶液Ⅱ：NaOH，1% SDS。2N NaOH 1ml，10%SDS 1ml，加ddH2O至10ml。使用前临时配置[t2] 。这是用新鲜的N的NaOH和2％的SDS等体积混合后使用的。要新从浓NaOH稀释制备的NaOH，无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。很多人不知道其实破细胞的主要是碱，而不是SDS，所以才叫碱法抽提。事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂，不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞，碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解，这是由于细胞膜发生了从bilayer（双层膜）结构向 micelle（微囊）结构的相变化所导致。用了不新鲜的N NaOH，即便是有SDS也无法有效溶解大肠杆菌（不妨可以自己试一下），自然就难高效率抽提得到质粒。如果只用SDS当然也能抽提得到少量质粒，因为 SDS也是碱性的，只是弱了点而已。很多人对NaOH的作用误以为是为了让基因组DNA变性，以便沉淀，这是由于没有正确理解一些书上的有关DNA变性复性的描述所导致。有人不禁要问，既然是NaOH溶解的细胞，那为什么要加SDS呢那是为下一步操作做的铺垫。这一步要记住两点：第一，时间不能过长，千万不要这时候去接电话，因为在这样的碱性条件下基因组DNA片断会慢慢断裂；第二，必须温柔混合（象对待女孩子一样），不然基因组DNA也会断裂。基因组 DNA的断裂会带来麻烦。 3. 溶液Ⅲ：醋酸钾（KAc）缓冲液，pH 。5M KAc 300ml，冰醋酸，加ddH2O至500ml。4℃保存备用。 溶液III加入后就会有大量的沉淀，但大部分人却不明白这沉淀的本质。最容易产生的误解是，
鼎信诺前端数据提取及数据转换说明
鼎信诺前端数据提取步骤 1、将前端取数文件夹拷贝到U盘中 然后将U盘插在企业财务电脑上(数据库服务器),双击Sjinput51进入，打开dataget.exe文件 进入取数界面； 2、选择“财务数据提取”和“操作系统环境”（右键我的电脑，点击属性，可查看），点击确认； 3、在财务软件列表中选择相应财务软件接口，或者在右上角的“模糊查询”区域输入财务软件拼音首字母 例如用友u8 我们就可以输入“YY”进行过滤选择好财务软件后 我们点击右下角的“下一步”； 4、数据库类型选择,用友软件一般为“access” 进入单机版取数界面，点击下一步； 5、点击浏览选取企业的备份数据； 6、浏览找到企业的数据库备份 后缀为.mdb 然后点击“打开”按钮； 7、点击“连接”按钮后 左下角区域出现账套名称和会计年选择需要的账套名称和会计年以后点击“开始取数”按钮进行取数； 8、取数完毕以后会弹出保存文件的对话框选择文件路径、文件名称以后 点击“保存”按钮，保存为后缀为.sjc的文件单机版取数完成（一般默认会导入U盘）。 鼎信诺导出数据转换步骤 1、打开鼎信诺，选择创建项目，点击确定； 2、在创建新审计项目中填上新项目名称，然后点击下一步； 3、选择审计期间，比如：2015年1-12月，点击创建单一公司或创建集团公司； 4、选择会计制度，点击下一步； 5、输入被审计单位名称等信息； 6、设置权限，点击确认，开始导入数据； 7、登录先建项目，点击确认； 8、点击“财务数据”，点击“前端数据导入”，选择文件，即导出的数据，选中后点击打开； 9、选择期数，确认；
10、点击“开始导数”，导数完成口进入数据检查，1、9、10是必须检查项； 11、点击确定，完成数据转换。
AVHRR图像上的水体提取
AVHRR图像上的水体提取 ●AVHRR图像上水体表现及特征分析 ●AVHRR图像上的水体识别提取模型 AVHRR图像上水体表现及特征分析 ●AVHRR数据拥有5个通道（CH），CH1（0.58-0.68微米）属橙色可见光范围，对水体中的泥沙 含量十分敏感；CH2（0.725-1.1微米）为近红外通道，为水的强吸收带，水体的反射率很低，水体的边界轮廓十分清晰。 ●为了整体上了解水体空间、时间、水质上的多变性在AVHRR影像上的反映，以及水体与其他易 混地物的区别，采用分地物类别按时间、空间变化的规律对AVHRR数据进行采样分析，分别在2月、5-8月AVHRR图像上对湖泊（太湖、鄱阳湖、洞庭湖、青海湖）、河流（长江、辽河）、海洋（黄海、东海、渤海）、云、云影、城市（上海、无锡、苏州、杭州）的光谱值进行采样分析。 ●该图幅内以平均值的光谱曲线为分界，厚云、薄云五个波段都相对为高值，光谱曲线明显高出 平均曲线；而其它地物明显低于或围绕平均曲线有小的起伏，其中云影在CH3、CH4、CH5又稍高于平均水平。从曲线的走向看，云、云影与河流、积水区一致，因此，要进一步区分水体与云及云影，在原有CH1>CH2的规律下，须加入CH2、CH3的判断条件，利用CH2、CH3的均值分别排除云及云影。 ●图内的河流、湖泊、海洋的3、4、5波段则相对洪水期有增高，表现出高于图幅均值的规律； 而云影在曲线走向和数据大小都与各种水体的规律极为相似，无法再加以区分；反而该时期的城市曲线依然全低于图幅均值，落在平均曲线的下方，虽然在CH1、CH2也满足水的规律，但完全可以利用CH3波段把它剔除掉。 ●上面的采样分析可知，在AVHRR这一特定的传感器上，水体的遥感特性与地面实测相比呈现出 一定程度的变化，表现为：正常情况下水体随空间的变化幅度较小，而随时间的变化幅度较大，而在洪水期间，水体表现大幅度的变化，由平常时期的相对稳定到起伏较大，呈现出特殊的规律。其中由于降水的增加引起水中泥沙含量，水温等异常变化也起到了相当大的作用，而由于时间变化引起水体的变化反映则相当的微弱。但无论水体随时间，空间怎么变化，则其在近红外吸收的特性则始终不变，且表现为CH1>>CH2，CH2<图像的均值；CH3有规律的上升或下降，在正常时期，水体CH3大于整幅图像的平均值，而洪水期间CH3小于整幅图像的均值，这就是水体在光谱多变性条件下，呈现出的统一规律，即光谱特征。 AVHRR图像上的水体提取模型 根据大量的水体光谱样本分析，得出AVHRR数据的水体信息摄取的基本光谱模型： ●CH1》CH2，且CH2<图像平均值； 洪灾期：CH3<图像平均值；非洪水期，且CH3>图像均值； ●随着水面积减小，混浊度增加，水深变浅，水体特征有所改变。CH1相对减小，CH2相对增加， 有向陆地逐渐过渡的趋势，且往往该部分水体是陆地包围的水体或覆盖在陆地上的浅水体。 ●在分析了水体在图像上的空间特征后，在光谱模型上又给出水体的空间模型： –水体相对于陆地或云层等呈现出较为均一的图斑，无明显的纹理特征 –水体图斑的边界相对于云层较稳定，河流的线状特征，湖泊、海洋等的面状特征较明显。 以上的光谱模型和空间模型采用面向对象的思想完成模型建立，可以实现水体的智能化信息提取。 TM图像上的水体提取 ●由于时间分辨率的限制，在洪水期难以获得无云雾的TM图像，因此TM主要用于洪水灾害损失 评估和本底水体的提取。 ●从TM数据中提取水体信息的关键是区分水体与其他地物的阴影，这同样需要进行不同地物各 波段的光谱值分析。 ●水体、阴影的第5波段明显小于第2波段。而其它地物则刚好相反。在第2、3波段上，水体的
高纯度质粒小量快速提取试剂盒操作方法及步骤说明书
杭州昊鑫生物科技股份有限公司 htpp://https://www.wendangku.net/doc/e56589812.html, HighPure Plasmid Mini Kit 高纯质粒小量快速提取试剂盒 目录号：PL03 试剂盒组成、储存、稳定性： 试剂盒组成保存 50次 （PL0301） 100次 （PL0302） 200次 （PL0303） 平衡液室温5ml 10ml 20ml RNaseA（10mg/ml）-20℃150μl 250μl 500μl 溶液P1 4℃15 ml 25 ml 50 ml 溶液P2 室温15 ml 25 ml 50 ml 溶液P3 室温20 ml 35 ml 70 ml 去蛋白液PE 室温16ml 31.5 ml 63 ml 第一次使用前按说明加指定量乙醇 漂洗液WB 室温15 ml 25ml 50ml 第一次使用前按说明加指定量乙醇 洗脱缓冲液EB 室温10ml 15ml 20ml 吸附柱AC 室温50个100个200个 收集管（2ml）室温50个100个200个 本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。 储存事项: 1.第一次使用时，将试剂盒所带的全部RNase A加入溶液P1后（终浓度100ug/ml） 置于2-8℃保存。如果溶液P1中RNase A失活，提取的质粒可能会有微量RNA 残留，在溶液P1中补加RNase A即可。 2.环境温度低时溶液P2中SDS可能会析出浑浊或者沉淀，可在37℃水浴加热几分 钟，即可恢复澄清，不要剧烈摇晃，以免形成过量的泡沫。 3.避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化，各溶液使用后应及时 盖紧盖子。 产品介绍：
本试剂盒采用改进SDS-碱裂解法裂解细胞，离心吸附柱内的硅基质膜在高盐、低pH值状态下选择性地结合溶液中的质粒DNA，再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除，最后低盐、高pH值的洗脱缓冲液将纯净质粒DNA从硅基质膜上洗脱。 产品特点： 1.离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界著名公司特制吸附膜，柱与柱之间吸附 量差异极小，可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。 2.独有的去蛋白液配方，可以高效去除残留的核酸酶，即使是核酸酶含量丰富的菌 株如JM系列、HB101也可以轻松去除。有效防止了质粒被核酸酶降解。 3.快速、方便，不需要使用有毒的苯酚、氯仿等试剂，也不需要乙醇沉淀。获得的 质粒产量高、纯度好，可以直接用于酶切、转化、PCR、体外转录、测序等各种分子生物学实验。 注意事项 1. 所有的离心步骤均在室温完成，使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机， 如Eppendorf 5415C 或者类似离心机。 2. 提取质粒的量与细菌培养浓度、质粒拷贝数等因素有关。一般高拷贝质粒，建议 接种单菌落于1.5-4.5 ml加合适抗生素的LB培养基，过夜培养14-16个小时，可提取出多达20μg的纯净质粒。如果所提质粒为低拷贝质粒或大于10kb的大质粒，应适当加大菌体使用量，使用5-10 ml过夜培养物，同时按比例增加P1、P2、P3的用量，其它步骤相同。 3. 得到的质粒DNA可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。OD260 值为1相当于大约50μg/ml DNA。电泳可能为单一条带，也可能为2条或者多条DNA条带，这主要是不同程度的超螺旋构象质粒泳动位置不一造成，与提取物培养时间长短、提取时操作剧烈程度等有关。本公司产品正常操作情况下基本超螺旋可以超过90%。 4. 质粒DNA确切分子大小，必须酶切线性化后，对比DNA分子量Marker才可以知 道。处于环状或者超螺旋状态的的质粒，泳动位置不确定，无法通过电泳知道其确切大小。 5. 洗脱液EB不含有螯合剂EDTA，不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗 脱，但应该确保pH大于7.5，pH过低影响洗脱效率。用水洗脱质粒应该保存在－
遥感影像水体提取实验
基于高分一号卫星多时相数据的洪水监测 摘要：本文利用两幅高分一号多光谱影像数据，通过ENVI4.8软件，采用NDVI对黑龙江地区水体进行了提取，并在图像上展示了水体变化区域，计算了水体变化面积。结果表明：9月9日黑龙江水域面积比8月27日增加了226.6822 km。最后又采用了假彩色合成法展示了水体增加区域。结果表明：两种方法对水体变化信息的提取具有一致性。 1 数据介绍 本作业获得了两幅高分一号TIF数据，分别是8月27日，9月9日。每幅影像有4个波段，查阅资料得知：1波段波长为0.45-0.52um，属于蓝、青光，2波段波长为0.52-0.59um，属于黄、绿光，3波段波长为0.63-0.69um，属于红光，4波段为0.77-0.89，属于近红外。 图1 0827影像信息图2 0909影像信息 2 研究区域 由所给数据的经纬度坐标可知，研究区域为抚远县，其地处黑龙江、乌苏里江交汇的三角地带。地理方位是东经133° 40′ 08″至
135° 5′20″,北纬47° 25′30″至48° 27′40″。 图3 研究区域的百度卫星地图 2 水体提取方法选择 单波段：水体在近红外波段的反射率很低，所以可以设置阈值进行提取。 归一化水体指数 )/()(NIR Green NIR Green NDWI ρρρρ+-= 归一化植被指数 )/()(NDVI Re Re d NIR d NIR ρρρρ+-= 但单波段方法中阈值的设置需要反复调整，而高分一号数据的1、2波段不完全是蓝、绿光，而3、4波段完全是红、近红外。所以选择归一化植被指数提取水体。-1= 遥感影像中水面及水体信息提取方法的研究 胡启中1，祁建勇2 （1.上海佳文比特信息科技有限公司，上海，200135；2.河北建设勘察研究院有限公司，石家庄，050031） 摘要：根据遥感影像中不同光谱波段对不同地物的反射率特征，以西洋河流域2000年春秋两期Landsat7 ETM＋遥感数据为研究对象，结合实地调查数据，利用地理信息系统及遥感数据处理系统软件平台，建立植被覆盖度对不同季节、不同程度的植被覆盖、岩土裸露及水面水体相关的特征关系、对该流域内分布的各类中小型水库塘坝的水面和水体信息的分析和提取方法进行系统的研究和验证。通过结果分析表明：根据不同时相遥感影像的光谱波段组合建立不同的处理方法可以提高季节性变化的水面及水体信息识别和提取的精度和效率。 关键词 ：遥感影像；光谱分析；水体信息；提取方法 水面及水体信息的分析和提取，一直是遥感影像分析处理及解译分类的基础性工作，在水资源调查、水环境监测、水灾害评估等许多方面得到了广泛应用。国内外很多专家学者在大规模区域尺度、高精度空间分辨率及多时相时间分辨率的遥感数据基础上对水体的提取方法做了深入研究，并提出了许多行之有效的方法。 在中小流域尺度范围上，基于中低空间分辨率的卫星遥感影像，对各类中小型水库塘坝的水面及水体信息的分析和提取是困难的，即使单一的借助专业的遥感数据处理系统软件平台进行分类解译，不仅技术性强，步骤繁多，模型构造复杂，也是费工费时费力的。水域范围精度控制和水面水体提取效率的提高一直是遥感解译水面及水体信息方法改进的驱动力。 1 Landsat7 ETM＋遥感波段光谱特征及归一化植被指数应用 遥感数据是在预定的光谱波段（波长）上获得的。美国陆地卫星7号（Landsat-7）携带的增强型专题制图仪（ETM+），包含三个可见光波段兰绿红、一个近红外波段、二个中红外波段，空间分辨率为30米；一个热红外波段，空间分辨率为60米；另加一个空间分辨率为15米的全色波段。尽管空间分辨率不是较高，重采样覆盖周期16天，但其波段设置比较合理，并采集传输回大量的遥感数据，成为陆地资源调查及生态环境监测等诸多领域应用重要的遥感数据源之一。各种地物，尤其是岩石土壤、绿色植被和水面水体在可见光和红外波段附近具有明显的反射率特征。在光谱中，波段3可见光红光主要被植物吸收，同土壤和岩石相比，绿色植物的反射系数相当弱；而在波段4近红外线部分的反射却比多数其它地表覆盖物的反射要强得多[ 1 ]。水面或水体几乎吸收了近红外波段4和中红外波段5或7的全部能量使之反射率很低，同时土壤和植被在这三个波段内的吸收能量较小，而有较高的反射率，这就使得水体在这三个波段上与植被和土壤具有明显的光谱特征差异。因此在假自然色彩波段合成影像（RGB543波段组合）中，水体呈现出深蓝色及蓝色的暗色调，而土壤因其岩类基质特征呈不同浅色调，植被则呈现出相对较亮的深绿色、绿色或浅绿色色调。但由于不规则山体阴影的影响，使得近红外、中红外在阴坡面的反射能量特别低，它们在影像上也呈现出明显的暗色调；规则的铁路线、公路线等基础设施在遥感影像上也同时呈现出明显的暗色调。水面水体与山体阴影、铁路线、公路线等基础设施的光谱特征混淆使得遥感解译的普通分类方法难以准确提取水面水体信息。 归一化植被指数（NDVI），是植被指数的一种通用化指标形式，正是利用了遥感数据中近红外线和红光之间植被、水体及岩石土壤等其它地物的光谱特征，计算两波段之间的差异或比值，使之反映植被覆盖状况。因此，通过遥感数据直接计算的植被指数近一步估算植被覆盖度，在全球植被变化、作物生长状况、 质粒提取的原理、操作步骤、各溶液的作用 细菌质粒是一类双链、闭环的DNA，大小范围从1kb至200kb以上不等。各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份，通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态，但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上，随着染色体的复制而复制，并通过细胞分裂传递到后代。 质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子，重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA分子。目前已有许多方法可用于质粒DNA的提取，本实验采用碱裂解法提取质粒DNA。 碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法，其基本原理为：当菌体在NaOH和 SDS溶液中裂解时，蛋白质与DNA 发生变性，当加入中和液后，质粒DNA分子能够迅速复性，呈溶解状态，离心时留在上清中；蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状，离心时可沉淀下来。 纯化质粒DNA的方法通常是利用了质粒DNA相对较小及共价闭环两个性质。例如，氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心、离子交换层析、凝胶过滤层析、聚乙二醇分级沉淀等方法，但这些方法相对昂贵或费时。对于小量制备的质粒DNA，经过苯酚、氯仿抽提，RNA酶消化和乙醇沉淀等简单步骤去除残余蛋白质和RNA，所得纯化的质粒DNA已可满足细菌转化、DNA片段的分离和酶切、常规亚克隆及探针标记等要求，故在分子生物学实验室中常用。 一、试剂准备 1. 溶液Ⅰ: 50mM葡萄糖，25mM Tris-HCl(pH 8.0)，10mM EDTA(pH 8.0）。1M Tris-HCl (pH 8.0）1 2.5ml，0.5M EDTA（pH 8.0）10ml，葡萄糖4.730g，加ddH2O至500ml。在10 lbf/in2高压灭菌15min ，贮存于4℃。 任何生物化学反应，首先要控制好溶液的pH，因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液。50 mM葡萄糖最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。因此，如果溶液I中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言，几乎没有任何影响。所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。EDTA呢？大家知道EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂，配在分子生物学试剂中的主要作用是：抑制DNase的活性，和抑制微生物生长。在溶液I中加入高达 10 mM 的EDTA，无非就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。如果不加EDTA，其实也没什么大不了的，只要不磨洋工，只要是在不太长的时间里完成质粒抽提，就不用怕DNA会迅速被降解，因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。如果哪天你手上正好缺了溶液I，可不可以抽提质粒呢？实话告诉你，只要用等体积的水，或LB培养基来悬浮菌体就可以了。 NaOH也使DNA变性，但只是个副产物，在溶液3加入后其中的醋酸和NaOH中和，质粒DNA恢复活性 2. 溶液Ⅱ：0.2N NaOH，1% SDS。2N NaOH 1ml，10%SDS 1ml，加ddH2O至10ml。使用前临时配置。 这是用新鲜的0.4 N的NaOH和2％的SDS等体积混合后使用的。要新从浓NaOH稀释制备0.4N的NaOH，无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。很多人不知道其实破细胞的主要是碱，而不是SDS，所以才叫碱法抽提。事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂，不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞，碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解，这是由于细胞膜发生了从bilayer（双层膜）结构向 micelle（微囊）结构的相变化所导致。用了不新鲜的0.4 N NaOH，即便是有SDS 也无法有效溶解大肠杆菌（不妨可以自己试一下），自然就难高效率抽提得到质粒。如果只用SDS当然也能抽提得到少量质粒，因为 SDS也是碱性的，只是弱了点而已。很多人对NaOH的作用误以为是为了让基因组DNA变性，以便沉淀，这是由于没有正确理解一些书上的有关DNA变性复性的描述所导致。有人不禁要问，既然是NaOH溶解的细胞，那为什么要加SDS 呢？那是为下一步操作做的铺垫。这一步要记住两点：第一，时间不能过长，千万不要这时候去接电话，因为在这样的碱性条件下基因组DNA片断会慢慢断裂；第二，必须温柔混合（象对待女孩子一样），不然基因组DNA也会断裂。基因组 DNA 的断裂会带来麻烦。 3.溶液Ⅲ：醋酸钾（KAc）缓冲液，pH 4.8。5M KAc 300ml，冰醋酸 57.5ml，加ddH2O至500ml。4℃保存备用。 溶液III加入后就会有大量的沉淀，但大部分人却不明白这沉淀的本质。最容易产生的误解是，当SDS碰到酸性后发生的沉淀。如果你这样怀疑，往1%的 SDS溶液中加如2M的醋酸溶液看看就知道不是这么回事了。大量沉淀的出现，显然与SDS的加入有关系。如果在溶液II中不加SDS会怎样呢，也会有少量的沉淀，但量上要少得多，显然是盐析和酸变性沉淀出来的蛋白质。既然SDS不是遇酸发生的沉淀，那会不会是遇盐发生的沉淀呢？在1％的SDS溶液中慢慢加入5 N的NaCl，你会发现SDS在高盐浓度下是会产生沉淀的。因此高浓度的盐导致了SDS的沉淀。但如果你加入的不是NaCl而是KCl，你会发现沉淀的量要多的多。这其实是十二烷基硫酸钠（sodium dodecylsulfate）遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾（potassium dodecylsulfate, PDS），而PDS是水不溶的，因此发生了沉淀。如此看来，溶液III加入后的沉淀实际上是 GSM BSS MR数据提取解决方案说明书V2.1 ――基于M2000集中采集方案 华为技术有限公司 版权所有侵权必究 All rights reserved 目录 1关于本文档 (3) 1.1目的 (3) 1.2范围 (3) 1.3文档管理 (3) 2BSC6000的MR数据采集方案（网管集中采集） (4) 2.1方案概述 (4) 2.1.1背景 (4) 2.1.2组网图 (5) 2.2网管集中采集MR数据方案 (5) 2.2.1M2000定制MR采集任务 (5) 2.2.2BSC侧对MR采集任务的处理 (6) 2.2.3M2000侧对MR数据的集中存储 (7) 2.2.4关键规格 (7) 2.2.5软件要求 (8) 2.2.6硬件要求 (8) 2.2.7组网要求 (8) 2.2.8数据接口 (8) 1 关于本文档 1.1 目的 《GSM BSS MR数据提取解决方案说明书V2.1》描述了华为GSM BSS系统从BSC获取MR测量数据的具体方案，实施措施和华为提供的相关服务策略，帮助和指导用户有效获取MR相关数据，实现对网络数据信心的良好监控和持续优化。 1.2 范围 本文是GSM BSS MR数据提取解决方案的总体介绍性文档，可在投标，技术交流，技术澄清等商务技术活动中被使用，也可作为项目相关客户或市场技术人员学习和了解相关特性的参考资料。 1.3 文档管理 本文档由华为公司无线产品线O&M开发部编写，修订和维护。并在“市场资料管理系统（3MS 平台）”上发布。 本文档可在“市场资料管理系统（3MS平台）”下载获得。 2 BSC6000的MR数据采集方案（网管集中采集） 2.1 方案概述 2.1.1 背景 基于MR包括，可实现利用现网手机用户的实时状态，基于快速收集真实的海量手机测量报告，直接采集手机用户上、下行链路数据，在实际话务模型下进行优化，能够及时发现覆盖问题、邻区多配漏配问题、直观全面地了解话务密度、上下行质量和干扰状况等。 本文档描述针对华为BSC6000产品如何实现对MR数据的集中采集。 传统的MR数据采集通常是通过在Abis口挂表方式采集，该方法的主要劣势是： （1）工程师必须在Abits口上挂接仪表，必须到各个端局操作，费时费力； （2）挂表方式要手工操作，需要不断检索传输线路，更替接口； （3）挂表方式一次只能对若干线路实现采集，难以实现全网信息的统一收集，除非对所有Abits口挂表，成本巨大； （4）挂表方式要经常倒换采集数据，易于出错； 华为针对客户上述困难，在BSC6000实现MR数据的软件采集，并通过M2000可实现对多BSC MR数据的集中采集。 水体提取方法简单归纳总结 一、基于MODIS影像的几种提取方法。 最常用的水体提取方法： 波段阈值法、谱间关系法（波段组合法）和多光谱混合分析法 单波段阈值法是提取水体的最简单易行的方法。 基本原理：是利用水体在近红外波段上反射率较低,易与其它地物区分的特点,选取单一的红外波段, 通过反复试验, 确定一个灰度值,作为区分水体与其它地物的阈值即可。 缺点：是无法将水体与山区阴影区分开来,提取的水体往往比实际要多。 有些文献中叙述由于阀值随时间、地点变化的不确定性使得该方法具有局限性,但对于非山区的特定时相和区域里,尤其像MODIS 这样高光谱的遥感数据, 首先应选用阈值法进行试验,因为光谱的细分已经将上述问题大大减弱。若能获得较满意的提取效果,则很容易实现水体的自动提取。 对于用阈值法确实得不到理想效果的,则可以考虑谱间关系法和多光谱混合分析法。 利用谱间关系可建立的模型很多,如对波段进行如下组合运算CH7/CH6 ,CH7/CH5, CH6/CH5, 从而找出组合图像上水陆分界非常明显的影像。以CH7/CH6为例,可以采用如下方法剔除非水体: 在ENVI 软件下输入CH7 及CH6 波段, 运用波段计算功能,将公式CH7/CH6 输入,载入影像, 在放大窗口中,手工裁取明水水域范围, 生成多边形,对各多边形赋予一个感兴趣区( AOI) 文件, 并将其输出为EN-VI 等矢量文件即可。 对波段进行组合运算的目的,是为了增强水陆反差。MODIS 数据的波段1 是红光区( 0. 62 ～0.67um) ,水体的反射率高于植被, 波段2 是近红外区( 0. 841 ～0. 876um) ,植被 XX系统数据提取管理办法 修订历史记录 编制部门/日期: 审核人/日期： 批准人/日期： XＸXＸXX集团发布 目录 1、目得3? 2、定义 (3) 3、适用范围 (3) 4、管理职责 ........................................................................................................................................................... ３５、XXＸ系统数据流程5? ６、附则 ................................................................................................................................................................. ７ 1、目得 为规范XXＸ系统数据管理工作,降低数据被非法使用、泄露、丢失及破坏得风险，特制定本管理规定. 2、定义 本管理办法中数据就是指XXX系统中各种业务与财务数据.数据管理包括涉及数据修改、提取,数据处理过程中对数据真实性得保证,数据内、外部传输得工作。 3、适用范围 3、1、总部用户 本规定适用于中国ＸＸＸ金融服务集团(以下简称“公司”）所有职能部门、业务单位及其业务部门(以下简称“各部门”）。 3、2、分支机构用户 中国XXX金融服务集团属下各分支机构。 4、管理职责 ４、2、１、公司各部门、各分支机构：填写《XXX系统数据提取申请表》描述提取数据得原因、数据范围、使用范围、知情人范围等内容，并签署《平台数据提取确认书》,由部门负责人审批后通过OA提交需求。申请人、申请人所在部门、申请人所在分支机构以及审批人员必须对所需提取得数据负全部责任,包括且不限于不外泄、不转发、不拷贝、用途不得违反公司各规章制度,如若违反需承担一切后果。 4、2、2、机构后援服务部:审核各分支机构提交得数据提取需求申请,包括但不限于审核该机构提取必要性、数据使用范围、知情人范围、数据内容就是否合理。 4、２、3、财务管理部:审核各部门、各分支机构提交得数据提取需求申请，包括但不限于审核该部门、机构提取必要性、使用范围、知情人范围、数据内容就是否合理。 4、2、4、风险控制部：审核公司各部门、各分支机构对内/外使用得数据提取需求申请得合法性、合理性、有效性、使用范围、知情人范围、数据范围。 4、2、５、总裁办公室:审核财务部、风险控制部对内/外使用得数据提取需求申请得合法性、合理性,使用范围、知情人范围、数据内容。 4、2、６、董事长办公室:审核财务部、风险控制部对内/外使用得数据提取需求申请得合法性、合理性,使用范围、知情人范围、数据内容。 水体样本提取的方法 手提 （细菌细胞直径约0.5um，长度约0.5~5um） 将300-500ml水样通过0.45um或者0.22um的滤膜 如果水样中不可溶解的颗粒较多，需要使用2-5um孔径的滤膜将不可溶解的颗粒杂质滤去，滤膜孔径大于水体微生物细胞直径。 用于水体微生物富集的滤膜的选择： 常用的滤膜孔径大小有45mm和22mm两种，孔径太小滤膜容易阻塞，45mm的孔径大小透水性较好，提样的时候可根据客户的需要，选择45mm或22mm孔径的滤膜。 滤膜材质有很多种，常用的三种为聚苯醚砜滤膜、混合纤维素酯薄膜、氧化铝薄膜。 聚苯醚砜滤膜（Polyethersulfone）：最结实的滤膜之一，可以过滤比其它滤膜更多的水样。使用真空泵可快速抽干，易于折叠不易撕破。能抵受真空泵长时间高压力的滤过。若需要过滤大量低微生物含量的清亮水样，0.22mm滤膜的更合适。在提取核酸时，得率可与PowerWater? DNA 和RNA Isolation Kits中自带的混合纤维素酯滤膜相媲美。 混合纤维素酯滤膜（膜醋酸纤维素、硝酸纤维素）: 0.45μm孔径最合适材质。如果水样浑浊，使用0.22μm滤膜过滤缓慢容易堵塞时，建议使用0.45μm孔径的滤膜。纤维素滤膜吸水性强，不好处理。有文献显示杀虫剂和除草剂很容易吸附到纤维素滤膜上。若样品含有杀虫剂和除草剂，最好避免使用这类滤膜。 聚碳酸酯滤膜（Polycarbonate）: 这种滤膜很薄且容易起褶皱，所以不太好用。通常用0.45μm孔径的滤膜来预防过滤时发生阻塞。不像聚醚砜膜（PES）和混纤膜（MCE），水样中微生物会停留在滤膜表面。使得滤膜很容易阻塞，本该滤过的小颗粒也会截留下来。实验证明，珠磨研磨破碎强度越小，获得DNA分子量越大。如果样品只是用来做PCR，可以采用强力的研磨方法提高得率，暂时忽略片段破碎。 样品富集之后按照以下方法进行提取： 1. 滤膜剪碎，溶于500ul水中，液氮反复冻融（或用超低温冰箱）（从-70℃拿出来后在65℃水中冻融，小心操作，防止管子炸裂）【裂解细胞】 2. 将水样于13000rpm下离心，10min，收集沉淀 3. 沉淀溶于100ul 1×TE，重悬 质粒抽提,实验室必备技能之一 质粒 质粒存在于许多细菌以及酵母菌等生物中，是细胞染色体外能够自主复制的很小的环状DNA 分子。 质粒抽提 从细菌中分离质粒DNA的方法包括3个基本步骤：培养细菌使质粒扩增；收集和裂解细菌；分离和纯化质粒DNA。采用强碱液、加热或溶菌酶（主要针对革兰氏阳性细菌）可以破坏菌体细胞壁，十二烷基磺酸钠（SDS）和 TritonX-100（一般很少使用）可使细胞膜裂解。经溶菌酶和SDS或 Triton X-100处理后，细菌染色体DNA会缠绕附着在细胞碎片上，同时由于细菌染色体DNA比质粒大得多，易受机械力和核酸酶等的作用而被切断成不同大小的线性片段。当用强热或酸、碱处理时，细菌的线性染色体DNA变性，而共价闭合环状DNA(Covalently closed circular DNA，简称cccDNA）的两条链不会相互分开。当外界条件恢复正常时，线状染色体DNA片段难以复性，而是与变性的蛋白质和细胞碎片缠绕在一起，而质粒DNA双链又恢复原状，重新形成天然的超螺旋分子，并以溶解状态存在于液相中。 质粒抽提最常用的方法是碱裂解法，它具有得率高、适用面广、快速和纯度高等特点。当然，碱裂解法也有缺陷：容易导致不可逆的变性。要降低不可逆的变性，就要控制好碱裂解的时间。 碱裂解法抽提质粒需要用到以下三种溶液 溶液Ⅰ 50 mmol/L 葡萄糖，25 mmol/L Tris-Cl（pH 8.0），10 mmol/L EDTA（pH 8.0），在15 psi 压力下蒸汽灭菌15 min，4℃保存。 溶液Ⅱ 0.2 mmol/L NaOH（从10 mmol/L 贮存液中现用现稀释），10 g/L SDS（室温保存）。 溶液Ⅲ 水体DNA提取实验方法 1．取200ml 样品经0.22μm 的微孔滤膜过滤，将滤膜及过滤物在无菌条件下剪成1-2mm 的碎屑，放入Eppendorf 管中，加STET 缓冲液至满管，离心5分钟； 2．小心去上清，向沉淀中加入1mL STET 缓冲液洗涤，10000rpm 离心2min收集沉淀； 3．用200μL STET 缓冲液重悬沉淀，将4μL 50mg/mL 的溶菌酶加到悬液中，室温放置（37℃）5min，然后置94℃水浴保温2min； 5. 加入SDS 至终浓度为0.5%（10μL）和蛋白酶K 至终浓度为100μg/mL（1μL、20mg/ml），混合后置37℃水浴保温1h； 6. 加入NaCl 溶液（20μL、5mol/L）至终浓度为0.5mol/L，充分混匀，再加入25μL 5% CTAB（十六烷基三乙基溴化铵），混合并置65℃水浴保温10min； 7. 加入等体积（260μL，具体视情况而定）的饱和酚，混匀，12000rpm 离心5min，将上清液转入另一洁净的 1.5mL Eppendorf 管中； 8. 加入等体积酚/氯仿（V/V），混匀，12000rpm 离心5min，将上清液转入另一洁净的1.5mL Eppendorf 管中； 9. 加入0.6倍异丙醇混匀，在4℃或者-20℃（老师建议4℃）放置（沉淀）1h 或过夜； 10. 12000rpm 离心20min，小心吸出或者倒出异丙醇； 11. 用500μL 70%冷乙醇洗涤沉淀，12000rpm 离心5min 收集沉淀； 12. 小心吸出或者倒出乙醇，然后在吸水纸上倒置使残余乙醇流尽，空气干燥10－15 min，以便表面乙醇挥发，注意不要使沉淀完全干燥； 13. 加入30μL无菌双蒸水（ddH2O），用微量移液器吹吸，混合至DNA 充分溶解； 14. 将DNA 溶液存放于-20℃，不可使用自动除霜冰箱，以避免DNA 反复冻融； 药品准备 1. STET 缓冲液：8%蔗糖，50mM Tris（pH 8.0），50mM EDTA，0.1% Tween-20； 2. 50mg/mL 溶菌酶；蛋白酶K 3. 10% SDS；5mol/L NaCl；5% CTAB（十六烷基三乙基溴化铵）； 实习一：水体信息提取姓名：XXxx 学号：!!!!!!!!!!!!!!!!!!! 专业：地理信息科学 教师：XXXXX 成绩： 环境与规划学院 二〇一六年四月 实验报告 一实验目的 学习水体光谱的征曲线，掌握应用遥感图像处理软件进行水体波普的差异性分析。 掌握水体提取的常用方法；能够使用ENVI软件进行水体信息提取。 二实验内容 遥感探测的水体波谱信息：水可以吸收也可以散射通过水汽界面的波谱辐射能量（Ed），但水的散射会增加天空辐射能量（Eu），而水的吸收则会同时减少Ed和Eu。 遥感影像记录了地表物体的反射信息及其自身向外的辐射信息。相对于其他地物而言，水体在整个光谱范围内都呈现出较弱的反射率。 在近红外、中红外及短波红外部分，水体几乎吸收了去不得入射能量，因此水体在这些的反射率特别低，而土壤、植被、建筑物等在这些波段吸收能量较小，具有较高的反射率，是的水体与他们具有明显的区别。 水体信息提取有助于确定水体边界、了解水域面积变化、水文水资源要素，提取结果可用于水资源信息统计及相关的辅助决策 三实验方案 单波段法（阈值）； 多波段法（谱间关系法、比值法、归一化差异水体指数（NDWI）、改进的归一化差异水体指数（MNDWI） 1．图像预处理 （1）辐射定标：将DN值转成辐亮度 >open image >。。。。MTL.txt--->spectral--->Preprocessing--->Calibration Utilities--->Landsat Calibration--->（选择文件），OK--Radiance，（选择保存地址并命名），Ok （2）BSQ转成BIL Basic Tools-->Convert data （BSQ、BIL、BIP）-->-BIL，choose（选择保存地址并命名），Ok （3）Flaash大气校正 Spectral--->Preprocessing--->Calibration Utilities--->Flaash —> Mul....Setting-->kanf......--->Band7,Band3,ok-->save，choose（选择保存地址并命名），Apply 加载出真彩色图，并与原始影像作对比 质粒提取的原理、操作步骤、各溶液的作用 (2010-11-11 17:19:05) 转载▼ 分类：Biology 标签： 质粒 溶液 无水乙醇 大肠杆菌 杂谈 细菌质粒是一类双链、闭环的DNA，大小范围从1kb至200kb以上不等。各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份，通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态，但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上，随着染色体的复制而复制，并通过细胞分裂传递到后代。 质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子，重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA分子。目前已有许多方法可用于质粒DNA的提取，下面主要介绍碱裂解法提取质粒DNA的方法。 碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法，其基本原理为：当菌体在NaOH 和SDS溶液中裂解时，蛋白质与DNA发生变性，当加入中和液后，质粒DNA分子能够迅速复性，呈溶解状态，离心时留在上清中；蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状，离心时可沉淀下来。 纯化质粒DNA的方法通常是利用了质粒DNA相对较小及共价闭环两个性质。例如，氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心、离子交换层析、凝胶过滤层析、聚乙二醇分级沉淀等方法，但这些方法相对昂贵或费时。对于小量制备的质粒DNA，经过苯酚、氯仿抽提，RNA酶消化和乙醇沉淀等简单步骤去除残余蛋白质和RNA，所得纯化的质粒DNA已可满足细菌转化、DNA片段的分离和酶切、常规亚克隆及探针标记等要求，故在分子生物学实验室中常用。 碱裂解法：此方法适用于小量质粒DNA的提取，提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析。方法如下： 1、接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2ml LB培养基。 2、37℃振荡培养过夜。 3、取1.5ml菌体于Ep管，以4000rpm离心3min，弃上清液。 4、加0.lml溶液I（1％葡萄糖，50mM/L EDTA pH8.0，25mM/L Tris-HCl pH8.0）充分混合。 5、加入0.2ml溶液II（0.2 mM/L NaOH，1％SDS），轻轻翻转混匀，置于冰浴 5 min . 6、加入0.15m1预冷溶液III（5 mol/L KAc，pH4.8），轻轻翻转混匀，置于冰浴5 min . 提取上年数据的完整操作说明 一、关联任务定义 首次启动报表软件，需要对关联任务路径、对应数据库进行设置。保证相关报表中的提取上年数据、不同任务间数据转换等能够顺利提取。 1、选择【高级/参数设置/关联任务定义】菜单，弹出关联任务定义窗口； 2、择关联任务：将光标定位于要定义关联任务的编号后： （1）若所选的关联任务是在任务管理列表中有的任务，可单击按钮，选择“2011年度部门决算”，单击“确定”按钮，系统将根据任务标识寻找此关联任务； （2）若选择的关联任务不在任务列表中，请单击按钮，弹出浏览文件夹窗口，选择关联任务存放路径，系统将根据任务存放路径寻找关联任务。 3、选择的关联任务的信息如任务标识、任务名称、年度、任务类别、任务路径将自动加入到关联任务列表中。 选择关联任务的对应数据库：单击“对应数据库”下拉列表框选择提取数据是所对应的数据库，默认为同名数据库； 设置提取数据时的单位对应关系，默认为单位主代码相互对应。 二、封面代码提取 1、单击“录入”主菜单下的“封面代码提取”子菜单，弹出代码提取窗口； 2、选择来源任务：单击按钮选择来源任务的存储路径，选择代码信息 的来源任务； 3、选择代码提取的来源数据库，单击“提取”按钮； 4、在弹出选择单位窗口中选择要提取封面代码的单位，单击“确定”按钮进行代码的提取； 5、代码提取完毕后，系统会显示代码提取的结果，可将代码提取信息导出或打印。 6、提取完毕后，单击“关闭”按钮。 三、提取上年数据 1、单击“录入”主菜单下的“上年数据提取”子菜单，弹出上年数据提取窗口； 2、单击“选择单位”按钮，可选择要进行数据提取的单位； 3、单击“提取”按钮，即可进行数据的提取，数据提取完成后系统会提示“上年数提取完成，请检查数据正确性！” 四、批量运算 提取上年数据后，相关合计行均无数据，需要执行批量运算。 1、单击“录入”主菜单，在弹出的下拉菜单中选择“批量运算”，弹出数据运算对话框； 2、单击“选择单位”按钮，可以选择要执行数据运算的单位； 3、单击“运算”按钮，进行数据运算，运算完成后会有“数据运算完成”的提示信息。 五、与上年数据核对 以上步骤执行完毕，需要通过“与上年数据核对”来检查提取的数据是否正确。遥感影像中水面及水体信息提取方法的研究
质粒DNA提取方法与原理
GBSS MR数据提取解决方案说明书V2.1-全采(客户)
水体提取方法
系统数据提取管理办法
水体样本提取的方法
质粒抽提原理和详细操作步骤
水体DNA提取实验方法
遥感ENVI水体信息提取实验
质粒提取的原理、操作步骤、各溶液的作用
提取上年数据的完整操作说明