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两种爱德华氏菌MALDI-TOF-MS检测方法的建立与应用

Open Journal of Fisheries Research 水产研究, 2017, 4(3), 119-123

Published Online September 2017 in Hans. https://www.wendangku.net/doc/8c46145.html,/journal/ojfr

https://https://www.wendangku.net/doc/8c46145.html,/10.12677/ojfr.2017.43019

Establishment and Application of

MALDI-TOF-MS Methods for

Two Types of Edwardsiella

Bin Wu*, Huiqiu Liu, Liang Zhao, Yuting Zang, Peng Guan

Liaoning Entry Exit Inspection and Quarantine Bureau, Dalian Liaoning

Received: Sep. 3rd, 2017; accepted: Sep. 19th, 2017; published: Sep. 28th, 2017

Abstract

In this paper, the rapid MALDI-TOF-MS method was established to detect and identify Edwardsiella ictaluri and Edwardsiella tarda. The stability and repeatability of MALDI-TOF-MS were verified by Vibrio parahaemolyticus, Edwardsiella ictaluri, Edwardsiella tarda, Aeromonas hydrophila, Aero-monas salmonicida. The strains from different sources were detected in order to confirm the ac-curacy of this method. Through the comparison of MALDI-TOF-MS technology and traditional identification methods, the results showed that MALDI-TOF-MS were better than traditional me-thods in detection time, repeatability, stability, and other aspects. MALDI-TOF-MS could be used for Edwardsiella ictaluri and Edwardsiella tarda in daily detection.

Keywords

MALDI-TOF-MS, Edwardsiella ictaluri,Edwardsiella tarda, Detection, Identification

两种爱德华氏菌MALDI-TOF-MS检测方法的

建立与应用

吴斌，刘卉秋，赵亮，臧玉婷，关鹏

辽宁出入境检验检疫局，辽宁大连

收稿日期：2017年9月3日；录用日期：2017年9月19日；发布日期：2017年9月28日

摘要

本文建立快速检测和鉴定鮰爱德华氏菌、迟钝爱德华氏菌的基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱*通讯作者。

吴斌等

(MALDI-TOF-MS)检测方法。采用副溶血性弧菌、鮰爱德华氏菌、迟钝爱德华氏菌、嗜水气单胞菌、杀鲑气单胞菌等菌株，进行MALDI-TOF-MS 检测，以验证该方法的稳定性和重复性。对不同来源的菌株进行检测，以确认方法的准确性。通过MALDI-TOF-MS 技术及传统生化鉴定方法进行比较，结果表明MALDI-TOF-MS 在检测时间、重复性、稳定性、准确性等方面的总体表现均优于传统生化鉴定方法，可用于鮰爱德华氏菌、迟钝爱德华氏菌的日常检测。

关键词

MALDI-TOF-MS ，鮰爱德华氏菌，迟钝爱德华氏菌，检测，鉴定

This work is licensed under the Creative Commons Attribution International License (CC BY).

https://www.wendangku.net/doc/8c46145.html,/licenses/by/4.0/

爱德华氏菌(Edwardsiella )属于肠杆菌科，目前分为迟钝爱德华氏菌、保科爱德华氏菌、鮰爱德华氏菌3个种。其菌体短杆状，具周鞭毛，革兰氏染色阴性，宿主范围很广，流行季节为夏季和秋初高温期。广泛分布于海水和淡水中，感染各种养殖水生动物，对水产养殖业危害极大。对鲤鱼、鲸鱼、鳝鱼和其他多种鱼类致病，可造成严重经济损失。引起鱼类发病的病原菌主要为鮰爱德华氏菌(Edwardsiella ictaluri )和迟钝爱德华氏菌(Edwardsiella tarda ) [1]。爱德华氏菌可使鱼类发病，目前已报道的主要导致斑点叉尾鮰肠败血症，可以危害所有规格的斑点叉尾鮰，但主要影响苗种存活率[2]，己成为美国养殖斑点叉尾鮰最主要的疾病之一。

传统的细菌鉴定方法依据细菌的形态学和生理生化特性分析，不仅耗时长，而且由于生化特性容易受培养基、保存时间等因素的影响，常常给鉴定带来困难[3]。近年来快速发展的基因检测技术在微生物鉴定方面取得了一定的应用，但由于其敏感性高，容易出现假阳性[4]，而且对近似种的细菌鉴定还存在一些不足。因此，对一些与人和动物关系密切的病原菌还需要建立更加快速、准确、实用的检测和鉴定方法。本文应用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术建立了检测和鉴定鮰爱德华氏菌和迟钝爱德华氏菌方法。

1. 材料与方法

1.1. 材料与试剂

试验菌株：本文所用的鮰爱德华氏菌(HYDX-01)由大连海洋大学赠送，迟钝爱德华氏菌(CICC10497, CICC10630)购自中国工业微生物菌种保藏管理中心菌株，其他分离的菌株经生化及分子生物学方法确认。

细菌培养基和生化鉴定卡：营养肉汤、BHI 琼脂、DHL 琼脂和TSA 琼脂等细菌培养基由北京陆桥技术有限公司提供；生化鉴定GN 卡由法国生物梅利埃公司提供。

1.2. 仪器与设备

基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪(MALDI Biotyper)，德国布鲁克公司；全自动微生物鉴定仪VITEK 2 (Compact 30)，法国生物梅利埃公司。

1.3. 方法

菌株的复活与检测：用营养肉汤对细菌进行复活(36℃ ± 1℃，培养24 h)后，接种于BHI 和DHL 37℃

Open Access

吴斌等

培养36 h，进行MALDI-TOF-MS检测。

样品处理：挑取可疑单个菌落于1.5 mL的离心管中，用生理盐水10,000常温r/min离心2 min洗涤二次；用75%的酒精固定细菌的表面蛋白；用等量的70%甲酸和乙腈溶解表面蛋白，10,000 r/min常温离心2 min。

点靶：吸取上清点靶。先点1 μL上清于样品靶板上，同时点1 μL标准品溶液(校准靶板)，待液体干后立即点1 μL基质溶剂。

质谱图的采集和分析：应用MALDI Biotyper仪器，选择BioTyper par的采集方法对细菌的图谱进行采集。用标准品对仪器进行校准后，采集样品质谱图。应用BioTyper软件对细菌质谱图进行分析和鉴定。

不同来源爱德华氏菌的MALDI-TOF-MS鉴定：将冷冻保存的从黄颡鱼、鳗鱼、大菱鲆、鲤鱼、六线鱼及甲鱼等水生动物中分离，并经形态和生化鉴定为鮰爱德华氏菌的9株菌株用肉汤培养液复活，进行MALDI-TOF-MS鉴定，并与菌株保存前的生化鉴定结果进行比较，判断MALDI-TOF-MS检测结果的准确性。

MALDI Biotyper的判断标准和鉴定结果：判断标准是待检细菌与数据库中标准菌株质谱图的符合度，用得分表示，得分越高，说明待测菌株的谱图同质谱库中某一标准菌株的谱图(质量和峰高)越相近。分值在2.300~3.000之间，标记为(+++)，可完全确认菌株鉴定结果；分值在2.000~2.299之间，标记为(++)，可基本确认菌株鉴定结果；分值在 1.700~1.999之间，标记为(+)，该菌株鉴定为不确定结果；分值在0.000~1.699之间，标记为(-)，可判断不是该种细菌。

2. 结果与讨论

2.1. 菌株鉴定结果

两种爱德华氏菌经Biotyper数据库鉴定后，与数据库中相应的爱德华氏菌的匹配分值分别为：迟钝爱德华氏菌为2.495、鮰爱德华氏菌2.367，且两种爱德华氏菌的质谱图比较相似，即其具有相近的蛋白组成，以此可以与其它非爱德华氏菌进行区分。图1为两种爱德华氏菌在分子量5000~8500间的质谱图，

图1. 两种爱德华氏菌的质谱图

吴斌等

从图中可以看出，两种爱德华氏菌之间的质谱峰存在明显的差异，可以进行爱德华氏菌的种间鉴别。表1为两种爱德华氏菌在分子量5000~8500之间的峰值比较，从表中可以看出鮰爱德华氏菌在5000~8500区间有20个可读峰值，而迟钝爱德华氏菌只有16个，缺少5384、7273、7983、8382左右的峰值，而且两种细菌的重复性试验结果变化很小，表现出很好的重复性，迟钝爱德华氏菌与数据库中Edwardsiella tarda ATCC 36.1 EGS的匹配分值均在2.45~2.495之间，与Edwardsiella tarda HL 23.1 EGS的匹配分值均在2.35~2.392之间，与Edwardsiella tarda ATCC 35.1 EGS的匹配分值均在2.302~2.31之间；鮰爱德华氏菌与数据库中Edwardsiella ictaluri 885 EGS的匹配分值均在2.35~2.367之间，与Edwardsiella ictaluri DSM 13697 HAM的匹配分值均在2.046~2.1之间，说明MALDI-TOF-MS技术具有良好的重复性。

2.2. 特异性试验结果

采用鮰爱德华氏菌、迟钝爱德华氏菌、嗜水气单胞菌、杀鲑气单胞菌等菌株培养液，在同一条件下进行MALDI-TOF-MS检测，以验证该方法的特异性。结果表明，MALDI-TOF-MS方法可以快速、准确地鉴定出两种爱德华氏菌，具有很好的特异性，见图2。

2.3. 不同方法鉴定结果

GN TestKit鉴定卡可以对革兰氏阴性菌的48项生化指标进行鉴定，两株细菌的大部分生化结果一致，只在D-甘露醇、蔗糖、L-阿拉伯糖、柠檬酸应上有差异，上述2株爱德华氏菌经全自动微生物鉴定仪鉴定后，均能区分开来，符合率在95%~99%之间。冷冻保存两年后的菌株的生化与保存前的生化会有差异，符合率也低于90%，如鸟氨酸脱羧酶和赖氨酸脱羧酶保存前为阳性，保存后变为阴性，脂酶由阴性变为可疑等，说明用传统的生化反应来鉴定细菌存在一定的缺陷。

2.4. 临床样本鉴定结果

对复活的9株爱德华氏菌的菌株进行MALDI-TOF-MS鉴定，其质谱图变化很小，与数据库中迟钝爱德华氏菌的匹配分值均在2.35以上，可信度很高。说明MALDI-TOF-MS技术具有很好的准确性。而VITEK对9株爱德华氏菌的鉴定值有3株只有85%，在结果判断上可信度有所降低。

3. 讨论

目前，针对爱德华氏菌的鉴定方法报道的有分子生物学方法、酶联免疫法及传统的分离培养法，尚无应用MALDI-TOF-MS法鉴定爱德华氏菌的报道[5]。本文通过对水生动物中常见的两种爱德华氏菌分别应用MALDI-TOF-MS技术及传统生化鉴定方法进行检测，结果表明MALDI-TOF-MS在检测时间、重复性、稳定性、准确性等方面的总体表现均优于传统生化鉴定方法。

MALDI-TOF-MS技术以细菌表面蛋白为检测对象，通过量化分析每种细菌的表面蛋白组成，与标准参考菌株的MALDI-TOF-MS图谱进行比较，从而得出鉴定结果[6]。由于每种生物的蛋白组成经过长期

Table 1. Peak comparison table of two species of Edwardsiella

表1. 两种爱德华氏菌的峰值比较表

迟钝爱德华氏菌鮰爱德华氏菌

24 2.461 2.367

36 2.560 2.432

48 2.465 2.441

72 2.432 2.381

吴斌等

Figure 2. Edwardsiella specific mass spectra 图2. 爱德华氏菌特异谱图

的进化，具有很好的稳定性。细菌的蛋白组成也主要取决于遗传因素，受培养基、培养时间以及其它培养条件等外部因素的影响很小。因此，与其他技术相比，MALDI-TOF-MS 具有很好的稳定性和重复性。

基金项目

国家质检公益项目(201410059)。

参考文献 (References)

[1] 董丽, 王印庚, 张正, 等. 养殖大菱鲆细菌性红体病病原菌的分离与鉴定[J]. 海洋科学, 2009, 3(37): 57-63. [2] 王印庚, 秦蕾, 张正, 等. 养殖大菱鲆的爱德华氏菌病[J]. 水产学报, 2007, 3(14): 487-495.

[3] 秦蕾, 王印庚, 张晓君. 迟钝爱德华氏菌感染大菱鲆的病理学研究[J]. 中国水产科学, 2009, 16(3): 411-4l9. [4] 邓显文, 谢芝勋, 刘加波, 等. 罗非鱼迟钝爱德华氏菌的分离与鉴定[J]. 水生态学杂志, 2009, 2(1): 114-117. [5] 龚艳清, 郭书林, 陈信忠, 等. 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱在动物病原菌检测中的应用[J]. 中国动物检

疫, 2012, 2(29): 22-25. [6] 王晔茹, 崔生辉, 李凤琴. 基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱在沙门菌检测和鉴定分型中的应用研究[J]. 卫

生研究

, 2008, 6(37): 685-689.

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