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乳腺癌基因检测方案

乳腺癌基因检测方案
乳腺癌基因检测方案

一、项目名称:遗传性乳腺癌基因检测(21个基因)

二、项目目的

肿瘤患者:了解自身肿瘤相关基因变异信息,辅助医生提供针对性治疗方案,查找致病原因,预测罹患其他肿瘤的几率,为亲属提供有效的遗传信息。

肿瘤患者家属及健康人群:提供遗传变异信息,并结合遗传咨询服务,辅助医生进行患癌风险分析,制定相应干预措施进行健康管理,从而降低受检者患癌风险。

三、项目内容

检测基因:BRCA1,BRCA2,CHEK2,PALB2,BRIP1,TP53,PTEN,STK11,CDH1,ATM,BARD1, MLH1,MRE11A,MSH2,MSH6,MUTYH,NBN,PMS1,PMS2, RAD50,RAD51C

样本类型:5-10ml外周血

取样方式:可由患者到医院抽血交与我方,或由我方安排抽血均可。

报告周期:30个工作日

四、项目使用技术

检测方法:基因芯片+NGS,即采用目标区域捕获与高通量测序技术,对检测基因的全部外

显子和剪切位点进行测序,并结合生物信息分析,获取该区域的基因突变信息。

项目优势:便捷:仅需5-10ml外周血

精准:准确率高达99.99%

全面:拥有完善的数据库资源进行解读

权威:依托华大先进的技术平台

五、项目流程:

患者咨询与知情同意—样本取样—样本寄送—样本和数据保存—基因检测—发送分析报告

其他相关项目简介:

一、乳腺癌个体化用药基因检测套餐

项目目的:分析化疗药物对肿瘤患者的药物敏感性及其毒副作用,根据个体化特性选择安全有效药物,对肿瘤实行有针对性的治疗。

化疗药物:铂类药物、5-FU、卡培他滨、吉西他滨、他莫西芬、紫杉醇、来曲唑、阿那曲唑、甲氨蝶呤、表柔比星、环磷酰胺

检测方法:质谱+Sanger

样本类型:5-10ml外周血

报告周期:7个工作日

二、肿瘤个体化用药指导基因检测 Oseq-T

项目内容:对目前肿瘤相关的500多个基因进行一次性全面解读,包含化疗药物27种,已经获FDA批准靶向药物33种以及正在进行临床试验药物28种

检测方法:基因芯片+NGS

样本类型:5-10ml外周血新鲜组织/石蜡切片

报告周期:30个工作日

三、肿瘤化疗用药指导12项

项目目的:分析化疗药物对肿瘤患者的药物敏感性及其毒副作用,根据个体化特性选择安全有效药物,对肿瘤实行有针对性的治疗。

化疗药物:吉西他滨、紫杉醇、长春新碱、甲氨蝶呤、环磷酰胺、铂类药物、表柔比星、5-FU、卡培他滨、伊立替康、阿那曲唑,来曲唑、他莫西芬

检测方法:质谱+Sanger

样本类型:5-10ml外周血

报告周期:7个工作日

详细情况可查询颢天生物

乳腺癌21基因检测,告别乳腺癌从这里出发

乳腺癌21基因检测 乳腺癌21基因检测是对21个与乳腺癌细胞增殖、侵袭、Her-2、激素等相关的基因进行定量并进行复发评分,为乳腺癌治疗的选择、预后判断提供依据。此外,21基因检测技术能够对肿瘤的生物学特性提供更为详尽的信息,从而为个体病例提供更为精确的治疗决策与预后信息,使临床医师能够选择出真正能够从内分泌或化疗中获益的患者。 检测意义 “乳腺癌21基因检测”是检测恶性肿瘤组织中一组特异基因的表达,对预测预后、复发、转移乃至指导治疗提供信息,最终目的是为患者的个体化治疗提供帮助。21基因检测结果以积分的形式表示,积分用于对肿瘤可能发生的生物学行为进行预测,提供个体化的治疗效果预测和1 0年复发风险的预测。 哪些人需要做“乳腺癌21基因检测”? l或l l期、雌激素受体阳性、淋巴结转移阴性及将要采用他莫昔芬治疗的新确诊乳腺癌患者。 绝经后,淋巴结阳性、雌激素受体阳性的浸润性乳腺癌患者,也可通过21基因检测评估是否需要化疗。 应在何时进行“乳腺癌21基因检测”? “乳腺癌21基因检测”应在患者接受手术(乳房肿瘤切除手术或乳房切除手术)之后,并在做出下一步治疗决定之前进行。 “乳腺癌21基因检测”属于一种非侵入性检测,患者无需再接受任何额外的穿刺程序,利用原来手术(乳房肿瘤切除手术、乳房切除手术或核心穿刺活组织裣查)过程中取出的组织进行检测即可。 乳腺癌21基因OncotypeDx检测的临床应用 乳腺癌21基因OncotypeDx检测能够为早期乳腺癌患者提供预测疾病复发概率的量化指标,它在判断患者对于化疗效果方面较传统方法具有明显优势。对于乳腺癌治疗,化疗是防止或者延缓患者术后肿瘤远期的复发。从临床研究中发现,被基因检测确定为高RS的患者化疗效果明显,而被确定为低RS的患者在化疗中的受益则十分微小。如果低RS乳腺癌患者,则术后采用化疗不但属于过度治疗,且会给患者带来不良反应,还会增加医疗费用。 1、国外研究者对NSABP B-20试验的651例肿瘤标本进行了检测。B-20试验是对雌激素受体阳性、淋巴结阴性的乳腺癌患者给予他莫昔芬联合化疗或他莫昔芬单纯治疗。研究表明,在低评分组,患者并未从化疗中受益;在高评分组,患者对化疗的获益程度极显著;在中等评分组,化疗仅为患者带来轻度的获益。由于B-20试验只纳入了淋巴结阴性的乳腺癌患者,因此研究者又对西南肿瘤研究组(SWOG)-8814试验的肿瘤标本进行了检测,结果证实,乳腺癌21基因OncotypeDx检测法的疗效预测价值同样存在于淋巴结阳性的乳腺癌患者。

BRCA基因检测实践

BRCA基因检测实践 复旦大学附属肿瘤医院分子病理实验室研究员山灵发表了《BRCA基因检测实践》的主 题演讲,首次分享中国人群卵巢癌组织和血液中BRCA1/2突变的比较数据。 BRCA1/2基因是一类肿瘤抑制基因,参与细胞同源重组修复(HRR)过程,2014年, 美国FDA批准了奥拉帕利可用于既往三线及以上铂类化疗的BRCA突变卵巢癌患者。 因此卵巢癌患者的BRCA突变检测,能更好的评估患者预后、优化治疗方案。针对不 同人群的BRCA突变情况,已有较多报道,但研究数据的人群都是以高加索人种为主, 更是缺少体细胞与胚系基因突变的比较。因此,针对中国人群的BRCA胚系和体细胞 突变情况的研究显得尤为迫切。 山博士首先介绍了BRCA检测的临床意义,根据国内外的指南共识,BRCA被用于高危人群的筛查、乳腺癌患者的手术方式选择、以及卵巢癌的用药选择。 山博士指出BRCA基因序列较大,整个BRCA基因的编码区突变都有可能造成BRCA基因的功能异常,而且目前的数据发现BRCA突变缺乏明确的突变热点,因此BRCA检测需要通过整个编码区的测序,通过比对目前大样本的数据库分析来确认。在下一代测序(NGS)的临床应用中,Ion Torrent平台相对操作和分析比较简单,且样本用量少报告时间短,比较适合临床样本的需求。

接下来对222例乳腺癌和169例卵巢癌在NGS上的BRCA数据进行了详细的分析,并首次发布了卵巢癌中组织样本(体细胞)和血液样本(胚系)的突变情况比较,以及使用毛细管电泳测序平台上的MLPA检测大片段缺失的结果,山教授深入浅出的对不同卵巢癌亚型中突变率进行了分析。 最后介绍了对BRCA数据的结果解读流程和参考数据库,以及建立中国人群数据的重要性和难点。

21基因Oncotype Dx对乳腺癌预后研究的进展

《中国癌症杂志 》2009年第19卷第12期 CHINA ONCOLOGY 2009 Vol.19 No.12 953 21基因Oncotype Dx对乳腺癌预后研究 的进展 [摘要] 目前最为有效的乳腺癌治疗模式是多学科综合标准化治疗。然而长期以来缺乏有效的预后预测手段来指导患者的个体化治疗,以至于相当一部分化疗获益甚少的低风险患者也不得不接受化疗。随着基因组学的发展,已有数个基因系列的检测结果被证实可以用于乳腺癌预后的预测,进而判断测患者从化疗中的获益,避免过度治疗。21基因Oncotype Dx检测正是其中之一,其有效性及准确性已在各种临床研究中得到了证实。本文就21基因Oncotype Dx对乳腺癌预后研究的进展进行综述。 [关键词] 乳腺癌; 21基因Oncotype Dx; 预后; 预测 中图分类号:R737.9 文献标识码:A 文章编号:1007-3639(2009)12-0953-06 Progress in the research on 21-gene Oncotype Dx in breast cancer prognosis LIAO Ning,ZHANG Xu-chao (Department of Breast Cancer, Cancer Center, Guangdong General Hospital, Guangzhou Guangdong 510080,China) Correspondence to:LIAO Ning E-mail:drliao_ning@https://www.wendangku.net/doc/fe8936310.html, [Abstract ] Currently the most effective treatment strategy for breast cancer is standardized multi-discipline comprehensive treatment. However, there are no effective models that can accurately predict prognosis, so that no guidance of individualized treatment has yet been set up, resulting in a proportion of patients with low risk who received chemotherapy with little benefit . With the development of genomics, several gene sets have been demonstrated to be helpful in predicting of breast cancer prognosis and grading the patients’ benefit from chemotherapy, thus avoid overtreatment. 21-gene Oncotype Dx was reported as one of them and has been demonstrated to be effective and accurate in various clinical studies. This paper summarizes researches on 21-gene Oncotype Dx in breast cancer. [Key words ] breast cancer; 21-gene Oncotype Dx; prognosis; prediction 通讯作者:廖宁 E-mail:drliao_ning@https://www.wendangku.net/doc/fe8936310.html, 乳腺癌是威胁女性的恶性肿瘤之一,近20年来,以手术为中心,化疗、放疗、内分泌治疗为辅助的多学科综合治疗模式?到长足的发展,使乳腺癌的复发和死亡率显著降低,但仍然缺乏有效的方法能够较为准确地预测患者的复发风险并给予相应的治疗。近几年来,随着基因组学的研究深入,已发现几个能够比临床病理学指标更能准确预测肿瘤复发的多基因标记物。针对雌激素受体阳性患者的“21基因检测”(Oncotype Dx)已经被证实比临床病理学指标更能准确预测雌激素受体阳性、腋下淋巴结阴性且降低服用他莫昔芬患者的远处转移风险[1-4]。该项检测不仅可以作为一种诊断 方法,而且还可以预测上述患者接受内分泌治疗或化疗的获益情况。本文就21基因检测的内容、研制和认证的研究及其在临床实践中的运用等方面作一综述。 1 乳腺癌21基因检测的由来 1.1 21基因检测的目的 临床和病理学的疾病分期是早期乳腺癌风险预测的基础。疾病分期对于病情程度的?述虽有限制,但却是目前最为广泛的预测手段。肿瘤科医师给早期乳腺癌患者治疗时面临的首要挑战在于决定哪些患者需要接受辅助性化疗。一直以来,治疗方案的选择是以肿瘤的临床病理特征为依?,比如淋巴结的转移以及组织学分级。但淋巴结中的微小转移,以及一些重要的肿瘤特征如雌激素受体的表达和Her-2的过表达等因素的不确定性,不但

乳腺癌患者HER2基因检测——

万方数据

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万方数据

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乳腺癌患者HER2基因检测——带着问题重读《ASCO/CAP指南》 作者:王炜, 项晶晶, 崔海东, 刘坚, 徐如君 作者单位:王炜,项晶晶,徐如君(310006,杭州市第一人民医院病理科), 崔海东,刘坚(310006,杭州市第一人民医院乳腺外科) 刊名: 中华外科杂志 英文刊名:Chinese Journal of Surgery 年,卷(期):2013,51(10) 参考文献(25条) 1.Wolff AC.Hammond ME.Schwartz JN American Society of Clinical Oncology/College of American Pathologists guideline recommendations for human epidermal growth factor receptor 2 testing in breast cancer 2007 2.Perez EA.Dueck AC.McCullough AE Predictability of adjuvant trastuzumab benefit in N9831 patients using the ASCO/CAP HER2-positivity criteria 2012 3.Perez EA.Reinholz MM.Hillman DW HER2 and chromosome 17 effect on patient outcome in the N9831 adjuvant trastuzumab trial 2010 4.Starczynski J.Atkey N.Connelly Y HER2 gene amplification in breast cancer:a rogues' gallery of challenging diagnostic cases:UKNEQAS interpretation guidelines and research recommendations 2012 5.Petroni S.Addati T.Mattioli E Centromere 17 copy number alteration:negative prognostic factor in invasive breast cancer 2012 6.Perez EA.Press MF.Dueck AC Immunohistochemistry and fluorescence in situ hybridization assessment of HER2 in clinical trials of adjuvant therapy for breast cancer (NCCTG N9831,BCIRG 006,and BCIRG 005) 2013 7.Valent A.Penault-Llorca F.Cayre A Change in HER2 (ERBB2) gene status after taxane-based chemotherapy for breast cancer:polyploidization can lead to diagnostic pitfalls with potential impact for clinical management 2013 8.Tse CH.Hwang HC.Goldstein LC Determining true HER2 gene status in breast cancers with polysomy by using alternative chromosome 17 reference genes:implications for antiHER2 targeted therapy 2011 9.Gunn S.Yeh IT.Lytvak I Clinical array-based karyotyping of breast cancer with equivocal HER2 status resolves gene copy number and reveals chromosome 17 complexity 2010 10.Ross JS Human epidermal growth factor receptor 2 testing in 2010:does chromosome 17 centromere copy number make any difference 2010 11.Pritchard KI.Munro A.O'Malley FP Chromosome 17 centromere (CEP17) duplication as a predictor of anthracycline response:evidence from the NCIC Clinical Trials Group (NCIC CTG) MA.5 Trial 2012 12.Vance GH.Barry TS.Bloom KJ Genetic heterogeneity in HER2 testing in breast cancer:panel summary and guidelines 2009 13.Bartlett AI.Starcyznski J.Robson T Heterogeneous HER2 gene amplification:impact on patient outcome and a clinically relevant definition 2011 14.Allison KH.Dintzis SM.Schmidt RA Frequency of HER2 heterogeneity by fluorescence in situ hybridization according to CAP expert panel recommendations:time for a new look at how to report heterogeneity 2011 15.Chang MC.Malowany JI.Mazurkiewicz J" Genetic heterogeneity" in HER2/neu testing by fluorescence in situ hybridization:a study of 2522 cases 2012 16.Brunelli M.Manfrin E.Martignoni G Genotypic intratumoral heterogeneity in breast carcinoma with HER2/neu amplification:evaluation according to ASCO/CAP criteria 2009 17.Press MF.Finn RS.Cameron D HER-2 gene amplification,HER-2 and epidermal growth factor receptor mRNA and protein expression,and lapatinib efficacy in women with metastatic breast cancer 2008 18.Yang YL.Fan https://www.wendangku.net/doc/fe8936310.html,ng RG Genetic heterogeneity of HER2 in breast cancer:impact on HER2 testing and its clinicopathologic significance 2012 19.Nakamura R.Yamamoto N.Onai Y Importance of confirming HER2 overexpression of recurrence lesion in breast cancer patients[published online ahead of print February 25,2012] 2012

解析遗传性乳腺癌基因筛查的报告

解析遗传性乳腺癌基因筛查的报告 在家族中和患者具有血缘关系的健康成员也可能携带致病性的基因突变,携带这些突变的妇女终生患乳腺癌的危险性会大大提高,以BRCA1和BRCA2基因为例,携带者终生患癌危险性高达60~70%。符合家族遗传倾向条件的高危人群,应做遗传性乳腺癌基因筛查。让美亚预约网(威信hk-mear)来为你科普科普遗传性乳腺癌基因筛查吧。 三姐妹先后患上乳腺癌 李阿姨,杭州人,50多岁,她的两个姐妹几年前先后患上了乳腺癌,所以,她很关注自己的健康状况,坚持每年体检。连续几年下来结果都是好的,但今年她“中招”了,体检报告提示,她左侧乳房有多发性肿块。李阿姨拿着体检报告找到傅佩芬医师。她说,她的肿块和她两个姐妹不一样,根本摸不到,所以她觉得是良性的,不是乳腺癌。但结合病史和检查结果,傅医师高度怀疑她患的是乳腺癌,建议她做个活检。活检结果证实了傅医师的判断,李阿姨左右乳房有3个肿块,大小均在1厘米左右,其中2个确诊为癌,且这两个肿块的位置很隐蔽,检查时稍一疏忽可能就会漏诊。由于是多发性的,李阿姨最后做了左侧乳房全切手术。 对于李阿姨的患病,傅医师觉得有点惋惜,她说,像李阿姨这样有乳腺癌家族史的人,最好能及时做基因检测,看看自己是否携带有乳腺癌易感基因BRCA1和BRCA2。BRCA1和BRCA2是控制DNA修复的基因,若发生突变,则会大大增加携带者的乳腺癌和卵巢癌风险。对于BRCA1/2突变基因携带者做遗传性乳腺癌基因筛查,和定期健康筛查;药物预防;预防性手术等,最高可将患病风险分别降低90%、96%。 遗传性乳腺癌基因筛查过程? 乳腺癌基因筛查,通过抽取10毫升静脉血便可准确评估乳腺癌患病风险,检测多大21个基因位点。约28个工作日出结果。 遗传性乳腺癌基因筛查费用? 美亚预约网推出活动,预约做乳腺癌基因筛查可享受以下活动优惠: (一)遗传性乳腺癌基因筛查仅需6800港币; (二)接种九价hpv疫苗+乳腺癌基因筛查,仅需9999港币 (三)在活动二的基础上,再加一港币,10000港币,可做乳腺癌筛查+体检+九价hpv疫苗接种 (四)乳腺癌+体检,7800港币

乳腺癌和肺癌基因检测项目计划书

乳腺癌和肺癌基因检测项目计划书 一项目背景 乳腺癌是女性最常见的癌种,占女性恶性肿瘤的1/3,其发病率约为30/10万,即每年10万女性中有30位会患乳腺癌。男性也可患乳腺癌,但比例很低,男女比例约为1:100。 遗传性乳腺癌占全部乳腺癌的10%左右,而在遗传性乳腺癌患者中,有50%左右是由于BRCA1、BRCA2基因突变所引起,30%是由ATM、BARD1、BRIP1、CDH1、CHEK2、MSH6、MRE11A、MUTYH、NBN、NF1、PALB2、PTEN、RAD50、RAD51C、STK11、TP53这16个基因突变所致。BRCA1、BRCA2基因主要功能是参与细胞DNA修复、蛋白降解、调节基因转录、调节细胞周期等,当它们发生突变后,细胞不能进行正常的生理活动而发生恶性增殖,最终导致乳腺癌的发生。BRCA1、BRCA2基因突变的携带者一生患乳腺癌的几率可能高于80%。因此,对有家族史的个体(也包括男性)进行基因检测有助于乳腺癌的早发现,早干预,早治疗。 肺癌是肺部常见的恶性肿瘤,对人类健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。在男性肿瘤中,肺癌发病率和死亡率均占所有恶性肿瘤的第一位,在女性肿瘤中,肺癌的发病率和死亡率屈居乳腺癌占第二位。 目前研究已发现有数十个基因与肺癌结肠癌的发生密切相关,而其中部分基因的突变又与靶向药物治疗的效果密切相关。如携带

EGFR基因敏感突变的肺癌患者,接受吉非替尼(易瑞沙)治疗疗效显著高于化疗药物,但这类敏感人群在欧美仅约10%,在中国也只有不到40%。又如,KRAS基因是肿瘤生长信号通路中的一个关键基因,如果结肠癌患者是KRAS野生型,接受西妥昔单抗治疗后,将近70%左右的患者会有明显获益,但如果患者携带KRAS耐药突变,则获益情况远不如传统化疗。因此,美国《NCCN指南》明确指出:患者在接受靶向药物治疗前应进行相关基因的检测,据此确定是否适合用药。因此,对潜在风险人群进行基因检测不仅有助于肺癌结肠癌的早发现早干预,对患者的靶向药物治疗也有重要的指导作用。 二市场调查 肿瘤的个性化用药基因检测是国家颁布的精准医疗计划重要的组成的部分,市场前景广阔,在美国这项检查已经纳入医保计划;在中国通过前期一些公司的市场宣传市场接受度高,预计市场规模可以达到百亿的规模。 市面上的主流二代测序公司都开展这项目,比较出名的是华大基因,达安基因,贝瑞和康,诺禾致源,上海伯豪,联川基因等,这些公司基本上采用卖服务的商业模式,自己获取标本,自己测序和分析。 三技术路线 1 总技术路线

基因检测相关问题及答案

十个问题及答案 问题1:基因检测有什么用途? 回答: 1. 辅助临床诊断:很多疾病表现出来的症状类似,临床上很难进行鉴别诊断,容易混淆。若是通过基因检测,在基因层面找到致病原因,可以辅助临床医生鉴别诊断甚至纠正临床上的诊断。 举例:某基因检测机构通过对一个临床疑似“先天性白内障-小角膜综合症”的家系进行了基因检测,最后在基因层面发现他们家系患的其实是“玻璃体视网膜脉络膜病”而非“先天性白内障-小角膜综合症”,帮其纠正了临床诊断。 又如:糖尿病中有一型特殊类型的糖尿病为“单基因糖尿病”(由单个基因突变引起,为孟德尔遗传病)由于其基因存在缺陷,使得患者在代谢特征、临床表现和治疗方案等方面,都与1型或者2型糖尿病患者有着明显的区别。但是,由于认识上的不足,单基因糖尿病常常被误认为1型或2型糖尿病。英国一项流行病学的调查显示,有80%的青春晚期糖尿病(MODY)患者未被正确诊断。在欧美国家的单基因糖尿病的研究中,发现有10%的1型糖尿病和2-5%的2型糖尿病其实是单基因糖尿病。所以,通过对正常人群体,特别是有糖尿病家族史的人群,进行单基因糖尿病致病基因的筛查,可以尽早发现基因缺陷,从而把单基因糖尿病患者从1型或者2型糖尿病患者中区分出来。 2.携带者筛查:最常见的是唐氏综合征的筛查。传统的唐氏综合征筛查是利用血清学筛查进行的,检出率为65%-75%,容易漏检。而无创产前基因检测则可以准确地筛查出唐氏综合征患儿,还包括对18三体综合征和13三体综合征的筛查。此外,针对具有某些单基因遗传病(尤其是隐性遗传病)家族史的高危人群进行相关致病基因的筛查,可以及时发现该家族中致病基因的携带情况,进而分析后代患病的风险,为家属成员提供有效的遗传信息,防止缺陷基因向下一代遗传。 3指导治疗:现在医生开药的遵循的是经过广泛测试后提供的剂量信息。但所有的药物在测试过程中都是以群体作为样本的,因此药物剂量在对于大多数人是合适的。但是由于每个人的基因不同,会导致正常剂量下的药物对一些人产生致命的作用。导致原本挽救健康的药可能反而对健康造成伤害。这样的现象就称为药物不良反应(adverse drug reactions, ADR)。如药物warfarin是一种抗凝剂,是防止血液凝固的一种药物,病人服用这种药物可以大大减轻血栓形成的危险。但是抗凝剂服用过多,血液便不容易凝固,会造成出血,甚至有生命危险。在我们身体中有一种酶叫CYP2C9,它可以代谢这种抗凝剂,把它分解成小分子物质,使之失去抗凝血作用。正常情况下warfarin发挥作用后被代谢,完成它的药物治疗作用,也并不对人身体造成危害。但是,如果一个人CYP2C9发生突变,代谢功能降低,是弱代谢型

乳腺癌预后评估

乳腺癌预后评估 一、概述 恶性肿瘤是危害人类健康的疾病之一,近年来,肿瘤的发病率和死亡率居高不下,肿瘤死亡率呈现上升趋势,癌症已经成为严重威胁健康的头号杀手。就我国而言,癌症为农村居民的第二位死因,城市居民的首位死因。在全球范围内,我国的癌症发病率与美国、英国、法国接近,高于多数亚洲国家。肺癌、肝癌、结直肠癌、乳腺癌、膀胱癌死亡率及其构成呈上升趋势,其中肺癌和乳腺癌上升幅度最大,肺癌已代替肝癌成为我国首位恶性肿瘤死亡原因。目前外科手术仍是恶性肿瘤主要治疗手段,但中晚期患者术后生存率很低,故癌症的早期诊断、疗效监控及复发监测是有效治疗的关键。 预后是指对发病后,疾病未来过程的一种预先估计。在医学上,“预后”是指根据经验预测的疾病发展情况。预后主要涉及到三方面,将发生什么结果、发生不良结局的可能性有多大、什么时候会发生。 预后分析是对疾病发病后发展为各种不同结局的预测;是临床非常实用、对临床很有指导作用的临床研究。研究和评价预后的目的,为了便于了解各种疾病对人类危害性的大小、探索影响预后的因素、研究改善预后的具体措施。特定分子式新的个体化的预后评估,及时制定最佳的治疗方案,进一步提高患者治疗效果,改善患者生存质量。 (一)乳腺癌与Onco type DX 21基因: 乳腺癌是威胁女性的恶性肿瘤之一,近20年来,以手术为中心,化疗、放疗、内分泌治疗为辅助的多学科综合治疗模式得到长足的发展,使乳腺癌的复发和死亡率显著降低,但仍然缺乏有效的方法能够较为准确地预测患者的复发风险并给予相应的治疗。近几年来,随着基因组学的研究深入,已发现几个能够比临床病理学指标更能准确预测肿瘤复发的多基因标记物。针对雌激素受体阳性患者的“21基因检测(Oncotype DX)”已经被证实比临床病理学指标更能准确预测雌激素受体阳性、腋下淋巴结阴性且降低服用他莫昔芬患者的远处转移风险。南加州大学Keck医学院的霍姆斯(Dennis Holmes)教授在第四届欧洲乳癌大会上说,虽然接受乳房肿瘤切除术患者病情复发的危险较高,但长期生存的机会不变。霍姆斯强调,患者必须接受严格的监控,以便在病情复发时尽早发现并治疗。 21基因检测项目: 检测背景: 2005年,获得FDA批准;2007年,ASCO,NCCN联合推荐检测;在美国、欧洲、日本等50多个国家和地区开展近6年,已有超过135000位乳腺癌患者从中获益;6种疗效相关基因检测为乳腺癌患者选择药物提供最可靠的依据; 检测目的: 临床和病理学的疾病分期是早期乳腺癌风险预测的基础。疾病分歧对于病情程度的描述虽有限制,但却是目前最为广泛的预测手段。21基因检测技术能够对肿瘤的生物学特性提供更为详尽的信息,从而为个体病例提供更为详尽的信息,是临床医师能够选择出真正能够从内分泌或化疗中获益的患者。 21基因的价值: 低复发指数(RS)与最小化疗获益相关; 高复发指数(RS)与较好的化疗获益相关。 (侵袭性乳腺癌患者10年复发风险评估;侵袭性乳腺癌患者他莫昔芬及他莫昔芬联合化疗疗效预测) Onco type DX复发指数提供了简洁、定量的个体预后信息,是具有统计学意义、与患者年龄、肿瘤大小和肿瘤分期分级无关的独立指标。利用他莫昔芬治疗乳腺癌的过程中,并不是

BRCA和BRCA基因检测的临床意义

BRCA1/2基因检测的意义 ●为什么要做BRCA1/2突变检测?携带BRCA1或BRCA2突变的女性,乳腺癌的发 病机率会增至60-90%。 BRCA1和BRCA2基因是抑癌基因,它们主要参与DNA损伤的修复和转录的调控。这两个基因的结构和功能异常与乳腺癌的发病密切相关。BRCA1、BRCA2突变相关性乳腺癌具有发病早、双侧性等特点。基因突变携带者的乳腺癌危险度远远高于一般人群,其乳腺终生患癌危险度高达80%~85%。所以,BRCA1、BRCA2突变相关性乳腺癌的普查和预防越来越受到人们的重视。 ●BRCA1/2突变方式有哪些? BRCA1基因可发生多形式多位点的基因突变。目前发现BRCA1突变位点以外显子11(占48.5%),2(占18.6%),20(占9.2%),5(占8.2%),18及21(各占3.1%)为多见,BRCA2突变主要集中在在外显子10和11上。 ●发现易感基因突变后,是否要选择切除乳腺? 据研究发现,约有1%的乳腺癌患者有家族史,并可能存在BRCA1/2基因突变,这些有BRCA1/2基因突变的妇女,其一生中患有乳腺癌的危险可高达80%,对这些女性视本人意愿并在医生的指导下视具体情况才可考虑做预防性乳房切除术,以使乳腺癌发生率下降,但预防性乳房切除术与通常的乳腺癌患的乳房切除术应该有所差异,不必全切,将创伤尽可能减低,可考虑把可能患上乳腺癌的乳腺切除,保留其他组织,包括乳头与皮肤,同时进行乳房再造等。而美国影星安吉丽娜·朱莉也正是使用这种手术,保留了乳头与皮肤,并在此后进行植入手术,只在身上留下小小的疤痕,却并不影响乳房的外观。 如果有基因缺陷的人对于手术有抵抗情绪,还可选择密切观察以在早期切除来治愈发生的癌症,使用他莫西芬等药物预防,或调整生活习惯来减少患癌的风险。 ●切除乳腺后,是不是就“一劳永逸”了呢? 即使切除乳房或乳腺,卵巢及输卵管,也不能保证绝对不会再发生癌,因为乳腺或卵巢的组织总会有一些少量的残留,但因为可发生癌变的组织量大幅度减少,癌变的风险也随之降低,所以安吉丽娜·朱莉的乳腺癌风险是由手术前的87%降到了5%左右。” ●什么人需要进行基因检测?一级或者二级亲属中有患卵巢癌或者50岁以下 的乳腺癌。 乳腺癌高发,目前已知的是和BRCA1和BRCA2两种基因突变有关,如果病人含有这两种基

FISH检测乳腺癌Her2基因状态

FISH检测乳腺癌Her2基因状态 什么是FISH: FISH技术是以直接标记或间接标记的DNA探针与靶组织或细胞内的DNA同源序列进行杂交,通过在含有特异滤光片的荧光显微镜下观察多彩信号,来检测标本中DNA(或基因)或染色体变化的一种分子细胞遗传学技术。 什么是Her2: 是人类表皮生长因子受体2基因,位于17号染色体17q11.2-21,编码一个分子量为185kD的跨膜糖蛋白。Her2受体的过度表达见于20%的浸润性乳腺癌和60%的原位导管癌(DCIS),也见于其它肿瘤,如膀胱癌、结直肠癌、胃癌和非小细胞肺癌等。Her2受体的过度表达在细胞向肿瘤转化和肿瘤发生中起着关键性作用。 Her2阳性在治疗上的意义: 预测对含蒽环类治疗方案的敏感性; 预测对紫杉类治疗的敏感性; 预测激素治疗的耐药性; 预测对CMF(环磷酰胺、氨甲喋呤、5-氟尿嘧啶)治疗方案的耐药; 赫赛汀(一种抗Her2的单克隆抗体,针对Her2阳性的乳腺癌患者的癌基因靶向治疗药物)的治疗指征。 为了减少Her2假阳性和假阴性的结果,评估Her2状态必须准确,这样可以既避免不必要的资源浪费,也可避免贻误延长患者生命的有效的治疗时机。 FISH检测Her2状态的指征: 免疫组化结果为2+ 由于某些原因导致免疫组化结果不易判断在使用相关靶向药物之前应该确定Her2状态

可以先做免疫组化,然后根据结果再做FISH,也可以直接做FISH。 ISH检测的优点和缺点: 可以做回顾性诊断:由于DNA稳定性比较好,多年存档的蜡块也可以得到很好的分析结果; 2)准确性高:DNA不易受到各种因素的影响,同时实验中设立了内对照(为绿色信号的17号染色体着丝粒探针),另外,结果判断是客观的(免疫组化有主观因素),因而准确性非常高。 3)费用高、操作复杂:需要昂贵的设备、试剂与耗材,操作人员要经过严格的相关技术培训。 下面是GeneTest采用FISH方法准确检测Her2基因状态的图片。 两个红色信号是her2基因(位于17q11.2-12),两个绿色信号是作为内对照的17号染色体着丝粒。

中国抗癌协会:乳腺癌患者BRCA12基因检测与临床应用(系列十七)

中国抗癌协会:乳腺癌患者BRCA1/2基因检测与临床 应用(系列十七) 17 乳腺癌患者BRCA1/2基因检测与临床应用 基于当前对BRCA1/2在乳腺癌发病、预防、治疗及预后预测中作用认识的深化、检测技术的成熟以及新的靶向药物的应用,参考国外指南,结合我国部分肿瘤中心的数据和临床经验,形成本部分内容。 17.1 BRCA1/2基因突变与乳腺癌发病风险 BRCA基因突变分为两种类型,一种为胚系突变,是指来源于精子或卵母细胞的生殖细胞突变,致机体所有细胞都带有突变,可以遗传给后代;另一种为体细胞突变,是指发生于肿瘤细胞中的BRCA基因突变,为非遗传性突变。携带BRCA1/2基因突变的女性不仅乳腺癌发病风险增加,其他如卵巢癌、输卵管癌、胰腺癌、胃肠道肿瘤及黑色素瘤等发病风险也增加,男性罹患乳腺癌、前列腺癌风险增加。 17.2 BRCA1/2基因突变与乳腺癌患者的治疗决策

BRCA基因编码蛋白通过同源重组参与DNA双链损伤修复,BRCA1/2基因突变乳腺癌由于同源重组修复功能缺陷,可能对铂类药物或PARP抑制剂等致DNA损伤药物更为敏感。对于伴有BRCA1/2基因胚系突变或体细胞突变的晚期或复发转移性乳腺癌患者,制定化疗方案时可以优先考虑铂类药物,也可选择PARP抑制剂如奥拉帕利作为化学治疗的替代药物。 17.3 对乳腺癌患者进行BRCA基因检测的建议 结合NCCN、欧洲肿瘤内科学会(ESMO)等国外指南,以及我国现有的临床数据,提出推荐进行BRCA基因筛查的乳腺癌患者特征,具体内容见表8。 表8 推荐对乳腺癌患者进行BRCA基因检测的专家共识 家族中有已知的BRCA1/2基因有害突变 乳腺癌病史符合以下条件: 确诊年龄≤45岁

NCCN推荐早期乳腺癌适用基因检测项目:21基因检测

NCCN推荐早期乳腺癌适用基因检测项目:21基因检测 2015年3月12日至14日第20届NCCN年会在美国举行,本次年会明确认可了一项适用于早期乳腺癌的基因检测:乳腺癌21-基因检测(GenomicHealth公司开发的Oncotype DX)。本次年会的主持是华盛顿大学Siteman癌症中心的Amy Cyr医生,他在会上演讲时表示,乳腺癌21基因检测具备了两个功能,不仅能够评估疾病的预后,而且能够预测对化疗的反应,是预后和预测的双重工具。因此优于其它的乳腺癌分子检测项目,如MammaPrint,Prosigna,EndoPredict及CancerIndex。随着乳腺癌筛查项目的广泛开展,越来越多乳腺癌患者在癌症的早期阶段被检出。研究发现有部分乳腺癌患者转移、复发风险低,通过内分泌等治疗措施预后良好,这部分患者不能从化疗中获益。通过21基因检测就能够发现这部分乳腺癌患者,避免因过度化疗造成不必要的伤害。与会的科罗拉多大学格里力诊所的MichaelStone医生表示,“21基因检测是非常有用的手段”,它可以预测局部或转移复发风险。“我的很多患者都很高兴他们有可能不需要化疗了。” Stone医生解释说,通常对低复发风险分数的患者不推荐化疗,但推荐其用于高复发风险分数的患者。中复发风险分数是个灰色地带,主要根据患者的年龄和健康状况推荐是否进行化疗。一般会对中复发风险分

数的、更年轻的、健康的绝经后患者推荐化疗。Cyr医生承认,很难确定中复发风险分数的女性是否该接受化疗。乳腺癌21基因检测在国外最受推荐的是GenomicHealth公司研发的Oncotype DX产品,然而国外检测试剂盒价格昂贵,每例患者需支付约25,000元人民币,对于中国患者来说费用 过于昂贵。随着国内21基因产品的研发成功,河南省肿瘤 医院分子病理科于2014年在我省率先开展21基因检测项目,现已拥有成熟的检测平台,能够为乳腺癌患者提供该项检测服务。检测原理基于液相芯片技术,不仅检测技术更为先进,更为重要的是检测成本已降低到4940元。并且,随着21基因检测的价值被广泛认可,我国的医保中心已将其纳入可报销范围(省医保报销95%,新农合报销85%),报销后个人仅需支付几百元的检测费用。乳腺癌21基因检测适用对象:I或II期、雌激素受体阳性(ER )、淋巴结转移阴性,新确诊乳腺癌患者。绝经后,淋巴结阳性、雌激素受体阳性的浸润性乳腺癌患者,也可通过21基因检测评估是否需要化疗。参考资料:1. NickMulcahy,NCCN Recommends Only One Genomic Test for Breast Cancer,Medscape,March 12, 20152. https://www.wendangku.net/doc/fe8936310.html,/cancer/info-progress/show-75670_ 53.html

【CN109988820A】一种用于乳腺癌多基因检测的文库构建方法及试剂盒【专利】

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 201910317012.X (22)申请日 2019.04.19 (71)申请人 奥明(杭州)基因科技有限公司 地址 310018 浙江省杭州市江干区杭州经 济技术开发区白杨街道6号大街452号 2幢A1711-A1712号房 (72)发明人 童云广 王瓯晨 徐鹭芹  (74)专利代理机构 杭州知见专利代理有限公司 33295 代理人 赵越剑 (51)Int.Cl. C12Q 1/6806(2018.01) C12Q 1/6886(2018.01) C40B 50/06(2006.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种用于乳腺癌多基因检测的文库构建方 法及试剂盒 (57)摘要 本发明公开了一种用于乳腺癌多基因检测 的文库构建方法及试剂盒,包括(1)样品采集与 提取;(2)末端修复/磷酸化/加A;(3)添加含标签 的接头序列;(4)捕获前扩增;(5)目的基因杂交 捕获;(6)富集;(7)捕获后扩增。本发明基于二代 数字分子标识符(DMI )和双链双标签双重纠错 (DSDC)技术,可有效降低深度测序PCR扩增或测 序中发生的错误,提高检测灵敏度,同时针对反 应体系和杂交洗涤液进行了优化,能对目标基因 进行有效富集,降低样本量的要求。可用于乳腺 癌的靶向治疗、临床试验以及疗效评估涉及基因 检测的技术领域。权利要求书3页 说明书14页序列表6页 附图2页CN 109988820 A 2019.07.09 C N 109988820 A

遗传性乳腺癌和卵巢癌的基因检测

遗传性乳腺癌和卵巢癌的基因检测BRCA1和BRCA2突变 ◆什么是“遗传性”乳腺癌和卵巢癌? 近十年来,我国乳腺癌和卵巢癌的发病率不断上升,已成为威胁女性生命健康的最大杀手。根据统计,截止2005年底,我国几个主要城市的乳腺癌发病率接近十万分之四十,而上海地区则已突破这一数字,总体上较20年前增加了一倍。而且我国女性乳腺、卵巢癌的发病正向着年龄化,恶性高的方向发展,值得高度重视。 乳腺癌、卵巢癌往往有着家族性聚集发作的特点,而在这其中则有一部分患者可被检查出明确的基因缺陷,这部分肿瘤被称为“遗传性”乳腺癌或卵巢癌。约有十分之一的乳腺癌、卵巢癌是遗传性的,也就是说,是由基因突变造成的。 ◆是什么基因突变导致了乳腺癌和卵巢癌? 早在1994年,科学家们就发现有一种基因突变可引发乳腺及卵巢癌,他们将其命名为乳腺癌基因(BRCA)。BRCA基因有两种突变方式:BRCA1和BRCA2,分别发生于人体的第17条和第13条

DNA(如图所示)。 BRCA原是人类染色体上负责乳腺腺管发育和细胞分化的一个正常基因,但在发生突变以后,BRCA就失去了对损伤DNA的修复能力(尤其是辐射损害后的DNA),进而任由畸变的细胞发展为恶性肿瘤。十余年来的大量研究和临床观察已证实,绝大多数遗传性乳腺癌是由BRCA1和BRCA2突变造成的,而在携带BRCA突变的人中,有80%~85%将发生乳腺癌,30%~40%将发展成卵巢癌。

◆ BRCA基因调查的现状如何? 基于对乳腺癌、卵巢癌的遗传学认识,发达国家已广泛开展了BRCA基因的检查。仅在美国就已经有一百多万人接受了基因检测,《美国医学会杂志(JAMA)》公布的资料表明,全美约有75万妇女携带有BRCA基因异常,在某些族群中,该突变的比例更高。数年来在欧美国家开展的大规模基因筛查工程,已成功地发现大批癌肿风

基因检测为乳腺癌患者提供最佳治疗方案

基因检测为乳腺癌患者提供最佳治疗方案 美国托马斯杰斐逊大学医院的研究人员发现,确定乳腺癌分子亚型的基因检测能带来更精确的预后,从而为最佳治疗方案提供宝贵的指导。领导这项研究的是杰斐逊乳腺护理中心的主任MassimoCristofanilli医学博士。 Cristofanilli博士及其同事认为,Agendia公司推出的MammaPrint和BluePrint基因检测能帮助肿瘤医生为每个患者选择最有效的疗法。在圣安东尼奥乳腺癌研讨会(SABCS)上,他们报告称,分子分型在乳腺癌分类上优于传统的临床病理方法,能更精确地定制每位患者的治疗方案。 Cristofanilli博士谈道:“我们目前每天都在使用这些基因检测和分子分型。这种方法的一个好处在于我们能够确定哪些患者将受益于化疗,而哪些不需要化疗。” 化疗风险包括即时的副作用,不适,及长期的损害。一些研究认为,化疗对许多乳腺癌患者而言并没有真正的好处。基因检测是测定肿瘤中一组基因的活性,从而帮助医生更全面地了解癌症。目前临床上将乳腺癌分为4个亚型,分别为LuminalA型、LuminalB型、基底细胞样癌(三阴)型和HER2阳性型。 一直以来,乳腺肿瘤都是通过免疫组化(IHC)和荧光原位杂交(FISH)来分类的。Cristofanilli博士及其同事将IHC和FISH结果的准确性与MammaPrint和BluePrint进行了比较。MammaPrint检测预测妇女乳腺癌复发的可能性有多大。而BluePrint确定癌症的分子亚型,并预测手术前后对靶向疗法的响应。 研究人员回顾性分析了325个肿瘤样品,这些乳腺癌患者的年龄、生存及癌症病理(IHC/FISH)结果都是已知的。325名患者的平均随访时间为10.2年。结果表明,对于25%的患者,基因检测所确定的亚型不同于IHC和FISH。通过比较患者的预后,研究人员确定了基因检测相对IHC和FISH的整体优势。MammaPrint和BluePrint能更准确地预测各种亚型患者的5年无远处转移生存(DMFS),包括LuminalA型(预后最好)和三阴肿瘤(预后最差)。BluePrint则带来了与IHC和FISH不同的分子诊断。在IHC/FISH诊断为HER2阳性的52位患者中,50%被重新分类,其中LuminalA型有5位,LuminalB型有13位,而三阴型有8位。 1 注:内容均来自网络

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