文档库 最新最全的文档下载
当前位置:文档库 › SNP Array

SNP Array

SNP Array
SNP Array

SNP Array

在一张约一厘米见方的固体(通常是硅或玻璃)平面上固定大量称之为探针的短序列。探针与样品中的靶序列在一定条件下发生杂交反应,通过荧光、化学发光标记的方法读取每个位点的复杂信息。它是生物学家受到计算机芯片制造和广为应用的启迪,融微电子学、生命科学、计算机科学和光电化学为一体,在原来核酸杂交(Northern、Southern)的基础上发展起来的一项新技术

基因芯片技术的优点:

(1)实验所需DNA样本量较少,一次实验即可检查全基因组的染色体拷贝数变化,可实现一次实验同时检测多种疾病。

(2)不仅适用于外周血、培养细胞和新鲜组织样本的研究,还可用于对存档组织的研究,也可用于因DNA量过少而经PCR扩增的样本的研究。

Array-CGH是在CGH(Comparative Genomic Hybridization,比较基因组杂交)技术上发展起来的芯片技术。其原理是:先分别将样本与正常人基因组DNA打碎,再利用双色荧光杂交的策略,对样本基因组DNA片段进行红色荧光(Cy5荧光素)标记,而对照的正常人基因组DNA片段用绿色荧光(Cy3荧光素)标记,再将这些标记后的片段作为探针,与高密度的涵盖整个人类基因组的DNA芯片杂交。通过这两组探针的竞争杂交,再利用共聚焦显微镜等数码摄像系统对结果进行扫描,并对芯片上每个点(对应于人类基因组的不同位置)的发光强度进行比较。红绿色均等的区域是样本细胞与正常细胞均具有的正常部分,而红色较强的部分即样本染色体区域重复的部分;反之,以绿色为主的部分则是样本染色体缺失的部分,以此对染色体拷贝数的变化进行定量研究。

Array-CGH芯片技术的局限性:

(1)检测到的最小的DNA重复或缺失是在3-5Mb,故对于低水平的DNA重复或缺失会漏检。

(2)相差染色体的拷贝数不变时,不能检测出平等染色体的易位。

(3)无法检测拷贝数不变的染色体异常,如单亲二倍体和杂合性缺失。

SNP-array芯片技术

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性而形成的遗传标记。一般而言,SNP 是指变异频率大于1%的单核苷酸变异。在人类基因组中大概每1000 个碱基就有一个SNP,人类基因组上的SNP 总量大概是3×106个。

SNP-array芯片技术是含有大量SNP位点序列的高密度芯片。与array-CGH技术相比,除了可检测染色体拷贝数变化外,还可获得SNP信息。目前最先进的SNP-array芯片的点阵密度可高达106~1010/cm2,如此高的点阵密度足以在一张芯片上涵盖整个物种的全基因组信息。与array-CGH不同的是,SNP-array芯片实验只需将样本DNA与芯片杂交,而不需要正常人基因组DNA做参考,避免了两种荧光染料之间的互相影响。另外,SNP-array是采用oligo 探针合成的方法,探针更短,分辨率比array-CGH更高,最小可以检测几十kb以上的微小重复或缺失,可提供的信息更加精细、全面。

图像中角点(特征点)提取与匹配算法

角点提取与匹配算法实验报告 1 说明 本文实验的目标是对于两幅相似的图像,通过角点检测算法,进而找出这两幅图像的共同点,从而可以把这两幅图像合并成一幅图像。 下面描述该实验的基本步骤: 1.本文所采用的角点检测算法是Harris 角点检测算法,该算法的基本原理是取以目标像素点为中心的一个小窗口,计算窗口沿任何方向移动后的灰度变化,并用解析形式表达。设以像素点(x,y)为中心的小窗口在X 方向上移动u ,y 方向上移动v ,Harris 给出了灰度变化度量的解析表达式: 2 ,,|,|,,()(x y x y x u y v x y x y I I E w I I w u v o X Y ??= -=++??∑∑ (1) 其中,,x y E 为窗口内的灰度变化度量;,x y w 为窗口函数,一般定义为2 2 2 ()/,x y x y w e σ +=; I 为图像灰度函数,略去无穷小项有: 222222 ,,[()()2]2x y x y x y x y E w u I v I uvI I Au Cuv Bv = ++=++∑ (2) 将,x y E 化为二次型有: ,[]x y u E u v M v ?? =???? (3) M 为实对称矩阵: 2 ,2 x y x x y x y y I I I M w I I I ???= ???????∑ (4) 通过对角化处理得到: 11 ,200x y E R R λλ-??= ??? (5) 其中,R 为旋转因子,对角化处理后并不改变以u,v 为坐标参数的空间曲面的形状,其特征值反应了两个主轴方向的图像表面曲率。当两个特征值均较小时,表明目标点附近区域为“平坦区域”;特征值一大一小时,表明特征点位于“边缘”上;只有当两个特征值均比较大时,沿任何方向的移动均将导致灰度的剧烈变化。Harris 的角点响应函数(CRF)表达式由此而得到: 2 (,)det()(())C RF x y M k trace M =- (6)

机构、岗位设置及岗位职责

目录 一、机构设置框图 (1) 二、部门职责及机构编制 (2) 一)、监事会 (2) 二)、董事会 (3) 三)、总经理办公室 (3) 四)、行政部 (5) 五)、财务部 (6) 六)、生产部 (7) 七)、研发部 (9) 八)、销售部 (10) 三、岗位职责 (12) 一)、监事长 (12) 二)、监事 (12) 三)、董事长 (13) 四)、董事 (14) 五)、总经理 (15) 六)、总经理助理 (16) 七)、行政部经理 (16)

八)、财务部经理 (17) 九)、生产部经理 (18) 十)、研发部经理 (19) 十一)、销售部经理 (20) 十二)、办公室主任 (21) 十三)、公关部主任 (23) 十四)、车间主任 (24) 十五)、督查 (25) 十六)、采购部主任 (26) 十七)、库管 (27) 十八)、销售代表 (29) 十九)、市场部主任 (30) 二十)、财务会计 (31) 二十一)、成本会计 (32) 二十二)、出纳 (33)

岚皋县民主烟花爆竹有限责任公司机构设置及岗位职责 (征求意见稿) 岚皋县民主烟花爆竹有限责任公司经改制后已经营运了一年的时间,在这一年时间里公司在内部管理、对外联络、产品销售上都取得了斐然的成绩,公司整体面貌也有了巨大的变化,公司员工的工作积极性也得到了提升。但也暴露出了一些问题,如岗位职责不明确、管理制度不健全等。 为了进一步合理分配公司资源,明确各部门职责,使部门设置能有效发挥职能部门的作用,确保公司的长足发展,根据公司目前的实际情况,现将管理部门的编制和组织结构设置做出如下方案:一、机构设置框图

SNP与基因型和疾病表型之间的关系

SNP与基因型和疾病表型之间的关系3 随着人类基因组计划精确序列图的完成,功能基因的克隆与鉴定、人类基因组多样性的研究也提到日程,而这些研究的进行将依赖于精细和精确的遗传标记的选择和应用。在人类基因组计划研究的历史上,RF LP(restriction fragment length polym or2 phism)和STR(short tandem repeats)作为上两代遗传标记,在物理图和遗传图的构建、序列草图的拼接和装搭过程中曾起到决定性的作用。但这些遗传标记依然存在多态性不高、无法摆脱电泳分型、难以实现大规模检测和自动化、难于进行基因判定等缺点。1996年由美国的https://www.wendangku.net/doc/707851838.html,nder提出了并称之为“第3代遗传标记”的“单核苷酸多态性”(single nucleotide polym orphism, S NP)。S NP即以基因组序列中一个核苷酸的变异而导致DNA序列的变化(多态性)为基础。由于所有遗传多态性的分子基础均为核苷酸,因此S NP在密度上有可能达到人类基因组多态位点数目的极限。S NP与RF LP和STR等DNA标记的根本不同,是不再以长度的差异作为检测手段,而直接以序列的变异作为标记;在理论上,S NP有可能在核苷酸水平上,把序列图、物理图与遗传图最终有机地整合、统一起来;在技术上,S NP可以完全摆脱电泳分型的瓶颈,而采用最新的非电泳分型技术等。以下就S NP与基因型和疾病表型之间的关系作一简介。 1 鉴定SNP 发现核苷酸的变体不是一件困难的事情,每天,许多分子遗传学家在他们的研究工作中会不经意间偶然发现。直接地S NP发现可采取对一个有一定规模的基因组并行测序的战略,如对Y染色体;或在看似候选基因的基因内寻找,如心血管疾病、炎症性疾病和Ⅱ型糖尿病等复杂性遗传病。然而,一些生物信息学小组正在应用“in silico”中储存的序列资料寻找S NP。 C.Lee描述了EST数据库如何提供了成千上万个个体的表现度,通过序列比对,使编码S NP的发现成为可能。同样的数据采集方法已经被用于重叠BAC的克隆。这种日积月累的结果使在S NP数据库(dbS NP)和人类基因组数据库(HG BASE)已有超过二百万个候选S NP。现在的任务是证实这些已发现的S NP,即由于序列错误、重复区域和选择性剪接而产生假的S NP变体。此外,由于这些S NP来自世界不同的人群,还有如下未完成的工作要做:一方面,要确定S NP的等位基因频率;另一方面,要区别在某单一人群中特殊的S NP。 2 SNP的应用 涌向S NP发现和分析淘金热的心理起源于推测它们在两个方面的应用潜力。一方面是应用S NP探索复杂疾病的分子遗传学基础,另一方面是应用S NP进行基因自动分型的可靠性。推荐应用S NP多位点作图的方法用于病例———对照(case2con2 trol)研究,其目的是鉴定某一位点的特殊等位基因和某一特定表型统计学上的显著相关性。广泛的基因组相关性研究的设计依赖于人们关于变异的设想,即变异构成复杂性状的基础。一直争论的问题是H ome sapiens在“hominids”有限的遗传变异中是否不同寻常。然而,关于构成人类常见疾病表型的变异已出现两种相互竞争的学说,其正确的学说将指导研究设计。 (1)常见病Π常见变体(C DΠC V)学说:C DΠC V学说认为这些常见病的等位基因在地球的人类迁移以前已经存在,或者这些通过正选择的等位基因在一定程度上(以显著的比例)代表易感性等位基因。在现存的人群中,预测这些等位基因授予人群以中度的危险性,并在人群中出现相对高的频率(>1%)。它们出现的高频率意味着在大规模的人群中进行相关性研究对于鉴定危险性等位基因将是富有成效的。https://www.wendangku.net/doc/707851838.html,nder(Whitehead Institute)引证了ApoE34等位基因的例子,该等位基因使对阿尔茨海默病(Alzheimer disease)的易感性增加;CCR52△32等位基因可防止被HI V-1感染。以上是在一些独立(特殊)的人群中产生一些常见变体的例子。在C DΠC V学说的指导下,现在主要的问题是要对公共变体库中的所有变体进行实验分析,或者对每一变体进行直接评价,或者对来自祖先的基因片段进行间接实验分析。从根本上说,目前通过环境导致变体的连锁不平衡度(LD)的研究方法是有限的。在大多数群体中,一个大样本的群体模型预测靠近共同变体的显著的LD一般将不会跨越3kb的基因组。然而,最近以经验为根据的研究已经给出了一个非常乐观的理由,在一个有北欧血统的美国人群中跨越60kb的区域显示了显著的LD。在2001年10月出版的《Nature genetics》发表了一系列的论文,表明被重组热点所中断的大范围基因组区域的连锁不平衡是人类基因组的一个特征。通过代表性的S NP定义有限数量的常见单体型好象能解释大多数的单体型。提示:应用代表性的S NP进行相关性研究将鉴定与疾病易感性增加有关的常见的单体型,形成构建人类基因组单体型图谱的必要基础,即鉴定所有主要的单体型和它们特征性的S NP。 (2)常见病Π稀有等位基因学说(C DΠRA):另一方面,C DΠRV学说的支持者认为,他们没有理由预期大多数常见遗传病是由常见的等位基因引起的。该学说最近被正式接受,应用群体模型在疾病位点预期了广泛的等位异质性(不均一性)。A. Clark已经扩展了该学说的研究工作,表明在人口爆炸性增长和分散以后,人类常见病的99.9999%的突变已经出现。另外,许多研究者相信,在复杂的疾病中我们可预示有意义的位点和异质性。观察与孟德尔疾病类似的疾病,C DΠRA的支持者指出视网膜炎色素沉着和非症状性常染色体隐性耳聋的遗传和等位异质性,这些“简单”的孟德尔疾病带有多个已知位点和一系列的疾病等位基因。如果这个方案适用于常见病的研究,在不均一人群中进行广泛的基因组疾病相关性研究将是无效的。J. T erwilliger争辩说,采用远交人群的病例———对照研究,通过遗传(血缘)查找鉴定等位基因没有令人信服的根据。在上一年的一个评论中上述观点引起注意。J.T erwilliger断言,那些我们估计遗传和等位异质性较低的方法在家系和具有独特来历的人群研究中会始终得到应用。鉴于目前仅把构建人类单体型图谱计划的重点放在常见等位基因上,而在一定程度上,那些稀有等位基因也可以解释常见病,在分析远缘人群时单体型图谱将是有用的,可以减少不一致性。 3 回归到生物学 无论常见或稀有等位基因被证实与某一特殊疾病发病风险相关,对所有的研究者而言,下一步的研究策略是相同的:一旦鉴定某一单体型与对某一疾病的易感性相关,那些定义单体型的所有S NP将被作为候选的致病因素。在这一点上,S NP达到遗传学研究的极限,必须重新回归到生物学。研究策略方面,基因型和表型之间关系的阐明将是21世纪面临的最大挑战和重要任务之一。 3第四届单核苷酸多态性和复杂基因组分析国际会议(The fourth international meeting on single nucleotide polym orphisms and complex genome analysis) 顾明亮 摘译自:Challenges for the21st century.Nature G enet,2001,29:353-354 邱长春 审校 ? 1994-2009 China Academic Journal Electronic Publishing House. All rights reserved. https://www.wendangku.net/doc/707851838.html,

执行部机构设置及岗位职责

执行部机构设置及岗位职责 部门建制 根据行政管理的要求,建立垂直管理模式的部门编制(组织架构图),以总监责制为核心,全面地建立销售各环节岗位职责,使部门业务发展责、权、利有效落实,真正做到工作配合的有效性,体现团队运作精神,确立了岗位职责的基本框架后,统一管理,分配执行部所属人员的岗位工作。 组织架构图 岗位职责 执行总监具体岗位职责: 管理权限:管理、培训本部门成员;完善本部门制度; 管理责任:协调部门内工作,有效调动部门员工工作积极性; 1、负责与策划部门及客户就相关活动进行沟通、协调,按要求及其提供的资料来开展工作; 2、负责编制总体活动方案的细化及执行计划方案,并按具体执行情况对方案进行修改、汇总; 3、将策划方案转化为具体的行动计划,细化执行流程,并提供最优性价比的执行方式; 4、就活动方案、计划的具体落实与工作人员进行分工及对接,协调活动进行中的突发状况; 5、负责项目的具体执行工作,全程监控,保障活动的顺利完成,并对其他部门配合开展的各 类主题活动进行指导、监督和反馈; 6、监督负责部门编制活动策划部工作总结、内部管理制度等相关材料; 7、监督负责各项活动相关资料的收集、整理、归档工作; 9、负责部门的组织协调工作、部门日常管理及上级交办的任务; 10、负责监督部门回收、整理、归纳活动所需道具,物品,做到不丢失,不损坏; 11、活动结束后负责组织回访客户,记录客户满意度,活动的有点以及不足之处; 12、管理、指导、监督项目团队开展工作,对部门员工进行业务评估和绩效考核; 13、熟练运用公司的工具和模板保证项目的有效管理及执行; 14、审核执行表格稿并确保质量,监管全过程,及时发现问题,提出解决方案; 15、完成总经理交待的临时事宜。 执行经理具体岗位职责: 1、负责与策划部门及客户就相关活动进行沟通、协调,按要求及其提供的资料来开展工作; 2、负责编制总体活动方案的细化及执行计划表,并按具体执行情况对方案进行修改、汇总; 3、将策划方案转化为具体的行动计划,细化执行流程,并提供最优性价比的执行方式; 4、就活动方案、计划的具体落实与工作人员进行分工及对接,协调活动进行中的突发状况; 5、负责项目的具体执行工作,全程监控,保障活动的顺利完成,并对其他部门配合开展的各类主题活 动进行指导、监督和反馈; 6、负责编制活动策划工作总结、内部管理制度等相关材料; 7、负责各项活动相关资料的收集、整理、归档工作; 8、负责活动前期物料跟踪安装、业务及知识学习、信息上报等相关工作; 9、协助部门的组织协调工作、部门日常管理及上级交办的任务; 10、负责回收、整理、归纳活动所需道具,物品,做到不丢失,不损坏;

Harris角点检测算法编程步骤及示例演示

Harris角点检测算法编程步骤及示例演示 也不说那么多废话了,要介绍啥背景意义之类的,角点检测,顾名思义,就是检测角点,最简单的就是两条线的交点了,还有比如下国际象棋的棋盘格子的交点之类的,反正就是检测这些点。 简单将Harris角点检测算法的思想说下,就是拿一个小窗在图像中移动,通过考察这个小窗口内图像灰度的平均变换值来确定角点。(1)如果窗口内区域图像的灰度值恒定,那么所有不同方向的偏移几乎不发生变化; (2)如果窗口跨越一条边,那么沿着这条边的偏移几乎不发生变化,但是与边垂直的偏移会发生很大的变化; (3)如果窗口包含一个孤立的点或者角点,那么所有不同方向的偏移会发生很大的变化。 下面给出具体数学推导: 设图像窗口平移量为(u,v),产生的灰度变化为E(u,v), 有E(u,v)=sum[w(x,y)[I(x+u,y+v)-I(x,y)]^2],其中w(x,y)为窗口函数, I(x+u,y+v)为平移后的灰度值,I(x,y)为平移前的灰度值。 有泰勒公式展开可得: I(x+u,y+v)=I(x,y)+Ix*u+Iy*v+O(u^2,v^2); Ix,Iy分别为偏微分,在图像中为图像的方向导数. 因此E(u,v)=sum[w(x,y) [Ix*u+Iy*v+O(u^2,v^2)]^2], 可以近似得到E(u,v)=sum[w(x,y) [Ix*u+Iy*v]^2],即 E(u,v)=[u,v][Ix^2,Ix*Iy;Ix*Iy,Iy^2][u,v]T

令M=[Ix^2,Ix*Iy;Ix*Iy,Iy^2],因此最后对角点的检测成了对矩阵M的特征值的分析了,令M其特征值为x1,x2; 当x1>>x2或者x2>>x1,则检测到的是边缘部分; 当x1,x2都很小,图像窗口在所有移动的方向上移动灰度级都无明显变化. 当X1,X2都很大时且相当,检测到的是角点。 编程时用x1,x2不方便,因此定义角点响应函数; R=det(M)-k(trace(M))^2; 其中det(M)为矩阵M的行列式,trace(M)为矩阵M的迹。 下面给出更具数学公式实际编程的步骤: 1.利用水平,竖直差分算子对图像的每个像素进行滤波以求得 Ix,Iy,进而求得M中的四个元素的值。 M=[Ix^2,Ix*Iy;Ix*Iy,Iy^2] 2.对M的四个元素进行高斯平滑滤波,为的是消除一些不必要 的孤立点和凸起,得到新的矩阵M。 3.接下来利用M计算对应每个像素的角点响应函数R,即: R=det(M)-k(trace(M))^2; 也可以使用改进的R: R=[Ix^2*Iy^2-(Ix*Iy)^2]/(Ix^2+Iy^2);里面没有随意给定的参数k,取值应当比第一个令人满意。 4.在矩阵R中,同时满足R(i,j)大于一定阈值threshold和R(i,j)

高通量SNP基因分型技术研究进展

10 Sheng W et al.J Virol,2003;77(6):3859 11 C ohen J I,et al.J Virol,1999;73(9):7627 12 Wei MX et al.Cancer Res,1994;54(7):1843 13 G ao Y et al.Oncogene,2002;21(5):825 14 T anner J E et al.J In fect Dis,1997;175(1):3815 Decaussin G et al.Cancer Res,2000;60(19):5584 16 Brink AA et al.J Clin M icrobiol,1998;36(11):3164 17 Hayes DP et al.M ol Pathol,1999;52(2):97 18 zur Hausen A et al.Cancer Res,2000;60(10):2745 (2002211201 收稿) 高通量SNP基因分型技术研究进展 方唯意综述 姚开泰审阅 中南大学湘雅医学院肿瘤研究所(长沙,410078) 摘要 在后基因组时代,单核苷酸多态性研究已迅速成为了生物医学许多领域的焦点。发展可靠、敏感、经济、稳定、高通量的S NP基因分型技术已迫在眉睫。本文主要着重于高通量S NP基因分型技术的原理、利弊以及这些技术在这个领域过去几年中的进展。 关键词 高通量;单核苷酸多态性;基因分型 单核苷酸多态性(S NPs)是最普遍的遗传变异形式。通过开展具有明显表型特征的S NPs基因分型大规模相关研究,有助于鉴定许多复杂疾病原因,了解个体对各种药物的耐受性和对环境因子的反应。人类基因组测序的完成和142万个S NPs在基因组上的定位[1],为首次在全基因组水平上进行S NPs研究打开了方便大门。经典的S NPs分析方法是PCR 扩增后用凝胶电泳检测,虽然可靠性好,但缺乏效率。寡核苷酸微阵列和其他高通量筛选技术效率有了明显的提高,但临床应用绝非可靠,因此,有必要改进和发展新的可靠、敏感、高通量、经济、稳定的S NPs基因分型技术。在本文中,我们主要阐述高通量S NPs基因分型方法,包括一步均质法、焦磷酸测序、DNA芯片/阵列分析法、微球法、MA LDI2T OF质谱基因分型分析法等,讨论这些技术的目前状态和将来潜力。 1 一步均质法 T aqman、Scorpion分析和分子灯塔组成了微滴定平板荧光阅读系统。T aqman和分子灯塔都依赖于等位基因特异性寡核苷酸杂交在PCR期间对等位基因进行区分。而Scorpion分析能使用等位基因特异性PCR或是等位基因特异性杂交反应[2]来区分等位基因。它们作为一个末端分析能在一个完全均质的反应条件下进行分析。在反应起始,所有试剂和基因组DNA都混合在一起,经热循环步骤后,荧光信号能被检测到。该反应既没有单独的预扩增步骤,也没有中间的处理过程,因此它们是一种最简单的分析方法。由于没有适合这些方法的384孔荧光检测器,以及荧光标记探针的价格过高和缺乏可靠的自动化基因型呼叫软件,因此阻碍了这些方法的发展。最近,Applied Biosystems公司新开发的7900HT型高通量荧光定量PCR仪,使得进行384孔微滴定平板荧光检测成为了可能,这主要归因于高通量能力的增加和反应容积的减少。当如果要发展更高的基因分型通量时,一个可靠的自动化等位基因呼叫能力是必须的,它不只是纠正基因型呼叫信号更快,而且在处理和加工数据上必须更迅速,更准确。近来研究表明,自动化基因型呼叫在无阳性对照情况下进行聚类分析是可行的[3]。 2 焦磷酸测序Pyrosequencing 焦磷酸测序是对短到中等长度的DNA序列样品进行高通量、精确和重复性好的分析方法。其反应原理是当测序引物与PCR扩增的,单链DNA模板杂交,和各种酶包括DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶、三磷酸腺苷双磷酸酶、以及底物、荧光素一起共同孵育。4种dNTP之一被加入反应体系,如与模板配对,该dNTP与引物的末端形成共价键,dNTP 的焦磷酸基团释放出来。ATP硫酸化酶在APS存在的情况下催化焦磷酸生成ATP,ATP驱动荧光素酶介导的荧光素向氧化荧光素的转化,氧化荧光素发出的可见光信号与ATP量成正比。ATP和未掺入的dNTP由三磷酸腺苷双磷酸酶降解,光信号淬灭,并再生反应体系,然后再加另一种dNTP继续反应。焦磷酸测序最初作为DNA测序方法而发展起来的,其化学反应与Sanger双脱氧二核苷酸法完全不同。它无需灌胶、毛细管电泳,也无需同位素或荧光染料

角点检测算法综述

角点检测算法综述 范娜,俞利,徐伯夏 (中国航天科工集团第三研究院8357所天津300308) 摘要:角点作为图像的一个重要特征,它保留了图像绝大部分的特征信息。角点在三维场景重建、运动估计、目标跟踪以及图像配准与图像匹配等计算机视觉领域有着重要的作用。本文对角点检测算法的类别进行总结,对各类算法进行了详细介绍,并对近几年来各类算法发展与改进进行了总结。 关键词:特征信息;计算机视觉;角点检测 Survey of Corner Detection Algorithms FAN Na, YU Li, and XU Bo-xia (The 8357 Research Institute of the Third Research Academy of CASIC Tianjin 300308) Abstract:As a more important feature of image, corner contains voluminous information of image features.In the domain of computer vision, such as three-dimensional reconstruction, motion estimation, object tracking, image registration and image matching, corner of image play an important role.this paper attempt to summarize and detailedly introduce corner detection algorithms, and summarize the developments of these algorithms in recent years. Key words: Feature Information;Computer Vision;Corner Detection 1 引言 角点并没有明确的定义,一般将图像中亮度变化剧烈的点或图像边缘上曲率取极大值的点认为是角点。从形态上来说,角点包括L、T、Y、X和箭头型角点等。角点作为图像的重要特征,保留了图像的绝大部分的特征信息,又有效地减少了信息的数据量,从而有效地提高了运算速度以及匹配的可靠性。总结现有的角点检测算子的评价方法,总体上有以下几个标准[1]: (1)稳定性:即同一场景图像在亮度、对比度等因素变化的情况下,检测出的角点数目及位置应当稳定 (2)可靠性:即在算子的可变参数改变情况下,不影响生成的角点的质量,只改变检测出角点的数目;检测到的角点具有平移、旋转、伸缩不变性 (3)鲁棒性:即算法的抗噪性能,在一定的噪声干扰下,算子仍然具有很强的角点检测能力 (4)准确性:主要指不发生误检测以及角点位置定位准确 (5)高效性:是指算法的计算速度快慢,算法速度必须足够快以满足图像处理系统的要求 经过几十年的研究与探索,产生了许多检测角点的方法,但大致可以分为四类:基于灰度图像的角点检测算法、基于二值图像的角点检测算法、基于边缘特征的角点检测算法以及支持矢量机角点检测算法。本文中

组织机构设置及部门职责

温州吉达科技有限公司 管理职能细则 编制人: 编制日期: 审核人: 审核日期: 批准人: 批准日期: 受控状态: 2012-11-15发布 2012-12-01实施

目录 1.组织机构图 (3) 2.部门岗位设置图 (4) 3.部门职能 (5) 4.岗位说明书 (9) 5.定岗定编 (31)

部门职能 一、技术部 (一)、工程方面 1. 从事研究发展,开发新产品,改良现有产品。 2. 提供产品设计,确定产品规格及允差,确定产品所使用的原料、种类、数量、规格及报 废率,制造成品及原料设计蓝图。 3. 制作原来用料清单。 4. 确定每项产品生产报废率。 5. 确定并核准工程变更及原料变更。 6. 制作样品,连同样品测试记录交予业务部门转交客户。如有需要,请客户对样品进行测 试,并将取得的数据送回我方作为校正标准。 7. 制造生产用的“标准产品”。供生产线作比对之用。 8. 制作生产用的测试夹具(Test Fixture) 9. 校正仪表,修理仪表。 10. 协助厂商进行原料、样品的核准。 11. 督导及解决产品在生产时的工程问题。 12. 协助业务人员为客户解决与本公司产品有关的工程问题 13. 协助厂商解决与本公司有关的原料工程问题。 14. 经由优化设计及原料变更等,达成降低成本的目标。 15. 对于任何有关工程方面的疑义,作最后的判定。 (二)工业工程方面 1.厂房布置及生产线安排 2.选择生产机器,设计生产工具及夹具。 3.确定制造过程,对每一过程作运作与实践研究后,确定标准工时,并编制标准公示表。 4.指导生产方法与动作。 5.研究改良生产方法,工具,夹具、设备减排等,达到降低成本的目标。 6.建立并主持生产效率的测定及追踪制度。 7.会同人事部门设立及主持直接生产作业员的奖励制度。 8.比较分析各生产线的生产效率、生产报废率、生产排程达成率极品管退货率等,并组织 生产竞赛进行评估

SNP基因分型的高通量方法

Chapter16 High-Throughput Methods for SNP Genotyping Chunming Ding and Shengnan Jin Abstract Single nucleotide polymorphisms(SNPs)are ideal markers for identifying genes associated with complex diseases for two main reasons.Firstly,SNPs are densely located on the human genome at about one SNP per approximately500–1,000base pairs.Secondly,a large number of commercial platforms are available for semiautomated or fully automated SNP genotyping.These SNP genotyping platforms serve different purposes since they differ in SNP selection,reaction chemistry,signal detection,throughput,cost,and assay flexibility.This chapter aims to give an overview of some of these platforms by explaining the technologies behind each platform and identifying the best application scenarios for each platform through cross-comparison.The readers may delve into more technical details in the following chapters. Key words:Whole genome association,fine mapping,single nucleotide polymorphism,copy number variation,haplotyping. 1.Introduction Single nucleotide polymorphisms(SNPs)are best known as genetic markers in disease-association studies to identify genes associated with complex diseases(1,2).However,SNPs are also used in many other clinically and biologically important applica- tions(3).A large variety of commercial platforms are available for semiautomated or fully automated SNP genotyping analysis.On the basis of the purposes of the study,SNP genotyping can be divided into two domains:whole genome association(WGA)and fine mapping(Fig.16.1).Most of the genotyping platforms can be classified accordingly.This chapter aims to briefly explain the principles behind various platforms which lead to a comparison of these platforms so that the readers will get a quick overview before delving into the technical details of some of these methods in the following chapters. A.A.Komar(ed.),Single Nucleotide Polymorphisms,Methods in Molecular Biology578, DOI10.1007/978-1-60327-411-1_16,aHumana Press,a part of Springer Science+Business Media,LLC2003,2009 245

机构设置及岗位职责

物资设备部职责 (1)在分管领导的领导下负责本项目施工机械、施工用电、工程物资管理工作。 (2)贯彻执行国家、上级有关部门的政策、法规、标准、规范、制度及办法,根据业主的各项制度和办法制定适宜本项目的机械设备、物资管理办法,并组织实施。 (3)监督、检查、指导本项目施工机械的管、用、养、修工作,保证施工机械技术状态良好,并使其在安全、环保、低消耗的状态下运行。 (4)负责主要工程材料的监督、检查、指导本项目物资、验收、储存、发放、核销等各环节的管理,力求做到工完料清,并保证物资使用安全,减少环境污染。 (5)监督、检查、指导临电的配置和安全用电管理。 (6)科学合理使用机械设备,提高设备使用效率。 (7)参与本项目机械设备事故的调查工作。 (8)参与安质部组织的机械设备、物资管理危险源的识别、评价、管理方案制定。 (9)协助计划财务部进行红线成本预算管理。 (10)按时完成领导交办的其他工作。

项目部物资设备部部长安全生产责任 (1)贯彻执行上级有关安全生产、劳动保护的方针、政策、法规、制度。 (2)负责组织实施上级颁布的机械管理制度、规程、标准、办法等,并制定实施细则。 (3)在推行新设备、新技术、新工艺的同时,按有关规定指导、协助编制安全技术操作规程。 (4)检查监督所属单位在制定维修计划的同时,制定相应的安全保证措施,并在维修中严格执行。 (5)全面负责甲供及甲控的安全管理工作,重点审查是否符合国家相关强制性标准。 (6)负责各类事故应急物资储备工作。 (7)全面对采购的物资及劳动保护用品,进行供方评价、管理。(8)全面负责火工品购买、运输、库存、发放等的安全管理工作。 (9)参与生产安全事故的调查处理工作。 (10)参与生产安全大检查,对违反安全操作规程的现象,有权制止,处以罚款。对发现的机电设备隐患应及时提出整改意见,并督促整改,限期完成。

harris角点检测与ncc匹配

harris角点检测与ncc匹配 file1:-------------------------------------------------------------------------------------- function [y1,y2,r,c]=harris(X) % 角点的检测,利用harris 算法 % 输出的是一幅图像 % [result,cnt,r,c]=harris(X) % clc,clear all; % filename='qiao1.bmp'; % X= imread('filename.bmp'); % 读取图像 % Info=imfinfo(filename); %这个要习惯用 % % f=rgb2gray(X); f=X; % ori_im=double(f)/255; %unit8转化为64为双精度double64 fx = [-2 -1 0 1 2]; % x方向梯度算子(用于Harris角点提取算法) Ix = filter2(fx,ori_im); % x方向滤波善于使用filter % fy = [5 8 5;0 0 0;-5 -8 -5]; % 高斯函数一阶微分,y方向(用于改进的Harris 角点提取算法) fy = [-2;-1;0;1;2]; % y方向梯度算子(用于Harris角点提取算法) Iy = filter2(fy,ori_im); % y方向滤波 Ix2 = Ix.^2; Iy2 = Iy.^2; Ixy = Ix.*Iy; clear Ix; clear Iy; %消除变量哈 h= fspecial('gaussian',[10 10 ],2); % 产生7*7的高斯窗函数,sigma=2 Ix2 = filter2(h,Ix2); Iy2 = filter2(h,Iy2); Ixy = filter2(h,Ixy); %分别进行高斯滤波 height = size(ori_im,1); width = size(ori_im,2); result = zeros(height,width); % 纪录角点位置,角点处值为1 ,背景都是黑色的哈 R = zeros(height,width);

项目组织机构设置和岗位职责

、机构设置 LH13 项目组织机构设置及岗位职责 编辑:超级管理员日期:2010年5月8日阅读次数:582 、岗位职责

项目经理岗位职责: 1、项目实施全面管理,贯彻执行国家和工程所在地政府的有关法律、法规和政策,执行企业的各项管理制度;贯彻实施公司质量方针,科学地组织和管理进入施工现场的人、财、物等生产要素。 2、关心人、管好人、用好人,项目经理必须在项目班子团队中树立起核心形象,使项目班子凝聚成文明的、遵守规章的、有进取心的、高效率的团队。 3、严格计划管理。坚持先有计划后有实施的原则。施工作业计划、劳动力使用计划、材料设备进场计划、质量控制计划、安全文明施工计划、后勤支持计划等必须纳入第一管理范畴,并由项目经理签署、检查。 4、严格控制工程成本;负责督促相关专业人员建立并检查工程材料和临时设施用料的入库、出库、领用、堆放、保管、退回、核算,以及配套的奖惩制度,堵截浪费和流失。 5、执行项目承包合同中由项目经理负责履行的各项条款;抓好项目班子各职能人员岗位责任的贯彻落实工作;负责对项目部工作的检查、评审,提出奖 罚制度。 6、协调好与建设单位、设计单位、监理单位和地方部门、土建总包单位等各方面的关系。 7、对工程项目施工进行有效控制,执行有关技术规范和标准,积极推广应用新技术,深入现场及时解决施工中出现的问题,确保工程质量和工期进度。 8、检查督促合规的技术经济资料的及时收集、外部签章、整理归档工作。要求相关业务人员对影响工程结算的资料必须及时核算、入账。 9、实现安全管理和文明生产,组织好定期或不定期的安全文明施工检查,

实安全措施。项目经理是施工安全的第一责任人。 10、保证施工项目按照规定和目标高速优质低耗地全面完成,保证各生产要素在项目经理授权范围内做到最大限度的优化配置。 11、制定项目部会议制度并实施。 12、完成公司临时交办的工作。 项目技术总负责人职责: 1、严格执行国家有关建筑工程的技术政策、技术标准和技术规范,严格组织 实施公司和项目经理部制定的有关保证工程质量的技术要求和技术措施; 2、参加或主持本项目的设计交底和图纸会审;负责编制本工程的《施工组织设计》文件并报公司审签;负责本项目的工程技术管理工作;全面负责工程上的设计技术处理问题。 3、统筹项目质量计划中各项工作的安排,组织实施“项目质量计划”开展项目质量教育,增强项目施工人员的质量意识。 4、主持处理施工中的技术问题,参加质量事故的处理和一般质量事故的处理方案编制。 5、组织编制施工进度计划;审核大宗材料的采购计划;组织与主持关键工序的检验和验收工作;审批现场施工及物资贮存、搬运,各分项工程、各分包队伍的施工方案; 6、负责督导专业施工员对各分项、分部工程的质量检查验收及资料的归档

matlab练习程序(Harris角点检测)

close all; clear all; clc; img=imread('rice.png'); imshow(img); [m n]=size(img); tmp=zeros(m+2,n+2); tmp(2:m+1,2:n+1)=img; Ix=zeros(m+2,n+2); Iy=zeros(m+2,n+2); E=zeros(m+2,n+2); Ix(:,2:n)=tmp(:,3:n+1)-tmp(:,1:n-1); Iy(2:m,:)=tmp(3:m+1,:)-tmp(1:m-1,:); Ix2=Ix(2:m+1,2:n+1).^2; Iy2=Iy(2:m+1,2:n+1).^2; Ixy=Ix(2:m+1,2:n+1).*Iy(2:m+1,2:n+1); h=fspecial('gaussian',[77],2); Ix2=filter2(h,Ix2); Iy2=filter2(h,Iy2); Ixy=filter2(h,Ixy); Rmax=0; R=zeros(m,n); for i=1:m for j=1:n M=[Ix2(i,j) Ixy(i,j);Ixy(i,j) Iy2(i,j)]; R(i,j)=det(M)-0.06*(trace(M))^2; if R(i,j)>Rmax Rmax=R(i,j); end end end re=zeros(m+2,n+2); tmp(2:m+1,2:n+1)=R; img_re=zeros(m+2,n+2); img_re(2:m+1,2:n+1)=img;

for i=2:m+1 for j=2:n+1 if tmp(i,j)>0.01*Rmax &&... tmp(i,j)>tmp(i-1,j-1) && tmp(i,j)>tmp(i-1,j) && tmp(i,j)>tmp(i-1,j+1) &&... tmp(i,j)>tmp(i,j-1) && tmp(i,j)>tmp(i,j+1) &&... tmp(i,j)>tmp(i+1,j-1) && tmp(i,j)>tmp(i+1,j) && tmp(i,j)>tmp(i+1,j+1) img_re(i,j)=255; end end end figure,imshow(mat2gray(img_re(2:m+1,2:n+1)));

Harris角点检测算法

Harris角点检测算法 软工1303陈伟峰 1.算法介绍 1988年Harris在Moravec算法的基础上提出了Harris算法。Harris算法是对moravec算法的改进和提高,harris算法使用高斯函数替代moravec算法的二值窗口函数,另外在moravec中只考虑每个45度的方向的灰度变化,二harris利用泰勒展开式,去近似计算每个方向的灰度变化情况。 2.Harris算法 (1)算法思想 Harris角点检测算法思想就是拿一个小窗在图像中移动,通过考察这个小窗口内图像灰度的平均变换值来确定角点。相应的会有三种情况发生。 (1)如果窗口内区域图像的灰度值恒定,那么所有不同方向的偏移几乎不发生变化,这个区域属于平坦区域; (2)如果窗口跨越一条边,那么沿着这条边的偏移几乎不发生变化,但是与边垂直的偏移会发生很大的变化,这个区域属于边缘区域; (3)如果窗口包含一个孤立的点或者角点,那么所有不同方向的偏移会发生很大的变化。 图1 Harris角点检测基本思想 (2)算法推导 假设窗口W发生位置偏移(u,v);比较偏移前后窗口中每一个像素点的灰度变化值;使用灰度误差平方和来构造一个误差函数E(u,v),其中的窗口函数是用来滤波的。 平坦区域: 任意方向移动,无灰度变化边缘: 沿着边缘方向移 动,无灰度变化 角点: 沿任意方向移动, 明显灰度变化

其中w(x,y)为窗口函数,I(x+u,y+v)为平移后的灰度值,I(x,y)为平移前的灰度值。 由Taylor展开式可以得到: 我们定义: H称为自相关矩阵, λmax和λmin是自相关矩阵的特征值。如图2所示,其中E(u,v)是一个二次型函数,二次型函数的本质就是一个椭圆,椭圆的扁率和尺寸是由H的特征值λmax和λmin决定的,椭圆的方向由H的特征向量决定。

学校主要机构设置和职能

丹凤县西街小学 学校主要机构设置及其职能 学校党支部的工作职能 学校党支部是中国共产党在学校的基层组织,是学校的政治核心。 其主要职能是: 一、认真抓好学校党的思想、组织、作风建设,加强党的教育、管理,努力提高党员的素质,充分发挥党支部的战斗堡垒和党员的先锋模范作用。 二、保证、监督校长正确贯彻执行党和国家的教育方针、政策、法规,保证办学的社会主义方向。 三、对学校行政工作的重大问题提出意见和建议,参与决策,支持校长充分行使职权。 四、发挥党员以身作则作用;做好全体教职员工的思想政治工作,配合校长抓好学校的德育工作。 五、坚持党管干部的原则,加强对学校后备干部、中层干部的教育、培养、考察。 六、根据党章规定,做好发展党员工作,做好党员的评议、鉴定工作。 七、领导学校工会、共青团、等群众组织。 工会的工作职能 一、充分发挥工会的教育职能,努力抓好教职工队伍建设

二、充分发挥工会的监督职能,积极完善校园民主政治制度建设 三、充分发挥工会的维权职能,切实维护教职工的合法利益 四、充分发挥工会的协调职能,努力促进校园和谐 办公室的工作职能 西街小学办公室是学校行政的综合办事机构。其主要职能是围绕学校中心工作,积极发挥参谋助手作用,负责综合协调、信息枢纽、督促检查等工作。 其主要职能是: 一、参谋职能:全面及时掌握全校情况和动态,做好全校日常行政管理工作,负责全校年度工作计划、总结。围绕学校重大事项和中心工作开展调查研究工作,分析、研究并提出意见。 二、承办职能:负责上级下发的公文及校内请示、报告的处理工作,负责各种人事档案,资料的整理、归档工作,负责图书、报刊、杂志征订及资料印刷支出的审核和分发工作。计划,承办学校行政会议的组织准备工作和会议记录整理、保密工作。 三、管理职能:参与全校管理事务,负责教职工聘用、工资审核等工作,做好岗位考勤统计、审核工作,配合总务处做好有关的资金核算工作。负责对 中层干部的选拔聘用、考核及考核资料的搜集、汇总和登记工作。 四、协调职能:主要抓好纵向协调、横向协调和内部协调,

相关文档