1 电子健康档案研究现状、热点与趋势——基于PubMed数据库的文献计量学分析

电子健康档案研究现状、热点与趋势——基于PubMed数据

库的文献计量学分析

郭海红①代涛＊胡红濮①黄薇①

＊通讯作者：北京协和医学院，中国医学科学院医学信息研究所，100020，北京市朝阳区雅宝路3号

①北京协和医学院，中国医学科学院医学信息研究所，100020，北京市朝阳区雅宝路3号

摘要目的：从文献角度探讨国际电子健康档案研究历史与现状，以及近五年研究热点。方法：文献计量、共词分析、聚类分析。结果与讨论：1990年以来电子健康档案研究日益受到各国研究者的广泛关注，并已形成核心期刊。高频主题词共现聚类分析表明电子健康档案的核心技术、功能和应用，及其安全性、医务人员对电子健康档案的态度等是近五年电子健康档案领域的研究热点，终身电子健康档案将是当前电子健康档案建设的趋势和目标。关键词电子健康档案文献计量共词分析聚类分析

电子健康档案/电子病历是指个人健康资料的电子化记录，是各国促进公共卫生均等化、减少医疗差错、提高医疗质量、降低医疗成本的有力手段之一。2009年，韩国汉城国立大学生物医学工程图书馆的Senator Jeong ? Hong-Gee Kim 通过对国际生物医学信息学相关学术活动的关键词进行共词分析，发现医疗信息系统、电子健康档案、临床决策支持系统日益成为医学信息学领域的重点研究课题[1]。

国外电子健康档案研究起源于1969年，兴起于上世纪90年代，至今已在该领域开展了广泛而深入的研究。近年来，我国已有多位学者从定性综述角度对国外电子健康档案的发展进行研究，如杭州师范大学的吴思静、郭清[2]综述了日本、英国、加拿大、美国、澳大利亚、新西兰等国的电子健康档案应用现状与发展困境；卫生部电子健康档案委员会[3]则以专著的形式系统阐述了上述国家的电子健康档案应用现状与发展策略。但是从文献计量学角度对国外电子健康档案研究领域进行回顾与展望、追踪与探测研究热点与前沿的相关研究仍然较少，而该方法在图书情报领域已应用得较为成熟。如武汉大学的邱均平、温芳芳 [4]采用文献计量方法探测了图书情报学学科研究热点与前沿；武汉大学的马费成、张勤 [5]采用该方法对比分析了国内外知识管理研究热点。

采用文献计量方法对领域研究前沿和热点进行追踪，不仅能够深入地揭示研究领域的轨迹、特征和规律，而且有助于所研究领域的专家学者更好地把握本领域的研究动态和发展趋势[4]。因此，本文尝试利用文献计量学方法对国际电子健康档案相关文献进行研究，梳理国际电子健康档案研究历史与现状，并采用高频主题词共词聚类分析法揭示近五年电子健康档案研究热点与前沿。

1 数据来源

本研究所采用的数据来源于全球最权威的生物医学文献检索系统——PubMed数据库，该数据库使用医学主题词表（MeSH）来揭示文献的内容特征，这种结构化的数据格式为对MEDLINE进行文本数据挖掘，全面、准确抽取电子健康档案相关研究文献中的主题词提供了便利。在其高级检索途径中以如下策略进行检索：

((((Medical Records System?, Computerized[MeSH Terms]) OR Health Record?, Personal[MeSH Terms]) OR Electronic Health Record*[MeSH Terms]) OR Electronic Patient Record*[Title/Abstract]) NOT Review[Filter] 共检索到PubMed收录的1969年至今的17291篇非综述性文献，其中近五年以电子健康档案为主要内容的期刊文献共5095篇，检索时间为2010年12月1日。

2 分析方法与工具

将检索结果以XML格式导出，并导入文本挖掘系统BICOMS进行分析。通过对文献出版年代、国家、来源出版物进行计量分析，探讨电子健康档案研究的历史、各国研究情况及重视程度，找出该领域的核心期刊。

由于一篇文献的主题词是文章核心内容的浓缩和提炼，因此，高频主题词代表研究者对该主题词所表征的内容非常关注。当两个能够表达某一学科领域研究主题或方向的主题词在同一篇文献中出现时，表明这两个词之间有一定的内在关系，并且出现次数越多，表明它们的关系越密切，利用聚类分析法可以进一步按这种“距离”将一个学科内的重要主题词加以分类，从而归纳出该学科的研究热点与前沿[6]。

在社会经济与科学技术（尤其是计算机技术）迅猛发展的当代，有关电子健康档案研究的内容可能随着所处的社会经济和技术环境的不同而有不同侧重，最新的数据则更能反映最近的研究热点与趋势。为保证足够的样本量，本研究决定截取近五年（即2006年至2010年）以电子健康档案为主要内容的5095篇期刊文献进行主题词共现分析。利用BICOMS软件系统将这些文献中的主要主题词（主要主题词-副主题词）全部套录下来，并统计每一个主题词出现的频次，截取出现频次大于90且累计频次超过50%的主题词共30个（见表3，其中去除了检索词Medical Records System, Computerized和Electronic Health Records），这些主题词代表了近五年国际电子健康档案研究文献的主要内容。对这些高频主题词做共词分析，得到高频主题词共现矩阵（见表4），再导入SPSS 11.5进行聚类分析，结合笔者对该领域的理解，并向专家请教，总结近五年国际电子健康档案研究热点与趋势。

3 结果分析

3.1文献量随时间变化趋势

图1 国际电子健康档案研究文献量随时间变化趋势PubMed中收录的电子健康档案相关文献最早出现于1969年（见图1），可见国际上关于电子健康档案的研究已有40多年历史，但是在1990年之前，文献量一直非常少，仅偶尔出现几篇。国际上对电子健康档案研究的关注实际上还只有20年，却在这20年中取得了长足进展。1990年到1995年文献量突然迅速增加，由年文献量几篇突飞猛进到1995年的670多篇，说明这五年间，电子健康档案研究迅速发展，引起了广大研究者的兴趣。1995年到2002年文献量较为稳定，基本上每年都在700篇左右，2003年至2008年，文献量又一轮迅猛增加，并于2008年达到顶峰，此时的年文献量已超过2002年的2倍，达到1600多篇，这可能与2003年SARS爆发，引发全球对公共卫生的关注，从而推动公共卫生系统信息化建设有关。近两年的文献量略有下降，可能是文献收录滞后所致。

3.2 国家分布经过数据清洗，PubMed中所收录的电子健康档案相关文献的国家分布显示，目前已有60余个国家和地区开展了电子健康档案研究，但95%以上的文献都集中在文献量排名前十的发达国家（见表1）。其中美国最多，共有11060篇文献，占总文献量的63.96%，英国位居第二，共有文献1680篇，占总文献量的9.72%，说明美英等发达国家已经对电子健康档案开展了广泛而深入的研究。相比之下，发展中国家的电子健康档案研究显得较为薄弱，没有一个发展中国家的文献量跻身前十，其文献总量还不到国际电子健康档案研究总文献量的5%，这也可能受数据库的收录范围的影响。在PubMed数据库中，我国以47篇相关文献排名第16，但国内数据库（如CNKI）中所收录的相关文献却有4000多篇（从主题途径检索），最早有时间标识的文献出现于1992年，说明我国电子健康档案研究较晚，但发展迅速，然而国际影响力尚待提高。

表1 电子健康档案研究文献国家分布

3.3 文献来源出版物分布PubMed中所收录的17291篇电子健康档案相关文献分布在1779种出版物上，平均每种出版物刊载了9.7篇，反映其受关注程度非常高。三分之一以上的文献分布在载文量排名前10的核心出版物上（见表2），50%以上的文献都集中在前34种出版物上，不到20%（291种，16.36%）的期刊刊载了相关论文总数的80%，而有617种来源出版物仅刊载了1篇相关文献，说明电子健康档案研究文献来源分布的集中-离散趋势非常明显，并已经形成了领域核心出版物。其中《Studies in health technology and informatics》载文量最多，共有1259篇文献，占总文献量的7.3%。值得注意的是，美国医学信息学会（AMIA）的年会论文集及其官方杂志载文量都名列前茅，在一定程度上反映该协会是国际上电子健康档案研究的研究主力和主要组织者。

另外，前34种出版物中有约三分之一的出版物名称直接涉及计算机技术与方法在医疗领域的应用，说明计算机技术与方法是研发电子健康档案系统的技术支撑。

表2 电子健康档案研究领域核心来源出版物

3.4 高频主题词PubMed中近五年以电子健康档案为主要内容的5095篇文献共有43612个主题词，平均每篇8.6个，所表征的内容过于宽泛，为了让所选取的主题词更准确地代表文献内容，本研究仅取其中的主要主题词，共19313个，即每篇3.8个。其中前30个高频主题词（见表3）基本涵盖了电子健康档案研究的主要方面，包括电子健康档案的应用（主题词1、2、3等）、电子健康档案的核心技术（主题词12、14、19等）、电子健康档案应用系统（主题词3、7、30等）、电子健康档案的安全性（主题词5、8等）等。通过聚类分析，进一步将这30个高频主题词划分为六个类别（见图2），通过查阅同类主题词共现文献，总结出近五年国际电子健康档案研究的六大热点。

表3 近五年国际电子健康档案研究文献中的高频主题词

表4 近五年国际电子健康档案研究文献高频主题词共现矩阵

医务人员对电子健康档案的态度

电子健康档案的应用

电子健康档案的核心技术

电子健康档案的功能

电子健康档案的安全性

电子健康档案的应用推广

图2 近五年国际电子健康档案研究文献高频主题词共词聚类视图

3.4.1 医务人员对电子健康档案的态度表征该研究方向的主题词为医务人员的态度（Attitude of Personal）、对计算机的态度（Attitude to Computer）及内科医生（Physicians）。由于填写繁琐、视觉效果不佳等原因，电子健康档案使用不足（"Under-utilization"）是实施电子健康档案后医院面临的一个普遍遗留问题[7]，因此，实施电子健康档案后医务人员对电子健康档案的使用意向成了近五年该领域的一个研究热点。此外，由于电子健康档案加大了医疗信息对患者的可及性，却减少了医务人员间的口头交流，因而电子健康档案的实施是否有助于改善医患关系、是否会恶化医务人员之间的关系等也日益受到关注。

3.4.2 电子健康档案的应用主题词初级卫生保健（Primary Health Care）、家庭医疗（Family Practice）、门诊医疗（Ambulatory Care）、信息系统（Information System）、计算机通讯（Computer Communication）、表单和记录控制（Forms and Records Control）、护理记录（Nursing Records）、医疗质量保证（Quality Assurance, Health Care）、组织效率（Efficiency, Organizational）等基本上涵盖了电子健康档案的应用领域、载体和目的。如何通过计算机通讯网络、信息系统等对表单和病历记录（电子健康档案）进行管理和控制，从而保证医疗质量，提高组织效率，是电子健康档案研究的出发点和最终目的，该方向将是一个持续的研究热点。

3.4.3电子健康档案的核心技术主题词文档编制（Documentation）、人机交互（User-computer interface）、数据库管理（Database Management）、系统集成（System Integration）、自然语言处理（Natural Language Processing）基本上涵盖了电子健康档案系统的核心技术内容。另外，数据存储和检索、数据集标准[8]等研究也属于该方向范畴。该方向的主题词词频普遍较高，排名介于11到19之间，说明该方向的研究在近五年非常活跃，同时也说明在现阶段实现电子健康档案，技术障碍仍然是主要困境之一。

3.4.4 电子健康档案的功能主题词医疗实践管理（Practice Management，Medical）、药物治疗差错（Medication Errors）、临床决策支持系统（Decision Support System, Clinical）、医疗记录链接（Medical Record Linkage），可见该方向的研究重点是通过电子健康档案系统与医嘱录入系统、临床决策支持系统的整合，设置临床实践指南和提示/警报（Alerts）功能，从而帮助规范临床实践、支持临床用药决策，预防和控制诊疗差错和药物治疗过失[9]，还可将电子健康档案中的医疗记录作为按绩效付费或按服务付费的依据。电子健康档案的功能论证是投资实施电子健康档案的重要依据，因而在电子健康档案研究中占有重要地位。

3.4.5 电子健康档案的安全性主题词保密性（Confidentiality）、计算机安全（Computer Security）。随着个人健康资料的电子化，患者的隐私保护、电子健康档案的完整性（未经授权不可修改）问题日益突出，各国都在积极探索保护电子健康档案安全性的措施，其中主要为寻求立法程序支持和计算机安全技术支持。如美国振兴和再投资法案（The American recovery and reinvestment act

of 2009，ARRA）对医疗信息的隐私保护作出了明确规定[10]。

3.4.6 电子健康档案应用推广该部分主要涉及电子健康档案系统与医疗机构其他信息系统的整合，如医院信息系统（Health Information system, HIS）、医嘱录入系统（Medical Order Entry System, MOES）、临床决策支持系统（clinical decision Support System, CDSS）等，并在这些系统之间统一实现信息存储和检索（Information Storage and Retrieval），实现电子健康档案的有意义使用（”Meaningful Use”）[11]。

4 讨论

对PubMed中收录的电子健康档案研究文献的计量学分析表明，电子健康档案研究自20世纪90年代开始，日益受到各国（尤其是美英等发达国家）研究者的广泛关注，经过1995年至2002年的相对稳定发展之后，在2003至2008年又掀起一轮新的研究热潮，可能与这一时期各国政府对电子健康档案建设的高度重视有关。电子健康档案研究历经40余年的发展历程，已经形成了领域核心出版物。高频词共现聚类分析表明电子健康档案的核心技术、功能和应用，及其安全性、医务人员对电子健康档案的态度等是近五年电子健康档案领域的研究热点。

值得注意的是，电子健康档案在各国有不同程度的应用推广。美国的电子健康档案建设已由单个医院内保存和管理的详细医疗记录发展到建立在国家卫生信息网络（National Health Information Network，NHIN）基础上，可跨平台、跨地区共享的电子健康档案发展新阶段[12]。世界银行也指出能以最理想的方式从出生到死亡一直跟踪病人，并能在不同的医疗服务提供者和医疗机构之间传递的终身电子健康档案（Lifelong electronic patient records）将是当前电子健康档案建设的趋势和目标[13]。

参考文献

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[4] 邱均平,温芳芳.近五年来图书情报学研究热点与前沿的可视化分析——基于13种高影响力外文源刊的计量研究[J].中国图书馆学报,2011,37(192):051- 060.

[5]马费成,张勤.国内外知识管理研究热点——基于词频的统计分析[J].情报学报,2006,25(2):163-171.

[6] 张勤,马费成.国内知识管理研究结构探讨——以共词分析为方法[J].情报学报,2008, 27(1):93-101.

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professionals' perceptions[J].Encephale.2010,36(3):236- 241.

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[12] 黄薇,代涛,李新伟,等.美国电子健康档案发展策略及启示[J].中国医院管理,已收录.

[13] John C. Langenbrunner, Cheryl Cashin, Sheila O’Dougherty. Designing and Implementing Health Care Provider Payment Systems: How-To Manuals[M]. The World Bank, Washington DC, 2009:263-286.

PubMed使用手册

PubMed使用手册 【基本查询方法】 ?一个检索词： 一个单词：在文本框中输入检索词，按GO查询。 含两个单词以上的检索词：需要加双引号，注意是英文输入状态下的双引号。 如："ultrasonic diagnosis"是正确的，“ultrasonic diagnosis” 是错误的 ?两个以上的检索词：可使用AND、OR 连接各检索词。 如："three dimensional ultrasound" AND thyroid ?可以在“limit”菜单下限制文献出版的时间、语种等等。 【完全手册】 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping） 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。 （1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词（题名词和文摘

词）进行检索。例如：键入"Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 （2）刊名转换表（Journal Tanslation Table），包括刊名全称、MEDLINE 形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为"MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如：在检索提问框中键入："new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。 （3）短语表（Phrase list）。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS: Unified Medical Language System）和补充概念（物质）名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词，就会查找短词表。 （4）著者索引（Author Index）。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语，PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词，PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程，直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词，单个词会被联一起（用AND）在全部字段中检索。如："single cell"，系统就会自动将其分成两个词："single"和"cell"检索，其检索表达式为："single AND cell"。要查验检索词的转换情况，可点击"Details"键。 2.截词检索功能

PubMed数据库与EMBASE数据库的比较

PubMed数据库与Embase数据库的比较 PubMed是一个免费的搜索引擎，是NLM所属的国家生物技术信息中心（NCBI）于2000年4月开发的，基于WEB的生物医学信息检索系统，它面向全世界免费提供最新的生物医学信息。每周5天更新数据，检索功能完善，使用方便。整合在NCBI的统一检索平台Entrez 上，与该平台其他数据库建立无缝链接，可实现跨库检索。PubMed 收录全世界80多个国家5200多种生物医学期刊的文摘及题录数据，绝大部分可回溯至1948年，最早回溯至1865年。累积了1900多万条文献记录，部分文献可直接获取全文，包括：PubMed Central (PMC，收录期刊780余种)：NLM开发的免费生物医学数字化期刊全文数据库、开放获取(Open Access，OA)期刊、部分出版商提供的免费文献，与出版商的电子期刊文献同步发布，标注为[Epub ahead of print](先于印刷版期刊发表的电子文献)或Epub。MEDLINE——自1949年至今数据1400万余条，内容每周更新一次，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和前临床科学等。In Process Citations ——1996年8月开始增加该数据库，只提供基本的引文信息和文摘，每天更新，经过标引以后进入MEDLINE，并从PreMEDLINE 中删除这些记录。Publisher Supplied Citation——接受出版商提供的文献数据，这种数据带有[MEDLINErecord in process]的说明。 Embase数据库全称Exceerpta Medica Database,由荷兰爱思唯尔公司出版，是印刷型检索工具Exceerpta Medica的电子版，也是最重要的生命科学文献书目型数据库之一。Embase收录从1974年以

pubmed数据库使用方法

pubmed数据库的使用方法 本文以 pubmed中的一篇文章 Inhibition of Notch pathway attenuates the progression of human immunodeficiency virus-associated nephropathy. 为例来说明pubmed数据库的使用方法。 在pubmed中检索到该篇文章后，网址是 https://www.wendangku.net/doc/209519113.html,/pubmed/23389453 在页面左侧稍微靠上的地方，显示有该文章所属的期刊名字，如下图所示： 上图中棕色横线标注处显示的就是收录该文章的期刊的名字（是缩写），鼠标移动到该缩写的期刊名字上后，会弹出提示框显示该期刊的全名。棕色横线标注处同行的后边是这篇文章在该期刊中是哪一年的哪一期以及该文章的doi编号等信息。双击棕色横线标注处的链接，将可以查看该期刊的更多详细信息。 页面的右上角有时候会显示出该篇文章的全文获取链接，如下图所示:

在上图的棕色横线标注处，有时可以看到一个矩形的图标，那就是该篇文献的全文下载链接。点击该链接将来到收录该文章全文的期刊或者数据库的该篇文章的网络下载页面，例如该篇文献的网络下载页面如下图所示：

上图红色链接标注处出现了一个登陆框，要求进行登陆，这表明你没有下载该篇文献的权限。上图中绿色横线标注处是当你有此篇文献下载权限时，点击下载文献全文的位置。没有该篇文献全文下载权限的话，是无法下载到此文献的，如果您是通过seek68数字图书馆提供的pubmed入口来到此页面，则有很大机会直接就具有该篇文献的下载权限，如下图所示：

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦 注：在本文中的叙述中，所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来，如以基因治疗为主题词检索，在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。 PubMed简介 PubMed是由隶属于美国国家卫生部（NIH, National Institues of Health）的国家医学图书馆（NLM, Nationa Library of Medicine）下属的国家生物技术信息中心（NCBI, National Center for Biotechnology Information）提供，可通过NCBI网站的Entrez检索系统（Entrez retrieval system）进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。此外，PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务，与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据，提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA 与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统，可检索NCBI网站的主要数据库，如PubMed，核酸与蛋白序列，基因组序列，蛋白结构，OMIM等等。PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库，此外，它还针对网上资源，提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源，如核酸蛋白序列、OMIM入口等，以及其它生命科学数据库。其文献内容的提供方式，由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。如果该出版商有网站，则NCBI会提供相应的网络出口。MEDLINE 及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。 PubMed服务内容概括 基于互联网WWW的MEDLINE及PreMEDLINE引文数据库免费检索系统。 提供MEDLINE、PreMEDLINE与其他相关数据库接入服务，如NCBI的其它数据库DNA与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线，及NCBI外的其它数据库。 提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据等等。 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆（U.S.National Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及临床医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。 随着国内互联网的普及，网络已逐步地成为一名医务工作者获取多种信息的有效渠道。网络已成为医学研究者追踪国际研究进展，了解世界先进水平的一个重要手段。 传统的医学文献检索（MEDLINE）尽管在本地局域网提供的情况下，具有高速的特点。但与互联网

Pubmed全攻略使用教程

PubMed检索系统简介 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆（U.S.National Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。 PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据，可为用户提供基本的文献条目和文摘，其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据，这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明，并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送，但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代，例如在综合性的科学杂志（Science 或Nature）上发表的地理学文章等。 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping） 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。 （1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord 词（题名词和文摘词）进行检索。例如：键入“Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 （2）刊名转换表（Journal Tanslation Table），包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN 号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如：在检索提问框中键入：“new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。 （3）短语表（Phrase list）。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS: Unified Medical Language System）和补充概念（物质）名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词，就会查找短词表。 （4）著者索引（Author Index）。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语，PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词，PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程，直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词，单个词会被联一起（用AND）在全部字段中检索。 如："single cell"，系统就会自动将其分成两个词：“single“和“cell”检索，其检索表达式为：“single AND cell”。要查验检索词的转换情况，可点击“Details”键。

PubMed数据库

PubMed数据库 一．检索Genbacev O 等撰写的关于“胎盘氧张与胎儿生长的关系”的文章。要求写出：①第一篇文章的原文出处，②第一篇原文后附第一篇参考文献中的第一作者的姓名。操作步骤：1．在地址栏中输入https://www.wendangku.net/doc/209519113.html,/pubmed，进入PubMed 2．在检索栏中输入 placenta growth oxygen genbacev o，点击Go 3．点击题录中作者姓名如: Genbacev O，得到文摘，点击出处下方免费获取全文（free text article）红色按钮。 4．在原文最后找到Reference(参考文献)，得到第一篇作者姓名。 二．用MeSH Database 检索肾衰竭饮食疗法的文献。要求：第一作者Rao M的工作单位及E-mail 地址。操作步骤： 1．进入PubMed主页，点击主页左侧中MeSH Database，进入MeSH Database网页 2．在检索栏中输入renal failure, 点击Go 3．在主题词注释页中，点击kidney failure。

4. 选副主题词(subheadings) 中的diet therapy (饮食疗法)，选择send to下的Search Box with AND。 5．在返回结果页的检索框中"Kidney Failure/diet therapy"[MESH]后输入Rao M，点击PubMed Search。 三．查找Challis DE作为第一作者发表于Pediatric Research 2000,47(3):309-15上的论文， 并写出其他合著者。操作步骤： 1. 进入PubMed主页，在主页的左侧栏中点击Single Citation Matcher。 2. 按要求输入著者、刊名、卷、年等信息，点击search 按钮。 基因序列获取与同源性对比 一．用NCBI查找人类抗癌基因（human antioncogene）的核酸序列报告，要求：写出序列号和 碱基数，并拷贝原序列（Origen）。操作步骤： 1.进入https://www.wendangku.net/doc/209519113.html,/entrez，选择Nucleotide 核酸序列库 2.输入human antioncogene 点击Go

PubMed数据库如何获取全文

PubMed数据库如何获取全文 当很多人开始了解PubMed，并且逐渐得心应手的时候，都会面临一个棘手的问题，即如何获取全文？的确，PubMed真正向公众（public）免费开放的只是摘要部分，而绝大部分文章都没有全文提供。当然，最省事最直截了当的做法是在PubMed上花钱购买，但一篇文章动辄十几甚至几十美金，使很多医学工作者只好望而却步。其实，只要我们掌握一些技巧，还是有可能获得一些文章的全文的。笔者查阅文献数年，为获取全文也做了不懈努力，积累了一些经验供大家参考。一、PubMed PubMed上约有5%的文献是可以免费看到全文的，通常这些文献的左上角会有一个Free Full Text的小标记。你只要点击这个图标，系统就自动链接入该文献的全文。但有两点值得注意的是，第一，很多时候，这个图标在PubMed处于显示简要（summary）状态下并不出现，而只有在选择显示摘要（abstract）时才出现。因此，如果你不只是泛泛浏览，而希望看到全文的话，我强烈建议你在display下拉菜单中选择摘要（abstract）状态。第二，有些时候，小图标上仅标着Full Text，而并没有Free字样，但仍然可以链接入全文，你不妨试一试。二、免费提供全文的期刊天下没有免费的午餐，这句老话也不一定正确。有些期刊就提供全文免费检索。比如著名的美国Science（科学）杂志，以前国内很多高校、研究所的资料室都流传着Science杂志的影印本，印刷质量低劣，而且有盗版之嫌。后来Science的老板充分理解到中国的国情，干脆顺手做个人情，就与中国有关方面达成协议，使在中国大陆的读者都可以在网上免费看到Science的全文。方法如下：（1）先登录Science网址：http：//https://www.wendangku.net/doc/209519113.html, 。注意，不是https://www.wendangku.net/doc/209519113.html,，否则你得不到全文。（2）点击中间那个SEARCH按钮，就进入查询页了。你可以选择简单检索还是复杂检索。（3）输入您要找的关键词（不一定是MESH标准主题词），再点击search 就可以了。（4）找出文章后，点击标题后的Full Text，就可以浏览原文了。除了Science，其他一些期刊如美国科学院院报（PNAS），Genetics等都可以在网上获取全文，甚至能够下载文献的pdf格式，这样就和真正在期刊上的排版形式一模一样了。一般而言，那些相应期刊的网址是以org为域名的，往往提供免费的全文。例如上面提到的两家期刊的网址就分别是：https://www.wendangku.net/doc/209519113.html, ；https://www.wendangku.net/doc/209519113.html, 。这里，我特别推荐一个提供免费全文的网站High Wire Press。该网站号称拥有地球上最大最全的免费的科学文献全文数据库。输入网址http：//https://www.wendangku.net/doc/209519113.html,/即可登录该网站，首页即列出几个生物医学相关栏目，包括：1、生命科学（包含：生物化学，细胞和分子生物学/ 微生物学与病毒学/ 免疫与免疫学/ 神经科学与神经生物学/ 生理学/ 植物学/ 其他生命科学/）2、医学（包含：心血管医学/ 临床医学/ 精神病学与心理学/ 医学研究/）3、自然科学以及其他科学栏目。你可以在这些栏目中选择自己需要的期刊。然后，你需要重点看一下该期刊后面的的说明信息，尤其是提供免费全文的方式，如free ISSUES是在多长时间内可以享受免费索取原文，从5年到一个月不等。而free TRIAL 是在限定时间内，可以免费提供原文。至于free SITE 则是可以完全免费获取全文的站点。当然，你也可以在检索框内输入关键字，然后点击首页右上方的Search all journals ，你就可以在所有的224种期刊里查找文献了。不过由于所检索到的结果仅仅局限于这200多种期刊，因此你一定要记住绝对不能用此网站来代替PubMed，来了解所研究课题的最新进展。我个人的建议是，先在PubMed上检索，而仅以High Wire Press作为获取全文的一个途径而已。三、利用一些高校图书馆网站国内一些高等院校，尤其是一些名牌高校的图书馆经常和国外一些大的出版商签订协议，支付不菲的费用，从而可以检索并看到所有由这些出版商出版的期刊的全文。你可以就近到这些高校的图书馆的电子检索厅去检索，或者链接到大学图书馆的网站（如复旦大学图书馆的网址是https://www.wendangku.net/doc/209519113.html,），然后通过该网站的链接进入相应的检索系统。可惜的是，从公众网到教育网之间的传输效率