转录因子的定义及其作用方式
转录因子是一种具有特殊结构、行使调控基因表达功能的蛋白质分子，也称为反式作用因子。植物中的转录因子分为二种，一种是非特异性转录因子，它们非选择性地调控基因的转录表达，如大麦(Hordeum vulgare) 中的HvCBF2
(C-repeat/DRE binding factor 2) (Xue et al., 2003)。还有一种称为特异型转录因子，它们能够选择性调控某种或某些基因的转录表达。典型的转录因子含有DNA 结合区(DNA-binding domain)、转录调控区(activation domain)、寡聚化位点(oligomerization site) 以及核定位信号(nuclear localization signal) 等功能区域。这些功能区域决定转录因子的功能和特性(Liu et al., 1999)。DNA结合区带共性的结构主要有：1）HTH 和HLH 结构：由两段α-螺旋夹一段β-折叠构成，α-螺旋与β-折叠之间通过β-转角或成环连接，即螺旋-转角-螺旋结构和螺旋-环-螺旋结构。2）锌指结构：多见于TFIII A 和类固醇激素受体中，由一段富含半胱氨酸的多肽链构成。每四个半光氨酸残基或组氨酸残基螯合一分子Zn2+ ，其余约12-13 个残基则呈指样突出，刚好能嵌入DNA 双螺旋的大沟中而与之相结合。3）亮氨酸拉链结构：多见于真核生物DNA 结合蛋白的 C 端，与癌基因表达调控有关。由两段α - 螺旋平行排列构成，其α - 螺旋中存在每隔7 个残基规律性排列的亮氨酸残基，亮氨酸侧链交替排列而呈拉链状，两条肽链呈钳状与DNA 相结合。
同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。转录调控区包括转录激活区(transcription activation domain) 和转录抑制区(transcription repression domain) 二种。近年来，转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-100个氨基酸残基，有时一个转录因子包含不止一个转录激活区。如控制植物储藏蛋白基因表达的VP1和PvALF转录因子，它们的N-末端酸性氨基酸保守序列都具有转录激活能力，与酵母转录因子GCN4和病毒转录因子的VP16的酸性氨基酸转录激活区有较高同源性(Bobb et al., 1996)。典型的植物转录因子激活区一般富含酸性氨基酸、脯氨酸或谷氨酰胺等，如GBF (G-box binding factor) 含有的GCB盒(GBF conserved box) 激活结构域(lunwen114 and Bevan, 1998)。
转录抑制区也是转录因子调控表达的重要位点，但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种：1）与启动子的调控位点结合，阻止其它转录因子的结合；2）作用于其它转录因子，抑制其它因子的作用；3）通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。
转录因子必须在核内作用，才能起到调控表达的目的。因此，转录因子上的核定位序列是其重要的组成部分。一般一个或多个核定位序列在转录因子中不规则分布，同时也存在不含核定位序列的转录因子，它们通过结合到其它转录因子上进入细胞核。核定位序列一般是转录因子中富含精氨酸和赖氨酸残基的区段。目前，水稻中的GT-2、西红柿中的HSFA1-2、玉米的O2和碗豆的PS-IAA4和6等转录因子中的核定位序列都已被鉴定(Boulikas, 1994; Dehesh et al., 1995; Lyck et al., 1997; Varagona et al., 1992; Abel and Theologis, 1995)。
绝大多数转录因子结合DNA前需通过蛋白质-蛋白质相互作用形成二聚体或多聚体。所谓二聚体化就是指两分子单体通过一定的结构域结合成二聚体，它是转录因子结合DNA时最常见的形式。由同种分子形成的二聚体称同二聚体，异种分子间形成的二聚体称异二聚体。这种多聚体的形成是转录因子上的寡聚化位点
(oligomerization site) 相互作用的结果，寡聚化位点的氨基酸序列很保守，大多与DNA结合区相连并形成一定的空间构象。除二聚化或多聚化反应，还有一些调节蛋白不能直接结合DNA，而是通过蛋白质－蛋白质相互作用间接结合DNA，调节基因转录，这样就形成了一个表达调控的复合物。
转录因子的作用是通过和顺式因子的互作来实现的。这段序列可以和转录因子的DNA结合域实现共价结合，从而对基因的表达起抑制或增强的作用
灵敏度因子表
附：单色器Al靶测定时元素灵敏度因子（RSF）表 m 原子序数元素灵敏度因子RSF原子序数元素灵敏度因子RSF 3Li1s0.0254Be 1s0.074 5 B 1s0.159 6 C 1s0.278 7N 1s0.4778O 1s0.780 9 F 1s 1.00010Ne 1s 1.340 11Na1s 1.68512Mg1s 2.260 13Al2p0.19314Si2p0.328 15P2p0.48616S2p0.668 17Cl2p0.89118Ar2p 1.155 19K 2p 1.46620Ca 2p 1.833 21Sc 2p 1.87522Ti 2p 2.001 23V 2p 2.11624Cr 2p 2.427 25Mn2p 2.65926Fe2p 2.957 27Co 2p 3.59028Ni 2p 4.044 29Cu 2p 5.32130Zn 2p 5.589 31Ga2p 5.58132Ge3d0.536 33As 3d0.67734Se 3d0.853
原子序数元素灵敏度因子RSF原子序数元素灵敏度因子RSF 35Br3d 1.05536Kr3d 1.287 37Rb3d 1.54238Sr3d 1.843 39Y 3d 2.17540Zr3d 2.576 41Nb3d 2.92142Mo 3d 3.321 43Tc3d 3.77644Ru3d 4.273 45Rh3d 4.82246Pd3d 5.356 47Ag3d 5.98748Cd3d 6.623 49In 3d7.26550Sn3d7.875 51Sb3d8.62752Te3d9.508 53I 3d10.34354Xe3d11.067 55Cs 3d11.73556Ba3d12.448 57La 3d9.12258Ce3d8.808 59Pr 3d7.62760Nd3d 5.671 61Pm 3d 4.59762Sm3d 6.0183 63Eu3d 2.46764Gd3d 1.873 65Tb 4d 2.47766Dy4d 2.474
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仪器型号及主要参数 元素组成鉴别 元素定量分析 元素化学态分析
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仪器型号及主要参数
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仪器型号及参数
X射线光电子能谱仪型号： AXIS ULTRADLD（岛津集团
Kratos公司生产）
X射线源：单色化Al靶， Al Kα hυ=1486.6eV 样品分析区域：700μm×300μm 信息采样深度：无机材料<5nm，有机材料<10nm X射线工作功率：一般为150W