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血清中病毒DNA提取方法

血清中病毒DNA提取方法
血清中病毒DNA提取方法

血清中病毒DNA提取方法。

一煮沸法

从血清中提取病毒DNA,与其它方法比较,此法最为简单,并且很多文献都有报道。

鲁艳芹等在一篇名为《乙型肝炎病毒荧光定量PCR检测方法及专用试剂盒》专利(专利申请号为200610044679)中对六种方法提取血清中乙型肝炎病毒DNA的效率做了比较,得出结果是:NaOH裂解法最佳,其次是直接煮沸法,但该法不适合提取粘稠度较高的血样标本。说明直接煮沸法还是可以的。

另外,陈秀珍等人《采用不同方法提取血清及乳汁中HBV-DNA扩增结果分析》对抽提法、热处理、碱变性法提取乙肝标志物阳性出产妇血清及乳汁中HBV-DNA方法进行评价,发现血清标本HBV-DNA的提取,三种方法无明显差异。

陈秀珍等:取血清100ul,放入0.5ulEP管中,沸水中煮10分钟,10000r/m,离心5分钟,取上清备用。

专利:取血清100ul和100ulPBS,煮沸10分钟,12000rpm, 离心5分钟,取上清备用.

两篇文章所用的煮沸法大致一样,只是是否加PBS的差异。加PBS,这样使得血清在煮10分钟后,不会干掉,没有上清,另外,它不会干扰核酸的提取。加TE是否也可以呢?

二裂解液煮沸法

郭龙华等《3种方法从血清标本中提取I--IBV DNA 的比较》

比较3种从血清标本中提取HBV DNA方法的效果,选出一种快速、简单、高效提取血清中HBV DNA的方法——裂解液煮沸法,此法提取的HBV DNA模板含量最高,与碱裂解法和蛋白酶K-苯酚抽提法之间的差异显著(P

裂解液配制(10 mmol/L Tris—HC1,1 mmol/L EDTA,15 mmol/L 氯化钠,0.5%SDS,pH 8.0).

方法:取5Oul 血清加1Oul 裂解液,混匀,煮沸1O分钟,5 O00xg 离心5分钟,取上清液备用,平均每管大约可以取到2Oul上清液。裂解液煮沸法是一种快速、简便、高效的提取HBV DNA的方法。特别适用于大批量标本,该法同时可节约实验成本和时间,具有很大的应用价值。

三碱裂解法

在不同的文献中,虽然都称为碱裂解法,但是所用的量不同,导致的结果就不同。

郭龙华等《3种方法从血清标本中提取I--IBV DNA 的比较》,所用的碱裂解法:5Oul血清加45ulddH20加5ulmol/L氢氧

化钠,混匀,37℃2O分钟,加入5 u1mol/L 氯化氢,10 O00xg

离心5分钟,取上清液备用.NaOH的终浓度只有0.01M,所以去蛋白效果不好,明显影响了PCR效果。

而陈秀珍等人《采用不同方法提取血清及乳汁中HBV-DNA扩增结果分析》,所用的碱变性法:50ul样品加入0.5mlEp管中,再加50ul02mol/L NaOH,置37℃水浴1小时,再加50ul 0.2mol/L HC1

置93℃10分钟,10000rpm/min离心5分钟,上清液备用. 与抽提法和热处理法无显著性差异。此法NaOH的终浓度为0.1M。

另外,鲁艳芹等在《乙型肝炎病毒荧光定量PCR检测方法及专用试剂盒》专利(专利申请号为200610044679)中使用的碱裂解法:100ul 血清加入100ul0.3mol/L 的NaOH ,80℃温育10分钟,12000rmp 室温离心5分钟,吸取上清加入50ul 0.4mol/L 的Tris-HCl PH7.5, 4℃保存。结果显示为阴性。

病毒DNA提取

小鼠血浆中HSV-1 DNA的提取 [目的] 掌握血浆中病毒DNA 提取的原理,熟悉其提取方法。 [原理] E.Z.N.A.?Viral DNA Kit 该试剂盒提供了从小于250ul血浆、血清、无细胞培养液等样品中快速简单地提取病毒DNA的方法,液体样品经Buffer BL和蛋白酶(OB)消化后,经乙醇调节结合条件,过柱吸附DNA,再经过两步快速洗涤后,最后用Elution Buffer (10mM Tris,pH8.5)溶解基因组DNA。纯化的DNA可直接用于PCR,Southern杂交,酶切等实验。 [试剂及仪器]旋涡混合振荡仪;微量DNA定量仪;台式离心机;65℃水浴锅。 1.5ml无菌EP管(2个/人);EP抗凝管(含100ul抗凝剂)(K);1000ul枪及枪头;。Hibind DNA 结合柱(1个/人);2ml收集管(3个/人);OB蛋白酶(OB);Buffer B L(含线性丙烯酰胺)(BL);乙醇(乙);Buffer HB(HB);DNA Wash Buffer(W);Elution Buffer(EB)。 [实验步骤] 一、血浆样品的制备: 1.用微量加样器取100ul抗凝剂加入1.5mlEP管中。 2.右手抓起小鼠尾巴,用左手固定动物,压迫眼球,尽量使眼球突出,右手用镊子迅速摘除 眼球,将流出的血液滴入含有抗凝剂的1.5ml EP管中,迅速混匀后,10000rpm,离心3min。 上层黄色透明的即为血浆。 二、DNA的提取 1.取血浆250ul(如不足250ul,用Elution Buffer补足250ul)于1.5ml无菌EP管中。 2.加入10ul OB蛋白酶和250ul BL Buffer(含4ul线性丙烯酰胺用于填补病毒DNA在吸附 柱上的本底吸附),于旋涡混合振荡仪上最大速度振荡15sec。 3.65℃孵育10min。孵育过程中,用旋涡混合振荡仪混匀一次。 4.加入260ul乙醇,旋涡混合振荡仪最大速度振荡20sec。12000×g离心10sec,使盖子上的 液体沉于管中。 5.将Hibind DNA结合柱装在2ml收集管中,将第4步离心的上清中所有液体(约760ul) 加入Hibind DNA结合柱装上,8000×g离心1min。卸下收集管,将收集管及其中的液体弃去。 6.将Hibind DNA结合柱装在另一个新的收集管中,向柱中加入500ul HB Buffer,8000×g 离心1min,卸下收集管,倒掉其中的液体后,将收集管重新装在柱子上。、 7.向柱中加入700ul DNA Wash Buffer,8000×g离心1min,卸下收集管,将收集管及其中 的液体弃去。 8.将Hibind DNA结合柱装在另一个新的收集管中,向柱中加入700ul DNA Wash Buffer, 8000×g离心1min,卸下收集管,倒掉其中的液体后,将收集管重新装在柱子上。 9.将空的Hibind DNA结合柱15000×g离心2min,以去掉其中残余的液体。卸下收集管, 将收集管及其中的液体弃去。----这一步非常重要 10.将Hibind DNA结合柱装在另一个新的无菌1.5ml EP管上(事先做好标记),加入50-100ul 65℃预热的Elution Buffer,室温静置5min后,8000×g离心1min,洗脱液中即含有病毒DNA。 三、DNA定量: 微量DNA定量仪。取1.5ul用于DNA定量。

病毒基因组DNA提取试剂盒使用说明书

病毒基因组DNA 提取试剂盒 Virus Genomic DNA Kit (目录号:HS0307) 产品包装 自备试剂 无水乙醇 储存条件 蛋白酶K 于-20℃,其他组分室温(15 ~ 25℃) 产品简介 本试剂盒适用于从新鲜或冷冻的血浆、血清和无细胞体液中提取高质量的病毒DNA 。无需使用苯酚、氯仿等有机溶剂抽提,独特的缓冲液/蛋白酶K 体系能迅速裂解病毒,使病毒蛋白与DNA 分离,在蛋白酶K 的作用下降解病毒蛋白,在高盐状态下将病毒DNA 选择性吸附于硅基质膜上,再通过快速的漂洗、离心步骤,去除蛋白等杂质,最后低盐的洗脱缓冲液将高纯度的病毒DNA 从吸附柱膜上洗脱下来。 本试剂盒操作简单、快速,所得病毒DNA 不含蛋白、核酸酶和其他杂质,可直接用于PCR 、RT-PCR 、Real-Time PCR 、印迹等分子生物学实验。 产品特点 1.简便快速,1小时内可获得高纯度的病毒基因组DNA 。 2.无需有机溶剂抽提,使用安全。 3.重复性好,产量高。 北京厚生博泰科技有限公司 Beijing Hooseen Biotech Co., Ltd.

4.所得病毒DNA纯度高,无污染物和抑制剂,方便下游应用。 注意事项 1.血清或血浆避免反复冻融,否则会使蛋白变性或产生沉淀,导致提取的DNA片段小,提取量下降。 2.如缓冲液Buffer GB、Buffer GD结晶或产生沉淀,可在56℃水浴溶解。 3.所有离心步骤均为室温下操作。 操作步骤 1. 取1.5 ml离心管(自备),加入20 ul的Proteinase K溶液。 2. 向离心管中加入200 ul血清或血浆,然后再加入200 ul Buffer GB,涡旋震荡15 sec。(注意:1、样本体积不足200 ul可以加入0.9% NaCl(自备)补足。2、为确保样本有效裂解,加入Buffer GB后,需将样本与Buffer GB充分混匀。) 3.56℃孵育15 min,短暂离心,将管壁上的溶液收集到管底。 4. 加入250 ul无水乙醇,涡旋震荡15 sec,室温放置5 min,短暂离心,将管壁上的溶液收集到管底。 (注意:如果环境温度超过25℃,无水乙醇应在冰上预冷后使用。) 5.将一个Spin Columns CG*放入Collection Tubes(2 ml)中,将上一步所得溶液转移到离心吸附柱中,10 000 rpm离心30 sec,弃收集管中的废液。 6. 向吸附柱内加入500 ul的Buffer GD,室温10 000 rpm离心30 sec,弃收集管中废液。(注意:Buffer GD中含有乙醇,用后及时盖紧,以防乙醇挥发) 7. 向吸附柱内加入500 ul的Buffer PW,室温10 000 rpm离心30 sec,弃收集管中废液。(注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤7一次。Buffer PW中含有乙醇,用后及时盖紧,以防乙醇挥发) 8.向吸附柱中加入500 ul无水乙醇,10 000 rpm离心30 sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 9.室温12 000 rpm离心3 min,甩干残留液体。 (注意:此步不能省略,否则残留乙醇会影响质粒的后续使用) 10. 将离心吸附柱置于一个新的1.5 ml塑料离心管(自备)中,小心打开吸附柱的盖子,室温放置3 min,使吸附膜完全变干。加入30 ~ 100 ul的洗脱液,室温放置2 ~ 5 min。12 000 rpm

病毒基因组DNA RNA快速提取试剂盒II操作方法及步骤说明书

试剂盒组成、储存、稳定性: 试剂盒组成保存50次(RN2201) 裂解液VLB 室温20 ml Poly Carrier -20℃200μl 去蛋白液RE 室温25 ml 漂洗液RW 室温10 ml 第一次使用前按说明加指定量乙醇 RNase-free H2O 室温10 ml RNase-free 吸附柱RA和收集管 室温50套 室温储存12个月不影响使用效果,各溶液使用后应及时盖紧盖子。 产品介绍: 采用特异性结合病毒DNA/RNA 的离心吸附柱和独特的缓冲液系统,病毒DNA/RNA提取试剂盒适合于从无细胞体液,包括血浆、血清、腹水、培养细胞上清液、脑脊髓液及尿液等中快速提取高纯的病毒DNA/RNA。该产品可以满足绝大多数的病毒RNA/DNA的同时提取要求,如病毒RNA:HCV(丙肝病毒),HIV(艾滋病毒),和HTLV(人类嗜T淋巴细胞病毒);病毒DNA:HBV(乙肝病毒)和CMV(巨细胞病毒)等等。病毒裂解后,DNA/RNA后在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜(特别配备了Poly Carrier可以从体系中轻松捕获微量核酸),再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,将盐、细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净的病毒DNA/RNA从硅基质膜上洗脱。纯化后的病毒核酸无杂质和PCR抑制剂,可直接适用于PCR/RT-PCR分析。 产品特点:

1.不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。 2.节省时间,简捷,单个样品操作一般可在20分钟内完成。 3.多次柱漂洗确保高纯度,提取的病毒DNA/RNA 纯度高,质量稳定可靠,可适用 于各种常规操作,包括PCR/RT-PCR、酶切、测序、Southern 杂交等。 注意事项: 1.所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机, 如Eppendorf 5415C 或者类似离心机。 2.开始实验前将需要的水浴先预热到特定温度备用。 3.裂解液VLB和去蛋白液RE中含有刺激性化合物,操作时戴乳胶手套,避免沾染 皮肤、眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。4.Poly Carrier: Poly Carrier使用方法:如果起始处理量很少,我们推荐使用Poly Carrier,如果预期有较大量核酸产量,用户可以根据需要选择是否加入Poly Carrier。使用时在每个样品提取所需裂解液VLB中加入4μl Poly Carrier储存溶液,将裂解液VLB与Poly Carrier溶液充分颠倒混匀即可(裂解液VLB容易起泡沫,请勿使用涡旋振荡混匀)。也可根据样品数量,在总共需要的裂解液VLB中加入总共需要的Poly Carrier混匀备用。混合液在室温24小时内稳定。 操作步骤:(实验前请先阅读注意事项) 提示:第一次使用前请先在10ml漂洗液RW中加入40ml无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入! 1.200μl血清等体液(需回复到室温,不足可用0.9% NaCl或者PBS补足)转入上 述1.5ml离心管,加入400μl 裂解液VLB,立刻涡旋振荡充分混匀。

RNA病毒基因组提取试剂盒使用说明

RNA病毒基因组提取试剂盒使用说明 货号:R2000 规格:50T/100T 保存:室温(15℃-25℃)干燥条件下可保存12个月,更长时间的保存可置于2℃-8℃。产品内容: 试剂盒组成R2000-50R2000-100 蛋白酶K1ml2ml 洗柱液50ml2ml 结合液25ml50ml×2 漂洗液15ml50ml RNase free ddH2O15ml15ml×2 RNase free吸附柱50个100个 RNase free收集管(2ml)50个100个 产品介绍: RNA病毒基因组提取试剂盒适合于从血清、细胞上清、淋巴液中提取RNA病毒基因组,不适合于细胞等组织内RNA病毒基因组的提取。使用本试剂盒提取的基因组RNA可用于RT-PCR实验。 操作步骤: 使用前请先在漂洗液中加入一瓶新开启的无水乙醇,加入到离瓶口约0.5-1cm距离,盖好摇匀。所有离心步骤均在2-8℃条件下进行。 1、取病毒上清液0.5ml,12000rpm离心5min,尽量吸尽上清使用,弃去沉淀(如无沉淀

可省去此步)。 2、向病毒上清中加入20ul10mg/ml的蛋白酶K,充分混匀,65℃消化10min,期间可颠倒离心管混匀数次。 3、吸附柱前处理:从包装中取出吸附柱,放入收集管中,加入700ul洗柱液,室温放置2分钟,2-8℃12000rpm离心2min,弃废液,将吸附柱放入收集管中待用。 4、向病毒上清中加入500ul结合液,充分混匀。再向管中加入400ul无水乙醇,充分混匀,此时可能会出现絮状沉淀,不影响RNA的提取,可将溶液和絮状沉淀都加入吸附柱中,静置2min。(吸附柱的最大容积为750ul,可分两次加入。一次吸附完离心后再将余下的混合液体加入柱中静置离心。) 5、12000rpm离心2min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。 6、向吸附柱中加入700ul漂洗液(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。 7、向吸附柱中加入500ul漂洗液,12000rpm离心1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。 8、12000rpm离心2min,将吸附柱置于室温或50℃温箱放置数分钟,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,否则漂洗液中的乙醇会影响后续的实验如酶切、PCR等。 9、将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜中央悬空滴加50ul-100ul经65℃水浴预热的RNase free ddH2O,室温放置5min,12000rpm离心2min。即可得到高质量的病毒基因组RNA。 注意事项: 1、经常更换新手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase污染。使用无RNase的塑料制品和枪头避免交叉污染。 2、样品应避免反复冻融,否则会导致提取的RNA提取量也下降。

病毒DNA提取

我要提取一种病毒的DNA,DNA是单链的,外面是病毒的蛋白质外壳包裹。 我的病毒样品是买来的灭活疫苗(vaccine)(干粉状),想用酚/氯仿来抽提DNA,请问病毒干粉要溶解在什么溶液里? 回复 1、病毒干粉可以溶解在PBS、HBSS或者营养液如1640或MEM中。 2、振荡溶解之后,取上清加入等体积的消化缓冲液(0.5M EDTA pH8.0.1M Tris·HCl pH7.4, 10% SDS) , 再加入蛋白酶K (20mg/ml) 至终浓度50ug/ml, 于50℃消化2 h。 3、取出300ul 的消化产物, 加入等体积的酚抽提一次。 4、用等体积的酚∶氯仿∶异戊醇再抽提两次,。 5、加入1/10体积的3M 乙酸钠(pH 5.2)和2倍体积的无水乙醇沉淀 6、70% 乙醇洗涤 7、待沉淀干燥后溶于含RNase A (40ug/ml) TE(pH 8.0) 溶液中。 谢谢您回答我的问题,还想请问,从疫苗(vaccine)干粉中提取DNA,跑琼脂糖凝胶电泳,能看到明显的条带吗?病毒干粉要取多少量来提取?另外,我曾经把疫苗(vaccine)中的病毒干粉溶解在无菌高纯水中,结果水变成了红色,应该是有些疫苗(vaccine)佐剂在影响,请问要如何排除疫苗(vaccine)佐剂影响,红色的物质可能是什么?? 红色的东西应该是保护剂的颜色,保护剂一般是蛋白或其他大分子一类的东西,对DNA提取可能会有一些干扰,如果有条件,可以细胞传代一次最好,不过可能影响也不是很大。疫苗(vaccine)干粉中提取的DNA跑琼脂糖凝胶电泳,能否看到明显的条带,主要与含有的病毒量、提取的DNA量有关。如果后续是扩增基因,微量的可能也就足够了。病毒干粉溶解具体看病毒说明书的推荐,如果没有一般用1-2ml的量来溶解,取多少量来提取DNA,按照说明书一般取300ul左右,如DNAzol。注意提取之前先离心,取上清提取DNA。 血清HBVDNA提取方法 裂解法: 试剂: TES:10mmol/LTris-HCl,pH8.0, 5mmol/L EDTA, 0.5%SDS 150μg/ml蛋白酶K 100μl血清加TES 方法: 65°C3小时 加等体积酚-氯仿-异戊醇,混匀,12000r/min离心10分钟,将上清吸入一新管 再用等体积氯仿-异戊醇提取一次,在上清中加入1/10体积的2mol/L乙酸钠和2倍体积的无水乙醇,-20℃放置30分钟(或过夜),沉淀DNA,用70%乙醇洗沉淀1次,12000rpm/min离心10分钟,倾去上清,晾干,加100μlTE缓冲液溶解沉淀 煮沸法提取血清HBV DNA: 吸200ul 血清放入0.5ml EP管中,沸水煮10分钟,10000rpm离心5min

血清中病毒DNA提取方法

血清中病毒DNA提取方法。 一煮沸法 从血清中提取病毒DNA,与其它方法比较,此法最为简单,并且很多文献都有报道。 鲁艳芹等在一篇名为《乙型肝炎病毒荧光定量PCR检测方法及专用试剂盒》专利(专利申请号为200610044679)中对六种方法提取血清中乙型肝炎病毒DNA的效率做了比较,得出结果是:NaOH裂解法最佳,其次是直接煮沸法,但该法不适合提取粘稠度较高的血样标本。说明直接煮沸法还是可以的。 另外,陈秀珍等人《采用不同方法提取血清及乳汁中HBV-DNA扩增结果分析》对抽提法、热处理、碱变性法提取乙肝标志物阳性出产妇血清及乳汁中HBV-DNA方法进行评价,发现血清标本HBV-DNA的提取,三种方法无明显差异。 陈秀珍等:取血清100ul,放入0.5ulEP管中,沸水中煮10分钟,10000r/m,离心5分钟,取上清备用。 专利:取血清100ul和100ulPBS,煮沸10分钟,12000rpm, 离心5分钟,取上清备用. 两篇文章所用的煮沸法大致一样,只是是否加PBS的差异。加PBS,这样使得血清在煮10分钟后,不会干掉,没有上清,另外,它不会干扰核酸的提取。加TE是否也可以呢? 二裂解液煮沸法 郭龙华等《3种方法从血清标本中提取I--IBV DNA 的比较》

比较3种从血清标本中提取HBV DNA方法的效果,选出一种快速、简单、高效提取血清中HBV DNA的方法——裂解液煮沸法,此法提取的HBV DNA模板含量最高,与碱裂解法和蛋白酶K-苯酚抽提法之间的差异显著(P

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