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pubmed检索攻略

pubmed检索攻略
pubmed检索攻略

第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述

有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。

我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。

尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:

https://www.wendangku.net/doc/e317149646.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。

俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢?

PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要

和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。

进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。

这是PubMed的核心部分。大部分工作,我们只要利用这"一框五键"(检索框,Limit键, Preview/Index键, History键,Clipboard键和Details 键)即可完成。

在主界面的左侧框(如左图),有:

· Journal Browser 期刊浏览

· MeS h Browser可以用它来分层流览MeSH表

· Single Citation Matcher输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。

· Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。

· Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。

· Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式)

3) Related Resources

· Order Docume nts可以使用户在当地得到文献的全文,但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我将在后面的有关章节中详述。

· Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系

统的链接。Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且还

有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。

· Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接,

MEDLINEplus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆

的网络节点。

· Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的

临床研究成果的发布。

利用左侧框的这些服务,我们不仅能够进行功能更加强大的检索,而且还能得到不少非常有用的服务。这些都将在后续章节中介绍。

总体而言,PubMed的界面相当简洁清晰,几乎是傻瓜式的。

然而傻瓜式的界面并不意味着傻瓜式的操作。我看到很多人用了几年的PubMed,还是只知道在检索框里输入一个关键字,然后按一下"Go"按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的情况,这样的操作就足以得到令人满意的信息,但对于另一半情况,就没有那么幸运了,要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的"无用"信息中,要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。

令人费解的是,很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间,却不愿花上几个小时的时间去认真研究一下PubMed。"君欲善其事,必先利其器", PubMed就好像一把功能强大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,如何把这把枪的功能发挥到及至。

在以后的章节中,我们将逐步深入地了解PubMed,相信通过这些章节的学习,我们可以真正熟练掌握PubMed,从而使自己的工作事半功倍。

第二章 PUBMED简单检索技巧

一.在这一章里,我们将对如何应用PUBMED这一得力助手检索文献,作

以简单介绍。

1.当你打开浏览器,在地址栏内键入

https://www.wendangku.net/doc/e317149646.html,/PubMed/或是https://www.wendangku.net/doc/e317149646.html,/后,

就进入了PUBMED检索系统主页,可以见到如下的页面。

2.在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。

在检索框中输入查询词,然后单击"go"按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面,你还可以选定所要检索内容的数据库范围,除NCBI的数据库以外,可供选择的还有:PROTEIN, STRUCTURE, POPSET等等。

说到这里,很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符然后回车一敲便可万事大吉,其实不然。每个人搜索效率的高低往往存在很大差别。在这里提供以下建议仅供读者参考:

? 明确你索要检索的关键概念及词语,即关键字;

? 考虑到关键字的类似说法,即有可能出现的同义词;

? 通过限定DATES, STUDY GROUP等,精炼你的检索范围;

? 多向有经验的人求教,因为不同的专业背景以及个人的差异,都有可能形成不同的方法和技巧。

3.通过布尔(BOOLEAN)运算来提高你的效率

最常用的三种布尔运算即是AND,OR,和NOT。

? AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所出现的位置在哪,只要他们都出现在索引文章的某一处,就将其列出。

? 而OR则是将出现至少一个关键词的文章列出,这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时,十分有效。

? NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去。但是在使用的时候要特别注意,会有可能将一些你所需要的文章漏掉。比如当你的检索词为LEAD POISONING NOT CHILDREN时,除了会删除掉那些仅讨论儿童的文章,同时也会删去那些同时讨论儿童及其他年龄组的文章。

4.PUBMED检索类型

通常我们所要查询的单词类型大致可以分为:

? 词语(主题)检索这时我们在PubMed主页的检索框中键入的是英文单词或短语(大写或小写均可)。然后回车或点击"Go", PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索,并将检索结果直接显示在主页下方。例如:键入"vitamin c common cold"后回车或点击"Go", PubMed开始检索并将检索结果显示出来。

? 著者检索当我们所要查询的是著作者时,在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写,格式为:"著者姓空格名字首字母缩写",例如smith ja,然后回车或点击Go,系统会自动到著者字段去检索,并显示检索结果。

? 刊名检索在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN 号,例如:molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524,然后回车或点击Go,系统将在刊名字段检索,并显示检索结果。

? 日期或日期范围检索可以在检索框中键入日期或日期范围,然后回车或点击Go,系统会按日期段检索,并将符合条件的记录予以显示。日期的录入格式为YYYY/MM/DD;如:1999/09/08

也可以不录月份和日子,如:2000或1999/12。

? 检索期刊子集(辑)检索的格式为:检索词AND jsubseta,如:neoplasm AND jsubseta。可供检索的期刊子库有3种:Abridged Index Medicus(有120种重要核心期刊)、Dental和Nursing。分别使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn进行限定。

? 检索带文摘的记录检索的格式为:检索词AND has abstract, 如:liver cancer AND has abstract。要注意的是在1975年前出版的文章,其

MEDLINE记录中没有文摘。

? 布尔逻辑检索 PubMed系统允许使用布尔逻辑检索,只要在检索框中键入布尔逻辑运算符(AND,OR或NOT)。具体使用时要注意的问题,详见上第3点所述。

5.如何处理检索结果

当你点击GO或回车后,PubMed将会自动运行检索命令,在屏幕的下方显示出符合检索要求的项目,并且在查询框内保留原检索词。此时要注意的是符合检索要求的项目是以SUMMARY(简要格式)显示出来的,就是列出作者,文章题目,以及文章来源的一些信息。

在DISPLAY键后还可以选择别的显示格式,点击DISPLAY键后,系统按所选格式全部检索结果。

如果只需要显示其中一部分记录,则需点击该记录左边的查询框,使标记后,再点击Display键;如果只需显示一条记录,则可直接点击该记录中的作者姓名超链接,系统会自动显示该记录的文摘格式。

还有一点,系统所设定的默认值为每页显示20条选项,这点可以在SHOW后的下拉菜单处选择。

如果选中所感兴趣的内容,即可进行保存,打印等等操作。PubMed 系统允许最多可保存5000条记录。要保存全部检索结果时,打开Summary下拉菜单选择其中一种格式,然后点击Save键;要保存特定记录时,点击记录左边的选择框予以标记后,再点击Save键。

使用浏览器的打印功能,即可把感兴趣的内容打印出来。系统允许每页最多显示500条记录。如果想打印成文本格式,请先点击Text键,然后再打印。

下一章我们将用几个实例来使大家熟悉以上检索技巧。

第三章 PUBMED简单检索实例

在上一章里,我们已经对如何用PUBMED来查询我们感兴趣问题的文献。在这一章,我们可以通过几个简单的实例来具体熟悉PUBMED的用法。

例一

1.明确所要检索的内容。如果我们要查询的问题是"维生素C对于普通感冒的防治作用"。首先我们应分析这一问题中的关键词语,主要由"维生素C",和"普通感冒"构成。即"VITAMIN C"和"COMMON COLD"。

2.分析所要检索的两个相关词语的关系。根据我们的日常生活经验,可以将两个关键词之间的关系定义为"AND",于是我们可以在检索框内键入

"VITAMIN C AND COMMON COLD".,然后点击"GO",进行检索。下面的画面即为经过上面检索过程后所得到的相关文章。

3.以上初步检索后所显示的结果都以默认的SUMMER格式显示出来,在经过对SUMMER的阅读后,我们可以进一步筛选文献的内容。如我们感兴趣的是第二、三、五篇的话,选中这几篇文献左侧的方框。如果我们想要同时看到这几篇的ABSTRACT,在DISPLAY键后的下拉菜单选择ABSTRACT,然后点击DISPLAY。即可看到所要结果。

例二

1.如果这一次我们想要查找的是与一个作者相关的文章,如这位作者的名字是Hemila h,则我们所要检索的内容就很明确了,是这位作者的名字Hemila h。

2.在检索框内输入Hemila h,点击GO键,屏幕上即会显示出与这位作者相关的文献。

3.在所列出的 39项文献内,我们如果想在一屏内看到所有的选项,可以在SHOW后面的下拉菜单内选择想要显示的数量,如50篇。

4.在PUBMED所检索到的文献里,我们对第 1篇很感兴趣,点击该篇文章左侧的方框,然后拉下Display键后的多选框,选择文献的显示类型,(如Abstract-摘要,Brief-提纲,Citation-引言等),一般情况下,以选择Abstract居多,这样一目了然。在确定好显示内容后,点击Display钮,即可阅读相关内容了。

5.在确定对检索到的内容感兴趣后,如果想把它保存下来,可以单击Save按键,如果想保存在剪贴板里,即可单击Clipboard,保存于剪贴板。点击"文件"菜单内的打印即可将该文打印出来。

上述是运用Pubmed进行简单检索的两个实例。如果经过上述的检索过程,仍然不能满足你的需要,我们可以进行较为复杂的高级检索。在以后的几章中,我们会详细介绍。

第四章 PUBMED高级检索技巧

在以上两章我们已经掌握了如何运用初级检索法达到检索文献的目的。不过在我们所要检索的问题相对较为复杂的时候,仅仅靠初级检索就远远达不到需求了。为了使得我们的检索更为准确,高效,我们可以充分利用PubMed所提供的高级检索功能。

在你进入PubMed首页之后,在检索框的下方,有PubMed所提供的五个重要的功能按钮,即Limits按钮, Preview/Index按钮, History按钮, Clipboard按钮,及Details按钮。如果你能够充分的利用好这几个功能按钮,那你的检索则很有可能事半功倍。

首先,让我们来简单的了解一下这几个按钮的主要功能。

1. Limits 按钮

当你单击Limits按钮后,你可以看到如下界面。(fig1)

在这里可以进行以下设定:

? 将搜索范围设定在一个特定的域。

? 将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。

? 也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型(如综述)。

? 设定只搜索包含摘要的文献。

? 设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。

? 设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库(如Abridged Index Medicus 或AIDS相关的条目)。

例如在All Fields域选择下拉菜单里,你可以把搜索词限定在一个特定的域,缺省设置是所有的域;打开下拉菜单就可以选择所需的域名了。又如"Only items with abstracts"指只检索那些有文摘的记录(1975年前出版的文章的记录中没有文摘)

2.Preview/Index 按钮

在按下Preview/Index按钮之后,我们可以进行的设定有:

? 在显示条目之前显示所查到的文献数。

? 随时通过增加查询单词来修改查询方案。

? 在特定的搜索域中向方案里加入查询词。

? 从Index中查看并选择词语来修改查询方案。

? 在你修改查询时查看方案。

Preview(预览) 使用此功能可以在显示条目之前显示所查到的文献数。使用时,在输入框中键入搜索词,然后单击Preview,PubMed返回的信息是条目的数量。

Index(索引)使用此功能,可以从特定域中选择以索引的单词,并把他们加入查询方案之中;可以查看某一个特定搜索域中词语列表;也可以使用布尔运算符来建立一个查询方案。

3.History 按钮

History (历史记录)历史记录中保存的是你所有的查询方案与查询结果,只有当你运行了一次查询之后,History中才有内容。History屏幕将会显示:你的查询方案、查询时间、查询到的文献数量。Preview显示的是历史记录中最近的三条记录,而使用History可以看到最近100次的查询结果。一旦查询数量超过100,PubMed会将最早的查询除去,加进最新的一次查询。如果两次查询内容相同,PubMed会将头一次的去除。

4.Clipboard 按钮

剪贴板可以帮助你保存或查看在一个或多个查询中选择的条目,然后就可以打印、保存、订购剪切板中的内容了。将条目左边的复选框选中,单击"Add to clipboard"就可以将其加入剪切板中。当点击 Clear History 可以将History中的所有内容清除。

剪切板中最大的储存数是500条。而放在剪切板中的内容如果在一小时内没有任何操作,将会自动消失。

5.Details 按钮

Details是用于帮助你查看PubMed的检索策略。即在提问框中键入的检索词被PubMed自动地转换成了那些词,并使用了什么样的检索规则和检索语法。此外,使用Details键可以对检索策略进行编辑,然后再一次检索。在PubMed Query框内显示的是PubMed实际使用的检索策略和语法。该框下有四个区域:Result区显示检索结果的记录总数,点击这个数字,可回到检索结果显示屏;Translation区显示检索词转换的详细情况;Database区显

示检索的数据库;User Query 区显示用户键入的检索词或检索式。

要对检索策略进行编辑可直接点击PubMed Query框中的检索策略,将其增加、删除或修改后点击Search键。

除了以上五个主要功能键以外,利用PubMed提供的其他一些功能,如MeSH 等,也可以在很大一部分程度上提高我们的检索效率。在以后的若干章里,我们将会以详尽的笔墨来系统的剖析这些功能用法。

第五章 PUBMED高级检索技巧实例

在我们对如何运用PubMed进行较为复杂的检索有了初步的了解后,我们来看几个应用性的实例。

例一现在让我们来查找一下有关于"锌对于儿童成长的作用"的文献。

步骤一,我们先来对这一话题进行初步的检索。我们确定了它的关键字应为"Zinc Infant Growth",把它输入查询框,按GO键进行检索。共有492篇相关文献。显然如果我们对这些文献一一打开逐项阅读,将是一项非常繁复的工作。这时我们就需要用高级检索的方法来减少工作量。

步骤二,如果我们所要检索的文献要求是反映比较新的动态进展,那么我们可以点击功能键Limits按钮.在其中的Publication Date的输入框内输入FROM"2000 01 01" TO"2002 01 01".("Entrez Date"指录入系统的日期;"Publication Date"指出版日期)

步骤三,如果我们进一步要求文章是用英文发表,且PubMed可以显示出Abstract的,我们可以依照上面的方法类推,在Languages下拉菜单内选择English,选中"Only items with abstracts"前的方框。然后点击GO键,开始检索。共有61篇,在当前页内显示出最新的20篇。(fig1)

其实,如果我们一开始就很明确所要检索的Limits限制,以上三步其实可以合成一步完成。在此仅仅是为了方便说明问题,我们将其分开描述。

例二还是查找有关于"锌对于儿童成长的作用"的文献。

如果当我们进行了很多检索(包括上述的例一检索)之后,我们发现在以前的检索步骤中还有想要翻看的检索的历史,首先我们可以点击Preview/Index按钮。这时屏幕上将会显示出我们检索过的内容。(fig2)使用History可以看到最近100次的查询结果,而Preview显示的是历史记录中最近的三条记录。

其次,输入我们想要看的以前那次检索过的检索字,如"Zinc Infant Growth",点击Preview按键,屏幕上则会显示出以前检索过"Zinc Infant Growth"的记录。

如果我们要进一步修改查询方案,可以在检索框内加入另外的单词,如"iron"等,点击Preview。依此方法我们可以继续加入另外的词语,点击Preview直到你希望得到的内容。使用这种功能可以帮助你看到以前的搜索方案与查询结果的数量。

以上的两个简单实例,说明了如何应用PubMed所提供的强大功能按钮来提高我们的检索效率。其实在实际应用中还有很多技巧有待于我们去探索,希望笔者的介绍能起到抛砖引玉的作用,帮助你在PubMed的海洋里自在地畅游。

第六章谈MeSH Browser(医学主题词浏览器)

何为MeSH?

MeSH其实是Medical Subject Headings的缩略词,即医学主题词,是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。NIH的工作人员按MeSH词表规定,浏览生物医学期刊全文后标引出每篇文献中的MeSH主题词,其中论述文献中心的主题词称主要主题词(major topic headings),论述主题某一方面的内容的词称为副主题词。

那么为什么要使用医学主题词呢?

我们先来看个比喻,如果有人问你感冒了吗?你会不会回答"没有啦,我只是有点着凉发烧而已"呢?当然不会,因为你知道感冒就是着凉发烧。但一个检索系统,如果你不告诉它的话,它就有可能不知道这一点。在期刊中,对于同一个概念往往可能有不同的描述形式,如Tumor和Neoplasm都是指肿瘤。当一个查询者希望查阅肿瘤和diet(饮食)相关的文献时,他可能会输入Tumor,也可能输入Neoplasm作为关键字,但其实这两者之间是没有区别的。一个愚蠢的检索系统可能就认识不到这点,而像PubMed这样的"智能化"检索系统就能够准确的意识到这点,从而不会造成检索结果的遗漏。

如何使用

如果你希望使用医学主题词进行检索,可以从PubMed首页上点击PubMed Services下方的MeSH Browser即可进入以下界面。

举例说明,如果你想要检索Neoplasms和bone的相关文献,首先在MeSH Browser的检索框内输入检索词Neoplasms,然后点击Browse按钮,系统显示其定义及在树状等级结构中的位置,如下图。

如果需要的话,你可以选择Detailed display,如同所示:

在这里,检索系统将显示详细的内容,可选择特定的副主题词,也可进行主要主题词或单个主题词检索,其选项如下:

(1)Add the search to the following subheadings:点击副主题词前的方框,表示选中该副主题词,可连续选择多个词,它们之间的逻辑关系为OR。

(2)Restrict Search to Major Topic headings only:若将检出结果限定在主要主题词(Major Topic Heading)则可提高查准率。

(3)Do Not Explode this term:系统要检索某一主题词时,会自动扩展检索(Explode),即将该主题词的下位词一并检出。如果只需检索单个主题词,可点击此按钮。

完成上述选项后,点击"Add"按钮,稍后在下一屏Current Query的方框中将显示所选的主题词。

然后,我们再在MeSH浏览器内输入bone, 按检索按钮,系统会告诉

你bone不是一个主题词,但它会自动将其转换成主题词Bone and Bones, 同样,其下方也会显示出其定义及在树状等级结构中的位置。你一样可以选择Detailed display以便进行更为精细的选择,选择完成后,点击"Add"按钮,则进入下面的界面。这时,你只需点击PubMed Search按钮即开始检索,查询出用这两个主题词为关键字以及所选择的相应逻辑关系的文献检索结果。

总而言之,主题词检索法虽然稍嫌繁琐,但其检索结果的准确性高,遗漏率低,是最佳的检索方法,一旦熟练掌握,将使得我们的检索工作事半功倍。

新版Pubmed检索攻略

新版Pubmed检索攻略 ——日读一帖,解螺旋大V团队伴你科研路 【科研热点】让你时间比别人花的少、知道的比他早!【基金专栏】国自然等各项基金独到经验见解【SCI 专栏】从开始到接收全程tips【实验技能】这么棒快告诉你老板!关注我们,为您的科研路提速 第一章PubMed概述 笔者最近接到很多同学的微信,说希望看到pubmed的搜索教程,然后就在网上进行了检索,发现网上的教程都是老版的pubmed,比如还有limit按钮等等,其实pubmed改版之后已经变得更加简洁,就行百度搜索框一样,只有一个框和go。而以前的5个功能按钮早早已经删除,在你搜索结果中才可以显示,在我们搜索的左侧。那么下面我们就开始学习学习pubmed的搜索技巧吧! 我看到很多人用了几年的PubMed,还是只知道在检索框里输入一个关键字,然后按一下'Go'按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的情况,这样的操作就足以得到令人满意的信息,但对于另一半情况,就没有那么幸运了,要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的'无用'信息中,要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。 令人费解的是,很多医务工作者宁可在每次检索时都花

上成倍的时间,却不愿花上几个小时的时间去认真研究PubMed。'君欲善其事,必先利其器',PubMed就好像一 把功能强大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,如何把这把枪的功能发挥到及至。 在以后的章节中,我们将逐步深入地了解PubMed,相信通过这些章节的学习,我们可以真正熟练掌握PubMed,从而使自己的工作事半功倍。 第二章PUBMED简单检索技巧 一.在这一章里,我们将对如何应用PUBMED这一得力助手检索文献,作以简单介绍。 1.直接检索。当你打开浏览器,在地址栏内键入 https://www.wendangku.net/doc/e317149646.html,/PubMed/ 或是百度pubmed,就进入了PUBMED检索系统主页。在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。这就是改版之后的pubmed,是不是非常简洁?在检索框中输入查询词,然后单击'go'按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面,你还可以选定所要检索内容的数据库范围,除NCBI的数据库以外,可供选择的还有:PROTEIN、STRUCTURE、POPSET等等。 说到这里,很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符

NCBI之PubMed完全攻略

PubMed完全攻略 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:https://www.wendangku.net/doc/e317149646.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed 的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。 进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。

PubMed检索原理及途径

PubMed检索原理及途径 1. 检索原理 PubMed具有自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)。对于输入检索框中的检索词,将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换,然后再进行检索。其顺序是:MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。此外,还可进行短语检索,即将短语作为一个词组进行检索,可用双引号将其引起,此时系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。 2. 检索途径 ⑴基本检索 PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏,此外,其左侧栏还提供了几种检索功能:Journals Database , MeSH Database , Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Special Queries, LinkOut, My NCBI (Cubby)。在提问框输入自由词或检索表达式(可直接进行字段限定),点击go 即可进行自由词检索。同样可结合辅助工具栏按钮,进一步检索。 Limits:限定检索。PubMed限制内容较多,可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Entrez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。 History:检索历史。可自动将检索式及结果数量记录到History屏,结合#号进一步检索。#号间可以用布尔逻辑符组佩检索,如#1 AND #2。 例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placenta growth)和氧气(oxygen)的英文文献 步骤:PubMed主页→点击limits,限定时间2004;语种为English→页面最下端点击go,在检索词输入框中,输入placenta gr owth AND oxygen→点击go→得到检索结果。 ⑵主题词检索 点击主页左侧栏MeSH Database,或从上面数据库PubMed下拉菜单中选中MeSH, 即可进入MESH检索界面。 输入提问词,点击go。如不是MeSH词,系统则提供相关概念供选择。 选择出现的MeSH词,可察看下面对该MeSH词的注释。 点击该主题词进入副主题词选择,选中需要的副主题词,也可点击进行加权、不扩展检索。 然后从屏幕上方或下方的display行Send to框的下拉菜单中选择发送地方及组配方式,如要检索,发送到Search Box中,在Search Box中将显示检索表达式,可进行修改和继续添加。 最后点击Search PubMed进行检索。

PubMed检索完全攻略----好东西_吐血狂顶!

PubMed检索完全攻略----好东西,吐血狂顶! 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入: https://www.wendangku.net/doc/e317149646.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与

PubMed 文献检索完全攻略

PubMed检索完全攻略 第一章 进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入: https://www.wendangku.net/doc/e317149646.html,/pubmed/ 就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这

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第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入: https://www.wendangku.net/doc/e317149646.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和

部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed 挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。 进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。 这是PubMed的核心部分。大部分工作,我们只要利用这"一框五键"(检索框,Limit键, Preview/Index键, History键,Clipboard键和Details键)即可完成。 在主界面的左侧框(如左图),有: · Journal Browser 期刊浏览 · MeS h Browser可以用它来分层流览MeSH表 · Single Citation Matcher输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。 · Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。 · Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。 · Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式) 3) Related Resources · Order Docume nts可以使用户在当地得到文献的全文,但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我将在后面的有关章节中详述。 · Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系

PubMed检索完全攻略----好东西,值得分享!

PubMed检索完全攻略----好东西,值得分享! 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:https://www.wendangku.net/doc/e317149646.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家

生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH )的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed 前都感谢NCBI 呢? PubMed 覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed 挂钩的出版商会自动向PubMed 提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed ,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed 提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed 上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。 进入PubMed 的主界面后, 首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。 这是PubMed 的核心部分。大部分工作,我们只要利用这"一框五键"(检索框,Limit 键, Preview/Index 键, History 键,Clipboard 键和Details 键)即可完成。 在主界面的左侧框(如左图),有: · Journal Browser 期刊浏览 · MeSh Browser 可以用它来分层流览MeSH 表 · Single Citation Matcher 输入期刊的信息可以找到某 单篇的文献或整个期刊的内容。 · Batch Citution Matcher 用一种特定的形式输入期刊 的信息一次搜索多篇文献。 · Clinical Queries 这一部分为临床医生设置,通过过 滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、 病原学与预后。 · Old PubMed (使用旧式的PubMed 查询方式) 3) Related Resources · Order Documents 可以使用户在当地得到文献的全 文, 但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我 将在后面的有关章节中详述。

PubMed完全攻略

文献首页生物动态实验方法软件应用生物信息产业信息其他文档七嘴八舌软件下载 PubMed完全攻略(一) 作者:佚名整理时间:2005-08-19 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:https://www.wendangku.net/doc/e317149646.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed 所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。 进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。

PUBMED检索

?主题词(Mesh Heading),又称叙词Descriptor,从信息内容中抽取出来的、能表达信息实质内容的规范化专业名词或术语?款目词,又称入口词,entry word,主题词的同义词或近义词?副主题词(Subheading), 又称为限定词(Qualifiers), 对主题词进一步限定的规范化用词 ?缩小检索范围,获取最专指的文献 ?举例:茶碱治疗哮喘 ?哮喘 asthma(指"asthma"[MeSH Terms] OR asthma[Text Word])99696 asthma[mesh](指"asthma"[MeSH Terms] )81824 ?哮喘的药物治疗 asthma/drug therapy19695 ?茶碱(theophylline)治疗哮喘(2352) theophylline/TU7366 Medline:是PubMed的主体部分。[PubMed--Indexed for MEDLINE]。 OldMedline:含1950-1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录中没有MeSH字段和摘要字段,记录的标记是[PubMed - OLDMEDLINE for Pre1966]。 PreMedline:是Medline的前期数据库,收录的是那些正在等待标引的文献,其作用在于缩短文献报道时差。[PubMed--in Process] Publisher-Supplied Citations:出版商提供的电子期刊中有一些属于

选择性收录期刊。[PubMed - as supplied by publisher] PubMed主页上提供与NCBI的7个数据库建立了超链接Nucleotide:DNA序列数据库 Protein:氨基酸(蛋白质)序列数据库 Genome:基因组序列数据库 Structure:分子结构模型数据库 Popset:种群、种系发生或突变序列数据库 Taxonomy:生物分类数据库 OMIM:人类孟德尔遗传学在线数据库 Books:相关图书 注:在检索提问框内输入的检索词若不用字段限定,系统依次到下列3个表中进行词语的核对、转换和检索:①MeSH转换表(MeSH Translation Table)、②刊名转换表(Journals Translation Table)、③著者索引(Author Index)。如果在MeSH转换表中找到了相匹配的检索词,系统用MeSH词和Text Word词(TI、AB、MH、NM、PS、OT等字段中的词)一起进行检索。如果在MeSH转换表中未找到匹配的检索词,系统接着到刊名转换表和著者索引中搜词检索。如果在上述3个表中都找不到匹配的短语,系统将短语拆小,继续到这3个表中搜索,短语断开部分的逻辑关系是AND。如果拆到单词在以上3个表中还是找不到匹配词,将到所有字段中去搜索这些单词,单词之间的逻辑关系也是AND。 作者检索Smith j模糊(Smith JD/JR/J等)

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PubMed 检索系统 PubMed 检索系统 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆 (U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。 PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据,这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明,并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送,但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围,将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代,例如在综合性的科学杂志(Science或Nature)上发表的地理学文章等。 PubMed 系统的主要特点 PubMed 检索 Details 键的用法 存储检索策略--URL 键的用法 特征栏(Feature Bar)介绍 检索结果的显示、存盘、打印 PubMed 详解 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping)在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。 (1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词(题名词和文摘词)进行检索。例如:键入“Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 (2)刊名转换表(Journal Tanslation Table),包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦 注:在本文中的叙述中,所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来,如以基因治疗为主题词检索,在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。 PubMed简介 PubMed是由隶属于美国国家卫生部(NIH, National Institues of Health)的国家医学图书馆(NLM, Nationa Library of Medicine)下属的国家生物技术信息中心(NCBI, National Center for Biotechnology Information)提供,可通过NCBI网站的Entrez检索系统(Entrez retrieval system)进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。此外,PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务,与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据,提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA 与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统,可检索NCBI网站的主要数据库,如PubMed,核酸与蛋白序列,基因组序列,蛋白结构,OMIM等等。PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库,此外,它还针对网上资源,提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源,如核酸蛋白序列、OMIM入口等,以及其它生命科学数据库。其文献内容的提供方式,由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。如果该出版商有网站,则NCBI会提供相应的网络出口。MEDLINE 及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。 PubMed服务内容概括 基于互联网WWW的MEDLINE及PreMEDLINE引文数据库免费检索系统。 提供MEDLINE、PreMEDLINE与其他相关数据库接入服务,如NCBI的其它数据库DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线,及NCBI外的其它数据库。 提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆(U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及临床医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。 随着国内互联网的普及,网络已逐步地成为一名医务工作者获取多种信息的有效渠道。网络已成为医学研究者追踪国际研究进展,了解世界先进水平的一个重要手段。 传统的医学文献检索(MEDLINE)尽管在本地局域网提供的情况下,具有高速的特点。但与互联网

PubMed检索步骤

PubMed检索步骤 1、PUBMED 词汇自动转换功能:例如:在键入“Vitamin c",点击"Go",再点击"Details"显示("ascorbic acid"[MeSH Terms] OR vitamin c[Text Word]),看一下主题词是什么?所用词汇是否合适?然后点击“Preview/Index”显示你所用的检索词、检中的篇数、所用时间。也可点击“limit"进行检索。检索时可以使用通配符"*"进行截词检索或用双引号进行强制检索词检索。 2、著者强制检索:作者用双引号括起来"zhang y" [au];比较一下分别输入zhang yun ;yun zhang,zhang y; zhang y [au];"zhang y" [au] 检索结果的区别。 3、刊名检索:可用刊名全称或缩写、ISSN号,再加上刊名子段限定符,如:输入J Tradit Chin Med [ta] ,然后敲回车或点击Go,系统将在刊名子段中检索,并显示检索结果。点击“History”可以查看检索历史。 4、布尔逻辑检索:系统允许使用布尔逻辑检索,布尔逻辑运算符要大写(AND、OR或NOT)。 5、剪贴板:使用"send to Clipboard",可把检索结果存入剪贴板,剪贴板最多可存放500条记录。只要剪贴板中有记录,就可点击Clipboard查看其中的记录(记录为summary格式),粘贴板按记录存放的先后顺序显示记录题录。 6、当前页显示篇数默认为20篇,如果需要可调整当前页的篇数“5、10、20、50、100、200、500”篇。检索结果默认summary格式(题录格式),可以选择display下拉菜单中的Abstract(文摘),以文摘格式显示。 (一)基本检索 1. 检索2000年以来收录我院孙保亮老师作为第一作者的论文数量 2.检索PubMed收录山东大学姓王的作者所有的文献 3. 字段限制检索:检索作者Jone W Smith发表的论文标题中含癌症治疗方面的文献。 提示:smith jw[AU] AND (cancer[TI] OR tumor[TI] OR neoplasms[TI] ) AND (treatment[TI] OR therapy[TI]) 4. 利用PubMed检索检索作者 Bishop B近5年来发表在J Biol Chem 期刊上的文献。请写出检索步骤。 5. 检索期刊N Engl J Med的全称,并通过济南泉方网站或Medsci网站查到2012年SCI的影响因子。 6.自己的名字在英文杂志上的书写格式? 7. 利用PubMed检索J Allergy Clin Immunol期刊近五年来非综述性文献。 8. 检索PubMed收录《中华内科杂志》(zhonghua nei ke za zhi)的论文有多少篇? 9.请利用PubMed检索2008年11月以来发表在BMC Public Health上的文献中,由Free full article免费全文文献有几条?请写出以Ahonkhai VI为最后一名作者的文献篇名。 10. 德国科学家哈拉尔德?楚尔?豪森(Harald zur Hausen)因发现导致宫颈癌的HPV(人乳头状瘤病毒)而获得2008年诺贝尔生理学或医学奖。请利用PubMed 回答该作者2008年是否发表了有关HPV的文章?如有,请写出该文的出处。

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PubMed检索系统简介 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆(U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。 PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据,这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明,并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送,但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围,将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代,例如在综合性的科学杂志(Science 或Nature)上发表的地理学文章等。 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping) 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。 (1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord 词(题名词和文摘词)进行检索。例如:键入“Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 (2)刊名转换表(Journal Tanslation Table),包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN 号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如:在检索提问框中键入:“new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。 (3)短语表(Phrase list)。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS: Unified Medical Language System)和补充概念(物质)名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词,就会查找短词表。 (4)著者索引(Author Index)。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语,PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词,PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程,直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词,单个词会被联一起(用AND)在全部字段中检索。 如:"single cell",系统就会自动将其分成两个词:“single“和“cell”检索,其检索表达式为:“single AND cell”。要查验检索词的转换情况,可点击“Details”键。

PubMed使用方法

PubMed检索完全攻略(1) 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed= Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:https://www.wendangku.net/doc/e317149646.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物

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