基因工程名词解释:
基因工程:一般指利用分子生物学的手段,将不同生物的遗传物质按人们的意志或需要,进行基因的定向改造,突变与重组,从而使生物体的遗传性状发生变异。穿梭质粒载体:质粒分子上含有两个亲缘关系不同的复制子以及相应的选择性标记,能在两种不同的受体细胞中复制并检测
T-DNA:
反向PCR:研究与已知DNA区域相连接的未知染色体DNA序列。
噬菌粒:噬菌粒是一类人工构建的含有单链噬菌体包装序列、复制子以及质粒复制子、克隆位点、标记基因的特殊类型的载体。
融合蛋白:将外源蛋白基因与受体菌自身蛋白基因重组在一起进行表达,并能正确折叠形成良好的杂合构象,但不同于天然构象。
载体:携带外源DNA进入宿主细胞进行复制和表达的双链DNA分子。
报告基因:指编码产物能够被快速测定,常用来判断外源基因是否已经成功的导入寄主细胞并检测其表达活性的一类特殊用途的基因。
同裂酶:来源不同,识别位点和切割位点均相同的限制性内切酶。即同裂酶产生同样的切割,形成同样的末端。同裂酶对识别序列的甲基化状态有不同的限制性反应。
多克隆位点:多个限制酶的单一切点。由许多酶切位点组成,往往是人工合成的一段外源基因的插入部位的DNA序列。
基因敲除:基因敲除是向正常生物个体内引入某个突变的基因位点而选择性地使某特定基因功能失活的技术。具有生物活性的蛋白质分子。
TA克隆:把PCR片断与一个具有3‘-T突出的载体DNA连接起来的方法。因为PCR反应中所使用的聚合酶具有末端转移的活性,通常在3'加上A。
RT PCR:逆转录PCR:先用逆转录酶作用于mRNA,以寡聚dT为引物合成cDNA第一链,然后用已知一对引物,扩增嵌合分子,这种方法称为逆转录PCR。
同尾酶:这一类的限制酶来源各异,识别的靶字序列也不相同,但产生相同的粘性末端。由同尾酶产生的DNA片段,是能够通过其粘性末端之间的互补作用彼此连接起来的。cDNA文库:是指将某种生物体基因组转录的全部mRNA经反转录产生的cDNA片段分别与克隆载体重组,储存于某种受体菌中,该群体就称该生物基因组的cDNA文库。
染色质免疫共沉淀:是基于体内分析发展起来的方法,也称结合位点分析法,是在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。
黏粒:人工建造的的含有λDNA的cos序列和质粒复制子的特殊类型的质粒载体。RACE:是一种通过PCR进行cDNA末端快速克隆的技术,是以mRNA为模板反转录成cDNA 第一链后用PCR技术扩增出某个特异位点到3,或5,端之间未知序列的方法。
转录因子圈套:应用与某转录因子所结合顺式元件相一致的寡核苷酸双链转染细胞,竞争结合转录因子,从而抑制内源性基因表达.
探针:用作检测的被标记的短片段特异DNA或RNA序列。基因组DNA探针、cDNA 探针、寡核苷酸探针、RNA探针
基因工程:是遗传工程的重要组成部分,是在分子水平上进行的遗传操作,将一种或多种生物体的基因或基因组提取出来,或者人工合成基因,按照人们的愿望,经过设计、体外加工重组,转移到另一种生物体的细胞内,使之能在受体细胞遗传并获得新的遗传性状的技术。 基因工程载体:基因工程中携带外源基因进入受体细胞的“运载工具”。 cos位点:当λDNA进入细菌细胞后,便迅速通过黏性末端配对形成双链环状的DNA 分子,这种黏性末端结合形成双链的区域称为cos位点。 取代型λ载体:具有两个限制性核酸内切酶的酶切位点,它们之间的DNA区段可被外源DNA片段所取代,这类λ噬菌体派生载体即取代型λ载体。 DNA变性:加热或变性作用可以使DNA双螺旋的氢键断裂,双链解离,形成单链DNA。 DNA复性(退火):解除变性条件之后,变性的单链可以重新结合起来形成双链。 受体细胞(宿主细胞,寄主细胞):能摄取外源DNA并使其稳定维持的细胞。 转化:重组质粒DNA分子通过与膜蛋白结合进入受体细胞,并在受体细胞内稳定维持和表达的过程称之为转化。 细菌转化:是受体菌直接吸收来自供体菌的游离DNA片段,并在细胞中通过遗传交换将之组合到自身的基因组中,从而获得供体菌的相应遗传性状的过 程。 转化率:指DNA分子转化受体菌获得转化子的效率。有两种表示方式:一是以转化子数于转化处理的DNA分子数或质量的比率表示;二是以转化子数与用于 转化处理的受体细胞数的比率表示。 转染:将重组λ噬菌体DNA分子直接导入受体细胞中的过程。 转导:指通过λ噬菌体(病毒)颗粒感染宿主细胞的途径把外源DNA分子转移到受体细胞内的过程。 体外包装:指在体外模拟λ噬菌体DNA分子在受体细胞内发生的一系列特殊的包装反应过程,将重组λ噬菌体DNA分子包装为成熟的具有感染能力的λ噬 菌体颗粒的技术。 脱菌培养:指把共培养后的外植体转移到含有抗生素的培养基上继续培养生长的过程。 DNA的直接转移:指利用植物细胞的生物学特件、通过物理化学的方法将外源基因转入受体植物细胞的技术。 脂质体:由人工构建的磷脂双分子层组成的膜状结构。 克隆子:将摄取外源DNA分子并能使该分子在其中稳定维持的受体细胞统称为克隆子。 基因表达:指结构基因在调控序列的作用下转录成mRNA,经加工后在核糖体的协助下又转译出相应的基因产物——蛋白质,再在受体细胞环境中经修饰而显示出相应的功能。 启动子:是一段提供RNA聚合酶识别和结合的DNA序列。 增强子:是能够增强启动子转录活性的DNA顺式作用序列,又称强化子。 衰减子:是位于mRNA分子前导序列中的一段控制蛋白质合成起始速率的调节区,亦即发生弱化作用的转录终止信号序列,又称弱化子。 反义RNA:同某种天然mRNA反向互补的RNA分子称为反义RNA。 反义子:编码反义RNA的DNA称为反义子。 外源基因表达系统:泛指目的基因与表达载体重组后,导入合适的受体细胞,并能在其中有效表达,产生目的基因产物(目的蛋白)。 复制子:是一段包含复制起始位点(ori)和反式因子作用区在内的DNA片段。 启动子:是一段能被宿主RNA聚合酶特异性识别和结合并指导目的基因转录的DNA 序列,是基因表达调控的重要元件。 转录终止子:是一段终止RNA聚合酶转录的DNA序列。 核糖体结合位点:是指原核基因转录起始位点下游的一段DNA序列,即Shine-Dalgarno序列(简称SD序列)。 包涵体:在一定条件下,外源基因的表达产物在大肠杆菌中积累并致密地集中在一起形成无膜的裸露结构,这种结构称为包涵体。 融合蛋白:将外源蛋白基因与受体菌自身蛋白基因重组在一起,但不改变两个基因的阅读框,以这种方式表达的蛋白称为融合蛋白。 寡聚型外源蛋白:在构建外源蛋白表达载体时,将多个外源目的蛋白基因串连在一起,克隆在质粒载体上,以这种方式表达的外源蛋白。 整合型外源蛋白:将要表达的外源基因整合到染色体的非必需编码区上,使之成为染色体结构的一部分而稳定地遗传,以此种方式表达的外源蛋白。 分泌型外源蛋白:外源基因的表达产物,通过运输或分泌的方式穿过细胞的外膜进入培养基中,即为分泌型外源蛋白。 转座子:存在于染色体DNA上可自主复制和移位的基本单位.转座子是基因组内相对独立的、可移动序列,它们不必借用噬菌体或质粒的形式就可以从基因组的一部位直接转移到另一部位,这个过程称转座 克隆子:将摄取外源DNA分子并能使该分子在其中稳定维持的受体细胞统称为克隆子。 重组子、阳性克隆子或期望重组子:含有重组DNA分子的克隆子被称为重组子,如果重组子中含有外源目的基因则又称为阳性克隆子或期望重组子。 转化子:把采用各种转化方法或转导方法获得的克隆子叫做转化子(导入外源DNA 分子后能稳定存在的受体细胞称为转化子) 克隆子的筛选:经过各种方法将外源DNA分子导入受体细胞后,获得所需阳性克隆子的过程称为 α-互补:lacZ 基因上缺失操纵基因区段的突变体与带有完整的近操纵基因区段的β-半乳糖苷酶阴性突变体之间实现互补,这种互补现象称为α-互补 报告基因:系指其编码产物能够被快速地测定,常用来判断外源基因是否已经成功地导入寄主细胞(器官或组织)并检测其表达活性的一类特殊用途的基因。
基因工程期末试题复习要点整理 基因工程是70年代出现的一门科学,是生物学最具生命力和最引人注目的前沿科学之一,是现代生物技术的代表,是生命科学类专业中的一门重要的专业课。本课程主要介绍基因工程概述、重组DNA基本技术及原理、基因克隆、基因的分离及鉴定、基因工程的表达系统、基因工程的应用等。通过本课程的学习,使学生掌握基因工程技术的基本原理和了解该技术在动物、植物和微生物等方面的应用,为今后从事生物学教学、生物技术研究和产品开发,或进一步的研究生学习科研打下坚实的理论及专业基础。扬州大学试题纸 一、名词解释:共10题,每题2分,共20分。 1. 基因: 是DNA分子中含有特定遗传信息的一段核苷酸序列,是遗传物质的最小功能单位。 2. 定位克隆: 获取基因在染色体上的位置信息,然后采用各种方法对该基因进行定位和克隆 3. 融合基因: 是指应用DNA体外重组技术构建的一类具有来自两个或两个以上的不同基因核苷酸序列的新型基因。 4. 转化子: 导入外源DNA后获得了新遗传标志的细菌细胞或其他受体细胞,又称重组体。 5. 人工接头:是人工合成的具有一个或数个特定限制性内切酶识别和切割序列的双股平端DNA短序列。 6. RT-PCR: 是指以mRNA在反转录酶作用下合成cDNA第一链为模板进行的PCR。 7. ORF : 起始于AUG、止于UAA、UGA、UAG的连续的密码子区域,是潜在的编码区。 8. MCS: 指载体上人工合成的含有紧密排列的多种限制核酸内切酶的酶切位点的DNA片段。 9. gene targeting : 基因工程中利用活细胞染色体DNA可与外源DNA的同源性DNA序列发生重组的性质,来进行定点修饰改造染色体上某一目的基因的技术 10. 5’RACE: 是一种通过PCR进行cDNA末端快速克隆的技术,是以mRNA为模板反转录成cDNA第一链后用PCR技术扩增出某个特异位点到5’端之间未知序列的方法。 四、简答题:共4题,共20分。 1.简述获得目的基因常用的几种方法。(5分)
1基因工程定义:是将一种生物细胞的基因分离出来,在体外进行酶切和连接并插入载体分子,构成遗传物质的新组合,引入另一种宿主细胞后使目的基因得以复制和表达的技术。 2.融合蛋白:指蛋白质的N末端由原核DNA序列编码,C端由真核DNA的完整序列编码,这样的蛋白由一条短的原核多肽和真核蛋白质结合在一起,故称为融合蛋白。 3.悬浮细胞:生长不依赖支持物表面,在培养液中呈悬浮状态生长。 4.二倍体细胞系:原代细胞经过传代筛选克隆,从多种细胞成分的组织中,挑选并纯化出某种具有一定特征的细胞株。 5.转化细胞系:通过某个转化过程形成的,常由于染色体断裂变成异倍体,失去正常细胞特点,而获得无限增殖能力。 6.基因文库:将特定生物个体的全部DNA片段连接入载体DNA分子上,并导入受体细菌或细胞中,经扩增产生的包含该生物全部基因组序列的克隆群体。 7.基因组文库:是包含有某物种全部基因随机片段的重组DNA克隆的集合体。 8. cDNA文库:是指通过克隆的方法保存在宿主中的一群混合分子,这些分子中的插入片段的总和可代表某种生物的全 9.mRNA序列9..补料分批培养:将种子接入发酵反应器中进行培养,经过一段时间后,间歇或连续地补加新鲜培养基,使菌体进一步生长的培养方式。10.连续培养:将种子接入发酵反应器中,搅拌培养至一定浓度后,开动进料和出料的蠕动泵,以控制一定稀释率进行不间断的培养。 11.分批培养:将溶氧控制和流加补料措施结合起来,使糖的流加速率不超过氧化容量。 12.透析培养:利用膜的半透性原理使代谢产物和培养基分离,通过去除培养液中的代谢产物来解除其对生产菌的不利影响。 13.星号(*)活性:如果改变反应条件就会影响限制酶的专一性和切割效率 14.强启动子:是DNA链上一段能与RNA聚合酶结合并起始RNA合成的特定序列15.转录终止子:在一个基因或是一个操纵子的3’末端提供转录终止信号的一段特定DNA序列15.逆转录法:先分离纯化目的基因的mRNA,再反转录成cDNA,后进行cDNA的克隆表达。 16. RT-PCR:是指以mRNA在反转录酶作用下合成的cDNA第一链为模板的PCR。 17.同裂酶:能识别相同序列,切割位点可以相同也可以不同,来源不同的酶。 18.同尾酶:识别的序列不同,但能切出相同的粘性末端。 19.穿梭质粒载体:人工构建的、具有两种不同复制起点和选择标记、可以在两种不同的寄主细胞中存活和复制的质粒载体。 20.可溶性受体:一般指细胞膜受体的胞外与配基结合的膜外区,由于多种原因自胞膜脱落但仍保留和配基结合能力的受体。 21.反义技术:是采用反义核酸分子抑制、封闭或破坏靶基因的技术。 22.反义核酸:是根据碱基互补原理结合并调节靶基因活性的核酸分子。 23.细胞因子概念:在机体内由多种细胞分泌的,在体内含量极低但具有多种生物学活性的小分子蛋白多肽或糖蛋白 24..基因诊断:是一种新的临床诊断方法,是通过基因检测寻找内源基因异常变化,以及发现与鉴定病原性外源基因的存在,从而达到对有关疾病特异、敏感和快速的诊断。 25.基因治疗:是指对缺陷基因进行原位修复或以正常基因替代缺陷基因(或)。26..in vivo法:通过载体将目的基因直接转入靶细胞、组织,使其在体内表达 27.受体介导的基因转移:是利用能与细胞表面特异性受体结合的相应的配体或抗体,以多价阳离子辅助物为连桥,与DNA形成一种特殊的蛋白- 核酸复合物 28.靶向逆转录病毒载体:逆转录病毒的宿主性决定于病毒外壳糖蛋白env,所以,通过改变或修饰env蛋白可以实现逆转录病毒载体的靶向转移。 29.细胞因子:在机体内由多种细胞分泌的,在体内含量极低但具有多种生物学活性的小分子蛋白多肽或糖蛋白。
名词解释: 1.Gene Engineering基因工程:在体外把核酸分子(DNA的分离、合成)插入载体分子,构成遗传物质的新组合(重组DNA),引入原先没有这类分子的受体细胞内,稳定地复制表达繁殖,培育符合人们需要的新品种(品系),生产人类急需的药品、食品、工业品等。 2.HGP人类基因组计划:是一项规模宏大,跨国跨学科的科学探索工程。其宗旨在于测定组成人类染色体(指单倍体)中所包含的30亿个碱基对组成的核苷酸序列,从而绘制人类基因组图谱,并且辨识其载有的基因及其序列,达到破译人类遗传信息的最终目的。 3.Gene Therapy 基因治疗:是指将外源正常基因导入靶细胞,取代突变基因,补充缺失基因或关闭异常基因,达到从根本上治疗疾病的目的。 .基因诊断:是利用重组DNA 技术作为工具,直接从DNA水平监测人类遗传性疾病的基因缺陷。 Vector载体:是把外源DNA(目的基因)导入宿主细胞,使之传代、扩增或表达的工具。 plasmid质粒:是生物细胞内固有的、能独立于宿主染色体而自主复制、并被稳定遗传的一类核酸分子。shuttle vector穿梭载体:是指含有两个亲缘关系不同的复制子,能在两种不同的生物中复制的。 质粒不相容性;同种的或亲缘关系相近的两种质粒不能同时稳定地保持在一个细胞内的现象,称为质粒不相容性. multiple cloning sites,MCS多克隆位点:DNA载体序列上人工合成的一段序列,含有多个限制内切酶识别位点。能为外源DNA提供多种可插入的位置或插入方案。 α-互补:LacZ’基因的互补:lacZ基因上缺失近操纵基因区段的突变体与带有完整的近操纵基因区段的β-半乳糖苷酶基因的突变体之间实现互补。 粘性末端:指DNA分子的两端具有彼此互补的一段突出的单链部分, 这一小段单链部分和同一分子的另一端或其它分子末端的单链部分如果互补的话,则能通过互补碱基之间的配对, 形成双链。并在DNA连接酶的作用下, 使同一DNA分子的两端连接成环状,或使两个分子连成一大的线状分子。 cos位点:当λDNA进入细菌细胞后,便迅速通过黏性末端配对形成双链环状的DNA分子,这种黏性末端结合形成双链的区域称为cos位点。 Cosmid考斯质粒:由于λ-DNA包装蛋白只识别粘性末端的一小段顺序cos区。将这段DNA与质粒连在一起,构建的重组质粒,可装载DNA(32~45.5kb)。 pBR322:是一个人工构建的重要质粒,有万能质粒之称。它是由pSF2124、pMB1及pSC101三个亲本质粒经复杂的重组过程构建而成的。 phagemid or phasmid噬菌粒:是一类人工构建的含有单链噬菌体包装序列、复制子以及质粒复制子、克隆位点、标记基因的特殊类型的载体。 人造染色体载体:利用染色体的复制元件来驱动外源DNA片段复制的载体称之为。 BAC细菌人工染色体:是指一种以F质粒为基础建构而成的细菌染色体克隆载体,常用来克隆150kb左右大小的DNA片段,最多可保存300kb个碱基对。 YAC酵母人工染色体:是一种能够克隆长达400Kb的DNA片段的载体,含有酵母细胞中必需的端粒、着丝点和复制起始序列。 19.工具酶;基因工程中分子水平的操作,是依赖于一些重要的酶(如限制性核酸内切酶,连接酶等)作为工具对DNA进行切割和拼接,我们把这些有关的酶统称为基因工程进行切割和拼接,我们把这些有关的酶统称为基因工程工具酶。 20.R-M System限制与修饰系统:限制性内切酶将侵入细菌体内的外源DNA切成小片断,细菌自身的DNA 碱基被甲基化酶甲基化修饰所保护,不能被自身的限制性内切酶识别切割。 21.同裂酶:又称异源同序酶或异源同工酶,是指识别位点与切割位点均相同的不同来源的酶识别相同序列. 22.同尾酶:是指识别位点不同,但切出的DNA片段具有相同的末端序列的一类酶,同尾酶的切割产物互为粘性末端,并能互补连接,但连接后二个酶的识别序列均被破坏。 23.star activity星活性:在极端非标准条件下,限制酶能切割与识别序列相似的序列,这个改变的特殊性称星
一、名词解释: 1、基因:是遗传的物质基础,是DNA(脱氧核糖核酸)分子上具有遗传信息的特定核 苷酸序列的总称,是具有遗传效应的DNA分子片段。 2、基因组:该指单倍体细胞中包括编码序列和非编码序列在内的全部DNA分子 3、操纵子:原核生物的几个功能相关的结构基因往往排列在一起,转录生成一个mRNA, 然后分别翻译成几种不同的蛋白质。这些蛋白可能是催化某一代谢过程的酶,或共同完成某种功能。这些结构基因与其上游的启动子,操纵基因共同构成转录单位,称操纵子。 4、启动子:是RNA聚合酶结合位点周围的一组转录控制组件,包括至少一个转录起始点。 在真核基因中增强子和启动子常交错覆盖或连续。有时,将结构密切联系而无法区分的启动子、增强子样结构统称启动子。 5、增强子:是一种能够提高转录效率的顺式调控元件,增强子通常占100~200bp长度, 也和启动子一样由若干组件构成,基本核心组件常为8~12bp,可以单拷贝或多拷贝串连形式存在。 6、基因表达:是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻 译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。 二、名词解释 1、基因工程:是指将一种或多种生物体(供体)的基因与载体在体外进行剪接重组,然后转入另一种生物体(供体)内,使之按照人们的意愿遗传并表达出新的性状。 2、载体:能载带微量物质共同参与某种化学或物理过程的常量物质,在基因工程重组 DNA技术中将DNA片段(目的基因)转移至受体细胞的一种能自我复制的DNA分子。三种最常用的载体是细菌质粒、噬菌体和动植物病毒。 3、转化:指将质粒或其他外源DNA导入处于感受态的宿主菌,并使其获得新的表型的过程。 4、感染:利用噬菌体将外源DNA导入宿主细胞的方法。 5、转导:由噬菌体将一个细胞的基因传递给另一细胞的过程。它是细菌之间传 递遗传物质的方式之一。其具体含义是指一个细胞的DNA或RNA通过病毒载体的 感染转移到另一个细胞中。 6、转染:指真核细胞主动摄取或被动导入外源DNA片段而获得新的表型的过程。常用的方法有电穿孔法,磷酸钙共沉淀法,脂质体融合法等。
各种题型 确定题目 重要题目 候补题目 不确定答案的题目 试卷与题库重复题目 名词解释 同裂酶(同切点酶):有一些来源不同的限制酶识别的是同样的核苷酸靶序列,这类酶称为同裂酶。 同尾酶:与同裂酶对应的一类限制性内切酶,它们来源各异,识别的靶序列也各不相同,但切割后都能产生相同的黏性末端,特称为同尾酶。测序酶:是经修饰过的T7噬菌体DNA聚合酶,是采用缺失的方法,从外切核酸酶结构域中除去28个氨基酸,这样使得T7DNA聚合酶完全失去了3~-5~外切酶活性,只有5~-3~聚合酶活性,而且聚合能力很强,测序时常用此酶。与klenow相比优点是:是双脱氧链终止法对长片段进行测序的理想用酶。 限制性核酸内切酶:是一类能识别和切割双链DNA分子中特定碱基系列的核酸水解酶。 限制-修饰系统中的限制和修饰作用:限制-修饰系统中的限制作用是指一定类型的细菌可以通过限制性酶的作用,破坏入侵的外源DNA(如噬菌体DNA等),使得外源DNA对生物细胞的入侵受到限制;而生物细胞(如宿主)自身的DNA分子合成后,通过修饰酶的作用,在碱基中特定的位置上发生了甲基化而得到了修饰,可免遭自身限制性酶的破坏,这就是限制-修饰系统中的修饰作用。 5. 限制性片段长度多态性(RFLP):当DNA序列的差异发生在限制性内切酶的识别位点时,或当DNA片段的插入、缺失或重复导致基因组DNA经限制性内切酶酶解后,其片段长度的改变可以经过凝胶电泳区分,出现的这种DNA多态性称为限制性片段长度多态性。 6. 星号活性:限制性内切核酸酶识别和切割特异性位点是在特定的条件下测定的。当条件改变时,许多酶的识别位点会改变,导致识别与切割序列的非特异性,这种现象称为星号活性。(“非最适的”反应条件例如高浓度的核酸内切限制酶、高浓度的甘油、低离子强度、用Mn2+取代Mg2+以及高pH值等。)克服星号活性的方法:维持反应体系适当的离子强度、较低的温度或酶浓度,尽可能缩短反应时间或DNA 样品的重新处理等。 7. 载体(vector): 在基因操作中携带外源基因进入受体细胞的工具。 克隆载体:主要用于扩增或保存DNA片段,是最简单的载体。主要有:质粒载体、噬菌体载体、黏粒载体、人工染色体(YAC和BAC)。YAC(酵母人工染色体):是利用酿酒酵母的染色体的复制元件构建的载体,其工作环境也是在酿酒酵母中。 BAC(细菌人工染色体):是基于大肠杆菌(E.coli)的F质粒构建的高通量低拷贝的质粒载体。 表达载体是可携带外源基因进入宿主细胞进行复制并进行转录、翻译的载体。 病毒表达载体:是以病毒基因组序列为基础,插入必要的表达元件所构建成的真核基因转移工具。 T-载体:Taq酶的末端转移酶活性可在PCR产物的3’端加上一个不依赖于模板的A,根据这一特性,为方便进行PCR产物的直接克隆而开发出T-载体。 Ti质粒(tumor inducing plasmid):是在根癌农杆菌中发现的可决定冠瘿病(即可诱发寄主植物产生冠瘿瘤)的质粒。大小在200kb左右。 12. 粘粒载体:由人工构建的、大小一般在5~7kb左右、含有λDNA的cos序列和质粒复制子的一类特殊的质粒载体。 17.一元载体:含目的DNA的中间表达载体与改造后的受体(Ti质粒)通过同源重组所产生的一种复合型载体。 18.双元载体:是指由两个分别含有T-DNA和vir区的相容性突变Ti质粒构成的系统。 16. 卸甲载体:将Ti质粒上的T-DNA的致瘤基因全部去掉,仅保留其两边界及与T-DNA转移所必需的25bp序列而构建成的载体。 8.质粒的相容性:是指两种质粒是否可以共存于同一个细胞,如果能够共存则叫相容又叫亲和。 质粒的不相容性:两个质粒在同一宿主中不能共存的现象,出现这种现象的原因主要是它们常常共用同一复制系统。 9. 转移性:质粒具转移性是指在自然条件下,很多质粒可以通过称为细菌接合的作用转移到新宿主内。不含tra基因的质粒则不具备转移性。 T-DNA :能导入宿主细胞并插入其DNA中发挥作用的Ti质粒部分DNA片段。 T-DNA区:即转移DNA,能转移并整合在植物细胞核基因组上的、决定植物形成冠瘿瘤的一段DNA。LTS和RTS对于T-DNA的转移和整合是不可缺少的。 α-互补:指lacZ 基因上缺失近操纵基因区段的突变体与带有完整的近操纵基因区段的β-半乳糖苷酶(β-galactosidase,由 1024个氨基酸组成)阴性的突变体之间实现互补。 11. cos序列(cohesive endsite):λDNA分子两端各有12碱基(5′-GGGCGGCGACCT-3′)的单链互补粘性末端,当λ噬菌体进入细菌细胞后,其DNA可迅速按碱基互补配对结合形成双链环状DNA分子。 COS位点:当λDNA进入细菌细胞后,便迅速粘性末端配对形成双链环状DNA分子,这种粘性末端结合形成的双链区域叫做COS位点. 13. 端粒重复序列(telomeric repeat,TEL):定位于染色体末端一段序列,用于保护线状的DNA不被胞内的核酸酶降解,以形成稳定的结构。 14. 自主复制序列:一段特殊的序列,含有酵母菌中DNA进行双向复制所必须的信号。 22. 多克隆位点:含有紧密排列的多个限制性内切酶识别位点的一段DNA片段。 23、分子杂交:是指在分子克隆中的一类核酸和蛋白质分析方法,用于检测混合样品中特定核酸分子或蛋白质分子是否存在及其分子量大小。 24、菌落原位杂交:是将菌落或噬菌斑转到固相膜上,原位裂解细胞后使核酸固定在膜上,然后与探针杂交。用标记的核酸探针,经放射自显影或非放射检测体系,在组织细胞间期染色体上对核酸进行定位和相对定量研究的一种手段。 26、真核细胞原位杂交:是一项组织化学与分子杂交相结合的技术,使探针与固定在载玻片上的细胞组织切片内的变性染色体杂交。 27、荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH):对寡核苷酸探针做特殊的修饰和标记,后用原位杂交方法与靶染色体或DNA 上特定的序列结合,再通过与荧光素分子相偶联的单克隆抗体(单个细胞增殖形成的细胞群所产生的抗体)来确定该DNA序列在染色体上的位置。 28、凝胶阻滞试验:(gel retardation assay):又叫DNA迁移率变动试验(electrophoretic mobility shift assay,EMSA),是用于体外研究DNA与蛋白质相互作用的一种特殊的凝胶电泳技术。 26. 盒式诱变:就是用一段人工合成具有突变序列的DNA片段,取代野生型基因中的相应序列。这就好象用各种不同的盒式磁带插入收
基因工程:按照预先设计好的蓝图,利用现代分子生物学技术,特别是酶学技术,对遗传物质DNA直接进行体外重组操作与改造,将一种生物(供体)的基因转移到另外一种生物(受体)中去,从而实现受体生物的定向改造与改良。 遗传工程:广义:指以改变生物有机体性状为目标,采用类似工程技术手段而进行的对遗传物质的操作,以改良品质或创造新品种。包括细胞工程、染色体工程、细胞器工程和基因工程等不同的技术层次。狭义:基因工程。 限制性核酸内切酶:是可以识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶,简称限制酶 回文结构:每条单链以任一方向阅读时都与另一条链以相同方向阅读时的序列是一致的,例如5'GGTACC3' 3'CCATGG5'. 同裂酶(isoschizomer)或异源同工酶:不同来源的限制酶可切割同一靶序列(BamH I 和Bst I具有相同的识别序列G↓GATGC) 同尾酶(isocaudiners):来源不同、识别序列不同,但产生相同粘性末端的酶。两个同尾酶形成的黏性末端连接之后,一般情况下连接处不能够再被其任何一种同尾酶识别。 BamH I 识别序列: G↓GATCC Bgl II 识别序列: A↓GATCT 黏性末端 (cohesive terminus/sticky ends):DNA末端一条链突出的几个核苷酸能与另一个具有突出单链的DNA末端通过互补配对粘合,这样的DNA末端,称为黏性末端。 平末端(blunt ends): DNA片段的末端是平齐的。 星活性(star activity):指限制性内切酶在非标准条件下,对与识别序列相似的其它序列也进行切割反应,导致出现非特异性的DNA片段的现象。易产生星活性的内切酶用*标记。如:EcoR I* 底物位点优势效应:酶对同一个DNA底物上的不同酶切位点的切割速率不同。连杆/衔接物(linker):化学合成的8~12个核苷酸组成的寡核苷酸片段。以中线为轴两边对称,其上有一种或几种限制性核酸内切酶的识别序列,酶切后可产生一定的粘性末端,便于与具有相同粘性末端的另一DNA片段连接。 衔接头/接头(adaptor):化学合成的寡核苷酸,含有一种以上的限制性核酸内
在DNA复制时,合成方向与复制叉移动的方向一致并连续合成的链为前导链;合成方向与复制叉移动的方向相反,形成许多不连续的片段,最后再连成一条完整的DNA链为滞后链。 转录(transcription) :生物体以DNA为模板合成RNA的过程。 DNA分子上转录出RNA的区段,称为结构基因。 转录单元(transcription unit):一段从启动子开始至终止子结束的DNA序列。 启动子:指能被RNA聚合酶识别、结合并启动基因转录的一段DNA序列。 转录起点:与新生RNA链第一个核甘酸相对应DNA链上的碱基。 增强子:指能使与它连锁的基因转录频率明显增加的DNA序列。 转录终止子:是在一个基因编码区下游的可被RNA聚合酶识别和停止合成RNA的一段DNA 顺序。 单顺反子mRNA:只编码一个蛋白质的mRNA。 多顺反子mRNA:编码多个蛋白的mRNA。 操纵子:多顺反子mRNA是一组相邻或相互重叠基因的转录产物,这样一组基因可被称为一个操纵子。一个操纵子(元)通常含有一个启动序列和数个编码基因 基因:产生一条多肽链或功能RNA所必需的全部核苷酸序列。 RNA的编辑:是指转录后的RNA在编码区发生碱基的突变、加入或丢失等现象。 SD序列:mRNA中用于结合原核生物核糖体的序列。在mRNA分子的起始码上游8-13个核苷酸处的顺序 翻译:指将mRNA链上的核甘酸从一个特定的起始位点开始,按每三个核甘酸代表一个氨基酸的原则,依次合成一条多肽链的过程。 三联子密码:mRNA链上每三个核甘酸翻译成蛋白质多肽链上的一个氨基酸,这三个核甘酸就称为密码子或三联子密码(triplet coden) 。 简并:由一种以上密码子编码同一个氨基酸的现象 同义密码子:对应于同一氨基酸的密码子 组成性表达:指不大受环境变动而变化的一类基因表达。
名词解释 基因工程:用人工方法, 在体外对DNA分子进行切割、连接,组成重组DNA分子,再导入生物体内,并使其在异种生物内复制、表达,从而使受体生物获得新的遗传性状,这一全过程称为基因工程。(PPT) 限制酶:限制酶是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列,并由此切割DNA双链结构的核酸内切酶。(P 21页) DNA连接酶:DNA连接酶是一种能够将两段DNA拼接起来的酶称为DNA连接酶。 (或DNA连接酶是一种能够催化双链DNA片段紧靠在一起的3`羟基末端与5`磷酸基团末端之间形成磷酸二酯键,使两末端连接起来的酶)(P 27页) DNA聚合酶:DNA聚合酶是能够催化DNA复制和修复DNA分子损伤的一类酶。(P 30页)DNA修饰酶:DNA修饰酶是一类通过添加或删除化学基团来修饰DNA分子的酶,主要有末端脱氧核苷酸转移酶(简称末端转移酶)、碱性磷酸酶、T4噬菌体多核苷酸激酶等。(P 22页与网上整理结合) 质粒:质粒是一些存在于微生物细胞染色体外的小型闭合环状双链DNA分子,是能够进行独立复制并保持恒定遗传的复制子。(P 42页) 穿梭质粒:穿梭质粒载体是指一类由人工构建的具有两种不同复制起点和选择标记,因而可在两种不同的寄主细胞中存活和复制,并可以携带着外源DNA在不同物种的细胞之间往返穿梭的质粒载体。(P 56页): 噬菌粒:噬菌粒是一类由质粒载体和单链噬菌体载体结合而成的新型载体系列。(P 77页)粘粒载体:粘粒又称柯斯质粒,是一类由人工构建的含有λDNA粘性末端cos序列和质粒复制子的杂种质粒载体。(P 70页) M13噬菌体载体: M13噬菌体是一种含有6.4kb环状单链DNA分子的大肠杆菌丝状噬菌体。(73页及PPT) 克隆载体:克隆载体是指具有在细胞内进行自我复制能力的DNA分子,是外源基因的运载体,
一、名词解释 1、分子生物学 2、基因工程 3、DNA的变性与复性 4、细胞学说 5、遗传密码的简并性 6、DNA半保留复制、半不连续复制 7、SD序列 8、开放阅读框(ORF) 9、多顺反子 10、蓝白斑筛选 11、中心法则 12、限制修饰系统 13、断裂基因 14、单链结合蛋白 15、核酶 16、密码子家族 17、TA克隆 18、PCR 19、SNP 20、操纵子学说 21、DNA重组技术 22、减色效应-增色效应 23、可变剪接 24、反转录 25、同尾酶 26、加帽反应 27、蓝白斑筛选 28、表观基因组学 29、DNA的溶解温度 30、DNA的大C值 31、重叠基因 32、引物酶 33、逆转录 34、限制性内切酶 35、载体的选择标记 36、DNA甲基化
37、端粒 38、端粒酶 39、前导链 40、启动子 41、反式作用因子 42、同义密码子 43、多克隆位点(MCS) 44、基因组计划 45、C值悖论 46、顺式作用元件 47、胸腺嘧啶二聚体 48、寄主的限制修饰现象 49、拓扑异构酶 50、DNA的溶解 51、拓扑异构体 52、间隔基因 53、假基因 54、同源异型蛋白 55、翻译 56、多重PCR 57、抗终止作用 58、SD序列 59、空载tRNA 60、cDNA RACE 61、分子杂交 62、cDNA文库 63、载体 64、RT-PCR 65、反义RNA 66、延伸tRNA 67、起始tRNA 68、探针 69、反式剪接 70、增强子 71、动物基因工程 72、基因组 73、限制性内切酶 74、单顺反子
75、密码子 76、转录 77、RNA干扰 78、中心法则 79、回环模型 80、TATA box 81、前导链 82、目的基因 83、RFLP 84、RACE 二、判断 1、大肠杆菌DNA生物合成中,DNA聚合酶I主要起聚合作用。( ) 2、DNA半保留复制时,后随链的总体延伸方向与先导链的延伸方向相反。( ) 3、原核生物DNA的合成是单点起始,真核生物为多点起始。() 4、以一条亲代DNA(3’→ 5’)为模板时,子代链合成方向5’→ 3’,以另一条亲代DNA链 5’→ 3’为模板时,子代链合成方向3’→ 5’。() 5、RNA的生物合成不需要引物。() 6、大肠杆菌RNA聚合酶全酶由4个亚基(α2ββ’)组成。( ) 7、大肠杆菌在多种碳源同时存在的条件下,优先利用乳糖。 ( ) 8、在DNA生物合成中,半保留复制与半不连续复制指相同概念。() 9、逆转录同转录类似,二者均不需要引物。() 10、真核生物染色体核心组蛋白的乙酰化、组蛋白H1的磷酸化,都会使基因得以失活。() 11、在原核细胞中,起始密码子AUG可以在mRNA上的任何位置,但一个mRNA上只有一个起 始位点。( ) 12、蛋白质生物合成过程中,tRNA在阅读密码时起重要作用,他们的反密码子用来识别mRNA上的密码子。( ) 13、表观遗传效应是不可遗传的。( ) 14、cAMP与CAP结合、CAP介导正性调节发生在有葡萄糖及cAMP较高时。( ) 15、DNA甲基化永久关闭了某些基因的活性,这些基因在去甲基化后,仍不能表达。 () 16、RNA聚合酶催化的反应无需引物,也无校对功能。( ) 17、基因是存在于所有生命体中的最小遗传单位 18、人类基因组中大部分DNA不编码蛋白质 19、蛋白质生物合成过程中,tRNA在阅读密码时起重要作用,他们的反密码子用来识别 mRNA上的密码子。 ( )
高一(生物)基因工程及其应用(第1课时)学案 编制人初审人审核人编制时间 5月20日 班级姓名第小组 【学习目标】: 1.简述基因工程的基本原理; 2.说出基因工程的基本工具 3 简述基因工程的基本操作步骤 【问题导学】: 学点1.基因工程的概念:阅读课本P102第2段回答下面的问题: 1. 基因工程又叫技术或技术。通俗地说,就是按照人们的意愿,把一种生物的提取出来,加以,然后放到另一种生物的细胞里,地改造生物的。 2.精读概念,想一想基因工程为什么又叫基因拼接技术”? 学点2. 基因工程的工具: : ﹙1﹚基因的“剪刀”:学习课本P102第3段回答下面的问题 ①基因的“剪刀”是指:(简称__________) 一种限制酶只能识别特定的核苷酸序列,并在的切点上切割DNA分子。 ②EcoRⅠ限制酶识别的特定序列是什么?在哪个部位将序列切开? ③什么是黏性末端?不同的酶切出的黏性末端是否相同?这体现了酶的哪种特性? 【试一试:】试写出下列序列受EcoRⅠ限制酶作用后的粘性末端 CTTCAT GAATTC CCTAA GAAGTA CTTAAG GGATT (2)、基因的“针线”:阅读课本P103第1段回答下面的问题 ①基因的“针线”是指_______ 它可以“缝合”和交替 连接而构成的DNA骨架上的缺口。 ②DNA连接酶作用的部位是氢键吗? 【试一试:】请在右图中标出DNA连接酶连接的部位。 (3)、基因的“运载体”:阅读课本P103第2段回答下面的问题 ①基因工程中,目前常用的运载体有________、________和______________等。 质粒存在于中,是拟核或细胞核外能够的分子。 ②运载体的作用是什么?质粒的本质是什么? 学点3. 基因工程的操作步骤:阅读课本P103第3段思考下面的问题 ①什么是目的基因? ②提取目的基因时需要对目标DNA切割几次才能获得目的基因? ③目的基因与运载体结合时需要对质粒切割几次? ④切取目的基因和运载体时是否需要使用相同的限制酶?为什么? ⑤基因工程操作的一般步骤为:__________________、目的基因与___________结合、将目的基因导入_________________、目的基因的________和________。 【小试牛刀】:重组DNA分子的模拟操作(以小组为单位,合作完成)
基因工程复习试题 (名词解释和问答仅供参考) 名词解释: 1、基因工程(genetic engineering):就是在分子水平上,提取(或合成)不同生物的遗传物质(基因),在体外切割,再和一定的载体拼接重组,然后把重组的DNA 分子引入细胞或生物体内,使这种外源DNA(基因)在受体细胞中进行复制与表达,按人们的需要繁殖扩增基因或生产不同的产物或定向地创造生物的新性状,并能稳定地遗传给下代。 2、载体(vector):基因工程中,携带目的基因进入宿主细胞进行扩增和表达的工具。 3、限制性核酸内切酶(restriction endonuclease):定义:是一类能识别双链DNA分子中的特定核苷酸序列,并由此切割DNA双链结构的核酸内切酶。主要从原核生物中分离纯化出来。 4、1)同裂酶(isoschizomers):来源不同,识别位点和切割位点均相同的限制性内切酶。即同裂酶产生同样的切割,形成同样的末端。同裂酶对识别序列的甲基化状态有不同的限制性反应。2)同尾酶(isocaudamer):来源不同,识别序列也不相同,但切出的DNA片段具有相同的末端序列。3)同位酶:识别序列相同,但切割位点不同。 5、酶活性单位:1个酶活性单位就是指1min能转化1mmol底物的酶量。 6、DNA连接酶:能催化双链DNA片段靠在一起的3′羟基末端和5′端磷酸基团末端之间形成的磷酸二酯键,使两末端连接的一种核酸酶。 7、DNA聚合酶:作用是指在引物和模板的存在下,把脱氧核糖核苷酸(dNTP)连续地加到引物链的3’–OH 末端,催化核苷酸的聚合作用。 8、DNA连接酶能够封闭双螺旋DNA骨架上的缺口,但不能封闭裂口。缺口(nick):即在双链DNA的某一条链上两个相邻核苷酸之间失去一个磷酸二酯键所出现的单链断裂; 9、常用连接酶:E.coli DNA 连接酶、T4 DNA 连接酶(常用)。既能进行粘性末端的连接,又能进行平末端的连接,但E.coli DNA 连接酶进行平末端连接的效率低。 10、DNA连接酶的连接条件:必须是两条双链DNA、一条链的3‘末端有游离的羟基(-OH),而另一条链的5’端具有一个磷酸基团(-P)、需要能量(ATP或NAD+)。 11、T4多核苷酸激酶:是一种磷酸化酶,可将ATP的磷酸基团转移到DNA或RNA的5‘末端。1)5‘加磷酸基团。对于缺乏5‘磷酸的DNA或合成接头进行磷酸化。2)末端标记。 12、末端转移酶TDT 来源:小牛胸腺活性:不依赖模板的DNA 聚合酶,能催化dNTP 掺入DNA 3′-OH 末端。当反应液中只有一种脱氧核苷酸时,可形成仅有一种核苷酸组成的3′尾巴,称之为同聚物加尾。功能:1)主要用于给外源DNA片段及载体分子加上互补的同聚物尾巴,便于连接。2)末端标记 13、碱性磷酸酶:细菌碱性磷酸酶(bacterial alkaline phosphatase,简称BAP)、小牛肠碱性磷酸酶(calf intestinal alkaline phosphatase,简称CIP)特性:催化除去DNA或RNA 5′端的磷酸基团。功能:1)DNA分子片段5′末端的去磷酸化,防止自身连接。2)可作为5′-末端标记的DNA片段。 14、分子杂交技术:分子杂交是用于检测混合样品中特定的核酸分子和蛋白质分子是否存在,以及其相对分子质量的大小的一种方法。杂交技术:是利用DNA分子的变性、复性以及碱基互补配对的高度精确性,对某一特异性DNA序列进行探查的技术。 15、Southern杂交(预杂交、杂交、洗膜) 分子杂交:预杂交:将结合了DNA 分子的滤膜先与特定的预杂液进行预杂交,也就是将滤膜的空白处用鱼精DNA 或牛奶蛋白封闭起
《医用基因工程》复习思考题 第一章基因和基因组及基因工程的概念 一、名词概念 ①移动基因(插入序列;转位子);②断裂基因;③RNA剪辑; ④内含子(间隔序列)与表达子;⑤重叠基因;⑥重复序列;⑦假基因;⑧启动子与终止子;⑨起始位点、终止位点。 二、讨论题 1.什么叫基因?何谓基因的新概念?基因的主要功能是什么? 2.一种基因一种酶的提法妥否? 3.基因密码子三联体间是否存在着逗号? 4.基因表达的产物中,氨基酸序列相同时,基因密码子是否一定相同?为什么? 5.何谓转位子和转位作用?转位的后果如何? 6.基因中最小的突变单位和重组单位是什么? 7.基因工程应包括哪些内容?何谓基因工程的四大里程碑和三大技术发明? 8.真核细胞基因组中常有内含子存在,能否在原核细胞获得表达?能,为什么?不能,为什么? 第二章基因工程中常用的工具酶 1.什么是限制性核酸内切酶? 2.什么是R/M现象?如何解释? 3.II型核酸内切酶的基本特点有哪些? 4.影响II型核酸内切酶活性的因素有哪些?如何克服和避免这
些不利因素? 5.DNA连接酶有哪两类?有何不同? 6.甲基化酶有哪两类?有何应用价值? 7.什么叫同尾酶、同裂酶?在基因工程中有何应用价值? 8.平末端连接的方法有哪些?(图示) 9.Klenow酶的特性和用途有哪些?举例说明。 10.反转录酶的特性有哪些?有何应用价值? 11.列举碱性磷酸酶BAP/CAP的应用之一。 12.列举末端核苷酸序列转移酶的应用之一。 13.质粒单酶切点的基因连接如何降低本底和防止自我环化和提高连接效率? 14.基因片段与载体的平末端连接的方法有哪些? 15.用寡核苷酸和衔接物DNA的短片段连接时为使基因内部的切点保护,常用何种办法解决? 第三章基因克隆载体 1.基因工程常用的载体有哪5种?其共同特性如何? 2.什么是质粒?质粒分哪几种?有哪两种复制类型,质粒的分子生物学特性有哪些? 3.质粒存在的三种形式是什么? 4.分离质粒的基本步骤有哪些? 5.分离纯化质粒的方法有哪几种?简述CsCl密度梯度(浮密度)分离法、碱变性法的原理,如何选择合适的分离方法? 6.作为理想质粒载体的基本条件有哪些? 7.什么叫插入失活,举例说明之。 8.构建pBR322质粒载体的亲本质粒有哪些? 9.什么叫插入型和替换型噬菌体载体?插入型和替换型入噬菌体
项目1 一、名词解释 基因、操纵子、外显子、内含子、启动子、增强子、终止子、SD序列、半保留复制、复制、转录、翻译、遗传密码 二、问答题 1.简述核酸的定义、分类、组成、结构。 2.核酸有哪些重要的理化性质?这些性质在基因操作中有什么作用? 3.比较病毒基因组、原核生物基因组、真核生物基因组的特点。 4.简述DNA复制、RNA转录以及蛋白质翻译的过程及其参与的酶和蛋白因子的作用。 5.以大肠杆菌乳糖操纵子为例说明原核生物基因表达调控的特点。 项目2 一、名词解释 基因工程、基因操作技术、基因克隆、基因文库 二、问答题 1.基因操作的基本步骤是怎样的?每一步骤各需要哪些物质参与? 2.目的基因克隆的方法有哪些? 项目3 一、名词解释 质粒、电泳 二、问答题 1.简述提取核酸的基本步骤。 2.简述提取质粒DNA的经典方法的步骤及原理。 3.简述提取基因组DNA的经典方法的步骤及原理。 4.结合实验比较经典碱裂解法与试剂盒法提取质粒DNA的差异。 5.结合实训简述试剂盒法所加试剂的作用? 6.简述测定核酸浓度和纯度的方法原理及步骤。 7.简述琼脂糖凝胶电泳分离DNA的原理、操作步骤、影响因素 8.结合DNA琼脂糖凝胶电泳实训简述所用试剂的作用。 9.简述SDS-PAGE电泳分离蛋白质的原理及操作步骤 项目4 一、名词解释 PCR、变性、变性温度、退火、退火温度、延伸、延伸温度、载体、质粒载体、λ噬菌体载体、病毒载体、克隆载体、表达载体、多克隆位点(MCS)限制性内切酶、回文结构 二、问答题 1.简述PCR反应的基本原理 2.简述PCR反应体系的组成和体系中各成分的作用 3.简述PCR的标准反应过程设定那些参数?其中那个参数最为重要,需要在实际工作中优化。 4.简述PCR引物设计的原则。 5. 简述载体的概念、种类。 6.简述作为载体应具备的条件。 7.简述表达载体应该具备的条件 8.简述 噬菌体载体的特点及其类型