Pubmed基本的检索知识

Pubmed基本的检索知识

Pubmed是医学专业常用的数据库，对于医学科研工作至关重要，但是对于Pubmed最基本的检索知识你都了解吗？下面介绍了Pubmed三种检索方式，检验一下你都get到了吗？

Pubmed主界面

1基本检索

引文状态标记值分为：

[PubMed-indexed for MEDLINE]、[PubMed-in process]、[PubMed-OLDMEDLINE]、[PubMed – as supplied by publisher]四种状态。

[PubMed-indexed for MEDLINE]：

被MEDLINE所收录并被标引MeSH主题词，具有完整的书目题录信息，检索此类文章方法:在检索框输入medline [sb]。

[PubMed-in process]：

每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据，该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、每星期当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时转入MedLine一次，而被处理前的数据从该数据库中删除。检索此类文章方法:在检索框输入inprocess [sb]。

[PubMed-OLDMEDLINE]：

含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要。检索此类文章方法:在检索框输入oldmedline [sb] [PubMed –as supplied by publisher]：

是由出版商提供的电子文献MEDLINE收录范围的文献，每日被添加到In Process Citation中去，换上[PubMed – in process]的标记，并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI；不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID 而没有MEDLINE UI。

布尔逻辑运算符（检索时需大写）

AND

可用来表示其所连接的两个检索项的交叉部分，也即交集部分。如果用AND连接检索词A和检索词B，则检索式为：A AND B：表示让系统检索同时包含检索词A和检索词B的信息集合C。

OR

用于连接并列关系的检索词。用OR连接检索词A和检索词B，则检索式为：A OR B。表示让系统查找含有检索词A、B之一，或同时包括检索词A和检索词B的信息。

NOT

用于连接排除关系的检索词，即排除不需要的和影响检索结果的概念。用NOT

连接检索词A和检索词B，检索式为：A NOT B。表示检索含有检索词A而不含检索词B的信息，即将包含检索词B的信息集合排除掉。

强制限定检索

如果想强制限定检索内容，可用“ ”将检索内容括起来，这样系统不进行自动词语转换和扩展检索，当检索目的十分明确时，可用此方法减少搜索结果数量。

截词符检索

使用截词符可以替代词中的一个或部分字母，扩大搜索结果。截词符“*”可代替多个字符，例如在检索框中输入bacter*代表了bacter、bacteria、bacterium等，pubmed一次最多可以联想出600多个词形变异词，且只针对单词，词组无效；“？”可代替0个或一个字符，例如disease？可代表disease和diseases。

字段限制检索

图中的[MH]就是字段的一种，只需在检索词后加入[字段名称]，就可以限定检索词，使搜索结果更具有指向性。下面就是常用的检索词缩写和中文释义

AB: abstract 摘要

AD: affiliation 第一作者的研究机构和通讯地址（作者单位）

AU：author 作者

1AU: first author name 第一作者

FAU: full author name 作者全称

LASTAU: last author 最后一位作者，责任作者

CN: corporate author 合作者

TI: title 文章英文题目

TA: journal title 期刊的全称、简称、ISSN号

TIAB: title/abstract 题目/文摘

TT: transliterated title 音译题目

PT: publication type 文章出版类型

PL: place of publication 出版国家

VI: volume 期刊卷

DP: PMCID & MIDPublication Date 文章出版日期

EDAT: entrez date 文章录入PubMed的日期

MHDA：MeSH Date 文章添加MeSH词的日期

LA：language 文章出版的语种

GR: grant number 资金资助号、合同号或由美国国家卫生研究院财政支持项目MH: MeSH terms 医学主题词

PA：pharmacological action MeSH terms 药理作用主题词

PMID: PubMed unique identifier PubMed唯一标识码

PS: personal name as subject 人名作为文章的主题词

RN: EC/RN number 酶号或化学物质登记号

SB: subset 子集

SI: secondary source identifier 第二来源标示符

TW: text words 自由文本词

2高级检索

在日常检索中可以在基本检索中输入检索信息在后面加上[所选字段]，例如：搜索Li Yang[author] 其搜索结果与在高级检索中选择作者字段收到的功效相同。3主题词检索

MeSH主题词检索是PubMed最具特色的功能之一，可以大大提高检索的查全率和查准率，这是因为MeSH主题词对同一概念不同的说法进行了规范和统一，主题词加配副主题词使检索更加专指和细化。

特别提示:

只选择主题词可能会漏掉部分文献，尤其是最新发表的文献，因为新发表的文章NCBI还未来的及做出标引，副主题词算是对主题词的一个扩充。在副主题下面有个Restrict to MeSH Major Topic.，意思就是对所选的主题词进行加权，搜索的文献就是必须包含加权了的主题的文章，这在有两个或两个以上主题词的检索中有意义。还有一个是Do not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierarchy.，意思是要你确定是否需要扩展主题词，如果勾选了这两项，那么就提高查准率，但是查全率会降低，所以要是为了查全文献的各位老师同学，一般不建议勾选这两项。

PubMed检索机制及规则

PubMed检索机制及规则 PubMed的检索功能非常强大，在检索中可实现检索词的自动转换、通配符的使用等功能，也可以进行强制性检索。 1 词汇的自动转换功能 在PubMed主页的检索提问框中输入检索词进行检索时，系统将按顺序自动使用如下3种索引，对检索词进行转换后再进行检索。 1.1 Mesh转换表（MeSH Translation Table） 包括MeSH词、参见词、副主题词、出版类型、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS）、补充概念（物质）名称表等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词（或其它词表中的词）和Text word词（题名词和文摘词），并用“OR”组配进行检索，同时停止使用其它的索引进行转换。有些词在转换后可能会出现3个词进行检索。例如：键入“blood"，系统将其转换成"("blood"[MeSH Subheading] OR "blood"[MeSH Terms]) OR blood[Text Word]"后进行检索。 1.2 刊名转换表（Journal Tanslation Table） 包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其对应到相应的刊名进行检索。此外，该转换表能把键入的刊名全称转换为MEDLINE缩写后进行检索。如：在检索提问框中键入：“new england journal of medicine”,PubMed将其转换为“N Engl J Med”后进行检索。 1.3 著者索引（Author Index） 如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词是一个后面跟有1-2个字母的短语，PubMed 即会自动查找著者索引。
如果仍然查不到相匹配的词，PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程，直到找到为止。假如仍然不能找到匹配的词，系统将把各单词用“and”连接，在全部字段中进行查找。 要查看词汇的转换情况，可点击“Details”进行查看。 2 截词检索功能 PubMed 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如：键入“flavor*”，系统会找到那些前一部分是flavor 的单词（如flavored, flavorful, flavoring等），并对其分别进行检索。如果这类词少于600个，PubMed会逐个词检索，若超过600个（如：ca*）,PubMed将显示警告信息，要求增加词汇的开头字母数量。截词功能只限于单词，对词组无效。如：“infection*”包括“infections”，但不包括“infection control”等。 注意：使用截词检索功能时，PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。 3 强制检索功能 如上所述，在PubMed主页的检索提问框中键入一个短语后点击“Go”，系统会用自动转换功能查找到相应的匹配词后再进行检索；但是，当键入的词语无匹配词时，PubMed就会将键入的词语断开后再重复上述自动词汇转换过程，若仍然没有匹配词，系统就将短语分解成单词，再用AND联在一起在全部字段中检索。很明显，这样检索的结果是不符合用户要求的。因此，PubMed允许使用双引号（“”）来强制系统进行短语检索。例如，在PubMed主页的检索提问框中键入“Single cell”，并用双引号引起来，然后点击“Go”，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。
使用双引号检索，会自动关闭词汇转换功能。

新版Pubmed检索攻略

新版Pubmed检索攻略 ——日读一帖，解螺旋大V团队伴你科研路 【科研热点】让你时间比别人花的少、知道的比他早！【基金专栏】国自然等各项基金独到经验见解【SCI 专栏】从开始到接收全程tips【实验技能】这么棒快告诉你老板！关注我们，为您的科研路提速 第一章PubMed概述 笔者最近接到很多同学的微信，说希望看到pubmed的搜索教程，然后就在网上进行了检索，发现网上的教程都是老版的pubmed，比如还有limit按钮等等，其实pubmed改版之后已经变得更加简洁，就行百度搜索框一样，只有一个框和go。而以前的5个功能按钮早早已经删除，在你搜索结果中才可以显示，在我们搜索的左侧。那么下面我们就开始学习学习pubmed的搜索技巧吧！ 我看到很多人用了几年的PubMed，还是只知道在检索框里输入一个关键字，然后按一下'Go'按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的情况，这样的操作就足以得到令人满意的信息，但对于另一半情况，就没有那么幸运了，要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的'无用'信息中，要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。 令人费解的是，很多医务工作者宁可在每次检索时都花

上成倍的时间，却不愿花上几个小时的时间去认真研究PubMed。'君欲善其事，必先利其器'，PubMed就好像一 把功能强大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹，更重要的是，你要知道如何利用准星瞄准，如何把这把枪的功能发挥到及至。 在以后的章节中，我们将逐步深入地了解PubMed，相信通过这些章节的学习，我们可以真正熟练掌握PubMed，从而使自己的工作事半功倍。 第二章PUBMED简单检索技巧 一．在这一章里，我们将对如何应用PUBMED这一得力助手检索文献，作以简单介绍。 1．直接检索。当你打开浏览器，在地址栏内键入 https://www.wendangku.net/doc/534669992.html,/PubMed/ 或是百度pubmed，就进入了PUBMED检索系统主页。在靠近页面上部的地方，首先映入我们眼帘的，即是供我们输入所需查询内容的检索框。这就是改版之后的pubmed，是不是非常简洁？在检索框中输入查询词，然后单击'go'按钮或按回车键，PubMed将会自动开始检索，并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面，你还可以选定所要检索内容的数据库范围，除NCBI的数据库以外，可供选择的还有：PROTEIN、STRUCTURE、POPSET等等。 说到这里，很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符

NCBI之PubMed完全攻略

PubMed完全攻略 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：https://www.wendangku.net/doc/534669992.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed 的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文，有时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了（关于如何获取全文将在以后的章节中详述）。 进入PubMed的主界面后，首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键（如下图）。

PubMed检索原理及途径

PubMed检索原理及途径 1. 检索原理 PubMed具有自动转换匹配功能（Automatic Term Mapping）。对于输入检索框中的检索词，将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换，然后再进行检索。其顺序是：MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。此外，还可进行短语检索，即将短语作为一个词组进行检索，可用双引号将其引起，此时系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。 2. 检索途径 ⑴基本检索 PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏，此外，其左侧栏还提供了几种检索功能：Journals Database , MeSH Database , Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Special Queries, LinkOut, My NCBI (Cubby)。在提问框输入自由词或检索表达式（可直接进行字段限定），点击go 即可进行自由词检索。同样可结合辅助工具栏按钮，进一步检索。 Limits：限定检索。PubMed限制内容较多，可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Entrez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。 History：检索历史。可自动将检索式及结果数量记录到History屏，结合#号进一步检索。#号间可以用布尔逻辑符组佩检索，如#1 AND #2。 例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placenta growth)和氧气(oxygen)的英文文献 步骤：PubMed主页→点击limits，限定时间2004；语种为English→页面最下端点击go，在检索词输入框中,输入placenta gr owth AND oxygen→点击go→得到检索结果。 ⑵主题词检索 点击主页左侧栏MeSH Database，或从上面数据库PubMed下拉菜单中选中MeSH, 即可进入MESH检索界面。 输入提问词，点击go。如不是MeSH词，系统则提供相关概念供选择。 选择出现的MeSH词，可察看下面对该MeSH词的注释。 点击该主题词进入副主题词选择，选中需要的副主题词，也可点击进行加权、不扩展检索。 然后从屏幕上方或下方的display行Send to框的下拉菜单中选择发送地方及组配方式，如要检索，发送到Search Box中，在Search Box中将显示检索表达式，可进行修改和继续添加。 最后点击Search PubMed进行检索。

PubMed检索完全攻略----好东西_吐血狂顶!

PubMed检索完全攻略----好东西，吐血狂顶！ 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入： https://www.wendangku.net/doc/534669992.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与

PubMed 文献检索完全攻略

PubMed检索完全攻略 第一章 进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入： https://www.wendangku.net/doc/534669992.html,/pubmed/ 就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这

PubMed检索

第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入： https://www.wendangku.net/doc/534669992.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和

部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed 挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文，有时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了（关于如何获取全文将在以后的章节中详述）。 进入PubMed的主界面后，首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键（如下图）。 这是PubMed的核心部分。大部分工作，我们只要利用这"一框五键"（检索框，Limit键, Preview/Index键, History键，Clipboard键和Details键）即可完成。 在主界面的左侧框（如左图），有： · Journal Browser 期刊浏览 · MeS h Browser可以用它来分层流览MeSH表 · Single Citation Matcher输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。 · Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。 · Clinical Queries这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围：治疗、诊断、病原学与预后。 · Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式) 3) Related Resources · Order Docume nts可以使用户在当地得到文献的全文，但这是要收费的，至于如何免费获得文献全文，我将在后面的有关章节中详述。 · Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系

PubMed检索完全讲解

PubMed检索完全攻略----好东西，吐血狂顶！2011-11-21 08:57阅读(4)转载 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入： https://www.wendangku.net/doc/534669992.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医

PubMed检索完全攻略----好东西,值得分享!

PubMed检索完全攻略----好东西，值得分享！ 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：https://www.wendangku.net/doc/534669992.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家

生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH ）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed 前都感谢NCBI 呢？ PubMed 覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed 挂钩的出版商会自动向PubMed 提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed ，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed 提供文献的全文，有时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed 上真正享受"坐拥书城"的感觉了（关于如何获取全文将在以后的章节中详述）。 进入PubMed 的主界面后， 首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键（如下图）。 这是PubMed 的核心部分。大部分工作，我们只要利用这"一框五键"（检索框，Limit 键, Preview/Index 键, History 键，Clipboard 键和Details 键）即可完成。 在主界面的左侧框（如左图），有： · Journal Browser 期刊浏览 · MeSh Browser 可以用它来分层流览MeSH 表 · Single Citation Matcher 输入期刊的信息可以找到某 单篇的文献或整个期刊的内容。 · Batch Citution Matcher 用一种特定的形式输入期刊 的信息一次搜索多篇文献。 · Clinical Queries 这一部分为临床医生设置，通过过 滤的方式将搜索的文献固定在4个范围：治疗、诊断、 病原学与预后。 · Old PubMed (使用旧式的PubMed 查询方式) 3) Related Resources · Order Documents 可以使用户在当地得到文献的全 文， 但这是要收费的，至于如何免费获得文献全文，我 将在后面的有关章节中详述。

Pubmed检索攻略

PUBMED简介 一、何为PUBMED？ PUBMED是美国国立卫生研究所（NIH）下属美国国立医学图书馆（NLM）开发的因特网检索系统，建立在国立生物医学信息中心（NCBI）平台上。PUBMED主要提供基于WEB的MEDLINE数据库检索服务，其中包括医学文献的定购、全文在线阅读的链接、专家信息的查询、期刊检索以及相关书籍的链接等。 二、PUBMED与图书馆光盘版本的MEDLINE有何不同？ PUBMED与光盘版本MEDLINE的不同之处在于：由于互联网的及时性，PUBMED的更新速度快于光盘版，光盘版本的更新周期是3个月，而PUBMED的更新周期是1天，PUBMED包含了一些尚未收录入光盘版MEDLINE的最新文献信息，因此PUBMED享有PRE-MEDLINE的美誉。 三、如何进入PUBMED检索系统？ 在浏览器地址栏中输入网址：https://www.wendangku.net/doc/534669992.html,/pubmed/ 四、PUBMED主页的基本组成？ PUBMED的检索系统大致由三个板块组成：页面上方的检索框和功能按钮（Limit、Preview/Index、History、Clipboard、Details）。在检索框"for"后面的空格中输入需要查询的关键词，点击"go"会出现相关的文献。每个功能按钮的具体功能下面会逐项介绍。左面的导航条指向PUBMED的一些其它功能板块，如MeSH Browser、Journal Browser等。剩下的右下方大片空间便是显示检索结果的空间。

五、PUBMED的主要功能按钮组成？ PUBMED的主要功能按钮有五种：Limit按钮、Preview/Index按钮、History按钮、Clipboard按钮和Details按钮。 六、LIMIT 按钮的主要功能？ 当点击Limit按钮，将出现以下界面： 各下拉框的基本作用如下： All Field：下拉可选择搜索的范围，如作者名、关键词等 Publication Types:下拉可选择所查文献的类型，如临床试验、荟萃分析等 Ages:下拉可选择所查文献研究对象的不同年龄组 Entrez Date:下拉可选择所查文献距离现在不同时间范围 Publication Date:下拉可选择限定所查文献发表日期 Language:下拉可选择所查文献的语种 Human or Animal:下拉可选择所查文献的研究对象：人或动物 Subset:下拉选择不同的医学网络系统，可查询特殊领域的文献AIDS, TOXICITY 七、Preview/Index按钮的功能？ 点击Preview按钮，可以预览检索的结果，此预览功能使我们浏览结果前，先知道查询的结果数量，从而可估计是否有必要进一步修改检索式以缩小或扩大检索范围，避免每次因传输大量的无用数据而浪费时间。 Index按钮的功能则使我们在输入一个检索词之后知道这个检索词将导出多少篇文献，同时其特有的允

PubMed完全攻略

文献首页生物动态实验方法软件应用生物信息产业信息其他文档七嘴八舌软件下载 PubMed完全攻略(一) 作者:佚名整理时间:2005-08-19 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：https://www.wendangku.net/doc/534669992.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed 所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文，有时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了（关于如何获取全文将在以后的章节中详述）。 进入PubMed的主界面后，首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键（如下图）。

PUBMED检索

?主题词(Mesh Heading)，又称叙词Descriptor,从信息内容中抽取出来的、能表达信息实质内容的规范化专业名词或术语?款目词，又称入口词，entry word,主题词的同义词或近义词?副主题词（Subheading）, 又称为限定词（Qualifiers）, 对主题词进一步限定的规范化用词 ?缩小检索范围，获取最专指的文献 ?举例：茶碱治疗哮喘 ?哮喘 asthma（指"asthma"[MeSH Terms] OR asthma[Text Word]）99696 asthma[mesh]（指"asthma"[MeSH Terms] ）81824 ?哮喘的药物治疗 asthma/drug therapy19695 ?茶碱（theophylline)治疗哮喘(2352) theophylline/TU7366 Medline：是PubMed的主体部分。[PubMed--Indexed for MEDLINE]。 OldMedline：含1950-1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录中没有MeSH字段和摘要字段，记录的标记是[PubMed - OLDMEDLINE for Pre1966]。 PreMedline：是Medline的前期数据库，收录的是那些正在等待标引的文献，其作用在于缩短文献报道时差。[PubMed--in Process] Publisher-Supplied Citations：出版商提供的电子期刊中有一些属于

选择性收录期刊。[PubMed - as supplied by publisher] PubMed主页上提供与NCBI的7个数据库建立了超链接Nucleotide：DNA序列数据库 Protein：氨基酸（蛋白质）序列数据库 Genome：基因组序列数据库 Structure：分子结构模型数据库 Popset：种群、种系发生或突变序列数据库 Taxonomy：生物分类数据库 OMIM：人类孟德尔遗传学在线数据库 Books：相关图书 注：在检索提问框内输入的检索词若不用字段限定，系统依次到下列3个表中进行词语的核对、转换和检索：①MeSH转换表(MeSH Translation Table)、②刊名转换表(Journals Translation Table)、③著者索引(Author Index)。如果在MeSH转换表中找到了相匹配的检索词，系统用MeSH词和Text Word词(TI、AB、MH、NM、PS、OT等字段中的词)一起进行检索。如果在MeSH转换表中未找到匹配的检索词，系统接着到刊名转换表和著者索引中搜词检索。如果在上述3个表中都找不到匹配的短语，系统将短语拆小，继续到这3个表中搜索，短语断开部分的逻辑关系是AND。如果拆到单词在以上3个表中还是找不到匹配词，将到所有字段中去搜索这些单词，单词之间的逻辑关系也是AND。 作者检索Smith j模糊（Smith JD/JR/J等）

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PubMed 检索系统 PubMed 检索系统 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆 （U.S.National Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。 PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据，可为用户提供基本的文献条目和文摘，其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据，这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明，并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送，但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代，例如在综合性的科学杂志（Science或Nature）上发表的地理学文章等。 PubMed 系统的主要特点 PubMed 检索 Details 键的用法 存储检索策略--URL 键的用法 特征栏（Feature Bar）介绍 检索结果的显示、存盘、打印 PubMed 详解 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping）在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。 （1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词（题名词和文摘词）进行检索。例如：键入“Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 （2）刊名转换表（Journal Tanslation Table），包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦 注：在本文中的叙述中，所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来，如以基因治疗为主题词检索，在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。 PubMed简介 PubMed是由隶属于美国国家卫生部（NIH, National Institues of Health）的国家医学图书馆（NLM, Nationa Library of Medicine）下属的国家生物技术信息中心（NCBI, National Center for Biotechnology Information）提供，可通过NCBI网站的Entrez检索系统（Entrez retrieval system）进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。此外，PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务，与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据，提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA 与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统，可检索NCBI网站的主要数据库，如PubMed，核酸与蛋白序列，基因组序列，蛋白结构，OMIM等等。PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库，此外，它还针对网上资源，提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源，如核酸蛋白序列、OMIM入口等，以及其它生命科学数据库。其文献内容的提供方式，由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。如果该出版商有网站，则NCBI会提供相应的网络出口。MEDLINE 及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。 PubMed服务内容概括 基于互联网WWW的MEDLINE及PreMEDLINE引文数据库免费检索系统。 提供MEDLINE、PreMEDLINE与其他相关数据库接入服务，如NCBI的其它数据库DNA与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线，及NCBI外的其它数据库。 提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据等等。 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆（U.S.National Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及临床医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。 随着国内互联网的普及，网络已逐步地成为一名医务工作者获取多种信息的有效渠道。网络已成为医学研究者追踪国际研究进展，了解世界先进水平的一个重要手段。 传统的医学文献检索（MEDLINE）尽管在本地局域网提供的情况下，具有高速的特点。但与互联网

PubMed检索步骤

PubMed检索步骤 1、PUBMED 词汇自动转换功能：例如：在键入“Vitamin c",点击"Go",再点击"Details"显示("ascorbic acid"[MeSH Terms] OR vitamin c[Text Word])，看一下主题词是什么？所用词汇是否合适？然后点击“Preview/Index”显示你所用的检索词、检中的篇数、所用时间。也可点击“limit"进行检索。检索时可以使用通配符"*"进行截词检索或用双引号进行强制检索词检索。 2、著者强制检索：作者用双引号括起来"zhang y" [au]；比较一下分别输入zhang yun ;yun zhang,zhang y; zhang y [au]；"zhang y" [au] 检索结果的区别。 3、刊名检索：可用刊名全称或缩写、ISSN号，再加上刊名子段限定符，如：输入J Tradit Chin Med [ta] ，然后敲回车或点击Go，系统将在刊名子段中检索，并显示检索结果。点击“History”可以查看检索历史。 4、布尔逻辑检索：系统允许使用布尔逻辑检索，布尔逻辑运算符要大写（AND、OR或NOT）。 5、剪贴板：使用"send to Clipboard",可把检索结果存入剪贴板，剪贴板最多可存放500条记录。只要剪贴板中有记录，就可点击Clipboard查看其中的记录（记录为summary格式），粘贴板按记录存放的先后顺序显示记录题录。 6、当前页显示篇数默认为20篇，如果需要可调整当前页的篇数“5、10、20、50、100、200、500”篇。检索结果默认summary格式（题录格式），可以选择display下拉菜单中的Abstract（文摘），以文摘格式显示。 （一）基本检索 1. 检索2000年以来收录我院孙保亮老师作为第一作者的论文数量 2.检索PubMed收录山东大学姓王的作者所有的文献 3. 字段限制检索：检索作者Jone W Smith发表的论文标题中含癌症治疗方面的文献。 提示：smith jw[AU] AND (cancer[TI] OR tumor[TI] OR neoplasms[TI] ) AND (treatment[TI] OR therapy[TI]) 4. 利用PubMed检索检索作者 Bishop B近5年来发表在J Biol Chem 期刊上的文献。请写出检索步骤。 5. 检索期刊N Engl J Med的全称，并通过济南泉方网站或Medsci网站查到2012年SCI的影响因子。 6.自己的名字在英文杂志上的书写格式？ 7. 利用PubMed检索J Allergy Clin Immunol期刊近五年来非综述性文献。 8. 检索PubMed收录《中华内科杂志》(zhonghua nei ke za zhi)的论文有多少篇？ 9.请利用PubMed检索2008年11月以来发表在BMC Public Health上的文献中，由Free full article免费全文文献有几条？请写出以Ahonkhai VI为最后一名作者的文献篇名。 10. 德国科学家哈拉尔德?楚尔?豪森（Harald zur Hausen）因发现导致宫颈癌的HPV（人乳头状瘤病毒）而获得2008年诺贝尔生理学或医学奖。请利用PubMed 回答该作者2008年是否发表了有关HPV的文章？如有，请写出该文的出处。

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PubMed检索系统简介 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆（U.S.National Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。 PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据，可为用户提供基本的文献条目和文摘，其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据，这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明，并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送，但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代，例如在综合性的科学杂志（Science 或Nature）上发表的地理学文章等。 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping） 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。 （1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord 词（题名词和文摘词）进行检索。例如：键入“Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 （2）刊名转换表（Journal Tanslation Table），包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN 号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如：在检索提问框中键入：“new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。 （3）短语表（Phrase list）。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS: Unified Medical Language System）和补充概念（物质）名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词，就会查找短词表。 （4）著者索引（Author Index）。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语，PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词，PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程，直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词，单个词会被联一起（用AND）在全部字段中检索。 如："single cell"，系统就会自动将其分成两个词：“single“和“cell”检索，其检索表达式为：“single AND cell”。要查验检索词的转换情况，可点击“Details”键。