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MOPS电泳缓冲粉剂(10×)

MOPS电泳缓冲粉剂(10×)

北京雷根生物技术有限公司 https://www.wendangku.net/doc/fe7426270.html,

MOPS 电泳缓冲粉剂(10×)

简介:

3-(N-吗啉基)丙磺酸简称MOPS ,分子式为C 7H 15NO 4S ,分子量为209.26,CAS 号为1132-61-2。MOPS 属于生物缓冲剂,经常用于配制RNA 电泳缓冲液。

Leagene MOPS 电泳缓冲粉剂(10×)由MOPS 、乙酸钠、EDTA 组成, 未经RNase free 处理,主要用于RNA 电泳。

组成:

操作步骤(仅供参考):

1、 溶解于DEPC 处理水并补加DEPC 处理水至1L ,即为MOPS 电泳缓冲液(10×)。

2、 用DEPC 处理水稀释到1×后使用。

注意事项:

1、 如果每次的使用量很小,可以适当分装后再使用。

2、 配制的缓冲液见光后易变黄,淡黄色完全可以使用,颜色过深后不宜使用。

3、 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

有效期: 24个月有效。

相关:

编号 名称 NA0013 Storage MOPS 电泳缓冲粉剂(10×) 1L RT 使用说明书 1份 编号 名称 CC0130 胰蛋白酶-EDTA 溶液(0.25%:0.02%) NA0034

Tris-硼酸电泳缓冲液(5×TBE) PE0080

Tris-HCl 缓冲液(1mol/L,pH6.8) PE0092

Tris-甘氨酸电泳缓冲液(5×) PW0040

Western blot 一抗稀释液 TC1167 尿素(Urea)检测试剂盒(脲酶波氏比色法)

生物实验常用缓冲液和酶的配制

实验室常用技术参数资料 一、核酸及蛋白质常用数据 1.核苷三磷酸的物理常数 2.常用核酸的长度与分子量

3.常用核酸蛋白换算数据(1)重量换算 1μg=10-6g1pg=10-12g 1ng=10-9g 1fg=10-15g (2)分光光度换算: 1A260双链DNA=50μg/ml 1A260单链DNA=30μg/ml 1A260单链RNA=40μg/ml (3)DNA摩尔换算: 1μg 100bp DNA=1.52pmol=3.03pmol末端 1μg pBR322 DNA=0.36pmol 1pmol 1000bp DNA=0.66μg 1pmol pBR322=2.8μg 1kb双链DNA(钠盐)=6.6×105道尔顿 1kb单链DNA(钠盐)=3.3×105道尔顿 1kb单链RNA(钠盐)=3.4×105道尔顿 (4)蛋白摩尔换算: 100pmol分子量100,000蛋白质=10μg 100pmol分子量50,000蛋白质=5μg

100pmol分子量10,000蛋白质=1μg 氨基酸的平均分子量=126.7道尔顿 (5)蛋白质/DNA换算: 1kb DNA=333 个氨基酸编码容量=3.7×104MW蛋白质 10,000MW蛋白质=270bp DNA 30,000MW蛋白质=810bp DNA 50,000MW蛋白质=1.35kb 100,000MW蛋白质=2.7kb DNA 4.常用蛋白质分子量标准参照物

5.常用DNA分子量标准参照物 续上表

二、常用缓冲液 1.分子克隆常用缓冲液 2.磷酸缓冲液 (1)25℃下0.1mol/L磷酸钾缓冲液的配制※

5.缓冲液离子强度对电泳速度的影响

缓冲液离子强度对电泳速度的影响 目标:⒈阐述电泳的基本原理及注意事项。 ⒉初步掌握电泳技术(以血清蛋白醋酸纤维薄膜电泳为例)。 ⒊观察并比较不同缓冲液离子强度对电泳速度的影响。 实验用品:电泳仪,电泳槽,醋酸纤维薄膜(2×8cm),点样器(X胶片),滤纸,无齿小镊子,pH8.6(I0.06和0.03)的巴比妥缓冲液等。 试剂:1、I0.06pH8.6的巴比妥缓冲液: 巴比妥钠12.76g 巴比妥 1.66g 蒸馏水1000ml 2、I0.03pH8.6的巴比妥缓冲液: 巴比妥钠 6.38 巴比妥0.83 蒸馏水1000ml 或用I0.06pH8.6的巴比妥缓冲液加蒸馏水稀释一倍即成。 3、氨基黑10B染色液: 氨基黑10B0.5g 冰醋酸10ml 乙醇50ml 蒸馏水40ml 4、漂洗液: 乙醇45ml 冰醋酸 5.0ml 蒸馏水50ml 实验原理: 由于血清中各种蛋白质等电点(pI)不同,所以在同一PH8.6缓冲液中电离程度不同,因而带电荷的多少不同。再则不同蛋白质其分子大小、形状等差异,把它放入同一电场中其电泳的迁移率(是指带电颗粒在单位电场强度下的电泳速度)不同而分离。蛋白质分子大而带电荷少的移动速度慢,如此将血清蛋白从正极到负极依次分为A、α1、α2、β、γ五个区带,经染色、漂洗、脱色,然后计算各蛋白质区带的迁移率,得出电泳缓冲液离子强度对电泳速度是如何影响的。 操作步骤: 1.一般电泳装置:示教 2.电泳操作: ①酸纤维薄膜的准备:在距一端1.5cm处用铅笔画一条细线,然后浸泡于I0.06PH8.6的巴比

妥缓冲液或I0.03PH8.6的巴比妥缓冲液中约20min。 ②取出,用滤纸吸走多余的缓冲液。 ③用点样器蘸取血样点于薄膜上。 ④将点好样的薄膜置于电泳槽上,点样面朝下,点样端置电场中的负极。 ⑤电泳:电压110~160V、时间35~40分钟。 ⑥染色:氨基黑10B或丽春红S染液染色2~3分钟。 ⑦漂洗:3~4次,背景变白,图象清晰。 结果观察与分析: 1.比较用I=0.03和I=0.06的缓冲液进行电泳时的结果,观察图形,判断用哪种离子强度好。 2.利用所记录的电泳电压(V),支持物有效长度(CM),电泳时间(S)和清蛋白移动距离(CM),分别计算用离子强度0.03和0.06的清蛋白迁移率,判断离子强度对电泳速度的影响。 ※迁移率(μ)是指带电颗粒在单位电场强度下的电泳速度(V)。 即:μ=V/E,∵V=d/t (cm/S)(t—时间d—移动距离cm) E=U/L(V/cm) (U—电压L—支持物有效长度) ∴μ=V/E=(d/t)/(U/L)=dL/Ut (cm2/vs) 结论:

常见缓冲液的配方

一.常用贮液与溶液 1mol/L亚精胺(Spermidine): 溶解2.55g亚精胺于足量的水中,使终体积为10ml。分装成小份贮存于-20℃。 1mol/L精胺(Spermine):溶解3.48g精胺于足量的水中,使终体积为10ml。分装成小份贮存于-20℃。 10mol/L乙酸胺(ammonium acetate):将77.1g乙酸胺溶解于水中,加水定容至1L后,用0.22um孔径的滤膜过滤除菌。 10mg/ml牛血清蛋白(BSA):加100mg的牛血清蛋白(组分V或分子生物学试剂级,无DNA酶)于9.5ml水中(为减少变性, 须将蛋白加入水中,而不是将水加入蛋白),盖好盖后,轻轻摇动,直至牛血清蛋白完全溶解为止。不要涡旋混合。加水定容到10ml,然后分装成小份贮存于-20℃。 1mol/L二硫苏糖醇(DTT):在二硫苏糖醇5g的原装瓶中加32.4ml水,分成小份贮存于-20℃。或转移100mg的二硫苏糖醇至微量离心管,加0.65ml的水配制成1mol/L二硫苏糖醇溶液。 8mol/L乙酸钾(potassium acetate):溶解78.5g乙酸钾于足量的水中,加水定容到100ml。 1mol/L氯化钾(KCl):溶解7.46g氯化钾于足量的水中,加水定容到100ml。3mol/L乙酸钠(sodium acetate):溶解40.8g的三水乙酸钠于约90ml水中,用冰乙酸调溶液的pH至5.2,再加水定容到100ml。 0.5mol/L EDTA:配制等摩尔的Na2EDTA和NaOH溶液(0.5mol/L),混合后形成EDTA的三钠盐。或称取186.1g的Na2EDTA?2H2O和20g的NaOH,

生物化学常用缓冲液

生物化学常用缓冲液 (一)基本概念 ⑴ Bronsted-Lowry酸碱理论(酸碱质子理论): 1923年由丹麦化学家J.N.Brφnsted和英国化学家T.M.Lowry同时提出了酸碱质子学说,认为凡能释放质子的分子或离子(如:H2O,HCl,NH4+,HSO4- 等)称为酸,凡能接受质子的分子或离子(如:H2O,NH3,Cl-等)称为碱。因此,一种酸释放质子后即成为碱,称为该酸的共轭碱,同样一种碱与质子结合后,形成对应的酸,称为该碱的共轭酸。 如盐酸在水中的解离: HCl Cl- +H+ HCl是酸,Cl-是它的共轭碱。 pH = pKa+log{[质子受体]/[质子供体]} ⑵缓冲体系的设计: 1960年,N.E.Good和他的同事们提出,适合生命科学研究使用的缓冲体系应具有以下特性: ① pKa值在6-8之间; ②在水中的溶解度高; ③不易穿透生物膜; ④盐效应小; ⑤离子浓度、溶液组成和温度对解离的影响小; ⑥不与金属离子生成复合物或沉淀; ⑦该缓冲剂化学稳定; ⑧紫外和可见光波长范围内光吸收小; ⑨易制得高纯度的盐。 (二)生物化学常用缓冲液 ⑴磷酸盐缓冲液: 磷酸盐是生物化学研究中使用最广泛的一种缓冲剂,由於它们是二级

解离,有二个pKa值,所以用它们配制的缓冲液,pH范围最宽: NaH2PO4: pKa1=2.12, pKa2=7.21 Na2HPO4: pKa1=7.21, pKa2=12.32 配酸性缓冲液:用NaH2PO4,pH=1-4, 配中性缓冲液:用混合的两种磷酸盐,pH=6-8, 配碱性缓冲液:用Na2HPO4,pH=10-12。 用钾盐比钠盐好,因为低温时钠盐难溶,钾盐易溶,但若配制SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳的缓冲液时,只能用磷酸钠而不能用磷酸钾,因为SDS(十二烷基硫酸钠)会与钾盐生成难溶的十二烷基硫酸钾。 磷酸盐缓冲液的优点为: ①容易配制成各种浓度的缓冲液; ②适用的pH范围宽; ③pH受温度的影响小; ④缓冲液稀释后pH变化小,如稀释十倍后pH的变化小于0.1。 其缺点为: ①易与常见的钙Ca++离子、镁Mg++离子以及重金属离子缔合生成沉淀; ②会抑制某些生物化学过程,如对某些酶的催化作用会产生某种程度的抑制作用。 ⑵ Tris(三羟甲基氨基甲烷)缓冲液: Tris缓冲液在生物化学研究中使用的越来越多,有超过磷酸盐缓冲液的趋势,如在SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳中已都使用Tris缓冲液,而很少再用磷酸盐。 Tris缓冲液的常用有效pH范围是在“中性”范围,例如: Tris-HCl缓冲液: pH=7.5-8.5 Tris-磷酸盐缓冲液: pH=5.0-9.0 Tris-HCl缓冲液的优点是: ①因为Tris的碱性较强,所以可以只用这一种缓冲体系配制pH范围由

DNA电泳相关试剂及缓冲液的配制

DNA 电泳相关试剂及缓冲液的配制

1. 0.5M EDTA(pH=8.0):在800ml 蒸馏水中加入186.1g 二水乙二胺四乙酸钠(EDTA-Na 2·2H 2O),充分搅拌,这时溶液为乳白色,加NaOH 调解pH 值至8.0,这时溶液颜色逐渐变为澄清。最后 定容至1L 。高压灭菌。 2. 5 X TBE:Tris 碱54g;硼酸27.5g;20ml0.5M EDTA(pH=8.0),加蒸馏水定容至1L 。高压灭菌。(不过我在实验中没有灭菌,实验结果影响不大)。1 X TBE:5 X TBE 缓冲液与蒸馏水按 1: 4 稀释就OK 。 配置方法方法1:1%的溴酚蓝 将托盘天平上称取1g 溴酚蓝定溶于100ml 无水乙醇中,转移入 滴瓶中,贴标签备用。 方法2:0.05% 的溴酚蓝 配western blot 用的2*SDS 上样缓冲液需要用到0.1% 的溴酚蓝,

2-DE中溴酚蓝一般也是配成0.1%母液。实际上,溴酚蓝在水中的溶解度不高,直接将0.1g溴酚蓝溶于100ml水是有困难的。下面是其较合适的配制方法: 0.05%的溴酚蓝配制方法:取溴酚蓝0.1g,加0.05mol/L氢氧化钠溶液3.0ml使溶解,再加水稀释至200ml,即得。变色范围pH2.8~4.6(黄→蓝绿)。只是不知道加入NaOH会不会影响2-DE实验。估计影响不大,因为指示剂用量毕竟很少。 方法3:1%溴酚蓝 加1g水溶性钠型溴酚蓝于100ml水中,搅拌或涡旋混合直到完全溶解。溴酚蓝其钠盐易溶解在水里。 相关词条 甲醇、乙醇、苯、有机化学、氢氧化钠 Western上样缓冲液配制整理

缓冲液的配制方法

核酸电泳相关试剂、缓冲液的配制方法 50×TAE Buffer (pH8.5) 组份浓度 2 M Tris-醋酸,100 mM EDTA 配制量 1 L 配制方法 3.加入57.1 ml的乙酸,充分搅拌。 4.加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。 10×TBE Buffer (pH8.3) 组份浓度 890 mM Tris-硼酸,20 mM EDTA 配制量 1 L 配制方法 3.加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。 10×MOPS(3-吗啉基丙磺酸)Buffer 组份浓度 200 rnM MOPS,20 mM NaOAc,10 mM EDTA 配制量 1 L 配制方法 1.称41.8 g MOPS,置于1 L烧杯中。 2.加约700 ml DEPC处理水,搅拌溶解。 3.使用2 N NaOH调节pH值至7.0。 6.用0.45 m滤膜过滤除去杂质。 7.室温避光保存。 注:溶液见光或高温灭菌后会变黄。变黄时也可使用,但变黑时不要使用。 溴乙锭 (10 mg/ml) 组份浓度 10 mg/ml溴乙锭 配制量 100 ml 配制方法 1.称量1 g溴乙锭,加入到100 ml容器中。 2.加入去离子水100 ml,充分搅拌数h完全溶解溴乙锭。 3.将溶液转移至棕色瓶中,室温避光保存。 4.溴乙锭的工作浓度为0.5 g/ml。

注意:溴乙锭是一种致癌物质,必须小心操作。 Agarose凝胶 配制方法 1.配制适量的电泳及制胶用的缓冲液(通常是0.5×TBE或1×TAE)。 2.根椐制胶量及凝胶浓度,准确称量琼脂糖粉,加入适当的锥形瓶中。 3.加入一定量的电泳缓冲液(总液体量不宜超过锥形瓶的50%容量)。 注:用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须统一。 4.在锥形瓶的瓶封上保鲜膜,并在膜上扎些小孔,然后在微波炉中 加热熔化琼脂糖。加热过程中,当溶液沸腾后,请戴上防热手套。 小心摇动锥形瓶。使琼脂糖充分均匀熔化。此操作重复数次,直 至琼脂糖完全熔化。必须注意,在微波炉中加热时间不宜过长, 每次当溶液起泡沸腾时停止加热,否则会引起溶液过热暴沸,造 成琼脂糖凝胶浓度不准,也会损坏微波炉。熔化琼脂糖时,必须 保证琼脂糖充分完全熔化,否则,会造成电泳图像模糊不清。 5.使溶液冷却至60℃左右,如需要可在此时加入溴乙锭溶液(终浓 度0.5 μg/ml)。并充分混匀。 注:溴乙锭是一种致癌物质。使用含有溴乙锭的溶液时,请戴好手套。 6.将琼脂糖溶液倒入制胶模中,然后在适当位置处插上梳子。凝胶 厚度一般在3~5 min之间。 7.在室温下使胶凝固(大约30 min~1 h),然后放置于电泳槽中进行电泳。 注:凝胶不立即使用时,请用保鲜膜将凝胶包好后在4℃下保存, 一般可保存2~5天。 琼脂糖凝胶浓度与线形DNA的最佳分辨范围 6× Loading Buffer(DNA电泳用) 组份浓度

生物化学常用缓冲液

生物化学常用缓冲液 ⑴ 磷酸盐缓冲液 磷酸盐是生物化学研究中使用最广泛的一种缓冲剂,由於它们是二级解离,有二个pK a 值,所以用它们配制的缓冲液,pH范围最宽: NaH 2PO 4 : pK a1 =2.12, pK a2 =7.21 Na 2HPO 4 : pK a1 =7.21, pK a2 =12.32 配酸性缓冲液:用 NaH 2PO 4 ,pH=1~4, 配中性缓冲液:用混合的两种磷酸盐,pH=6~8, 配碱性缓冲液:用 Na 2HPO 4 ,pH=10~12。 用钾盐比钠盐好,因为低温时钠盐难溶,钾盐易溶,但若配制SDS-聚丙烯 酰胺凝胶电泳的缓冲液时,只能用磷酸钠而不能用磷酸钾,因为SDS(十二烷基硫酸钠)会与钾盐生成难溶的十二烷基硫酸钾。 磷酸盐缓冲液的优点为:①容易配制成各种浓度的缓冲液;②适用的pH范围宽;③pH受温度的影响小;④缓冲液稀释后pH变化小,如稀释十倍后pH的 变化小于0.1。 其缺点为:①易与常见的钙Ca++离子、镁Mg++离子以及重金属离子缔合生成沉淀;②会抑制某些生物化学过程,如对某些酶的催化作用会产生某种程度的抑制作用。 ⑵Tris(三羟甲基氨基甲烷,N-Tris(hydroxymethyl)aminomethane)缓冲 液 Tris缓冲液在生物化学研究中使用的越来越多,有超过磷酸盐缓冲液的趋势,如在SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳中已都使用Tris缓冲液,而很少再用磷酸盐。 Tris缓冲液的常用有效pH范围是在“中性”范围,例如: Tris-HCl缓冲液: pH=7.5~8.5 Tris-磷酸盐缓冲液: pH=5.0~9.0 配制常用的缓冲液的方法有两种:①按书后附录中所列该缓冲液表中的方法,分别配制0.05mol/L Tris和0.05mol/L HCl溶液,然后按表中所列体积混合。由于标准浓度的稀盐酸不易配制,所以常用另一种方法;②若配1L 0.1mol/L 的Tris-HCl缓冲液:先称12.11g Tris碱溶于950mL~970mL 无离子水中,边 搅拌边滴加4N HCl,用pH计测定溶液pH值至所需的pH值,然后再加水补足到1L。 Tris-HCl缓冲液的优点是:①因为Tris碱的碱性较强,所以可以只用这 一种缓冲体系配制pH范围由酸性到碱性的大范围pH值的缓冲液;②对生物化学过程干扰很小,不与钙、镁离子及重金属离子发生沉淀。 其缺点是:①缓冲液的pH值受溶液浓度影响较大,缓冲液稀释十倍,pH值的变化大于0.1;②温度效应大,温度变化对缓冲液pH值的影响很大,即: △pK a /℃=-0.031 ,例如:4℃时缓冲液的pH=8.4,则37℃时的pH=7.4,所以一定要在使用温度下进行配制,室温下配制的Tris-HCl缓冲液不能用于 0℃~4℃。③易吸收空气中的CO 2 ,所以配制的缓冲液要盖严密封。④此缓冲液对某些pH电极发生一定的干扰作用,所以要使用与Tris溶液具有兼容性的电极。

凝胶电泳缓冲液的配制

2.测序凝胶加样缓冲液 98%去离子甲酰胺 10mol/L EDTA(pH8.0) 0.025%二甲苯青FF 0.025%溴酚蓝 甲酰胺:许多批号的试剂级甲酰胺,其纯度符合使用要求,无须再进行处理。不过,一旦略呈黄色,则应用在磁力搅拌器上将甲酰胺与Dowex XG8混合床树脂共同搅拌1小时进行去离子处理,并用Whatman 1号滤纸过滤2次,去离子甲酰胺分装成小份,充氮存于-70℃。 3.常用的电泳缓冲液

说明: ①TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5×溶液,出现沉淀后则予以废弃。 以片都以1×TBE作为使用液(即1:5稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。但0.5×的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1:10稀释的贮存液作为使用液。 进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小,故通过缓冲液的电流量通常较大,需要使用1×TBE以提供足够的缓冲容量。 ②碱性电泳缓冲液应现用现配。 ③Tris-甘氨酸缓冲液用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。 4.2×SDS凝胶加样缓冲液 100mmol/L Tris·HCl(6.8) 200mmol/L二硫苏糖醇(DTT) 4%SDS(电泳级) 0.2%溴酚蓝 20%甘油 不含DTT的2×SDS凝胶加样缓冲液可保存于室温,应在临用前取1mol/L 贮存液现加于上述缓冲液中。 5.凝胶加样缓冲液

使用以上凝胶加样缓冲液的目的有三:增大样品密度;以确保DNA均匀进入样品孔内;使样品呈现颜色,从而使加样操作更为便利,含有在电块中能以可预知速率向阳极泳动的染料。溴酚蓝在琼脂糖中移动的速率约为二甲苯青FF的2. 2倍,而与琼脂糖浓度无关。以0.5×TBF作电泳液时,溴酚蓝在琼脂糖中的泳动速率约与长300bp的双链线状DNA相同,而二甲苯青FF的泳动则与长4kb的双链线状DNA相同。在琼脂糖浓度为0.5%~1.4%的范围内,这些对应关系受凝胶浓度变化的影响并不显著。 选用哪一种加样染料纯属个人喜恶。但是,对于碱性凝胶应当使用溴甲酚绿作为示踪染料,因为在碱性pH条件下其显色较溴酚更蓝为鲜明。

电泳缓冲液的作用

电泳缓冲液的作用 缓冲液在电泳过程中的一个作用是维持合适的pH。电泳时正极与负极都会发生电解反应,正极发生的是氧化反应(4OH--4e->2H2O+O2),负极发生的是还原反应(4H++4e->2H2),长时间的电泳将使正极变酸,负极变碱。一个好的缓冲系统应有较强的缓冲能力,是溶液两极的pH保持基本不变。电泳缓冲液的另一个作用是使溶液具有一定的导电性,以利于DNA 分子的迁移,例如,一般电泳缓冲液中应含有0.01-0.04mol/L的Na+离子,Na+离子的浓度太低时电泳速度变慢;太高时就会造成过大的电流使胶发热甚至熔化。电泳缓冲液还有一个组分是EDTA,加入浓度为1-2mmol/L,目的是螯合Mg2+ 等离子,防止电泳时激活DNA 酶,此外还可防止Mg2+离子与核酸生成沉淀。 TAE是使用最广泛的缓冲系统。其特点是超螺旋在其中电泳时更符合实际相对分子质量(TBE中电泳时测出的相对分子质量会大于实际分子质量),且双链线状DNA在其中的迁移率较其他两种缓冲液快约10%,电泳大于13kb的片段时用TAE缓冲液将取得更好的分离效果,此外,回收DNA片段时也易用TAE缓冲系统进行电泳。TAE的缺点是缓冲容量小,长时间电泳(如过夜)不可选用,除非有循环装置使两极的缓冲液得到交换。 TBE的特点是缓冲能力强,长时间电泳时可选用TBE,并且当用于电泳小于1kb的片段时分离效果更好。TBE用于琼脂糖凝胶时易造成高电渗作用,并且因与琼脂糖相互作用生成非共价结合的四羟基硼酸盐复合物而使DNA片段的回收率降低,所以不宜在回收电泳中使用。TPE的缓冲能力也较强,但由于磷酸盐易在乙醇沉淀过程中析出,所以也不宜在回收DNA片段的电泳中使用。

电泳缓冲液TAE的作用

电泳缓冲液TAE起什么作用呢? 缓冲液在电泳过程中的一个作用是维持合适的pH。电泳时正极与负极都会发生电解反应,正极发生的是氧化反应(4OH--4e->2H2O+O2),负极发生的是还原反应(4H++4e->2H2),长时间的电泳将使正极变酸,负极变碱。一个好的缓冲系统应有较强的缓冲能力,是溶液两极的pH保持基本不变。 电泳缓冲液的另一个作用是使溶液具有一定的导电性,以利于DNA分子的迁移,例如,一般电泳缓冲液中应含有0.01-0.04mol/L的Na+离子,Na+离子的浓度太低时电泳速度变慢;太高时就会造成过大的电流使胶发热甚至熔化。 电泳缓冲液还有一个组分是EDTA,加入浓度为1-2mmol/L,目的是螯合Mg2+ 等离子,防止电泳时激活 DNA酶,此外还可防止Mg2+离子与核酸生成沉淀。 TAE是使用最广泛的缓冲系统。其特点是超螺旋在其中电泳时更符合实际相对分子质量(TBE中电泳时测出的相对分子质量会大于实际分子质量),且双链线状DNA在其中的迁移率较其他两种缓冲液快约10%,电泳大于13kb的片段时用TAE 缓冲液将取得更好的分离效果,此外,回收DNA片段时也易用TAE缓冲系统进行电泳。TAE的缺点是缓冲容量小,长时间电泳(如过夜)不可选用,除非有循环装置使两极的缓冲液得到交换。 TBE的特点是缓冲能力强,长时间电泳时可选用TBE,并且当用于电泳小于1kb 的片段时分离效果更好。TBE用于琼脂糖凝胶时易造成高电渗作用,并且因与琼脂糖相互作用生成非共价结合的四羟基硼酸盐复合物而使DNA片段的回收率降低,所以不宜在回收电泳中使用。 TPE的缓冲能力也较强,但由于磷酸盐易在乙醇沉淀过程中析出,所以也不宜在回收DNA片段的电泳中使用。 人外周血单个核细胞总RNA的分离纯化 逆转录聚合酶链反应扩增细胞因子mRNA 琼脂糖凝胶电泳鉴定及DNA的胶回收 PCR扩增产物的克隆 感受态细胞的制备和重组DNA的转化 重组化的筛选和鉴定

三、核酸电泳相关试剂、缓冲液的配制方法

三、核酸电泳相关试剂、缓冲液的配制方法 50×TAE Buffer (pH8.5) 组份浓度 2 M Tris-醋酸,100 mM EDTA 配制量 1 L 配制方法 3.加入57.1 ml的乙酸,充分搅拌。 4.加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。 10×TBE Buffer (pH8.3) 组份浓度890 mM Tris-硼酸,20 mM EDTA 配制量 1 L 配制方法 3.加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。 10×MOPS(3-吗啉基丙磺酸)Buffer 组份浓度200 rnM MOPS,20 mM NaOAc,10 mM EDTA 配制量 1 L 配制方法 1.称41.8 g MOPS,置于1 L烧杯中。 2.加约700 ml DEPC处理水,搅拌溶解。 3.使用2 N NaOH调节pH值至7.0。 6.用0.45 m滤膜过滤除去杂质。 7.室温避光保存。 注:溶液见光或高温灭菌后会变黄。变黄时也可使用,但变黑时不要使用。溴乙锭(10 mg/ml) 组份浓度10 mg/ml溴乙锭 配制量100 ml 配制方法 1.称量1 g溴乙锭,加入到100 ml容器中。 2.加入去离子水100 ml,充分搅拌数h完全溶解溴乙锭。 3.将溶液转移至棕色瓶中,室温避光保存。 4.溴乙锭的工作浓度为0.5 g/ml。

注意:溴乙锭是一种致癌物质,必须小心操作。 Agarose凝胶 配制方法 1.配制适量的电泳及制胶用的缓冲液(通常是0.5×TBE或1×TAE)。 2.根椐制胶量及凝胶浓度,准确称量琼脂糖粉,加入适当的锥形瓶中。 3.加入一定量的电泳缓冲液(总液体量不宜超过锥形瓶的50%容量)。 注:用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须统一。 4.在锥形瓶的瓶封上保鲜膜,并在膜上扎些小孔,然后在微波炉中 加热熔化琼脂糖。加热过程中,当溶液沸腾后,请戴上防热手套。 小心摇动锥形瓶。使琼脂糖充分均匀熔化。此操作重复数次,直 至琼脂糖完全熔化。必须注意,在微波炉中加热时间不宜过长, 每次当溶液起泡沸腾时停止加热,否则会引起溶液过热暴沸,造 成琼脂糖凝胶浓度不准,也会损坏微波炉。熔化琼脂糖时,必须 保证琼脂糖充分完全熔化,否则,会造成电泳图像模糊不清。 5.使溶液冷却至60℃左右,如需要可在此时加入溴乙锭溶液(终浓 度0.5 μg/ml)。并充分混匀。 注:溴乙锭是一种致癌物质。使用含有溴乙锭的溶液时,请戴好手套。 6.将琼脂糖溶液倒入制胶模中,然后在适当位置处插上梳子。凝胶 厚度一般在3~5 min之间。 7.在室温下使胶凝固(大约30 min~1 h),然后放置于电泳槽中进行电泳。 注:凝胶不立即使用时,请用保鲜膜将凝胶包好后在4℃下保存, 一般可保存2~5天。 琼脂糖凝胶浓度与线形DNA的最佳分辨范围 6× Loading Buffer(DNA电泳用) 组份浓度 配制量 配制方法 1.称量下列试剂,置于500 ml烧杯中。

电泳缓冲液TAE,TBE的区别

电泳缓冲液TAE,TBE 缓冲液在电泳过程中的一个作用是维持合适的pH。电泳时正极与负极都会发生电解反应,正极发生的是氧化反应(4OH--4e->2H2O+O2),负极发生的是还原反应(4H++4e->2H2),长时间的电泳将使正极变酸,负极变碱。一个好的缓冲系统应有较强的缓冲能力,是溶液两极的pH保持基本不变。 电泳缓冲液的另一个作用是使溶液具有一定的导电性,以利于DNA分子的迁移,例如,一般电泳缓冲液中应含有0.01-0.04mol/L的Na+离子,Na+离子的浓度太低时电泳速度变慢; 太高时就会造成过大的电流使胶发热甚至熔化。 电泳缓冲液还有一个组分是EDTA,加入浓度为1-2mmol/L,目的是螯合Mg2+ 等离子,防止电泳时激活DNA酶,此外还可防止Mg2+离子与核酸生成沉淀。 TAE是使用最广泛的缓冲系统。其特点是超螺旋在其中电泳时更符合实际相对分子质量(T BE中电泳时测出的相对分子质量会大于实际分子质量),且双链线状DNA在其中的迁移率较其他两种缓冲液快约10%,电泳大于13kb的片段时用TAE缓冲液将取得更好的分离效果,此外,回收DNA片段时也易用TAE缓冲系统进行电泳。TAE的缺点是缓冲容量小,长时间电泳(如过夜)不可选用,除非有循环装置使两极的缓冲液得到交换。 TBE的特点是缓冲能力强,长时间电泳时可选用TBE,并且当用于电泳小于1kb的片段时分离效果更好。TBE用于琼脂糖凝胶时易造成高电渗作用,并且因与琼脂糖相互作用生成非共价结合的四羟基硼酸盐复合物而使DNA片段的回收率降低,所以不宜在回收电泳中使用。 TPE的缓冲能力也较强,但由于磷酸盐易在乙醇沉淀过程中析出,所以也不宜在回收DNA 片段的电泳中使用。 50×Tris-乙酸(TAE)缓冲液终浓度配制1L溶液 成分各成分的用量 2mol/L Tris碱242g 1mol/L 冰乙酸57.1 ml EDTA (pH=8.0)18.622g (200ml的0.5 mol/L EDTA(pH 8.0))水补足1L

电泳缓冲液

电泳缓冲液 测序凝胶加样缓冲液 98%去离子甲酰胺 10mol/L EDTA(pH8.0) 0.025%二甲苯青FF 0.025%溴酚蓝 甲酰胺:许多批号的试剂级甲酰胺,其纯度符合使用要求,无须再进行处理。不过,一旦略呈黄色,则应用在磁力搅拌器上将甲酰胺与Dowex XG8混合床树脂共同搅拌1小时进行去离子处理,并用Whatman 1号滤纸过滤2次,去离子甲酰胺分装成小份,充氮存于-70℃。 常用的电泳缓冲液 说明: ①tbe溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5×溶液,

出现沉淀后则予以废弃。 以片都以1×tbe作为使用液(即1:5稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。但0.5×的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1:10稀释的贮存液作为使用液。进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小,故通过缓冲液的电流量通常较大,需要使用1×tbe以提供足够的缓冲容量。 ②碱性电泳缓冲液应现用现配。 ③tris-甘氨酸缓冲液用sds聚丙烯酰胺凝胶电泳。 2×sds凝胶加样缓冲液: 100mmol/l tris·hcl(6.8) 200mmol/l二硫苏糖醇(dtt) 4%sds(电泳级) 0.2%溴酚蓝 20%甘油 不含dtt的2×sds凝胶加样缓冲液可保存于室温,应在临用前取1mol/l贮存液现加于上述缓冲液中。 电泳缓冲液 50×Tris-乙酸(TAE)缓冲液 成分及终浓度配制1L溶液各成分的用量 2mol/L Tris碱 1mol/L 乙酸 100 mmol/L EDTA 水242g 57.1 ml的冰乙酸(17.4 mol/L) 200ml的0.5 mol/L EDTA(pH 8.0) 补足1L 5×Tris-硼酸(TBE)缓冲液 成分及终浓度配制1L溶液各成分的用量 445 mmol/L Tris碱 445 mmol/L 硼酸盐 10 mmol/L EDTA 水54g 27.5g 硼酸 20 ml的0.5 mol/L EDTA(pH 8.0) 补足1L 染料 1%溴酚蓝(bromophenol blue) 加1g水溶性钠型溴酚蓝于100ml水中,搅拌或涡旋混合直到完全溶解。 1%二甲苯青FF(xylene cyanole FF) 溶解1g二甲苯青FF于足量水中,定容到100ml。 10mg/ml的溴化乙锭(ethidium bromide)

常用缓冲液的配制

常用缓冲液的配制 认为帖子很好,转帖,希望对大家有用 乙醇-醋酸铵缓冲液(pH3.7) 取5mol/L醋酸溶液15.0ml,加乙醇60ml和水20ml,用10mol/L氢氧化铵溶液调节pH值至3.7,用水稀释至1000ml,即得。 三羟甲基氨基甲烷缓冲液(pH8.0) 取三羟甲基氨基甲烷12.14g,加水800ml,搅拌溶解,并稀释至1000ml,用6mol/L盐酸溶液调节pH值至8.0,即得。 三羟甲基氨基甲烷缓冲液(pH8.1) 取氯化钙0.294g,加0.2mol/L三羟甲基氨基甲烷溶液40ml使溶解,用 1mol/L盐酸溶液调节pH值至8.1,加水稀释至100ml,即得。 三羟甲基氨基甲烷缓冲液(pH9.0) 取三羟甲基氨基甲烷6.06g,加盐酸赖氨酸3.65g、氯化钠5.8g、乙二胺四醋酸二钠0.37g,再加水溶解使成1000ml,调节pH值至9.0,即得。 乌洛托品缓冲液 取乌洛托品75g,加水溶解后,加浓氨溶液4.2ml,再用水稀释至250ml,即得。 巴比妥缓冲液(pH7.4) 取巴比妥钠4.42g,加水使溶解并稀释至400ml,用2mol/L盐酸溶液调节pH值至7.4,滤过,即得。 巴比妥缓冲液(pH8.6) 取巴比妥5.52g与巴比妥钠30.9g,加水使溶解成2000ml,即得。 巴比妥-氯化钠缓冲液(pH7.8) 取巴比妥钠5.05g,加氯化钠3.7g及水适量使溶解,另取明胶0.5g加水适量,加热溶解后并入上述溶液中。然后用0.2mol/L盐酸溶液调节pH值至7.8,再用水稀释至500ml,即得。 甲酸钠缓冲液(pH3.3)

取2mol/L甲酸溶液25ml,加酚酞指示液1滴,用2mol/L氢氧化钠溶液中和,再加入2mol/L甲酸溶液75ml,用水稀释至200ml,调节pH值至3.25~3.30,即得。 邻苯二甲酸盐缓冲液(pH5.6) 取邻苯二甲酸氢钾10g,加水900ml,搅拌使溶解,用氢氧化钠试液(必要时用稀盐酸)调节pH值至5.6,加水稀释至1000ml,混匀,即得。 枸橼酸盐缓冲液 取枸橼酸4.2g,加1mol/L的20%乙醇制氢氧化钠溶液40ml使溶解,再用20%乙醇稀释至100ml,即得。 枸橼酸盐缓冲液(pH6.2) 取2.1%枸橼酸水溶液,用50%氢氧化钠溶液调节pH值至6.2,即得。 枸橼酸-磷酸氢二钠缓冲液(pH4.0) 甲液:取枸橼酸21g或无水枸橼酸19.2g,加水使溶解成1000ml,置冰箱内保存。乙液:取磷酸氢二钠71.63g,加水使溶解成1000ml。取上述甲液61.45ml与乙液38.55ml混合,摇匀,即得。 氨-氯化铵缓冲液(pH8.0) 取氯化铵1.07g,加水使溶解成100ml,再加稀氨溶液(1→30)调节pH值至8.0,即得。 氨-氯化铵缓冲液(pH10.0) 取氯化铵5.4g,加水20ml溶解后,加浓氯溶液35ml,再加水稀释至 100ml,即得。 硼砂-氯化钙缓冲液(pH8.0) 取硼砂0.572g与氯化钙2.94g,加水约800ml溶解后,用1mol/L盐酸溶液约2.5ml调节pH值至8.0,加水稀释至1000ml,即得。 硼砂-碳酸钠缓冲液(pH10.8~11.2) 取无水碳酸钠5.30g,加水使溶解成1000ml;另取硼砂1.91g,加水使溶解成100ml。临用前取碳酸钠溶液973ml 与硼砂溶液27ml,混匀,即得。硼酸-氯化钾缓冲液(pH9.0) 取硼酸3.09g,加0.1mol/L氯化钾溶液500ml使溶解,再加0.1mol/L氢氧化钠溶液210ml,即得。

电泳缓冲液TAE,TBE的区别

电泳缓冲液TAE,TBE 令狐采学 缓冲液在电泳过程中的一个作用是维持合适的pH。电泳时正极与负极都会发生电解反应,正极发生的是氧化 反应(4OH4e>2H2O+O2),负极发生的是还原反应(4H ++4e>2H2),长时间的电泳将使正极变酸,负极变碱。 一个好的缓冲系统应有较强的缓冲能力,是溶液两极的 pH保持基本不变。 电泳缓冲液的另一个作用是使溶液具有一定的导电性,以利于DNA分子的迁移,例如,一般电泳缓冲液 中应含有0.010.04mol/L的Na+离子,Na+离子的浓度太低时电泳速度变慢;太高时就会造成过大的电流使胶发 热甚至熔化。

电泳缓冲液还有一个组分是EDTA,加入浓度为12m mol/L,目的是螯合Mg2+ 等离子,防止电泳时激活 DN A酶,此外还可防止Mg2+离子与核酸生成沉淀。 TAE是使用最广泛的缓冲系统。其特点是超螺旋在其中电泳时更符合实际相对分子质量(TBE中电泳时测出的相对分子质量会大于实际分子质量),且双链线状D NA在其中的迁移率较其他两种缓冲液快约10%,电泳大于13kb的片段时用TAE缓冲液将取得更好的分离效果,此外,回收DNA片段时也易用TAE缓冲系统进行电泳。TAE的缺点是缓冲容量小,长时间电泳(如过夜)不可选用,除非有循环装置使两极的缓冲液得到交换。 TBE的特点是缓冲能力强,长时间电泳时可选用TB E,并且当用于电泳小于1kb的片段时分离效果更好。T BE用于琼脂糖凝胶时易造成高电渗作用,并且因与琼脂糖相互作用生成非共价结合的四羟基硼酸盐复合物而使

DNA片段的回收率降低,所以不宜在回收电泳中使用。 TPE的缓冲能力也较强,但由于磷酸盐易在乙醇沉淀过程中析出,所以也不宜在回收DNA片段的电泳中使用。 50×Tr is乙酸(TAE)缓冲液终浓度配制1L溶液 成分各成分的用量 2mol/L Tris碱 242g 1mol/L 冰乙酸 57.1 ml EDTA (pH=8.0) 18.622g (200ml的0.5 mo l/L EDTA(pH 8.0)) 水补足1L

常用的电泳缓冲液

常用的电泳缓冲液 缓冲液使用液浓贮存液(每升) Tris-乙酸(TAE)1×:0.04mol/L Tris-乙酸50×:242g Tris碱 0.001mol/L EDTA 57.1ml冰乙酸 100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) Tris-磷酸(TPE)1×:0.09mol/L Tris-磷酸10×:10g Tris碱 0.002mol/L EDTA 15.5ml85%磷酸(1.679g/ml) 40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) Tris-硼酸(TBE)a0.5×0.045mol/L Tris-硼酸5×:54g Tris碱 0.001mol/L EDTA 27.5硼酸 20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 碱性缓冲液b1×:50mmol/L NaOH1×:5ml 10mol/L NaOH 1mmol/L EDTA 2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0) Tris-甘氨酸c1×:25mmol/L Tris5×:15.1g Tris 250mmol/L 甘氨酸94g 苷氨酸(电泳级)(pH8.3) 0.1% SDS 50ml 10% SDS(电泳级) 说明: ①TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5×溶液,出现沉淀后则予以废弃。 以片都以1×TBE作为使用液(即1:5稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。但0.5×的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1:10稀释的贮存液作为使用液。 进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小,故通过缓冲液的电流量通常较大,需要使用1×TBE以提供足够的缓冲容量。 ②碱性电泳缓冲液应现用现配。

电泳常见问题

Q:SDS-PAGE电泳的基本原理? A:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS(十二烷基硫酸钠),SDS会与变性的多肽,并使蛋白带负电荷,由于多肽结合SDS的量几乎总是与多肽的分子量成正比而与其序列无关,因此SDS多肽复合物在丙稀酰胺凝胶电泳中的迁移率只与多肽的大小有关,在达到饱和的状态下,每克多肽可与1.4g去污剂结合。当分子量在15KD到200KD之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为常数,若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。 Q:配胶缓冲液系统对电泳的影响? A:在SDS-PAGE不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris-HCL缓冲系统,浓缩胶是pH6.7,分离胶pH8.9;而电泳缓冲液使用的Tris-甘氨酸缓冲系统。在浓缩胶中,其pH环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而CL离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。由于导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压剃度,压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭窄的区带。当样品进入分离胶后,由于胶中pH的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接紧随氯离子之后,同时由于分离胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋白分子根据其固有的带电性和分子大小进行分离。 所以,pH对整个反应体系的影响是至关重要的,实验中在排除其他因素之后仍不能很好解决问题的情况,应首要考虑该因素。 Q:样品如何处理? A:根据样品分离目的不同,主要有三种处理方法:还原SDS处理、非还原SDS处理、带有烷基化作用的还原SDS处理。

DNA提取各种缓冲液的配制

植物总DNA的提取 一、所需仪器设备及消耗品 剪刀、塑料袋(封口)、冰箱、棕色广口瓶(1000、500、200、100、50ml)、量筒(1000、500、100、10ml)、烧杯(1000、500、200、100ml)、pH试纸、电子天平、高压灭菌锅、研钵、液氮罐(液氮)、水浴锅、离心机、移液器(1套)、枪头(1ml、200ml、20μl)、枪头盒、离心管(1.5ml)(包括盒和架)、一次性手套、电泳仪、电泳槽、塑料胶带(宽)、微波炉、凝胶成像系统、垃圾桶、冰盒(自制)、记号笔、单面刀片 二、所需化学药品及试剂 CTAB、NaCl、EDTA-Na2·2H2O、Tris、冰乙酸、硼酸、β-巯基乙醇、NaAc、氯仿(三氯甲烷)、异戊醇、无水乙醇、溴酚蓝、琼脂糖、蔗糖、溴化乙锭(EB)、RNase、NaOH、HCl(浓)、ddH2O 三、各种缓冲液的配制 (一)2%CTAB提取缓冲液(300ml)(高压灭菌) 4mol/L的NaCl 35ml×3=105ml 1mol/L的Tris-HCl 10ml×3=30ml 0.5mol/L的EDTA 4ml×3=12ml CTAB 2g×3=6g (二)1×TE(母液pH8.0)(50ml)(高压灭菌) 1mol/L的Tris-HCl(pH8.0)500μl 0.5mol/L的EDTA(pH8.0)100μl 最后加ddH2O定容到50ml 工作液为0.1×TE(45ml灭菌的ddH2O中,加入5ml已灭菌的1×TE) (三)4mol/L的NaCl(150ml)(高压灭菌) 35.055g的NaCl,加ddH2O120ml溶解,再加水定容到150ml (四)1mol/L的NaCl(400μl)(用于配制RNase储存液) 取4mol/L的NaCl(已灭菌)100μl,加300μl灭菌的ddH2O。 (五)3mol/L的NaAc溶液(pH5.2)(50ml)(高压灭菌) NaAc·3H2O 20.405g 加ddH2O 30ml 用冰乙酸调节pH至 5.2 加ddH2O定容到50ml (六)RNase储存液(10mg/ml)(1ml) 1mol/L的Tris-HCl(pH7.5)10μl 1mol/L的NaCl 15μl RNase 10mg 沸水浴15~20min (七)EB储存液(1mg/ml) EB 30mg ddH2O 30ml 磁力搅拌至完全溶解,装入棕色瓶,铝箔包裹,保存于室温。 制胶时EB终浓度为0.5μg/ml(30ml加15μl、40ml加20μl) (八)10×TBE缓冲液(电泳缓冲液)(高压灭菌)

琼脂糖凝胶电泳常见问题分析

琼脂糖凝胶电泳常见问题分析

DNA凝胶电泳简介 一、实验原理 DNA电泳是基因工程中最基本的技术,DNA制备及浓度测定、目的DNA片段的分离,重组子的酶切鉴定等均需要电泳完成。根据分离的DNA大小及类型的不同,DNA电泳主要分两类:

1、聚丙烯酰胺凝胶电泳适合分离1kb以下的片段,最高分辨率可达1bp,也用于分离寡核苷酸,在引物的纯化中也常用此中凝胶进行纯化,也称PAGE纯化。 2、琼脂糖凝胶电泳可分离的DNA片段大小因胶浓度的不同而异,胶浓度为0.5~0.6%的凝胶可以分离的DNA片段范围为20bp~50kb。电泳结果用溴化乙锭(EB)染色后可直接在紫外下观察,并且可观察的DNA条带浓度为纳克级,而且整个过程一般1小时即可完成。由于该方法操作的简便和快速,在基因工程中较常用。 二、琼脂糖凝胶 琼脂糖是从琼脂中分离得到,由1,3连接的吡喃型b-D-半乳糖和1,4连接的3,6脱水吡喃型阿a-L-半乳糖组成,形成相对分子量为104~105的长链。琼脂糖加热溶解后分子呈随机线团状分布,当温度降低时链间糖分子上的羟基通过氢键作用相连接,形成孔径结构,而随着琼脂糖浓度不同形成不同大小的孔径。表1给出了不同浓度凝胶对DNA片段的线性分离范围。 表1不同类型琼脂糖分离DNA片段大小的范围 由于琼脂糖凝胶是通过氢键的作用,因此过酸或过碱等破坏氢键形成的方法常用于凝胶的再溶化,象NaClO4能用于凝胶的裂解,一般的凝胶回收试剂盒利用的也是这一原理。 随着实验技术的发展,也针对不同用途开发了各种类型的琼脂糖凝胶:(1)低熔点琼脂糖凝胶,用于DNA片段的回收,且由于该种凝胶中无抑制酶,可在胶中进行酶切、连接等;(2)高熔点凝胶,可分离小于1kb的DNA片段,专用于PCR产物的分析;(3)快速凝胶,电泳速度比普通凝胶中快一倍,可节省实验时间;(4)适用于DNA大片段的分离。(5)其它类型。各生产商还开发很多类型的凝胶,可根据实验要求选择不同类型的,选择原则是考虑合适的机械强度和熔点。

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