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怎么RNA逆转录DNA

怎么RNA逆转录DNA
怎么RNA逆转录DNA

请教:用Takara的逆转录试剂盒,推荐程序为37度15分钟,85度15秒,PCR仪上设置为37度15分钟,85度15秒,end.逆转录完后晚了20分钟将产物拿出,会影响cDNA 得率吗?

没关系的

变成cDNA后就很稳定了,不像RNA那么容易降解

逆转录为cDNA后可以直接跑,也可以保存起来(长期-80度,短期-20度)

刚学会作反转录,用的是Fermentas的反转录试剂盒,20ul的体系,说可以转录0.1~5ug的总RNA。曾试着用不同个体的RNA样本,每次用50ng、100ng、200ng、300ng、400ng、800ng、1ug、2ug、4ug 的总RNA做反转录,结果得到的cDNA浓度都在2300~2500ng/ul。只有50ng的时候稍微少一些2200ng/ul,另外,个别时候(2ug的一次)到达300

纯度不高时,建议少加一点,因为太多杂质会影响反转录效率。

纯度很高时,就无所谓了。我做的时候都是加1 uL,大约2 ug。

我估计你是用吸光度法测反转录后的浓度,这时候受到逆转录体系中dNTP、RNA、酶和离子等的干扰你测出来的浓度不代表cDNA的浓度,你大多数时候测到的值就应该是一个相对恒定的值。

一般不测cDNA浓度的,加入RNA在试剂盒推荐范围的话就认为完全转录了,1:1变成了cDNA。做定量PCR的时候一般先做一个浓度梯度(一般我1ug总RNA最后做的时候稀释一倍效果比较好)

我是用Trizol提取RNA,最后用10ulDEPC水溶解,然后取2ul按1:50稀释后在分光光度计上测出OD160/280基本是在1.8,浓度是8ug/ml

这样算来我溶解的原液浓度就是0.4ug/ul了?

然后我再去2ul进行RT,那就是等于去了0.8ug的RNA了?

我用的是fermentas的逆转录试剂盒,说明书上要求是可以对0.1-5ug的样品进行逆转录但是其他同学提的RNA浓度都很高,这个对以后的实验有影响吗,我是做半定量RT-PCR

我是从组织中取材,之后直接放-80度保存了半个月,这个会不会有影响呢?按说RNA降解OD比值应该升高啊。

还是我在提取中那一步做的不对呢,我在最后乙醇干燥时时间不长,而且加了DEPC水之后也没有在55--60度中助溶,这个会有影响吗?

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